Making quality control easy Materiales de referencia microbiológicos 26 de octubre 2011 Preguntas más frecuentes 1. ¿Qué es un material de referencia? 2. ¿Qué es un material de referencia certificado? 3. ¿Qué características principales tienen los materiales de referencia microbiológicos desarrollados por Labaqua? 4. ¿Qué son los productos BACuali, BACuanti, BAControl, BACuanti PCR y BACuanti DNA desarrollados por Labaqua? 5. ¿Qué diferencia existe entre los diferentes materiales presentados por Labaqua? 6. ¿Qué proporciona el uso de los materiales de referencia y materiales de referencia certificados? 7. ¿Qué vantajas presentan estos materiales frente a las cepas habituales procedentes de Colecciones de Cultivo? Preguntas más frecuentes 8. ¿ Son los productos BACuali, BACuanti, BACuanti PCR, BAControl y BACuanti trazables con cepas de Colecciones de Cultivo? 9. ¿En que actividades del laboratorio puedo emplear estos materiales? 10. ¿Es obligatoria la realización de todas estas actividades? 11. ¿Qué es validar un método de ensayo? 12. ¿Cuales son los controles de calidad que debe efectuar un laboratorio? 13. ¿Cuales son los controles de calidad internos que debe realizar un laboratorio? 14. ¿Qué son los controles externos de calidad? 15. ¿Con que periodicidad debe un laboratorio realizar las actividades internas de control de calidad? Materiales de Referencia Material de Referencia (ISO 17025) Material o substancia una o más de cuyas propiedades tienen valores suficientemente homogéneos y claramente establecidos como para poder ser utilizados en la calibración de un aparato, la evaluación de un método de medida, o la asignación de valores materiales. Material de Referencia Certificado (ISO 17025) Material de referencia, acompañado de un certificado, en el cual uno o más valores de sus propiedades han sido certificados mediante un procedimiento que establece su trazabilidad a una realización exacta de la unidad en la que se expresan los valores de dichas propiedades. Cada valor certificado se acompaña de una incertidumbre y el nivel de confianza correspondiente. Materiales de Referencia Cepa de Referencia (ISO 11133) Microorganismo definido por lo menos al nivel de género y especie, catalogado y descrito según sus características y preferiblemente de origen conocido. Cepa de Reserva (ISO 11133) Cepas idénticas logradas mediante un único subcultivo de una cepa de referencia, o lo que es lo mismo, una serie de alícuotas de cultivos idénticos elaboradas en el laboratorio por subcultivo de la cepa de referencia. Cepa de Trabajo (ISO 11133) Subcultivos primarios obtenidos de una cepa de reserva, a fín de ser empleados en los ensayos pertinentes. G-ENAC-04: Utilización de cepas de referencia Un material de referencia debe ser: • Representativo • Valor de la propiedad (Identidad) • Homogéneo • Estable Material liofilizado clásico 1. Ampolla conteniendo material liofilizado 2. Rotura de la ampolla con diamante 3. Rehidratación en medio líquido apropiado 4. Extensión en medio sólido apropiado 5. Crecimiento y preparación de cepas de reserva TIEMPO: 24-48 h Material liofilizado clásico 1. Preparación suspensión bacteriana 2. Preparación de diluciones seriadas 3. Incubación y recuento del título TIEMPO: 24-48 h Inconvenientes de los materiales de referencia microbiológicos NECESIDAD DE NUEVOS MATERIALES DE REFERENCIA - Estabilidad (microorganismos) - Homogeneidad (bajas concentraciones) Nuevos Materiales de Referencia BACuanti BAControl BACuali Objetivo Desarrollo de un material de referencia microbiológico GUÍA-ISO 34 “General requirements for the competence of reference materials producers ” -Fácil de preparar -Homogéneo -Estable -Fácil de usar Guia ISO 35 e ISO 13528 -Aplicable a diferentes microorganismos Material de Referencia: Preparación I Hidratación de la cepa de una Colección de Cultivos Tipo Comprobación de la identidad de la cepa mediante secuenciación del gen rDNA 16S Realización de la titulación del microorganismo Material de Referencia: Preparación II Realización de los cálculos a partir del título obtenido Pastillas de rango bajo (<2 log) Pastillas de rango alto (>2 log) Preparación y dispensación de una mezcla homogénea : “Caldo de mantenimiento” + suspensión bacteriana Material de Referencia: Preparación III Proceso de estabilización (liofilización) Resultado: PASTILLA Desemblistado y conservación a -18ºC Material de Referencia: Controles de calidad I 1. Reconstitución del Material de Referencia De cada cepa empleada 2. Controles de esterilidad De cada mezcla preparada De cada lote fabricado Material de Referencia: Controles de calidad II 3. Homogeneidad 10 pastillas, 2 réplicas de cada pastilla ISO 13528: Statistical methods for use in proficiency testing by interlaboratory comparisons T: Test estadístico de Cochran T2/(I-1) ≤ 2 (Heisterkamp et. al.,1993) ANOVA p-valor>0.05 ss ≤ 0.3 σ (σ: desviación estándar diana) Material de Referencia: Controles de calidad II ESTUDIO DE MATERIAL DE REFERENCIA Homogeneidad Ejemplo 1: Test T Lote PCP11088 C. perfringens HOMOGENEIDAD PASTILLAS (11/02/08) Lote PCP11028 Microorganismo: Clostridium perfringens (UFC/1 mL) Dilución: 1/10 Cápsula 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 Réplica 1 Réplica 2 42 36 30 48 40 46 39 44 37 34 44 37 41 43 37 37 41 39 38 36 Media Nº cápsulas 39,5 10 T-1: T-1/I(J-1): 6,22 0,57 T-2: T-2/(I-1): 2,67 0,30 Media geométrica St. dev. (log) 39,2 0,027 RESULTADO: T-1 T-2 Limites T-1 (97.5%) 3,25 T-2 (5%) 16,92 HOMOGENEO HOMOGENEO T-1(2.5%) 20,48 Material de Referencia: Controles de calidad II Ejemplo 1: ANOVA, Homogeneidad Lote PCP11028 C. perfringens Análisis de varianza de un factor RESUMEN Grupos Fila 1 Fila 2 Fila 3 Fila 4 Fila 5 Fila 6 Fila 7 Fila 8 Fila 9 Fila 10 Cuenta 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 ANÁLISIS DE VARIANZA Origen de las Suma de variaciones cuadrados Entre grupos 0,013184202 Dentro de los grupos 0,030518894 Total Suma 3,179551791 3,158362492 3,264817823 3,234517284 3,099680641 3,211654401 3,246252312 3,136403448 3,203848464 3,136086097 Grados de libertad Varianza 0,00224094 0,02083248 0,00184211 0,00137225 0,00067428 0,00283135 0,00021393 0 0,00023586 0,00027568 Promedio de los Valor crítico F Probabilidad cuadrados para F 9 0,001464911 0,48000145 0,857775864 3,020382947 10 0,003051889 0,043703096 19 Ss= 0,028168937 Ss/sigma= Promedio 1,589775896 1,579181246 1,632408912 1,617258642 1,549840321 1,6058272 1,623126156 1,568201724 1,601924232 1,568043049 0,06 < 0.3 Material de Referencia: Controles de calidad II ESTUDIO DE MATERIAL DE REFERENCIA Homogeneidad Ejemplo 2: Test T Lote PEC08027 E. coli ESTUDIO HOMOGENEIDAD PASTILLAS (08/02/07) Lote PEC08027 Microorganismo: Escherichia coli (UFC/1 mL) Dilución: Cápsula 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 