bioenergetica e introducion al metabolismo

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UNIVERSIDAD CENTRAL DE VENEZUELA
ESCUELA
DE AGRONOMÍA
UNIVERSIDAD
CENTRAL DE VENEZUELA
FACULTADESCUELA
DE AGRONOMÍA
DE AGRONOMÍA
DEPARTAMENTO DE QUIMÍCA Y TECNOLOGÍA
FACULTAD DE AGRONOMÍA
CATEDRA DE BIOQUÍMICA
DEPARTAMENTO DE QUIMÍCA Y TECNOLOGÍA
CATEDRA DE QUIMÍCA IV
BIOENERGETICA
Introducción
Los seres vivos son sistemas
abiertos (intercambio de energía
y materia con el entorno)
ENTORNO
SISTEMA
TERMODINAMICA
BIOENERGETICA
Es el estudio de los cambios de
energía que ocurren en las células y
de los procesos químicos (reacciones
bioquímicas) sobre los que se basan
estos cambios
ENTALPIA
(H)
ENTROPIA
(S)
ENERGIA
LIBRE
(G)
Magnitudes termodinámicas que
describen los cambios de energía en una
reacción química
REACCIONES
BIOLÓGICAS
Relación entre ΔG, ΔH y ΔS
VARIACIÓN DE ENERGÍA LIBRE O ENERGÍA DE GIBBS (ΔG)
Predice si una reacción es factible o no
Energía liberada capaz de
producir un trabajo útil a presión
constante.
Proporciona información sobre la dirección de la reacción química
Se determina en función de:
 La constante de equilibrio de la Reacción, Ke
 Los Potenciales de Reducción (reacciones REDOX)
Reactivos
Productos
GR
GP
Variación de energía libre (Δ G)
ΔG<0
Es Factible, el proceso es EXERGÓNICO
ΔG=0
Proceso en equilibrio, es I SOERGÓNICO
ΔG>0
NO Es Factible, el proceso es ENDERGÓNICO
ΔG = GP - GR
RELACIÓN ENTRE ΔG Y
aA + bB
cC + dD
CONSTANTE DE EQUILIBRIO
Keq
=
[C] c * [D] d
[A]a * [B]b
ΔG = - RT ln Keq
ΔG = cal/mol
R = 1,987 cal /º K mol
En condiciones estándar:
En condiciones fisiológicas:
T = ºK
25º C, 1 atm presión,
[R] y [P] = 1 M
25º C, 1 atm presión,
solución acuosa con [H2O] constante
pH = 7
Δ G´ = Δ Go´ + RT ln Keq´
ΔGo
Δ Go ´
Relación entre ΔG’º y K’eq
en el equilibrio ΔG ´= 0
Δ Go´ = - RT ln Keq´
Keq´ > 1
Keq´ = 1
Keq´ < 1
Δ Go´ < 0
Δ Go´ = 0
Δ Go´ > 0
EXERGÓNICA
Reactivos
Productos
Reactivos
Productos
Reactivos
Productos
ISOERGÓNICA
ENDERGÓNICA
REACCIONES REDOX
Oxidación: Dona eReducción: Acepta eReacciones de OXIDO-REDUCCION
Ocurren simultáneamente
Se trabajan como
medias reacciones
Se escriben como Reducciones
A+ + eA
Potencial de
Reducción (E)
Cede eAcepta e-
E <0
E>0
RELACIÓN ENTRE ΔG Y
POTENCIALES DE REDUCCION
En condiciones estándar:
En condiciones fisiológicas:
25º C, 1 atm presión,
[H = 1 M Eº (H) = 0,00 V
Eo
25º C, 1 atm presión,
pH = 7 Eº (H) = - 0,42 V
Eo´
Ecuación de Nerst
ΔEº ´= RT ln Keq´
Δ Go´ = - nF Δ Eo´
nF
Energía Libre estándar
Δ
Go ´
= - RT ln Keq´
n = nº de e- transferidos
F = 23060 cal /V . mol
ACOPLAMIENTO ENERGÉTICO DE LAS REACCIONES BIOQUÍMICAS
Las reacciones exergónicas espontáneas se acoplan a reacciones
endergónicas para que éstas tengan lugar
A
B
ΔGo´1
C
ΔGo´2
D
ΔGo´3
Las ΔGo´ de reacciones secuenciales son aditivas
A
D
EJEMPLO
ΔGo´total
=
ΔGo´1
+ ΔGo´2 + ΔGo´3
Fosforilación de la glucosa:
Glucosa + Pi
ATP + H2O
Glucosa + ATP
Glucosa 6P + H2O
ΔGo´ = +3,2 Kcal/mol (+13,8 KJ/mol)
ADP + Pi
Δ Go´= -7,3 Kcal/mol (- 30,5 KJ/mol)
Glucosa 6P + ADP
Δ Go´= - 4,3 Kcal/mol ( - 16,7 KJ/mol)
COMPUESTOS RICOS EN ENERGÍA
Liberan la energía mediante hidrólisis y transferencia de grupo (rotura
del enlace rico en energía ~)
Son aquellos que ceden una energía < -30 K kJ/mol (- 7 Kcal/mol) (potencial de
transferencia de grupo)
Potencial de transferencia de grupo:
Capacidad de un compuesto para ceder “el grupo” a otra sustancia.
