Cultivo de microorganismos

Microbiología General
Tema 2.- Cultivo de microorganismos.
Tema 2.- Cultivo de microorganismos.
Crecimiento microbiano. Cultivo de microorganismos. Medios de cultivo. Métodos de
aislamiento. Concepto de cultivo puro. Crecimiento microbiano en medio líquido. Crecimiento microbiano en medio sólido. Concepto de muerte de un microorganismo. Medida del crecimiento y enumeración de microorganismos. Crecimiento microbiano
equilibrado. Cinética de crecimiento de un cultivo estanco. Factores físicos y químicos
que influyen en el crecimiento. Rendimiento de los cultivos. Cinética de crecimiento en
un cultivo continuo. Tipos de fermentadores.
Bibliografía recomendada: Cap. 1 de la 8ª edición de Brock: Biología de los microorganismos
CRECIMIENTO MICROBIANO
Entendemos por crecimiento microbiano el aumento del número de microorganismos a lo largo del tiempo. Por tanto, no nos referimos al crecimiento de un único microorganismo que denominaremos ciclo celular, sino al demográfico de una población.
En este tema nos centraremos en el crecimiento de bacterias, el estudio que se hace
puede servir también para entender el crecimiento de levaduras y de otros hongos. El
crecimiento de los virus se produce de otra forma diferente y será tratada al final de este
capítulo.
Denominamos ciclo celular al proceso de desarrollo de una bacteria aislada. A lo
largo del ciclo celular tiene lugar la replicación del material genético, la síntesis de
componentes celulares, la elongación de la bacteria para alcanzar un tamaño doble del
inicial y su división por bipartición para dar lugar a dos células hijas. La duración del
ciclo celular coincide con el tiempo de generación y depende, en general, de los mismos
factores de los que depende este.
El crecimiento de una población resulta de la suma de los ciclos celulares de todos
los individuos de dicha población.
Los cultivos de microorganismos de los que hemos hablado son asincrónicos puesto
que en ellos cada microorganismo se encuentra en un punto diferente del ciclo celular.
Por consiguiente, en un momento determinado en un cultivo se encuentran células que
acaban de dividirse, otras que están replicando su ADN, otras que están credciendo,
otras que están iniciando la división celular, etc.
En un cultivo sincrónico todas las células se encuentran simultáneamente en la
misma fase del crecimiento celular.
Los cultivos sincrónicos son muy difíciles de mantener por lo que su importancia
está principalmente ligada a los estudios básicos de biología microbiana. Sin embargo,
en la naturaleza, las bacterias del suelo se encuentran en condiciones de crecimiento
próximas a la fase estacionaria (en la que se produce una cierta sincronización del cultivo) y, por consiguiente, durante cierto tiempo las poblaciones naturales probablemente
se comporten como relativamente sincrónicas.
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Las poblaciones de bacterias crecen de forma explosiva acumulando grandes números en un periodo de tiempo muy reducido. Puesto que el efecto de los microorganismos
es en la mayoría de los casos depende de su número, entender cómo se produce el crecimiento microbiano es importante para poder evitar o reducir sus efectos nocivos y
potenciar los beneficiosos o aplicados.
CULTIVO DE MICROORGANISMOS
El cultivo de microorganismos consiste en proporcionarles las condiciones físicas,
químicas y nutritivas adecuadas para que puedan multiplicarse de forma controlada. En
general, podemos distinguir cultivos líquidos y sólidos en función de las características
del medio y cultivos discontinuos y continuos en función de la disponibilidad de nutrientes en el medio.
MEDIOS DE CULTIVO
Un microorganismo necesita para crecer nutrientes que le aporten energía y elementos químicos para la síntesis de sus constituyentes celulares. Dependiendo de la fuente
de carbono que utilizan, los microorganismos se pueden clasificar en autotrofos si es el
CO2 atmosférico (microorganismos que fotosintetizan) y heterotrofos si utilizan carbono orgánico.
La fórmula elemental de un microorganismo es, aproximadamente,
C4H7O2N
lo que supone que los componentes de las células son: carbono que representa alrededor del 50% del peso seco, oxígeno (32%), nitrógeno (14%), fósforo (3%), azufre (en
torno al 1%) y otros elementos traza entre los que se encuentran Fe, K, Mg, Mn, Co,
Mb, Cu y Zn.
La elaboración de medios de cultivo requiere proporcionar los elementos antes citados en una forma asimilable. Así, por ejemplo, el C debe estar en forma de carbono orgánico para los heterotrofos y como CO2 para los autotrofos, el N en forma de NH4, de
NO3- o de NO2- o en forma de aminoácidos a los que se pueda tomar su grupo amino; el
P debe estar en forma de PO43-, el S procede de aminoácidos sulfurados o de SO42-, etc.
Además, en ciertos casos, es necesario añadir a los medios de cultivo algunos aminoácidos o vitaminas que determinados tipos de microorganismos no pueden sintetizar.
En el caso de la levadura del pan (Saccharomyces cerevisiae) la fórmula elemental
más concreta es:
C3.72H6.11O1.95N0.61S0.017P0.035K0.056
esta composición puede variar ligeramente en función de las condiciones de cultivo o de
fase de crecimiento. El conocimiento de la fórmula elemental del microorganismo que
se cultiva facilita la formulación del medio de cultivo más adecuado para el mismo.
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Los medios de cultivo se pueden clasificar en definidos cuando su composición
química se conoce totalmente y complejos cuando no es el caso porque están compuestos por mezclas de extractos de materiales complejos (extracto de levadura, extracto
de carne, etc.).
Por otra parte, los medios de cultivo pueden ser líquidos o sólidos si se añade algún
agente solidificante que no sea consumible por los microorganismos (normalmente
agar).