Réplica 1 Réplica 2 10 13 9 13 15 13 17 15 12 14 17 13 6 10 9 15 8 8 17 7 Media Nº cápsulas 12,1 10 T-1: T-1/I(J-1): 8,74 0,79 T-2: T-2/(I-1): 10,49 1,17 Media geométrica St. dev. (log) 11,5 0,104 RESULTADO: T-1 T-2 Limites T-1 (97.5%) 3,25 T-2 (5%) 16,92 HOMOGENEO HOMOGENEO T-1(2.5%) 20,48 Material de Referencia: Controles de calidad II Ejemplo 2: ANOVA, Homogeneidad Lote PEC08027 E. coli Análisis de varianza de un factor RESUMEN Grupos Fila 1 Fila 2 Fila 3 Fila 4 Fila 5 Fila 6 Fila 7 Fila 8 Fila 9 Fila 10 Cuenta 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 Suma 2,11394335 2,06818586 2,29003461 2,40654018 2,22530928 2,34439227 1,77815125 2,13033377 1,80617997 2,07554696 Promedio 1,05697168 1,03409293 1,14501731 1,20327009 1,11265464 1,17219614 0,88907563 1,06516688 0,90308999 1,03777348 Varianza 0,00649154 0,01275218 0,00193118 0,00147738 0,00224094 0,00678677 0,02460843 0,02460843 0 0,07424765 ANÁLISIS DE VARIANZA Entre grupos Dentro de los grupos 0,19622884 0,15514451 Promedio de Valor crítico los F Probabilidad para F cuadrados 9 0,0218032 1,40534808 0,300849328 3,02038295 10 0,01551445 Total 0,35137335 19 Ss= 0,05607474 Origen de las variaciones Suma de cuadrados Ss/sigma= Grados de libertad 0,21 < 0.3 Material de Referencia: Controles de calidad II Homogeneidad Estudios de Homogeneidad (04/08/02) Lote PLPQ28036 Microorganismo: Legionella pneumophila (ct/7.1 uL) Ejemplo 3: Test T Lote PLPQ28036 L. pneumophila Q-PCR Pastilla 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 Replica 1 Replica 2 39,07 37,84 36,1 37,23 36,67 36,58 35,74 37,71 39,92 36,51 36,06 38 36,48 38,02 37,42 37,76 36,73 38,84 36,28 35,94 Media Nº Pastillas T-1: T-1/I(J-1): 37,2 10 0,39 0,04 T-2: T-2/(I-1): 0,28 0,03 Media geométrica St. dev. (log) 37,2 0,009 Resultados: T-1 T-2 Limites T-1 (97.5%) 3,25 T-2 (5%) 16,92 HOMOGENEO HOMOGENEO T-1(2.5%) 20,48 Material de Referencia: Controles de calidad III 4. Estabilidad Dos pastillas por triplicado durante X días Estudios previos: Temperatura de conservación: ambiente, 4ºC y –18ºC. Estabilidad medio plazo: Período de tiempo de 15-20 días Estabilidad largo plazo: 9 meses Estudiado tanto por cultivo como por Q-PCR (L. pneumophila) Estudios estadísticos (ISO 13528): /X-Y/ < 0.4 σ (X:media homogeneidad; Y:media cada día estudiado; σ:desviación estándar diana) L.pneumophila: Análisis de varianza (p-valor>0.05) Gráficas de evolución temporal Material de Referencia: Controles de calidad III 4. Estabilidad Temperatura de conservación Escherichia coli ESTABILIDAD LOTE PEC160 4.5 4 3.5 Conservar a –18ºC 3 2.5 E.coli Tª amb. E.coli Nevera 2 E. coli Congelador 1.5 1 0.5 0 0 7 14 21 28 35 42 49 56 63 70 77 84 91 98 DIAS 105 112 119 126 133 140 147 154 161 168 175 Material de Referencia: Controles de calidad III 4. Estabilidad Estabilidad a corto plazo ESTABILIDAD LOTE PCF25115 6,0 5,5 5,0 Citrobact er f. 4,5 4,0 3,5 Citrobacter freundii Lineal (Citrobac ter f.) 3,0 2,5 2,0 0 5 10 DIAS 15 y = 0,0045x + 5,1686 ESTABILIDAD DIANA PCF25115 0,1600 0,1400 0,1200 0,1000 /X-Y/ 0,4xSs 0,0800 0,0600 0,0400 0,0200 0,0000 0 4 7 11 15 Material de Referencia: Controles de calidad III 4. Estabilidad Estabilidad a largo plazo Enterococcus faecium ESTABILIDAD LOTE 160 PEF28084 4,0 3,5 3,0 2,5 E.faecium Caducidad 6 meses 2,0 Lineal (E.faecium) 1,5 1,0 0,5 0,0 0 7 14 21 28 35 42 49 56 63 70 77 84 91 98 105 112 