Laboratorio 8: Familia Enterobacteriaceae Métodos de Identificación Rápida Biol: 3725L Objetivos Conocer los métodos rápidos para la identificación de bacterias (API 20E, Enterotubo II, Biolog y Vitek). Inocular un desconocido en varias pruebas bioquímicas Tomar datos de las reacciones bioquímicas después de 24 horas de inoculación. Características generales de la familia Enterobacteriaceae Bacilos (o coco-bacilos) Gram negativos Flora normal del intestino de animales de sangre caliente. Catalasa positivos Oxidasa negativos Causantes de enfermedades nosocomiales. Patógenos humanos más comunes. No producen esporas Temperatura óptima entre 32°45.5°C. Anaerobios facultativos. Algunos producen cápsula. Algunos fermentan lactosa. Pueden ser mótiles (flagelo). Miembros de la Familia Enterobacteriaceae Citrobacter sp. Enterobacter sp. Salmonella typhimurium Salmonella enteritidis Escherichia sp. Klebsiella sp. Morganella sp. Proteus sp. Shigella dysenteriae Yersinia pestis Providencia sp. Salmonella sp. Serratia sp. Shigella sp. Serratia marcescens Yersinia sp. Klebsiella pneumoniae Miembros de la Familia Enterobacteriaceae Los géneros patogénicos más comunes se clasifican en tres grupos Coliformes: bacilo, Gram -, fermentan lactosa a gas y acido, microbiota normal, pueden ser patógenos oportunistas. No coliformes oportunistas: no fermentan lactosa. Patógenos verdaderos Enfermedades Gastrointestinales Tracto urinario Meningitis Septicemia Pneumonia Modo de Transmición Transmición Alimentos contaminados Persona a Persona Agua contaminada Contacto con animal Ruta Oral Propiedades virulentas de E.coli Enterohemorrágico Enterohemorr ágico Diarrea en humanos, bovinos, gatos y perros. Escherichia coli O157:H7 Clasificada de acuerdo a sus antígenos somáticos (O) y flagelares (H). Tolerancia acídica (pH bajo) Tolerante a muchos antibióticos Escherichia coli O157:H7 Causa principal de colitis hemorrágica o diarrea con presencia de sangre. Puede progresar a Síndrome Urémico Hemolítico. Afecta riñones Puede causar Púrpura Trombocitopenia Trombótica Moretones Disminución de plaquetas (trombocitos) Trombos (coágulos en los vasos sanguíneos Métodos rápidos de identificación de la Familia Enterobacteriaceae Métodos rápidos de identificación API 20E (Analytical Profile Index) Provee muchos resultados de una sola inoculación. 20 microtubos con sustratos deshidratados (rehidratación con suspensión de bacteria) Se pueden identificar 127 géneros y 550 spp. diferentes Bacterias oxidasa-negativo Gram-negativo de la familia Enterobacteriaceae y otros Gram - API 20E Incubar a 35-37ºC 18-24 hrs API 20E Provee lectura de 22 pruebas bioquímicas Utilización Se genera anaerobiosis con aceite mineral estéril en pruebas cuyas siglas están subrayadas: Ej. ADH, LDC, ODC, etc Las pruebas marcadas con un recuadro inferior, se deben llenar completamente: Ej. CIT , VP , etc. Procedimiento de API 20E Preparación de la suspensión Inocule una colonia (2-3mm diámetro) del cultivo puro de su bacteria en solución salina 0.85% Asegúrese que la suspensión sea homogénea. Procedimiento de API 20E •Luego de hacer la suspensión inocular los microtúbulos de API 20E •Añadir 5 ml de agua en la bandeja de incubación para proveer atmósfera húmeda. Como llenar los microtúbulos ¿Como se lee el API 20E? Aminoácidos analizados son (en orden) arginina, lisina y ornitina. Decarboxilación: reacción alcalina (cambio de color a rojo) Carbohidratos analizados son glucosa, manitol, inositol, sorbitol, ramanosa, sacarosa, melibiosa, amygdalina y arabinosa. Fermentación: reacción ácida (cambio de color a amarillo) Producción de H2S e hidrólisis de gelatina (cambio a color negro en todo el microtubo). Interpretación del API 20E Apuntar los resultados en la tabla de tabulación (1, 2, o 4 puntos para reacciones +, 0 puntos para reacciones -) . La prueba de oxidasa debe ser negativa. Tres pruebas son añadidas a la vez para dar un código de 7 dígitos (profile index number), el cual es interpretado en el manual de códigos. Ventajas de API 20E Rápido Eficaz Permite realizar numerosas pruebas a la vez Desventajas de API 20E Solo para microorganismos no fastidiosos. Cepas Gram negativas y oxidasa negativa. Bacterias de la Fam. Enterobacteriaceae. De encontrarse Salmonella o Shiguella spp., es necesario llevar a cabo pruebas serológicas para confirmar la identificación. API 20E Resultados para diferentes miembros de la Familia Enterobacteriaceae Sistema de Enterotubo II Identificar miembros de la familia Enterobacteriaceae, fermentadoras de glucosa y que son oxidasa negativa. (Salmonella, Yersinia, Escherichia etc.) Algunas de las pruebas usadas en este sistema son: Simmon Citrate, Triple Sugar-iron agar, ureasa entre otros. Sistema de Enterotubo II Tubo con 12 compartimentos, cada uno con un medio de cultivo sólido diferente. 