UNIVERSIDAD RICARDO PALMA Abril, 2014 Volumen 1, Nº1 Laboratorio de Microbiología Boletín Científico Visitas de Estudios Integrantes del Laboratorio vistan el INS y FARVET. Pág. 4 Capacitación de alumnos en el extranjero Nuestros compañeros realizaron trabajos en la Universidad de Yale en E.E.U.U. Pág. 8 ONCOSALUD—URP; trabajando juntos Se inicia un prometedor ciclo de eventos académicos. Pág. 9 Proyectos de Investigación Múltiples investigaciones se inician en el laboratorio. Pág 11-16. Dirección: Contacto: Facultad de Ciencias Biológicas Laboratorio de Microbiología Av. Benavides 5440, Santiago de Surco, alcides.guerras@urp.pe Lima 33—PERU http://www.urp.edu.pe/biologia/index.php?urp=Laboratorios Página 2 Laboratorio de Microbiología Volumen 1, nº 1 Editorial Fecunda Labor de Verano 2014 Les damos la más cordial bienvenida a este nuevo ciclo académico 2014-I. En esta oportunidad les hacemos llegar el nuevo boletín informativo producido por los miembros del Laboratorio de Microbiología de la Facultad de Ciencias Biológicas de la Universidad Ricardo Palma. En este boletín queremos dar a conocer todas las actividades que hemos realizado durante este verano y así mismo brindarles información acerca de los eventos que están próximos, con el objetivo de ayudarlos en su formación académica e invitarlos a participar en los mismos. En el presente boletín ustedes podrán encontrar información relevante acerca de los proyectos de investigación que se están realizando en el laboratorio, las visitas que hemos realizado a diferentes institutos de investigación, alumnos de otras universidades que han formado parte del laboratorio, próximos convenios de cooperación con instituciones y mucho más. Les reiteramos nuestro saludo por el comienzo de este nuevo ciclo de estudios y les deseamos éxitos en todas las tareas y trabajos que realicen, recuerden que todo esfuerzo tiene su recompensa. Director: Alcides Guerra Santa Cruz Editor General: Santiago Justo Arévalo Editor de Estilo: Tania Churasacari Vinces Editor Científico: Gonzalo Tueros Farfán Cómite editor: Cindy Cajachagua Pucuhuaranga Diego Santiago Bravo Marlon Morales Carla Saldaña Serrano Luis Pabón Rodríguez Miguel Gonzáles Olivos Página 3 Laboratorio de Microbiología Volumen 1, nº 1 Editorial Palabras del Dr. Tomás Agurto Saenz Decano de la Facultad de Ciencias Biológicas Profesor Principal en la Cátedra de Microbiología Con estas palabras describo brevemente a la microbiología y al microbiólogo como paradigmas de la ciencia y el conocimiento. Un microbio con la ayuda de un piojo derrotó a Napoleón en las afueras de Moscú, con el tifus producido por una rickettsia cambio el mundo feudalista-capitalista en socialista. Una bacteria es madre y ancestro de todos los seres vivientes, tienen su estructura y componentes químicos igual que cualquier otro ser, son los únicos que están al inicio y al final de los ciclos biológicos y cadenas alimenticias, producen fermentos buenos y los malos generan enfermedades, así lo anunció Louis Pasteur. Los hombres hace más de 2000 años, creyeron que la lepra hacía al hombre impuro, no había que tocarlos, Hansen demostró que este mal era producido por una bacteria: Mycobacterium leprae. Las bacterias están en el suelo, tierra, agua y objetos, producen males severos, como también elementos muy especiales, como el yogurt, queso, vino, licores, enzimas digestivas y medicinales. El microbiólogo, hombre de ciencia y tecnología, evidencia lo mágico en elemento medible, es conocer que existen seres diminutos que tienen estructura, composición química y actúan. Así el microbiólogo es un paradigma que aísla, identifica, de- muestra y aplica las bondades de estos seres pequeños que ocupan el mayor porcentaje de la megadiversidad. Gracias a los microbiólogos se previenen muchos males con la vacunas de Jenner contra la viruela y los de Salk y Sabin contra la poliomielitis; con los antibióticos de Fleming y los de Waksman, aplican técnicas para reciclar la materia orgánica y potabilizan el agua. El microbiólogo cortó y eliminó las epidemias y propició el aumento demográfico y el hambre se acrecentó, resolverlo es un reto del biólogo. Favorecer la conservación de nuestro mundo viviente, hacer bien los bionegocios, bioempresas, ecodesarrollo, saber explotar la naturaleza sin da- ñarla, guardando a las especies para el mañana, a eso se llama sustentable, educar a todos que somos vida, quien estudia, conoce y maneja a ella es el Biólogo, ignorar, excluir, minimizar a la Biología es ignorancia. El presente boletín es otro gran paso que da el hombre para que la humanidad avance y se beneficie. Aprecio y felicito a los docentes, egresados y alumnos que están trabajando en nuestro laboratorio y han producido este excelente instrumento de divulgación. Página 4 Laboratorio de Microbiología Volumen 1, nº 1 Visitas de estudios al INS y FARVET Alumnos en el Instituto Nacional de Salud Como parte de los procesos de capacitación que se da a los alumnos en el laboratorio de microbiología, ayudantes e investigadores de nuestro