119 126 133 140 147 154 161 168 175 DIAS y = -0,0002x + 2,9436 Material de Referencia: Controles de calidad III 4. Estabilidad Estabilidad a largo plazo Legionella pneumophila Lote PLP18065 Means and 95,0 Percent LSD Intervals 1,7 1,6 1,5 1,4 0 7 14 21 28 38 42 49 57 63 70 77 84 DIAS p-valor=0,5898 DIAS RESULTADOS 1,8 Box-and-Whisker Plot 0 7 14 21 28 38 42 49 57 63 70 77 84 1,3 1,4 1,5 1,6 RESULTADOS 1,7 1,8 Estudios de certificación I Condiciones: - 7 laboratorios acreditados por ENAC - 2 pastillas por triplicado - mismas condiciones de ensayo Microorganismo Medio cultivo Tiempo/ Temperatura incubación Escherichia coli Citrobacter freundii Enterococcus faecium Clostridium perfringens Legionella pneumophila Staphylococcus aureus Pseudomonas aeruginosa Tergitol-7 agar Tergitol-7 agar Slanetz-Bartley agar TSC agar BCYE-α Chapman manitol Agar Cetrimida 24 h a 37ºC 24 h a 37ºC 48 h a 37ºC 24 h a 44ºC (Anaerobiosis) 4 días a 37ºC 48 h a 37ºC 48 h a 37ºC Estudios de certificación II BOLETÍN DE RESULTADOS (*) Resultados: LABORATORIO: - fecha envío resultados LOTE: MICROORGANISMO: RESULTADOS MEDIO ESPECÍFICO - boletín de resultados RÉPLICA PASTILLA - tratamiento estadístico (Guía ISO 35: Certification of reference materials. General and statistical principles) ¿Diferencias entre pastillas? ¿Diferencias entre réplicas? UNIDADES R1 R2 R3 1 2 RESULTADOS MEDIO GENERAL (en su caso) RÉPLICA PASTILLA UNIDADES R1 R2 R3 1 2 NOTA: En caso de que los resultados correspondan a una dilución, indicar a cual corresponde. OBSERVACIONES: ¿Diferencias entre laboratorios? (*)Realizar tantas copias de este boletín como lotes se hayan analizado Estudios de certificación III Enterococcus faecium ¡¡¡Calcular la estadística robusta para obtener H15 mean y H15 Std Dev!!! PEF01028 (19/02/2008) Lab 1 Lab 2 Lab 3 Lab 4 Lab 5 Lab 6 Lab 7 R1 1400 1980 1220 2200 2000 1600 1620 Slanetz Bartley (ufc/pastilla) Pastilla 1 Pastilla 2 R2 R3 R1 R2 R3 1600 2800 2000 3000 2600 1800 1740 1760 1940 1800 1740 1580 2140 1560 1800 2000 1600 2600 1400 1400 1800 1600 2000 1600 2000 1200 2000 2800 2600 2000 1880 1760 2080 2200 1960 TOTAL X S 3,3318 0,1364 3,2635 0,0231 3,2174 0,0811 3,2591 0,1109 3,2611 0,0476 3,2912 0,1359 3,2803 0,0483 AMC Robust Statistics V1.0 ROBUST STATISTICS SUMMARY Estimate Estimate value Parameters Median 3,263512308 A15 mean 3,268905864 c=1.5: Convcrit=0.001 H15 mean 3,271059179 c=1.5: Convcrit=0.001 MAD 0,016808962 MADe 0,024920982 sMAD 0,024920982 H15 Std Dev 0,029790253 c=1.5: Convcrit=0.001 ¡¡¡Asignar valor de n (Nº de laboratorios)!!! media robusta desviación estandard 3,271 0,030 ¡¡¡Asignar valor de t en la tabla, para (n-1)!!! Incertidumbre=s/raiz n % 0,011 0,344 VALORES CERTIFICADO Valor medio/pastilla 1,87E+03 0,34 Incertidumbre (%) 1,75E+03 Intervalo confianza 1,99E+03 Intervalo confianza(I)=t*s/raiz n 0,02755238 3,244 Intervalo (media-I; media+I) 3,299 Certificados de análisis: Cuantitativos BACuanti Guía Caducidad ISO 31: Contenido 6 mesesde Descripción Certificados de Materiales de Código: L060046 Referencia Microorganismo: Citrobacter freundii V318 precedente de NCTC 6272, con menos de dos Valor medio porliofilizada pastilla, en las pases desde la cepa empleada condiciones Lote: PCF05028de análisis indicadas Fecha de preparación: 05/02/08 Fecha de caducidad: 05/08/08 Resultados Conservar –18ºC 10% Porcentaje del loteaanalizado: Valor medio por pastilla: 