NUEVAS HERRAMIENTAS BIOTECNOLÓGICAS PARA UNA PRODUCCIÓN AGRÍCOLA SOSTENIBLE Dr. Antonio Molina Departamento de Biotecnología-UPM Escuela Técnica Superior de Ingenierso Agrónomos Centro de Biotecnología y Genómica de Plantas (UPM-INIA) PLANT INNATE IMMUNITY AND RESISTANCE TO NECROTROPHIC FUNGI ANTONIO MOLINA LUCÍA JORDÁ (Associate Prof. (AP); RLKs/G!"/#/PTI) MIGUEL ANGEL TORRES (AP, since 3/2012; ROS/G!"/#//PTI) SOLEDAD SACRISTAN (AP, since 1/2014; Fungal Genomics) Eva Miedes (Assistant Professor) Hugo Mélida (MC Postdoc; since 2/15) Financial Support Sara Sopeña (PhD student; until 12/14) Jorge Morales (PhD student; until 4/14) Laura Bacete (PhD student; since 2/14) Sanjay Swami (PhD student, since 9/14) Antonio Muñoz (PhD student, since 12/14) Gemma López (Technician) Former Lab Members: C. Sánchez-Rodríguez, C., M. Delgado-Cerezo. A.! Sánchez-Vallet, B. Núñez-Corcuera, V. Escudero, J. Morales INSTALACIONES DEL CBGP MICROORGANISMOS EN AGRICULTURA SOSTENIBLE ! Comunidades microbianas y Nutrición/Sanidad vegetal. ! Nueva visión del “micro-biosuelo”: Metagenómica, microorganismos, plantas y nutrientes. ! Inmunidad Innata y agricultura sostenible ! Agrobiológicos (bioestimulantes) y tecnologías emergentes en agricultura sostenible LA COMPLEJIDAD DE LA INTERACCIÓN PLANTA-MICROORGANISMO Y SU IMPACTO EN NUTRICIÓN VEGETAL Interacciones Epigenoma Ionoma Hormonas/ metabolitos Minerales Interacciones cul5vo-­‐ malas hierbas Interacciones cul5vo-­‐ microorganismo Interacciones Transcriptoma Metaboloma Metagenomas/ Metatranscriptomas LAS PLANTAS VIVEN EN ÍNTIMA ASOCIACIÓN CON MICROORGANISMOS DEL SUELO 9'*"'.$-1#""#0&%-'$"'.&'"1-&;"'.1"%.,&'. 2,&%*&'<. * 7! /012345* 64* 748947:;5* <0* =2>=492>?* 5:93492>*@*4A25:2* PGPR 7! .3290B05* =30590* 4* 0>930>0>* C:;D72>* @* 4C:;D72>. 7! ) 5* 6 0 B E A : 5 2 > 4 >* F 1 4 5* 5 : 9 3 ; B 0 5 2* 49A2>=G3:72* Hongos micorrícicos (85 % plantas) 7! /012345* 64* 748947:;5* <0* A09460>* 0 > 0 5 7 : 4 6 0 >* 0 5* > E 0 6 2 >* 7 2 5* C 4 1 4* C:2<:>825:C:6:<4<* Rizobios (leguminosas) EL IMPACTO DEL MICROBIOMA INTESTINAL EN LA NUTRICIÓN HUMANA: “la revolución nutricional microsilenciosa” &%*/)$%-)"H/!'%*.)I/!$)*'%I%'$)I!J%I*&(#*/!'I((I-%"!#/(#*+)&*#K)&(?*+)*&%*I!J(#L)I%*M* &(#**NO%,!$%"$)#*+)*&%#*I%!')#P*+)*&%#*.&%"$%#Q**&%*.I(.(I'!H"*+)*)#.)'!)#*)#*+!#$!"$%* )6*0>94C607:A:0592*<0*64*:5903477:;5*<0805<0*<0Q** •! .2C647:;5*<0*/:73223B45:>A2>*05*06*>E062* •! -05GD74*<0*64*864594* •! -05GD74*<06*A:73223B45:>A2* •! #0R460>*<0*64*864594* •! #0R460>*<06*A:73223B45:>A2* MICROORGANISMOS EN AGRICULTURA SOSTENIBLE ! Comunidades microbianas y Nutrición/Sanidad vegetal. ! N u e v a v i s i ó n d e l “ m i c r o - b i o s u e l o ” : M e t a g e n ó m i c a , microorganismos, plantas y nutrientes. ! Inmunidad Innata y agricultura sostenible ! Agrobiológicos (bioestimulantes) y tecnologías emergentes en agricultura sostenible Inmunidad Innata en Sanidad Vegetal: Una nueva estrategia tecnológica" PLANTS DROSOPHILA MAMMALS TOLL CD14 TLR4 EFR Plant Immunity Resistance Technology FLS2 