laboratorio han tenido la grata oportunidad de conocer instituciones de alto potencial científico como el INS y FARVET. El Instituto Nacional de Salud y FARVET son instituciones líderes a nivel nacional en Investigación en Salud y en producción de vacunas para aves, respectivamente. Nuestros ayudantes y estudiantes han podido conocer la importancia y el uso de equipos de alta tecnología, líneas prioritarias de investigación en nuestro país, conocimientos en bioseguridad (pues el INS cuenta con un laboratorio de bioseguridad 3), entre muchas otras cosas. Pero, las visitas a estas colosales instituciones ha logrado por sobretodo, formar a nuestros ayudantes de laboratorio en las aplicaciones de normas de bioseguridad, y fomentar ideas de investigación en nuestro alumnado tomando en cuenta las prioridades de nuestra nación. Laboratorio de Microbiología Volumen 1, nº 1 Página 5 Compartiendo el conocimiento científico En los meses de Enero y Febrero del presente año, dos estudiantes provenientes de universidades muy bien posicionadas en el ámbito científico, acudieron a nuestras instalaciones para realizar trabajos de investigación de gran importancia, con el fin de reforzar sus conocimientos en temas correspondientes a la Microbiología. Una de las personas fue Alexandra Prado Mantilla, estudiante de la Universidad Peruana Cayetano Heredia, quien realizó el aislamiento del plásmido pGLO, electroforesis del plásmido aislado, transformación bacteriana y logró evidenciar a la proteína GFP, pudiendo identificar con éxito los pasos necesarios para la experimentación. Por otro lado, la estudiante Alejandra Salazar Arévalo de la Universidad Nacional Agraria de La Molina, quien centró su investigación en la obtención de piocianina de la bacteria Pseudomonas, así cómo el análisis de otros pigmentos encontrados durante la investigación. Es así que el Laboratorio de Microbiología e Inmunología apoya a investigadores y estudiantes de diferentes instituciones con el fin de poder compartir nuestros conocimientos y mantener una actividad contínua en el ámbito científico. Agradecemos a estas estudiantes quienes nos permitieron ser parte de sus proyectos y así cumplir con el objetivo mencionado anteriormente. A continuación, presentamos las palabras de agradecimiento de nuestras compañeras: ―Quiero expresar mi más profundo agradecimiento por el tiempo y apoyo brindado en el Laboratorio de Microbiología de la Universidad Ricardo Palma durante mi estadía que aunque corta, fue muy significativa. En esta pude reforzar conocimientos y destrezas en el que hacer de nuestra carrera, rodeada de un ambiente de fraternidad, en el cual pude notar el empeño de cada uno de los integrantes del laboratorio y el trabajo en equipo para continuar progresando como una comunidad científica. En tal sentido, mi reconocimiento muy especial al Sr. Profesor Alcides Guerra Santa Cruz por sus sabias enseñanzas; asimismo a Santiago Justo, y a todos aquellos compañeros que de una u otra manera me apoyaron e hicieron muy grata mi estancia en los ambientes de esta universidad. Gracias por todo.‖ Alexandra Prado Mantilla Alexandra Prado Mantilla Estudiante de Biología Universidad Peruana Cayetano Heredia DNI: 47558939 ―Quiero aprovechar este espacio para expresar mi más sincero agradecimiento al profesor Alcides Guerra Santa Cruz y a los alumnos encargados del Laboratorio de Microbiología de la Universidad Ricardo Palma quienes muy amablemente me abrieron las puertas de su laboratorio y brindaron no solo su apoyo para llevar a cabo la investigación que les propuse sino también un ambiente netamente profesional donde pude apreciar el gran compromiso que estos tienen para con su carrera y la sociedad. Fue verdaderamente grato trabajar junto a este gran equipo, donde compartimos conocimientos e ideas para enriquecernos mutuamente. Me llevo esta magnífica experiencia que me ha permitido crecer como profesional, llegar más lejos de lo aprendido en clase y sobretodo comprobar que cuando uno se propone algo, es posible lograrlo.‖ Alejandra Salazar Arévalo Estudiante de Ing. De Industrias Alimentarias Universidad Nacional Agraria la Molina DNI: 46666688 Alejandra Salazar Arévalo Página 6 SDS—PAGE Laboratorio de Microbiología Nuevas prácticas de laboratorio implementadas El laboratorio de Microbiología ha logrado estandarizar cinco protocolos sobre técnicas moleculares lo que permitirá a los actuales alumnos salir mejor preparados al ambiente laboral: Electroforesis de ADN en agarosa Purificación de proteínas GFP purificada. Volumen 1, nº 1 Electroforesis de ADN y proteínas: La electroforesis es una de las técnicas más empleadas en el área de biología molecular y biotecnología, la estandarización de esta técnica permite que los alumnos puedan separar, identificar y purificar moléculas de ADN o proteínas de acuerdo a diferentes propiedades como: peso molecular, carga eléctrica, entre otros. Además el alumno podrá conocer las dos variantes más utilizadas de esta técnica: el SDS-PAGE y la electroforesis de ADN en agarosa. Aislamiento de plásmidos: Los plásmidos son los vectores de ADN más utilizados en el campo de recombinación genética ya que pueden otorgar a un organismo propiedades que no presentan en su forma nativa. Los plásmidos son aislados a partir de bacterias, es así que el laboratorio ha logrado estandarizar el protocolo para el aislamiento de plásmidos, permitiendo a los alumnos conocer los fundamentos en los que se basa esta técnica. Extracción y purificación de proteínas: Para el estudio de las propiedades de una proteí- na se debe contar con muestras purificadas en tal caso estas se deben obtener a partir de las bacterias de origen. El laboratorio cuenta con un protocolo estandarizado para la extracción de GFP y la purificación de dicha proteína con la técnica de cromatografía de interacción hidrofóbica (HIC). Transformación bacteriana: La tecnología de ADN recombinante permite la introducción de diferentes vectores plasmídicos en un individuo, de esta manera el alumno podrá conocer los mecanismos como se logra introducir un gen recombinante en una bacteria hospedera; es por esto que se ha estandarizado el protocolo para incorporar plásmidos en la cepa bacteriana de Escherichia coli HB-101 K-12 logrando que produzca la proteína de interés. Aislamiento de ADN genómico bacteriano: El estudio del ADN bacteriano tiene importancia clínica y taxonómica ya que permiten la identificación de una cepa bacteriana específica. El primer paso para el estudio del ADN genómico bacteriano es el aislamiento de este, de esta manera el laboratorio ya cuenta con un protocolo estandarizado para dicha finalidad, en que los alumnos conocerán los principios básicos de cómo se puede obtener un ADN genómico de alta pureza para fines como clonación de genes, identificación de genes, amplificación, secuenciamiento, etc. Reacción en cadena de la polimerasa (PCR): El termociclador es un equipo que permite realizar la técnica de reacción en cadena de la polimerasa (PCR), la cual permite obtener múltiples copias de un fragmento de ADN con ayuda de primers específicos. El laboratorio cuenta con el equipo y los reactivos necesarios para realizar PCR y ya se ha empleado para replicar fragmentos de ADN que codifiquen GFP, PSP, entre otros. Así el alumno podrá entrenarse en el manejo de este equipo pudiendo realizar cualquier amplificación génica según los requerimientos de su trabajo. Electrotransferencia: Luego de realizar una SDS-PAGE, las proteínas pueden ser transferidas a una membrana de nitrocelulosa; permitiendo, por ejemplo, su identificación por anticuerpos específicos basándose en la asociación antígenoanticuerpo (Western Blot); para dicho fin el laboratorio ha estandarizado un protocolo de electrotransferencia en nitrocelulosa para que en las prácticas los alumnos puedan conocer los fundamentos y la importancia de esta técnica. Laboratorio de Microbiología Volumen 1, nº 1 Página Trabajos de Tesis Los trabajos de tesis de pregrado son la forma como un alumno demuestra al mundo que está preparado tanto teóricamente como en la práctica para reconocer y explicar un problema de la sociedad, plantearlo y resolverlo. mo principal objetivo desarrollar una bacteria capaz de ―anunciar‖ la presencia de contaminantes en el medio, como el cianuro, a través de la producción de una proteína reportera, la GFP (proteína verde fluorescente). Actualmente en el laboratorio de Microbiología se vienen desarrollando dos trabajos de tesis: Hasta la fecha hemos logrado la clonación del promotor del gen PSP y del gen de la GFP, se ha realizado el aislamiento del vector que contendría la secuencia objetivo; además ya se ha logrado estandarizar todas las técnicas necesarias para la elaboración del proyecto, como la digestión de ADN, transformación bacteriana, electroforesis y ligación. -Desarrollo de un biosensor bacteriano con el promotor del gen PSP y la proteína verde fluorescente (GFP). -Ensayo biológico de las proteínas Cry de Bacillus thuringiensis sobre larvas de Phthorimea operculella ―Polilla de la Papa‖ El primer proyecto a cargo del tesista Gonzalo Tueros tiene coAmplificación del gen Bacillus thuringiensis esporulando El segundo proyecto está a cargo del tesista Gabriel Delgado quien pretende determinar la efectividad de las diferentes proteínas Cry sobre el insecto plaga Phthorimea operculella ―Polilla de la Papa‖, la importancia de este trabajo es que el uso de bioinsecticidas es favorable y además protege la integridad de los agricultores como de los consumidores de los productos, ya que resulta totalmente inocuos para el ser humano a diferencia de los productos de control químicos. Actualmente se está trabajando en el aislamiento de cepas nativas de Bacillus thuringiensis, además ya se han realizado los ensayos de producción, extracción, purificación y reconocimiento de la proteína Cry en cepas de referencia de Bacillus thuringiensis. Amplificación del gen PSP Gabriel Delgado TESISTA Gonzalo Tueros TESISTA Detección de proteína Cry10A 7 Página 8 Laboratorio de Microbiología Volumen 1, nº 1 Presentación de Libro: Bases de La Inmunología