2.06x103 ufc Incertidumbre: + 1.82% Intervalo de confianza 95%: 1.46x103 – 2.89x103 ufc Certificados de análisis: Cuantitativos BAControl Guía Caducidad ISO 31: Contenido 6 mesesde Certificados de Materiales de Descripción Referencia Código: L060046 Microorganismo: Citrobacter freundii V318 Valor por pastilla, en las condiciones precedente de NCTC 6272, con menos de dos de ensayo pases desde ladel cepafabricante liofilizada empleada Lote: PCF07028 Fecha de preparación: 07/02/08 Fecha de caducidad: 07/11/08 Resultados Conservar a –18ºC Valor por pastilla obtenido por el fabricante: 8.87x103 ufc Certificados de análisis: Cualitativos BACuali Descripción 9 meses Código: Caducidad L060031 Microorganismo: Citrobacter freundii V318 precedente de NCTC 6272, con menos de dos pases desde la cepa liofilizada empleada Lote: PCF25117 de la identidad de Certificación preparación: 25/11/07 laFecha cepadesuministrada Fecha de caducidad: 25/08/08 Control de calidad Conservar a –18ºC Contaminación: Correcto Homogeneidad: Homogéneo Estabilidad: Estable Certificados de análisis: Cuantitativos para PCR BACuanti- PCR Descripción Caducidad 12 meses Código: L060047 Microorganismo: Legionella pneumophila L2949 precedente de ATCC 33152, con menos de dos pases desde la cepa liofilizada empleada Lote: PLPQ21018 Valor medio por pastilla, en las Fecha de preparación: 21/01/08 condiciones de análisis indicadas Fecha de caducidad: 21/01/09 Resultados Porcentaje del lote analizado: 10% 8 células Conservar a temperatura ambiente Valor medio por pastilla: 3.15x10 Incertidumbre: + 0.98% Intervalo de confianza 95%: 1.84x108 – 5.37x108 células Certificados de análisis: Cuantitativos para PCR BACuanti- DNA Descripción Código: L060024 Caducidad 6 meses Microorganismo: Legionella pneumophila L2949 precedente de ATCC 33152, con menos de dos pases desde la cepa liofilizada empleada Lote: LN31018 Fecha de preparación: 17/01/08 Valor medio por vial, en las Fecha de caducidad: 17/07/08 condiciones de análisis indicadas Resultados Porcentaje del lote analizado: 10% Conservar temperatura Valor medio a por pastilla: 12 µg ambiente (2.8x109 unidades genómicas) Incertidumbre: + 2.6% Intervalo de confianza 95%: 11.32 - 12.70 µg/vial Material de Referencia: Guía rápida de utilización (BACuanti/BACuali) Recepción del material Extraer el dispositivo Conservar a -18ºC Romper precinto seguridad Rasgar la bolsa de aluminio Girar siguiendo flecha Incubar 10 min. Suspensión bacteriana Tratar como una muestra Extraer el dispositivo Liberar la pastilla en 20 mL Comparar con el valor certificado Material de Referencia: Guía rápida de utilización (BAControl) Recepción del material Conservar a -18ºC Romper precinto seguridad Incubar 10 min. Tratar como una muestra Extraer el vial Adicionar 20 mL Materiales de referencia disponibles BACuanti • Escherichia coli BAControl • Citrobacter freundii • Entrococcus faecium • Clostridium perfringens • Pseudomonas aeruginosa • Staphylococcus aureus • Legionella pneumophila Material cuantitativo Material cuantitativo Cada pastilla contiene un número determinado de células viables y cultivables Cada pastilla contiene un número determinado de células viables y cultivables Útil para la validación de métodos y controles de calidad cuantitativos Útil para el control de calidad rutinario (controles de proceso, gráficos de control, control de calidad de medios