PAMPs flg22 K LRR LBP elf18 LRR PK NBS LRR LPS LRR Spätzle LRR PGN LRR Pelle PK PK K K K Incremento Ca+2 " Producción de ROS" MYD88 IRAK PBS1 Avr PphB Avr Rps4 Cactus. Dif/ Relish CC MAPKs PKKK PKK PK PKKK PKK PK PKKK PKK PK NBS RPS5 NF-$B NBS TIR RPS4 The “classical” Gene for Gene Resistance Technology IkB TFs (WRKYs/TGAs) Effectors/Avr LRR Tube BAK1 LRR PK TIR TIR TIR (PRRs) TFs (WRKYs/TGAs) IMMUNE RESPONSE GENES AND CROP RESISTANCE PAMPs/DAMPs/Elicitores: Nuevos moduladores de la Sanidad Vegetal PAMPs QUE MODULAN RESPUESTAS DE DEFENSA ! Glucanos ! Mananos ! Derivados de la degradación de la Pared Celular Vegetal (DAMPs) ! Derivados de la degradación de Quitina (STEMICOL) ! Lipopolisacaridos (LPS) de bacterias Gram-negativas ! Peptidoglicano de bacterias Gram-positivas ! Flagelina del flagelo bacteriano ! ADN metilado bacteriano ! Harpina (Messenger®) ! Otros RESISTENCIA INDUCIDA POR PAMPs/MAMPs (PTI) -­‐ SISTÉMICA -­‐ DURADERA -­‐ AMPLIO ESPECTRO RESISTENCIA A PATÓGENOS TRATAMIENTO CON PAMPs/MAMPs /9?@G3=/F.A9.@??3HG.A9.EF=./FABE@AFC9=.A9.E@.3G/BG3A@A.3GG@8@.J9I98@E<.. E&.*)1%","0-&.I)%"$-1&.&,.')#6-1-".;),.C)0-'*#".K.1&#&*)#-L&1-M%.;),.$";".;).&11-M%. 8#&*&;".1"%.3%$4%"$";4,&;"#. ?"%*#",. G".3%"14,&1-"%.".3%"14,&1-ón 1"%.D&*"0)%".. Purificación de ARNs Purificacion de ARNs Análisis Transcriptómico (microarrays, RNAseq, qRT-PCR, etc.) comparativo: Análisis Bioinformático mediante Clustering Genes diferencialmente expresados tras tratamiento con inmunomoduladores (PRB1-PRB5) PATÓGENO 3" PATÓGENO 2" PRB5" PRB4" PRB1 (Confiere Resistencia a patógeno 1)" PATÓGENO 1" DN. DO. C'. DP. !"# l C9DCFIC@/@?3HG.A9.9QDC9=3HG.I>G3?@.. DFC.3GAB?8FC9=.A9.3G/BG3A@A. 8.3 Normed to frequency in Arabidopsis set percentaje 7.7 26.2 "!CFRF<.I9G.3GAB?3AF. "!J9CA9<.I9G.C9DC3/3AF. I1. 7.5 6.1 0.9 1.1 2.7 5.1 3.0 3.0 3.0 5.1 3.3 4.0 4.1 4.2 4.9 cell wall plasma membrane plastid electron transport or energy pathways other enzyme activity transferase activity extracellular chloroplast response to stress response to abiotic or biotic stimulus hydrolase activity protein binding nucleotide binding nucleus protein metabolism developmental processes nucleic acid binding uncategorized functions Genes diferencialmente expresados tras tratamiento con PRB1: modo de acción Inducción de la expresión de genes de defensa en plántulas de Arabidopsis thaliana Expresión de WRKY33 (n-veces frente al control) Control Producto 1 90 90 80 80 70 70 60 60 50 50 40 40 30 30 20 20 10 10 0 0 50 µg/ml 100 µg/ml PLANTAS SILVESTRES 200 µg/ml 50 µg/ml 100 µg/ml 200 µg/ml MUTANTES EN EL RECEPTOR DEL PRODUCTO 1 Los inmunomoduladores no tienen actividad antibiótica directa frente a patogenos "T = 0 Inductor de " Resistencia" Fungicida empresa " de AEPLA" " " " "T = 3 Días " Del laboratorio … al mercado er-1 WT Dr. Antonio Molina" (Universidad Politécnica de Madrid, CBGP)" Research & Development Company Green Biotechnology UPM Spin-­‐off Transfer labs excellence to growers Co-Founders" " Antonio Molina Fernández, Universidad Politécnica de Madrid Professor" Pablo Rodriguez Palenzuela, Universidad Politécnica de Madrid Professor" .32<E792>* @ICF^3FEFI3?F=. . D # " ; 4 1 * " '. ; ) # - 6 & ; " '. ; ). 