Clínica Bases de la inmunología clínica, es un libro escrito por 64 investigadores americanos, europeos y latinos entre ellos investigadores de la sociedad peruana de inmunología (SPI). El biólogo y jefe del laboratorio de Microbiología: Alcides guerra Santa Cruz, uno de los representantes de Perú, aportó también en la elaboración y edición de este libro con la d e sc r i pc i ón d e l ―RECONOCIMIENTO POR RECEPTORES DE INMUNIDAD INNATA‖, el cual pretende dar aportes de inmunología básica y clínica; y está dirigido a estudiantes, y profesionales. La ceremonia de presentación del libro se llevó a cabo el día 22 de noviembre del 2013 en el Hotel Business Tower a cargo del Dr. Luis José Aguilar; en la que se hizo presente la Facultad de Ciencias Biológicas de la URP con el Dr. Tomás Agurto Saenz, decano de la facultad, profesores y alumnos del curso de inmunología. Alumnos se capacitan en la Universidad de Yale Dos brillantes estudiantes que han realizado trabajos en el laboratorio de Microbiología, Juan Manuel Iglesias y Gonzalo Tueros, fueron aceptados por el programa REPU ―Research Experience for Peruvian Undergraduates‖, este programa les ha permitido capacitarse en una de las mejores universidades a nivel mundial: La Universidad de Yale; de esta universidad han salido notables personajes, entre ellos 6 Premios Nobel. se a los retos del mundo científico, actualmente tan competitivo. Además esto ha permitido que estos estudiantes puedan transmitir al laboratorio lo aprendido logrando que el Laboratorio de Microbiología vaya fortaleciendo sus prácticas de tal manera que los futuros alumnos de nuestra facultad salgan mejor capacitados para enfrentar- Cabe resaltar que este programa (REPU) es abierto a todos los estudiantes que deseen realizar este tipo de pasantías, toda la información como fechas, requisitos, etc; pueden encontrarlas en la página web del programa: http:// www.repuprogram.com/ REPU/Home.html Gonzalo Tueros REPU 2012 Juan Manuel Iglesias REPU 2013 Laboratorio de Microbiología Volumen 1, nº 1 ONCOSALUD — URP trabajando en el cáncer Ciertamente una labor realizada por dos personas es mucho mejor que la ejecutada por una sola; y si hablamos de instituciones, en la que participan grupos humanos los objetivos a alcanzar se multiplicarán. Oncosalud es una empresa del grupo AUNA altamente especializada en la prevención, detección, diagnóstico y tratamiento del cáncer. Nace en el año 1989 como el Primer Sistema de Atención Oncológica del Perú, ofreciendo bajo el sistema de prepago la seguridad de contar con un tratamiento ilimitado para combatir el cáncer, con los mejores especialistas del medio, equipos y medicinas de última generación. Está comprometida con la sociedad en salvar vidas del cáncer a través del fomentó de una cultura de prevención y un estilo de vida saludable, así como el desarrollo de programas oncológicos estructurados de manera tal que las personas puedan gozar de la mejor aten- ción, médicos, tecnología y servicios complementarios que nos permitan: Prevenir el cáncer, detectarlo a tiempo, diagnosticarlo y tratarlo eficientemente, cuidar del paciente en su recuperación o garantizar su calidad de vida, y alcanzar el mejor índice de sobrevida para sus pacientes. Conociendo esto, nuestro laboratorio cree importante formar una alianza estratégica. Por esto durante estos meses de verano hemos tenido reuniones constantes con el Centro de Investigaciones de la institución a fin de concretar las siguientes acciones en beneficio de todos los participantes y la sociedad misma: 1.– Organización de un evento académico en el formato de CICLO DE CONFERENCIAS: Inmunidad y Cáncer. Para tratar aspectos relacionados a los diferentes eventos inmunobiológicos que acontecen en el cáncer. Este evento pretende constituirse en un referente a nivel nacional para tratar temas sobre dicha enfer- medad, de manera que se desea establecer una fecha para cada año. 2.– Promover la redacción científica en la comunidad universitaria. Para cumplir con este ansiado y difícil objetivo estamos diseñando un curso taller dirigido a estudiantes para el 29, 30 y 31 de Mayo: ―Taller de redacción científica‖; los participantes deberán asistir con un escrito, el cuál será revisado y corregido durante el taller; así al finalizar este se obtendrá un artículo científico de calidad. 3.– Promover la investigación. Para esta tercera acción desarrollaremos el proyecto de investigación: ―Prevalencia de polimorfismos PvuII (c454397T>C) y XbaI (c454A>G) del receptor de estrógeno alfa en pacientes con cáncer de mama atendidos en oncosalud en el período Julio 2014 – Junio 2015‖ Así pues estamos trabajando de la mano de instituciones de prestigio. Página 9 Página 10 Laboratorio de Microbiología Volumen 1, nº 1 Proyecto de Investigación Bacterias marinas: “Las Mejores Soluciones Vienen en Frasco Pequeño” Por: Santiago Justo Mientras una familia cenaba, se posó una mosca en el vaso del hijo, como suele suceder la madre exclamó - ¡aaaaah! ¡Una mosca!