Se mide por la energía libre desprendida en la hidrólisis del enlace de alta energía.
ATP + H2O
ADP +Pi
ATP + H2O
AMP +PPi
ΔGo´ = -7,3 Kcal/mol (– 30,6 Kj/mol)
ΔGo´ = -8,2 Kcal/mol (- 32,2 Kj/mol)
ESTRUCTURA DEL ATP
enlaces ricos en
energía
Adenina
(base nitrogenada)
Fosfato
Ribosa
(azúcar)
Adenosina-trifosfato (ATP)
(nucleótido)
Adenosina
(nucleósido)
Factores que determinan el potencial de Transferencia del ATP
Alta densidad de cargas de igual signo ( negativa )
1. REPULSIÓN : disminuye al separarse un grupo fosfato
2. Estabilizado por
RESONANCIA
3. IMPEDIMENTO ESTÉRICO (por la cantidad de oxígenos en cada átomo de fósforo)
El carácter dual del nucleótido FOSFATO DE ADENINA como donador (ATP) y aceptor
(ADP) definen su papel central como ·transferidor” de fosfatos en el metabolismo
ATP = moneda energética universal
VALORES DE G°´ DE HIDRÓLISIS
COMPUESTO
G’º
PRODUCTOS
(kJ/mol)
(kcal/mol)
fosfoenolpiruvato
piruvato + Pi
-49,3
-11,8
1,3-bisfosfoglicerato
3-fosfoglicerato + Pi
-49,3
-11,8
ATP
AMP + PPi
-45,6
-10,9
Fosfocreatina
Creatina + Pi
-43,0
-10,3
ADP
Acetil-CoA
AMP + Pi
Acetato + CoA
-32,8
-31,4
-7,8
-7,5
ATP
ADP + Pi
-30,5
-7,3
glucosa-1-P
glucosa + Pi
-20,9
-5,0
PPi
2Pi
-19,2
-4,0
fructosa-6-P
fructosa + Pi
-15,9
-3,8
AMP
adenosina + Pi
-14,2
-3,4
glucosa-6-P
glucosa + Pi
-13,8
-3,3
glicerol-P
glicerol + Pi
-9,2
-2,2
ACOPLAMIENTO ENERGÉTICO DE LAS REACCIONES BIOQUÍMICAS
REGENERACIÓN DEL ATP POR ACOPLAMIENTO DE A LA HIDROLISIS
DE UN COMPUESTO DE MAYOR ENERGÍA
(Reacción de Fosforilación a nivel de sustrato)
PAPEL DEL ATP EN EL
ACOPLAMIENTO
ENERGÉTICO DE LAS
REACCIONES
BIOQUÍMICAS
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DEPARTAMENTO DE
QUIMÍCA DE
Y TECNOLOGÍA
CATEDRA DE BIOQUIMÍCA
DEPARTAMENTO
DE QUIMÍCA Y TECNOLOGÍA
CATEDRA DE QUIMÍCA IV
CÉLULA
(UNIDAD FUNDAMENTAL DEL METABOLISMO)
Materia
Energía
1. Nucléolo
2. Núcleo celular
3. Ribosoma
4. Vesículas de secreción
5. Retículo endoplasmático rugoso
6. Aparato de Golgi
7.Citoesqueleto
8. Retículo endoplasmático liso
9. Mitocondria
10.Vacuola
11. Citosol
12. Lisosoma
13. Centríolo
REACCIONES QUÍMICAS DE LA CÉLULA VIVA
METABÓLISMO
METABÓLISMO
Suma de transformaciones químicas, catalizadas por enzimas, que se
producen en una célula u organismo (vías o rutas metabólicas).
