Ayuda - Biodiversidad de Canarias

Manual de
Usuario de
Atlantis 3.3
Versión septiembre 2015
1
Diseño y elaboración:
Servicio de Biodiversidad. Dirección General de Protección de la Naturaleza
Viceconsejería de Medio Ambiente
2
INDICE:
PRESENTACIÓN ............................................................................................... 5
¿Qué es el Banco de Datos de Biodiversidad de Canarias? .................................................... 6
¿Qué no es el Banco de Datos de Biodiversidad de Canarias? ............................................... 7
I. Criterios generales del Banco de Datos de Biodiversidad de Canarias ................................. 7
II. Características técnicas de Atlantis 3.3 ................................................................................. 8
a. Componentes y desarrollo. ............................................................................................................... 8
b. Requisitos técnicos para acceder a la aplicación .............................................................................. 9
c. Solución de incidencias en el acceso a la sección cartográfica de la aplicación. ............................ 10
1. MENÚ PRINCIPAL. Generalidades. ............................................................. 11
1.1. Usuarios del Banco de Datos de Biodiversidad de Canarias ........................................... 11
1.2. Barra de Herramientas de Atlantis 3.3 ............................................................................. 12
1.3. Menú principal. ................................................................................................................. 13
1.4. Pantallas principales. ........................................................................................................ 14
1.5. Pantalla general de búsqueda. Documentos, especies, etc. ........................................... 14
2. ESPECIES. .................................................................................................. 17
2.1. CONSULTA DE ESPECIES. Generalidades .................................................................... 17
2.1.1. Criterios en el registro de las especies en el Banco de Datos de Biodiversidad de Canarias. .. 20
a. Taxonómicos ................................................................................................................ 20
b. Año de la cita ................................................................................................................ 21
c. Atributos de extinción, nidificación y varamientos ........................................................ 21
2.2. CONSULTA DE ESPECIE. Ficha de la especie/subespecie ........................................... 23
2.2.1. Imagen ...................................................................................................................................... 24
2.2.2. Sub nómine ............................................................................................................................... 25
2.2.3. Criterios en el registro de los sub nómines en el BDBC............................................................ 26
2.2.4. Niveles de protección ................................................................................................................ 26
2.2.5. Estatus de conservación ........................................................................................................... 27
2.2.6. Categoría de hábitat .................................................................................................................. 27
2.2.7. Categoría de origen .................................................................................................................. 27
2.2.8. Endemicidad ............................................................................................................................. 28
2.2.9. Validación del taxón .................................................................................................................. 29
2.2.10. Criterios geográficos. .............................................................................................................. 29
a. Límites del Archipiélago. .............................................................................................. 29
b. Tamaño de la cuadrícula .............................................................................................. 31
c. Niveles de precisión y confianza .................................................................................. 32
2.2.11. Mapa resumen de la especie .................................................................................................. 36
Mapa de las islas en verde ............................................................................................... 36
Mapa de las islas en azul ................................................................................................. 37
Mapa del mar en azul ....................................................................................................... 37
Mapa del mar e islas en blanco ........................................................................................ 38
2.2.12. Consulta de distribución de una especie. ................................................................................ 39
2.2.12.1. Visor simple. ...................................................................................................... 40
2.2.12.2. Visor avanzado. ................................................................................................. 45
2.3. CONSULTA DE ESPECIE: Taxonomía ........................................................................... 60
2.3.1. Imprimir informe taxonómico ..................................................................................................... 62
3. ARCHIVO DOCUMENTAL ........................................................................... 63
3.1. CONSULTA DE DOCUMENTOS. Generalidades............................................................ 63
3.1.1. Criterios en el registro de documentos en el BDBC .................................................................. 65
3.2. CONSULTA DE DOCUMENTOS: Ficha de documentos ................................................ 66
3.2.1. Publicaciones ............................................................................................................................ 67
3.2.2. Referencias de experto ............................................................................................................. 67
3.2.3. Notas de incidencias ................................................................................................................. 68
3.2.4. Estudios no publicados ............................................................................................................. 68
3.2.5. Palabras clave........................................................................................................................... 68
3.2.6. Imprimir carátula de documentos. ............................................................................................. 69
3.2.7. Especies citadas ....................................................................................................................... 69
3.2.8. Contenido del documento ......................................................................................................... 70
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a. Niveles de protección ................................................................................................... 71
b. Categorías de hábitat ................................................................................................... 72
c. Datos espaciales (taxones) .......................................................................................... 73
d. Imágenes de la especie................................................................................................ 75
e. Categorías de origen de la especie .............................................................................. 76
f. Endemismo .................................................................................................................... 77
g. Descripción de la especie............................................................................................. 77
4. ADMINISTRACIÓN (Acceso a usuarios validados) ...................................... 78
4.1. Mantenimiento. Creación de Carpetas y subcarpertas .................................................... 78
4.2. Mantenimiento. Búsqueda y creación de localidades o ámbitos...................................... 79
4.2.1. Búsqueda de localidades. ......................................................................................................... 79
4.2.2. Crear una localidad o un ámbito nuevo ..................................................................................... 81
4.2.3. Crear una localidad o un ámbito nuevo a partir de un archivo shape ....................................... 81
5. ÁNALISIS TERRITORIAL............................................................................. 83
5.1. MENÚ PRINCIPAL. Generalidades .................................................................................. 83
5.2. CONSULTA DE ANALISIS. Nuevo Mapa ........................................................................ 83
5.3. CONSULTA DE ANALISIS. Gestión de Capas ................................................................ 84
5.3.1. Nueva capa de riqueza ............................................................................................................. 85
5.3.1.1. Filtros para crear una capa de riqueza ............................................................... 87
5.3.1.2. Visualizar una capa de riqueza ........................................................................... 92
5.3.2. Catálogo o checklist ................................................................................................................ 109
5.3.2.1. Filtros para crear un catálogo o checklist .......................................................... 111
5.3.2.2. Visualizar un catálogo o checklist ..................................................................... 116
6. IMPORTAR/EXPORTAR (Sólo administradores del sistema) .................... 117
7. CÁLCULO ÍNDICES DE RAREZA (Sólo administradores del sistema) ..... 118
8. AUDITORÍA (Sólo administradores del sistema) ........................................ 119
9. CARGA MASIVA DATOS (Sólo administradores o usuarios de carga) ..... 120
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PRESENTACIÓN
El programa informático ATLANTIS surge de la necesidad de divulgar la información
taxonómica y de distribución de las especies silvestres, marinas y terrestres de las
islas Canarias, cumpliendo con uno de los objetivos principales del Banco de Datos de
Biodiversidad de Canarias.
La aplicación ATLANTIS 3.3 viene a sustituir las anteriores aplicaciones informáticas
ATLANTIS TIERRA 2.0 y ATLANTIS MAR. En esta nueva aplicación se unifican los
anteriores módulos de carga, de usuario y de distribución, y se da acceso a una única
base de datos que fusiona la información de las especies marinas y terrestres. Es un
programa web, basado en aplicaciones gratuitas, lo que mejora sustancialmente la
accesibilidad al Banco de Datos de Biodiversidad de Canarias. ATLANTIS 3.3
incorpora además la posibilidad de modificar la base cartográfica y el idioma para ser
adaptado a cualquier otro ámbito territorial.
Este manual se ha diseñado teniendo en cuenta los dos ejes principales del programa,
esto es: la consulta de información sobre las especies y los análisis territoriales de
distribución de la biota. De esta manera, en primer lugar se abordan todos los menús y
pantallas relacionadas con la consulta de especies/subespecies y los diferentes
campos asociados a la misma y en segundo lugar los relacionados con los distintos
análisis territoriales que puede realizar el usuario. Para ello se muestran las distintas
pantallas que de la aplicación con una descripción de todos los botones de acceso, de
las funciones que desempeñan cada uno de ellos y, en su caso, los criterios
adoptados que rigen la carga de datos (bibliográficos, taxonómicos, corológicos,
cartográficos, etc.).
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¿Qué es el Banco de Datos de Biodiversidad de Canarias?
El Banco de Datos de Biodiversidad de Canarias (en adelante Banco de Datos o BDBC)
constituye el registro oficial taxonómico de la biota del archipiélago. A tales efectos se crea
como registro público de carácter administrativo, incluyéndose en él el listado y la distribución
conocida de especies silvestres de plantas, hongos, animales y demás organismos vivos que
de modo regular habitan o se reproducen en el Archipiélago y sus aguas. Dentro de la finalidad
y objetivos del BDBC están, entre otros, facilitar el acceso libre a la información por parte de las
personas e instituciones interesadas y favorecer la divulgación de la biodiversidad. Así se
contempla en la Orden de 1 de junio de 1999 1 y en la Ley 4/20102.
El pilar fundamental del Banco de Datos es el rigor de la información que se incorpora,
fundamentado en dos aspectos: por un lado, la información registrada viene avalada por
documentos (publicados o inéditos) y por otro lado cada dato y documento está sometido a la
supervisión por parte de especialistas. En este proceso de validación científica han participado
y colaborado más de un centenar de expertos internacionales, nacionales y locales.
El BDBC constituye una base de datos dinámica que trata de actualizarse de forma continua.
De este modo, pretende reflejar el avance del estado del conocimiento, tanto en lo que se
refiere al descubrimiento de nuevas especies como a nuevos datos de distribución de otras,
además de corrección de errores, afinamiento de datos corológicos, actualización de
información biológica, imágenes, etc.
El BDBC se nutre de toda la información actual, pero también histórica, desde la llegada de los
primeros naturalistas a Canarias. Los registros que se introducen en el Banco se extraen de
publicaciones e informes inéditos (tesis doctorales, estudios científicos, expedientes técnicos,
referencias de experto, etc.) que se generan en todos los sectores públicos o privados. Estos
documentos, en soporte papel y debidamente referenciados, están depositados en el Archivo
Documental del BDBC (salvo aquellos de los que no se dispone de copia impresa).
El BDBC es de acceso libre y gratuito vía web, tanto para las administraciones públicas como
para el público en general. Se accede a él a través de la aplicación informática ATLANTIS 3.3.,
que ofrece la información disponible sobre las especies silvestres de Canarias y su distribución,
y permite realizar consultas territoriales sobre diferentes parámetros de la distribución de la
biodiversidad en el archipiélago. Entre otras utilidades, ATLANTIS 3.3 aporta información para
la evaluación del estado de conservación de especies amenazadas y para la redacción y
ejecución de planes de recuperación de estas especies, así como para la elaboración de
informes, para orientar la toma de decisiones en materia de ordenación territorial, facilitar la
selección y planificación de espacios naturales de diferente naturaleza y la ejecución de los
correspondientes instrumentos de ordenación, etc.
Orden de 1 de junio de 1999, por la que se crea el banco de Datos de Biodiversidad de Canarias (BOC nº 84, de 30 de junio de
1999).
2 Ley 4/2010, de 4 de junio, del Catálogo Canario de Especies Protegidas (BOC nº 112, de 9 de junio de 2010).
1
6
¿Qué no es el Banco de Datos de Biodiversidad de Canarias?
El Banco de Datos no constituye un registro bibliográfico de toda la información conocida
de las especies silvestres de las islas. De hecho, en él no se registran información redundante
o ya recopilada en otras fuentes (es decir, las citas que corresponden a una misma especie
para la misma localidad y la misma fecha se registran una sola vez, aún cuando provengan de
diferentes documentos).
El Banco de Datos es una herramienta de consulta que pretende facilitar y orientar la gestión y
la conservación de las especies y de los recursos naturales del archipiélago. Dado que la
información en él contenida tiene un claro sesgo bibliográfico es un reflejo del estado del
conocimiento, pero en ningún caso no debe entenderse como una descripción de la situación
real en la naturaleza. Es por tanto una herramienta complementaria a otras fuentes de
información posible pero no puede de ningún modo sustituir a las prospecciones de campo o
estudios faunísticos o botánicos que sean necesarios en cada caso.
I. Criterios generales del Banco de Datos de Biodiversidad de Canarias

Se registran las especies silvestres terrestres y marinas de Canarias de plantas,
hongos, animales y otros organismos vivos.


El nivel taxonómico inferior que se registra es el de especie y subespecie.
La unidad mínima territorial de información que se asigna a las especies es la
cuadrícula UTM de 500 x 500 m.

Toda la información registrada está avalada con un documento que se deposita en el
Archivo Documental del Banco de Datos. Estos documentos pueden ser tanto
publicados como inéditos (memorias de investigación, tesis doctorales, estudios
técnicos, informes, etc.).

Toda la información registrada está validada por expertos en los diferentes grupos
taxonómicos, para garantizar su rigor científico.

Se omiten los datos redundantes, por lo que el Banco de Datos no debe entenderse
como una base de datos que recopila toda la bibliografía sobre la biota de Canarias.
7
II. Características técnicas de Atlantis 3.3
a. Componentes y desarrollo.
ATLANTIS 3.3 es una aplicación web desarrollada con la tecnología Java Server Faces de Sun
Microsystems Inc. que se ejecuta sobre un servidor Tomcat 6 y que utiliza para el
almacenamiento una base de datos PostgreSQL.
La tecnología JavaServer Faces (JSF) es un framework para aplicaciones Java basadas en
web que simplifica el desarrollo de interfaces de usuario en aplicaciones Java EE. JSF se basa
en JavaServer Pages (JSP) para el despliegue de las páginas, pero también se acomoda a
otras tecnologías como XUL. JSF incluye:






Un conjunto de API para representar componentes de una interfaz de usuario y
administrar su estado, manejar eventos, validar entradas, definir un esquema de
navegación de las páginas y dar soporte para internacionalización y accesibilidad.
Un conjunto de componentes por defecto para la interfaz de usuario.
Dos librerías de etiquetas personalizadas para JavaServer Pages que permiten
expresar una interfaz JavaServer Faces dentro de una página JSP.
Un modelo de eventos en el lado del servidor.
Administración de estados.
Beans administrados.
Tomcat (también llamado Jakarta Tomcat o Apache Tomcat) funciona como un contenedor de
servlets desarrollado bajo el proyecto Jakarta en Apache Software Foundation. Tomcat
implementa las especificaciones de los servlets y de JavaServer Pages (JSP) de Sun
Microsystems.
PostgreSQL es un sistema de gestión de base de datos relacional orientada a objetos de
software libre, publicado bajo la licencia BSD, desarrollado por PostgreSQL Global
Development Group (PGDG).
Atlantis 3.3 también utiliza nuevos estándares para el almacenamiento de información
geográfica. Para ello, recurre principalmente a dos soluciones:

GeoTools: es una biblioteca SIG de código libre que permite desarrollar soluciones
adaptadas a los estándares. Proporciona una implementación de las especificaciones
del Open Geospatial Consortium según van apareciendo. Su diseño y concepción
modular hace que numerosas implementaciones de software libre en el ámbito de los
Sistemas de Información Geográfica (SIG) hagan uso de ellos.

PostGIS: es un módulo que añade soporte de objetos geográficos a la base de datos
objeto-relacional PostgreSQL, convirtiéndola en una base de datos espacial para su
utilización en Sistema de Información Geográfica. Se publica bajo licencia pública
general de GNU. PostGis ha sido desarrollado por la empresa canadiense Refraction
Research, especializada en productos "Open Source". PostGIS ha sido certificado en
2006 por el Open Geospatial Consortium (OGC) lo que garantiza la interoperabilidad.
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b. Requisitos técnicos para acceder a la aplicación
Los ordenadores que actúen como cliente de la aplicación deben tener una conexión a Internet
y disponer al menos de:

Versión de Java igual o superior a 1.6.0.

Versión última del Firefox (recomendado).

