Proteínas de unión con ARN, moléculas integradoras de la

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NARRACIONES DE LA CIENCIA Y LA TECNOLOGÍA
Proteínas de unión con ARN,
moléculas integradoras de la expresión genética
Ramón A. González
Berto Tejera Hernández
Paloma Hidalgo Ocampo
T
odos los seres vivos están constituidos
que se expresan a partir de la información conte-
por los mismos tipos de biomoléculas.
nida en su genoma. La secuencia de nucleótidos
Entre ellas se encuentran los ácidos nu-
en una molécula de ADN es utilizada como un
cleicos y las proteínas, que son moléculas informa-
molde para transcribir y sintetizar una molécula
cionales. En el caso de las proteínas, este término
de ARN. La secuencia de nucleótidos de esta mo-
se refiere a que la secuencia de aminoácidos que
lécula de ARN es después traducida y resulta en
compone cada proteína determina el arreglo tri-
la síntesis de una proteína, es decir, una cadena
dimensional que adopta la cadena polipeptídica y,
de aminoácidos organizada en una secuencia que
consecuentemente, su conformación y su función.
corresponde directamente a la secuencia de nu-
Para los ácidos nucleicos, el ácido desoxirribo-
cleótidos en el ARN, pero traducida a un lenguaje
nucleico (ADN) y el ácido ribonucleico (ARN) son
molecular diferente.
moléculas informacionales porque portan en las
El ARN es una biomolécula formada por azú-
secuencias de nucleótidos que las componen la
cares (ribosa), bases nitrogenadas (adenina,
información genética de cada organismo. En el ca-
uracilo, guanina o citosina) y fosfatos, los cuales
so del ARN, se trata además de una molécula que
constituyen nucleótidos que forman los bloques
puede tener actividad catalítica. En la molécula de
que construyen el ARN. Esta molécula puede en-
ARN, la secuencia de nucleótidos determina no so-
contrarse en forma de cadena sencilla o doble,
lo la información genética sino que también deter-
formando estructuras (secundarias y terciarias)
mina la forma y la función de la molécula; en otras
topológicamente complejas. La organización tri-
palabras, la molécula de ARN puede representar
dimensional de estas estructuras depende de la
tanto un genotipo como un fenotipo.
secuencia del ARN, de su longitud, de modifica-
1
La identidad de cada célula y las actividades
que pueden desempeñar dependen de los genes
ciones químicas a las que está sujeto y de proteínas que se le asocian.
Thomas R. Cech, “The RNA worlds in context”, Cold Spring Harbor Perspectives in Biology, vol. 4, 2012, pp. 1-5.
1
Profesor e investigador, Facultad de Ciencias, UAEM
Doctorado en Ciencias, Facultad de Ciencias, UAEM
Maestría en Ciencias Bioquímicas, Instituto de Investigación en Biotecnología (IBT), UNAM
inventio 2 3
Tabla 1. Principales tipos de ARN presentes en metazoarios
Tipo de ARN
Función
ARNm
ARN que codifica para una proteína
ARNt
ARN que aporta cada aminoácido en la síntesis de proteínas
ARNr
ARN que forma parte estructural y catalítica de los ribosomas
ARNsi
ARN de 20-25 nucleótidos de longitud, que regula la traducción de un ARNm
miR
ARN de 21-22 nucleótidos de longitud, que regula la traducción de un ARNm
ARNnc
ARN que no codifica para una proteína
ARN pequeños
ARN estructural y catalítico del “spliceosoma” en el procesamiento de ARNm
nucleares
ARNlnc
ARNlnc
ARN largos no codificantes que regulan la expresión génica
ARNpi
ARN derivados de transcritos largos que regulan transposones
Existen muchos tipos de ARN, con tamaños, es-
nas. A estas proteínas se les llama RBP (por sus si-
tructuras y funciones diversas. Los tres más cono-
glas en inglés, RNA-binding-proteins o proteínas de
cidos, por ser los primeros en identificarse, son los
unión con ARN) y, dado que toda molécula de ARN
ARN mensajeros (ARNm), los de transferencia (AR-
está siempre asociada con una o más RBP, enton-
Nt) y los ribosomales (ARNr). No obstante, en los
ces funcional y estructuralmente, los ARN pueden
últimos años se han encontrado muchos otros ti-
ser considerados ribonucleoproteínas o RNP. Las
pos de ARN. En la tabla 1 se incluyen algunos de los
proteínas de unión con ARN (RBP) son determi-
2
ARN que se encuentran en todos los metazoarios.
