La mitocondria es un orgánulo citoplasmático. Aproximadamente hay unas 2000 mitocondrias por célula. - Ciclo de Krebs Fosforilación oxidativa ó CR: Transporte de electrones (CTE) Formación de ATP En la cadena respiratoria, actúan V complejos diferentes La entrada de protones, a través del canal de la ATPsint sirve para la formación de ATP Ahora se ha producido una separación de cargas: (+) fuera = protones y (-) dentro = hidroxilos Se cree que la mayoría de las mitocondrias se originan por fragmentación de otras ya existentes, antes de la división celular. ADN mitocondrial Las mitocondrias poseen un material genético específico, ADN, así como la maquinaria bioquímica capaz de sintetizar proteínas (ácidos ribonucleicos y ribososomas ADN mt cromosomas bacterianos se ha postulado un origen endosimbionte Herencia: - vía materna - no recombina Esto ha hecho del ADN mitocondrial una gran fuente de información e investigación: forense: relaciones de parentesco y criminalística, estudios evolutivos y análisis de flujos migratorios, etc.... ADN mitocondrial humano 1 sólo cromosoma circular de doble cadena. Tamaño pequeño: 16569 pares de bases (pb) en el CRS (Cambridge reference sequence). oscila ± 20 pb 1 cromosoma nuclear 8.000x ADNmt 1 célula posee varios miles de copias del ADN mitocondrial Distinguimos las cadenas por su peso: cadena pesada = H cadena ligera = L La mayor parte de la cadena H constituye el molde para la transcripción de la mayoría de los genes, mientras que la cadena L es la cadena codificadora, también llamada cadena con sentido. Estructura del ADNmt El genoma mitocondrial contiene 37 genes: 22 para ARN de transferencia 2 para ARN ribosómicos (RNA16s y RNA12s) 13 genes que codifican ARN mensajeros, es decir, 13 proteínas: - varias subunidades de la enzima NADH deshidrogenasa (esencial para que transcurra el proceso redox en el inicio de la cadena respiratoria) ND (1,2,4,4L,5,6) - moléculas de citocromo b, componente primordial de la parte media de la CTE (Cytb) - diversas subunidades de citocromo oxidasa (porción final de la cadena respiratoria) citocromo oxidasa I, II y III - dos subunidades de la enzima ATPsintetasa (ATPasa 6 y 8), responsable de la obtención del ATP. Asimismo presenta una región no codificadora, asa o lazo D, en la que se encuentran los elementos reguladores de la replicación de la molécula. El resto de los componentes de las enzimas y complejos que participan en la cadena respiratoria, son codificados por genes nucleares y deben ser importados desde el citoplasma. De igual forma, los lípidos que forman las membranas externa e interna de la mitocondria también son importados. Mutaciones y patologías. Algunas mutaciones en los genes mitocondriales ocasionan enfermedades en el hombre. MELAS: (miopatía mitocondrial con encefalopatía, acidosis láctica y episodios similares al ictus [=accidente cerebro vascular]). Se debe a una disfunción el complejo I de la cadena respiratoria mitocondrial Mutación: cambio de bases en la posición 3243 MERRF: (epilepsia mioclónica, con fibras rojas deshilachadas) Se debe sobre todo a una mutación del gen que codifica el t-ARN de la lisina y produce una disfunción del complejo V de la cadena respiratoria Mutación: cambio de bases en la posición 8344. NARP (neuropatía, ataxia, retinitis pigmentosa) Se debe a una mutación del gen que codifica el complejo V de la cadena respiratoria (ATP-asa 6, la mayoría 8993) LHON (neuropatía hereditaria de Leber) Se debe a múltiples mutaciones en los genes que codifican el complejo I (NADH-deshidrogenasa) Otro hecho de interés es el de las estrechas relaciones, cada vez más conocidas, entre las alteraciones del ADN mitocondrial y patologías tan importantes como son el