Versión 10.1.3.23. del Plugin Adobe Acrobat.
El acceso a la aplicación por primera vez requiere ejecutar la certificación de confianza en el
cuadro de diálogo correspondiente.
Figura 1A. Cuadro de diálogo de certificado de confianza en la aplicación.
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c. Solución de incidencias en el acceso a la sección cartográfica de la aplicación.
Es posible que los usuarios detecten en sus ordenadores bloqueos en el acceso a la sección
cartográfica de visualización de los mapas de distribución de especies, así como, a los mapas
de riqueza de distribución de especies.
Esta situación se puede producir por incompatibilidades con al versión de Java utilizada y con
los permisos de seguridad. Se muestran distintas pantallas de la configuración ideal de la
aplicación Java para el perfecto funcionamiento de Atlantis 3.3.
Figura 1B. Cuadro de diálogo de la configuración de Java.
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1. MENÚ PRINCIPAL. Generalidades.
En la dirección www.biodiversidadcanarias.es se aloja el Banco de Datos de Biodiversidad
de Canarias. Se accede a la siguiente página de inicio:
Figura 2. Menú principal de la aplicación.
1.1. Usuarios del Banco de Datos de Biodiversidad de Canarias
La información registrada en el Banco de Datos de Biodiversidad de Canarias
está disponible de forma gratuita para todos los usuarios, sin que sea
necesario validarse para realizar consultas y análisis. Ahora bien, existen
otros perfiles de usuarios con diferentes funciones y accesibilidad. Estos
últimos deben validarse introduciendo nombre y contraseña.
Los perfiles de usuario definidos son los siguientes:
Administrador: responsables del funcionamiento, mantenimiento y control de todo el sistema.
Tienen acceso total a todas las funcionalidades del Banco de Datos: dar de alta y de baja a los
usuarios, control de calidad de los datos, creación y edición de documentos, etc.
Supervisor: expertos científicos que validan la información registrada en el Banco de Datos.
Tienen capacidad de creación, edición y validación de documentos.
Usuario: operadores de carga de los datos, responsables de la actualización de la información
registrada. Tienen capacidad de creación y edición de documentos.
Usuario de consulta: usuarios validados con contraseña que tienen acceso para realizar
consultas y análisis. Como los usuarios anteriores tienen capacidad para crear y almacenar
ámbitos territoriales y realizar las consultas y análisis sobre ellos.
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Usuario sin validación: usuarios no validados que tienen acceso para realizar consultas y
análisis. Al contrario que los usuarios anteriores no tienen capacidad para crear y almacenar
ámbitos territoriales y deben realizar las consultas y análisis territoriales sobre ámbitos ya
definidos en la base de datos.
1.2. Barra de Herramientas de Atlantis 3.3
En la barra superior de herramientas, se han habilitado botones de acceso, visibles y disponibles
desde cualquier pantalla de la aplicación, que aportan información de interés para los usuarios, a
saber:
Inicio
Contacto
Ayuda
Aviso legal
Remite al menú principal de la aplicación.
Permite remitir consultas, sugerencias y comentarios, vía correo electrónico, al equipo de soporte del
Banco de Datos de Biodiversidad de Canarias y de la aplicación Atlantis 3.3.
Permite acceder al Manual de Usuario de Atlantis 3.3
Permite acceder a las Normas de Uso del Banco de Datos de Biodiversidad de Canarias.
Banco de Datos
Permite acceder a información relativa al Banco de Datos de Biodiversidad de Canarias:
antecedentes, esferas de organización, créditos, etc.
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1.3. Menú principal.
El menú principal permite acceder a los distintos módulos de consulta del Banco de Datos
gracias a la aplicación Atlantis 3.3. A partir de este apartado se presentan las herramientas,
uso y funcionalidad de la aplicación para hacer más fácil al usuario la consulta e interpretación
de los resultados.
1
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4
Figura 5. Menú principal.
1. ESPECIES. Permite el acceso de todos los usuarios a la información registrada de todas las
especies y subespecies registradas, entre otros, información general del taxón, su distribución,
los documentos que la aportan y su taxonomía (su posición en la Sistemática).
2. ANÁLISIS TERRITORIAL. Permite el acceso de todos los usuarios para realizar análisis de la
información registrada sobre distribución de las especies y otros parámetros de la biodiversidad
(riqueza, rareza, etc.), creando mapas o catálogos (checklist) de una o un conjunto de especies,
en Canarias o en un ámbito territorial concreto.
3. ADMINISTRACIÓN. Permite el acceso a los usuarios validados (según el tipo de acceso) a
pantallas de administración y mantenimientos de contenidos (localidades, creación de carpetas
etc.).
4. ARCHIVO DOCUMENTAL. Permite el acceso a todos los usuarios a la búsqueda de la
información registrada en los documentos (publicaciones, informes, etc.) que se han registrado
en el Banco de Datos de Biodiversidad de Canarias.
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1.4. Pantallas principales.
Para facilitar el manejo de la aplicación se han aglutinado en esta sección las herramientas
comunes a la mayoría de las pantallas de Atlantis 3.3.
Pestañas de acceso rápido: se encuentran en la parte superior derecha y permiten acceder
rápidamente a la sección que indica su nombre desde cualquier parte de la aplicación
(Señaladas con trazo amarillo en la figura 3).
Ubicación de la pantalla actual en la ruta de navegación: situada en la parte superior
izquierda, refleja las diferentes pantallas por las que se ha ido navegando hasta llegar a la
actual. Permite acceder directamente a cualquiera de esas otras pantallas pulsando sobre sus
correspondientes nombres. (Señaladas con trazo azul en la figura 3).
.
Textos explicativos: se encuentran en la parte superior derecha y aportan información para el
usuario, ya sea sobre contenidos de la pantalla, ya sea sobre las tareas que pueden realizarse.
(Señaladas con trazo rojo en la figura 3).
Figura 3. Contenidos y accesos rápidos comunes a numerosas pantallas de ATLANTIS 3.3.
1.5. Pantalla general de búsqueda. Documentos, especies, etc.
En las pantallas de búsqueda, por especies, por documentos, etc., los listados de resultado de
la búsqueda pueden ordenarse en orden ascendente o descendente por las diferentes
columnas pulsando sobre los títulos de la misma. Una flecha de color verde indica cuál es la
columna por la que se ha ordenado el listado y en que orden.
En la parte inferior del listado, se muestra el número de páginas y un selector para navegar
entre ellas.
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Figura 4. Pantalla de general de búsqueda. Ejemplo: listado resultado de búsqueda de documentos que contienen la
palabra “seguimiento” en el título.
Menú desplegable: Permite realizar una búsqueda por determinados campos, eligiendo
entre los posibles contenidos; puede escribirse el texto una parte inicial de él para facilitar la
búsqueda. Una vez seleccionado el valor de campo, para borrar dicha selección puede
pulsarse sobre el aspa (x) situada a la derecha.
Permite ejecutar el filtro de búsqueda.
Permite borrar todos los parámetros de búsqueda simultáneamente para realizar
una nueva búsqueda.
Permite exportar el contenido del listado resultado en formato de texto (archivos csv). No existe
en todos los casos.
Impresión Permite imprimir los contenidos que estamos visualizando en pantalla, ya sea
una página de búsqueda o de consulta o bien capas cartográficas seleccionadas por el
usuario.
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El menú principal permite acceder a los distintos módulos de consulta del Banco de Datos
gracias a la aplicación Atlantis 3.3. A partir de este apartado se presentan las herramientas,
uso y funcionalidad de la aplicación para hacer más fácil al usuario la consulta e interpretación
de los resultados.
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Figura 5. Menú principal.
1. ESPECIES. Permite el acceso a todos los usuarios a la información registrada de especies y
subespecies silvestres que tienen distribución conocida en el archipiélago canario. En esta
pantalla tendrán acceso a la taxonomía de las especies, documentos que los citan aportando
información de distribución geográfica entre otros, así como a la ficha general de consulta
especie.
2. ANÁLISIS TERRITORIAL. Permite el acceso a todos los usuarios para realizar análisis de
información en el territorio creando mapas de riqueza de distribución o catálogos (checklist) de
una o un conjunto de especies, en Canarias o en un ámbito territorial concreto.
3. ADMINISTRACIÓN. Permite el acceso a los usuarios validados (según el tipo de acceso) a
pantallas de administración y mantenimientos de contenidos (localidades, creación de carpetas
etc.).
4. ARCHIVO DOCUMENTAL. Permite el acceso a todos los usuarios a la búsqueda de la
información registrada en los documentos (publicaciones, informes, etc.) que se han registrado
en el Banco de Datos de Biodiversidad de Canarias.
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2. ESPECIES.
2.1. CONSULTA DE ESPECIES. Generalidades
Figura 6. Menú principal. Selección de especie.
A través del botón ESPECIES, se accede a una serie de pantallas de búsqueda relacionados
con la información conocida registrada en el Banco de Datos de Biodiversidad de Canarias.
Figura 7. Menú búsqueda de especie. Selección de especie.
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Se puede realizar la búsqueda escribiendo el nombre científico o común (ver casillas) o parte
del mismo. Por defecto, la aplicación hace la búsqueda por el nombre científico validado, no
obstante, el usuario puede seleccionar por el sub nómine y repetir la consulta.
Figura 8. Menú búsqueda de especie. Selección de sub nómine.
A su vez se puede filtrar y realizar la búsqueda por el tipo de especie (marino o terrestre).
Figura 9. Menú búsqueda de especie. Selección de tipo e especie: marino o terrestre.
Utilizando los menús desplegables de rangos taxonómicos organizados jerárquicamente, se
realizan todo tipo de búsquedas. Cada desplegable tiene un sistema de autobúsqueda, que a
medida que se escribe el nombre se va aproximando al más coincidente, lo que facilita
muchísimo su localización.
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Herramienta
Código
especie
Nombre especie/
subespecie
Nombre común
Tipo de
especie
Nombre sub
nómine
Familia y Clase
Origen
Endemicidad
Descripción
Código alfanumérico que se crea automáticamente al registrar la especie o subespecie.
Permite editar la ficha de la especie para hacer modificaciones de nombre, autoría, año de
descripción, etc. Sólo está habilitado para los administradores y usuarios de carga
Permite buscar por el nombre válido con el que se ha registrado en el Banco de Datos.
Permite buscar por el nombre común que se le ha asignado a cada una de las
especies/subespecies en el Banco de Datos, pueden tener más de un nombre.
Permite buscar por el tipo de especie marino o terrestre.
Permite buscar por los sub nómines con los que se ha citado la especie en el Banco de Datos.
Rangos taxonómicos de cada una de las especies. Se han utilizado éstas porque ayudan de
forma rápida a localizar la especie.
Categorías de origen biogeográfico asignada a cada una de las especies registradas en el
Banco de Datos.
Categoría de endemicidad asignada a cada una de las especies registradas en el Banco de
Datos.
Indica que la especie tiene imágenes registradas en el Banco de Datos. Habilitado el acceso
para todos los usuarios.
Indica que la especie tiene documentos registrados en el Banco de Datos. Habilitado el acceso
para todos los usuarios.
Permite realizar e imprimir listados por categorías taxonómicas, considerando todos los rangos
incluidos entre un nivel inicial y final, que selecciona el usuario. Los resultados obtenidos se
pueden exportar, copiar y guardar como pdf, Word, etc..
Permite acceder a la pantalla donde se recogen todos los documentos que tiene
registrada la especie en el Banco de Datos. Se pueden ordenar por el código PELCRIN (código
interno del BDBC para archivar los documentos registrados en el archivo documental y facilitar
su búsqueda), por tipo de documento, por año de la publicación o por título. Se muestra
también el número total de documentos y el contador de páginas en función del número de
documentos registrados.
Los registros de documentos en color rojo son aquellos que tienen datos de distribución en
cuadrículas de las especies citadas en él. El resto de documentos en color negro aportan
información de otra índole, del tipo de imágenes, categorías de endemicidad, de origen, etc.
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Figura 10. Menú búsqueda de especie. Lista de documentos registrados en el BDBC que tienen citada una especie
determinada
2.1.1. Criterios en el registro de las especies en el Banco de Datos de
Biodiversidad de Canarias.
a. Taxonómicos

El rango taxonómico mínimo registrado en el Banco de Datos es la especie o
subespecie, de forma que otros niveles como variedades, híbridos, formas o
poblaciones no se dan de alta en la base de datos.

El nombre de científico de los taxones debe de estar correctamente publicado según
las normas del Código Internacional de Nomenclatura correspondiente.

Los taxones indeterminados (recogidos en la bibliografía como “sp”, “spp”, “aff” o
“grex”) no se registran en la Base de Datos.

Están registrados sólo los rangos taxonómicos superiores:
ReinoDivisiónSubdivisiónClaseOrdenFamiliaGéneroEspecie/subespecie
ReinoPhylumClaseOrdenFamilia GéneroEspecie/subespecie

Los taxones cuyo rango taxonómico no se conoce con claridad están registrados en la
categoría “posición incierta” (incertae sedis), solamente aplicado a los rangos de orden
y familia y nunca a categorías superiores o inferiores.

Las autorías de los taxones se registran utilizando las normas del Código Internacional
de Nomenclatura Zoológica para los animales. En Botánica, no se ha hecho uso del
protólogo completo (autores de la especie, lugar y fecha de la publicación), sino que se
indican exclusivamente los autores mediante las abreviaturas taxonómicas establecidas
por Brummit (1992).
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b. Año de la cita

Cada cita georreferenciada está registrada con el año que se recoge en la publicación.

No se registran redundancias, es decir, no se introduce la misma localidad y año de la
colecta, referida a más de un documento.

Si se publican los años de las citas como intervalo se registran ambos años del
intervalo.

Si se publican los años de las citas como intervalo dentro de una misma década se
registra uno de los años procurando que sea el más probable por el resto de
información o consulta al experto.

Se estableció el Criterio “década” ante la necesidad de registrar el mayor volumen de
información. Una cita de un taxón para una misma localidad en varios años
pertenecientes a una misma década, se registró un solo año de los citados. Se
considera que la década comienza en el año terminado en 0 y finaliza en el año
terminado en 9. Sólo se aplica en aquellos documentos publicados antes del año 2000.
A partir de este año, las citas de las especies se registran año a año.
c. Atributos de extinción, nidificación y varamientos
Extinción

Se registran datos considerados como extinciones y siempre que estén avalados por
una fuente bibliográfica, tanto las formas fósiles o subfósiles, como extinciones
recientes. Las cuadrículas se visualizan con el símbolo de la calavera, junto con la
paleta de colores de precisión y confianza.
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Nidificación

Están registradas sólo las aves nidificantes en Canarias, a partir de la fecha de
nidificación constatada.

Están registrados con un símbolo de una cigüeña las cuadrículas cuando la cita
nidificación segura (presencia de nidos, pollos, ceba de pollos, etc).

Están registrados como presencia cuando el dato de la cita es de nidificación probable
o posible.

 Restos/Varados
Están registrados con el símbolo  las citas de conchas marinas, animales varados, restos o
especimenes muertos fuera de su hábitat natural, para diferenciarlos de las citas de ejemplares
vivos.
22
2.2. CONSULTA DE ESPECIE. Ficha de la especie/subespecie
Pulsando sobre el nombre del la especie en la pantalla de consulta de especies, accedemos a
su ficha, donde está aglutinada toda la información disponible registrada en el Banco de Datos,
imágenes, sub nómines, datos taxonómicos y el acceso a la distribución de la especie conocida
en el Archipiélago.
Los campos de datos adicionales, nos permiten acceder a información ampliada sobre la
especie. El resto de los datos, los taxonómicos, endemicidad y mapa resumen de la especie
son datos visuales de la propia pantalla.
Figura 11. Ficha de la consulta de especie.
Herramienta
Consulta de
especie
Endemicidad
del taxón
Imagen
Sub nómine
Niveles de
protección
Estatus de
conservación
Categoría de
hábitat
Categoría de
origen
Mapa resumen de
la especie
Descripción
Nombre de la especie/subespecie con toda la información jerarquía taxonómica con la que se ha
registrado en el BDBC.
Datos sobre la endemicidad asignada a cada una de las especies/subespecies en el Banco de
Datos.
Permite visualizar la imagen. Si una especie/subespecie tuviese más de una imagen asociada,
tendría un contador en la parte inferior de la misma, sobre el que nos podremos desplazar para ver
cada una de ellas.
Permite acceder a la relación de nombres con los que ha sido citada la especie/subespecie en
Canarias.
Permite acceder a la consulta de las categorías de protección asignadas a la especie.
Permite acceder a las categorías de conservación asignadas a la especie.
Permite acceder a la consulta de los hábitats asociados al taxón.
Permite acceder a la consulta de las categorías de origen.
Mapa de distribución insular asociados a la especie, resultado de la unión de todas las citas
conocidas de la especie.
Filtro de fecha, por el que se puede hacer consultas sobre la distribución de las especies.
Permite acceder a la distribución en cuadrículas asociadas a la especie, resultado de la unión de
todas las citas conocidas de la especie.
A esta pantalla se puede acceder directamente con la url donde el código del final indica el
código de la especie:
http://www.biodiversidadcanarias.es/atlantis/admin/adminEspecieConsulta.jsf?especieC
ode=E02326
23
2.2.1. Imagen
Si se pulsa en la imagen de la ficha de consulta de especie, se activa una vista ampliada de la
misma. Este visor lleva adjunto un cuadro de texto con observaciones de interés (autor de la
imágen, colector del ejemplar, localidad, dibujante, etc.). El usuario puede utilizar estas
imágenes siguiendo las normas de uso (ver Aviso Legal en el menú inicial del Banco de Datos)
publicadas en la web.
24
Figura 12. Imagen ampliada de la especie.
2.2.2. Sub nómine
Acceso a la pantalla donde se muestran los nombres con los que ha sido citada la
especie o subespecie en Canarias.
Figura 13. Pantalla de sub nómines registrados en el Banco de Datos para una especie.
Herramienta
Descripción
Sub nómine
Lista de nombres antiguos o no aceptados con los que ha sido citada la especie
en Canarias.
Documento, año
Código y año de los documentos en los que el taxón ha sido citado con ese
nombre.
Documento justifica, año
Código y año del documento que justifica el cambio de nombre.
25
2.2.3. Criterios en el registro de los sub nómines en el BDBC

Están registrados los sub nómines de taxones citados en Canarias.

Existen Referencias de Experto registradas en el BDBC para justificar los sub nómines
en los casos de no disponer de los documentos originales.

Así, para el Banco de Datos como sub nómines de un taxón se entiende:
- Sinonimias propiamente dichas (totales o proparte [pp.]).
- Cambios de género.
- Nombres del taxón mal escritos (errores ortográficos).
- Cambios de autoría.
- Determinaciones erróneas (nombres mal aplicados).
- Nombres que se engloban dentro de las categorías de variedades, formas,
híbridos y grupos.
2.2.4. Niveles de protección
Cuando la opción Niveles de protección de la consulta de especie está en color verde significa
que el taxón tiene asignada una o varias categorías de protección según se recoge en los
documentos normativos regionales, nacionales o internacionales. Si no está resaltado de color
el taxón no está protegido según la legislación que afecta a las especies que se distribuyen en
Canarias.
Figura 14. Pantalla de Niveles de Protección asociadas a una especie en el Banco de Datos.
Herramienta
Documento asignación
niveles
Descripción
Documento normativo que asigna las categorías de protección.
Documento definición niveles Documento que define las categorías de protección.
26
Isla, descripción, descripción Indica la isla donde la especie se encuentra protegido con esa categoría y la
ampliada
descripción ampliada que se encuentra recogida en cada norma legal.
2.2.5. Estatus de conservación
Cuando la opción Estatus de conservación de la consulta de especie está en color verde
significa que el taxón tiene asignada una o varias categorías de conservación según se recoge
en los documentos registrados en el Banco de Datos. Si no está resaltado de color la especie
no está publicada en los documentos (Listas Rojas, Libros Rojos, UINC, etc.) siguiendo los
criterios del Banco de Datos de Biodiversidad de Canarias.
2.2.6. Categoría de hábitat
Cuando la opción Categoría de hábitat de la consulta de especie está en color verde significa
que el taxón tiene asignada una o varias categorías de hábitat según se recoge en los
documentos registrados en el Banco de Datos. Si no está resaltado de color la especie no tiene
asignada ninguna categoría de hábitat siguiendo los criterios del Banco de Datos de
Biodiversidad de Canarias.
2.2.7. Categoría de origen
Cuando la opción Categoría de origen de la consulta de especie está en color verde significa
que el taxón tiene asignada una categoría siguiendo los criterios definidos en el Banco de
Datos. Si no está resaltado de color la especie no tiene asignada ninguna categoría.
El concepto y la definición para cada una de las categorías es la siguiente:
Nativo seguro (NS): incluye los taxones nativos, tanto los endémicos como los no
endémicos. En ambos casos esta categoría será asignada a aquellas especies y
subespecies de las que se tiene constancia de que su presencia en Canarias es natural y
no asociada a la actividad humana.
Nativo probable (NP): incluye aquellos taxones en los que a pesar de que no hay
seguridad de su carácter nativo, sin embargo existen indicios que señalan que es muy
difícil que hayan sido introducidos por el hombre. Por ejemplo, taxones cuya distribución
restringida y su asociación a algún tipo de hábitats natural de las islas hace suponer que
no es introducido. Aquí se incluyen también aquellas especies no endémicas parásitas de
especies endémicas o nativas, en las que no existen indicios de su carácter introducido.
Se trata de especies que viven sobre plantas o animales nativos, que pueden ser
frecuentes también sobre plantas o animales que viven fuera de los límites del
archipiélago.
Nativo posible (NO): aquí se incluirán los taxones que no puedan asignarse a cualquiera
de las otras cinco categorías definidas. Se trata de relacionar en esta categoría todos los
taxones de los que no se tiene conocimiento ni sospecha alguna sobre su origen
introducido, y tampoco se tenga claro su carácter natural de inmigrante. Siguiendo la
premisa de la North American Inmigrant Arthropods Data Base, la idea es clasificar a
cualquier especie o subespecie como nativo posible mientras no se demuestre su
asociación probable o segura a un proceso de colonización artificial.
Introducido seguro (IS): incluye aquellos taxones de reconocida situación ecológica
cosmopolita y de amplia distribución fuera del ámbito de Canarias o cuya introducción
(accidental o deliberada) reciente (último siglo) o histórica está registrada en la
bibliografía. Suelen ser especies que están asociadas al transporte marítimo, al comercio
27
y a los diversos aprovechamientos desarrollados después de la conquista de Canarias.
Algunas están reconocidas a través de documentos escritos, otras están recogidos en la
bibliografía científica y otras son reconocidas por los expertos en cada grupo taxonómico.
Se incluyen también las especies introducidas de las que se ignora su carácter invasivo.
Siguiendo el concepto de especies foráneas recogido por la Comisión para la
Supervivencia de las especies de la UICN (1998) son “especies o subespecies que se
encuentran fuera de su rango natural (pasado o presente), con dispersión potencial (fuera
del rango que ocupa de forma natural o en el rango que no podría ocupar sin la
introducción directa o indirecta del hombre) y que incluyen parte de los gametos o
propágulos de tales especies, las cuáles pueden sobrevivir y reproducirse
subsecuentemente”.
Introducido invasor (II): incluye aquellos taxones que se han establecido en
ecosistemas o hábitats naturales o seminaturales y constituyen un agente de cambio y
amenaza sobre la diversidad biológica nativa. Se incluyen aquí tanto las especies cuya
expansión en el territorio de las islas ha podido ser constatada como otras que han
seguido dicho comportamiento en otros lugares fuera de las islas.
Introducido probable (IP): incluye aquellos taxones en los que a pesar de que no hay
seguridad de su carácter introducido, sin embargo existen indicios que señalan que es
muy difícil que su presencia en Canarias se deba a procesos naturales no asociados a la
actividad humana. Son taxones no reconocidos en citas bibliográficas como introducidas,
pero con una asociación clara y exclusiva a ambientes antrópicos o con una distribución
amplia en zonas continentales. En esta categoría se incluirán también las especies que
dada su condición de especies invasoras en otros lugares fuera de las islas, su amplia
distribución intra y extrainsular, o sus sistemas de dispersión natural fuertemente
asociado al hombre le suponen un carácter introducido.
2.2.8. Endemicidad
En la parte inferior izquierda de la pantalla de consulta de especie se visualiza la endemicidad,
entendiéndola como el indicador del grado en que un taxón se circunscribe o es propia de un
territorio dado. Cuando se tienen datos asociados aparece indicado en cada una de las
casillas, dividido en dos bloques Canarias y Macaronesia.
Visualización de la endemicidad
- Si el taxón no es endémico del archipiélago, se visualiza No
en cada una de las casillas de la columna Canarias.
- Si el taxón es endémico de Canarias, se visualiza Sí, en la
casilla de especie o subespecie según el caso. Lo mismo
ocurrirá con el género.
- Si el taxón es endémico de Canarias, se visualiza Sí, en la
casilla correspondiente a Macaronesia, siguiendo los criterios
de BDBC.
Documento registrado en el Banco de Datos que
asigna la categoría de endemicidad de la
especie/subespecie.
28
2.2.9. Validación del taxón
Los taxones registrados en el BDBC son válidos, entendiéndose que están descritos y
nombrados siguiendo los Códigos de nomenclatura. No obstante, en los documentos, a juicio
de los supervisores científicos, hay taxones dudosos, identificaciones erróneas, etc., que se
considera que deben estar registrados en el BDBC, de ahí que se haya establecido una
clasificación para asignar la validación del taxón, que son las siguientes:
Especie válida: taxón que tiene una combinación correcta y cumplen las normas del
Código Internacional de Nomenclatura correspondiente.
Especie dudosa: especie que tiene una posición taxonómica incierta o que su presencia
en Canarias no se puede constatar con seguridad. Además, pertenecen a esta clase
aquellas especies que se citan de forma indirecta dentro de un documento y que se les
asigna el rango de validación dudosa, porque no corresponden a citas del propio autor
del documento.
Especie por confirmar: especie que aparece citada en el documento como “por
confirmar” o “cf.”. En este caso será el supervisor quién establezca si la especie se
incluye en esta categoría o en la de especies dudosas. Además, se incluyen dentro de
esta categoría aquellas especies de posición taxonómica correcta, pero que su
distribución geográfica para Canarias necesita confirmación.
Esta información se visualiza en la consulta de la especie en la parte inferior de la ubicación de
la taxonomía de la especie consultada. El documento de validación es el que asigna esta
categoría.
2.2.10. Criterios geográficos.
a. Límites del Archipiélago.