En función de los microorganismos que pueden crecer en ellos, los medios pueden
ser generales, selectivos cuando favorecen el crecimiento de ciertos microorganismos
mientras suprimen el de otros (por ejemplo, el medio SPS para clostridios), diferenciales cuando alguno de sus componentes permite identificar las colonias de un tipo de
microorganismos (por ejemplo medios con hematíes para identificar colonias de microorganismos hemolíticos), selectivo-diferenciales cuando combinan las dos características anteriores (por ejemplo, el agar de MacConkey para identificar Escherichia coli), y
medios de enriquecimiento que permiten aislar un tipo determinado de microorganismo a partir de una mezcla una población mixta de gran tamaño.
MÉTODOS DE AISLAMIENTO
El aislamiento de bacterias a partir de muestras naturales se realiza, en la mayoría de
los casos, mediante la producción de colonias aisladas en cultivos sólidos. El crecimiento explosivo de las bacterias permite producir un gran número de ellas a partir de
una única célula inicial de forma que, tras un periodo de incubación en las condiciones
ambientales adecuadas, se produce una colonia observable a simple vista y formada por
individuos iguales (un clon bacteriano).
Sin embargo, no todos los microorganismos presentes en las muestras ambientales
son cultivables (microorganismos no cultivables). Esto es debido a dificultades intrínsecas en el cultivo (microorganismos parásitos de otros), al desconocimiento de los requerimientos específicos de cultivo, y a la existencia de grupos de microorganismos que
deben mantenerse en equilibrio para poder sobrevivir (casos de sintrofía por ejemplo).
Se estima que en sólo en torno al 1% de las bacterias del suelo al 0,1 - 0,01 % de las
bacterias marinas son cultivables.
Existen procedimientos de enriquecimiento del número de bacterias de ambientes
naturales para facilitar su aislamiento. Uno de ellos es la Columna de Winogradski
que crea un microcosmos para enriquecer el número de ciertos tipos de microorganismos presentes en ambientes naturales con objeto de facilitar su aislamiento.
CONCEPTO DE CULTIVO PURO
Se denomina cultivo puro (axénico) al que contiene sólo un tipo de microorganismos. Los cultivos puros se inician a partir de colonias aisladas, de manera que todos los
individuos del mismo tengan la misma composición genética. Los cultivos puros son
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esenciales para poder estudiar las características de los microorganismos y para poder
identificarlos con seguridad.
Sin embargo, cada vez se va conoce más sobre el funcionamiento de las comunidades bacterianas lo que debe hacernos reflexionar sobre el hecho de que un cultivo puro
supone unas condiciones no naturales y que, por consiguiente, la fisiología de los microorganismos en ambientes naturales puede ser diferente de la que presentan en condiciones de cultivos puros.
CRECIMIENTO MICROBIANO EN MEDIO LÍQUIDO
Si la bacteria crece en un medio líquido, en la mayoría de los casos las células que se
producen en cada división continúan su vida independientemente formándose una suspensión de células libres.
En un cultivo discontinuo de bacterias en medio líquido, se pueden diferenciar cuatro
fases en la evolución de los parámetros que miden el crecimiento microbiano:
1.- Fase lag o de adaptación durante la que los microorganismos adaptan su metabolismo a las nuevas condiciones ambientales (abundancia de nutrientes y condiciones
de cultivo) para iniciar la fase de crecimiento exponencial.
2.- Fase exponencial o logarítmica: en ella la velocidad de crecimiento es máxima y
el tiempo de generación es mínimo. Durante esta fase las bacterias consumen a velocidad máxima los nutrientes del medio. La evolución del número de células durante esta
fase se explica con los modelos matemáticos que describiremos a continuación.
3.- Fase estacionaria: en ella no se incrementa el número de bacterias (ni la masa u
otros parámetros del cultivo). Las células en fase estacionaria desarrollan un metabolismo diferente al de la fase exponencial y durante ella se produce una acumulación y liberación de metabolitos secundarios que pueden tener importancia industrial.
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Los microorganismos entran en fase estacionaria porque se agota algún nutriente
esencial del medio o porque los productos de desecho que han liberado durante la fase
exponencial hacen que el medio sea inhóspito para el crecimiento microbiano.
La fase estacionaria tiene gran importancia porque probablemente represente con
mayor fidelidad el estado metabólico real de los microorganismos en los ambientes naturales.
4.- Fase de muerte: se produce una reducción del número de bacterias viables del
cultivo.
CRECIMIENTO MICROBIANO EN MEDIO SÓLIDO
Las fases, parámetros y cinética de crecimiento discutidas para el caso de los cultivos
líquidos se presentan también en cultivos sólidos. La cinética de crecimiento, en este
caso, se puede estudiar siguiendo la evolución del número de células viables por unidad
de superficie o por unidad de masa.
Cuando una célula aislada e inmóvil comienza a crecer sobre un substrato sólido, el
resultado del crecimiento al cabo del tiempo es una colonia. Por consiguiente, se denomina unidad formadora de colonia (UFC) a una célula bacteriana viva y aislada que si
se encuentra en condiciones de substrato y ambientales adecuadas da lugar a la producción de una colonia en un breve lapso de tiempo. Si el número inicial de bacterias por
unidad de superficie es muy alto, la confluencia de las colonias da lugar a lo que se llama un césped cuando se realizan los cultivos en placas de laboratorio.
En el caso de microorganismos móviles (deslizantes) o en el de los hongos filamentosos que tienen un crecimiento trófico no se producen colonias aisladas sino formaciones más difusas o miceliares.