nantes en la estabilidad de la molécula de ARN, su
El ARN es una molécula central en la regulación
localización celular, su forma y su función. Las RBP
de la expresión génica y el funcionamiento de la
funcionan como integradoras de las actividades
célula, y puede actuar como integradora de las
celulares, desde la organización estructural del
diferentes funciones biológicas de una célula. No
ADN en el núcleo de una célula, hasta cada paso
obstante, no se encuentra libre en una célula, ya
en la regulación de la expresión de los genes.
que a lo largo de su biogénesis —desde el inicio
En la última década, los hallazgos que han
de su síntesis hasta su degradación—, cada ARN
permitido aprender sobre la estructura y función
está físicamente asociado con diferentes proteí-
de los ARN y las proteínas que se les asocian, han
John S. Mattick e Igor V. Makunin, “Non-coding RNA”, Human Molecular Genetics, vol. 15, núm. 1, 2006, pp. R17-R29.
2
2 4 inventio
NARRACIONES DE LA CIENCIA Y LA TECNOLOGÍA
Tabla 2. Ejemplos de enfermedades causadas por fallas en ARN y RBP
Enfermedad
Función alterada
Síndrome de Prader Willi
biogénesis de ribosoma
Eritroblastopenia congénita de Blackfan-Diamond
biogénesis de ribosoma
Síndrome de Shwachman-Diamond
biogénesis de ribosoma
Síndrome de Treacher-Collins
biogénesis de ribosoma
Cáncer de próstata
biogénesis de ribosoma
Esclerosis lateral amiotrófica
splicing, transcripción
Atrofia muscular espinal
splicing
Retinosis pigmentaria
splicing
Síndrome X Frágil
traducción
Síndrome de Charcot–Marie–Tooth
traducción
Discapacidad cognitiva ligada a X
traducción/NMRDA
Autismo
RNA no codificante
Cáncer
splicing/traducción/exportación
mostrado que las RBP son esenciales en el funcio-
RBP, proteínas de unión con ARN
namiento normal de la célula. Este tipo de proteínas son moléculas clave en el flujo y la expresión
Aspectos estructurales y funcionales
de la información genética.
Las RBP se unen con ARN a través de una o más
En los últimos años se ha encontrado que mu-
regiones de la cadena polipeptídica, conocidas
taciones que afectan el funcionamiento del ARN
como dominios. Los dominios son regiones de una
y las RBP están ligadas con una gran variedad de
proteína que pueden adoptar una conformación
enfermedades (en la tabla 2 se incluyen algunos
estructural y funcional de forma autónoma. Se
ejemplos). En este artículo hacemos una descrip-
han encontrado múltiples tipos de dominios en
ción breve de algunas de las principales activida-
las proteínas, que son responsables de su interac-
des celulares que dependen de las RBP y cómo
ción con ARN. En la tabla 3 se enlistan los princi-
estas pueden convertirse en enfermedades.
pales dominios que se conocen en la actualidad.
3
Kiven E. Lukong, Kai-wei Chang, Edouard W. Khandjian y Stephane Richard, “RNA-binding proteins in human genetic disease”,
Trends Genetics, vol. 24, núm. 8, 2008, pp. 416-425.
3
inventio 2 5
Tabla 3. Tipos de dominios proteicos de unión con ARN
Dominios de unión
a ARN
Topología
Tipo de ARN que une
Ejemplo
Dominio KH
tipo I: βαββα
tipo II: αββαβ
ARNcs
hnRNP K
PAZ
Barril β
ARNcd
Ago
Dominio rico en argininas
-------
ARNcd, ARNcs
SC35, ASF/SF2
Dominio dedo de zinc
Ββα
ARNcd
BRCA-1,
Complejo Polycomb
RRM
Βαββαβ
ARNcs
U1, U2, Aly, Tap
CSD
Barril β
ARNcs
eIF2α
dsRBD
Αβββα
ARNcd
PKR
PIWI
5 hojas β rodeadas
por una α hélice
ARNcd
Ago
ARNcs: ARN de cadena sencilla; ARNcd: ARN de cadena doble; KH: dominio con homología a proteína K;
RRM: motivo de reconocimiento de ARN; CSD: dominio cold shock; dsRBD: dominio de unión a ARN de cadena doble; PAZ: dominio PIWI-Argonauta-Zille; PIWI: dominio P-element induced wimpy testis.