El ámbito geográfico del Banco de Datos de Biodiversidad es Canarias y el mar que las
rodea.

Se ha establecido como límite territorial canario, para asignar la distribución de las
especies del archipiélago aquel que está demarcado por la Zona Económica Exclusiva de
Canarias.

El ámbito insular de distribución de un taxón es el comprendido por la superficie terrestre
de las islas y como límite marino la plataforma insular hasta la cota batimétrica de 200 de
profundidad.

Todos los taxones cuya presencia esté localizada fuera del límite de 200 m batimétricos
se considera que se distribuyen en el mar abierto sin quedar asociados al territorio
insular.
29
Figura 15. Límites de la Demarcación marina (Fuente: MAGRAMA 2015).
Figura 16. Límites de la zona batimétrica de 200m de profundidad, alrededor de cada una de las islas.
30
b. Tamaño de la cuadrícula

La unidad territorial de referencia es la cuadrícula UTM de 500 x 500 metros.

Las cuadrículas de 500m, están registradas para aquellas citas correspondientes con
topónimos concretos (montañas, roques, etc.) o con profundidad inferior o igual a 200m,
aplicándoles el nivel de precisión que le corresponda.

Las cuadrículas de 5000m, están registradas para aquellas citas correspondientes a
zonas amplias en el territorio insular o con profundidades superiores a 200m,
aplicándoles el nivel de precisión que le corresponda.

Están registradas las localidades en UTM o similar, frente al nombre de la localidad
cuando están disponibles ambas en los documentos.

Los topónimos están registrados transformándolos en cuadrículas atendiendo a las
características ecológicas y biológicas del lugar y de la especie citada, utilizando todos
los medios técnicos disponibles, cartografía base, esquemas, etc., siempre validada por
un supervisor científico.

Cuando se cita un accidente geográfico está transformado a cuadrículas lo más ajustado
posible. Cuando se trata de un topónimo litoral (playa, cabo, bahía, golfo, etc.) se
registran las celdas de mar próximas a él.

Cuando coincide el topónimo citado con el nombre de un municipio (por ejemplo Santa
Cruz de Tenerife) está ajustado el número de cuadrículas en función de la distribución
conocida de la especie, los datos ecológicos y el criterio del supervisor científico. En el
caso de especies marinas están registradas las celdas del litoral de la ciudad, no de todo
el municipio.

Están registradas para las especies marinas la presencia según las coordenadas de
posición de los barcos en el caso de dragados y rastreos.

Están registrados para las especies marinas la presencia según los datos obtenidos con
hidrófono, abarcando el ámbito de detección de los aparatos.
31
c. Niveles de precisión y confianza
En el Banco de Datos se han definido cinco niveles de precisión, los cuales se asignan y
ajustan teniendo en cuenta varios factores: certeza y exactitud de la cita, ecología de la
especie, etología, corología y la supervisión científica de la cita, etc.
c.1. Precisión

Nivel 1. Es el nivel de precisión más alto. Se registra con este nivel aquellas
cuadrículas de 500 m o 5000 m en las que con toda certeza ha sido observada o
colectada la especie.

Nivel 2. Se registran con este nivel citas de ámbito reducido pero poco preciso, como
topónimos: montañas, barrancos, playas, bahías, cabos, roques, etc. Se asignan a
celdas de 500 o 5000 m según corresponda.

Nivel 3. Se registran con este nivel citas amplias y poco precisas, tales como: Anaga,
costa norte de Tenerife, Jandía, costa de un municipio, etc. Se asignan a celdas de 500
o 5000 m según corresponda.

Nivel 4. Se registran con este nivel las citas que se refieren al territorio insular, a su
litoral o aguas próximas de una isla, sin precisar más. En este caso se usan
cuadrículas de 5000 m.

Nivel 5. Los taxones que están citadas en la bibliografía como “Canarias”, sin datos
geográficos más precisos en la ficha de la especie se visualizan las islas y el mar en
blanco y al pulsar para acceder a la información cartográfica no muestra el mensaje “la
especie no dispone de datos espaciales para este filtro”
Ejemplos de distribución de especies con los niveles de precisión:
Nivel 1
32
Nivel 2
Nivel 3
Nivel 4
Nivel 5
33
Sobre la combinación de niveles de precisión
Se han establecido combinaciones de niveles de precisión dentro de una misma localidad. Bajo
el criterio del supervisor científico, se eleva el nivel de precisión de algunas de las cuadrículas
de una localidad específica, pese a que la localidad indicada en la publicación se encuentra
reflejada de manera ambigua o poco exacta. Los niveles combinados asignados a un dato de
un mismo documento no deben ser consecutivos necesariamente y no requieren de una
referencia de experto.
Sobre las citas directas e indirectas
Se considera la cita de un taxón en una localidad es directa cuando en el documento aparece
asociada la fecha a la cita. Hay muchos casos en el que las citas son indirectas, cuando en un
documento se cita a otro autor que es el verdadero responsable de las mismas, sin citarlo
expresamente, o citándolo de tal forma que no es posible rastrear con facilidad la fecha o la
fuente del dato. En estos casos consideramos estas citas como si fuera directa,
responsabilizando a dicho autor del documento como responsable de todos los datos que
recoge en su artículo.
Este planteamiento implica que la revisión de un artículo obligue, en cuanto a las localidades
citadas, a revisar otros artículos más antiguos cuando se incluyan referencias de otros autores.
Así se evita registrar datos provenientes de citas indirectas sin ser comprobados siempre y
cuando ello fuera posible.
Ejemplos:
1. Bohn (1996), cita “…encontré Calathus tenerifensis en las cumbres de Güímar, pero
Phillip (1989) ya lo había capturado antes en el volcán de Fasnia”. La referencia Bohn
(1996) es una cita directa en cuanto a las Cumbres de Güímar, pero indirecta en
cuanto al volcán de Fasnia, en consecuencia, para registrar este último dato habría que
saltar al artículo de Phillip (1989) y archivarlo como un dato de este último autor.
2. Smith (1994), cita “…encontré Lotus berthelotii en la cueva Grande, en el mismo
lugar donde Webb colectó hace unos años Adiantum perezi”. La referencia de
Adiantum es indirecta, pero imposible de comprobar ya que no alude a ningún artículo
bibliográfico. En este caso se registra como si fuera un dato de Smith (1994)
3. Miller (1994), cita “…encontré Lotus berthelotii en la cueva Grande, en el mismo
lugar donde Webb (1981) colectó hace unos años Adiantum perezi”. La referencia de
Adiantum es comprobable, de modo que sólo se registrará cuando se analice el
documento de Webb (1981).
4. Pérez (1994) cita “…encontre Pericallis canariensis, que suele acompañarse de
especies como Ocydromus tenerifensis y Genista ruderalis”. Los datos de Ocydromus y
Genista no son citas formales, de modo que no se registran.
5. En el caso que un documento cite una especie con localidades sin fecha (por ejmplo:
en fechas pasadas, en otras épocas, o que la localidad no tenga fecha), sin posibilidad
de rastrear en la bibliografía, se considera de forma general que la fecha de la cita es la
del documento donde se recogen, aunque sepamos que es posterior, ya que si no el
dato se perdería.
34
c.2. Confianza
Cuando se registra una localidad se determina cuántas cuadrículas ocupa el topónimo citado y
se asigna un nivel de confianza, como grado de validez del dato.

Datos seguros: Es el nivel asignado mayoritariamente, avalado por los documentos y
validado por el supervisor científico.

Datos dudosos: Es nivel asignado cuando existen dudas de la validez del dato
extraído del documento avalado por el supervisor científico. Se aplica cuando:

-
Cuando existen varios topónimos con el mismo nombre, en una misma isla o
en varias, y no se puede precisar a cuál de ellos se refiere el documento.
-
Cuando la situación de una localidad dada no está clara que corresponda a
una isla determinada.
-
Cuando el nombre del topónimo está mal escrito y no se puede establecer con
claridad a qué lugar se refiere el autor.
-
También corresponde a datos de nidificación no constatados pero los indicios
de su presencia en la isla hacen pensar que su nidificación es posible.
Datos equívocos: Es el nivel menos asignado en la base de datos y se usa cuando
una especie ha sido citada en una localidad y hay muchas probabilidades de que sea
falso.
Sobre la representación de los datos espaciales de la precisión y la confianza
Cuando en una misma cuadrícula y para el mismo rango de años (décadas) coinciden datos
con diferentes niveles de precisión y confianza, las prioridades se representación en la
cartografía se visualizan según la siguiente secuencia:
S1>S2>D1>D2>E1>E2>S3>D3>E3>S4>D4>E4
Donde S, D y E representan los niveles de confianza “seguro”, “dudoso” y “equívoco” y los
números 1, 2, 3 y 4 representan los niveles de precisión
El análisis de prioridades se ejecuta con independencia del tamaño de las celdas, de tal forma
que cuando se superponen una o más celdas de 500 y una de 5.000 se sigue la regla anterior y
en el caso de que la/s celda/s de 500 sea prioritaria entonces la de 5000 se divide en celdas de
500 y cada una de ellas se representará según las prioridades.
35
Sobre el desplazamiento entre la cartografía militar y REGCAN.
Cuando un documento da una coordenada UTM hay que saber si éstas están referidas a la
cartografía militar o la cartografía desarrollada por GRAFCAN, S.A.U,. Ambas cartografías no
coinciden sino que existe un desplazamiento. En la Figura 17., se observa en verde el
entramado de cuadrículas de 1000 según REGCAN95, mientras que en marrón se muestra la
cartografía militar. Si la cita es una cuadrícula de 1.000 m según la cartografía REGCAN 95 se
registran las cuatro cuadrículas azules. Sin embargo, si la coordenada facilitada fuera según la
cartografía militar, se registran además las cuadrículas adyacentes al desplazamiento (Figura
17, cinco cuadrículas verde transparente).
Figura 17. Representación cartográfica de una cuadrícula de 1.000
metros según cartografía REGCAN 95 (malla verde) y según
cartografía militar (malla marrón).
2.2.11. Mapa resumen de la especie
El minimapa de la ficha de especie permite visualizar la distribución del taxón a nivel insular y
en las aguas del Archipiélago.
Si consultamos un taxón que tiene una o más subespecies, el mapa resumen será el
correspondiente a la suma de la distribución conocida de todas y cada una de sus subespecies.
Se indica en la parte superior del minimapa el número de subespecies en color rojo.
Figura 18. Minimapa de una especie con subespecies distribuidas en Canarias.
Mapa de las islas en verde
Cuando las islas se visualizan en color verde, indica que son especies terrestres y tienen
distribución georreferenciada en cada una de las islas coloreadas. Las islas en blanco
significan que la especie no tiene distribución conocida en ellas.
36
Figura 19. Minimapa de una especie terrestre con distribuidas en Canarias.
Mapa de las islas en azul
Cuando las islas se visualizan en color azul, indica que son especies marinas y tienen
distribución georreferenciada en el territorio costero o marino hasta los 200 m de batimetría,
considerado como el límite de la plataforma insular. Las islas en blanco significan que la
especie no tiene distribución conocida en ellas.
Figura 20. Minimapa de una especie marina costera con distribuidas en Canarias .
Mapa del mar en azul
Cuando el entorno de las islas aparece en azul indica que son especies marinas pero que su
distribución no está vinculado al ámbito insular, es decir, que la información conocida de
distribución de la especie está ubicada fuera de los límites de 200 m de batimetría, considerado
como plataforma insular.
37
Figura 21. Minimapa de una especie marina pelágica con distribuidas en Canarias.
Mapa del mar e islas en blanco
Cuando las islas y su entorno aparecen en color blanco indica que son especies marinas o
terrestres que han sido citadas en las Islas sin tener más información, se corresponde con el
nivel 5 de precisión, es decir, conocida para “Canarias”.
Figura 22. Minimapa de una especie citada en Canarias sin más información.
Pulsando el botón
la aplicación permite consultar todos los datos de
distribución conocida y registrada de la especie consultada. La información se representa en
cuadrículas de 500 x 500 m o de 5000 x 5000 y se corresponde con datos registrados desde la
vista de los primeros naturalistas que llegan a las islas hasta la actualidad.
Se puede establecer un filtro previo de búsqueda por una fecha concreta de observación de la
especie, utilizando el menú desplegable.
Figura 23. Menú desplegable para la selección de año de la cita.
38
Todas: la consulta se filtra con la totalidad de las citas conocidas y registradas de la especie a
lo largo de la historia, representada en un sólo mapa.
Mayor que: la consulta se filtra por un año concreto y el resultado es un mapa de la
información conocida y registrada de la especie a partir del año seleccionado (sin incluirlo), en
orden ascendente, representada en un sólo mapa.
Menor que: la consulta se filtra por un año concreto y el resultado es un mapa de la
información conocida y registrada de la especie a partir del año seleccionado (sin incluirlo), en
orden descendente, representada en un sólo mapa.
Igual al: la consulta se filtra por un año concreto y el resultado es un mapa de la información
conocida y registrada de la especie en el año seleccionado representada en un sólo mapa.
Entre: la consulta se filtra por un intervalo de años concreto y el resultado es un mapa de la
información conocida y registrada de la especie en ese intervalo, incluyendo ambos años
seleccionado, representada en un sólo mapa.
2.2.12. Consulta de distribución de una especie.
Al pulsar sobre el botón de “Distribución” en la página de Consulta de especie, se accede a un
visor que permite visualizar la información de distribución de la especie.
Figura 24.Visor de distribución de la especie.
A esta pantalla también se puede acceder directamente mediante una url del tipo siguiente
donde el código final indica el código de la especie a visualizar:
http://www.biodiversidadcanarias.es/atlantis/analisis/visor.jsf?especieCode=A01275
39
Figura. Visor de distribución de la especie con url de acceso directo por código.
Mediante el botón situado en la parte superior derecha “Visor avanzado”, se puede acceder a
otro visor con mayor funcionalidad para el análisis de la información.
2.2.12.1. Visor simple.
Este visor nos permite de forma sencilla ver la distribución geográfica de la especie, niveles de
precisión y confianza de las celdas que se visualizan, utilización de capas cartográficas
(Espacios Naturales Protegidos, ortofotos, curvas de nivel, etc.) e información de capa
geográficas.
Panel de capas.
El panel de capas está situado a la derecha del mapa. Este panel permite gestionar las capas
que aparecen en el mapa, su visibilidad y orden.
40
Figura 25. Panel de capas.
El panel de capas se puede ocultar mediante el enlace situado debajo que indica “Ocultar
capas”.
El panel se divide en dos pestañas:

Capas activas: esta pestaña muestra las capas existentes en el mapa y el orden de
visualización. Por defecto aparecen tres capas resultado de la consulta: capa de presencia
de la especie, capa de extinción de la especie y capa de varamiento de la especie. En el
caso de que no hubiera resultados de cualquiera de ellas, no tendrían datos asociados
cuando se visualiza.