- ante esto el padre acercándose sigilosamente aplastó a la mosca con la mano… ¡Cochino! - exclamó disgustada la madre - ¡esa mosca debe estar llena de bacterias! - tras un breve silencio de reflexión… el padre dirigiéndose hacia su hijo estudiante de biología de la Ricardo Palma preguntó - Hijo, ¿Por qué tenemos tanto temor a las bacterias? - a lo que el hijo respondió serenamente - pues, por cierta ignorancia padre, pues aunque las bacterias son las causantes de muchas enfermedades, y algunas potencialmente mortales como la tuberculosis. No podemos dejar de lado las grandes soluciones que se están creando a partir de estos organismos en la actualidad - dijó el hijo - por ejemplo: Marinobacter hydrocarbonoclasticus… - ¿Qué cosa? ¿Qué es eso? - preguntó el padre algo confundido - a lo que el hijo respondió - ¡Una bacteria!, una bacteria capaz de degradar parte del petróleo, actualmente los científicos la están usando para poder resolver los problemas que traen los derrames de petróleo sin dañar el ecosistema del oceáno; Pseudomonas es otra bacteria sorprendente, esta es capaz de degradar el cianuro… - ¿El cianuro? - interrumpió el padre - Sí, el cianuro - siguió hablando el hijo - ese compuesto procedente de las minas de oro que envenena y mata a muchos organismos, incluyendo humanos en varias partes del mundo y claro, también en nuestro Perú; otros tipos de esta misma bacteria tienen la propiedad de poder degradar el plástico, que tarda miles de años en descomponerse… - Pero hijo ¿Cómo es posible que seres tan diminutos puedan resolver problemas tan grandes?... - Pues fácil - añadió el hijo - a diferencia de nosotros los humanos, las bacterias han existido en la tierra desde el origen de la vida, es una de las formas de vida más antiguas y por esto ―conocen‖ la tierra muchísimo mejor que nosotros, han evolucionado pudiéndose ―alimentar‖ de casi cualquier compuesto existente, transformándolo de acuerdo a sus necesidades. Los científicos se han dado cuenta de esto y con las tecnologías actuales es posible usar casi cualquier capacidad de estos organismos en favor de la propia tierra; los humanos nos hemos equivocado en muchas cosas, pero ahora podemos revertir estos da- ños con los seres de mayor experiencia: ―las bacterias‖. El océano tan inmenso como lo vemos es uno de los lugares de biodiversidad más grande que podamos imaginar y también uno de los pocos que el hombre no ha podido modificar a su antojo. Por esto es tiempo que empecemos a buscar recursos genéticos en nuestros mares, a la vez que entendemos cómo funciona ese fascinante ecosistema haciendo hincapié en las bacterias - finalizó el hijo. En este verano 2014 el Laboratorio de Microbiología de la Facultad de Ciencias Biológicas de la Universidad Ricardo Palma ha empezado a investigar que bacterias se pueden encontrar en nuestros mares con dos objetivos claros: el primero, entender cuál es el rol ecológico de estos seres en el ecosistema y segundo, qué recursos biotecnológicos podrían obtenerse de estos organismos. Esquema del uso de Pseudomonas en la biorremedicación del cianuro Laboratorio de Microbiología Volumen 1, nº 1 Página 11 Proyecto de Investigación Ácaros del Polvo: “Gran Fuente de Alergénos” Por: Tania Churasacari Los alergenos son proteínas presentes en alimentos, polen, látex, mohos, epitelios, insectos y/o polvo, siendo el polvo doméstico la principal fuente de alergenos ya que en este habitan entre 100 a 2000 ácaros por gramo de polvo doméstico (Zubeldia, 2012) dependiendo del clima, estación, tiempo e higiene. Los alergenos presentan pesos moleculares entre 7,2 a 98 kDa, además están agrupadas según su actividad enzimática; estas proteínas al encontrarse en cierta cantidad generan un mecanismo de respuesta exagerada y perjudicial del sistema inmunitario la cual se observa por signos y síntomas como enrojecimiento de la piel, de los ojos, molestias en la nariz y garganta, lo que conocemos como alergia; por lo descrito anteriormente, el estudio de estas proteínas en ácaros es importante debido que han llegado a sensibilizar a más del 30% de la población, causando enfermedades como asma, rinitis, o dermatitis; por ello el laboratorio de Microbiología empezó a trabajar en el aislamiento de alergenos a partir de ácaros del polvo (Dermatophagoides sp. y Blomia sp. principalmente) y así ampliar el conocimiento sobre su biología, aspectos moleculares y epidemiológicos ya que esto es importante para el manejo integral de las enfermedades causadas por los alergenos de ácaros del polvo. Blomia sp. ácaros de mayor abundancia en zonas tropicales Dermatophagoides sp. en los 60’s la describieron por primera vez como fuente de alergenos Respuesta alérgica: Primera y segunda exposición Página 12 Laboratorio de Microbiología Volumen 1, nº 1 Proyecto de Investigación El fascinante mundo de los bacteriófagos Por: Cindy Lee Cajachagua Las primeras investigaciones en bacteriófago se originan a inicios del siglo XX. En 1915, Frederick W. Twort realizó un estudio sobre el papel de los agentes filtrantes ―virus‖ en las placas lisis de cultivos de Staphylococcus aureus; dos años más