2 , & % * & '. ". $-1#""#0&%-'$"'V. K. $-1#""#0&%-'$"'. W4). '). &2,-1&%. &. ,&'. ,&'. 2,&%*&'. XT",-&#. ". )%. ')$-,,&YV. ". &. ,"'. '4),"'. 2&#&. $)Z"#&#. ,&. *",)#&%1-&. ;). ,"'. 14,56"'. &. )'*#)')'. +-M51"'(&+-M51"'. ). -%1#)$)%*&#.,&.2#";411-M%.K.'4.1&,-;&;[[.. DE@G8.!9@E8!.?@C9.. D@/D'V./@/D'.K.A@/D'.W4).$";4,&%.K.&156&%. ,&.-%$4%-;&;.-%%&*&.6)0)*&,.XD83Y. DE@G8.=8C9==.?@C9.. /)*&+",-*"'. 6)0)*&,)'. W4). #)04,&%. ,&. *",)#&%1-&.;).,"'.14,56"'.&.)'*#)')'.&+-M51"'. DE@G8/?CFI. /-1#""#0&%-'$"'.&'"1-&;"'.1"%.,&'.2,&%*&'.W4). 2#"2"#1-"%&%. +)%)\1-"'. )%. '4. \'-","0]&. K. 2#";4156-;&;[. /9RFC@.J9I98@E. . I ) % ) '. W 4 ). ' ). 4 5 , - L &. ) %. 2#"0#&$&'. ;). $)Z"#&. 1"%. ),. "+Z)56". ;). ;)'&##",,&#. %4)6&'. 6&#-);&;)'.1"%.$&K"#.*",)#&%1-&. &.)'*#)')'.K.$&K"#.2#";411-M%[.. D"#*&T",-".;).2#";41*"'. DCB9^@. 89?GFEHI3?@. AGROBIOLÓGICOS" DC^P. DC^b. DC^OP. DC^OO. DC^PPc. MICROORGANISMS" DC^PcI. DC^NI. DC^dI. DC^OOI. GENES" DCB9^@.A9. ?FG?9D8F. J@E3A@?3HG.9G.DCFAB??3HG. _@=9.P.. ._@@=9.`.. ._@=9.O. C9I3=8CF(.. ?F//9C?3@E3a@?3FG. $07S5262B@Q*L4>9V$347Z*M:06<* 9%'&K"'.;).1&$2". $07S5262B@* >72ED5B* .](]$]*^46:<4D25* .](]'* U46:<4D25* .O%#)*\Q* L:06<*93:46>* .O%#)*[*45<* _** [\* .32<E792>*%B32C:26;B:72>* %-I(,!(&(-!'(#Q*.&%"$*O)%&$O*'%I)** .I,\** .I,`** 7.^#"&;7'2)1*#4$.A-')&').*",)#&%1).X_4%0&,.&%;.^&1*)#-&,Y. 7.A)$"%'*#&*);.2#"*)15"%.-%.e.d.1#"2.'2)1-)'. 7.f"#g'.&'.&.'));.*#)&*$)%*."#.T",-&#.'2#&K. 7.G&*4#&,.D#";41*.h-*:.L)#".#)'-;4)'. 7._&6"#&+,).?FI=. 7.?"$$)#1-&,-L&5"%.2&#*%)#<.&:<4*.6459*I0>0437S* 7.G"6),.$";)."T.&15"%. 7.^#"&;)#.'2)1*#4$."T.&156-*K.6)#'4'.DC^P. 7.A)$"%'*#&*);.2#"*)15"%.-%.bi.1#"2.'2)1-)'. 7.f"#g'.&'.T",-&#.'2#&K. 7.G&*4#&,.D#";41*.h-*:.L)#".#)'-;4)'. 7._&6"#&+,).?FI'. 7.=*&*4'<.D:&').`.J&,-;&5"%. 0 0 27 54 81 107 134 161 188 214 241 268 294 321 348 375 401 428 455 481 508 536 564 592 620 648 676 0 0 0 34 68 102 136 170 204 238 274 310 346 382 418 454 490 526 562 598 634 670 706 742 778 814 850 RLU 0 0 52 105 157 210 262 315 367 420 473 525 578 630 683 735 788 841 RLU CONTROLES DE CALIDAD" RLU Desarrollo de PRB1" PRB 1 50µg/ml 10000 8000 6000 4000 2000 PRB 1 25µg/ml 10000 8000 6000 4000 2000 PRB 1 50µg/ml in Mutant 10000 8000 6000 4000 2000 Desarrollo del STEMICOL y su uso en producción integrada y ecológica " D-$-)%*"<.Pc7`cj.-%1#)$)%*".;).,&.D#";411-M%. 80! *" *" *" 70! k-,"0#&$"'(8#&*&$-)%*". 60! 50! 40! 30! 20! 10! 0! 80! *" *" *" *" k-,"0#&$"'(8#&*&$-)%*". 70! 60! 50! G".&T)1*&.&,.1"%*#",.+-",M0-1". 40! 30! 20! 10! 0! Control " P1M P1m P2M P2m P3M P3m P4M P4m" Productos de " referencia" 14! 12! 10! 8! 6! 4! 2! 0! ORIUS! SWIRSKII! EFECTIVIDAD DE ALGUNOS “FUNGICIDAS” DEPENDE DE LOS MECANISMOS DE DEFENSA DE LAS PLANTAS /("#%"$(V"(^(JM/)*N,!(%-P*%&&&!%"')Q*K#(*+)*/!'I((I-%"!#/(#*)"*%-I!'K&$KI%. ,!(%-** %&&!%"')* abcc/deb@043f* * [?ccc*/!'I((I-%"!#/(#** %"%&!J+(#*'%+%*%g(*)"** &(#*b*.I!"'!.%&)#*'K&$!^(#*