cáncer y las enfermedades neurodegenerativas. Aunque en muchas ocasiones aún no estamos en situación de establecer la exacta relación causa-efecto, lo que es indudable es la estrecha conexión existente entre alteraciones del ADN mitocondrial y los procesos degenerativos Además, hay que tener en cuenta que los haplotipos pueden también ser usados para dibujar árboles que describan las relaciones entre los diferentes ADNmt, incluso de otras especies. Por procesos de azar, todos haplotipos actualmente presentes en individuos humanos son copia del cromosoma que portaba un individuo que vivió hace miles o millones de años. la población actual retiene un record de su paso a través del tiempo, de manera que nos pueden revelar la genealogía materna y las relaciones entre grupos de la población. Los cromosomas son estructuras complejas localizadas en el núcleo de las células, compuestos por DNA, histonas y otras proteínas, RNA y polisacáridos. Bajo el microscopio, los cromosomas se ven como estructuras delgadas y alargadas. El brazo corto se designa como p y el largo como q. CROMOSOMA Y Tamaño 1/3 del crom X No presente recombinación en un 95%, el 5% restante, la porción pseudoautosómica, recombina su contenido con el cromosoma X. El ADN: génico, codifica proteínas “junk = basura”, que aparentemente no tiene ningún propósito. La mayoría (quizás el 98%) del cromosoma Y es “basura” los cambios son neutros se heredan Se han detectado cuatro tipos de cambios en el cromosoma Y UEPs (“unique event polymorphisms”) - “indels” – inserciones o deleciones de segmentos cromosómicos. - “snips” (SNPs)=“single nucleotide polymorphisms”=polimorfismos de un solo nucleótido, es decir, una base es sustituida por otra. Microsatélites (STR): “short tandem repeats” Secuencias cortas de nucleótidos repetidas varias veces en tandem. Aunque se suelen mantener, pueden aumentar o disminuir el número de (por deslizamiento de las hebras en el momento de la replicación). Usualmente se asume que el aumento o disminución en el número de repeticiones tiene lugar en pasos de un solo cambio. Cambios en la longitud de un microsatélite son mas frecuentes que la aparición de un nuevo UEP. Por ello no podemos asumir que el número de repeticiones sea un suceso único en el linaje paterno. Minisatélites (MVR): “minisatellite variant repeats” Son repeticiones de fragmentos algo mayores, 10-60 pb Cambios durante el proceso de copiado son más frecuentes en minisatélites que en microsatélites, por ello los mecanismos envueltos pueden ser diferentes. Reloj molecular: UEPs ------------- manecilla de las horas microsatélites --- minutero minisatélites ----- segundero Al igual que ocurre con el mitocondrial, al no sufrir recombinación, todos los marcadores se mantienen ligados en toda su longitud. Tal ligamiento de marcadores significa que un haplotipo, construido de diferentes marcadores, señala la historia evolutiva del cromosoma Y en particular en el que están localizados. haplotipos árboles que describan la historia evolutiva del cromosoma Y. DETECCIÓN DE UN SNP por RFLP Posición 7028 puede ser C ó T 6841 6901 6961 7021 7081 aatgatctgc tgactggcat ttgtagcCca tcattcactg tgcagtgctc tgtattagca cttccactat atttccccta tgagccctag aactcatcac gtcctatcaa ttctcaggct gattcatctt tagacatcgt taggagctgt acaccctaga a tcttttcacc actacacgac atttgccatc ccaaacctac agcaatatga gtaggtggcc acgtactacg ataggaggct g gacacgtactacgttgtagcCcacttccactatgtcctat gacacgtactacgttgtagcTcacttccactatgtcctat Alu I (AG / CT ) cortaría sólo al 2º grupo (portadores de 7028T) Amplificación de un fragmento de ADN que incluya la posición 7028 y corte con enzima de restricción (Alu I) 1) Búsqueda de primers 2) Predicción de los resultados AMPLIFICACIÓN DE ADN por PCR