tarde en 1917, Félix d’Hérelle propone que el microbio que antagoniza el crecimiento de la Shigella dysenteriae es también un virus al cual le da el nombre de bacteriófago, también conocidos como fagos, pero este término no se emplea en el sentido estricto de comer sino en el sentido de que viven a expensas de las bacterias. Actualmente son varias las líneas de investigación que incluyen el estudio de bacteriófagos, así tenemos: a) La Ecología, donde se las estudia por el papel importante que cumplen en el balance de los ecosistemas bacterianos, b) La Biología molecular, ya que hace posible la introducción de genes a otros organismos, sin importar la complejidad; y c) En el campo clínico, debido a la problemática de la propagación de bacterias resistentes y multiresistentes a antibióticos se ha desarrollado una nueva área de investigación conocida como fagoterapia en el cual se realizan estudios que involucran que pacientes con enfermedades infecciosas persistentes causadas por cepas resistentes a antibióticos sean tratados con extractos estériles de fagos. Los resultados han sido alentadores hasta el momento y han demostrados mayor eficiencia y especificidad en comparación con los antibióticos, sin embargo la mayoría de las investigaciones realizadas carecen de cuantificación clínica y del uso de grupos de control por lo que se deben seguir realizando estudios que cumplan dichas premisas. Resulta fascinante el hecho de que un bacteriófago cuyo tamaño se mide en nanómetros y que tiene una composición principal de solo ADN o ARN más proteínas se proyecten actualmente como una valiosa herramienta ecológica, molecular y clínica y eso sin contar con el hecho de que aún nos falta más por conocer sobre estos virus. Microfotografía electrónica de Podoviridae. Bar. 60 nm. El laboratorio de Microbiología actualmente se encuentra trabajando en la estandarización de un protocolo para el aislamiento de fagos. Este es el primer paso para introducirnos en el área de investigación en bacteriófagos con proyección a la aplicación en fagoterapia e identificación de bacteriana. Microfotografía electrónica de Siphoviridae. Bar. 60 nm. Virus los entes biológicos más abundantes del planeta Microfotografía electrónica de Myoviridae. Bar. 60 nm. Principales tipos de bacteriófagos clasificados de acuerdo a su morfología Laboratorio de Microbiología Volumen 1, nº 1 Página 13 Proyecto de Investigación SDS-PAGE: Herramienta Fundamental de la Proteómica Por: Carla Saldaña ―Sin proteínas no hay vida posible en nuestro planeta‖, dijo Mulder, químico Holandés, quien sugirió el término ―proteos‖ que quiere decir ―el primero‖, para designar el componente universal de todos los tejidos vegetales y animales, ya que forma parte básica de la estructura corporal. Las proteínas son complejas sustancias orgánicas nitrogenadas y tienen un papel fundamental en la estructura y función de las células tanto animales como vegetales. Cada especie tiene proteínas características, lo que le confiere su carácter específico. Existen muchos tipos de proteínas las cuales pueden ser identificadas y a partir de ello, analizadas y darles múltiples aplicaciones. Gerrit Jan Mulder Quìmico Holandes La electroforesis de proteínas es un método analítico, en el que se separan e identifican proteínas. Fue empleado por primera vez por Tiselius en el año 1937. Raymond y Weintraub en 1959 emplearon como soporte para la electroforesis un gel de poliacrilamida (PAGE), posteriormente el método fue perfeccionado por varios investigadores como Davis y Ornstein. El dodecil sulfato de sodio (SDS) se introduce en esta técnica en 1970, y ya en 1972 se emplean agentes reductores y SDS en la determinación del peso molecular de proteínas en lo que se denominó ―SDS-PAGE‖. Representación de la estructura tridimensional digitalizada de la mioglobina La electroforesis se fundamenta en la migración de solutos iónicos bajo la influencia de un campo eléctrico; estas partículas migran hacia el cátodo o ánodo (electrodos - y +), en dependencia de una combinación de su carga, peso molecular y estructura tridimensional. Es útil además para determinar parámetros como peso molecular, punto isoeléctrico y número de cadenas polipeptídicas de las proteínas. Además el desplazamiento depende del voltaje aplicado y de la porosidad del gel de electroforesis. Arne Wilhelm Kaurin Tiselius Premio Nobel 1948. En el SDS-PAGE, la poliacrilamida es el soporte empleado, este es químicamente inerte, de propiedades uniformes, capaz de ser preparado de forma rápida y reproducible; forma, además, geles transparentes con estabilidad mecánica, insolubles en agua, relativamente no iónicos y que permiten buena visualización de las bandas durante tiempo prolongado. El SDS desnaturaliza por completo las proteínas y rompe las interacciones no covalentes que determinan la estructura terciaria y cuaternaria. Así el SDS-PAGE permite al investigador determinar el peso molecular (PM) de las proteínas al comparar las movilidades electroforéticas de varios marcadores de peso molecular conocido. El