ASPECTOS GENÓMICOS DE LA EVOLUCIÓN HUMANA

ASPECTOS GENÓMICOS DE LA EVOLUCIÓN HUMANA
CLAVE ****
OCTAVO o NOVENO SEMESTRE
CREDITOS: 10
ASIGNATURA OPTATIVA (Área de
Genómica Antropológica)
HORAS POR CLASE
Teóricas: 2.5
HORAS POR SEMANA
Teóricas: 5
HORAS POR SEMESTRE
Teóricas: 80
MODALIDAD:
SEMINARIO
Asignatura precedente: todas las de la etapa básica.
Asignatura subsecuente: Ninguna
Objetivos:
1. Que el estudiante conozca y evalúe las estrategias y perspectivas actuales de la
aplicación de los enfoques genómicos en el estudio de la evolución humana.
2. Que el estudiante proponga nuevas aplicaciones para la resolución de problemas
concretos.
Metodología de la enseñanza
Conferencias (en persona o por videoconferencia interactiva) con investigadores
trabajando en el área de genómica antropológica. Discusión con la participación activa
de los estudiantes. Discusión de artículos por parte de los estudiantes en seminarios.
Evaluación del curso:
Asistencia y participación en conferencias, discusiones. Elaboración de documentos
críticos (ya sea personal o grupalmente) los cuales serán evaluados por el coordinador
del seminario.
Temario
1. Información basada en DNA ancestral.
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1.1. Metodología para su aislamiento.
1.2. Marcadores más empleados.
1.3. Prevención de contaminación con DNA moderno.
2. Información basada en DNA moderno.
2.1. Marcadores más empleados.
2.2. Comparaciones genómicas globales.
3. La evolución humana en el contexto de los primates.
4. Orígenes de las poblaciones humanas modernas
5. Evidencia genética para expansiones regionales y patrones de migración.
6. La conexión entre genes y lenguaje.
Bibliografía Básica
1. Cavalli-Sforza, L. L., A. Piazza, P. Menozzi, and J. Mountain. (1988).
Reconstruction of human evolution: bringing together genetic, archaeological,
and linguistic data. Proc. Natl. Acad. Sci. (USA) 85: 6002-6006.
2. Hummel S. Ancient DNA Typing. Springer Verlag, 2002.
3. Kaessmann, H., and S. Paabo. (2002). The genetical history of humans and the
great apes. J. Intern. Med. 251: 1-18.
4. Jones, M. The Molecule Hunt: Archaeology and the Search for Ancient DNA.
Arcade Publishing, 2002.
5. Ruvolo, M. (1997). Genetic diversity in hominoid primates. Annu. Rev. Anthropol.
26: 515-540.
Bibliografía complementaria
Esta será definida por el coordinador de seminarios previo al inicio de cada semestre,
en consonancia con el programa establecido. Esta podrá incluir las siguientes
referencias:
1. Cann, R. L., M. Stoneking, and A. C. Wilson. (1987). Mitochondrial DNA and
human evolution. Nature 325: 31-36.
2. Chiu, C.-H., and M. W. Hamrick. (2002). Evolution and development of the
primate limb skeleton. Evol. Anthropol. 11: 94-107.
3. Chou, H. H., T. Hayakawa, S. Diaz, M. Krings, E. Indriati, M. Leakey, S. Paabo, Y.
Satta, N. Takahata, and A. Varki. (2002). Inactivation of CMP-N-acetylneuraminic
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acid hydroxylase occurred prior to brain expansion during human evolution.
Proc. Natl. Acad. Sci. (U S A) 99:11736-11741.
4. Ebersberger, I., D. Metzler, C. Schwarz, and S. Paabo. (2002). Genomewide
comparison of DNA sequences between humans and chimpanzees. Am. J.
Hum. Genet. 70: 1490-1497.
5. Enard, W., M. Przeworski, S. E. Fisher, C. S. L. Lai, V. Wiebe, T. Kitano, A. P.
Monaco, and S. Pääbo. (2002). Molecular evolution of FOXP2, a gene involved in
speech and language. Nature 418: 869-872.
6. Enard, W., P. Khaitovich, J. Klose, S. Zollner, F. Heissig, P. Giavalisco, K. NieseltStruwe, E. Muchmore, A. Varki, R. Ravid, G. M. Doxiadis, R. E. Bontrop, and S.
Paabo. (2002) Intra- and interspecific variation in primate gene expression
patterns. Science 296: 340-343.
7. Erlandsson, R., J. F. Wilson, and S. Paabo. (2000). Sex chromosomal
transposable element accumulation and male-driven substitutional evolution in
humans. Mol. Biol. Evol. 17: 804-812.
8. Foster, M. W., and R. R. Sharp. (2002). Race, ethnicity, and genomics: social
classifications as proxies of biological heterogeneity. Genome Res. 12: 844-850.
