UNIDAD 2: INTRODUCCIÓN AL LENGUAJE DE PROGRAMACiÓN R

UNIDAD 2: INTRODUCCIÓN AL
LENGUAJE DE PROGRAMACiÓN
R
Técnicas Inteligentes en Bioinformática
Máster en Lógica, Computación e Inteligencia Artificial
Dpto. Ciencias de la Computación e Inteligencia Artificial
Francisco J. Romero Campero
Universidad de Sevilla
CONTENIDOS
1.
El lenguaje de programación R
2.
Concepto de variable
3.
Tipos de datos simples
4.
Operaciones aritmético-lógicas
EL LENGUAJE DE PROGRAMACIÓN R
o
Un programa informático es una secuencia de
instrucciones que un ordenador puede entender.
o
Los programas informáticos se escriben en un
archivo de texto siguiendo un lenguaje de
programación.
o
A la secuencia de instrucciones que componen un
programa informático la denominaremos código
fuente.
EL LENGUAJE DE PROGRAMACIÓN R
o
El ordenador sólo es capaz de entender un único
lenguaje: código máquina. El programador
necesita traducir su código fuente a código
máquina antes de ejecutarlo.
o
Existen dos tipos de lenguajes de programación:
 Compilados:
El programador debe escribir todo el
código fuente antes de pasarlo a código máquina y
ejecutarlo.
 Interpretados: El programador puede escribir y
ejecutar su código fuente instrucción a instrucción.
EL LENGUAJE DE PROGRAMACIÓN R
o
R es un lenguaje de programación interpretado.
o
R se utiliza para:
 Análisis
de datos
 Cálculos estadísticos
 Representación de gráficos
o
R se utiliza para el análisis estadístico de datos de
laboratorio en biología molecular.
o
http://cran.r-project.org/
EL ENTORNO DE PROGRAMACIÓN
o
Un entorno de programación es un programa
informático que nos permite:
 Escribir
código en un lenguaje de programación
 Compilar el código
 Ejecutar instrucción a instrucción
o
En este curso se utilizará RkWard como entorno
de programación para R
 Software
libre
 Requiere GNU/Linux
 http://rkward.sourceforge.net
EL ENTORNO DE PROGRAMACIÓN
CONTENIDOS
1.
El lenguaje de programación R
2.
Concepto de variable
3.
Tipos de datos simples
4.
Operaciones aritmético-lógicas
CONCEPTO DE VARIABLE
o
Elemento fundamental de cualquier lenguaje de
programación.
o
Son espacios reservados en la memoria que
pueden cambiar de contenido. Se identifican con
una cadena de caracteres.
o
Una variable tiene un nombre que la identifica en
el código fuente y un contenido (dato) que puede
variar.
ASIGNACIÓN DE VARIABLES
o
o
La asignación de variables es una instrucción que permite
definir el nombre de una variable y asociarle un contenido.
Ejemplo:
a <- -2.5
b <- TRUE
seq.adn <- “ATGCTAGATCGC”
o
o
o
En R, los nombres de variables deben comenzar por una
letra seguida de más letras, dígitos o los caracteres punto (.)
o subrayado (_). Se diferencia entre mayúsculas y
minúsculas.
En R, para saber el contenido de una variable, basta con
escribir su nombre.
También se puede usar el operador = en lugar de <-
GESTIÓN DE VARIABLES EN R
o
Todas las variables asignadas quedan salvadas en
un espacio de trabajo.
o
Podemos listar las variables del espacio de trabajo
actual mediante la instrucción ls()
o
Podemos borrar una variable del espacio de
trabajo mediante la instrucción
rm(nombre_de_variable)
CONTENIDOS
1.
El lenguaje de programación R
2.
Concepto de variable
3.
Tipos de datos simples
4.
Operaciones aritmético-lógicas
TIPOS DE DATOS SIMPLES
o
Numéricos
 3,
-4, 0.45…
 Saber si un dato es numérico: is.numeric(dato)
o
Lógicos
 True,
False
 Saber si un dato es lógico: is.logical(dato)
o
Caracteres
 ‘a’,
‘c’, ‘g’, ‘t’
 Saber si un dato es carácter: is.character(dato)
o
Cadenas
 “atgctagatcgc”
CONTENIDOS
1.
El lenguaje de programación R
2.
Concepto de variable
3.
Tipos de datos simples
4.
Operaciones aritmético-lógicas
OPERACIONES ARITMÉTICAS
Operación
Operador en R
Suma
+
Diferencia
-
Producto
*
División
/
División entera
%/%
Módulo (resta)
%%
Potencia
^
OPERACIONES ARITMÉTICAS
o
Ejemplo en R:
a <- 4
b <- 3
suma <- a + b
diferencia <- a – b
producto <- a * b
division <- a / b
potencia <- a ^ b
division_entera <- a %/% b
modulo <- a %% b
OPERACIONES DE COMPARACIÓN
o
Devuelven un valor lógico (true o false)
Sentencia
Código en R
Mayor que
>
Mayor o igual que
>=
Menor que
<
Menor o igual que
<=
Igual que
==
Distinto que
!=
OPERACIONES LÓGICAS
o
Reciben y devuelven valores lógicos
Sentencia
Código en R
AND
&&
OR
||
NOT
!
 Operando
sobre vectores
Sentencia
Código en R
AND
&
OR
|
OPERACIONES LÓGICAS
o
Comportamiento del operador AND
A
B
A && B
FALSE
FALSE
FALSE
FALSE
TRUE
FALSE
TRUE
FALSE
FALSE
TRUE
TRUE
TRUE
OPERACIONES LÓGICAS
o
Comportamiento del operador OR
A
B
A || B
FALSE
FALSE
FALSE
FALSE
TRUE
TRUE
TRUE
FALSE
TRUE
TRUE
TRUE
TRUE
OPERACIONES LÓGICAS
o
Comportamiento del operador NOT
A
!A
FALSE
TRUE
TRUE
FALSE
PRECEDENCIA DE OPERADORES
o
o
o
Podemos combinar en una expresión varias
operaciones aritméticas y lógicas.
Los operaciones se agrupan automáticamente
según un orden de precedencia
Por ejemplo: El producto y la división tienen
mayor precedencia que la suma y la diferencia.
A
<- 3 * 5 + 10 / 2
Primero se evalúa 3 * 5 y 10 / 2, luego se suman los
resultados obteniendo el valor 20 que se asigna a la
variable A.
PRECEDENCIA DE OPERADORES
o
Precedencia de operadores en R:
1.
2.
3.
4.
5.
6.
7.
o
Potencia
Producto, división, división entera y módulo
Suma y diferencia
Mayor, mayor o igual, menor, menor o igual, igual y
distinto que.
AND, OR
NOT
Asignación
Podemos modificar la precedencia de operadores
usando paréntesis. Ejemplo:
a <- 3 * (5 + 10) / 2
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Estas transparencias están basadas en el material docente desarrollado
por Francisco J. Romero Campero e Ignacio Pérez Hurtado de Mendoza
para la asignatura Informática Aplicada a la Bioquímica del Grado
Conjunto en Bioquímica por la Universidad de Sevilla y la Universidad de
Málaga (Andalucía Tech). Este trabajo está liberado bajo la licencia
Creative Commons Attribution-NonCommercial NoDerivs 3.0 Unported
License.