GLOSARIO DE TÉRMINOS Estructura y propiedades de las proteínas

GLOSARIO DE TÉRMINOS
Estructura y propiedades de
las proteínas
Martínez Jiménez Damaris Adriana
Profesoras:
Sobeida Sánchez Nieto
Bertha Reséndiz Vázquez
[Seleccionar fecha]
20 mayo 2010
Absorbancia.cantidad de intensidad de luz que absorbe una muestra. Está definida
como:
siendo la intensidad después de haber habido la absorción e
que se hace incidir en la muestra.
la intensidad de la luz
Albumina de suero bovino (BSA). Sustancia purificada ideal para las aplicaciones
industriales y de investigaciones las cuales requieren una proteína de alta pureza y baja
en endotoxinas, libre de acido graso, y de IgG, libre de proteasas y libre de virus
bovino.
Catalizador. Sustancia química, simple o compuesta, que modifica la velocidad de una
reacción química, interviniendo en ella pero sin llegar a formar parte de los productos
resultantes de la misma, se caracterizan con arreglo a las dos variables principales que los
definen: la fase activa y la selectividad. La actividad y la selectividad, e incluso la vida
misma del catalizador, dependen directamente de la fase activa utilizada.
Cinética enzimática. Estudia la velocidad de las reacciones químicas que son catalizadas
por las enzimas. El estudio de la cinética de una enzima permite explicar los detalles de
su mecanismo catalítico, su papel en el metabolismo, cómo es controlada su actividad
en la célula y cómo puede ser inhibida su actividad por fármacos o venenos o
potenciada por otro tipo de moléculas.
Coeficiente de partición. Cociente o razón entre las concentraciones de esa sustancia en
las dos fases de la mezcla formada por dos disolventes inmiscibles en equilibrio. Por
tanto, ese coeficiente mide la solubilidad diferencial de una sustancia en esos dos
disolventes.
Donde: [sustancia]1 es la concentración de la sustancia en el primer disolvente y,
análogamente [sustancia]2 es la concentración de la misma sustancia en el otro
disolvente.
Cromatografía. Método físico de separación para la caracterización de mezclas
complejas. Conjunto de técnicas basadas en el principio de retención selectiva, cuyo
objetivo es separar los distintos componentes de una mezcla, permitiendo identificar y
determinar las cantidades de dichos componentes.
Las técnicas cromatográficas consisten en la utilización de una fase móvil que consiste en
un fluido (gas, líquido o fluido supercrítico) que arrastra a la muestra a través de una
fase estacionaria que se trata de un sólido o un líquido fijado en un sólido. Los
componentes de la mezcla interaccionan en distinta forma con la fase estacionaria. De
este modo, los componentes atraviesan la fase estacionaria a distintas velocidades y se
van separando. Diferencias sutiles en el coeficiente de partición de los compuestos da
como resultado una retención diferencial sobre la fase estacionaria y por tanto una
separación efectiva.
La cromatografía puede cumplir dos funciones básicas que no se excluyen mutuamente:
 Separar los componentes de la mezcla, para obtenerlos más puros y que puedan
ser usados posteriormente (etapa final de muchas síntesis).
 Medir la proporción de los componentes de la mezcla (finalidad analítica). En
este caso, las cantidades de material empleadas son pequeñas.

Cromatografía de afinidad o inmunoafinidad. Método que emplea esferas de gel que
conforman el lecho de la columna presentan unido en su superficie un ligando, una
molécula ante la que tiene afinidad una o más de las proteínas presentes en la mezcla a
separar. La naturaleza del ligando es muy variada, puede ser un receptor (proteína)
unido a las bolas, que seleccionará su/s ligando/s de una mezcla compleja, o el antígeno
empleado en una inmunización el que recubre las bolas y que retendrá del suero del
animal aquellos anticuerpos que lo reconocen (anticuerpos purificados por afinidad), o
en el caso concreto de la inmunoafinidad el ligando que recubre las bolas son
anticuerpos que retienen en la columna a aquellas proteínas que contienen los epítopos
que reconocen.