laboratorio de Microbiología está entrando al campo de la proteómica a través del estudio integral de diferentes sustancias proteicas de importancia como la GFP, con la cual se están haciendo ensayos para su utilización como marcador de anticuerpos. Ejemplo de resultado de SDSPAGE. M: marcador de peso molecular, A: Albúmina. Página 14 Laboratorio de Microbiología Volumen 1, nº 1 Proyecto de Investigación Por: Gonzalo Tueros Biosensores Bacterianos Los biosensores o bioreportadores son aquellos organismos que pueden detectar ciertos componentes de interés dentro de un determinado ambiente, el primer biosensor fue desarrollado en 1990 y desde su desarrollo la técnica ha sido perfeccionada y nuevos circuitos han sido creados. Esto ha permitido un enorme crecimiento en la microbiología ambiental y biotecnología ambiental. Actualmente en el Laboratorio de Microbiología de la Facultad de Ciencias Biológicas, se esta elaborando una tesis en la cual se trata de desarrollar un bionsensor bacteriano capas de responder a contaminantes que rompan el equilibrio de protones, inhibiendo la síntesis de ATP dentro de la célula y por tanto siendo muy perjudiciales para la vida. El cianuro un contaminante muy toxico que es usado en grandes cantidades por la industria minera representa una amenaza para la salud de poblaciones aledañas y a la biodiversidad de la localidad. Es por tal motivo, que desarrollando un biosensor bacteriano capaz de detectar cianuro facilitaría el monitoreo de este peligroso contaminante, evitando de esta manera posibles catástrofes ambientales. El Biosensor en esta tesis será desarrollado usando el promotor de la proteína del shock por fagos de E. coli, el cual es activado por varios estímulos dentro de los cuales se encuentra el estrés por desbalance de protones, y el gen de la proteína verde fluorescente de la famosa medusa Aequarea victoria. Este circuito genético será construido en un plásmido usando técnicas de clonamiento clásicas como el empleo de enzimas de restricción y ligasas. Este plás- mido dotara a las bacterias con la capacidad de responder a la presencia de cianuro produciendo la proteína verde fluorescente y de esta manera poder cuantificar las concentraciones de este contaminante. Cabe resaltar, que esta investigación se esta llevando a cabo con fondos ganados en el Primer Concurso de Tesis de la Universidad Ricardo Palma, por tal motivo agradecemos el apoyo de la Universidad y de la Facultad de Ciencias Biológicas por brindar las facilidades para el uso del laboratorio. Esquema del funcionamiento general de un biosensor bacteriano. Página 15 Laboratorio de Microbiología Volumen 1, nº 1 Proyecto de Investigación Sobrepoblación de Palomas: Un Riesgo Latente para Nuestra Salud Por: Miguel Gonzales y Luis Pabón Los Colúmbidos son la familia de daño pulmonar, neumonías, hepa- tos causando salmonelosis y coli- las palomas y tórtolas, que incluye titis, afección cerebral, e incluso la bacilosis, respectivamente, que se a nivel mundial más de 310 espe- muerte; siendo el grupo con ma- presentan con cuadros de fiebre, cies, en el Perú 27 y en el departa- yor riesgo los niños, ancianos, diarrea y pequeñas hemorragias mento de Lima, 10 especies como personas infectadas con VIH, en la piel en los consumidores de la Paloma Doméstica, la Tórtola enfermos de cáncer y diabetes estos alimentos. Orejuda y la Cuculí. debido a que sus defensas están En vista de esta problemática, el ―Las palomas son un vector para disminuidas. Laboratorio de la trasmisión de muchas enferme- Dentro de los géneros bacterianos emprendió investigaciones en el dades. Sus plumas, sus excremen- más comunes que se hallan en las tema con el fin de aislar e identifi- tos, entre otros agentes de estas deposiciones de palomas se en- car bacterias patógenas que ten- aves, trasmiten hongos, bacterias cuentran algunas especies de Cla- gan impacto en la salud humanas, y parásitos‖ mencionó hace unos midia que causan infecciones pul- pues creemos que es necesario años Ana María Navarro, coordi- monares como psitacosis y clami- informar y educar a la comunidad nadora nacional de la Estrategia diasis las cuales se transmiten al sobre estos agentes, que aunque de Zoonosis del MINSA, sobre- hombre por respirar polvo infec- no producen grandes epidemias, saltando a la comunidad limeña tado con deposiciones secas en sí pueden afectar a poblaciones que desde hace tiempo se ve afec- suspensión transportado por el vulnerables. tada por la sobrepoblación de aire, de esta misma forma, repre- estas aves que ponen en riesgo la sentantes del género Salmonella y salud humana. Entre las afeccio- del género Escherichia llegan a nes que pueden causar figuran el lugares de preparación de alimen- Microbiología Página 16 Laboratorio de Microbiología Volumen 1, nº 1 Proyecto de Investigación Bacillus thuringiensis: Productor de toxinas Por: Diego Santiago Existe un gran número de insectos que se consideran plaga para especies vegetales de interés agronómico. El actual control de estas plagas es usando insecticidas químicos. No