REPARACIÓNREPARACIÓN-RECOMBINACIÓN • • • • Importancia del tema. Fidelidad de la replicación. Daños en el ADN y sistemas de reparación del ADN. Recombinación: concepto, clasificación, modelos, enzimología. Consecuencias genéticas de la Recombinación. Daño del ADN • Como toda molécula el ADN participa de div ersas reacciones químicas, y como tal puede eventualmente sufrir modificaciones. •Dichas modificaciones pueden ser •espontáneas •inducidas por div ersos agentes •físicos •químicos •biológicos. Tipos de daño que ocurren en el ADN ESPONTÁNEOS: •depurinaciones •desaminaciones 5000 depurinaciones depurinaciones/día/ /día/ célula 100 desaminaciones desaminaciones/día /día / célula •Cambios tautoméricos de base Son formas alternativas isoméricas de las bases nitrogenadas que cambian el patrón de apareamiento normal. .Las variantes son de ceto a enol para timina y guanina y de amino a imino para citosina y adenina Cambios tautoméricos durante la replicación Tipos de daño que ocurren en el ADN Sistemas de reparación INDUCIDOS: 1) Fidelidad de la polimerasa Químicos los agentes alquilantes adicionan grupos metilo o etilo en diversas bases del ADN Figura a: sitios proclives a modificaciones - oxidación - hidrólisis - metilación Físicos Exposición a UV : Dímeros de pirimidina Sistemas de reparación Fidelidad intrínseca de la maquinaria de replicación (10-9pb) • Esta dada por la actividad exonucleasa 3´ 3´--´5´ • Requerimiento de primers • Imposibilidad de la polimerasa de agregar nucleótidos si no hay apareamiento exacto en los nucleótidos previos • Implica la imposibilidad de replicación en dirección 3´3´ -5´. 2) Sistemas de reparación directa 3) Reparación por escisión. 4) Sistemas de reparación postpost-replicación. Sistemas de reparación 1) Sistemas de reparación directa. a. Fotorreactivación: Fotorreactivación: eliminación de dímeros de pirimidina. (procariotas y plantas) b. Remoción del metilo en O6 de guanina (la met ilación se produce por agentes alquilantes) Sistemas de reparación 2) Reparación por escisión. 2a: Reparación por escisión de base 2b: Reparación por escisión de nucleótido Sistemas de reparación 2c: Sistema de reparación por apareamiento erróneo. ¿Cómo se diferencia la hebra parent al de la nueva? _E. Coli Coli:: la hebra parent al est á metilada.. metilada _Eucariot as: la hebra nueva present a rot uras de simple hebra. 2d: Sistema de reparación acoplada a la transcripción. _Se reparan preferentemente las hebras t ranscript as. (fact ores de la t rasncripción que act úan en la maquinaria de reparación, ej. TFIIH) Sistemas de reparación 3) Sistemas de reparación postpostreplicación. 3a: Reparación recombinatoria. recombinatoria. La hebra parental no dañada rellena el espacio opuesto al sitio dañado en la otra molécula hija, mediante recombinación entre secuencias homólogas. Sistemas de reparación Mantenimiento de la informacion hereditaria La replicación del material genético es esencial a la vida mitosis Errores en la replicación son el origen de las enfermedades hereditarias meiosis Errores en la replicación son causa primaria de canceres DNA RECOMBINATION mitosis Existen patologías por incapacidad de reparar e rrores cometidos en la replicación La recombinación aumenta la variabilidad y genera diversidad Donde y cuando sucede la recombinación homóloga....? -Durante la formación de gametos: MEIOSIS Recombinación Importancia de la variabilidad génica: génica: -La estabilidad génica es crucial para la supervivencia a corto plazo. -A largo plazo, la supervivencia de los organismos puede depender de la variación génica, génica, mediante la cual células y organismos pueden adaptarse a las variaciones del ambiente. -La propiedad del ADN de experimentar reordenaciones determina que se formen nuevas combinaciones génicas, sustrato molecular de la variabilidad génica. Donde y cuando sucede la recombinación homóloga....? Consecuencias genéticas de la recombinación Aumento de la variabilidad genética: -Varios niveles: 1) Dado por la combinación aleatoria de los cromosomas paternos y maternos. Consecuencias genéticas de la recombinación 1) La recombinación aumenta el número de combinaciones entre alelos paternos y maternos. 2) Permite ir eliminando alelos deletéreos tras diversas generaciones. 3) Ofrece mecanismos de reparación del ADN. “Por estos motivos y muchos más, es que la reproducción sexual ha sido tan efectiva a lo largo de la evolución”. 