UNIVERSIDAD PERUANA CAYETANO HEREDIA Facultad de Ciencias y Filosofía Departamento Académico de SILABO I. DATOS GENERALES 1.1. 1.2. 1.3. 1.4. 1.5. 1.6. 1.7. 1.8. 1.9. 1.10. 1.11. Nombre de la asignatura Código Año Semestre Académico Créditos Tipo de asignatura Prerrequisitos Semestre/Año de estudios/Nivel N° de horas lectivas (total semestral) Duración de la asignatura Profesor coordinador/ responsable BIOLOGIA MOLECULAR DE LA CELULA CF-0009 2006 SEGUNDO 5 OBLIGATORIO CF 3050 – BIOQUIMICA I NIVEL 300 Teoría 86 Hrs Práctica Del 22 de Agosto de 2006 Al 5 de Diciembre de 2006 MSc. Rocio Inga Peña II. SUMILLA La Biología Moderna se basa en el entendimiento de la estructura y función de las moléculas dentro de la célula y de las interacciones entre células que permiten el desarrollo de organismos multicelulares. En el curso Biología Molecular de la Célula se estudian las macromoléculas y las reacciones bioquímicas, los procesos celulares y los mecanismos de control genético. Los conceptos en Biología Molecular son continuamente modificados por resultados experimentales, y esto es posible por el desarrollo de herramientas experimentales cada vez más poderosas y sofisticadas que permiten estudiar a las células y organismos vivos cada vez con mayor resolución. III. OBJETIVOS EDUCATIVOS ó COMPETENCIAS El objetivo general del presente curso es que el estudiante adquiera el conocimiento de los fundamentos moleculares de los procesos que rigen la función de los seres vivos. Además se espera que el estudiante desarrolle una actitud crítica y capacidad autoformativa. Se hará énfasis en los métodos y tecnologías frecuentemente empleados en la investigación moderna. Objetivos Específicos: Comprender la estructura y organización del genoma. Entender el rol de los ácidos nucleicos en los procesos de herencia, expresión genética y su regulación. Estudiar los mecanismos que mantienen la estabilidad de la información genética de generación en generación, así como aquellos procesos capaces de generar variación. Conocer el fundamento de las tecnologías modernas que permiten estudiar la estructura y función de los ácidos nucleicos, su organización y expresión genética, así como el alcance de la manipulación genética de microorganismos, plantas y organismos complejos. Entender los procesos de transmisión de señales y su efecto en la regulación del ciclo celular, así como los procesos que ocurren en la muerte celular programada y el cáncer. IV. CONTENIDOS UNIDAD 1 Conceptos generales del Flujo de Información Genética. Estructura, propiedades, y alteraciones químicas de los Acidos Nucleicos. Tecnicas de análisis de Acidos Nucleicos (Electroforesis, hibridacion, secuenciamiento). Interacción DNA-Proteína. Replicación del DNA. Recombinación y variabilidad genética. Sistemas de Reparación del DNA. UNIDAD ò MODULO 2 El Proceso de transcripción, mecanismo y aparato basal. Procesamiento del RNA eucariote. Control de la Expresión Genética en Procariotes. Control de la Expresión Genética en eucariotes. Técnicas básicas de manipulación genética. DNA recombinante. Gene targetting y transgenia. UNIDAD ó MODULO 3 Código genético y traducción de proteínas. Inhibidores de la traducción. Procesamiento de proteínas: fosforilación, glicosilación, acilación, etc. Organización de cromatina y cromosoma. Complejidad del genoma. Expansión – contracción cromosómica. Telomerasas. Uso de la electroforesis en campo pulsado (PFGE) para el estudio y separación de cromosomas enteros. Elementos móviles: transposones, retrotransposones. UNIDAD ó MODULO 4 Diagnóstico Molecular y Terapia Génica. Plantas transgénicas. Genómica, Transcriptómica y Proteómica. Uso de microarreglos,. Microsecuenciamiento de proteínas. Análisis del polimorfismo genético y sus aplicaciones a microorganismos patógenos, suceptibilidad a enfermedades infecciosas, o análisis evolutivos. UNIDAD ó MODULO 5 Interacción lípido-proteínas y estructuras funcionales de membrana. Canales iónicos y transportadores. Señales celulares, proteínas G, proteín quinasas. Ciclo celular, daño celular y apoptosis. Cancer, oncogenes y genes supresores de tumores. V. ESTRATEGIAS DIDÁCTICAS Clases Teóricas: Los profesores presentarán los aspectos relevantes del capítulo correspondiente y orientarán a los alumnos en las lecturas que les permitirán profundizar en el tema. El alumno deberá reforzar su aprendizaje mediante la lectura de los textos recomendados y de literatura adicional sugerida por cada profesor Seminarios: Los seminarios desarrollan temas específicos relacionados a los tópicos tratados en las clases. Cada grupo de estudiantes presentará un seminario de 45 minutos de duración, incluyendo el tiempo para comentarios y preguntas. La presentación de los temas así como la participación de los alumnos durante el seminario serán evaluadas por el profesor. Los temas tratados durante los seminarios formarán parte del material a ser evaluado en las Evaluaciones de Seminario, en la misma fecha del Examen Parcial del capítulo correspondiente. VI. EVALUACIÓN Examenes Parciales: Son cinco Exámenes Parciales (uno por cada Capítulo) que el estudiante deberá