Capas disponibles: esta pestaña muestra las capas que el usuario puede seleccionar del
directorio disponible en el Banco de Datos para que se muestren como parte de su
consulta, incorporándose al listado de capas activas. Si el usuario no está autentificado,
solo verá las capas públicas disponibles. Pulsando sobre el nombre de la capa se puede
añadir o eliminar la capa del mapa.
41
La pestaña de las capas activas permite seleccionar la capa sobre la que se van a realizar las
operaciones y se marcará en negrita en el panel. La pestaña permite realizar varias
operaciones sobre las capas:

Eliminar: elimina del mapa la capa seleccionada

Ocultar: oculta en el mapa la capa seleccionada

Visualizar: muestra en el mapa la capa seleccionada

Baja la capa un nivel: baja la capa seleccionada un nivel en la pila de visualización de
capas del mapa

Sube la capa un nivel: sube la capa seleccionada un nivel en la pila de visualización de
capas del mapa
Barra de herramientas.
La barra de herramientas permite las siguientes acciones sobre la capa seleccionada:
Figura 25. Barra de herramientas.
Desplazar mapa: permite mover el mapa al pulsar el botón izquierdo del ratón
y desplazar. La rueda del ratón permite hacer zoom también.
Zoom: el botón con el símbolo + permite realizar zoom sobre una zona al
pulsar con el botón izquierdo del ratón. El botón con el símbolo – permite
realizar un alejamiento del mapa al pulsar el icono sobre la zona visible en ese
momento.
Seleccionar celdas: permite seleccionar celdas sobre el mapa con el tamaño
indicado por el icono Tamaño de la rejilla. El botón de eliminar celdas, elimina
todas las celdas seleccionadas en el mapa.
Pulsando la flecha verde sobre cualquiera de las cuadrículas que se muestran
en la consulta el usuario puede obtener información directa de ella de la
precisión, confianza, endemicidad, extinción, etc. (ver círculo rojo).
42
Capa activa sobre la que se ejecuta la consulta
Figura 26. Selección de cuadrícula de distribución de una especie.
Una vez tengamos seleccionada la celda y teniendo siempre la capa que queremos consultar
activa (resaltada en negrita), pulsado el botón derecho del ratón se habilita una pantalla que da
información de los documentos que citan esa cuadricula.
Figura 27. Información asociada a la cuadrícula de la especie seleccionada.
Figura 28. Selección de la información asociada a la cuadrícula para su exportación.
43
Se pueden seleccionar los campos de esta pantalla y copiar en un procesador de texto o en
una hoja de cálculo, transformándose en una tabla en ambos casos.
Tamaño rejilla: elije el tamaño de las celdas a seleccionar.
Vista total: permite adecuar el mapa a una vista general de toda la región.
Seleccionar todas las celdas: permite seleccionar de una vez todas las celdas de la
distribución de la especie.
Exportar capa: abre otra ventana donde el usuario puede solicitar la exportación de la
capa seleccionada a los formatos shape, kml o texto. Al terminar la exportación, la
aplicación envía un correo electrónico con la información de la exportación. En el
apartado del visor avanzado, se puede leer una descripción más detallada.
Capa shape: permite añadir una nueva capa al conjunto de capas disponibles de
cartografía. Este icono abre una nueva ventana donde se debe introducir datos de la
nueva capa y un fichero zip con la información geográfica de la capa. En el apartado
del visor avanzado, se puede leer una descripción más detallada.
Información de capas: permite obtener datos de todas capas que se están
visualizando en este momento en el mapa. Al seleccionar el icono y pulsar con el botón
izquierdo del ratón sobre una posición, se marca dicha posición con una marca verde y
se abre una nueva ventana. En esa ventana aparecen todas las capas añadidas al
mapa en ese momento y seleccionando cada una de ellas, se puede visualizar
información para el punto seleccionado. En el apartado del visor avanzado, se puede
leer una descripción más detallada.
Otra funcionalidad adicional se da si tenemos seleccionada la capa de distribución de la
especie y seleccionamos un conjunto de celdas, al pulsar sobre el botón derecho del ratón, se
abre una nueva ventana con información de los documentos que citan esas cuadrículas.
Barra de estado
Figura 26. Barra de estado.
La barra de estado muestra información sobre el mapa, celdas seleccionadas y capa
seleccionada.

Escala: muestra la escala actual que tiene el visor.

Coordenadas: muestra las coordenadas en las que se encuentra el puntero del ratón.

Celdas: nos indica el número total de celdas de la capa seleccionada. Las capas
externas no tienen celdas de información por lo que su valor siempre es cero.

Celdas seleccionadas: muestra la cantidad de celdas seleccionadas y el área que
ocupan.
44
Cuando se seleccione una celda, se muestra una barra adicional con información de la celda.
Figura 27. Barra de estado adicional.
La información que se ofrece indica la nidificación, extinción, varamiento, confianza, precisión y
tamaño de la celda de la que se ha obtenido la información.
2.2.12.2. Visor avanzado.
Barra de Herramientas.
En esta pantalla de distribución de especie se pueden realizar análisis de información del
taxón. Como pueden ser: consultas bibliográficas de las citas, niveles de precisión y confianza
de las celdas que se visualizan, utilización de capas cartográficas (Espacios Naturales
Protegidos, ortofotos, curvas de nivel, etc.) que nos ayuden a profundizar y comprender la
consulta.
Figura 29. Pantalla de consulta de distribución del taxón seleccionado.
Barra de estado
La barra de estado muestra alguna información relativa al mapa y capa seleccionada:

Escala: muestra la escala actual que tiene el visor.

Coordenadas: muestra las coordenadas en las que se encuentra el puntero del ratón.
45

Celdas: nos indica el número total de celdas de la capa seleccionada. Las capas
externas no tienen celdas de información por lo que su valor siempre es cero.

Área: muestra el área resultado de una operación de cálculo de área.

Perímetro: muestra la distancia tras una operación de cálculo de distancia y también el
perímetro del polígono que nos permite calcular el área.

Celdas seleccionadas: muestra la cantidad de celdas seleccionadas y el área que
ocupan.
Desplazamiento en el mapa. Pulsando este icono y colocándonos sobre la capa que
estamos visualizando aparece un icono en forma de mano que manteniéndolo pulsado
y arrastrándolo nos permite desplazarnos por la pantalla.
Zoom. Pulsando estos iconos permite aumentar o disminuir la escala de trabajo del
mapa, ampliando la imagen de la capa que estamos visualizando. También podemos
hacer un recuadro sobre una zona concreta aumentando su escala de una forma más
precisa.
Selección de cuadrículas en una capa. Pulsando la flecha verde sobre cualquiera de
las cuadrículas que se muestran en la consulta el usuario puede obtener información
directa de ella de la precisión, confianza, endemicidad, extinción, etc. (ver círculo rojo).
El comportamiento es el mismo que en el caso del visor simple.
Tamaño de la rejilla de selección. Permite seleccionar y cambiar el tamaño de las
cuadrículas para hacer una selección sobre el mapa que estamos visualizando.
(cuadrícula de 500 x 500 m y 5000 x 5000 m).
Medir líneas. Permite medir líneas. Con el puntero del ratón nos posicionamos donde
comienza la longitud a medir, realizar un click, a continuación arrastramos el ratón y
con doble click finalizamos la medición. El valor de la longitud medida aparece en la
parte inferior de la pantalla (ver recuadro).
46
Figura 28. Información asociada a la distancia medida linealmente.
Medir áreas. Permite medir polígonos y obtener su área. Con el puntero del ratón nos
posicionamos donde comienza el polígono a medir, realizar un click, a continuación
arrastramos el ratón deteniéndonos con un click en cada uno de los vértices que
definen el polígono y con doble click finalizamos la medición. El valor del área medida
aparece en la parte inferior de la pantalla (ver recuadro).
Figura 29. Información asociada al área medida.
Vista total. Permite hacer una visualización de todas las islas con un solo click.
Selección de todas las celdas. Permite seleccionar con un solo click todas las
cuadrículas que están representadas en el mapa. En la parte inferior de la pantalla vemos el
número de celdas seleccionadas y su área en Km 2
Figura 30. Información asociada al número de celdas seleccionadas.
47
Selección de UTM y coordenadas geográficas. Permite ir a una pantalla donde el
usuario puede buscar una UTM o una coordenada geográfica y localizarla en el
mapa. Pulsando el icono se habilita la pantalla.
En ambos casos el usuario tiene que rellenar los campos
correspondientes UTM o geográficas. Si se pulsa el icono:
con las coordenadas
El visualizador se posiciona en las coordenadas indicadas sin seleccionarla.
Se selecciona con el contorno verde la cuadrícula de las coordenadas
indicadas.
Permite convertir coordenadas geográficas en UTM.
En el caso de las coordenadas geográficas en Atlantis 3.3 no se puede especificar si los grados
son grados Norte o grados Sur, o si son grados Este o grados Oeste, por lo que se hace
necesario en la casilla de los grados, especificar el signo de los mismos. Es decir:
- positivo para latitudes Norte y negativo para latitudes Sur
- positivo para longitudes Este y negativo para longitudes Oeste
Imprimir. Permite imprimir la información cartográfica de la especie desde la pantalla
consulta de distribución.
48
Imprimir
Figura 31. Pantalla de consulta de distribución de una especie.
Una vez seleccionado el botón impresión se abre una pantalla donde el usuario puede elegir y
configurar los elementos de la leyenda del mapa que va a imprimir. Utilizando todos
desplegables se pueden cambiar los logos, se pueden poner títulos y subtítulos, etc.
En la leyenda a figurarán todas las capas que el usuario haya seleccionado previamente. Hay
que marcar el directorio matriz (por ejemplo: Consulta de especies presencia) y luego todas las
casillas de los grados de colores para que se visualicen en la caja de la leyenda del mapa.
Figura 32. Pantalla de edición de la leyenda del mapa de distribución de la especie.
Una vez configurado por el usuario y pulsando el botón imprimir, se genera un archivo pdf (que
podremos guardar) con el formato que se ve en la imagen.
49
Figura 33. Pantalla del diseño de impresión del mapa configurado.
Exportar capa. Permite exportar la capa que el usuario está visualizando en formato
shp. o kml. Al pulsar el icono se habilita la pantalla de exportación, donde hay que
cumplimentar un email donde el usuario recibirá el archivo donde el remitente es
atlantis@grafcan.com., con un mensaje de confirmación del envío, y tiempo de
duración de la exportación. El usuario recibirá un archivo zip., que contiene los archivos
(.dbf. shx ,shp,) correspondientes al formato shape y en su caso un archivo kmz, si ha
exportado la capa en este formato.
A.
B.
Figura 34. A. Pantalla de exportación de capas. B. Mensaje informativo del proceso de exportación.
Una vez se ha exportado la capa el usuario puede gestionarla en un Sistema de Información
Geográfico, de tal manera que se pueda obtener el máximo de información del archivo
generado.
50
Se debe hacer en varios pasos:
-
en primer lugar se debe de establecer una relación de tablas entre la tabla del archivo
shp y la tabla del archivo XX_taxones.dbf (siendo XX el nombre que el usuario le haya
asignado a la capa).
-
Una vez están transferidos los datos (nombre de los taxones, etc.) a la tabla del archivo
shp se hará otra nueva relación con el archivo XX_documentos.dbf.
Siguiendo estos pasos obtendremos una tabla donde se relacionan los siguientes datos: código
de la celda, nombre de los taxones, documento donde se citan, año de la publicación, año de la
cita, niveles de precisión y confianza, etc.
Capa externa. Permite incorporar una capa externa a la selección de capas existentes.
Es una petición GetMap, donde el usuario debe completar la URL del servicio que quiere
incorporar de la forma que se explica más adelante:
Campo donde incorporar la URL
Figura 35. Pantalla para incorporar una nueva capa externa.
El usuario debe copiar la URL de una capa existente en las capas disponibles y modificar los
parámetros específicos de cada servicio: LAYERS, FORMAT.
http://idecan2.grafcan.es/ServicioWMS/Cultivos?REQUEST=GetMap&SERVICE=WMS&VERSI
ON=1.1.1&SRS=EPSG:32628&LAYERS=WMS_ZEC&STYLES=&FORMAT=image/png&BBOX
=-16.875,28.304380682962783,15.46875,29.53522956294847&WIDTH=256&HEIGHT=256&reaspect=false&BGCOLOR=0xFF
FFFF&TRANSPARENT=TRUE
Ejemplo: Mapa de cultivos disponible en la IDE de Grafcan. Utilizamos la URL
http://idecan2.grafcan.es/ServicioWMS/Cultivos?request=getcapabilities&service=wms.
Aparece mucha información, desde los propietarios hasta la relación de capas que forman el
servicio.
La configuración de una capa externa (petición GetMap a un servicio WMS) es como sigue:
URL
del
servicio
WMS:
en
el
caso
http://idecan2.grafcan.es/ServicioWMS/Cultivos?
del
Mapa
de
Cultivos,
sería
1. Parámetros de la petición:
o REQUEST=GetMap
 Tipo de petición: GetMap (imagen de mapa); GetFeatureInfo
(información de un punto); GetLegendGraphic (recuperar la leyenda
del servicio); GetCapabilities (solicita información del servicio: de qué
51
o
o
o
o
o
o
o
o
capas dispone; si tiene leyenda o no; metadatos; sistemas de
referencia válidos;...)
SERVICE=WMS
 Especifica que nos estamos dirigiendo a un servicio WMS
VERSION=1.1.1
 Versión del servidor WMS
SRS=EPSG:32628
 Sistema de referencia en el que se solicita la imagen del servicio (viene
especificado en la respuesta de GetCapabilities). En este caso, 32628
es UTM para Canarias
LAYERS=WMS_MapaCultivos
 Nombre de la capa del servicio WMS de la que deseamos la imagen.
Puede ser una de las capas independientes del servicio o la capa
global, que engloba a todas las capas del servicio.
FORMAT=image/png
 Formato de la imagen devuelta: png para vectorial; jpeg para raster
(especificado en GetCapabilities)
BBOX=...
 Zona solicitada del territorio
WIDTH=256, HEIGHT=256
 Dimensiones de la imagen (Atlantis las modifica a su conveniencia,
según la configuración)
TRANSPARENT=TRUE
 Ha de estar a TRUE para capas vectoriales con transparencia, para
que se vea lo que hay debajo de ellas.
Para saber las capacidades y características de un servicio WMS, se debe poner la dirección
del servicio WMS en la caja de direcciones del navegador con los siguientes parámetros:
http://......?request=getcapabilities&service=wms
Capa shape. Permite al usuario validado incorporar una capa en formato shape y
visualizarla en las pantallas de cartografía ya que se incorpora al directorio de capas
disponibles. Para incorporar una nueva capa shape debe estar comprimido en formato
ZIP, debe de incluir los componentes del formato shape (.shp., .shx., .dbf., .sbn) y
debe estar en la proyección WGS_1984_UTM_Zone_28N. El nombre del archivo debe
tener como máximo 8 caracteres, sin acentos, ni otro tipo de símbolos que den
problemas de incompatibilidad a la hora de incorporarlo al Banco de Datos.
52
Figura 36. Pantalla para incorporar una nueva capa shape.
El usuario debe rellenar los campos correspondientes, ubicar la capa shape (en formato ZIP)
en una subcarpeta, previamente definida (ver creación de carpetas y subcarpetas), seleccionar
el archivo ZIP y pulsar guardar. La capa quedará incorporada en el directorio de capas
disponibles.
Figura 37. Visualización y ubicación de una nueva capa shape.
Cuando falta alguno de los componentes del archivo ZIP la aplicación advierte al usuario de
cual es el problema. Ejemplo:
Figura 38. Visualización de posibles errores en los atributos de los ficheros shape a incorporar.
Información de capas. Permite al usuario obtener información de la capa que está
visualizando. Con el ratón se pulsa el icono, se posiciona en la capa donde se quiere
obtener datos y se hace click con el ratón. Se habilita una pantalla de información de
esa capa, puede ser de distribución de especie o de todas aquellas que están
disponible sen el directorio de capas disponible.
53
Pulsar sobre la capa que se quiere obtener información
Figura 39. Información sobre una capa de distribución.
Pulsar sobre la capa que se quiere obtener información
Figura 40. Información sobre una capa de disponible: Red de Espacios Naturales Protegidos.
Localidades. Permite acceder al administrador de localidades una pantalla donde el
usuario validado puede crear y buscar una localidad o crear un ámbito de análisis. (ver
Generalidades. Localidades).
Búsqueda de Topónimos. Permite localizar topónimos de forma genérica y aproximarnos
en la pantalla cartográfica. Funciona con una base de datos asociada de toponimias y callejero.
Pulsando el icono se habilita la pantalla de búsqueda, seleccionando el que se quiere ubicar
nos envía a la pantalla cartográfica con su ubicación resaltada.
54
Figura 41. Información de Topónimos.
Confianza y precisión. Permite la representación de cuadrículas de distribución
combinando las opciones de precisión y confianza (ver criterios geográficos)
Confianza. Permite la representación de la confianza del dato. (ver criterios geográficos)
Precisión. Permite la representación de la precisión del dato. (ver criterios geográficos)
Búsqueda de topónimos y capas.
Tanto en la pantalla de la consulta de distribución de especies, como en el contenido de los
documentos, así como, desde la consulta de análisis el usuario tiene la posibilidad de gestionar
búsquedas de topónimos existentes creados en el Banco de Datos y su visualización,
incorporación, etc., de las capas activas y capas disponibles.
En la barra de herramientas de las pantallas donde se muestra cartografía de especies se
muestra siempre el nombre de la especie que estamos consultando (círculo rojo) y los
controles donde podemos visualizar las islas y los topónimos que están creados en el BDBC
(círculo verde).
55
Nombre de la especie de la consulta de
distribución
Elemento zonal (isla) y listado de localidades registradas
Figura 42. Menú desplegable
de información de
Topónimos.
El Menú desplegable permite al usuario hacer búsquedas de topónimos registrados en el
Banco de Datos (deben ser tomados como orientativos). Están ordenados alfabéticamente, el
botón ir nos ejecuta la selección, mostrándonos las celdas correspondientes.
Figura 43. Pantalla de selección de Topónimos.
a. Si se elige “Aceptar” se mostraran las celdas que se corresponden con la localidad
seleccionada, que se añadirá a otras que pudiéramos tener seleccionadas. Si no es
así, se mostrarán sólo las de la localidad seleccionada.
b. Si se elige “Cancelar” se mostrarán sólo las celdas de la localidad seleccionada. Si
tuviésemos otras selecciones en pantalla se anulará la visualización de éstas.
56
A
B
Figura 44. Directorio de capas disponibles en pantalla. A. Directorio de capas de la consulta realizada. B. Directorio de
capas disponibles en la Base de Datos.
A
Capas activas: capas de consulta realizada por el usuario, junto con las que haya
seleccionado del directorio de capas disponibles. Por defecto aparecen tres capas resultado de
la consulta: capa de presencia de la especie, capa de extinción de la especie y capa de
varamiento de la especie. En el caso de que no hubiera resultados de cualquiera de ellas, no
tendrían datos asociados cuando se visualiza. Además la capa base de localidades, que se
corresponde con la línea de costa de cada una de las islas y sus términos municipales.
B
Capas disponibles: capas que el usuario puede seleccionar del directorio disponible en
el Banco de Datos para que se muestren como parte de su consulta, incorporándose al listado
de capas activas. También se visualizan las capas que cada usuario ha creado (ver crear capa
de usuario).
Eliminar. Permite eliminar una capa seleccionada del mapa.
Visualizar. Permite mostrar una capa seleccionada del mapa que previamente se ha
ocultado.
Ocultar. Permite ocultar una capa seleccionada del mapa.
Filtro de consulta. Permite mostrar el filtro con el que se ha generado el mapa.
Ordenar. Permite bajar la capa seleccionada un nivel de visualización.
57
Ordenar. Permite subir la capa seleccionada un nivel de visualización.
Permite eliminar temporalmente la visualización de todas las capas.
Permite mostrar el directorio de capas que se eliminó temporalmente.
Visualización de tramas y colores de las capas. Permite modificar la paleta de colores y
tramas diseñadas en el Banco de Datos según los criterios de los usuarios.
Modificación de tramas y colores. Consulta de especie
Figura 45. Tramas de colores de representación de los niveles de precisión y confianza.
Seleccionando uno de los colores o tramas que queremos modificar se habilita una opción de
estilo donde podemos seleccionar el color del entramado, el color del borde, así como el tipo de
entramado, para modificarlo.
58
Modificación de tramas y colores. Mapas de riqueza
Figura 46. Tramas de colores de representación de una capa de riqueza.
Seleccionando uno de los colores o tramas que queremos modificar se habilita una opción de
estilo donde podemos seleccionar el color del entramado, el color del borde, así como el tipo de
entramado, para modificarlo.
59
2.3. CONSULTA DE ESPECIE: Taxonomía
En la pantalla de búsqueda de especies la aplicación permite emitir e imprimir listados de
categorías taxonómicas. Se pueden seleccionar búsquedas en una categoría taxonómica
concreta o bien el usuario puede seleccionar varios rangos definidos entre un nivel inicial y un
nivel final. También se pueden elaborar listados más específicos (listado parcial), en los casos
que sólo interese mostrar la taxonomía de un grupo.
Figura 47. Pantalla de Taxonomía.
Cada uno de los resultados se visualizan pulsando el botón y se obtiene el informe resultado de
la consulta, que se puede exportar, guardar, copiar, transformar a pdf, etc.
Figura 48. Vista previa de la búsqueda de los reinos registrados en el Banco de Datos.
60
En el caso de que el usuario quiera seleccionar un informe taxonómico más detallado y
personalizado, pulsando la opción listados puede establecer los filtros de su consulta.
Se rellenan los campos correspondientes y se
seleccionan los rangos taxonómicos con los que
generará el listado taxonómico, siguiendo la
estructura jerárquica.
A
B
Figura 49. Pantalla para seleccionar el tipo de informe
taxonómico que se consulta. A. Listado taxonómico completo. B. Listado taxonómico parcial.
Figura 50. Informe del Listado taxonómico en formato pdf.
61
2.3.1. Imprimir informe taxonómico
Hacemos una consulta en la opción taxonomía de la pantalla de búsqueda de especies y en el
botón
nos habilita la opción de imprimir el resultado de nuestra consulta. Además
permite archivarlo o guardar los datos como pdf.
Figura 51. Pantalla de búsqueda desde informe taxonómico.
Figura 52. Pantalla de resultado del informe taxonómico elaborado.
Se genera un archivo pdf que el usuario puede guardar o bien imprimir
utilizando el menú que se activa con la generación del pdf.
62
3. ARCHIVO DOCUMENTAL
3.1. CONSULTA DE DOCUMENTOS. Generalidades
Figura 53. Menú principal. Selección de Archivo documental.
A través del botón ARCHIVO DOCUMENTAL, se accede a una serie de pantallas de búsqueda
relacionados con los documentos registrados en el Banco de Datos de Biodiversidad, que
disponen de información relativa a las especies silvestres marinas y terrestres que se
distribuyen en Canarias.
Figura 54. Filtros de búsqueda de documentos.
63
En esta pantalla se realizan búsquedas de documentos por código PELCRIN, por autores, por
Título (no es necesario el título completo), por año de la publicación, palabras clave, etc.
Figura 55. Filtros de búsqueda
de documentos por autores.
Si hacemos el filtro por autores (que figuran ordenados alfabéticamente por apellidos y a
continuación por iniciales de nombre) aparece el listado de documentos donde figure el autor
seleccionado.
Permite ordenar por cualquiera de estos campos. En la columna donde
figure la flecha verde indica que está ordenada la pantalla por este campo.
En este caso por la columna año.
Contador del número de documentos
encontrados con los filtros de la consulta
Contador del número de páginas que muestran el listado de
documentos encontrados con los filtros de la consulta
Figura 56. Listado de documentos resultado de la búsqueda por autor.
64
Pulsando sobre cualquiera de los registros se abre la pantalla del documento seleccionado, con
lo que el usuario puede consultar toda la información que desee registrada en ese documento
(ver consulta de documento).
3.1.1. Criterios en el registro de documentos en el BDBC