223 gametos diferentes Recombinación Concepto: Implica la ruptura física y posterior unión de hebras de ADN de forma tal que intercambian el contenido de ADN resultando en dos “nuevas” hebras. Clasificación: 1) HOMÓLOGA: HOMÓLOGA: requiere grandes regiones de homología. (ej. recombinación meiótica) 2) SITIO ESPECÍFICA: ESPECÍFICA: se da entre regiones específicas de moléculas de ADN. Requiere regiones pequeñas de homología.(ej. reorganizaciones del ADN –genes de Igs, inserción viral) 3) TRANSPOSICIÓN: implica el movimiento de secuencias a través del genoma y no requiere secuencias homólogas. (transposones transposones,, retrotransposones retrotransposones,, etc etc)) Recombinación homóloga Primeros indicios: Morgan (1910) Análisis de ligamiento. Recombinación homóloga Primeros indicios: Recombinación homóloga Modelo de Robin Holliday (1964): -Habría un intercambio físico de información hereditaria. -Relación directa entre la frecuencia de recombinación y distancia de mapa. -Sienta las bases del mapeo genético. Recombinación homóloga Intermediario Holliday Forma Chi Recombinación homóloga Recombinación homóloga Resolución del intermediario Holliday: Holliday: Intermediario de Holliday Inicio Resolución No se forman moléculas recombinantes.. Persiste un recombinantes sector heterodúplex heterodúplex.. Se forman moléculas recombinantes,, con un sector recombinantes heterodúplex.. heterodúplex Recombinación homóloga Recombinación homóloga Otros modelos del inicio del evento recombinacional: recombinacional: 1975: Modelo de rotura de simple hebra en una sola molécula de ADN. Modelo de rotura de doble hebra en una sola molécula de ADN. (la más aceptada actualmente) A pesar de los múltiples modelos del comienzo de la recombinación, recombinación, la unión Holliday de hebra cruzada continúa siendo el intermediario central del proceso. Enzimología de la recombinación homóloga Fenómeno estudiado fundamentalmente en bacterias, pero con homólogos en eucariotas: -Rec BCD: Con su actividad helicasa desenrrollna el ADN, y cuando encuentra la secuencia “chi” (GCTGGTGG) corta una hebra, dejando un sustrato de reconocimiento para Rec A. Enzimología de la recombinación homóloga -Rec A: Se une al ADN simple hebra. Promueve la invasión de una hebra a la otra molécula de ADN, reconociendo secuencias de alta homología. Enzimología de la recombinación homóloga -Rec BCD: Con su actividad helicasa desenrrollna el ADN, y cuando encuentra la secuencia “chi” (GCTGGTGG) corta una hebra, dejando un sustrato de reconocimiento para Rec A. Enzimología de la recombinación homóloga -Rec A: RAD 51 (homólogo en levaduras) Enzimología de la recombinación homóloga -Ruv AB: Complejo enzimático (helicasa (helicasa)) que promueve la migración de ramas Enzimología de la recombinación homóloga -Ruv C: (resolvasa)Complejo enzimático con función endonucleasa que promueve la rotura y unión de las moléculas de ADN del intermediario Holliday. Holliday. Determina según las hebras que corte si se van a producir moléculas recombinantes o no. Recombinación Consecuencias genéticas de la recombinación Clasificación: 1) HOMÓLOGA: HOMÓLOGA: requiere grandes regiones de homología. (ej. recombinación meiótica) 2) SITIO ESPECÍFICA: ESPECÍFICA: se da entre regiones específicas de moléculas de ADN. Requiere regiones pequeñas de homología.(ej. reorganizaciones del ADN –genes de Igs, inserción viral) 1) La recombinación aumenta el número de combinaciones entre alelos paternos y maternos. 2) Permite ir eliminando alelos deletéreos tras div ersas generaciones. 3) Ofrece mecanismos de reparación del ADN. 3) TRANSPOSICIÓN: implica el movimiento de secuencias a través del genoma y no requiere secuencias homólogas. (tranposones tranposones,, retrotransposones retrotransposones,, etc etc)) Recombinación sitio específica -El reordenamiento entre moléculas de ADN se produce en sitios específicos. Recombinación sitio específica -Integración de bacteriófagos: -El reordenamiento entre moléculas de ADN se produce en sitios específicos. -Integración de bacteriófagos: Recombinación sitio específica -Genes de Inmunoglobulina y receptores T Recombinasas: Recombinasas: RAG 1 & 2 Recombinación sitio específica -Genes de Inmunoglobulina y receptores T Recombinasas: Recombinasas: RAG 1 & 2 Transposición Concepto: -La transposición implica el movimiento de secuencias a través del genoma. _Descubiertos a través de evidencias genéticas por McClintock (50´) Clasificación: -Vìa intermediario de ADN. -Vìa intermediario de ARN Aplicaciones ADN recombinante Inactivacion génica por recombinación (animales transgénicos) transgénicos)