CONCEPTO DE MUERTE DE UN MICROORGANISMO
Desde el punto de vista microbiológico, un microorganismo muere cuando pierde de
forma irreversible la capacidad de dividirse. Como consecuencia de esta pérdida, no se
produce aumento en el número de microorganismos y, por tanto, no hay crecimiento.
Sin embargo, un microorganismo puede estar muerto desde el punto de vista microbiológico y continuar desarrollando una actividad metabólica que se traduzca, por ejemplo,
en liberación de toxinas.
Por otra parte, hay que considerar que la capacidad de multiplicación (crecimiento)
de un microorganismo puede verse transitoriamente afectada por lesiones o por las condiciones físicas o químicas del entorno. En estos casos, podríamos considerar como
muertos microorganismos que pueden reanudar su crecimiento si las condiciones son de
nuevo favorables.
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MEDIDA DEL CRECIMIENTO Y ENUMERACIÓN DE MICROORGANISMOS
Existen diferentes sistemas para detectar y medir el crecimiento de microorganismos.
Los principales, se enumeran a continuación:
1.- Recuento directo: consiste en la observación al microscopio de volúmenes muy
pequeños de suspensiones de bacterias. Se usan unos portaobjetos especiales denominados cámaras de Petroff-Hausser. Para que la medida sea correcta es necesario que la
densidad de células sea del orden de 105 por ml.
2.- Medida de la masa de células: el sistema se basa en que las células en suspensión dispersan la luz causando la turbidez del cultivo. La turbidez depende de la masa en
suspensión y, por tanto, midiendo esta se puede estimar aquella. Este es el parámetro de
medida más fácil de usar en los cultivos de laboratorio. La densidad de células debe ser
del orden de 105 por ml.
3.- Recuento de viables: consiste en sembrar un volumen determinado de cultivo o
muestra sobre el medio de cultivo sólido adecuado para estimar el número de viables
contando el número de colonias que se forman puesto que cada una de estas deriva de
una célula aislada. Para que la medida sea correcta desde el punto de vista estadístico, es
necesario contar más de 300 UFC.
En ciertas ocasiones en las que la densidad de microorganismos es demasiado baja,
éstos se pueden recolectar por filtración a través de una membrana (de 0.2 µm de tamaño de poro) y posterior colocación de la membrana en un medio de cultivo adecuado
para que se formen las colonias.
4.- Medida del número de partículas usando contadores electrónicos de partículas.
Estos sistemas no nos indican si las partículas corresponden a células vivas o muertas;
pero nos pueden dar una idea del tamaño de las partículas.
5.- Medida de parámetros bioquímicos tales como la cantidad de ADN, ARN,
proteínas, peptidoglicano, etc. por unidad de volumen de cultivo.
6.- Medida de actividad metabólica de las bacterias como que respiran producen
una disminución del potencial redox del medio en que se encuentran como consecuencia
del consumo de oxígeno (utilización de colorantes sensibles a oxidación-reducción tales
como el azul de metileno).
CRECIMIENTO MICROBIANO EQUILIBRADO
Se denomina crecimiento equilibrado a aquél en el que todos los parámetros del
cultivo (biomasa, número de células, cantidad de proteínas, de ADN, etc.) evolucionan
en paralelo. El crecimiento equilibrado probablemente ocurra en muy contadas ocasiones en condiciones naturales. Por tanto, es principalmente un concepto de aplicación en
el laboratorio (o en microbiología industrial). Sin embargo, es útil porque permite estudiar el crecimiento microorganismos.
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CINÉTICA DE CRECIMIENTO DE UN CULTIVO DISCONTINUO
En este apartado vamos a revisar el estudio de la cinética del crecimiento de microorganismos que crecen aislados que no forman ningún tipo de estructura. Esta es la
forma de crecimiento de la levadura (hongo unicelular) y de las bacterias.
Es importante conocer la cinética de crecimiento de los cultivos microbianos para
predecir cómo va a evolucionar un cultivo, cómo va a ir consumiéndose el substrato y
cómo se van a ir acumulando los productos del cultivo. Sin conocer estos factores es
muy imprudente iniciar el cultivo en un fermentador de 10.000 litros, por ejemplo, con
el coste que ello supone, puesto que no podemos predecir qué va a pasar, cuándo va a
completarse el crecimiento, cómo se va a acumular el producto, etc.
Las células aisladas cultivadas en un volumen finito de medio de cultivo apropiado
van utilizando los nutrientes que tienen disponibles con la mayor eficiencia y rapidez
que pueden, sintetizando sus propios componentes celulares y dividiéndose en cuanto
han podido duplicar su masa y su material genético. El tiempo que tarda una célula en
hacer todo lo anterior es lo que conocemos como tiempo de generación (τ) y puede
variar desde unos 20 minutos en condiciones óptimas hasta varios meses en condiciones
del suelo. Cada vez que transcurre un tiempo de generación, el número de células se
duplica, siguiendo, por tanto, un incremento exponencial.
TRATAMIENTO DEL CRECIMIENTO COMO PROGRESIÓN GEOMÉTRICA
Las bacterias crecen siguiendo una progresión geométrica en la que el número de
individuos se duplica al cabo de un tiempo determinado denominado tiempo de generación (τ). De esta forma, podemos calcular el número de bacterias (N) al cabo de un número de generaciones (n) usando la ecuación siguiente:
N = N0 2n
(ecuación 1)
siendo N0 el número de células en el momento actual. El número de generaciones se
puede calcular de la siguiente forma:
n=t/τ
(ecuación 2)
donde t es el tiempo transcurrido.