Las RBP pueden reconocer secuencias de nucleótidos o estructuras específicas en el ARN, y la
grupos 3’ OH de un nucleótido y el extremo 5’ fosforilado del nucleótido entrante.
presencia de varios dominios de unión con ARN
• ARNasas o ribonucleasas. Son enzimas que
en una misma proteína incrementa la afinidad y
cortan enlaces entre los nucleótidos del ARN. Se
especificidad por su ARN blanco.
han identificado al menos veinte tipos diferentes
Las funciones de las RBP en el nivel molecular
que reconocen distintas formas de ARN. Algunas
varían tanto como las actividades en las que están
reconocen secuencias específicas de nucleótidos
involucradas, pero para describirlas las dividimos
y otras reconocen arreglos estructurales en la mo-
aquí en cinco grandes grupos:
lécula del ARN. Pueden reconocer moléculas de
• ARN polimerasas. Son las RBP encargadas de
ARN de cadena sencilla o doble, o híbridos de ARN/
la síntesis de ARN. Estas RBP son enzimas polime-
ADN; algunas cortan enlaces en los extremos (exo-
rasas (polimerasas de ARN celulares; replicasas y
rribonucleasas) y otras, enlaces internos (endorri-
transcriptasas de ARN virales) que reconocen una
bonucleasas) de un ARN.
secuencia de ADN como molde (o ARN en los ge-
• Helicasas de ARN. Son RBP encargadas de in-
nomas virales compuestos por esta molécula) y
ducir cambios conformacionales del ARN; en estos
dirigen la formación de enlaces fosfodiéster entre
casos, una enzima helicasa reconoce una secuen-
2 6 inventio
NARRACIONES DE LA CIENCIA Y LA TECNOLOGÍA
cia o estructura en el ARN y cambia su torsión y
encargan de organizar y compactar las moléculas
arreglo estructural, por la remoción de puentes de
de ADN) y de modificaciones químicas a las que
hidrógeno.
están sujetas tanto las histonas (metilación y ace-
• Enzimas modificadoras de ARN. Entre estas
tilación) como el ADN (metilación). La forma más
RBP se puede incluir un número muy grande de
compactada del ADN se conoce como heterocro-
enzimas que comprenden todas aquellas que
matina, mientras que a la menos compactada se
pueden hacer cambios químicos en los nucleóti-
le llama eucromatina. En las regiones del genoma
dos que forman un ARN, sin alterar su secuencia.
menos compactadas —en la eucromatina— ge-
• Ribonucleoproteínas (RNP). Este es el grupo
neralmente se encuentran genes activos; es decir,
más extenso de las RBP; estas participan en el con-
estas son regiones de ADN temporalmente acce-
tacto de una molécula de ARN con otras proteínas,
sibles a la maquinaria celular encargada de expre-
formando complejos de ribonucleoproteínas. En
sar los genes. Pueden ser activamente transcritas
un complejo de RNP pueden estar incluidas proteí-
y son reconocidas por las enzimas celulares encar-
nas de cualquiera de los cuatro grupos anteriores.
gadas de sintetizar las moléculas de ARN codifica-
4
Las RNP pueden estar formadas por un ARN y
das en cada gen.
una RBP, o pueden llevar a la formación de com-
Las RBP tienen un papel crucial en la estabili-
plejos macromoleculares en los que las RBP se
dad de los cromosomas. Tal es el caso del supresor
asocian con moléculas de ARN y permiten la inte-
tumoral BRCA-1. Esta RBP es un componente de la
racción de otras proteínas, formando así estructu-
“maquinaria de reparación de daño” del ADN (DDR,
ras multiméricas complejas.
de DNA damage repair); funciona como factor trans-
Entre ellas están dos de los complejos macro-
cripcional e interactúa con complejos remodelado-
moleculares de mayor tamaño y complejidad de la
res de la cromatina, entre muchas funciones más.
célula: el “spliceosoma” y el ribosoma. Ambos son
BRCA-1 ayuda a reparar ADN dañado por cortes de
ensamblajes de ARN y RBP que cumplen funcio-
doble cadena e induce la muerte de las células en
nes estructurales y enzimáticas, e incluso acompa-
las que el genoma dañado no puede repararse.
