ESTRUCTURAS SUPERSECUNDARIAS
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RESUMEN ESTRUCTURA de PROTEÍNAS 9 ESTRUCTURA 1ª 9 ESTRUCTURA 2ª TEMA 6 Secuencia de aa Alfa-hélice Beta-laminar Hélice de colágeno 9 Estructura supersecundaria ESTRUCTURAS SUPERSECUNDARIAS Colágeno 9 Dominio estructural: región compacta, plegada localmente, de la estructura terciaria. Conectados entre si por la hebra polipeptidica de toda la molécula 9 ESTRUCTURA 3ª Fibrosa Globular 9 ESTRUCTURA 4ª Protómeros Tres dominios en esta representación de la Piruvato quinasa 1 ESTRUCTURAS SUPERSECUNDARIAS ESTRUCTURAS SUPERSECUNDARIAS a-hélice 9 En proteínas con estructura terciaria globular 9 combinaciones de estructuras al azar α y β; solo α ; solo β. 9 con una disposición característica que se repite en distintos tipos de proteínas Hélice-giro-Hélice Ej: proteínas que interaccionan con el DNA. 9 son los llamados motivos estructurales o estructuras supersecundarias α-hélice hélicegiro-hélice coiled-coil Mano EF 4 hélices estructura β Horquilla β Meandro β Barril β Hélice β α-β β−α−β Rossmann ESTRUCTURAS SUPERSECUNDARIAS a-hélice Coiled-coil Ej: "cremallera de leucina" que aparece frecuentemente en proteínas que interaccionan con el DNA. Interacción DNA-proteína • Proteínas reguladoras de los genes contienen “motivos” estructurales específicos para interactuar con el DNA. • Muchas de estas proteínas son factores de transcripción a) hélice-vuelta-hélice b) Dedos de cinc c) Cremallera de leucinas (= coiled-coil) 2 Los giros también conectan hélices Dedo de zinc y forman motivos funcionales E Mano EF Ej: calmodulina F Ca 2+ Motivo de unión a DNA Cremallera de leucinas Motivo de unión a calcio ESTRUCTURAS SUPERSECUNDARIAS a-hélice Mano E-F Está presente en proteínas que se unen a calcio como la calmodulina o la troponina-C. La unión al Ca++ (átomo de color verde en la Figura izquierda y de color naranja en la Figura derecha) 3 Estructuras tipo de proteínas globulares α-giro-α ESTRUCTURAS SUPERSECUNDARIAS estructura β Horquilla beta barril 4 hélices empaquetadas Dos estructuras β adyacentes se orientan de forma antiparalela, no se le relaciona con ninguna función concreta. Meandro β silla representació n lineal vuelta β ESTRUCTURAS SUPERSECUNDARIAS estructura β Barril beta Numerosas estructuras β orientadas de forma antiparalela se entrecruzan entre sí dando lugar a una especie de canasta o barril, donde los residuos hidrofóbicos se acumulan en el interior. Ej: proteína que une retinol, 4 Los giros son flexibles y están involucrados Clave o llave griega en diversas funciones biológicas representación lineal Hojas β (antiparalelas) 5 ESTRUCTURAS SUPERSECUNDARIAS estructura α-β ESTRUCTURAS SUPERSECUNDARIAS α-β beta-alfa-beta beta-alfa-beta UNIDAD β-α-β hélice-α representación lineal Conformación β Estructura de Rossmann Ej: proteínas que se unen a nucleótidos Plegamiento β-α 6 Estructuras tipo de proteínas globulares Hélice-giro-hélice barril 4 hélices empaquetadas silla 7