Por consiguiente, combinando las ecuaciones 1 y 2:
N = N0 2t/τ
(ecuación 3)
Los tiempos de generación de bacterias creciendo en ambientes favorables pueden
ser muy cortos (valores de τ de 20 min). Esto lleva a que una única célula (N0=1) creciendo con un τ = 20 min, llegue a poder producir 4.7 x 1021 células en 24 horas.
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Las ecuaciones exponenciales son muy difíciles de manejar gráficamente, por ello es
mejor transformarlas en otras más simples. Para transformar una ecuación exponencial
en una recta, tomamos logaritmos en los dos términos y resulta:
lnN = lnN0 + (t/τ) ln2
(ecuación 4)
Esto es: el logaritmo del número de células crece linealmente con el tiempo a razón
de una constante igual a ln2/τ. Si el tiempo de generación τ es muy grande, el crecimiento tendrá poca pendiente (será lento) y si τ es pequeño el crecimiento será rápido.
En un crecimiento equilibrado, todos los parámetros de crecimiento (número de células, biomasa de cultivo, acumulación de metabolitos primarios, proteínas, ácidos nucleicos etc.) evolucionan en paralelo. Por tanto, en la ecuación anterior N puede representar cualquiera de estos factores.
TRATAMIENTO DEL CRECIMIENTO EN FUNCIÓN DE LA TASA DE CRECIMIENTO µ
Otra forma de representar la cinética es considerando el incremento en el número de
células (dN) en un intervalo corto de tiempo (dt). En este caso, la ecuación que describe
la cinética es la siguiente:
dN/dt = µN
(ecuación 5)
esto es: el incremento del número de células (dN) por unidad de tiempo (dt) es proporcional al número de células presentes en el cultivo (N). A la constante de proporcionalidad (µ) se le denomina tasa de crecimiento.
Integrando la ecuación anterior durante el tiempo de cultivo, se transforma en la siguiente función exponencial:
N = N0 eµt
(ecuación 6)
la transformación de esta ecuación en una recta (tomando logaritmos) rinde lo siguiente:
lnN = lnN0 + µt
(ecuación 7)
esto es: el incremento del logaritmo del número de células aumenta linealmente con el
tiempo siendo la constante de proporcionalidad µ.
Comparando esta ecuación (7) con la similar presentada más arriba (4), podemos
concluir que µ = ln2/τ y, por consiguiente, que τ = ln2/µ. Es decir, que hay una correlación inversa entre el valor de la tasa de crecimiento (µ) y el tiempo de generación (τ).
Estas ecuaciones nos permiten predecir cuál será el número de células, masa celular,
etc. después de un cierto tiempo de cultivo (t) si conocemos µ; o bien, poder calcular la
tasa de crecimiento µ a partir de medidas experimentales del incremento en el número
de células, biomasa, etc.
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12.- FACTORES FÍSICOS Y QUÍMICOS QUE INFLUYEN EN EL CRECIMIENTO.
1.- Temperatura: Cada microorganismo tiene una temperatura de crecimiento adecuada. Si estudiamos la variación de la velocidad de crecimiento en función de la temperatura de cultivo, podemos observar una temperatura mínima por debajo de la que
no hay crecimiento; a temperaturas mayores se produce un incremento lineal de la velocidad de crecimiento con la temperatura de cultivo hasta que se alcanza la temperatura
óptima a la que la velocidad es máxima. Por encima de esta temperatura óptima, la velocidad de crecimiento decae bruscamente y se produce la muerte celular.
El incremento de la velocidad de crecimiento con la temperatura se debe al incremento generalizado de la velocidad de las reacciones enzimáticas con la temperatura. Se
denomina coeficiente de temperatura a la relación entre el incremento de la velocidad
de reacción y el de temperatura. En términos generales, la velocidad de las reacciones
bioquímicas suele aumentar entre 1.5 y 2.5 veces al aumentar 10ºC la temperatura a la
que tienen lugar.
La falta de crecimiento a temperaturas muy bajas se debe a la reducción de la velocidad de crecimiento por la reducción de la velocidad de reacción y al cambio de estado
de los lípidos de la membrana celular que pasan de ser fluidos a cristalinos impidiendo
el funcionamiento de la membrana celular.
La muerte a altas temperaturas se debe a la desnaturalización de las proteínas y a las
alteraciones producidas en las membranas lipídicas a esas temperaturas.
Es importante tener en cuenta que a temperaturas bajas, el metabolismo celular se
enlentece y las células paran de crecer; aunque no tienen porqué morir. Sin embargo,
cuando la temperatura es superior a la óptima, se produce la muerte celular rápidamente
y las células no pueden recuperar su capacidad de división si baja posteriormente la
temperatura. Esto permite esterilizar por calor y no por frío.
Hay varios tipos de microorganismos en función de sus temperaturas de crecimiento mínima, máxima y óptima.
Tipo de
Temperatura Temperatura Temperatura
microorganismo
mínima
óptima
máxima
Psicrófilo
-5 +5
12 - 15
15 - 20
Psicrótrofo
-5 +5
25 - 30
30 - 35
Mesófilo
5 - 15
30 - 45
35 - 47
Termófilo
40 - 45
55 - 75
60 - 90
Los microorganismos psicrótrofos son mesófilos que pueden crecer a temperaturas
bajas. Por tanto, se les puede considerar como psicrófilos facultativos. Esto es importante desde el punto de vista aplicado porque cuando se encuentran contaminando alimentos, son capaces de crecer en condiciones de refrigeración (4 - 8ºC) y de producir
infecciones en los consumidores del alimento (30 - 35 ºC).
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Los microorganismos capaces de producir infecciones son los mesófilos y algunos
psicrótrofos ya que sus temperaturas óptimas de crecimiento coinciden con las corporales. sin embargo, tanto mesófilos como psicrófilos, psicrótrofos y termófilos pueden
producir toxinas causantes de intoxicaciones alimentarias.
