Clase 5-Elementos geneticos moviles

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Elementos genéticos móviles
Elementos genéticos móviles
Se pueden mover de un lado a otro del genoma
•Diferentes nombres:
•
•
•
•
•
Elementos controladores
Genes saltarines
Genes móviles
Transposones
Elementos transponibles
Elementos móviles
• Un número muy grande de copias de relativamente
pocas familias de secuencias
• Constituyen 25-50% del genoma de los mamíferos
• Tienen capacidad de moverse en el genoma
• De cientos a miles de pares de bases
• Transposición: el proceso de copiarse e insertarse
en nuevo sitio del genoma
• „ADN egoísta“: no cumple función en hospedero
Granos manchados resultan de la interacción de un elemento móvil con un gen de pigmentación
Descubrimiento
• En los 40s Barbara McClintock descubrió un
sitio en el cromosoma 9 de maíz que se rompía
frecuentemente
• Para romperse requería dos elementos:
– Ds (necesario para disociación)
– Ac (necesario para activar).
El elemento transponible Ds causa rompimiento
Se dio cuenta de que habían elementos móviles porque Ac era imposible de
mapear, en diferentes plantas mapeaba a diferentes sitios
El laboratorio de maíz de Rollins A. Emerson en la Universidad de Cornell, 1929
Premio
Nobel
1952
Cromosomas grandes
Visibles al microscopio de luz
vs
2000
Huso en azul, centrómeros en rojo,
cromosomas en verde
Fenotipos producidos por elementos
transponibles en granos
Ac se puede mover
a sí mismo y a
otros elementos
como Ds
Ds no se puede
mover solo
Manchas: células
con genotipos
diferentes
Poco a poco se fueron descubriendo
en otros
organismos
Cuando se descubrió que estaban en
la mayoría (tal vez todos) los
organismos se dio el Premio Nobel a
Barbara McClintock en 1983
Elementos transponibles en una rosa
Inserción de elementos
transponibles: no hay
pigmento
Se pierde elemento
transponible: color
Elementos móviles en
procariotas
Dos tipos de elementos en bacterias
• Elementos IS: cortos y pueden moverse pero no
tienen otros genes más que los que necesitan
para moverse
• Transposones: más largos, tienen genes
necesarios para movimiento y otros más
Elementos IS
• Primeros conocimientos moleculares de
elementos móviles: estudio de mutaciones de
E.coli causadas por inserción espontánea de
una secuencia de 1-2kb en medio del gen.
• Esas secuencias se denominaron secuencias
de inserción o elementos IS
• Existen más de 20 elementos IS en E.coli y
otras bacterias
Transposición de IS
• Transposición de un elemento IS: 1 de 105-107
células por generación
• Si la tasa fuera más alta: exceso de mutaciones
• Tasa pequeña: mayoría de células sobreviven,
propagan elementos IS. Los IS se pueden
insertar en plásmidos o virus lisogénicos y pasar
a otras células
Transferencia horizontal
Estructura elemento IS
aprox 50pb
Baja
expresión
Repeticiones Invertidas
5‘-GAGC----------GCTC-3‘
3‘-CTCG----------CGAG-5‘
Transposones en procariotas
Genes para transposición y otros más, como resistencia a Ab
Dos tipos de transposición en procariotas (y
eucariotas)
Conservativa o “cortar y pegar”
Inserción de un elemento genético móvil
Lo que varía
entre diferentes
elementos es el
tamaño de la
duplicación
Dos tipos de elementos móviles en
eucariotas
• Clase 1: retrotransposones
• Clase 2: transposones de ADN
Ciclo de vida de un retrovirus
Retrotransposones tienen características en
común con retrovirus
retrotranscriptasa
Para
maduración
ADN
cubierta
Retrotransposición
Elementos clase 2
• Similares a los de bacterias: son elementos
móviles de ADN
• Usan los mismos dos mecanismos de
transposición:
– Replicativo
– Conservativo
Elementos P de Drosophila son elementos de
ADN
Utilidad de transposones de ADN para
estudio de genes
• Se pueden insertar elementos P en genoma. Si
hay mutante interesante se busca gen mutante
localizando el elemento P. El gen mutante se
usa como sonda para identificar el gen silvestre.
• Elementos P se pueden usar para insertar
genes específicos en genomas.
Falta de correlación tamaño de genomacomplejidad del organismo
• Paradoja del valor C
• Ej: genoma de salamandra 20x más grande que
el humano
• Sí hay correlación: tamaño genoma y proporción
del genoma derivada de elementos
transponibles
Elementos transponibles en humanos
Autónomo: se pueden mover por sí mismos
No autónomos: requieren ayuda para moverse
SINES: aprovechan RT de LINEs del genoma. Ej: Alu
Importancia de elementos móviles en el
genoma humano
Constituyen más del 40% del genoma
Figure 4-17 Molecular Biology of the Cell (© Garland Science 2008)
Abundancia de elementos transponibles
Ej: Gen HGO (cuando está mutado causa alcaptonuria)
¿Cómo soportan los genomas tantas
inserciones?
• Mayoría elementos transponibles en intrones
– ¿Será que no se insertan en exones?
• Además, la gran mayoría están inactivos y no se
pueden mover
• En algunos casos la inserción parece darse con
mayor probabilidad en “sitios seguros” (como la
región centromérica)
Genoma del hospedero mantiene a elementos
genéticos móviles en “silencio”
Tamaño del genoma y cantidad de elementos
transponibles
Terapia Génica
• Uno de los métodos de terapia génica utiliza
mecanismo de retrovirus y transposones
• Aprovecha capacidad del retrovirus de insertar
ADN en el genoma del hospedero, para insertar
una copia correcta de un gen
Inmunodeficiencia severa combinada
• Defecto en linfocitos T y B
• Falla total del sistema inmune
• Niño burbuja
SCID
Terapia Génica SCID
Ensayo terapia génica para SCID
• Se insertó gen correcto en retrovirus
• Se curaron 20 niños
• 3 de ellos desarrollaron leucemia
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