TAXONOMÍA FÚNGICA FÚNGICA TAXONOMÍA Microbiología General Área Micología Dra. Alicia Luque CEREMIC TAXONOMÍA TAXONOM ÍA Taxón: un grupo taxonómico de cualquier rango Ciencia de la clasificación, 2 disciplinas: 1. Identificación 2. Nomenclatura Propósitos: 1. Nombrar los organismos de acuerdo a un sistema internacionalmente aceptado. 2. Indicar el concepto de la relación de los organismos con cada uno de los otros seres vivientes TAXONOMÍA TAXONOM ÍA Métodos para clasificar las especies en grupos: 1. Método fenético: las especies se agrupan según sus atributos fenéticos (fenotípicos). Es una clasificación no evolutiva. 2. Método filogenético: es evolutivo, se clasifican sólo las entidades que tienen relaciones evolutivas. Se clasifican las especies según cuanto tiempo hace que han compartido un ancestro común. Dificultades en la clasificación de los hongos: -Pleomorfismo: Teleomorfo Anamorfo (Sinanamorfo) Holomorfo Nomenclatura Categorías taxonómicas SUFIJOS DIFERENCIALES: DIFERENCIALES DIVISIÓN (Phylum) Mycota División: Ascomycota Clase: Endomycetes SUBDIVISIÓN -mycotina Orden: Onygenales CLASE -mycetes Familia: Onygenaceae SUBCLASE -mycetidae ORDEN -ales SUBORDEN -ineae FAMILIA -aceae SUFAMILIA -oideae Género: Ajellomyces Especie: capsulatus Estado anamórfico: Histoplasma capsulatum H. capsulatum var. capsulatum H. capsulatum var. duboisii H. capsulatum var. farciminosum Variedades, patotipos, formas, razas, etc. Nomenclatura Graphium eumorphum Scedosporium apiospermum Pseudoallescheria boydii DIVISIONES PRIMARIAS DE LA VIDA REINOS 1869 Plantas Animales 1956 Plantas Animales Protistas Bacterias (Copeland) Monera Protista Fungi Plantae Animalia 1969 (Whittaker) 1987 Eubacteria Archaebacteria Eukaryotes (Woese) DOMINIOS 1990 (Woese) Bacteria Archaea Eukarya Protozoa Chromista Fungi DOMINIO EUKARYA REINO PROTOZOA Phylum Myxomycota Ciclo de un Mixomicete DOMINIO EUKARYA REINO PROTOZOA Phylum Dyctiostellomycota Ciclo de Dictyostelium DOMINIO EUKARYA REINO CHROMISTA Phylum Oomycota Ciclo de vida de Saprolegnia sp. Phylum Oomycota El género Phytophthora, comprende numerosas especies que son específicas a las plantas a las que atacan: papas, tomates, robles, alisos, rododendros, cocoteros, pinos, tejos, etc. Causa enfermedades tales como el tizón tardío (P. infestans), la muerte repentina del roble (P. ramorum), etc. Espora de Phytophthora Phytophthora infestans fue el agente causante del tizón tardío de la patata que provocó la gran hambruna de Irlanda entre 1845 y 1849 y que originó la extraordinaria emigración de irlandeses a Estados Unidos. DOMINIO EUKARYA REINO FUNGI DOMINIO EUKARYA REINO FUNGI Phylum Chytridiomycota Ciclo de vida del hongo acuático Allomyces macrogynus (quitridiomicete) DOMINIO EUKARYA REINO FUNGI Phylum Zygomycota Ciclo de vida del hongo del pan Rhizopus stolonifer (zigomicetes). Phylum Zygomycota Orden Mucorales •orden más importante de la clase Zigomycota •saprófitos en su mayoría •importancia económica, síntesis de productos industriales: •Rhizopus stolonifer (=R. nigricans), fabricación de ácido fumárico, y en la elaboración de cortisona •R. oryzae, producción de alcohol •Rhizopus sp., producción de ácidos láctico, cítrico, succínico, oxálico, etc. •parásitos débiles sobre frutos •causantes de infecciones oportunistas en pacientes inmunocomprometidos Otros órdenes de Zigomycetes son: parásitos de animales (insectos sobre todo) o plantas, o saprófitos. DOMINIO EUKARYA REINO FUNGI Phylum Ascomycota Ciclo de vida de un ascomicete. Phylum Ascomycota Orden Onygenales Gimnotecio Ascosporas Histoplasma capsulatum Ajellomyces capsulatus Otros Ascomicetes de importancia clínica: Arthroderma (dermatofitos), Pseudallescheria boydii. Teleomorfos de Candida, Aspergillus, Penicillium. Paracoccidioides brasiliensis, Coccidioides spp. DOMINIO EUKARYA REINO FUNGI Phylum Basidiomycota Ciclo de vida de un basidiomicete. Phylum Basidiomycota Orden Tremellales Cyptococcus neoformans Filobasidiella neoformans (basidios y basidiosporas) Otros Basidiomicetes de importancia clínica: Malassezia, Trichosporom y Rhodotorula. HONGOS MITOSPÓRICOS (Deuteromicotina, Deuteromicetes, Fungi Imperfecti, hongos asexuales) Hifomicetes: formas miceliares con conidios sobre hifas Separadas o en agregados. Agonomicetes: (Mycelia sterilia) formas miceliares estériles, pueden producir clamidoconidios, esclerotes. Coelomicetes: producen conidios en cuerpos fructíferos. Blastomicetes: levaduras anamórficas. Blastomicetes Sistemas de clasificación de levaduras 1.