2.- Actividad de agua: Se denomina actividad de agua a la relación entre la presión
de vapor de agua del substrato de cultivo (P) y la presión de vapor de agua del agua pura
(P0). El valor de la actividad de agua está relacionado con el de la humedad relativa
(HR).
El valor de la actividad de agua nos da una idea de la cantidad de agua disponible
metabólicamente. Por ejemplo: comparemos el agua pura donde todas las moléculas de
agua están libremente disponibles para reacciones químicas con el agua presente en una
disolución saturada de sal común (NaCl) donde una parte importante de las moléculas
de agua participa en la solvatación de los iones de la sal disuelta. En este último caso, la
actividad de agua es mucho menor que en el primero. Conforme aumenta la cantidad de
solutos en el medio, disminuye su actividad de agua.
Cuando un microorganismo se encuentra en un substrato con una actividad de agua
demasiado baja, su crecimiento se detiene. Esta detención del crecimiento no suele llevar asociada la muerte del microorganismo, sino que éste se mantiene en condiciones de
resistencia durante un tiempo más o menos largo. En el caso de las esporas, la fase de
resistencia puede ser considerada prácticamente ilimitada.
La gran mayoría de los microorganismos requiere unos valores de actividad de agua
muy altos para poder crecer. De hecho, los valores mínimos de actividad para diferentes
tipos de microorganismos son, a título orientativo, los siguientes: bacterias aw >0.90,
levaduras aw>0.85, hongos filamentosos aw >0.80. Como puede verse, los hongos filamentosos son capaces de crecer en substratos con una actividad de agua mucho menor
(mucho más secos) de la que permite el crecimiento de bacterias o de levaduras. Por
esta razón se puede producir deterioro de alimentos de baja actividad de agua (por
ejemplo, el queso o almíbares) por mohos (hongos filamentosos) y no por bacterias.
En función de su tolerancia a ambientes con baja aw, los microorganismos que pueden crecer en estas condiciones se clasifican en halotolerantes, halófilos y xerófilos
según toleren o requieran condiciones salinas o hipersalinas, respectivamente.
La reducción de la actividad de agua para limitar el crecimiento bacteriano tiene importancia aplicada en industria alimentaria. La utilización de almíbares, salmueras y
salazones reduce la actividad de agua del alimento para evitar su deterioro bacteriano.
3.- pH: Es un parámetro crítico en el crecimiento de microorganismos ya que cada
tipo de microorganismo sólo puede crecer en un rango estrecho de pH fuera del cual
mueren rápidamente.
El pH intracelular es ligeramente superior al del medio que rodea las células ya que,
en muchos casos, la obtención de energía metabólica depende de la existencia de una
diferencia en la concentración de protones a ambos lados de la membrana citoplásmica.
El pH interno en la mayoría de los microorganismo está en el rango de 6.0 a 7.0.
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Los rangos de pH tolerables por diferentes tipos de microorganismos son, también,
distintos. Hay microorganismos acidófilos que pueden vivir a pH=1.0 y otros alcalófilos que toleran pH=10.0
Hay que considerar que, como consecuencia del metabolismo, el pH del medio de
crecimiento suele tender a bajar durante el cultivo. Por otra parte, la bajada del pH del
medio que producen ciertos microorganismos les confiere una ventaja selectiva frente a
otros microorganismos competidores. Así, por ejemplo, las bacterias lácticas que producen grandes cantidades de ácido láctico como consecuencia de su metabolismo primario
reducen el pH del medio de cultivo a valores inferiores a los soportables por otras bacterias competidoras (llegan a bajar el pH del medio hasta 4.5). De esta forma, las bacterias
competidoras mueren y las lácticas se convierten en la población dominante.
La bajada del pH se puede deber a varios factores, uno de los cuales es la liberación
de ácidos orgánicos de cadena corta (fórmico, acético, láctico) por ciertas bacterias. En
este sentido, hay que tener en cuenta que la acción bactericida de estos ácidos orgánicos
de cadena corta es más potente que la debida únicamente a la bajada del pH que producen. Esto es, los ácidos orgánicos de cadena corta son tóxicos para algunas bacterias por
sí mismos.
El efecto letal del pH ácido sobre los microorganismos tiene aplicación en la conservación de alimentos acidificándolos. De esta forma, la adición de ácido acético en forma
de vinagre permite la conservación de alimentos perecederos (escabeches, por ejemplo)
y la producción de ácidos en el curso de fermentaciones naturales permite alargar la
vida de los alimentos (coles fermentadas, por ejemplo).
4.- Potencial redox: nos indica la capacidad del substrato para aceptar o donar electrones, esto es: sus características oxidantes o reductoras. Uno de los factores que intervienen en el potencial redox, aunque no el único, es la concentración de oxígeno
[O2].
Hay microorganismos que requieren ambientes oxidantes para crecer, mientras que
otros necesitan ambientes reductores. El metabolismo de ambos tipos de microorganismos presenta diferencias notables. El requerimiento de condiciones oxidantes o reductoras no debe confundirse con la necesidad de presencia o ausencia de oxígeno para que
se produzca el crecimiento.
En general, cuando un microorganismo requiere un ambiente oxidante se dice que
desarrolla un metabolismo oxidativo (o respirativo) mientras que los microorganismos
que requieren ambientes reductores (o menos oxidantes) realizan un metabolismo fermentativo.
Un microorganismo es aerobio cuando necesita oxígeno para vivir y es anaerobio
cuando o bien no lo necesita (anaerobios facultativos como las bacterias entéricas, o
como Saccharomyces cerevisiae; o anaerobios aerotolerantes como las bacterias lácticas) o cuando muere en presencia de oxígeno (anaerobios estrictos como los clostridios).