La información registrada en el Banco de Datos está avalada con un documento
escrito, validada por los supervisores científicos y que queda archivada en el Archivo
Documental.

Los documentos registrados son trabajos publicados, informes inéditos o documentos
creados exclusivamente para introducir información en el Banco de Datos (Referencias
de experto, Notas de Incidencia, etc.).

Se omiten datos redundantes, es decir, no se registra la misma localidad y año de la
colecta, referida a más de un documento, por lo que el Banco de Datos no es una
base de datos bibliográfica de todas las publicaciones de la biota de Canarias.

El proceso de volcado de la información es muy riguroso reproduciendo al máximo la
información contenida en el documento original.

Los documentos registrados en el Banco de Datos y clasificados según el código
PELCRIN (código interno del BDBC) están depositados en el archivo documental que
se encuentra en el Servicio de Biodiversidad de la Dirección General de Protección de
la Naturaleza.

En el Banco de Datos existen una serie de documentos que definen categorías como:
niveles de protección, estatus de conservación, categorías de hábitat y categorías de
origen, para su asignación en cada uno de ellos. Así los tipos de documentos que
definen son:
o
Niveles de protección: normas jurídicas regionales, nacionales o
internacionales que sean de aplicación. Por ejemplo, el Catálogo canario de
especies protegidas define qué es una especie “en peligro de extinción”.
o
Estatus de conservación: documentos que no tienen un carácter normativo y
expresan la opinión de algún organismo o institución. Por ejemplo, la lista roja
de la UICN.
Categoría de hábitat: documento que agrupa los diferentes hábitats presentes
en Canarias. Al registrar una especie se le asigna una o varias categorías.
Actualmente este documento está en revisión.
Categoría de origen: documento creado para el Banco de Datos, que define la
diferente origen/comportamiento que pueden tener los taxones registrados en
Canarias.
o
o
65
3.2. CONSULTA DE DOCUMENTOS: Ficha de documentos
Cada uno de los documentos registrados dispone de una ficha donde se recogen todos los
datos bibliográficos: título, autor, páginas, año de la publicación, palabras claves, así como
notas del documento donde se compilan aclaraciones de todo tipo relacionadas con la
información de las especies que se citan o de otra naturaleza, como topónimos, localidades,
etc.
Tipo de documento: Publicaciones, Estudios no
publicados, Legislación, Referencias de Experto, Notas
de Incidencia,etc.
Datos bibliográficos de cada tipo de documento. El
campo nota, se utiliza para hacer todo tipo de
aclaraciones de taxonomía, localidades,
comunicaciones personales, supervisión, etc, que
ayuden a comprender la información registrada.
Datos de gestión del documento, figura el operador de
carga, el supervisor científico, si está terminado, etc,
Figura 57. Generalidades de documentos
En el BDBC se registran cinco tipos de documentos diferentes, en la pantalla de búsqueda
podemos filtrar por uno o más campos según las necesidades del usuario (ver generalidades).
Herramienta
Código
Descripción
Código PELCRIN asignado al documento. Todos los documentos incluidos en la
base tienen asociados un código que permite identificarlos.
Páginas documento
Nº de fotocopias que tiene la copia en papel que está disponible en el archivo
documental.
Año
Año de publicación del documento. En el caso de informes inéditos, referencias de
experto etc, es la fecha del informe.
Título
Título del documento.
Tipo de publicación
Libro, capítulo de libro, cartografía, Póster editado, trabajo en revista, otros
Editorial
Editorial que publica el documento.
ISBN
Código de cada una de las publicaciones.
Autores
Autor/es del documento.
Notas
Aclaraciones del documento defecto de páginas del documento, errores
tipógráficos, localidades no consideradas, etc.
Especies citadas
Permite acceder al formulario de introducción de especies citadas en el
documento.
66
Palabras clave
Palabras clave del BDBC asociadas al documento.
Contenido del documento
Se registran toda la información recopilada en el documento, desde endemicidad,
imágenes, datos corológicos georrefernciados, etc.
Formato documento
Formato en papel del documento original.
Nivel de confianza
Nivel de confianza que se le atribuye al documento, validez de la información.
Taxón
Filtro utilizado en la carga de datos en el momento de introducir la información.
Gestión del documento
Datos de administración del documento: operador que ha gestionado el
documento; la fecha de inicio, de finalización de carga y de visto bueno del
supervisor; indicaciones de necesidad de revisión del documento, de documento
completo y de VºBº del supervisor.
Fecha nota
Fecha de la redacción de la nota de incidencia.
Texto
Campo donde se redacta el texto de la nota de incidencia.
Imprimir
Impresión de la ficha de cabecera del documento (ver impresión)
Volver
Retorno a la pantalla anterior
Referencia de experto
Documentos asociados
Listado de documentos relacionados con la referencia de experto para aclarar o
justificar algún contenido.
Estudio no publicado
Tipo de estudio
Informe, Memoria, Tesina, Tesis doctoral, otros.
Entidad que lo avala
Entidad que acredita el estudio, normalmente coincide con los redactores o la
empresa que contrata el estudio.
Nota de incidencia
Documentos asociados
Listado de documentos relacionados con la referencia de experto para aclarar o
justificar algún contenido.
Como parte integrante da cada pantalla de documento figura una sección donde se agrupa los
procedimientos de registro y validación científica de los datos, que incluye: fecha de inicio y
finalización del registro de información, operador de carga de los datos y el supervisor científico
que ha validado la información registrada. Estos datos están reflejados en la aplicación y en la
carátula impresa que está firmada por el operador encargado de registrarlo y por el supervisor
científico del grupo correspondiente, quién valida la información. Esta carátula forma parte del
documento y está archivada en el archivo documental del BDBC (Figura 59).
3.2.1. Publicaciones
Son documentos publicados como libros, publicaciones, trabajos en revista, etc.; en la pantalla
del trabajo se visualizan los datos bibliográficos incluidos en la pantalla de contenido del
documento. Se indica los datos de: Autor, año, título, editorial/revista, páginas, volumen,
número, ISSN/ISBN y número de páginas existentes en el archivo documental. Además existe
un campo adicional (notas), donde se incluyen algunas observaciones del documento, como
por ejemplo defecto de páginas del documento, errores tipógráficos, localidades no
consideradas, aclaraciones de especies no registradas, etc.
3.2.2. Referencias de experto
67
Son documentos creados dentro del Banco de Datos donde los especialistas consultados o los
supervisores científicos hacen aclaraciones o aportan información relevante de especies o
subespecies registradas. También se crean para registrar distribución de taxones o adición de
localidades, décadas, años asociados a especies o especies nuevas conocidas en el
Archipiélago y que no estén publicadas, etc. Tienen los contenidos propios de una publicación
y se deben citar siguiendo las normas de uso del Banco de Datos.
3.2.3. Notas de incidencias
Estos documentos creados expresamente para el banco de datos recogen aclaraciones
vinculadas con trabajos, especies, localidades etc., introducidas en el Banco de Datos y que
son necesarias para la comprensión y rigor de la información introducida.
3.2.4. Estudios no publicados
Son documentos no publicados: informes inéditos, tesis, tesinas, etc. En la pantalla de
contenido del documento se indican los datos principales del trabajo consultado: Autor, año,
título, entidad que avala el estudio, páginas, volumen, número, y número de páginas existentes
en el archivo documental. También existe, al igual que en resto de los estudios, un campo
adicional (notas), donde se han incluido algunas observaciones del documento, como por
ejemplo defecto de páginas del documento, errores tipógráficos, localidades no consideradas,
etc.
3.2.5. Palabras clave
Son términos identificadores que se asocian en número de uno o más a cada unos de los
documentos que se registran en el Banco de Datos. Las palabras clave, previamente
establecidas como criterios de carga del Banco de Datos, dan una idea aproximada de la
temática tratada en cada documento y son especialmente útiles a la hora de realizar
búsquedas.
BIOLOGÍA
Alimentación (Dieta)
Biotipos
Células y tejidos
Ciclo biológico
Fitoquímica
Fisionomía
Fisiología
Plagas
BIOGEOGRAFÍA
Biogeografía insular
Distribución fuera de Canarias
Hipótesis de poblamiento
Lugar de procedencia
CONSERVACIÓN
Acciones de conservación
Amenazas
Áreas protegidas
Beneficios ambientales
Economía
Evaluación de impacto
Extinción artificial
Estado de conservación
Fragmentación de hábitats
Fragmentación de poblaciones
Gestión de ecosistemas
Paisajes
Planificación de conservación
Prioridades de conservación
Procesos ecológicos
Seguimiento (monitoreo)
Símbolos
Translocaciones y reforzamientos
Turismo
DIBUJOS
Dibujos de la especie, subespecie
Dibujos de variedades
Dibujos del hábitat
Dibujos del microhábitat o del huésped
ECOLOGÍA
Caracterización ecológica
Comunidades
Dinámica de poblaciones
Diversidad
Fitosociología
Hábitats de especies, subespecies
Invasiones
Sucesión
Vegetación
ETOLOGÍA
Pautas de comportamiento
EVOLUCIÓN
Cambios adaptativos
Especiación
Híbridos
Morfología evolutiva
Radiación adaptativa
Taxones relacionados
FILOGENIA
Gradismo/Cladismo
Inmunotaxonomía
Relaciones evolutivas
Sistemática molecular
ADN
ARN
Mitocondrias
Secuenciación ADN,ARN,enzimática
GEOLOGÍA
Geomorfología
Historia geológica
Vulcanismo histórico o subhistórico
PALEONTOLOGÍA
Cambio de clima en Canarias
Descripción de yacimientos
Extinción natural
Fósiles y subfósiles
TAXONOMÍA
Correcciones taxonómicas
Descripción del taxon
Establecimiento de sinonimias
UTILIDAD
Aprovechamiento de recursos
Plagas
Plantas cultivadas
Sobreexplotación
Variedades domésticas
FOTOGRAFÍAS
Fotos del hábitat
Fotos del microhábitat o del huésped
Fotos del taxon
GENÉTICA
68
Manual de usuario - ATLANTIS 3.3
3.2.6. Imprimir carátula de documentos.
En todas las pantallas que tiene la aplicación referidas a tipos de documentos: publicación,
referencia de experto, nota de incidencia y estudio no publicado existe la opción imprimir. El
resultado es una carátula o ficha donde se recogen los datos bibliográficos y no el contenido
del mismo y que se adjunta a cada documento impreso, con la firma de cada uno de las
personas implicadas en su registro, para incorporarse al archivo
documental.
Figura 58. Pantalla de un documento.
documento
Figura
59.
Carátula
del
3.2.7. Especies citadas
En esta pantalla se visualizan las especies citadas en el documento registradas con el nombre
actual validado por los supervisores científicos. En el caso que se haya citado con un nombre
taxonómicamente no válido, se le asocia éste siempre como sinonimia. De esta manera el
usuario dispone del nombre actual así como, el nombre antiguo, pudiéndolo consultar en el
botón editar de esta pantalla.
Figura 60. Especies citadas en el documento.
69
Manual de usuario - ATLANTIS 3.3
En esta pantalla se visualiza la validez del taxón, así como la existencia de sinonimias
asociadas a la especie. En el caso de que el taxón disponga de sinonimias, se accede
pulsando en editar:
Nombre actual validado por el supervisor
científico de cada grupo taxonómico
Código del documento y autor que justifica el
cambio taxonómico.
Sinonimia del taxón seleccionado validado por el
supervisor científico de cada grupo taxonómico
Figura 61. Sub nómine de la especie citada en el documento.
Permite localizar especies dentro del listado de especies citadas del documento.
Permite exportar y archivar en formato excell el listado de las especies citadas en el documento.
3.2.8. Contenido del documento
Esta pantalla permite definir diferentes categorías (protección, hábitats etc., que establecerán
los administradores del sistema y los usuarios de carga) así como, asignar información de
todos los contenidos del documento:
- Niveles de protección en el caso de documentos normativos, nacionales o
internacionales.
- Estatus de conservación en el caso de libros rojos, listas UICN, etc. (actualmente sin
registrar).
- Categorías de hábitat, origen y endemicidad en función de los documentos creados
en el Banco de Datos que recogen su clasificación y definición.
- Descripción de la especie, actualmente sin registrar.
- Imágenes de la especie.
- Datos espaciales de los taxones registrados en el documento. Se accede al registro
en cuadrículas de 500 o 5000 m de las localidades, UTM, puntos o polígonos, etc que
están publicados en el documento, siguiendo los criterios de carga del Banco de Datos.
Cuando está activo el tick de verificación significa que es un documento que
otorga validez (siguiendo los criterios del BDBC) a los taxones que se incluyen
en el documento. Se ha creado un documento para cada grupo taxonómico
registrado en la base de datos.
Cuando están activos el tick de verificación significa que es un documento que
define cualquiera de las categorías que se incluyen en el documento.
(siguiendo los criterios del BDBC).
Cuando están activos el tick de verificación significa que es un documento que
registra cualquiera de las categorías que se incluyen en el documento
(siguiendo los criterios del BDBC) a los taxones que se incluyen en el
documento.
Figura 62. Contenido del documento.
70
Manual de usuario - ATLANTIS 3.3
a. Niveles de protección
Si está señalado el tick de esta opción la aplicación permite acceder a las especies citadas en
el documento, con las categorías de protección asociadas según el documento legal que esté
consultando el usuario.
Figura 63. Contenido del documento. Niveles de protección.
Pulsando sobre la especie que se
consulta se activa en la parte inferior de
la pantalla la categoría de protección y la
isla donde se asigna.
Figura 64. Contenido del documento. Niveles de protección por isla de la especie seleccionada.
71
Manual de usuario - ATLANTIS 3.3
b. Categorías de hábitat
Si está señalado el tick de esta opción la aplicación permite acceder a las especies citadas en
el documento, con las categorías de hábitat asociadas según el documento que esté
consultando.
Figura
65.
documento.
hábitat.
Contenido
Categorías
del
de
Si seleccionamos la especie que se desea consultar se habilita la categoría de hábitat en la
parte inferior de la pantalla.
Figura 66. Contenido del documento. Categorías de hábitat de la especie seleccionada.
72
Manual de usuario - ATLANTIS 3.3
c. Datos espaciales (taxones)
Si está señalado el tick de esta opción la aplicación permite acceder a las especies citadas en
el documento, para acceder a los datos de distribución asignadas en el documento que se está
consultando.
Figura 67. Contenido del
documento.
Datos
espaciales.
Si pulsamos sobre una especie accedemos a la información cartográfica registrada para ese
taxón en el documento seleccionado.
Accede a la cartografía registrada de
esta especie en el documento
Accede a la consulta de la especie en el
BDBC (ver consulta de especie)
Figura 68. Contenido del documento. Datos espaciales de la especie.
73
Manual de usuario - ATLANTIS 3.3
Figura 69. Contenido del documento. Datos espaciales de la especie en el documento.
Desde esta pantalla utilizando todos los iconos disponibles en la barra de herramientas (ver
consulta de especie) se habilitan todas las consultas, mediciones, etc., que permite hacer
Atlantis 3.3.
Si se selecciona una celda automáticamente se presenta en la parte inferior de la pantalla los
datos de precisión y confianza, tamaño de la celda, si la especie en esa cuadrícula tiene datos
de nidificación, extinción, varamiento, etc.
Datos asociados a la cuadrícula seleccionada, en el documento.
Figura 70. Contenido del documento. Datos espaciales de la especie en el documento .
74
Manual de usuario - ATLANTIS 3.3
d. Imágenes de la especie
Si está señalado el tick de esta opción la aplicación permite acceder a las especies citadas en
el documento, para acceder a imágenes del taxón asignadas en el documento que se está
consultando.
Si pulsamos en contenido del documentoimágenes de la especie se abre la pantalla con el
listado de especies registrados en él.
Figura 71. Contenido del documento. Especies citadas en el documento.
Seleccionando uno de los registros se abre la pantalla de imágenes de esa especie.
Se habilita los datos de la especie y el autor de la imagen.
Se amplia la imagen de la especie.
Figura 72. Contenido del documento. Imágenes de las especies en el documento.
75
Manual de usuario - ATLANTIS 3.3
e. Categorías de origen de la especie
Si está señalado el tick de esta opción la aplicación permite acceder a las especies citadas en
el documento, para consultar las categorías de origen al taxón asignadas en el documento que
se está consultando. Si pulsamos en contenido del documentocategorías de origen de la
especie se abre la pantalla con el listado de especies registrados en él. (ver categorías de
origen)
Figura 73. Contenido del documento. Especies citadas en el documento.
Seleccionando uno de los registros se abre la pantalla de categorías de origen de esa especie.
Figura 74. Contenido del documento. Categoría de origen de la especie en el documento .
Las categorías de origen, igual que la endemicidad, están asignadas por un solo documento,
de tal forma que cada uno de los taxones registrados en el BDBC, sólo tienen regsitradas una.
76
Manual de usuario - ATLANTIS 3.3
f. Endemismo
Si está señalado el tick de esta opción la aplicación permite acceder a las especies citadas en
el documento, para consultar las categorías de endemicidad del taxón asignadas en el
documento que se está consultando. Si pulsamos en contenido del documentoendemismo de
la especie se abre la pantalla con el listado de especies registrados en él. (ver endemicidad)
Figura 75. Contenido del documento. Especies citadas en el documento.
Seleccionando uno de los registros en la parte inferior de la pantalla se habilita una sección
para consultar los datos de endemicidad asignados a esa especie. La endemicidad, igual que
las categorías de origen, están asignadas por un solo documento, de tal forma que cada uno
de los taxones registrados en el BDBC, sólo tienen registradas una.
A
B
Figura 76. Contenido del documento. Endemicidad de la especie seleccionada en el documento. A. Documento y
categoría de endemicidad del género. B. Documento y categoría de endemicidad de la especie (en este ejemplo no hay
subespecie, por lo que carece de información este campo).
g. Descripción de la especie
Sin datos actualmente.
77
Manual de usuario - ATLANTIS 3.3
4. ADMINISTRACIÓN (Acceso a usuarios validados)
4.1. Mantenimiento. Creación de Carpetas y subcarpertas
A través del botón Administración se abre la pantalla que permite a los usuarios validados
(utilizando rl de usuario y contraseña) la creación de carpetas y subcarpetas para almacenar
las capas creadas, con un tiempo de almacenaje automático de 10 días desde la edición de la
capa. Una vez haya transcurrido ese tiempo la capa se eliminará también de forma automática.
En el caso de que se desee mantener en el servidor el usuario puede modificar la fecha de
caducidad de la capa, así como, eliminarla desde que se desee y visualizar el filtro con la que
editó. Estas carpetas y subcarpetas a figuran como directorio en las capas disponibles del
usuario que las creó, lo que le permite visualizarlas de forma privada desde las pantallas de
cartografía seleccionando capas disponibles.
Figura 77. Acceso a Mantenimientos.
Creación de carpetas.
Los pasos para la creación de carpetas y subcarpetas son los siguientes:
El usuario tiene que definir el nombre
de la carpeta y pulsar guardar. Para
eliminarla a través de la misma pantalla
mantenimientoCarpetasEliminar.
A continuación y siguiendo el mismo
procedimiento se pueden crear tantas
Subcarpetas como el usuario estime necesario.
Si se pulsa el tick “pública”, la carpeta y todo su contenido
podrá ser visualizado por cualquier usuario desde su
terminal.
Figura 78. Creación de carpetas.
78
Manual de usuario - ATLANTIS 3.3
4.2. Mantenimiento. Búsqueda y creación de localidades o ámbitos.
En esta pantalla el usuario validado puede buscar, crear y eliminar localidades y ámbitos.
Figura 79. Acceso a Mantenimientos.
Creación y búsqueda de localidades.
Las localidades disponibles en el BDBC son “orientativas” ya que se han creado a lo largo de
los registros y consultas en la base de datos y pueden no ajustarse a los topónimos reales.
Sin embargo, los ámbitos territoriales que se pueden seleccionar en la sección de análisis
territorial, disponibles para todos los usuarios de la aplicación están validados y ubicados
correctamente en el territorio y se corresponden con los Términos Municipales, islas, Red de
Espacios Naturales Protegidos y los espacios de Natura 2000.
Localidad: conjunto de cuadrículas (500 o 5000 m) que un usuario validado puede definir para
ubicar datos de distribución de una especie en el territorio, no permite hacer consultas
territoriales.
Ámbito: selección de cuadrículas (500 o 5000 m) que se corresponden con un territorio
definido por el usuario validado (veáse análisis territorial, ámbitos) y sobre los que se pretende
hacer un análisis territorial, bien en forma de mapa de riqueza o bien como catálogo o checklist.
Existen dos tipos de ámbitos:
-
De interés general: Términos Municipales, islas, Espacio Naturales, ZEC, ZEPAS,
etc.
Personalizados: son ámbitos temporales, definidos por el usuario validado, para
realizar análisis concretos en el territorio.
Para atribuir a una localidad su carácter de ámbito temporal el usuario debe seleccionar el “tick”
ámbito y también el “tick” temporal que aparece en la pantalla de edición de localidades (ver
creación de localidad o ámbito). Una vez hecho esto, éte ámbito aparece en el listado de
ámbitos temporales en los filtros de análisis territorial para su uso por parte del usuario. Es
obligatorio que los usuarios validados al crear ámbitos para estudio lo hagan siempre en forma
de ámbitos temporales, para evitar que se visualicen en los ámbitos de carácter general para
todos los clientes del Banco de Datos.
4.2.1. Búsqueda de localidades.
Las localidades que existen en el Banco de Datos se deben considerar de forma orientativa, ya
que se han creado para registrar información en los documentos. Para buscar localidades el
usuario escribirá el nombre o parte de él, seleccionará el elemento zonal (isla correspondiente)
o sin elegir ninguna isla para buscar en toda la base de datos.
79
Manual de usuario - ATLANTIS 3.3
Pulsando sobre una localidad que nos interese, se edita y se accede
a su ubicación en la pantalla cartográfica
1
Figura 80. Acceso a Mantenimientos. Búsqueda de localidades.
A través de Def. gráfica se accede a la pantalla de Cartografía donde se visualizan las
cuadrículas de esa localidad.
Una vez elegidas las cuadrículas correspondientes
con este botón se termina la edición de la localidad
y regresamos a la pantalla original para proceder a
guardar definitivamente la localidad
Figura 81. Visualización de una localidad.
Permite guardar la localidad seleccionada si se han hecho modificaciones es
su localización, en su nombre o si se le ha asignado el atributo de ámbito .
Permite eliminar una localidad o ámbito siempre que se haya utilizado para
hacer análisis territoriales y no tengan asociado ningún dato de distribución
(año, confianza y precisión) en ningún documento.
80
Manual de usuario - ATLANTIS 3.3
Permite el acceso a las pantallas cartográficas, para asignar o eliminar
nuevas cuadrículas a esa localidad o ámbito.
Permite incorporar un archivo shp. (líneas, polígonos o puntos), de forma
automática, para transformar las celdas en localidad o ámbito, de tal
manera que el usuario podrá manualmente eliminar o modificar las
cuadrículas antes de almacenarlo.
4.2.2. Crear una localidad o un ámbito nuevo
El usuario validado tiene acceso a la creación de localidades y ámbitos nuevos. Desde la
pantalla de mantenimientoslocalidadesnuevo, permite acceder a la creación de una nueva
localidad o ámbito.
Figura 82.
Creación de una
localidad o ámbito
nuevo.
Se rellenan los campos correspondientes (el campo altitud no es necesario cumplimentarlo). El
elemento zonal es la isla donde se ubica la localidad.
Con
el
localidad.
icono
se selecciona la cuadrícula o el conjunto de ellas que forman la
Una vez elegidas las cuadrículas correspondientes
con este botón se termina la edición de la localidad
y regresamos a la pantalla original para proceder a
guardar definitivamente la localidad
Figura 83. Visualización y almacenamiento de una localidad o ámbito nuevo.
4.2.3. Crear una localidad o un ámbito nuevo a partir de un archivo shape
Desde mantenimientosLocalidadesNuevo, se puede crear una localidad o ámbito utilizando
los puntos, líneas o polígonos de un fichero shape de forma semiautomática.
81
Manual de usuario - ATLANTIS 3.3
Figura 84. Creación y almacenamiento de una localidad o ámbito nuevo.
Una vez rellenados los campos de la pantalla de localidades, en examinar se busca el archivo
shp., con el que crearemos la localidad (debe de ser un archivo perfectamente
georreferenciado, no tener más de 8 caracteres). Para acceder a la pantalla cartográfica se