Cromatografía de filtración en gel. Técnica que permite separar moléculas en función de
su tamaño molecular. La capacidad separadora reside fundamentalmente en el gel cuya
matriz consta de un gran número de esferas porosas microscópicas. Cada gel se
caracteriza por un rango de fraccionamiento que depende del tamaño de sus poros.
Cromatografía De Intercambio Iónico. Método cromatográfico predominante utilizado
en la producción de macromoléculas biológicas. Está basada en la atracción entre iones
del soluto y puntos cargados que existen en la fase estacionaria. En el caso de
intercambiadores aniónicos, grupos cargados positivamente en la fase estacionaria atraen
aniones del soluto. Los intercambiadores catiónicos contienen puntos cargados
negativamente que atraen cationes del soluto.
Electroforesis. Método en el que se utiliza una corriente eléctrica controlada con la
finalidad de separar biomoleculas según su tamaño y carga eléctrica a través de una
matriz gelatinosa. Fundamento. Cuando una mezcla de moléculas ionizadas y con carga
neta son colocadas en un campo eléctrico, estas experimentan una fuerza de atracción
hacia el polo que posee carga opuesta, dejando transcurrir cierto tiempo las moléculas
cargadas positivamente se desplazaran hacia el cátodo (el polo negativo) y aquellas
cargadas positivamente se desplazaran hacia el ánodo (el polo positivo).
Electroforesis gel de. Consiste en un polímero soluble de muy alto peso
molecular que atrapa moléculas de agua y forma un tamiz que dificulta
el movimiento de los solutos, consecuentemente, la migración
electroforética de las moléculas será mas lenta, pero el ensanchamiento
del frente se vera reducido.
fig. Fragmentos de ADN teñidos en bromuro de etidio
tras una electroforesis en un gel de agarosa.
Enzimas. moléculas de naturaleza proteica que catalizan reacciones químicas.
En estas reacciones, las enzimas actúan sobre unas
moléculas denominadas sustratos, las cuales se convierten
en moléculas diferentes denominadas productos. Casi
todos los procesos en las células necesitan enzimas para
que ocurran a unas tasas significativas. A las reacciones
mediadas por enzimas se las denomina reacciones
enzimáticas.
Debido a que las enzimas son extremadamente selectivas
con sus sustratos y su velocidad crece sólo con algunas
reacciones, el conjunto (set) de enzimas sintetizadas en una
célula determina el tipo de metabolismo que tendrá cada
fig. Estructura de la triosafosfato isomerasa. Conformación en
célula. A su vez, esta síntesis depende de la
forma de diagrama de cintas rodeado por el modelo de relleno
regulación de la expresión génica.
de espacio de la proteína. Esta proteína es una eficiente enzima
involucrada en el proceso de transformación de azúcares en
energía en las células.
Espectrofotometría método de análisis óptico que fundamenta que todas las sustancias
pueden absorber energía radiante. La absorción de las radiaciones ultravioletas, visibles e
infrarrojas depende de la estructura de las moléculas, y es característica para cada
sustancia química.
Cuando la luz atraviesa una sustancia, parte de la energía es absorbida; la energía
radiante no puede producir ningún efecto sin ser absorbida.
El color de las sustancias se debe a que éstas absorben ciertas longitudes de onda de la
luz blanca que incide sobre ellas y solo dejan pasar a nuestros ojos aquellas longitudes
de onda no absorbidas.
La espectrofotometría ultravioleta-visible usa haces de radiación del espectro
electromagnético, en el rango UV de 80 a 400 nm, principalmente de 200 a 400 nm y
en el de la luz visible de 400 a 800 nm , por lo que es de gran utilidad para caracterizar
los materiales en la región ultravioleta y visible del espectro.
Al campo de luz uv de 200 a 400 nm se le conoce también como rango de uv cercano ,
la espectrofotometría visible solamente usa el rango del campo electromagnético de la
luz visible , de 400 a 800 nm.