de cultivo, etc.) Disponibilidad de rango bajo (<2log) y rango alto (>2log) Disponibilidad de rango bajo (<2log) y rango alto (>2log) Materiales de referencia disponibles BACuali • Escherichia coli • Citrobacter freundii • Entrococcus faecium • Clostridium perfringens • Pseudomonas aeruginosa • Staphylococcus aureus • Legionella pneumophila • Salmonella enterica subsp. enterica Material cualitativo Se certifica la identidad de la cepa suministrada Útil para la validación de métodos y controles de calidad cualitativos Materiales de referencia disponibles BACuanti- PCR Legionella pneumophila Material cuantitativo Cada pastilla contiene un número determinado de células inactivadas Útil para la validación de métodos moleculares y control de calidad del proceso analítico completo BACuanti- DNA DNA liofilizado de Legionella pneumophila Material cuantitativo Cada vial contiene un número determinado de unidades genómicas Útil para la validación de métodos moleculares y control de calidad de la fase de amplificación por PCR Materiales de Referencia: Ventajas SENCILLEZ: la preparación del material es extremadamente simple, gracias al formato en pastilla que se suministra en un vial o en un dispositivo plástico estéril de muy fácil uso, que evita manipulaciones engorrosas RAPIDEZ: el tiempo de reconstitución se reduce a 10 minutos SEGURIDAD: al reducirse las manipulaciones al mínimo, se reduce el riesgo de contaminación TRAZABILIDAD: las cepas empleadas son trazables a diferentes Colecciones de Cultivos tipo CALIDAD: el material va acompañado de una Guía Rápida de Uso y el correspondiente Certificado de Análisis FLEXIBILIDAD: el material está disponible en dos rangos de concentraciones, baja (<2 log.) y alta (>2 log.) SERVICIO: además de las especies disponibles en stock, se ofrece la posibilidad de preparar material de referencia a una concentración predefinida por el cliente Material liofilizado clásico 1. Ampolla conteniendo material liofilizado 2. Rotura de la ampolla con diamante 3. Rehidratación en medio líquido apropiado 4. Extensión en medio sólido apropiado 5. Crecimiento y preparación de cepas de reserva TIEMPO: 24-48 h 1. Preparación suspensión bacteriana 2. Preparación de diluciones seriadas 3. Incubación y recuento del título TIEMPO: 24-48 h Material de referencia: BACuanti – BACuali - BAControl 1. Sacar del congelador 2. Abrir el sobre de aluminio/Extraer el vial de la caja 3. Abrir el dispositivo de dispensación/Desprecintar el vial 4. Servir una pastilla/Adicionar el agua 5. Incubar a Tª ambiente 10 min. 6. Material preparado TIEMPO: 15 min TIEMPO: 48-96 h TIEMPO: 15 min Uso de los materiales de referencia junto con los kits de qPCR www.ielab.es Kits de diagnóstico molecular KITS PARA CADA UNA DE LAS FASES DEL PROCESO CONCENTRACIÓN DE MUESTRAS DE AGUA -Kit aguas limpias EXTRACCIÓN & PURIFICACION DE DNA -Kit aguas sucias ANALISIS POR PCR - Confirmación bacteriológica por PCR - Detección cualitativa de Legionella - Detección cuantitativa de Legionella Kits de diagnóstico molecular KITS PARA CADA FASE DEL PROCESO 1. KIT DE CONCENTRACIÓN DE MUESTRAS DE AGUA - Membranas de filtración - Tubos de recogida - Tubos de concentración 2. KIT EXTRACCIÓN & PURIFICACIÓN DE DNA AGUA LIMPIA AGUA SUCIA Kits de diagnóstico molecular KITS PARA CADA FASE DEL PROCESO 3. ANALISIS POR PCR 3.3. Kit de detección cuantitativa de Legionella spp. y L. pneumophila 