Hay microorganismos que viven en ambientes carentes de oxígeno (anaerobios) que,
sin embargo, llevan a cabo un metabolismo oxidativo porque usan otro aceptor final de
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Tema 2.- Cultivo de microorganismos.
electrones que actúa como oxidante ambiental. Por ejemplo, las bacterias que "respiran"
nitratos (NO3-), sulfatos (SO42-) u otros compuestos orgánicos oxidados (respiración
anaerobia).
Hay microorganismos que, aunque viven en presencia de oxígeno, no son capaces de
utilizarlo como aceptor final de electrones y deben desarrollar un metabolismo fermentativo (las bacterias lácticas que son anaerobias aerotolerantes, por ejemplo).
Por otra parte, hay microorganismos que pueden desarrollar ambos tipos de metabolismo. Esto es: en presencia de oxígeno desarrollan un metabolismo oxidativo y en su
ausencia, fermentativo. El rendimiento de los procesos fermentativos es menor que el
de los respirativos: las bacterias y las levaduras producen menos biomasa cuando crecen
fermentando que cuando lo hacen respirando.
En el curso de ciertas reacciones metabólicas redox se forman compuestos altamente reactivos (radicales libres, formas superóxido) que pueden dañar las proteínas, membranas y ácidos nucleicos produciendo la muerte de las células. Las células se defienden
de estos compuestos reactivos mediante las enzimas siguientes: Superóxido dismutasa
(SOD) y catalasa. Los anaerobios estrictos carecen de SOD y de catalasa o tienen niveles muy bajos de estas enzimas de forma que no pueden sobrevivir en presencia de
oxígeno. La detección de estas enzimas tiene valor taxonómico.
13.- RENDIMIENTO DE LOS CULTIVOS.
El gráfico siguiente representa la variación de la biomasa (o número de células, etc.)
de un cultivo a lo largo del tiempo. En este cultivo, se va consumiendo un substrato cuya concentración decrece de forma proporcional al crecimiento de la biomasa.
Definiremos el rendimiento de utilización del substrato (Ys) al valor que representa la cantidad de biomasa producida por unidad de substrato consumido:
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Ys = dN/dS
(ecuación 8)
El rendimiento de utilización de diferentes substratos puede ser diferente (hay substratos, o alimentos, que "engordan"1 más que otros), varía entre diferentes microorganismos (hay microorganismos que "engordan" más que otras comiendo lo mismo) y
varía también en función de otras condiciones ambientales o fisiológicas (no engorda lo
mismo uno al comer algo si está sano o enfermo o si está en verano o en invierno).
También varía el rendimiento en función de que el metabolismo sea oxidativo o fermentativo (estos conceptos serán revisados más adelante).
Podemos calcular el rendimiento de la utilización del substrato en función de la cantidad de substrato añadido al cultivo, o en función de la cantidad de carbono presente en
ese substrato (por ejemplo). Asimismo, podemos calcular la cantidad de biomasa total
(gramos de células, por ejemplo) o de carbono presente en las células (aproximadamente el 50% de la masa celular corresponde a carbono).
Haciendo las transformaciones que se indican a continuación sobre la fórmula que
relaciona la variación de biomasa con la de substrato (8), llegamos a la definición de un
nuevo concepto qs denominado tasa específica de consumo de substrato por el organismo.
Ys = dN/dS
(ecuación 8)
dN/dt = Ys (dS/dt)
(ecuación 9)
(dN/dt)/N = Ys (dS/dt)/N
(ecuación 10)
como, de acuerdo con la ecuación (5), µ = (dN/dt)/N,
µ = Ys qs
(ecuación 11)
Esto es, la tasa específica de consumo de substrato (qs) la podemos considerar la
"velocidad" con la que el organismo consume el substrato. Evidentemente, cuanto mayor sea la tasa de consumo mayor será la tasa de crecimiento (µ).
qs = Ys/µ
(ecuación 12)
Asimismo, cuanto mayor sea el rendimiento del substrato consumido, también mayor
será la tasa de crecimiento.
Sin embargo, hay una cierta compensación entre la tasa de consumo del substrato y
el rendimiento de forma que los microorganismos que tienen altas tasas de consumo de
substrato tienen rendimiento más bajos (o cuando se dan las condiciones para una alta
tasa, el rendimiento disminuye). A esta relación inversa se le conoce con el nombre de
efecto Pasteur.
1
La expresión "3engordar" está usada de forma metafórica: las bacterias no engordan. La uso porque
resulta útil esta metáfora antropòmórfica para entender algunos de los conceptos relacionados con el rendimiento de cultivos.
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Tema 2.- Cultivo de microorganismos.
Por último, nos falta relacionar la tasa de crecimiento (µ) con la concentración de
substrato (S). En condiciones de substrato abundante, la concentración de este no afecta
al valor de µ; pero cuando el substrato se hace limitante, sí existe ese efecto. La expresión matemática que relaciona ambos parámetros se conoce con el nombre de ecuación
de Monod y es la siguiente:
µ = µmax [S/(Ks+S)]
(ecuación 13)
En esta ecuación la tasa de crecimiento (µ) depende de la máxima que puede alcanzar el microorganismo (µmax), de la concentración de substrato (S) y de un valor constante, Ks, que representa la concentración de substrato a la que se alcanza una tasa de
crecimiento igual a la mitad de la máxima. La ecuación de Monod tendrá mucha importancia al tratar de cultivos continuos. Para que se cumpla esta ecuación el rendimiento debe ser independiente de la concentración de substrato.
