21-327 460-801 619-746 802-923 1143-1810 1961-2818 Kit pMBL-T vector No. Catálogo: MBL097 (20 reacciones) MBL236 (20 reacciones) Versión: 05/2012 GenBank: DQ059139 Descripción: El kit pMBL-T vector es un excelente sistema para la clonación de productos de PCR amplificados con aquellas polimerasas que colocan adenina en los extremos 3’ de la molécula. pMBL1-T se diferencian únicamente en las enzimas de restricción incluidas en el sitio múltiple de clonación. Ambos confieren resistencia a ampicilina, cuentan con el origen de replicación del fago f1 y mantienen, bajo el control del promotor lac, la secuencia del αpéptido de la β-galactosidasa. MCS de pMBL1 Aplicaciones: Este kit permite: - La ligación del inserto de interés con el vector pMBL-T en tan solo una hora. - Una doble selección de las colonias: (1) Selección de colonias resistentes a ampicilina. (2) Selección de colonias positivas blancas frente a las negativas azules debido a que el policloning interrumpe la secuencia del α-péptido. Nhe I Not I Sac I Hind III Eco RV Stu I Eco RI Sma I Spe I Bam HI Sal I Apa I Bsp 120I Promotor T3 CGGTACCAGC TTTTGTTCCC TTTAGTGAGG GTTAATTGCG CGCTTGGCGT AATCATGGTC ATAGCTGTTT Concentración final 1X 5 ng/µL Reverse www.mbl.es _ CCT 1 Este plásmido no ha sido secuenciado completamente. Los primers M13 forward y M13 reverse flanquean el sitio de clonación a una distancia aproximada de 30 a 40 pb. A diferencia de ApaI, la enzima Bsp120I (isoesquizómero PspOMI) corta dejando extremos 5’ protuberantes. 4 A diferencia de SacI, la enzima Ecl1136II corta dejando extremos romos. 2 3 CONTENIDO KIT 0,5 U/µL La eficiencia de clonación usando la relación vector : inserto= 1:5 es mayor a un 90%: cantidad vector(ng) * tamaño inserto(pb) vector = relación tamaño vector(pb)*cantidad banda(ng) inserto * Bgl II Inserto de PCR En un vial mezclar: * Xba I Forward Kpn I Envío y almacenamiento del producto: El envío a temperatura ambiente no afecta su actividad, sin embargo el almacenamiento de rutina a -20ºC es altamente recomendado. 1 µL T4 DNA ligasa 10X Buffer 1 µL pMBL T-Vector (50 ng/µL) x µL DNA inserto* 1 µL T4 DNA ligasa (5U) H2O hasta 10 µL Xho I GAGCTCAAGC TTGATATCAG GCCTCCCGGG GAATTCACTA GTCATATATG GGATCCGTCG ACTTTGGGCC Control de calidad: Ligación de pMBL T-Vector con distintas cantidades de inserto. En ninguno de los casos el número de colonias negativas (azules) superaba el 10% del total de 7 las colonias obtenidas. Los controles se llevaron a cabo sobre células con competencia ≥ 10 . 1. Kpn I Pst I GTAAAACGAC GGCCAGTGAC TGCAGGGTAC CACGCGTCTC GAGTCTAGAA GATCTGCTAG CAGCGGCCGC El kit contiene: -pMBL T-vector (1µg, 50 ng/µL) -T4 DNA ligasa (100 U, 5 U/µL) -T4 10X Buffer (400mM Tris-HCl, 100 mM MgCl2, 100 mM DTT, 5mM ATP, pH 25ºC=7,8) -Inserto control de 600 pb (16 ng/µL) Protocolo Origen de replicación f1(-) α-péptido MCS Promotor lac Origen de replicación pUC Resistencia a ampicilina Esta efieciencia suele reducirse a medida que el fragmento a clonar es mayor. Sin embargo, el empleo de secuencias PIG en los extremos 5’ de los primers a emplear en al PCR permiten la clonacion de fragmentos grandes con una alta eficiencia. Laadicion de secuencia PIG, GTTTCTT aumenta 9 veces la eficiencia de clonacion de un fragmento de PCR de 3,5 kb. 2. Incubar a una temperatura de entre 20º y 22º C durante una hora. 3. Transformar con 5 µL de la mezcla de ligación para 50 µL de células competentes. No superar el volumen de 7,5 µL de la mezcla de ligación para esta cantidad de células. COMPONENTES MBL097(20 rxn) MBL236 (20 rxn) pMBL-T Vector 20 reacciones 20 reacciones T4 DNA Ligasa 20 µL 20 µL 10× Buffer T4 DNA Ligasa 200 µL 200 µL — 2 x 10 reacciones Células Químicamente Competentes Podrá encontrar más información en http://www.mbl.es