ñan la actividad catalítica del ARN.
Por otra parte, se asocia con el dominio carboxilo terminal del ARN polimerasa II (descrito
Las RBP en la regulación de la expresión de los genes
más adelante) y con complejos de desacetilación
5
• Estabilidad y organización de la cromatina.
de histonas, y participa en el control de la trans-
Dentro de un núcleo celular, el ADN se organiza en
cripción, a través de la modulación de la croma-
arreglos que tienen diferentes grados de compac-
tina. Recientemente se identificó este supresor
tación. Estos grados de compactación dependen
como una RBP que reconoce estructuras secunda-
de las histonas (un conjunto de proteínas que se
rias de ARN y que se une directamente a miR a tra-
Y. Chen y G. Variani, “Protein families and RNA recognition”, FEBS J, vol. 272, 2005, pp. 2088-2097.
Emily Bernstein y C. David Allis, “RNA meets chromatin”, Genes & Development, vol. 19, núm. 14, 2005, pp. 1635-1655.
4
5
inventio 2 7
vés de un dominio de dedo de zinc. Esta función
cipa en la activación de la transcripción de genes,
se ha asociado con su mecanismo como supresor
como el gen c-myc (un factor que regula el creci-
tumoral y en el mantenimiento de la estabilidad
miento celular) y eIF4E (un factor esencial en la
cromosómica. Mutaciones en el gen que codifica
traducción de ARNm). Adicionalmente, esta RBP
para BRCA-1 están estrechamente asociadas al
participa en el procesamiento postranscripcional,
desarrollo de cáncer, principalmente el de mama.
al regular a SRp20, otro conector de actividades
Durante la remodelación de la cromatina, el
celulares, ya que es un protooncogen que parti-
papel de las RBP también es fundamental. Esta ac-
cipa en el splicing, exportación y traducción de
tividad de las RBP es novedosa, ya que no se cono-
ARNm. La hnRNP K se encuentra sobrexpresada
cían algunas de ellas que pudieran participar en
o tiene una localización intracelular aberrante en
la remodelación de la cromatina. Dos grupos de
cáncer colorectal, de próstata, hepático, de mama
RBP ejemplifican este caso: la familia de proteínas
y en leucemias.
Argonauta y la proteína heterogénea nuclear (hn)
hnRNP K. Las proteínas Argonauta se encuentran
Las RBP en la regulación de la expresión de los genes
en organismos de los tres dominios de la vida (Eu-
• Transcripción. El primer paso en la expresión
karya, Bacteria y Archaea) y sus secuencias están
de un gen es el proceso llamado transcripción, que
muy conservadas a lo largo de la evolución.
se describió anteriormente. Durante la transcrip-
Las Argonauta unen ARN a través de un do-
ción de un gen, se reclutan varios factores a la mo-
minio PAZ (PIWI/Argonauta/Zwille) y participan
lécula de ADN que se ensamblan sobre secuencias
principalmente en la regulación de la traducción
específicas de nucleótidos, los cuales permiten
de ARNm mediante el silenciamiento, que depen-
unir la ARN polimerasa II (RPII). Esta última es una
de de ARN cortos, conocidos como ARNsi (RNA
RBP formada por doce subunidades, que utiliza
pequeños interferentes o silenciadores). Recien-
ADN como templado para sintetizar ARN.
temente se ha observado que al asociarse con al-
La RPII tiene una secuencia en el carboxilo ter-
gunos ARN, las Argonauta se pueden unir al ADN
minal conocida como CTD; este es modificado por
y favorecer su compactación en heterocromatina.
fosforilación para regular su actividad, así como
En el caso de la hnRNP K, la conexión entre
su asociación con otras proteínas, entre ellas, RBP
diferentes actividades es aún más notable. Esta
que participan en la biogénesis del ARNm (por
RBP funciona como un conector entre la remode-
ejemplo, TAF15, un componente del factor de ini-
lación de la cromatina y varios pasos en la regu-
cio de la transcripción, TFIID). Por lo tanto, el CTD
lación de la expresión de genes. La hnRNP K se
de la RPII funciona como un sitio de andamiaje
une con proteínas del grupo Policomb (PcG) para
para el reclutamiento de RBP durante el proceso
permitir la compactación de la cromatina, inhi-
transcripcional y postranscripcional, permitiendo
biendo así la expresión de genes. Además, parti-
el acoplamiento de ambos eventos.