En la práctica, los valores de Ks suelen ser muy bajos, lo que indica que los microorganismos crecen con tasas (µ) muy próximas a las máximas (µmax) a concentraciones de
substrato bajas y sólo cuando estas son extremadamente bajas, la velocidad de crecimiento se reduce. Esto es debido a que los sistemas de transporte de nutrientes suelen
tener valores de Km considerablemente reducidos (La Km indica la concentración de
substrato a la que la velocidad de transporte es la mitad de la máxima)
14.- CINÉTICA DE CRECIMIENTO EN UN CULTIVO CONTINUO.
En un cultivo continuo se mantienen los microorganismos en crecimiento constante
porque se añade de forma constante medio de cultivo fresco (que aporta nuevos nutrientes) y se elimina cultivo (medio usado con sus microorganismos correspondientes)
a la misma velocidad con objeto de mantener el volumen total del cultivo constante.
Los cultivos continuos son importantes para trabajar con microorganismos que estén
creciendo constantemente de manera que sean capaces de producir constantemente productos de interés (biomasa, metabolitos secundarios, etc.). Este tipo de cultivo es también importante en los estudios de fisiología y de ecología microbiana. En la naturaleza
un ejemplo de cultivo continuo lo constituye el rumen de ciertos animales y el conjunto
de procesos microbianos intestinales de todos los animales.
En un cultivo continuo se pretende mantener un ambiente constante durante todo el
tiempo de cultivo. Esto es imposible en un cultivo estanco en el que los nutrientes se
van consumiendo progresivamente y el medio se va cargando de productos de desecho.
QUIMIOSTATO
El tipo más frecuente de cultivo continuo es el quimiostato en el que se introduce
medio fresco a un flujo constante denominado velocidad de dilución (D) a la vez que
se elimina cultivo viejo al mismo flujo. El medio de cultivo de un quimiostato contiene
un nutriente esencial en una cantidad limitante (nutriente limitante). Estos parámetros
se relacionan de acuerdo a la siguiente ecuación:
14
Microbiología General
Tema 2.- Cultivo de microorganismos.
D = f/V
(ecuación 14)
donde f es la velocidad de flujo (ml h-1) y V el volumen del recipiente en ml. Por consiguiente, las dimensiones de D son [h-1]. El valor D indica el número de volúmenes de
reactor (volúmenes de fermentador) que pasan a través el reactor por unidad de tiempo.
Este valor es el recíproco del tiempo de residencia o tiempo que una unidad de substrato está dentro del reactor.
Tanto la tasa de crecimiento µ como el nivel de población microbiana están relacionados con el valor de D.
densidad celular o biomasa
Tiempo de generación
concentración de substrato
Velocidad de dilución
A velocidades de D muy bajas, pequeños incrementos de la velocidad de dilución
producen un cierto incremento de la densidad del cultivo debido a que se aportan más
nutrientes al medio y el microorganismo no ve limitada su tasa de crecimiento (µ) según
lo indicado en la ecuación de Monod (ecuación 13).
La velocidad de crecimiento aumenta (µ aumenta y τ disminuye) cuando la energía
aportada por los nutrientes entrantes supera la energía de mantenimiento de los microorganismos del cultivo.
A valores bajos de D la concentración de nutriente limitante (S) en el efluente es baja
porque es consumido casi completamente por los microorganismos del cultivo que alcanzan unas poblaciones de gran tamaño creciendo a una tasa (µ) baja porque se encuentran en condiciones de limitación de nutrientes (S<Ks). A valores más altos de D no
todo el nutriente es consumido por los microorganismos del cultivo por lo que S en el
efluente aumenta.
En una situación de equilibrio (steady state), velocidad de dilución D se iguala a la
tasa de crecimiento µ, de forma que el control de la tasa de dilución (control del flujo f)
permite regular la tasa de crecimiento y, de esa forma, la situación fisiológica del orga
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Microbiología General
Tema 2.- Cultivo de microorganismos.
nismo. A valores de D> µmax, el microorganismo no es capaz de crecer lo suficiente
como para evitar ser eliminado del cultivo por el rebosadero y, por consiguiente S alcanza un valor máximo (el nutriente limitante no es consumido en el cultivo y la concentración del substrato en el efluente es igual a la del substrato en el medio inicial) y la
tasa de crecimiento de microorganismos (µ) dentro del cultivo se hace nula (el cultivo
desaparece).
La evolución de la biomasa de un quimiostato se ajusta a la ecuación siguiente:
dX/dt = crecimiento - salida = µX - DX
(ecuación 15)
Por consiguiente, si µ > D hay un incremento positivo de la población en el quimiostato, cuando µ = D el tamaño de la población se mantendrá estable (equilibrio) y si
µ < D la población disminuirá como consecuencia de la dilución de las bacterias. En el
steady-state, como (dN/dt) = 0, µ = D como se había explicado anteriormente.2
Habida cuenta de que en el estado estacionario D = µ, la ecuación de Monod ((13)
puede reformularse en los siguientes términos
D = µmax [Sr/(Ks+Sr)]
(ecuación 16)
donde Sr es la concentración de nutriente limitante en el efluente del cultivo continuo.
Despejando de la ecuación 16 el valor de Sr en función de los demás, se obtiene la
ecuación siguiente:
Sr = DKs/(µmax-D)
(ecuación 17)
que permite calcular cómo varía la concentración del nutriente limitante en el efluente
en función de la tasa de dilución D.
