D.Casanova. Fac. Tandil - ACHA

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CARACTERES FUNCIONALES
SU INCLUSION EN EL PROGRAMA NACIONAL
DE EVALUACIONES GENETICAS
DE LA RAZA HOLANDO ARGENTINO
Daniel Casanova.
Jornada APROCAL en Mercoláctea .- Mayo 2012
MEJORA GENETICA RAZA HOLANDO
Natalia Rubio
Mailen Larsen
Edgardo Rodriguez
Cecilia Andere
Daniel Casanova
Facultad de Ciencias Veterinarias- Tandil
danca@vet.unicen.edu.ar
22/11/2011
Asociación
Criadores de Holando Argentino
2
GRUPO DE CARACTERES FUNCIONALES
(ICAR, 2012)
PARTO
FERTILIDAD
LONGEVIDAD
PATAS Y PEZUÑAS
SALUD BASADA EN MEDIDAS INDIRECTAS DE ENFERMEDAD
SALUD BASADA EN MEDIDAS DIRECTAS DE ENFERMEDAD
Número de vacas totales
NUMERO DE VACAS EN CONTROL LECHERO OFICIAL
EN LOS ULTIMOS 15 AÑOS
600000
550000
500000
450000
400000
350000
300000
250000
200000
150000
100000
`98
`00
`02
`04
Vacas
`06
`08
'10
`12
CONTROL LECHERO OFICIAL
Formosa
1 entidad
3 tambos
278 vacas
Salta
1 entidad
3 tambos
528 vacas
Córdoba
19 entidades
321 tambos
100.000 vacas
Entre Ríos
4 entidades
46 tambos
12.000 vacas
Santa Fe
20 entidades
789 tambos
170.000 vacas
Buenos Aires
45 entidades
997 tambos
270.000 vacas
CONTROL DE MORFOLOGIA
REGISTROS GENEALOGICOS
ORIGEN DE LOS TOROS UTILIZADOS EN ARGENTINA
NACIDOS A PARTIR DE 1986*
18%
2%
1%
61%
17%
1%
USA
ALEMANIA
CANADA
ARGENTINA
ESPAÑA
* 627 Toros. Repetibilidad mínima: 80% en tipo.
ITALIA
GRUPO DE CARACTERES FUNCIONALES
(ICAR, 2012)
PATAS Y PEZUÑAS
FERTILIDAD
LONGEVIDAD
SALUD BASADA EN MEDIDAS INDIRECTAS DE ENFERMEDAD
PARTO
IMPLEMENTACION DE NUEVA BASE DE DATOS EN LINEA
OCTUBRE DE 2008
22/11/2011
10
22/11/2011
11
GRUPO DE CARACTERES FUNCIONALES
(ICAR, 2012)
PATAS Y PEZUÑAS
FERTILIDAD
LONGEVIDAD
SALUD BASADA EN MEDIDAS INDIRECTAS DE ENFERMEDAD
PARTO
22/11/2011
13
22/11/2011
14
22/11/2011
15
GRUPO DE CARACTERES FUNCIONALES
(ICAR, 2012)
PATAS Y PEZUÑAS
FERTILIDAD
LONGEVIDAD
SALUD BASADA EN MEDIDAS INDIRECTAS DE ENFERMEDAD
PARTO
DESARROLLO DE PREDICTORES
GENETICOS Y GENOMICOS PARA FERTILIDAD
EN BOVINOS HOLANDO ARGENTINO
Tesista: Fernando Di Croce
Schrick, Saxton, Pighetti, Kirkpatrick, Casanova
Universidad de Tennessee, octubre de 2010
TENDENCIA GENETICA PARA
HTP - % TPH
TPH - VACAS
0,5
0,25
0.0 %
0
95
96
97
98
99
00
01
02
03
04
05
06
07
Año de nacimiento
%TPH
Fuente: Evaluación Genética ACHA-FCV Febrero 2012.
08
TPH
Toros
Vacas
Mínimo
-2,3
-2,0
Máximo
2,5
2,2
Animales
5.628
316.392
DESARROLLO DE PREDICTORES
GENETICOS Y GENOMICOS PARA FERTILIDAD
EN BOVINOS HOLANDO ARGENTINO
Tesista: Fernando Di Croce
Schrick, Saxton, Pighetti, Kirkpatrick, Casanova
Universidad de Tennessee, octubre de 2010
OBJETIVOS
Determinar marcadores genéticos asociados a
caracteres de fertilidad (GWAs)
3,282,843 lactancias y 1,622,088 animales
SNP Chip-50k
Se utilizó el genotipado realizado por el
“Bovine Functional Genomics Laboratory”
(USDA; Beltsville, Maryland) mediante el
bovineSNP50 (IlluminaInc.)
SNP: Polimorfismo de nucleótido único
Variaciones de un nucleótido en la secuencia de ADN:
dos posibles bases distintas en una misma posición
Alelo A aaacctgtcaactactag......
Alelo B aaaccggtcaactactag......