2 8 inventio
NARRACIONES DE LA CIENCIA Y LA TECNOLOGÍA
• Procesamiento de ARN. Durante su síntesis, la
hancers. Ambas funcionan como promotoras del
molécula de ARN sufre diferentes modificaciones,
procesamiento de ARNm por splicing. Además, SC-
las cuales incluyen la adición de un nucleótido en
35 promueve la transcripción de algunos genes al
el extremo de la molécula en el que inicia su sín-
favorecer la fosforilación del CTD de la RPII. Por lo
tesis (extremo 5’), conocido como “estructura de
tanto, SC-35 permite el acoplamiento de la trans-
caperuza” o “cap”; la adición de una secuencia de
cripción con el procesamiento postranscripcional.
poliadeninas en el extremo opuesto de la molé-
Además, se ha sugerido que SC-35 participa en el
cula (extremo 3’), y la remoción de secuencias de
transporte de ARNm, favoreciendo su exportación
la molécula de ARN por un mecanismo muy com-
a citoplasma. Por otro lado, estas dos proteínas
plejo, conocido como corte y empalme o splicing,
también están asociadas con la degradación de
en el que se unen secuencias de ARN, conocidas
ARNm por un mecanismo conocido como NMD
como exones, y se eliminan las secuencias co-
(degradación de ARN mediado por sinsentido,
nocidas como intrones. El resultado es el ARNm
nonsense-mediated RNA decay), proceso que se
maduro que puede ser exportado a citoplasma y
describirá más adelante.
traducido a proteína.
Para el procesamiento de ARNm por splicing, es
Gran parte de las RBP son proteínas multifun-
esencial la formación del mayor complejo de ribo-
cionales, es decir, que participan en diferentes
nucleoproteínas en la célula mencionado antes y
actividades biológicas, lo que les permite funcio-
llamado “spliceosoma”. Este complejo está confor-
nar como acopladores entre diferentes procesos
mado por ARN pequeños nucleares (U1, U2, U4,
celulares. Además de los citados en la sección
U5, U6, U4atac, U6atac, U11 o U12) y subconjuntos
anterior, otro ejemplo de RBP multifuncional es el
de alrededor de cien proteínas RBP con activida-
de los factores de splicing conocidos como SC-35
des de helicasas, nucleasas y RBP accesorias, como
y ASF/SF2. Estas son proteínas SR (factores de spli-
las proteínas Sm (o Lsm, en el caso del ARN U6),
cing llamados así por tener secuencias ricas en los
que dirigen el reconocimiento de secuencias entre
aminoácidos serina (S) y arginina (R)), que modifi-
los ARN pequeños nucleares y el ARNm. Las pro-
can el ARNm al unírsele mediante dominios RRM.
teínas Sm forman un anillo que envuelve al ARN y
Estas proteínas participan en la transcripción, pro-
son esenciales para la biogénesis, el transporte y la
cesamiento postranscripcional, exportación, esta-
actividad de las RNP pequeñas nucleares. Los ARN
bilidad y traducción del ARNm. En otras palabras,
pequeños nucleares se unen con el ARNm recién
en cada uno de los eventos moleculares en la ex-
sintetizado en un orden específico (U1 y U2, segui-
presión de un gen.
das por U4, U5 y U6) para marcar las regiones del
SC-35 y ASF/SF2 reconocen secuencias especí-
ARNm que serán cortadas por la actividad catalíti-
ficas del ARN, conocidas como mejoradores o en-
ca del complejo formado por U4 y U6, para unir los
inventio 2 9
exones, escindir los intrones y formar ARNm maduros listos para ser exportados a citoplasma.