selecciona “desde shapefile”. La aplicación de forma automática transformará los puntos, líneas
o polígonos del shape (en color rojo) en cuadrículas de 500 m de lado (cuadrículas de color
verde). En este momento el usuario podrá eliminar o añadir celdas si así lo considera,
utilizando el icono de selección de celdas de la barra de herramientas.
Una vez elegidas las cuadrículas correspondientes con este
botón se termina la edición de la localidad y regresamos a la
pantalla original para proceder a guardar definitivamente la
localidad
1
1
Figura 85. Creación y almacenamiento de una localidad o ámbito nuevo. Visualización del shape y almacenaje de la
localidad o ámbito.
82
Manual de usuario - ATLANTIS 3.3
5. ÁNALISIS TERRITORIAL
5.1. MENÚ PRINCIPAL. Generalidades
Este apartado de la aplicación proporciona varias herramientas de análisis de la información de
las especies registradas en el Banco de Datos, bien en forma de capa o bien en forma de
listado de especies. Estos instrumentos permiten ejecutar y consultar análisis de la información
conocida de las especies del archipiélago para su uso técnico, divulgación, etc., siendo una
herramienta fundamental de apoyo en las tareas de gestión y planificación de la biota de las
islas.
A través de Menú principal del Banco de DatosAnálisis Territorial se accede a la consulta de
análisis
Figura 86. Acceso a las Consultas de Análisis.
5.2. CONSULTA DE ANALISIS. Nuevo Mapa
Un mapa es una colección de capas apiladas, para visualizar siendo las capas las que contiene
la información geográfica. El procedimiento es similar a los proyectos de los programas de
información geográfica, donde el usuario estructura y organiza la visualización de sus capas.
Se puede crear un Mapa estándar según las necesidades y no tener que definirlo y
estructurarlo cada vez que se necesite utilizar. Por defecto se visualiza siempre la capa base
de localidades, a la que le podemos añadir las capas que necesita el usuario en cada
momento.
Se introduce el nombre del mapa y pulsar guardar
Figura 87. Acceso a la creación de un nuevo mapa.
83
Manual de usuario - ATLANTIS 3.3
Se pulsa sobre el nombre del mapa y se accede a la pantalla
cartográfica donde el usuario en las capas disponibles
incorpora o elimina las que desee en su configuración de
proyecto.
Figura 88. Acceso a la creación de un nuevo mapa.
5.3. CONSULTA DE ANALISIS. Gestión de Capas
Figura 89. Acceso a la creación capas.
Una capa es la entidad que aglutina y representa la distribución conocida de las
especies registradas en el Banco de Datos.
Herramienta
Descripción
Nueva capa de riqueza
Permite elaborar una nueva capa de riqueza en función de los parámetros de filtro
seleccionados por el usuario.
Cuartil de rareza
Permite elaborar una nueva capa de cuartel de rareza en función de los parámetros de
filtro seleccionados por el usuario.
Número de presencias
Localidades
Permite, a partir de una capa de rareza, obtener otra capa que represente la distribución
taxones que estén citados en un númerod e celdas especificado por el usuario. Cuando se
indica una única celda obtendremos celdas insiustitibles, que contienes especies cuya
distribución concocida se limita a dichas cuadrículas.
Permite acceder a la gestión de localidades (ver Localidades).
Combinar capas de
análisis
Permite elaborar combinaciones de capas de riqueza de distribución entre dos grupos de
especies en función de los parámetros de filtro seleccionados por el usuario.(ver mapas
84
Manual de usuario - ATLANTIS 3.3
combinados)
Consulta de especie
Permite consultar todos los datos conocidos y registrados de las especies (ver consulta
de especies)
Método Kunin
Permite el cálculo del área de ocupación de un taxón a cualquier escala.
Tipos de capas
Capa de riqueza: Es una capa donde se representa el número de especies y subespecies
presentes en cuadrícula de 500 o 5000 m, independientemente de la abundancia de cada una.
La representación cartográfica que se visualiza se realiza en función de los parámetros
definidos por el usuario en su elaboración (ver nueva capa de riqueza).
Capa de rareza: Es una capa donde se representa en cada celda un indicador que refleja la
suma de los valores de rareza de cada una de las especies presentes en la celda. Para cada
una de las especies el valor de rareza se calcula mediante la fórmula 1/N donde N es el
número de celdas donde esta registrada la especie. Para obtener una capa de rareza es
necesario disponer previamente de una capa de riqueza (ver nueva capa de riqueza).
Capas combinadas: capa que resulta de correlacionar pautas de distribución de grupos de
especies diferentes. Es necesario disponer de una capa de riqueza de cada grupo de especies
que queramos combinar. El resultado será una capa con dos escalas de colores, una para
cada grupo correlacionado.
Capa Cuartil de rareza: capa generada a partir de una capa de riqueza y que muestra los
taxones con distribuciones más restringidas, es decir, representa el 25 % de especies que
menos celdas ocupan, de la totalidad de los taxones.
Capa de número de presencias: capa que muestra las rarezas extremas, en los que se
representan los taxones con distribuciones más restringidas. Cuando se genera seleccionando
una única celda obtenemos una capa de especies con distribución conocida restringida a una
única cuadrícula, correspondiéndose con celas insustituibles. (especies en una celda, celdas
insustituibles)
Capa externa: capa que se añaden a las capas disponibles de la aplicación especificando una
URL de un servidor WMS y cuya información se encuentra fuera del sistema (ver capas
externas).
Capa Consulta de especies (Presencia): capa que indica la distribución conocida de la
especie (ver consulta de especie).
Capa Consulta de especies (Extinción): capa que indica las celdas donde la especie tiene
datos de extinción según los criterios del Banco de Batos (ver consulta de especie)
5.3.1. Nueva capa de riqueza
Una capa de riqueza representa el número de especies y subespecies presentes en una
cuadrícula de 500 o 5000 m, independientemente de la abundancia de especies en cada una.
La representación está en función de los parámetros definidos por el usuario en su elaboración.
Cualquier filtro que utilice el usuario significa que el resultado de la consulta se ajusta sólo a los
taxones que cumplen con el filtro requerido.
Los usuarios no validados utilizan la subcarpeta por defecto que le ofrece la aplicación para la
elaboración de la capa de riqueza. En el caso de un usuario validado debe tener creada una
carpeta y subcarpeta donde se almacenará el resultado de su consulta (ver
AdministraciónMantenimientos).
85
Manual de usuario - ATLANTIS 3.3
Figura 90. Pantalla de
los filtros para crear
una nueva capa de
riqueza.
Herramienta
Nombre de la Capa
Subcarpeta
Rangos taxonómicos
Nivel taxonómico
Nivel de confianza
Nivel de precisión
Escala
Validez del taxón
Año observación
Origen
Endemicidad
Nidificación
Extinción
Varamiento
Estado de conservación
Nivel de protección
Categorías de Hábitat
Ámbito de trabajo
Descripción
Nombre de la capa
Carpeta en el servidor donde se ubicará la capa creada.
Permite la selección de los rangos taxonómicos. Mediante el botón “añadir” se
pueden seleccionar varios rangos, por el contrario, el botón “eliminar” permite
anular los rangos que hayan sido considerados previamente
Permite la selección del nivel taxonómico (especie/subespecie, género, etc.,) que
se pretende analizar en la capa.
Permite filtrar los datos de distribución de la consulta según el nivel de confianza.
Permite filtrar los datos de distribución de la consulta según el nivel de precisión.
Permite la selección de la escala de visualización, es decir, si la capa de salida se
corresponde con un grid de cuadrículas de 500 o 5000 m de lado.
Permite filtrar los taxones según su validez taxonómica (de forma general debe ser
válido).
Permite filtrar los datos de distribución de la consulta según un rango de fechas de
citas en los documentos.
Permite filtrar la consulta de la distribución de las especies según su origen
biogeográfico.
Permite filtrar la consulta de la distribución de las especies según su endemicidad.
Permite filtrar la consulta de la distribución de las especies según sus datos de
nidificación.
Permite filtrar la consulta de la distribución de las especies según sus datos de
extinción.
Permite filtrar la consulta de la distribución de las especies según sus datos de
varamiento.
Permite filtrar la consulta de distribución de las especies según los documentos que
asignan estado de conservación y categorías a considerar en la elaboración de la
capa.
Permite filtrar la consulta de distribución de las especies según los documentos
normativos que asignan estado de protección y categorías a considerar en la
elaboración de la capa.
Permite filtrar la consulta de distribución de las especies según los hábitats que
tienen asignados las especies.
Permite filtrar la consulta de distribución de las especies en el ámbito de estudio.
86
Manual de usuario - ATLANTIS 3.3
Para crear una capa de riqueza se debe seleccionarnueva capa de riqueza donde el usuario
dispone de una serie de filtros de análisis que se han agrupado en bloques para que sea más
fácil su selección.
5.3.1.1. Filtros para crear una capa de riqueza
a. Filtros de rangos taxonómicos.
Permite elegir los grupos taxonómicos con los que se quiere realizar la capa de riqueza.
Pueden seleccionarse rangos superiores, como por ejemplo una clase o un orden, o bien
individualmente a nivel de especie. Se pueden elegir tantos como el usuario desee y
combinarlos según la consulta que vaya a realizar.
En la opción añadir se abre una pantalla para seleccionar mediante desplegables, las
categorías, especie/subespecies de la que se obtendrá la capa de riqueza.
Figura 91. Pantalla de los filtros para seleccionar y añadir los rangos taxonómicos de la consulta.
Se termina la selección con la opción añadir. Se ha de repetir estos pasos tantas veces como
taxones o categorías el usuario quiera incorporar al análisis.
87
Manual de usuario - ATLANTIS 3.3
Permite deseleccionar la categoría elegidas
Contador del número de rangos taxonómicos de la capa de riqueza
Figura 92. Pantalla del filtro de rango taxonómico seleccionado en la consulta.
El siguiente paso es elegir el nivel taxonómico y el tipo de especie (marina, terrestre o ambas)
con el que se representará la capa de riqueza.
b. Filtros de categorías de endemicidad, origen, precisión, confianza, etc.
A continuación el usuario debe decidir otro conjunto de filtros, relacionados con atributos de las
especies como endemicidad, origen, validez del taxón o bien con datos atribuidos a las
cuadrículas de distribución de las especies como precisión, confianza, la escala de
visualización de la capa (500 o 5000 m), año de la cita etc. Marcando cada una de las casillas
de verificación se elegirán los parámetros de representación de la capa de riqueza.
Si el usuario no selecciona ningún filtro la aplicación no puede discriminar ningún parámetro,
con lo que la consulta representa todos los valores de cada filtro simultáneamente.
Se debe seleccionar siempre el nivel de confianza seguro y la opción válido en validez de
taxón, ya que la gran mayoría de la información registrada en el Banco de Datos se
corresponde con taxones válidos y su confianza segura.
c. Filtros de niveles de protección y conservación.
Si la capa de riqueza representa especies que tengan asignado un nivel de conservación y de
protección (especies amenazadas y protegidas) se deben seleccionar con el botón añadir.
88
Manual de usuario - ATLANTIS 3.3
El usuario seleccionará las categorías de protección de los
documentos que considere y la capa de riqueza
representará a los taxones que se ajusten al filtro, junto
con los parámetros que haya elegido en otros apartados.
Figura 93. Pantalla de los filtros para seleccionar los documentos normativos y los anexos y categorías de protección
de las especies.
d. Filtros de categorías de hábitat.
Si la capa de riqueza representa especies que tengan asignado una categoría de hábitat se
debe seleccionar con el botón añadir.
Figura 94. Pantalla de los filtros para seleccionar las categorías de hábitat de la consulta.
89
Manual de usuario - ATLANTIS 3.3
Dada la complejidad de la asignación de las categorías de hábitats para todos los taxones de la
biota del archipiélago, en la actualidad el Banco de Datos de Biodiversidad tiene registrado con
categorías de hábitat únicamente las especies cavernícolas que pertenecen al medio hipogeo
(medio hipogeo e hipogeo exclusivamente). En un futuro dado que la aplicación está preparada
para ello se irán completando el resto de los tipos de hábitats y sus especies.
e. Filtros de ámbitos territoriales.
Si la capa de riqueza representa especies que se distribuyen en un ámbito territorial
determinado se debe seleccionar con el botón añadir.
El usuario debe seleccionar el territorio sobre el cuál desea hacer el análisis y que será el que
se represente en su capa de riqueza. Existen dos tipos de ámbitos:
- ámbitos de interés general, definidos por los administradores del sistema, como
Términos Municipales, islas, Espacio Naturales, etc; serán utilizados por todos los
usuarios validados o no.
- ámbitos temporales, definidos exclusivamente por el usuario validado, para realizar
análisis concretos en el territorio. Para atribuir a una localidad su carácter de ámbito
temporal el usuario validado debe seleccionar el “tick” ámbito y también el “tick”
temporal que aparece en la pantalla de edición de localidades. Una vez hecho esto
este ámbito temporal aparecerá con el nombre que se definió, en el listado de ámbitos
de trabajo que figuran en los filtros disponibles en análisis territorial y podrá ser
utilizado en los análisis que desee el usuario.
Se ha seleccionar previamente el elemento zonal,
es decir, la isla dónde llevará a cabo el análisis
Figura 95. Pantalla de los filtros para seleccionar el ámbito territorial de la consulta.
En el caso de los ámbitos temporales (ver creación de ámbitos), el usuario validado debe
haberlo definido previamente para que aparezca en el listado de ámbitos temporales y pueda
seleccionarse.
f. Filtros de localidades y carpetas.
90
Manual de usuario - ATLANTIS 3.3
Si la capa de riqueza representa especies que se distribuyen en un ámbito territorial que no
está definido el usuario validado puede crearlo desde la opción localidad (ver creación de
ámbitos) pulsando el botón nuevo.
En el caso de que un usuario validado no disponga de una carpeta creada para almacenar la
capa de riqueza lo puede hacer desde la opción carpetanuevo (ver creación de carpeta)
g. Ejecutar la consulta de una nueva capa de riqueza.
Una vez se han seleccionado todos los filtros de la capa de riqueza queda solamente mandar a
ejecutar la consulta pulsando crear capa.
En este momento la capa que se desea crear aparece en la pantalla principal de gestión de
capas en capas pendientes, es decir, se está a la espera de que se ejecute la consulta en el
servidor, si no es muy pesada la espera será de unos minutos, en cualquier caso podemos ver
el estadoen proceso.
Se pueden ejecutar tantas consultas como el usuario necesite de forma sucesiva, que
aparecerán en cola a la espera del tiempo de ejecución. Una vez haya transcurrido el tiempo y
se haya generado la capa aparecerá debajo de la opción capas disponibles.
Figura 96. Pantalla del estado de ejecución de las capas de riqueza generadas.
Caducidad de la capa:
91
Manual de usuario - ATLANTIS 3.3
- En el caso de usuarios sin validación las capas generadas se perderán en el
momento que se cierre la aplicación y el navegador. Para evitar la pérdida se pueden
exportar.
- En el caso de usuarios validados las capas generadas están disponibles para su
visualización durante 15 días (fecha de caducidad), transcurrido este período se
eliminarán sin previo aviso.
h. Exportar e importar el filtro de consulta de una nueva capa de riqueza.
Una vez se haya ejecutado la consulta de una capa de riqueza se puede exportar los
parámetros filtro y almacenarlos para poder ejecutarlo automáticamente siempre que el usuario
lo requiera sin tener que seleccionar nuevamente todos y cada uno de ellos.
Pulsando, se exporta y almacena en el directorio de descargas del PC del usuario un
archivo kml, con todos los parámetros de la consulta.
Figura 97. Pantalla del estado de ejecución de las capas de riqueza generadas.
Si el usuario en consultas futuras quiere recuperar este filtro y aplicarlo automáticamente a la
consulta, desde la pantalla de nueva capa de riquezaexaminarse localiza en el directorio
del PC el archivo kml se seleccionaImportarnueva capa. Se ejecutará la consulta sin
tener que pulsar cada uno de los filtros, con lo que se agiliza el tiempo de consulta.
5.3.1.2. Visualizar una capa de riqueza
Para visualizar la capa de riquezasobre el nombre de la capa se visualiza la pantalla
cartográfica. Se accede a la visualización de la capa en un visor simple. Si se quiere mayor
funcionalidad, se puede acceder al visor avanzado por medio del botón “Visor avanzado”.
5.3.1.2.1. Visor simple
92
Manual de usuario - ATLANTIS 3.3
Figura 98. Pantalla de visualización de una capa de riqueza.
Panel de capas.
Tiene el mismo comportamiento que el indicado en la consulta de especie. Por defecto, no se
añaden las capas de distribución de la especie como en consulta de especie.
Barra de herramientas.
Figura 98. Barra de herramientas.
La primera parte de la barra de herramientas tiene la misma funcionalidad que en la capas de
consulta de especie.
Sin embargo, se introduce un cambio de funcionalidad. Cuando se tiene seleccionado el primer
icono “Desplazar el mapa”, si se pulsa con el botón izquierdo sobre una posición cualquiera del
mapa, se marca la posición con una marca y se abre otra ventana. Es ventana nos muestra
información sobre las especies localizadas en esa posición pulsada.
Además, ahora aparece un segundo conjunto de iconos con funcionalidad adicional:
Figura 98. Barra de herramientas adicional
93
Manual de usuario - ATLANTIS 3.3
Mapa de riqueza: muestra información de riqueza de cada celda. Esta activada por
defecto.
Mapa de rareza local: muestra información de rareza local de cada una de las
especies. Se calcula a partir de una capa de riqueza para un ámbito territorial
determinado. Se puede obtener más información sobre este icono en el apartado del
visor avanzado.
Mapa de rareza insular: muestra información de rareza insular de cada una de las
especies. Se calcula a partir de una capa de riqueza para una isla determinada.
Mapa de rareza regional: muestra información de rareza regional de cada una de las
especies. Se calcula a partir de una capa de riqueza para todas las cuadrículas de
Canarias.
Mostrar etiquetas: permite habilitar o deshabilitar la visualización de las etiquetas de
cada una de las cuadrículas de la capa. Las etiquetas indican el número de especies
en cada una de las cuadrículas de la capa de riqueza, la suma de los índices de rareza
en cada celda y el número máximo de especies en una celda
Informe taxonómico: permite la visualización de información de las especies en un
número de celdas seleccionadas del mapa de riqueza. Se obtienen listados de
especies con el número de celdas donde se distribuye, así como estadísticas y análisis
de las cuadrículas marcadas. Se puede obtener más información sobre este icono en el
apartado del visor avanzado.
Barra de estado
Se mantiene la barra de estado inicial con información de escala, coordenadas, etc.
Desaparece la segunda barra de estado con información específica de la celda seleccionada.
5.3.1.2.2. Visor avanzado
En ciertas ocasiones, al entrar en la pantalla del visor, el navegador dará un mensaje de
advertencia (ver requisitos técnicos), en este caso habrá que aceptar las condiciones y
ejecutar.
94
Manual de usuario - ATLANTIS 3.3
Figura 98. Pantalla de visualización de una capa de riqueza.
Barra de herramientas.
Es la misma barra de herramientas en
todas las pantallas cartográficas
Es la misma barra de herramientas de
búsqueda de localidades en todas las
pantallas cartográficas
Barra de herramientas específica que se habilita
cuando se genera una capa de riqueza
Capa de riqueza. Permite acceder a la información en cada una de las celdas de la
capa. Para poder visualizar la información de etiquetas, selección de celdas,
elaboración de informes taxonómicos, etc. Se debe pulsar previamente este icono para
que la capa de riqueza esté activada.
95
Manual de usuario - ATLANTIS 3.3
Figura 99. Capa de riqueza, con la etiqueta.
Cálculo de rareza local. Permite acceder a la información de rareza local de cada una
de las especies. Se calcula a partir de una capa de riqueza para un ámbito territorial
determinado.
Es una capa donde se representa en cada celda un indicador que refleja la suma de los
valores de rareza de cada una de las especies presentes en la celda. Para cada una de
las especies el valor de rareza se calcula mediante la fórmula 1/N donde N es el
número de celdas donde esta registrada la especie. Para obtener una capa de rareza
es necesario disponer previamente de una capa de riqueza. Lo mismo ocurre con la
capa de rareza insular
Figura 100. Capa de rareza local, con la
etiqueta
y regional.
Una vez elaborado la capa de rareza se pueden obtener capas de rareza extrema, en
los que se representan los taxones con distribuciones conocidas más restringidas. Se
obtiene este resultado utilizando el icono de número de presencias (ver número de
presencias).
Cálculo de rareza insular. Permite acceder a la información de rareza insular de cada
una de las especies. Se calcula a partir de una capa de riqueza para una isla
determinada.
96
Manual de usuario - ATLANTIS 3.3
Cálculo de rareza regional. Permite acceder a la información de rareza regional de
cada una de las especies. Se calcula a partir de una capa de riqueza para todas las
cuadrículas de Canarias.
Cálculo de mapa general de rareza. Permite acceder a la información del mapa
general de rareza de cada una de las especies de la capa de riqueza. Una vez se
pulsa el icono se habilita una pantalla donde se visualiza un listado con el número de
taxones de la capa de riqueza y el número de celdas dónde está registrada. Los datos
don exportables a otro programa informático para su tratamiento.
Figura 101. Pantalla de resultados del mapa general de rareza.
Mostrar etiquetas. Permite habilitar o deshabilitar la visualización de las etiquetas de
cada una de las cuadrículas de la capa. Las etiquetas indican el número de especies en
cada una de las cuadrículas de la capa de riqueza, la suma de los índices de rareza en cada
celda y el número máximo de especies en una celda.
Búsqueda de máximos. Permite visualizar la celda con el valor máximo de especies en
una capa de riqueza o de rareza en la capa correspondiente. Una vez generada la capa
de riqueza o rareza se pulsa el icono y se selecciona en el visor la cuadrícula con el valor
máximo con el borde en color rojo. Puede darse el caso de que existan más de una celda
con el número máximo de taxones o de rareza.
Figura 102. Capa de riqueza con el valor máximo en las celdas de borde rojo oscuro.
97
Manual de usuario - ATLANTIS 3.3
Incremento de protección. Permite partiendo de una capa de riqueza con una celda
seleccionada, diagnosticar qué celda contiene un mayor número de especies diferentes
a la de partida, basado en el principio de complementariedad. Esta operación se
puede hacer desde una cuadrícula con la máxima biodiversidad o bien a partir de una
cuadrícula o de un conjunto de cuadrículas que hayan sido definidas por el usuario. El
procedimiento de selección y pantallas es el mismo independientemente de la
selección de partida.
Partiendo de una celda seleccionadapulsar el icono de
incremento de protección se habilita la pantalla inferior
Se selecciona incorporar 2 cuadrículas complementarias a la de partida para
aumentar el número de taxones diferentes a los de partida.
Total de niveles: corresponde al número de taxones totales de la capa de riqueza.
Grupo inicial: número de taxones registrados en la celda selecciona de partida en este análisis.
Incremento: son los taxones que se incrementan en la consulta.
Sin proteger: son aquellos que quedan fuera de la selección de cuadrículas.
Figura 103. Pantalla de la opción incremento de protección definido por el usuario.
Visualización mostrando las coordenadas de las cuadrículas que se
incrementan
Visualización mostrando los taxones de las cuadrículas que se
incrementan
Figura 104. Pantalla de la opción incremento de protección definido por el usuario.
98
Manual de usuario - ATLANTIS 3.3
Celdas incrementadas
Celda de origen de la consulta
Realizando este procedimiento el usuario partiendo de una capa de riqueza con 13
taxones, seleccionando una celda de partida y haciendo la consulta, en un solo paso ha
detectado que en La Palma y en El hierro hay dos celdas complementarias que
engloban dos taxones más a la lista de partida, con lo que el resultado orienta al
usuario sobre alternativas de compra, protección, toma de decisiones de conservación
sobre el territorio, garantizando el mayor número de taxones registrados en esas
cuadrículas.
En el caso de que el usuario no seleccione ninguna cuadrícula previa de partida la
aplicación por defecto hace el cálculo de incremento de protección a partir de la celda
de máxima riqueza. El resultado puede ser o no el mismo, ya que la celdas o grupo de
celdas inicial es diferente.
Cálculo de solape. Permite averiguar las especies coincidentes entre dos áreas
