Parte 1 3 general Introducción Índice a la genética de contenidos 3.1 duplicación del adn 3.1.1 etapas de la duplicación 3.1.2 duplicación en procariontes 3.2 transcripción 3.2.1 etapas de transcripción 3.3 código genético y traducción 3.3.1 código genético 3.3.2 traducción y eucariontes Extras Ejemplos Cuestiones Objetivos Conocer las diferentes etapas de la duplicación del ADN. Conocer las diferentes etapas de la transcripción del ADN. Identificar las diferencias básicas entre la transcripción en procariotas y eucariotas. Conocer el Código Genético. Conocer las diferentes etapas de la traducción de ácidos nucleicos a proteínas. Relacionar los ácidos nucleicos con las proteínas mediante el Código Genético. 3.1 Duplicación del adn El proceso de duplicación consiste en la separación de las dos cadenas complementarias del ADN (molécula madre) y la formación de dos nuevas (moléculas Nota hijas). Cada molécula hija es complementaria a una de las cadenas de la molécula madre, por ello que a este tipo de La herencia del material genético se duplicación se le llama “semiconservativa” porque cada una basa en el proceso de duplicación de las dos moléculas hijas contiene la mitad de la molécula o replicación de ADN y su estudio madre. ha permitido la puesta a punto de 3.1.1 Etapas numerosas técnicas biotecnológicas, como la reacción de la PCR. de la duplicación Existen 3 etapas bien diferenciadas en el proceso de duplicación: la iniciación, la elongación y la terminación. importante a. iniciación El objetivo de esta primera etapa es indicar el inicio de la replicación y separar las dos hebras “madres”, para permitir así la entrada del complejo enzimático que dará lugar a la replicación del ADN, permitiendo su acceso al origen de la replicación. El inicio de la duplicación comienza en una secuencia específica de nucleótidos denominada origen de replicación, en el que hay un gran contenido de adenina y timina. b. elongación Para poder separar las dos hebras de una molécula tan estable como es el ADN, la célula presenta una serie de proteínas iniciadoras que desestabilizan la doble hélice como: Girasas: enzimas que desenrollan la doble hélice efectuando unos cortes en el ADN. Helicasas: generan unos bucles conocidos como horquillas de replicación mediante la ruptura de los puentes de hidrógeno existentes entre las bases complementarias de la doble hélice. Proteínas ssb: proteínas de unión a cadena que permiten que el ADN no se vuelva a naturalizar o forme estructuras secundarias. Topoisomerasas: evitan que los extremos de la El objetivo de esta segunda etapa es sintetizar zona de ADN que se va a replicar formen super las hebras hijas de ADN. Para ello, una enrollamientos. vez separadas las dos hebras madres, un oligonucleótido de ARN específico, llamado ARN cebador, determina el punto donde la enzima que es realmente responsable de la síntesis del ADN, la ADN polimerasa, comienza a añadir nucleótidos. Este ARN cebador está sintetizado por las ARN primasas. La ADN polimerasa sintetiza las hebras hijas siempre en sentido 5´ → 3´ de la cadena madre por lo que la cadena madre antiparalela que va en sentido en sentido 3´ → 5´, necesita la presencia de una enzima extra, la ADN polimerasa I y un ARN cebador que deja un extremo 3´ libre, sintetizando así ADN de forma discontinua en forma de fragmentos de Okazaki. c. terminación La síntesis del ADN prosigue hasta que todo el cromosoma ha quedado replicado longitudinalmente. En el caso de la cadena hija procedente de la hebra madre que va en sentido 3´ → 5´, el ADN ligasa une los polinucleótidos de los fragmentos de Okazaki entre sí, catalizando las reacciones de condensación que unen los grupos fosfato y azúcar de los nucleótidos contiguos, recomponiendo la integridad de esta cadena hija, denominada retardada. 3.1.2 Duplicación Nota Ecuación química. Los nucleótidos (dNTP) utilizados en la replicación del ADN por la ADN polimerasa liberan un grupo pirofosfato (PPi) para introducir el correspondiente dNMP. en procariontes y eucariontes En procariotas como Escherichia coli, el ADN genómico es circular. El desenrollamiento y apertura de la doble hélice se realiza en el punto ori-c, interviniendo un grupo de enzimas y proteínas, cuyo conjunto se denomina replisoma. 40 En eucariotas como el hongo Saccharomyces cerevisiae, la traducción, al igual que en procariontes es semiconservativa y bidireccional pero el inicio se da en las burbujas de replicación (puede haber unas 100 a la vez). Las enzimas que intervienen son similares a las que actúan en las células procariotas, pero en los eucariotas es además necesaria la presencia de enzimas que han de duplicar las histonas, que forman parte de los nucleosomas. Los nucleosomas viejos permanecen en la hebra conductora. 3.2 Transcripción Durante la transcripción, las secuencias de ADN son copiadas a ARN mediante una enzima llamada ARN polimerasa. La transcripción produce ARN mensajero (ARNm) como primer paso de la síntesis de proteínas. 