rendir, en los cuales se evaluarán los temas desarrollados en las clases teóricas y las lecturas que haya indicado el profesor. Los alumnos que no hayan podido rendir un exámen en la fecha programada deberán presentar un documento que justifique su inasistencia en un plazo no mayor a una semana después de ocurrido el exámen. En caso que el alumno no pueda presentar el documento personalmente, deberá hacerlo mediante un familiar o compañero. El alumno deberá tener al menos 3 exámenes aprobados además de presentar el promedio final aprobatorio, para ser considerado aprobado en el curso. El peso ponderado del Promedio de Exámenes (PEX) es de 60%. Pasos Cortos: Son evaluaciones cortas que tiene como objetivo evaluar el desempeño del alumno durante el desarrollo del Capítulo. Cada capítulo tendrá 2 pasos cortos los cuales se llevarán a cabo de acuerdo al cronograma adjunto, cubriendo los contenidos de las clases anteriores. Las inasistencias a pasos cortos recibirán un calificativo de cero (0). El peso ponderado del Promedio de Pasos Cortos (PPC) es de 20%. Presentación de Seminario : Para cada capítulo, se escogerán artículos relacionados a los temas en estudio. Estos artículos serán distribuidos entre los alumnos, quienes deberán exponerlo en la fecha programada. La evaluación de los seminarios será realizada por el profesor considerando la etapa de preparación y consulta, así como la calidad de la presentación oral y el resumen / monografía entregado. El peso ponderado de la Presentación de Seminario (PSM) es de 10%. Evaluación de Seminarios: Estas son evaluaciones sobre los artículos de Seminarios que corresponden al Capítulo en evaluación y serán rendidas en la misma fecha que el Examen Parcial. El peso ponderado del Promedio de Evaluación de Seminario (PES) es de 10%. La nota final (NF) del curso se determinará de la siguiente manera: NF = PEX x 0.6 + PPC x 0.20 + PSM x 0.10 + PES x 0.10 Para ser aprobado en un curso se requiere obtener como mínimo la Nota Final 11. Solo para efectos del cálculo de la Nota Final del curso (NF), la fracción 0.50 se redondeará a la unidad inmediata superior a favor del alumno. Este redondeo no es aplicable a los promedios parciales o a calificaciones obtenidas en las evaluaciones a lo largo del curso. Se programará una fecha para los Exámenes Sustitutorios, los que se aplicarán al final del semestre según el calendario de evaluaciones que es anexo del presente Syllabus y forma parte de él. En este curso, de acuerdo al creditaje del mismo, los alumnos podrán rendir hasta Exámenes Sustitutorios (según lo determinado en el Manual de la Actividad Académicas). La nota obtenida en estas evaluaciones reemplaza a la nota del examen materia de sustitución cualquiera sea el resultado. Los alumnos que no rindan un Examen Parcial en la fecha programada deberán rendir el Examen Sustitutorio correspondiente. Para rendir el examen sustitutorio deberá abonar los derechos correspondientes en la caja de la Universidad indicando el código de la Facultad de Ciencias y Filosofía, así como satisfacer los requisitos académicos y administrativos vigentes. El alumno deberá tener al menos 3 exámenes aprobados además de presentar el promedio final aprobatorio, para ser considerado aprobado en el curso. El alumno puede solicitar retiro del curso hasta la fecha determinada al efecto por el Consejo de Facultad, la que figura en el Cronograma de Actividades de la Facultad, o hasta tener conocimiento de sus calificaciones correspondientes al 50% de los exámenes programados, lo que ocurra primero. VII. BIBLIOGRAFÍA Bibliografía 1. Lodish, H.; Berk, A.; Matsudaira, P.; Kaiser, C.A.; Krieger, M.; Scott, M.P.; Zipurski, D.L. & Darnell, J. (2004) Molecular Cell Biology. Fifth Edition. W.H. Freeman and Company, New York. 2. Cooper, G.M. and Hausman, R.E. (2004) The Cell: A molecular approach. Third Edition. ASM Press, Washington, D.C. 3. Alberts, B., Bray, D., Lewis, J., Raff, M., Roberts, K., y Watson, J.D. Molecular Biology of the Cell. (1994). 3rd ed. Garland Publishing Inc. New York 4. Lewin, B. (1997) Genes VI. Oxford University Press, Oxford, England. 5. Berg, J.M.; Tymoczko, J.L. & Stryer, L. (2002) Biochemistry. Fifth Edition. W.H. Freeman and Company, New York. 6. Nelson D, Cox M. (2005) Lehninger´s Principles of Biochemistry. Fouth Edition. Freeman and Company, New York, 7. Watson, J.D.; Gilman, M. Witkowski, J. and Zoller, M. (1992) Recombinant DNA. Second Edition. Scientific American Books. W.H. Freeman and Company, New York. Enlaces internet 1. Medline (Busqueda de artículos científicos, secuencias de proteína, DNA, genomas): www.ncbi.nih.gov 2. ExPASy Molecular Biology Server (base de datos y herramientas de análisis) : www.us.expasy.org 3. Sumanas (Animaciones varias en biología general, biología molecular, etc) http://www.sumanasinc.com/webcontent/anisamples/biology/biology.html ANEXO 1 DOCENTES PARTICIPANTES Grado ó Título MSc. Ph.D. Ph.D. MSc. MSc. Ph.D. Nombre Apellidos Jorge Arévalo Zelada Daniel Clark Leza Patricia Herrera Velit Rocío Inga Peña Carla Gallo López-Aliaga Gisela Orjeda Anexo 2 Programación de actividades VER CRONOGRAMA ADJUNTO