9. Frazer, K. A., Chen, X. Hinds,D. A., Pant, P. V. K., Patil, N.,and D. R. Cox. (2003).
Genomic DNA insertions and deletions occur frequently between humans and
nonhuman primates. Genome Res. 13: 341-346.
10. Goldstein, D. B., and L. Chikhi. (2002). Human migrations and population
structure: what we know and why it matters. Annu. Rev. Genom. Human. Genet.
3: 129 - 152.
11. Ingman, M., H. Kaessmann, S. Paabo, and U. Gyllensten. (2000). Mitochondrial
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12. Kaessmann, H., F. Heissig, A. V. Haeseler, and S. Pääbo. (1999). DNA sequence
variation in a non-coding region of low recombination on the human X
chromosome. Nature Genet. 22: 78-81.
13. Kaessmann, H., V. Wiebe, G. Weiss, and S. Paabo. (2001). Great ape DNA
sequences reveal a reduced diversity and an expansion in humans. Nat Genet.
27:155-156.
14. Krings, M., C. Capelli, F. Tschentscher, H. Geisert, S. Meyer, A. von Haeseler, K.
Grossschmidt, G. Possnert, M. Paunovic, and S. Paabo. (2000). A view of
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15. Laan, M., and S. Pääbo. (1997). Demographic history and linkage disequilibrium
in human populations. Nature Genet. 17: 435-438.
16. Lai, C. S., S. E. Fisher, J. A. Hurst, F. Vargha-Khadem, and A. P. Monaco. (2001). A
forkhead-domain gene is mutated in a severe speech and language disorder.
Nature 413: 519-523.
17. Liu, G., NISC Comparative Sequencing Program, Zhao, S., Bailey, J. A., Sahinalp, S.
C., Alkan, C., Tuzun, E., Green, E. D., and E. E. Eichler. (2003). Analysis of
primate genomic variation reveals a repeat-driven expansion of the human
genome. Genome Res.13: 358-368
18. Locke, D. P., Segraves, R., Carbone, L., Archidiacono, N., Albertson, D. G., Pinkel,
D. and E. E. Eichler. (2003). Large-scale variation among human and great ape
genomes determined by array comparative genomic hybridization. Genome
Res. 13: 347-357
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19. Mountain, J. L. (1998). Molecular evolution and modern human origins. Evol.
Anthropol. 7: 21-37.
20. O'Rourke, D. H., M. G. Hayes, and S. W. Carlyle. (2002). Ancient DNA studies in
physical anthropology. Annu. Rev. Anthropol. 29: 217-242.
21. Poinar, H. N., M. Kuch, K. D. Sobolik, I. Barnes, A. B. Stankiewicz, T. Kuder, W. G.
Spaulding, V. M. Bryant, A. Cooper, and S. Paabo. (2001). A molecular analysis of
dietary diversity for three archaic Native Americans. Proc. Natl. Acad. Sci. (USA)
98:4317-4322.
22. Romualdi, C., D. Balding, I. S. Nasidze, G. Risch, M. Robichaux, S. T. Sherry, M.
Stoneking, M. A. Batzer, and G. Barbujani. (2002). Patterns of human diversity,
within and among continents, inferred from biallelic DNA polymorphisms.
Genome Res. 12: 602-612.
23. Schmitz, R. W., D. Serre, G. Bonani, S. Feine, F. Hillgruber, H. Krainitzki, S. Paabo,
and F. H. Smith. (2002). The Neandertal type site revisited: interdisciplinary
investigations of skeletal remains from the Neander Valley,Germany. Proc. Natl.
Acad. Sci. (U S A) 99: 13342-13347.
24. Sherry, S. T., M. A. Batzer, and H. C. Harpending. (1998). Modeling the genetic
architecture of modern populations. Annu. Rev. Anthropol. 27: 153-169.
25. Stoneking, M. (1994). In defense of "Eve" - A response to Templeton's critique.
Amer. Anthropol. 96: 131-141.
26. Stoneking, M., J. J. Fontius, S. L. Clifford, H. Soodyall, S. S. Arcot, N. Saha, T.
Jenkins, M. A. Tahir, P. L. Deininger, and M. A. Batzer. (1997). Alu insertion
polymorphisms and human evolution: evidence for a larger population size in
Africa. Genome Res. 7: 1061-1071.
27. Templeton, A. R. (1993). The "Eve" hypothesis: a genetic critique and
reanalysis. Amer. Anthropol. 95: 51-72.
28. Wells, R. S., et al. (2001) The Eurasian heartland: a continental perspective on Y
chromosome diversity. Proc. Natl. Acad. Sci. (USA) 98:10244-10249.
Perfil profesiográfico.
Dada la actualidad y profundidad que se desea en cada una de las asignaturas del
programa, se emplearán preferentemente investigadores con doctorado, que laboren en
temas relacionados a la asignatura. En casos particulares, el Comité Académico podrá
autorizar la participación de estudiantes doctorales avanzados o de profesores con
experiencia en la temática de la asignatura.
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