En el caso del núcleo, este se comunica con el
citoplasma a través de un canal de comunicación
Las alteraciones en la localización y función
conocido como Complejo del Poro Nuclear (NPC).
de estas RBP se han asociado con el desarrollo de
Las proteínas que lo componen hacen contac-
cáncer, específicamente de leucemias, y de una
to con RBP que participan en la organización de
variedad de otras enfermedades. Se piensa que
la cromatina en el núcleo, en la regulación de la
esto podría deberse a que el mal funcionamiento
transcripción, el procesamiento postranscripcio-
de estas proteínas puede afectar la fidelidad de la
nal de ARN, y que seleccionan de forma activa
expresión génica y producir cambios en la organi-
ARNm procesados correctamente, permitiendo
zación o ensamblaje de la maquinaria involucrada
su exportación al citoplasma, donde pueden ser
en la transcripción de genes y el procesamiento
traducidos a proteínas por los ribosomas. El NPC
postranscripcional de los ARNm. Además, la pro-
es, entonces, no solo un canal que permite el pa-
ducción de formas aberrantes de ARNm por altera-
so regulado de moléculas, sino que participa ac-
ciones en el procesamiento por splicing podría fa-
tivamente en la regulación de la expresión de los
vorecer la transformación oncogénica de la célula
genes.6
debido a la síntesis de variantes de ARNm con po-
La exportación de los ARNm está mediada por
tencial oncogénico, como en el caso del síndrome
la maquinaria compuesta por las RBP ALY/REF y
mielodisplásico y de la leucemia mieloide aguda.
Tap. Estas se unen con otras RBP y con el NPC, pa-
• Exportación núcleocitoplásmica de ARNm.
Los pasos posteriores del procesamiento pos-
ra asociarse con el ARNm y traslocarlo en el citoplasma.
transcripcional de ARNm ocurren hacia la perife-
La síntesis, el procesamiento, el empaqueta-
ria del interior del núcleo y una vez que los ARNm
miento y la exportación del ARNm asociado con
salieron al citoplasma. Las células eucariontes po-
las RBP requieren de mecanismos muy finos de
seen una compartimentalización que les permite
control de calidad, ya que cualquier falla puede ori-
separar y regular diferentes funciones biológicas
ginar ARNm aberrantes que, si son exportados al
en microambientes definidos. A pesar de esta se-
citoplasma y traducidos a proteínas, pueden tener
paración física, los procesos que ocurren en el nú-
efectos deletéreos sobre la célula y favorecer el de-
cleo y citoplasma no están desconectados, ya que
sarrollo de enfermedades.
moléculas como las RBP y los ARN a los que se aso-
Uno de estos mecanismos es la vigilancia de-
cian permiten integrar las actividades celulares.
pendiente de SUMO y exosoma, establecido des-
Además, existen estructuras que funcionan como
de el NPC. Asociados con la cara nuclear del NPC
comunicadores entre estos microambientes.
se encuentran factores de vigilancia que parti-
Caterina Strambio-de-Castillia, Mario Niepel y Michael P. Rout, “The nuclear pore complex: bridging nuclear transport and
gene regulation”, Nature Reviews. Molecular Cell Biology, vol. 11, núm. 7, pp. 490-501.
6
3 0 inventio
NARRACIONES DE LA CIENCIA Y LA TECNOLOGÍA
cipan en el control de calidad de los ARNm. Los
• Traducción. La traducción es un proceso en
transcritos que no son correctamente procesados
el que, a partir de una molécula de ARNm (en un
son rápidamente degradados por el exosoma,
lenguaje de nucleótidos), se sintetiza una cadena
un complejo de exonucleasas y ARN helicasas. El
polipeptídica (traducido a un lenguaje de amino-
complejo TRAMP, formado por un ensamblaje de
ácidos). La maquinaria celular encargada de la tra-
varias RBP, se asocia con el NPC y participa en este
ducción de un ARNm es el segundo RNP de mayor
proceso. TRAMP poliadenila los ARNm aberrantes,
tamaño y complejidad en la célula, el ribosoma.8
marcándolos para ser procesados correctamente
o degradados por el exosoma.
