Problemas: Cambios conformacionales Problema I Para un péptido

Problemas: Cambios conformacionales
Problema I
Para un péptido de 10 aa, compare la degeneración del sistema si la transición
ovillo-a-hélice sigue el modelo de todo-o-nada, el modelo cooperativo, y el modelo
de cremallera. Evalúe la función de partición para los 3 modelos (usando =2x10-4
y s=1)
Problema II
Calcule las degeneraciones y entropías resultado de arrojar 10 veces la moneda y
obtener todas caras, y obtener mitad cara y mitad seca.
Problema III
Estime  para la transición desde una hélice 310 a una α-hélice , asumiendo que
ovillo- α-hélice es ≈10-4 y depende solamente de la diferencia de la entropía
conformacional.
Problema IV
El término de nucleación en la fusión del RNA de doble cadena es ≈10-7 . ¿Qué
longitud de esta doble hebra tendrá iguales probabilidades de comenzar a fundirse
en los extremos o en el interior?
Problema V
Secuencias alternadas de n pares de bases d(C∙G) pueden formar Z-DNA bajo
tensión de superenrrollamiento negativo en DNAs circulares de tamaño n + 4269.
Los estados intermedios de esta transición fueron observados como topoisómeros
con los siguientes valores de ∆Lk:
N
12
24
48
∆Lk
-12.5
-15.5
-22.0
Calcule el parámetro de nucleación y propagación para esta transición.