3.2.1 Etapas de la transcripción Nota La información genética recogida en el ADN se ejecuta mediante un complejo sistema en el que interviene la síntesis de proteínas o enzimas que son las que llevarán a cabo la mayoría de los procesos biológicos. Este proceso, denominado expresión genética comienza con la transcripción, denominándose así porque el ADN se transcribe a otro tipo de moléculas. Al igual que en la duplicación del ADN, las etapas de la transcripción son tres: iniciación, elongación y terminación, existiendo diferencias entre eucariotas y procariotas. a. iniciación El objetivo de la etapa de iniciación es que el complejo de transcripción de ARN polimerasa, reconozca secuencias específicas de ADN donde comenzar la transcripción mediante la síntesis de un ARN cebador. Nota El inicio de la secuencia de ADN que se va a Los promotores se localizan en los extremos transcribir a ARNm viene determinado por unas 5’-terminales de los genes. Sin embargo la secuencias de nucleótidos definidas llamadas secuencia promotora, además del promotor promotores, siendo las más conocidas la caja está constituida por unos 70 pares de bases TATAAT y la caja TTGACA. En el caso de células nitrogenadas o más (1.000-2.000), donde procariotas, la ARN polimerasa es guiada hacia se unen diferentes proteínas que controlan el promotor mediante una serie de proteínas la transcripción, como la holoenzima ARN llamadas factores sigma. El reconocimiento del promotor por la ARN polimerasa corre a cargo de la subunidad sigma del enzima. La unión de ARN polimerasa a ADN se llama complejo cerrado. En este momento la ARN polimerasa se une a una de las cadenas del ADN bicatenario y éste se enrolla sobre la enzima. La interacción entre la ARN polimerasa y el ADN está estabilizada por diferentes tipos de enlaces débiles como interacciones iónicas, interacciones de Van der Waals y enlaces de hidrógeno. Nota En la zona del ADN donde se produce la unión con el ARN polimerasa, se Los ribonucleótidos produce una desnaturalización de 18 pares de bases y apertura de las trifosfato se van dos cadenas complementarias para generar una estructura denominada apareando al ADN horquilla de transcripción o complejo abierto. Es en esta estructura molde para formar el donde comienza la síntesis del ARN cebador a partir del nucleótido cebador, liberando, número 10 del ADN molde (Fig. 3.1). La subunidad sigma del ARN polimerasa abandona el complejo de transcripción cuando el cebador alcanza una longitud de 12 ribonucleótidos. al igual que ocurre con los dNTP de la duplicación del ADN, grupos pirofosfatos. 3 En la etapa de iniciación la búsqueda del promotor por la ARN polimerasa es muy rápida, sin embargo la formación de la burbuja de transcripción o apertura del ADN y la síntesis del cebador es muy lenta (Fig. 3.1). introducción a la genética molecular polimerasa. 41 A. Complejo cerrado. Unión de la holoenzima a la región promotora 5’ ARN polimerasa punto de inicio -35 pb 3’ ADN sigma B. Complejo abierto. Separación de la doble hebra -35 pb -35 pb -10 pb sigma 5’ C. Elongación en dirección 5’→ 3’, a los 12 nucleótidos transcritos a la subunidad sigma se disocia -35 pb ARNm sigma Fig. 3.1 Inicio de la transcripción b. elongación Una vez sintetizado el ARN cebador comienza la segunda etapa de la transcripción, la elongación. En esta etapa la ARN polimerasa se va desplazando por el ADN molde mediante la formación de sucesivas horquillas de replicación catalizando la elongación de la cadena del ARN mediante la formación del enlace fosfodiéster entre la cadena de ARN ya formada y el ribonucleótido trifosfato entrante siguiente. Nota c. terminación La terminación es la última etapa de la transcripción y su objetivo es la de desensamblar la unión de la ARN polimerasa del ADN justo cuando la elongación se ha completado. Al igual que la iniciación de la transcripción, la terminación también está señalizada por la información contenida en la secuencia del ADN que se está transcribiendo. Estas secuencias, ricas en guanina y citosina, se encuentran localizadas en los extremos de los genes, seguidas de secuencias ricas en timina y formando secuencias 42 En el caso de eucariotas la transcripción se produce en el núcleo, siendo un proceso de mayor complejidad que en procariotas ya que una vez transcrito, el ARN sufre un proceso de maduración que tras cortes y empalmes sucesivos elimina ciertos segmentos del ADN llamados los intrones (que no son necesarios para la correcta expresión de la proteína) para producir el ARNm. Por ello, un mismo gen o secuencia de ADN, puede dar lugar a diferentes moléculas de ARNm y por tanto, producir diferentes proteínas. El proceso de transcripción en eucariotas está además regulado por factores de regulación como son los “enhancer”, proteínas que incrementan notablemente la actividad de transcripción de un gen en la célula.