3.1. Confirmación bacteriológica por PCR (confirmación simultánea de hasta 10 especies) 3.2. Kit de detección cualitativa de Legionella spp. y L. pneumophila CONTROLES POSITIVO & NEGATIVO CONTROL INTERNO POSITIVO Kits de diagnóstico molecular KITS DE DETECCIÓN CUALITATIVA DE Legionella spp. y L. pneumophila Description Analysis conditions Code: I060002 Method: amplification by PCR and electroforesis Specificity: Legionella pneumophila in agarose gel analysis Batch: CLN11068 Thermocycler: GeneAmp PCR System9700, Manufacturing Applied Biosystemsdate: 11/June/2008 Expiry date:program: 11/Dec/2008 Quality controls Amplification Denaturation at 95ºC 4 Number of tests: 70 Positive control right min, 35 cycles of amplification: 95ºC 30 s., 58ºC 30 s., 72ºC 1 Negative control amplification: min. and final extesion at 72ºC 10right min. Internal positive control amplification: right Kits de diagnóstico molecular KITS DE DETECCIÓN CUANTITATIVA DE Legionella spp. y L. pneumophila Used fungible material Analysis conditions Description TaqMan Environmental Mix, Internal Method: amplification by “realMaster time” PCR Code: ED000864 positive control (plamidic DNA), Thermocycler: 7500 Real-Time PCRprimers, System,probe Specificity: Legionella spp. and Legionella Quality controls spp. ATCC 33152 DNA as Applied Biosystems Batch: QLS030909 positive control Positive control amplification: right Amplification program: 50ºC 2 min, 95ºC 10 Manufacturing date: 08/June/2009 Negative control right min. and 42date: cycles ofamplification: 95ºC 15 s. and 60ºC 1 min. Expiry 08/March/2010 Internal positive control amplification: right Number of tests: 70 Ejemplo de aplicación: Legionella pneumophila Control de proceso en qPCR RM Dispensar la pastilla en un tubo con 4 mL de agua estéril Analisis por qPCR Incubar durante 10 min a Tª ambiente Extracción/Purificación de DNA Preparación de la Analizar como una muestra de muestra de trabajo rutina cuantitativa Elución Concentración Ejemplo de aplicación: Legionella pneumophila Control de proceso en qPCR El Control de Calidad Interno permite establecer la Tasa de Recuparación del proceso completo de PCR (concentración de muestra, extracción/ purificación de DNA, etc.) El uso de RM ayuda en la Validación de métodos PCR methods, porque facilita la preparación de muestras cuantitativas y la determinación de la Exactitud y Precisión del método. Análisis directo (1.49x105 células/pastilla) Proceso completo (6.72x104 células/pastilla) Ejemplo de aplicación: Legionella pneumophila Rectas de calibrado Curva de calibrado Ct=-3,028 log[DNA]] +39,6148 R²= 0,94743 r= -0,9733 CURVA ESTANDAR STANDARD CURVE 50 Ct 40 30 20 10 0 0 2 4 Certificación Multisector 6 Log Nº copies 8 10 Ejemplo de aplicación: Legionella pneumophila Routine qPCR control BACuanti-PCR RM Dispensar la pastilla en un tubo con 4 mL de agua estéril Incubar durante 10 min a Tª ambiente Analysis por qPCR BACuanti-DNA Preparación de la muestra de trabajo cuantitativa Analizar como una muestra de rutina Extración/purificación de DNA Concentratción Elución Conclusiones PTs, Materiales de Referencia y Kits qPCR: 1. Facilitan la aplicación de métodos normalizados y validados. 2. Ahorra tiempo de implementación. 3. Ofrecen un sistema rápido y fácil de implementar sistemas intenos y externos de control de la calidad. 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