Los ribosomas constan de dos subunidades
que están compuestas por cuatro moléculas de
Un mecanismo de control de calidad de los
ARNr y alrededor de ochenta proteínas ribosoma-
ARNm es el conocido como “degradación de ARN
les. Las proteínas S forman la subunidad pequeña,
mediado por sinsentido”, NMD (nonsense media-
y las L, la subunidad grande. La mayoría de estas
ted RNA decay), en el cual los ARNm con codones
proteínas tiene topología tipo barril β o sandwich
de paro prematuros son reconocidos y degra-
α/β. La integridad y estabilidad del ribosoma de-
dados para impedir la síntesis de una proteína
pende de interacciones proteína-ARN y proteína-
incompleta que pueda tener efectos deletéreos
proteína. Estas interacciones electrostáticas de-
sobre el funcionamiento celular.
penden del acoplamiento conformacional entre
7
Este mecanismo de control de calidad es prin-
ARN y proteínas, lo que asegura la especificidad
cipalmente citoplásmico, pero se ha observado
de la interacción. Las proteínas que forman parte
que proteínas SR, como SC-35 y ASF/SF2 pueden
de la superficie del ribosoma están más directa-
promover esta respuesta en el núcleo. Estos da-
mente involucradas en la interacción con ARN.
tos indican que existe una función adicional pa-
En este sentido, se sabe que las proteínas de
ra estos factores de splicing, que actúan no solo
la superficie del ribosoma S2, S16, L1, L2 y L3 son
sobre el procesamiento de ARNm (como se des-
responsables de las principales interacciones en-
cribió antes), sino también en la regulación de su
tre el ARNm y el ribosoma. Estas interacciones son
estabilidad. Se ha observado que, en tumores, el
imprescindibles para el reconocimiento correcto
mecanismo de NMD se encuentra inhibido, lo que
del ARNm por parte del ribosoma, ya que permi-
permite una desregulación génica favorable para
ten que se ensamble el complejo de inicio de la
la tumorogénesis.
traducción, formado a su vez por varias otras RBP.
Kristian E. Baker y Roy Parker, “Nonsense-mediated mRNA decay: Terminating erroneous gene expression”, Current Opinion in
Cell Biology, vol. 16, núm. 3, 2004, pp. 293-299.
8
John W. B. Hershey y William C. Merrick, “Pathway and mechanism of initiation of protein synthesis”, en John W. B. Hershey,
Michael B. Mathews y Nahum Sonenberg (eds.), Translational regulation of gene expression, Cold Spring Harbor Laboratory Press,
Cold Spring Harbor, 2000, pp. 33-88.
7
inventio 3 1
Para el inicio de la traducción, es necesario el reco-
todos los procesos biológicos; consecuentemen-
nocimiento de la estructura de “cap” y secuencias
te, las proteínas que se asocian a ARN juegan un
específicas en el ARNm, por una serie de RBP que
papel igualmente esencial en la biología.
se conocen como factores de inicio de la traduc-
Hemos hecho aquí una breve descripción de
ción eucariotes eIF (eukaryotic initiation factor),
algunas de las actividades celulares que, por de-
como eIF4F, que está constituido por eIF4E, eIF4A
pender de algún tipo de ARN, dependen de las
y eIF4G, los cuales hacen contacto con al menos
proteínas que se asocian con ARN y definen su for-
otras seis RBP.
ma, procesamiento, estabilidad y función.
Estos factores de inicio de la traducción favo-
Estas proteínas y los mecanismos celulares en
recen la interacción correcta entre el ARNm y las
los que participan están alterados en enfermeda-
subunidades del ribosoma para su traducción. La
des. La participación de RBP en cada aspecto del
alteración de cualquiera de los pasos, desde el en-
funcionamiento celular, desde la organización es-
samblaje del ribosoma hasta la traducción de un
tructural y funcional del núcleo hasta la regulación
ARNm, está asociada con diversas enfermedades,
de la expresión de genes, permite suponer que en
particularmente cáncer y enfermedades neuro-
los próximos años se seguirán encontrando nue-
degenerativas.
vas RBP, y que aprender sobre las funciones de
RBP permitirá, por una parte, entender mejor el
Importancia de la molécula de ARN
funcionamiento de la célula y, por otra, desarrollar
En las últimas dos décadas, las evidencias experi-
nuevas estrategias terapéuticas para interferir o
mentales acumuladas han dejado claro que la mo-
utilizar ARN y RBP en el tratamiento de un número
lécula de ARN es central en el funcionamiento de
creciente de enfermedades.
3 2 inventio
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