15 pruebas estándar preformadas: Aerobia y anaerobias Se inocula con una aguja, que se pasa por el centro de los compartimentos Incubación: 18 – 24 horas a 37ºC (oscuridad) Desventajas Poco preciso Riesgos de contaminación de las pruebas Se diagnosticaban erróneamente géneros de bacterias Sistema Enterotubo II Lectura Observar cambios de color Identificación: Estructurar un código de 5 dígitos (Biocode) Consultar con el manual ENCISE (Enterobacteriaceae Numerical Coding and Identification System for Enterotube) Sistemas Computarizados VITEK Identificación y/o determinación de reacción antibiótica de bacterias y levaduras anaerobias (más de 300 especies). 30 pozos con pruebas bioquímicas deshidratadas. Identificación en 2 a 7 hrs. La automatización aporta mayor seguridad, suprimiendo las manipulaciones repetitivas. Una vez inoculada, queda herméticamente cerrada y por lo tanto es manipulable sin riesgo de contaminación. No es necesario añadir ningún reactivo, lo cual evita cualquier riesgo de olvido o error. Sistemas Computarizados Inoculador / Sellador El cual permite la inoculación de las tarjetas en pocos minutos. Incubador / Lector Asegura simultáneamente la incubación y la lectura de las tarjetas para una capacidad que varía de 32 a 480 tarjetas según el modelo. Ordenador Efectúa un control permanente de las operaciones en curso, memoriza los valores, trata e interpreta los resultados. Impresora Sistemas Computarizados BIOLOG: Identificación de 1900 bacterias, levaduras y hongos en base a su capacidad enzimática. Sistema de microplacas de 96 fosas cada una conteniendo una fuente única de carbono, nutrientes básicos y un indicador colorimétrico. El indicador colorimétrico que utiliza este sistema es una sal de tetrazolium que en su forma oxidada es incolora. Cuando el organismo es introducido en la gran variedad de sustratos de carbono en la microplaca se produce una huella con un patrón característico. Los resultados bioquímicos de la muestra son leídos y guardados en segundos automáticamente, eliminando la subjetividad visual de la interpretación. Sistemas Computarizados BIOLOG: Posteriormente son comparados con la extensa base de datos para su identificación final. Los resultados se interpretan y se registran automáticamente. Especie identificada se exhibe en un monitor de la pc junto con su patrón de la reacción. También una lista de 10 especies con los patrones relacionados más cercanos y otra estadística útil. La tecnología de Biolog es tan sensible que puede detectar cultivos mezclados o contaminados. Práctica Práctica De las colonias aisladas de la práctica de la semana anterior, se inoculará aproximadamente 11 colonias (una en cada columna) y la primera columna representa el control negativo. De MacConkey Gram negative 1- SIM 2- Citrate 3-MacConkey 4- Glucose 5- EMB 6- Urea 7- Colilert 8- Control De MSA Gram positive 1- Catalase 2- BEA 3- MSA 4- Glucose 5- Glucose 6.5%NaCl 6- Urea 7- Enterolert 8- Control Instrucciones Inocular de la misma colonia, cada fosa de las columnas de la placa. Seguir instrucciones del instructor. Incubar a 37ºC/24hrs. Observar sus resultados y anotarlos. Posibles resultados Medio Negativo Positivo Dextrosa Rojo Amarillo Lactosa Rojo Amarillo Bile Esculine Agar Marrón claro Negro Manitol Rojo Amarillo SIM Marrón claro Motilidad Turbidez difusa Producción de H2S Negro Citrato Verde Azul Urea Rojo Rosado “Fuschia” colilert Amarillo claro Amarillo intenso = coliforme total Fluorescencia = E. coli Enterolert No Fluorescencia Fluorescencia = Enterococcus sp. MacConkey Colonias claras (G-) Colonias fusha = fermentador de Lactosa EMB Colonias oscuras (G-) Verde metalico = E.coli Catalase No burbujas Burbujas Fermentación de carbohidratos Bile Esculin Agar MSA Fermentación del mannitol. SIM Sulfide Indole Motility Simmon’s citrate negativo positivo Urease