Generalmente dialélicos
Un SNP cada 500-1000pb. Distribución aleatoria
Genomic-Wide Association Study
MODELO TORO
489 toros genotipados SNP chip (50K )
Modelos estadísticos (regresión)
Identificación de marcadores moleculares (SNPs/Alelos)
Manhattan Plot para Edad al Primer Parto
GENOMICA Y FERTILIDAD
114 SNP presentaron una asociación
estadísticamente significativa con los caracteres
de fertilidad.
47 SNP mostraron asociación con 2 o más
caracteres de fertilidad.
El Cromosoma 16 presentó el mayor número de
asociaciones significativas con 12 marcadores.
GRUPO DE CARACTERES FUNCIONALES
(ICAR, 2012)
PATAS Y PEZUÑAS
FERTILIDAD
LONGEVIDAD
SALUD BASADA EN MEDIDAS INDIRECTAS DE ENFERMEDAD
PARTO
ANALISIS DE LA LONGEVIDAD DE LA RAZA
HOLANDO ARGENTINO
Exp N°2157-1819/05 - CIC
Se utilizó un modelo Weibull
Programa: Survival Kit (Ducrocq and Solkner, 1998)
Efectos fijos: kg leche, kg grasa y la interacción número de
lactancia y estadío de lactancia como tiempo dependientes,
y edad como tiempo independiente.
Efectos aleatorios: interacción del rodeo y año de parto,
y del toro.
1.671.683 lactancias (1984-2005)
Distribucion de valores geneticos de longevidad para 1277 toros
Holando
40
35
Numero de toros
30
25
20
15
10
5
Valores geneticos expresados como RCR
N toros
Promedio
DE
Mínimo
Máximo
h2
1277
1.0174075
0.1860791
0.5596600
1.7213000
0.09
172
154
147
141
137
133
129
125
121
117
113
109
105
101
97
93
89
85
81
77
73
69
65
61
56
0
EFECTO DE LA EDAD AL PRIMER PARTO
15
1,6
1,2
1,0
0,8
0,6
0,4
0,2
clases de edad (meses)
44
42
40
38
36
34
32
30
28
26
24
0,0
22
riesgo relativo
1,4
EFECTO DE LA PRODUCCION DE LECHE
15
12
riesgo relativo
10
8
6
4
2
0
-2.5
-2
-1.5
-1
-0.5
0
0.5
clases de producción de leche
1
1.5
2
LONGEVIDAD
Vacas que paren a una edad avanzada al primer parto (40m)
tienen un riesgo de ser descartadas 23% mayor que las que
paren a los 30 meses.
Vacas con menor producción de leche tienen un riesgo de
ser descartadas 10 veces mayor que las de mayor producción.
Vacas de baja producción de grasa tienen mayor riesgo de ser
descartadas (15%) con respecto a las de alta producción.
El riesgo de eliminación se incrementa a medida que avanza
la lactancia.
La heredabilidad fue 0.09.
GRUPO DE CARACTERES FUNCIONALES
(ICAR, 2012)
PATAS Y PEZUÑAS
FERTILIDAD
LONGEVIDAD
SALUD BASADA EN MEDIDAS INDIRECTAS DE ENFERMEDAD
PARTO
CELULAS SOMATICAS
DIFICULTAD AL PARTO
INVESTIGACION, DESARROLLO Y
TRANSFERENCIA
EVALUACION GENETICA INTERNACIONAL
PRUEBA DE TOROS
INTERBULL
USA
CAN
AUS
ARG
ARG
_________________________________________
A
A
A
*
|
A
B
*
B
B
|
B
*
*
|
C
C
C
*
D
D
*
|
D
E
|
E
*
*
*
_________________________________________
CORRELACION ENTRE PAISES
ARG
r
AUS
CAN
ESP
FRA
ITA
NLD
NZL
USA
ZAF
0.73
0.67
0.69
0.72
0.66
0.65
0.67
0.66
0.74
Fuente: Anne Torsell 2007. Interbull Centre
PROGRAMA NACIONAL
DE
PRUEBA DE TOROS
Instrumentación, coordinación y seguimiento
del proceso de prueba de un toro joven
para que el mismo se gradúe más rápido
y con mejor precisión
en la información editada.
OBJETIVO GENERAL
• Implementar un programa nacional
para probar 30 terneros de alto nivel
genético por año, hasta llegar
paulatinamente a unos 100 terneros
por año.
“Detectar animales genéticamente superiores, antes
de los 6 años de edad, para producir semen
de calidad probado en nuestro sistema de
producción, orientando la selección hacia los
objetivos del país y posicionar al sector con los
requisitos necesarios para competir
en los mercados nacional e internacional”.
FINALIDAD
Programa Nacional de Pruebas
de Toros
• Política de Estado.
• Solo se realiza con el trabajo conjunto de
Productores, Industria de la I.A, Técnicos
y Estado.
• Representa un enorme esfuerzo técnico.
• Genera un nuevo polo económico.
“GRACIAS POR SU
ATENCIÓN”
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