Lactato deshidrogenasa. Enzima catalizadora que corresponde a la
categoría de las oxidorreductasas, en la que el piruvato es reducido a
lactato debido a la oxidación de NADH a NAD+. La lactato
deshidrogenasa (140 kDa) está formada por 4 subunidades, cada una de
unos 35 kDa. Se conocen dos tipos de subunidades: H y M, que
presentan pequeñas diferencias en su secuencia de aminoácidos. Ambas
pueden asociarse independientemente para formar tetrámeros, dando
lugar a cinco isoenzimas (isoformas de la enzima), correspondientes a las
cinco combinaciones posibles, cada una de las cuales se encuentra
Fig. Estructura cuaternaria de la LDH
preferentemente en determinados tejidos y puede identificarse
(lactato deshidrogenasa) tetrámero M4
mediante electroforesis. La lactato deshidrogenada de músculo
se encuentra formada por 4 subunidades M y es conocida como la LDH-5 (M4).
Ley de Lambert –Beer. relación empírica que relaciona la absorción de luz con las
propiedades del material atravesado.
Relaciona la intensidad de luz entrante en un medio con la intensidad saliente después
de que en dicho medio se produzca absorción. La relación entre ambas intensidades
puede expresarse a través la siguiente relación:
En la que:
I1 I0 son las intensidades saliente y entrante respectivamente; a es el coeficiente de
absorción, l es la longitud atravesada por la radiación, c es la concentración del medio.
Peso molecular. Masa total de los protones y neutrones en un átomo único en estado de
reposo.
Precipitación por salado método de separación de proteínas de su estado natural
(actividad biológica).El sulfato de amonio es una de las sales más utilizadas para la
precipitación salina de proteínas. Es muy soluble (760 g de sulfato de amonio/1000 ml.
de agua a una temperatura de 20°C, temperatura promedio del laboratorio) y el ión
sulfato divalente permite
alcanzar altas fuerzas iónicas.
En esta determinación la
proteína blanca del huevo (clara) será separada en fracciones de globulina y albúmina.
Proteína. Molécula orgánica compuesta por una sola cadena polipeptídica; en tal caso
reciben el nombre de manométricas. Cuando la proteína está formada por varias
cadenas polipeptídicas que pueden o no ser idénticas entre sí, reciben el nombre de
oligoméricas. Poseen pesos moleculares elevados. Todas producen por hidrolisis µ aminoácidos.
Proteína composición de las. Las proteínas preincipalmente están compuestas de :
 Carbono
 Hidrógeno
 Nitrógeno
 Oxígeno
Y otros elementos tales como:
 Azufre
 Hierro
 Fósforo
 Cinc
fig. Relación de tamaños de las moléculas principales en las proteínas
Proteína desnaturalización de las. Modificaciones en la estructura de la proteína
que traen como resultado una alteración o desaparición de sus funciones. Puede
producirse por una factores físicos cómo : el calor, las radiaciones ultravioleta,
las altas presiones; o químicos cómo : ácidos, bases, sustancias con actividad
detergente.
Este fenómeno genera la ruptura de los enlaces disulfuro y los puentes de
hidrógeno, generando la exposición de estos.
Cuando la proteína es desnaturalizada pierde sus funciones cómo: viscosidad,
velocidad de difusión y la facilidad con que se cristalizan.
La reversibilidad de la desnaturalización, depende que tan fuertes sean los
agentes que desnaturalizaron la proteína.
fig. Desnaturalización reversible de una
ribonucleasa (1) y renaturalizacion (2)
Proteína Estructura de las. de acuerdo a la estructura de las proteínas
estas pueden clasificarse en :
 Estructura Primaria : Es el esqueleto covalente de la cadena
polipeptídica, y establece la secuencia de aminoácidos. Rige el orden
de encadenamiento por medio del enlace polipeptídico.

Estructura Secundaria : Ordenación regular y periódica de la
cadena polopeptídica en el espacio.Rige el arreglo espacial de la cadena
polipeptídica en el espacio.
Arreglos: Hélice-a , Hélice-b , Hélice Colágeno.

Estructura Terciaria: Forma en la cual la cadena polipeptídica se curva o se
pliega para formar estructuras estrechamente plegadas y compactas como la de las
proteínas globulares.