- Morfología de los estados vegetativo y sexual: crecimiento en varios medios de cultivo. 2.- Características fisiológicas: .- asimilación y fermentación de fuentes de carbono (36 f.c.) y nitrógeno (11 f.n.) .- crecimiento a diferentes temperaturas .- producción de ácido de glucosa .- producción de almidón .- hidrólisis de urea .- actividad lipolítica .- resistencia a cicloheximida .- tolerancia a ácido acético .- liquefacción de la gelatina .- reacción DBB etc... Estos estudios han sido utilizados para elaborar claves de identificación que nos permiten clasificar las especies de los diferentes géneros de levaduras. Criterios de clasificación en el género Candida 1.- Reproducción vegetativa: gemación multilateral, células globosas, elipsoidales o cilíndricas, y ocasionalmente ojivales, triangulares o en forma de media luna. Pueden existir pseudomicelio y micelio verdadero. No se forman artroconidios. . Se puede observar película en cultivo líquido 2.- Fisiología: pueden fermentar azúcares. Los nitratos pueden ser asimilados. No se producen compuestos amiloideos extracelulares. Algunas especies pueden asimilar inositol. Ureasa negativas. Pueden degradar la gelatina. En la actualidad hay descritas 163 especies pertenecientes al género Candida. Para simplificar las claves de identificación, el género esta dividido en 12 grupos fisiológicos que abarcan a las especies. Dentro de cada grupo fisiológico hay una clave para la identificación de las diferentes especies. La especie Candida albicans, junto a otras especies del género que causan infecciones en humanos, aparecen en el grupo fisiológico VI, con las características: inositol negativo, nitrato negativo, eritritol negativo y crecimiento a 40ºC positivo. Clave dicotómica Hifomicetes Sistemas de clasificación de hongos filamentosos 1.- Caracteres morfológicos macroscópicos: apariencia de la colonia cuando crece en diferentes medios de cultivo y temperaturas .- tamaño de la colonia, diámetro .- textura, lanosa, flocosa, granulosa, etc .- color, escala de colores .- presencia de surcos .- exudado .- producción de pigmento, etc... 2.- Caracteres morfológicos microscópicos: .- estructuras reproductoras sexuales: ascosporas, basidiosporas, zigosporas. .- estructuras reproductoras asexuales: conidios, artrosporas, clamidosporas, etc... .- micelio: hifas gruesas, no septadas o con pocos septos (Zygomycetos), hifas con brazos (clamp connections) (Basidiomicetos), hifas delgadas, muy septadas, etc. Estos estudios han sido utilizados para elaborar claves de identificación que nos permiten clasificar las especies de los diferentes géneros de hongos filamentosos. Criterios de clasificación en el género Fusarium Las características macroscópicas más evidentes en Fusarium son: 1.- Crecimiento generalmente rápido. 2.- Colores pálidos o brillantes. 3.- Colonias con micelio aéreo flocoso o lanoso. Las características microscópicas más relevantes para la identificación de especies del género Fusarium son: 1.- Esporodoquio: masa algodonosa constituida por conidioforos de escaso tamaño que crecen directamente sobre el medio de cultivo. 2.- Conidióforo: Hifa fértil simple o ramificada, que lleva células conidiógenas. 3.- Célula conidiógena: Célula de la cual se produce directamente el conidio. 4.- Fiálide: Célula conidiógena, que suele tener forma de botella, y que puede desarrollar uno (monofiálide) o más (polifiálide) extremos abiertos a partir de los cuales se producen los conidios, aunque sin incrementar la longitud de la fiálide misma. 5.- Locus: Sitio en la célula conidiógena donde nace el conidio. 6.- Conidio: Estructura asexual inmóvil de propagación, nunca encerrada en una estructura en forma de saco. Hay varios tipos: macroconidios, mesoconidios y microconidios. 7.- Clamidosporas: Esporas asexuales que presentan una pared gruesa. Se originan por la modificación de un segmento de la hifa. Su función, mas que de propagación, es la de supervivencia durante largo tiempo. A partir de estas características se puede elaborar una clave que nos diferencia las especies del género. Características morfológicas microscópicas del género Fusarium. Características morfológicas macroscópicas del género Fusarium. Clave dicotómica Clave sinóptica LOS CRITERIOS DE CLASIFICACIÓN SON: •Caracteres Morfológicos •Bioquímicos •Fisiológicos •Hábitat •Hospederos •Localización en hospedero •Efecto sobre el hospedero •Fases de su ciclo •Ecología •Caracterización molecular (proteínas, ácidos nucleicos)