Si llamamos SR a la concentración de nutriente limitante que entra en el fermentador
y Sr la concentración de este nutriente en el efluente; considerando que el substrato
consumido en el fermentador (SR-Sr) es transformado en biomasa durante el estado estacionario (Ñ) con un rendimiento Ys, podemos calcular la producción de biomasa en el
fermentador con las siguiente ecuaciones
Ñ = Ys(SR-Sr)
(ecuación 18)
Ñ = Ys{SR-[DKs/(µmax-D)]}
(ecuación 19)
Estas ecuaciones nos permiten modular la cantidad de biomasa producida o la cantidad
de substrato consumido regulando la tasa de dilución del fermentador.
TURBIDOSTATOS
2
En realidad, esto no es una demostración de que en el steady state las tasas de dilución y crecimiento se
igualan, ya que en los cáculos se partía de esta condición para poder reformular la ecuación de Monod.
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Microbiología General
Tema 2.- Cultivo de microorganismos.
El segundo tipo de cultivo continuo es el turbidostato en el que se ajusta la velocidad de dilución de tal forma que la densidad óptica del cultivo se mantiene constante.
El valor D en un turbidostato, por tanto, es variable. Por otra parte, en un turbidostato el
medio de cultivo no contiene nutrientes limitantes.
Los turbidostatos funcionan mejor valores de D altos, mientras que el quimiostato a
valores de D bajos.
CULTIVO SEMI-CONTINUO
Un cultivo semi-continuo (feed-batch) es un cultivo estanco al que se añaden en diferentes momentos nutrientes concentrados para permitir un mayor crecimiento o una
producción más efectiva de metabolitos secundarios. En un cultivo de estas características el nutriente añadido suele ser una fuente que aporte el carbono necesario para obtener energía y elementos para la síntesis de los metabolitos secundarios de interés. Por
ejemplo, la producción de penicilina se realiza mediante un cultivo de estas características.
15.- TIPOS DE FERMENTADORES
Podemos distinguir dos grandes tipos de fermentadores según el estado del medio de
cultivo: fementadores líquidos y sólidos.
FERMENTADORES LÍQUIDOS
En ellos los nutrientes se encuentran en esta forma y los microorganismos se desarrollan flotando libremente en el volumen de medio de cultivo o formando agregados
más o menos esféricos (pellets) en el caso de los cultivos de hongos. Este tipo de cultivos se denomina en ocasiones cultivo sumergido.
El diseño de un fermentador líquido requiere tener en cuenta una serie de factores
que influyen en el crecimiento, y en el rendimiento del proceso: temperatura, pH, aireación, etc. Por consiguiente, el diseño físico de los fermentadores líquidos tienen que
incluir la presencia de sondas que permitan medir estos parámetros durante el cultivo y
de sistemas que permitan corregir las desviaciones que se puedan producir (sistemas de
refrigeración para control de temperatura, sistemas de ajuste de pH mediante la adición
de ácidos o bases, etc.).
Un aspecto adicional que considerar en el diseño de un fermentador es la presión hidrostática que se alcanza en su base y que puede limitar el crecimiento de microorganismos. En general, la altura máxima de un tanque de fermentación se sitúa en los 15 m
ya que por encima de esa altura se alcanzan valores de presión inhibidores.
Tienen especial importancia dos problemas: la agitación destinada a asegurar una
mezcla correcta de los ingredientes del medio y de los microorganismos que crecen en
él, y la aireación.
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Microbiología General
Tema 2.- Cultivo de microorganismos.
Fermentadores en tanque
Son los fermentadores más sencillos. La agitación se consigue por un sistema de
palas unidas a un eje y un motor y por las turbulencias creadas por un sistema de bafles
adosados a las paredes de la cuba de fermentación.
La aireación se consigue por un difusor de aire que emite desde la parte inferior de la
cuba de fermentación. La transferencia de oxígeno al cultivo se hace por las burbujas
que van ascendiendo por el volumen de cultivo.
El principal problema de estos fermentadores es el elevado coste del sistema mecánico de agitación, principalmente cuando se realizan cultivos de hongos filamentosos en
los que la viscosidad debida al micelio aumenta mucho.
Fermentadores Air-lift
En estos fermentadores la agitación y a aireación se logran mediante la inyección de
aire por la parte inferior de la cuba de fermentación,
la entrada de aire produce un convección que se canaliza por un tubo vertical interior en
la cuba. La aireación también permite reducir la cantidad de calor producida durante la
fermentación.
En este fermentador, las burbujas de aire van aumentando de tamaño conforme ascienden por el tubo interior por lo que su relación superficie/volumen disminuye y la
transferencia de oxígeno al cultivo es menor.
Fermentadores Deep-Jet
En ellos el aire se inyecta a presión desde la parte superior de la cuba de fermentación de forma que las burbujas de aire se van haciendo más pequeñas (mejor transferencia de oxígeno) hasta llegar al final del cilindro interior, y a partir de ahí las burbujas
vuelven a crecer al ascender por la parte exterior de la cuba de fermentación. En la
práctica, es un fermentador similar al anterior; pero operado al revés.
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Tema 2.- Cultivo de microorganismos.
FERMENTADORES SÓLIDOS
En ellos los nutrientes se encuentran en esta forma y los microorganismos se desarrollan en la superficie del substrato o penetrando en él. Es un tipo de fermentación muy
aplicada en la producción de algunos alimentos (setas cultivadas, koji, etc.) y también la
que tiene lugar en los procesos de compostaje de residuos orgánicos.
Hay varios modelos de fermentadores sólidos:
1. Tambor
2. Bandejas
3. Sistema de lecho (bed system)
Por otra parte, existen sistemas semisólidos en los que los microorganismos están
adheridos a superficies estáticas y los nutrientes pasan por filtración o goteo a través de
ellos (sistema de la producción de vinagre por goteo), o los microorganismos se encuentran formando agregados que se mantienen en suspensión por medio de una corriente de medio de cultivo líquido (reactores de lecho fluidificado).
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