Fig. Estructura de las proteínas
Rige el arreglo tridimensional en el cual participan las atracciones intermoleculares.
(Fuerzas de Van der Walls, Puentes de Hidrógeno, Puentes disulfuro, etc)

Estructura Cuaternaria : Es el arreglo espacial de las subunidades de una
proteínas, para conformar la estructura global.
Es el acompañamiento paralelo de las cadenas polipeptídicas, responsable de las
funciones de las proteínas.

Proteína purificación de. Aislamiento de la molécula que permite estudiar tanto su
actividad enzimática como la función específica que desempeña en la célula o tejido de
donde se aisló.
Punto isoeléctrico. es el pH al que una sustancia anfótera tiene carga neta cero. En
moléculas complejas, tales como las proteínas, se combinan con los iones hidrógeno y
con otros iones presentes en la disolución, dando lugar a la carga neta de la molécula. A
la concentración de iones hidrógeno, o al pH, para el cual la concentración del ion
híbrido de una proteína es máxima y el movimiento neto de las moléculas de soluto en
un campo eléctrico es prácticamente nulo, se le denomina punto isoeléctrico.
salting in. Fenómeno por el cual la concentración de sal aumenta la solubilidad de la
proteína por la concentración de iones en el medio.
Salting out. precipitación de una proteína por saturación de la solución con sales neutras
Técnica de Bradfor procedimiento simple para la determinación de la concentración de
la proteína en soluciones Se basa en la unión de un colorante, Comassie Blue G-250
(también Serva Blue) a las proteínas. El colorante, en solución ácida, existe en dos
formas una azul y otra naranja. Las proteínas se unen a la forma azul para formar un
complejo proteína-colorante con un coeficiente de extinción mayor que el colorante
libre. Este método es sensible (1-15 μg), simple, rápido, barato y pocas sustancias
interfieren en su determinación. Entre las sustancias que interfieren están los detergentes
y las soluciones básicas.
Técnica de Lowry: método colorimétrico de valoración
cuantitativa de las proteínas. A la muestra se añade un
reactivo que forma un complejo coloreado con las
proteínas, siendo la intensidad de color de la disolución resultante proporcional a la
concentración de proteínas, según la ley de Lambert-Beer (ver apartado de fotometría).
Este método consta de dos etapas:
1) Los iones Cu2+, en medio alcalino, se unen a las proteínas formando complejos con
los átomos de
Fig. Reacción en técnica de Lowry
nitrógeno de los enlaces peptídicos. Estos complejos Cu2+proteína tienen un color azul claro. Además, provocan el desdoblamiento de la
estructura tridimensional de la proteína, exponiéndose los residuos de tirosina que
van a participar en la segunda etapa de la reacción. El Cu2+ se mantiene en solución
alcalina en forma de su complejo con tartrato.
2) La reducción, también en medio básico, del reactivo de Folin-Ciocalteau por los
grupos fenólicos de los residuos de tirosina presentes en la mayoría de las proteínas,
actuando el cobre como catalizador. El principal constituyente del reactivo de
Folin-Ciocalteau es el ácido fosfomolibdotúngstico, de color amarillo, que al ser
reducido por los grupos fenólicos da lugar a un complejo de color azul intenso.
Técnica de Biuret:reacción que se basa en la formación de un complejo coloreado entre
el Cu2+ y los grupos NH de los enlaces peptídicos en medio básico.
1Cu2+ se acompleja con 4 NH y la intensidad de coloración es directamente
proporcional a la cantidad de proteínas (enlaces peptídicos) y la reacción es bastante
específica, de manera que pocas sustancias interfieren.
La sensibilidad del método es muy baja y sólo se recomienda para la cuantificación de
proteínas en preparados muy concentrados (por ejemplo en suero).
Velocidad de reacción relación de el cambio en la concentración de reactivos o
productos con el tiempo expresado, usualmente, en mol/l × s. Se establece midiendo la
variación de la concentración de los reactivos o de los productos con el tiempo. Si se
selecciona un producto, la expresión de la velocidad tiene signo positivo, ya que la
variación de su concentración siempre es positiva.