Formulario para presentación de Cursos del Programa de Posgrados NOMBRE DEL CURSO: Métodos moleculares aplicados al estudio de microorganismos de interés en salud animal NOMBRE DEL/LOS COORDINADOR/ES: Pablo Zunino Nombre de los Docentes invitados: Nacionales: Claudia Piccini, Pablo Zunino, Karina Antúnez, Martin Fraga, Paola Scavone, Elena Fabiano. FECHA DE INICIO……3/11/2014… 75 hs. Totales CARGA HORARIA: 46 hs. presenciales CUPO: FECHA DE FINALIZACIÓN………18/12/14… PROPUESTA DE CRÉDITOS: No Sí 5 Cantidad ………………… DINÁMICA Y EVALUACIÓN DEL CURSO: X Clases prácticas: X Laboratorio: Seminario individual: Seminario grupal: X Otros: Examen parcial Examen final Clases teóricas: X X Talleres: X Evaluación continua ___________________________________________________________________________________________ TRANSMISIÓN POR VIDEOCONFERENCIA (Por el momento limitada a Reg. Norte- Salto, EEMAC-Paysandú, y Montevideo) Lugar de transmisión ___________________________ Lugar de recepción ___________________________ El docente responsable realizará las gestiones necesarias en Facultad (UPEI-UGESA) y en los otros puntos de transmisión- recepción de la videoconferencia. 1 PROPUESTA DE 3 MIEMBROS PARA INTEGRAR EL TRIBUNAL EXAMINADOR (2 como Mínimo docentes de Posgrado) 1……Pablo Zunino…… 2……Claudia Piccini … 3……Karina Antúnez…… 4……Pala Scavone… 5………………………………… _____________________________________________________________ FORMULARIO MODIFICADO POR RESOLUCIÓN DEL CAMD DEL 31/03/2011 . 2 Curso Teórico - Práctico Noviembre/Diciembre de 2014 Métodos moleculares aplicados al estudio de microorganismos de interés en salud animal Número total de horas: 46 (30 horas teóricas y 16 horas prácticas) Lugar: Instituto de Investigaciones Biológicas Clemente Estable Coordinadores: Pablo Zunino (algún co-coordinador a designar) Docentes: Ver programa Participantes: Objetivo El objetivo principal del curso es brindar a los estudiantes las herramientas básicas para el diseño de estrategias de identificación y diagnóstico de microorganismos de interés en sanidad animal, así como para el estudio de comunidades microbianas nativas. A la vez, se pretende fomentar la interacción entre estudiantes, así como con los docentes participantes, estimulando la generación de cooperación científica. PROGRAMA PROGRAMA TEÓRICO MODULO UNO: MÉTODOS DE DIAGNÓSTICO E IDENTIFICACIÓN • • • • • PCR, Reactivos para PCR, Equipamiento necesario, Diseño de primers, Extracción, purificación y cuantificación de ADN, Extracción de ARN, Retrotranscripción a ADNc, Métodos basados en PCR (RT-PCR, Multiplex PCR). Dra. Karina Antúnez. Duración: 2 hs. Secuenciación, Análisis de secuencias. Nociones básicas de bioinformática. Mag. Martín Fraga. Duración: 2 hs. PCR en tiempo real, Equipamiento necesario, Tipos de colorantes (tipos de sondas, SYBR Green), Cuantificación absoluta y relativa, Temperatura de melting. Dra. Karina Antúnez. Duración: 2 hs Métodos basados en microscopia de fluorescencia: Nociones básicas de microscopia de fluorescencia y microscopia confocal, Hibridación in situ fluorescente, Inmunofluorescencia. Dra. Paola Scavone. Duración: 2 hs. Taller de discusión: Ejemplo de uso de estas técnicas para el diagnóstico y la identificación de microorganismos de interés en sanidad animal. Dra. Claudia Piccini, Dr. Pablo Zunino, Dra. Karina Antúnez, Mag. Martin Fraga, Dra. Paola Scavone. Duración: 4 hs. MODULO DOS: MÉTODOS DE ANÁLISIS DE COMUNIDADES • • • • • • • Conceptos generales de diversidad. Filogenia. Diversidad metabólica. Índices de diversidad. Dra. Claudia Piccini. Duración 2 horas Microbiotas nativas. Importancia en la fisiología animal. Relación con el hospedero. Estrategias de modulación de la microbiota. Probióticos. Dr. Pablo Zunino. Duración 2 horas. Métodos de estudio de comunidades microbianas. Fingerprinting. ARDRA. TRFLP. DGGE. Bibliotecas de clones- secuenciación. Árboles filogenéticos. Dra. Claudia Piccini. Duración 2 horas Metagenómica. Dra. Elena Fabiano. Duración 2 horas Secuenciación masiva. Conceptos básicos. Tipos de plataformas. Aplicaciones. Dr. José Roberto Sotelo. Duración 2 horas. Aplicaciones de la secuenciación masiva a la Microbiología. Mag. Martín Fraga. Duración 2 horas. Taller de discusión: Aplicaciones de estas técnicas para el estudio de comunidades microbianas en animales de importancia productiva. Dra. Claudia Piccini, Dr. Pablo Zunino, Dra. Karina Antúnez, Mag. Martin Fraga, Dra. Paola Scavone. Duración: 4 hs. PROGRAMA PRÁCTICO Los estudiantes se dividirán en tres grupos y cada uno trabajará con un problema (muestra) diferente: 1. Detección e identificación de microorganismos de importancia en apicultura. 2. Análisis de comunidades microbianas ruminales. 3. Biofilms bacterianos En cada grupo, se realizarán los siguientes procedimientos: • • • • • • Preparación del muestreo. Toma y almacenamiento de muestra. Extracción de ADN, extracción de ARN. Retrotranscripción, PCR, Multiplex PCR, Microsatélites, PCR en tiempo real, DGGE Electraoforesis en gel de agarosa y/o acrilamida, Análisis de imágenes FISH e inmunofluorescencia Secuenciación masiva (demostración). Análisis de los resultados de secuenciación masiva. Las fechas y horarios de los prácticos (a realizarse luego de culminado el programa teórico) se coordinarán luego de comenzado el curso. Fecha de inicio: 3 de noviembre de 2014. Días y horarios: Lunes, Miércoles y Viernes de 9 a 11 hs.