FUNCIONES DEL METABOLISMO
 Obtener energía química a partir de energía solar o nutrientes
 Transformar moléculas nutrientes en en biomoléculas
componentes de la célula incluidos precursores de
macromoléculas
 Polimerizar precursores monoméricos en macromoléculas
 Sintetizar (ANABOLISMO) y degradar (CATABOLISMO)
biomoléculas necesarias en funciones celulares especializadas
DIVISIONES O FASES DEL METABOLISMO
CATABOLISMO
calor
ADP+Pi
NAD+
FAD+
NADP+
ATP
NADH
FADH2
NADPH
Energía
Química
Productos poco
energéticos
CO2, H2O, NH3
ANABOLISMO
Macromoléculas
celulares (Polisacáridos,
Lípidos, Proteínas,
Ácidos Nucleicos).
Macromoléculas
(Nutrientes productores
de energía: Glúcidos,
Grasa y Proteínas)
moléculas precursoras
(sillares estructurales y
otras moléculas
sencillas)
PRINCIPALES CARACTERÍSTICAS DEL
CATABOLISMO Y EL ANABOLISMO
CATABOLISMO
Moléculas mas
complejas
• Degradativo,
oxidativo
• Sintético, reductivo
• Utiliza energía (ATP
y potenciales de
reducción: NADH,
FADH2, NADPH )
• Generación de
energía (ATP y
potenciales de
reducción: NADH,
FADH2, NADPH )
• Los productos finales
e intermediarios son
materias primas para
el anabolismo.
• Generan desechos
que se excretan al
entorno
ANABOLISMO
• Los productos
finales son materias
primas para el
catabolismo.
Moléculas pequeñas
sencillas
• Utiliza nutrientes del
entorno
METABÓLISMO
RUTAS METABÓLICAS
A
E1
B
E2
Precursor
C
E3
D
E4
Metabolitos
E
E5
F
ATP
En: Enzimas
ATP
A E1 B E2
C
E3
G
D E4
E6
Producto Final
E
H
E5
F
Producto Final 1
Producto Final 2
Precursores
A
+ E1 C E 2
B
ATP
D
E3
E
E4
Metabolitos
Acetil CoA
F
E5
G
Producto Final
ETAPAS DEL METABOLISMO
Sentido
catabólico
Polímeros
CARBOHIDRATOS
GRASAS
ETAPA I
Hidrolítica
Monómeros
H2O
H2O
H2O
Ac. Grasos
y Glicerol
PROTEÍNAS
Monosacáridos
ETAPA III
Polimerización
Aminoácidos
ADP +Pi
ATP + H2O
ETAPA II
Anaeróbica
Acetil-CoA
Intermediarios
comunes
e
ETAPA III
Aeróbica
Ciclo de
Krebs
ETAPA I
Aeróbica
H+
ADP + Pi
Moléculas
pequeñas
sencillas
ETAPA II
Anaeróbica
Piruvato
ATP + H2O
H2O
O2
CO2
NH3
Sentido
anabólico
RUTAS GENERADORAS DE ACETIL CoA
PROTEÍNAS
H2O
Aminoácidos
ALMIDÓN O GLUCOGENO
H2O
TRIACILGLICERIDO
H2O
Ác. grasos+Glicerol
Glucosa
Glucólisis
Desaminación
Transaminación
Piruvato
Descarboxilación
oxidativa
ACETIL-COA
CICLO DE
KREBS
β-oxidación
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