obstante, este tipo de insecticidas ha traído numerosos problemas, tanto ambientales como incluso la muerte en el ser humano. Por todo esto, se buscó una alternativa que no fuera tóxica para el medio y que fuera específica para cada plaga. Estos dos factores los cumple Bacillus thurigiensis y actualmente es el bioinsecticida más utilizado a nivel comercial. Bacillus thuringiensis fue aislado por primera vez en Japón por Ishiwata en 1901 como patógeno del gusano de seda, Bombyx mori (Lepidoptera, Bombycidae). En 1911 Berliner en Alemania aisló la misma bacteria a partir de larvas del lepidóptero Anagasta kuehniella (Lepidoptera , Pyrallidae) “la palomilla de la harina del mediterráneo‖ e hizo una descripción formal de esta bacteria: bacilo gram positivo, que presenta un cristal paraes- poral de naturaleza proteica, endosporas y flagelos peritricos en distintas fases de su ciclo de crecimiento. La denominó Bacillus thuringiensis, en honor a la región Alemana de donde se aisló: Thuringia. El uso de Bacillus thuringiensis para el control de insectos se inició en los años 30 contra el barrenador europeo del maíz, Ostrinia nubilalis (Lepidóptera, Pyrallidae). El primer producto comercial salió en Francia en 1938 bajo el nombre de Sporeine®; en EEUU se comercializó por primera vez en 1957, bajo el nombre de Thuricide®. Desde entonces se ha desarrollado la producción de forma masiva en varios países de todo el mundo. La principal acción de estas toxinas es lisar células epiteliales del intestino medio del insecto objetivo a partir de la formación de poros en la membrana apical de las microvellosidades de estas células (Aronson y Shai 2001). Por tanto, las proteínas Cry deben pasar de estar en forma de protoxina a toxina activada para unirse a receptores específicos de la membrana intestinal. Las esporas y cristales viajan a lo largo del aparato digestivo de la larva, hasta llegar al intestino medio. Allí, los cristales se solubilizan a causa del pH alcalino del medio. Una vez disueltos los cristales, las protoxinas liberadas son procesadas por proteasas del intestino, transformándose en toxinas. De este modo se forman canales iónicos en las microvellosidades, produciendo un desequilibrio osmótico y lisis celular. Actualmente en el laboratorio de Microbiología se está trabajando en el aislamiento y purificación de la proteína Cry de Bacillus thuringiensis. El objetivo es producir la toxina para disminuir los daños ocasionados por plagas en cultivos de importancia económica, como el algodón o el maíz, a través de biocontroladores específicos y amigables al ambiente. Mecanismo de las toxinas luego de ser ingeridas por un insecto lepidóptero. Página 17 Laboratorio de Microbiología Volumen 1, nº 1 Proyecto de Investigación Macroalgas Marinas Exterminadoras de Bacterias Por: Marlon Morales Las macroalgas constituyen un manera increíble al ambiente pu- importante recurso natural en los diendo soportar las fuertes co- ambientes marinos ya que son la rrientes marinas. fuente de oxígeno en el mar y Por otro lado, las macroalgas tienen la capacidad de secretar sustancias que evitan el desarrollo de microorganismos patógenos en sus estructuras. Gran parte de las investigaciones actuales están dedicadas a encontrar sustancias que pueden eliminar microorganismos patógenos de importancia en la salud humana, como por ejemplo: el temido Staphylococcus aureus causante de fuertes infecciones respiratorias o Pseudomonas aeruginosa causante de casi el 50% de las enfermedades intrahospitalarias. Así, se ha encontrado que extractos etanólicos y fenólicos de macroalgas inhibían el crecimiento de bacterias muy mencionadas en la medicina como son Escherichia coli y Salmonella. constituyen el alimento principal de la dieta de diferentes organismos. El grupo de las Phaeophyta o algas pardas constituyen una división compleja debido a sus características morfológicas y a las sustancias que produce, en este grupo se encuentra un representante de importancia económica en el Perú: Macrocystis pyrifera o también llamada ―Sargazo‖. Este representante fue descrito por primera vez por C. Agardh en 1820; además en este grupo se encuentran las actividad antimicrobiana de Macrocystis pyrifera ante bacterias de importancia en la salud pública: Escherichia coli, Salmonella enterica, Bacillus cereus, Pseudomonas aeruginosa y Staphylococcus aereus; esta evaluación se realizará utilizando extractos de diferentes partes de la ya mencionada macroalga: Macrocystis pyrifera. Asimismo, este trabajo, intenta promover la integración entre los laboratorios de nuestra facultad ya que forma parte de la tesis del colega egresado: José Ávila. algas de mayor tamaño, que pueden llegar a medir hasta 30 metros de alturas y se adaptan de una Actualmente en el Laboratorio de Microbiología se está llevando a cabo una investigación sobre la Macrocystis pyrifera, macroalga parda. Dirección: Facultad de Ciencias Biológicas Av. Benavides 5440, Santiago de Surco, Lima 33—PERU Contacto: Laboratorio de Microbiología alcides.guerras@urp.pe 999227470