seleccionadas de un mapa de riqueza. El usuario debe seleccionar la opción solape
pulsando el icono, con la capa de riqueza activase habilitan dos iconos para seleccionar
los dos conjuntos de celdas a compararpulsar el icono de cálculo de solape.
Figura 105. Pantalla de selección de las celdas para calcular el solape entre ellas.
99
Manual de usuario - ATLANTIS 3.3
Conjunto de taxones que tienen distribución en las
cuadrículas seleccionadas en la primera opción (color
verde)
Conjunto de taxones que tienen distribución en las
cuadrículas seleccionadas en la segunda opción (color
rojo)
Consulta hecha por solape
Conjunto de taxones comunes que tienen distribución
coincidentes en las dos selecciones de cuadrículas.
Figura 106. Pantalla con el resultado de las especies presentes en las celdas con el resultado del cálculo de
solape entre ellas.
La aplicación Atlantis 3.3 permite hacer el cálculo de Beta-diversidad entre dos conjuntos de
cuadrículas seleccionadas en el territorio dónde existirán especies diferentes y muy
probablemente especies comunes. La Beta-diversidad entendida como la tasa de cambio en
especies de dos conjuntos de celdas seleccionadas y refleja la diferencia de composición entre
los conjuntos de cuadriculas seleccionadas y en última instancia la heterogeneidad de las
especies. Sobre el mismo conjunto de celdas de la selección anterior aplicamos el cálculo de la
Beta-diversidad
Figura 107. Pantalla con el resultado de las especies presentes en las celdas con el resultado del cálculo
Beta-diversidad entre ellas.
Para exportar cualquiera de los listados de resultados, la opción es copiar y pegar los registros
seleccionados a una hoja Excel o a un documento Word.
100
Manual de usuario - ATLANTIS 3.3
Número de presencias. Una vez elaborado una capa de rareza de distribución de
taxones, utilizando este icono se abre una pantalla donde el usuario puede decidir en
número de celdas máximo donde se distribuyen las especies de la capa, de tal manera,
que si selecciona una única celda se obtendrían cuadrículas insustituibles (como
aquellas cuadrículas que contienen especies cuya distribución se limita a esas
cuadrículas).
A
B
Figura 108. Mapa de riqueza (A) de partida para el análisis. Mapa de rareza (B) para el análisis.
A
B
Figura 109. A. Cuadro de diálogo para la selección del número de celdas máximos de distribución de
taxones. B Mapa de rareza que representa la distribución de especies en una única cuadrícula de la consulta
inicial.
Cuartil de rareza. capa generada a partir de una capa de riqueza y que muestra los
taxones con distribuciones más restringidas, es decir, la capa resultante se corresponde
con el 25 % de especies que menos cuadrículas ocupan, de la totalidad de los taxones
representados. Ejemplo: Partiendo de una capa de riqueza de distribución de especies
del grupo taxonómico artrópodos, endémicos de Canarias, con niveles de precisión (1 y
2) y fecha de las citas posteriores a los años 1970, que contiene 6450 cuadrículas, con
un total de 833 taxones (mapa A), consultamos el cuartil de rareza, es decir,
obtendremos una capa que representa el 25 % de especies que menos celdas ocupan de
esta capa de partida, con un resultado de 361 taxones (mapa B)
101
Manual de usuario - ATLANTIS 3.3
A
B
Figura 110. A. Mapa de distribución de artrópodos endémicos (precisión 1 y 2, citas posteriores a 1970) en
Tenerife. B. Mapa de cuartel de rareza endémicos (precisión 1 y 2, citas posteriores a 1970) en Tenerife.
Evolución temporal. En este apartado se representan gráficamente, mediante un diagrama
de barras, el número de cuadrículas de uno o varios mapas seleccionados. Esto puede
resultar muy interesante ya que cuando los mapas analizados se han elaborado según
distintos rangos de fechas, se puede observar una evolución temporal del número de
cuadrículas registradas en el Banco de Datos.
Para la realización de este análisis, en primer lugar hay que pulsar sobre el icono
correspondiente. Aparecerá una pantalla emergente en la que se seleccionan las capas a
considerar en el análisis. Una vez que se ha pulsado el botón “Generar informe”, se
genera un histograma, en el que, además de la representación gráfica, se indica el
número de cuadrículas asociadas a cada capa.
102
Manual de usuario - ATLANTIS 3.3
Figura 111. Diagrama de barras de el resultado de los distintas capas de riqueza.
Frecuencias de rangos. Permite ver a través de un gráfico el número de celdas
asociadas a cada uno de los rangos taxonómicos del mapa de riqueza. Partiendo de
un mapa de riqueza definido por el usuario en este ejemplo es un mapa de riqueza del
género Pimelia en Tenerife, dónde el número máximo de taxones es 7. La Columna Y
representa el número total de celdas, y la columna X es el intervalo del número de
taxones representados.
El formato de exportación es en archivo pdf.
Figura 112. Pantalla con el resultado de la frecuencia de rango de distribución de especies.
103
Manual de usuario - ATLANTIS 3.3
Figura 113. Tramas de colores de representación de una capa de riqueza.
Seleccionando uno de los colores o tramas que queremos modificar se habilita una opción de
estilo donde podemos seleccionar el color del entramado, el color del borde, así como el tipo de
entramado, para modificarlo.
Mapas combinados. Permite correlacionar pautas de distribución de distintos grupos de
especies. El punto de partida lo constituyen dos mapas de riqueza de dos grupos de especies
(seleccionando cualquier rango taxonómico), en un ámbito (local, insular o regional). El mapa
combinado resultante tendrá dos escalas de colores, una para cada grupo. Ejemplo: Mapa de
distribución del género Argyranthemum en Tenerife (mapa de la izquierda) y mapa de riqueza
del género Pimelia en Tenerife (mapa de la derecha).
A
B
Figura 114. A. Mapa de distribución de especies del género Argyranthemum en Tenerife. B. Mapa de
distribución de especies del género Pimelia en Tenerife
104
Manual de usuario - ATLANTIS 3.3
En el caso de la figura adjunta, una de las escalas oscila entre negro y verde, mientras que la
otra lo hace entre negro y rojo. De esta manera, las zonas donde las dos especies tienen una
distribución coincidente se observará el color verde o color rojo (dependiendo del grupo
dominante) y cuando sucede lo contrario se observará color blanco.
Una vez elaborado el mapa
combinado, al pulsar sobre el botón
correspondiente, el programa ofrece
el cálculo de la correlación o grado
de dependencia entre las dos series
de datos mediante los índices de
Spearman y Pearson.
Figura 115. Tramas de colores de representación de un mapa combinado de distribución de especies.
Coeficiente
Pearson
Coeficiente
Spearman
Herramienta
de correlación
de
correlación
Frecuencias acumuladas
de
de
Descripción
Se utiliza para conjuntos de datos que se ajustan a una distribución
normal, puede utilizarse para medir el grado de relación de dos variables
siempre y cuando ambas sean cuantitativas (Test paramético). Si r=1,
existe una correlación perfecta; r=0 no existe relación lineal; 0<r<1 existe
correlación positiva.
Se utiliza para conjuntos de datos que no se ajustan a una distribución
normal, es una medida de la correlación (la asociación o independencia)
entre variables aleatorias continuas. ES igual al testa anterior, oscila entre
-1 y +1, indicándonos asociaciones negativas o positivas, donde 0
significa no correlación pero no independencia. (Test no paramétrico).
Representación gráfica de la distribución de frecuencias para detectar la
105
Manual de usuario - ATLANTIS 3.3
bondad de ajuste a una distribución normal
Informes taxonómicos. Permite la visualización de información de las especies en un
número de celdas seleccionadas del mapa de riqueza. Se obtienen listados de especies
con el número de celdas donde se distribuye, así como estadísticas y análisis de las
cuadrículas marcadas.
A partir de un mapa de riqueza, el primer paso es seleccionar una o más cuadrículas, en el
caso de que el usuario no marque las celdas a consultar la aplicación advierte con el
mensaje:
El usuario marca una o varias celdas sobre las que quiere
elaborar la consulta
Seleccionar el tipo de informe que se desea obtener
Listado de especies
106
Manual de usuario - ATLANTIS 3.3
El usuario obtiene le listado de los taxones y su clasificación taxonómica en la cuadrícula
seleccionada, así como, el número de celdas donde se distribuyen los taxones sobre el total de
cuadrículas seleccionadas.
Estadísticas
De las especies que se distribuyen en la cuadrícula seleccionada, obtenemos un conjunto de
datos de información de endemicidad, hábitat, origen, etc., que el usuario puede exportar a
otros formatos.
Endemicidad frente a estatus de protección
De las especies que se distribuyen en la cuadrícula seleccionada, obtenemos un conjunto de
datos de información de endemicidad frente al estatus de protección.
Endemicidad frente a habitat
107
Manual de usuario - ATLANTIS 3.3
De las especies que se distribuyen en la cuadrícula seleccionada, obtenemos un conjunto de
datos de información de endemicidad frente las categorías de hábitat.
Origen frente a estatus de protección
De las especies que se distribuyen en la cuadrícula seleccionada, obtenemos un conjunto de
datos de información de origen biogeográfico frente las categorías de protección.
Origen frente a hábitat
De las especies que se distribuyen en la cuadrícula seleccionada, obtenemos un conjunto de
datos de información de origen biogeográfico frente las categorías de hábitat.
Estatus de protección frente a hábitat
De las especies que se distribuyen en la cuadrícula seleccionada, obtenemos un conjunto de
datos de información del estatus de protección frente las categorías de hábitat.
108
Manual de usuario - ATLANTIS 3.3
Imprimir desde análisis territorial. Cartografía.
Figura 116. Pantalla de resultado de un análisis territorial.
Se habilita la misma pantalla de selección de parámetros para configurar la leyenda, con los
campos que el usuario desee mostrar en la impresión del mapa. El procedimiento es el mismo
que en el caso de imprimir desde la consulta de especie (ver imprimir)
5.3.2. Catálogo o checklist
Un catálogo o checklist es un listado de taxones que incluye la información conocida y
registrada en el Banco de Datos, en un ámbito determinado, en una isla o un conjunto de ellas.
Su resultado se presenta en formato de columnas que están en función de los filtros de
selección utilizado por el usuario en su elaboración, es decir, a medida que se eligen filtros se
añaden nuevas columnas en la tabla de resultados. Una vez generado se puede exportar a
otros programas informáticos para su tratamiento.
De la misma manera que en las capas de riqueza el filtro con el que se ha creado el catálogo
se puede exportar a formato kml y volver a utilizar en Atlantis 3.3. facilitándole la acción al
usuario ya que no tendrá que repetir la consulta seleccionando todos los parámetros, cada vez.
Se puede elaborar más de un catálogo de forma sucesiva que irán apareciendo en el listado de
catálogos pendientes y una vez elaborado se incorporarán a los catálogos generados. En este
apartado no se puede modificar la fecha de caducidad, si no que la aplicación la genera por
defecto, y es de un mes.
109
Manual de usuario - ATLANTIS 3.3
Figura 117. Pantalla de los filtros para crear un catálogo (checklist).
Herramienta
Nombre de la Capa
Rangos taxonómicos
Nivel taxonómico
Nivel de confianza
Nivel de precisión
Escala
Validez del taxón
Año observación
Origen
Endemicidad
Nidificación
Extinción
Varamiento
Estado de conservación
Descripción
Nombre de la capa
Permite la selección de los rangos taxonómicos. Mediante el botón
“añadir” se pueden seleccionar varios rangos, por el contrario, el botón
“eliminar” permite anular los rangos que hayan sido considerados
previamente.
Permite la selección del nivel taxonómico (especie/subespecie, género,
etc.,) que se pretende analizar en la capa.
Permite filtrar los datos de distribución de la consulta según el nivel de
confianza.
Permite filtrar los datos de distribución de la consulta según el nivel de
precisión.
Permite la selección de la escala de visualización, es decir, si la capa de
salida se corresponde con un grid de cuadrículas de 500 o 5000 m de
lado.
Permite filtrar los taxones según su validez taxonómica (de forma general
debe ser válido).
Permite filtrar los datos de distribución de la consulta según un rango de
fechas de citas en los documentos.
Permite filtrar la consulta de la distribución de las especies según su
origen biogeográfico.
Permite filtrar la consulta de la distribución de las especies según su
endemicidad.
Permite filtrar la consulta de la distribución de las especies según sus
datos de nidificación.
Permite filtrar la consulta de la distribución de las especies según sus
datos de extinción.
Permite filtrar la consulta de la distribución de las especies según sus
datos de varamiento.
Permite filtrar la consulta de distribución de las especies según los
documentos que asignan estado de conservación y categorías a
considerar en la elaboración de la capa.
110
Manual de usuario - ATLANTIS 3.3
Nivel de protección
Categorías de Hábitat
Ámbito de trabajo
Permite filtrar la consulta de distribución de las especies según los
documentos normativos que asignan estado de protección y categorías a
considerar en la elaboración de la capa.
Permite filtrar la consulta de distribución de las especies según los
hábitats que tienen asignados las especies.
Permite filtrar la consulta de distribución de las especies en el ámbito de
estudio.
El procedimiento de filtro para las consultas de catálogos de especies es exactamente igual
que los utilizados para la creación de una nueva capa de riqueza, utilizando las mismas
pantallas de selección y los mismos parámetros de filtro, a excepción de los rangos visibles.
(ver crear capa de riqueza).
5.3.2.1. Filtros para crear un catálogo o checklist
a. Filtros taxonómicos. Rangos visibles
Permite elegir los grupos taxonómicos con los que se quiere realizar el catálogo de taxones.
Pueden seleccionarse rangos superiores, como por ejemplo una clase o un orden, o bien
individualmente a nivel de especie. Se pueden elegir tantos como el usuario desee y
combinarlos según la consulta que vaya a realizar.
En la parte superior de la pantalla está la opción Rango Visible, que no es más que las
categorías taxonómicas que aparecerán en forma de columnas en el resultado del catálogo.
En la opción añadir se abre una pantalla para seleccionar mediante desplegables, las
categorías taxonómicas de la que se obtendrá en catálogo o checklist.
Figura 117. Pantalla de los filtros para crear un catálogo (checklist).
b. Filtros de categorías de endemicidad, origen, precisión, confianza, etc.
A continuación el usuario debe decidir otro conjunto de filtros, relacionados con atributos de las
especies como endemicidad, origen, validez del taxón o bien con datos atribuidos a las
cuadrículas de distribución de las especies como precisión, confianza. Marcando cada una de
111
Manual de usuario - ATLANTIS 3.3
las casillas de verificación se elegirán los parámetros del listado de especies que se
presentarán en columnas independientes.
Si el usuario no selecciona ningún filtro la aplicación no puede discriminar ningún parámetro,
con lo que la consulta representa todos los valores de cada filtro simultáneamente.
Se debe seleccionar siempre el nivel de confianza seguro y la opción válido en validez de
taxón, ya que la gran mayoría de la información registrada en el Banco de Datos se
corresponde con taxones válidos y su confianza segura.
c. Filtros de niveles de protección y conservación.
Si el usuario selecciona para su catálogo especies que tengan asignado un nivel de
conservación y de protección (especies amenazadas y protegidas) se deben seleccionar con el
botón añadir. Se mostrarán tantas columnas como documentos con información se hayan
seleccionada. En el encabezado de la columna figurará el código del documento normativo que
a través del archivo documental se obtienen los datos completos del documento. En cada
columna aparecerán en abreviatura las categorías o anexos donde están incluídos.
El usuario seleccionará las categorías de protección de los
documentos que considere y la capa de riqueza
representará a los taxones que se ajusten al filtro, junto
con los parámetros que haya elegido en otros apartados.
112
Manual de usuario - ATLANTIS 3.3
Fgura 118. Pantalla de los filtros para seleccionar los documentos normativos y los anexos y categorías de protección
de las especies.
d. Filtros de categorías de hábitat.
Si en el catálogo se representa especies que tengan asignado una categoría de hábitat se
debe seleccionar con el botón añadir.
Figura 119. Pantalla de los filtros para seleccionar las categorías de hábitat de la consulta.
Dada la complejidad de la asignación de las categorías de hábitats para todos los taxones de la
biota del archipiélago, en la actualidad el Banco de Datos de Biodiversidad tiene registrado con
categorías de hábitat únicamente las especies cavernícolas que pertenecen al medio hipogeo
(medio hipogeo e hipogeo exclusivamente). En un futuro dado que la aplicación está preparada
para ello se irán completando el resto de los tipos de hábitats y sus especies.
e. Filtros de ámbitos territoriales.
Si el listado representa especies que se distribuyen en un ámbito territorial determinado se
debe seleccionar con el botón añadir.
El usuario debe seleccionar el territorio sobre el cuál desea hacer el análisis y que será el que
se represente en su capa de riqueza. Existen dos tipos de ámbitos:
- ámbitos de interés general, definidos por los administradores del sistema, como
Términos Municipales, islas, Espacio Naturales, etc; están disponibles para su uso
tanto por los usuarios validados o como no.
- ámbitos temporales, definidos exclusivamente por el usuario validado, para realizar
análisis concretos en el territorio. Para atribuir a una localidad su carácter de ámbito
temporal el usuario validado debe seleccionar el “tick” ámbito y también el “tick”
113
Manual de usuario - ATLANTIS 3.3
temporal que aparece en la pantalla de edición de localidades. Una vez hecho esto
este ámbito temporal aparecerá con el nombre que se definió, en el listado de ámbitos
de trabajo que figuran en los filtros disponibles en análisis territorial y podrá ser
utilizado en los análisis que desee el usuario.
Se ha seleccionar previamente el elemento zonal,
es decir, la isla dónde llevará a cabo el análisis
Figura 120. Pantalla de los filtros para seleccionar el ámbito territorial de la consulta.
En el caso de los ámbitos temporales (ver creación de ámbitos), el usuario validado debe
haberlo definido previamente para que aparezca en el listado de ámbitos temporales y pueda
seleccionarse.
f. Filtros de localidades y carpetas.
Si el catálogo representa especies que se distribuyen en un ámbito territorial que no está
definido el usuario validado puede crearlo desde la opción localidad (ver creación de ámbitos)
pulsando el botón nuevo.
En el caso de que un usuario validado no disponga de una carpeta creada para almacenar la
capa de riqueza lo puede hacer desde la opción carpetanuevo (ver creación de carpeta).
g. Ejecutar la consulta de un catálogo.
Una vez se han seleccionado todos los filtros del catálogo queda solamente ejecutar la
consulta pulsando crear catálogo.
En este momento el catálogo que se desea crear aparece en la pantalla principal de gestión de
capas en catálogo pendientes, es decir, se está a la espera de que se ejecute la consulta en
el servidor, si no es muy pesada la espera será de unos minutos, en cualquier caso podemos
ver el estadoen proceso.
Se pueden ejecutar tantas consultas como el usuario necesite de forma sucesiva, que
aparecerán en cola a la espera del tiempo de ejecución. Una vez haya transcurrido el tiempo y
se haya generado la capa aparecerá debajo de la opción capas generado.
114
Manual de usuario - ATLANTIS 3.3
Figura 121. Pantalla del estado de ejecución del catálogo generado.
Caducidad del catálogo:
- En el caso de usuarios sin validación los catálogos generadas se perderán en el
momento que se cierre la aplicación y el navegador. Para evitar la pérdida se pueden
exportar.
- En el caso de usuarios validados los catálogos generados están disponibles para su
visualización durante 30 días (fecha de caducidad), transcurrido este período se
eliminarán sin previo aviso.
h. Exportar e importar el filtro de consulta de un catálogo o checklist.
Una vez se haya ejecutado la consulta de un catálogo se puede exportar los parámetros filtro y
almacenarlos para poder ejecutarlo automáticamente siempre que el usuario lo requiera sin
tener que seleccionar nuevamente todos y cada uno de los filtros.
Pulsando, se exporta y almacena en el directorio de descargas del PC del usuario un
archivo kml, con todos los parámetros de la consulta.
Figura 122. Pantalla de filtros utilizados en la ejecución de un catálogo o checklist.
Si el usuario en consultas futuras quiere recuperar este filtro y aplicarlo automáticamente desde
la pantalla de nuevo catálogo o checklistexaminarse localiza en el directorio del PC el
archivo kml se seleccionaImportarcrear catálogo. Se ejecutará la consulta sin tener que
pulsar cada uno de los filtros, con lo que se agiliza el tiempo de consulta.
115
Manual de usuario - ATLANTIS 3.3
5.3.2.2. Visualizar un catálogo o checklist
Para visualizar un catálogosobre el nombre del catálogo se visualiza un pdf, donde figuran
todos los taxones que hemos seleccionado y cada una de las columnas, que se corresponden
con los filtros elegidos en la consulta.
En esta pantalla se puede almacenar en formato pdf, o imprimir.
Figura 123. Pantalla de resultado de un catálogo o checklist en formato pdf.
En la parte inferior de la pantalla de visualización, está el botón exportar, que permite al usuario
la exportación del catálogo a formato txt, para poder utilizarlo en otro programa informático,
como Excel.
Figura 124. Pantalla con las opciones de exportación.
Si el usuario elije la opción abrir con Excel, la consulta se transforma automáticamente en una
tabla con tantas columnas como filtros haya utilizado. También permite abrir el resultado con el
bloc de notas. Si se selecciona guardar archivo se almacena en la carpetadescargas, en
formato txt.
116
Manual de usuario - ATLANTIS 3.3
Imprimir desde análisis territorial. Catálogo o checklist.
Figura 125. Pantalla de resultado de un catálogo o checklist en formato pdf.
Se genera un archivo pdf que el usuario puede guardar o bien imprimir
utilizando el menú que se activa con la generación del pdf, o con el
existente en la barra de herramientas.
6. IMPORTAR/EXPORTAR (Sólo administradores del sistema)
La sección de de Importar/Exportar permite extraer o introducir datos en la base de datos.
Solamente tendrán acceso a esta sección los usuarios pertenecientes a los grupos
administradores o supervisores.
Existen dos modalidades a la hora de exportar/importar datos:
-
Completa: realiza una exportación/importación de toda la base de datos al completo.
Parcial: realiza una importación/exportación de datos relativos a documentos,
especies,... Esta modalidad no tiene en cuenta las tablas de análisis (capas, checklist,
mapas,...), usuarios, carpetas,...
La modalidad parcial permite actualizar una base datos con nueva información de documentos,
especies o taxonomía sin perder la configuración que ya tiene la base de datos que recibe la
importación.
117
Manual de usuario - ATLANTIS 3.3
Figura 126. Pantalla de exportación de datos.
El usuario debe establecer la ip de la máquina con la base de datos, el nombre de la base de
datos y los datos del usuario que tiene permiso de conexión a la base de datos. La modalidad
de exportación/importación se decide marcando o no el campo "Listado parcial".
En el momento de la instalación de la aplicación, el administrador debió configurar
correctamente las herramientas para permitir la exportación / importación.
7. CÁLCULO ÍNDICES DE RAREZA (Sólo administradores del
sistema)
Esta sección realiza el cálculo de los índices de rareza en la base de datos de la aplicación
sobre los datos de distribución de las especies existentes en la base datos. Solamente tendrán
acceso a esta sección los usuarios pertenecientes a los grupos administradores o supervisores.
El cálculo de los índices de rareza conlleva la ejecución de una serie de sentencias sql sobre la
base de datos de la aplicación. Estas sentencias realizan unos cálculos complejos que
requieren mucho tiempo para ejecutarse y consumen muchos recursos de la base de datos.
Por ese motivo de recomienda ejecutar este cálculo en horas de baja actividad de la aplicación.
118
Manual de usuario - ATLANTIS 3.3
Figura 127. Cálculo de los índices de rareza.
8. AUDITORÍA (Sólo administradores del sistema)
La sección de auditoría nos permite examinar las diferentes modificaciones que se han
realizado en la base de datos y el usuario que realizó dicha modificación. Dicha sección solo
está disponible si el usuario pertenece al grupo de administradores o supervisores. Permite
buscar registros por fecha, usuario, descripción, acción (Nuevo, Actualizar o Borrar) y
documento.
Para examinar un registro, el usuario debe pulsar sobre la columna “fecha” del registro que
desee examinar. En la pantalla siguiente se muestran los datos del registro: fecha, usuario,
acción, objeto sobre el que se realiza la acción, identificador de ese objeto (clave primaria) y
modificación realizada. En el campo de modificación se pueden dar los siguientes casos en
función de la acción:

Nuevo: se muestra el valor que tiene cada uno de las columnas de la nueva entidad a
almacenar.

Actualizar: muestra el valor anterior de la columna actualizada y el nuevo valor que se
escribe.

Borrar: se muestra el valor que tiene cada uno de las columnas de la entidad antes de
ser borrada.
119
Manual de usuario - ATLANTIS 3.3
Figura 128. Selección de fecha para una consulta de auditoría.
9. CARGA MASIVA DATOS (Sólo administradores o usuarios de
carga)
Esta herramienta de la aplicación permite subir un fichero zip con imágenes y datos
georreferenciados de las especies para ser añadidos automáticamente a la aplicación.
La página permite subir un fichero zip e indicar una dirección de correo electrónico. Cuando se
sube el fichero al servidor, la aplicación avisa que empezará a procesar el fichero en segundo
plano y enviará un email a la dirección indicada con el resultado de la carga masiva de datos.
El fichero zip puede tener un conjunto de ficheros imágenes con un nombre determinado y/o un
fichero csv.
Imágenes
Cada fichero imagen debe tener un nombre determinado para poder asignarla a la especie
adecuada.
El
nombre
debe
ser:
codigoDocumento_codigoEspecie_XXXX.jpg.
“codigDocumento” es el código Pelcrin del documento que realizará la asociación entre la
imagen y la especie. “codigoEspecie” es el código de la especie a la que se asocia dicha
imagen en el documento. XXXX será el nombre que tenga la imagen en la aplicación.
Si la especie no estuviera citada en ese documento, se cita automáticamente al añadirla la
imagen. Si el nombre de la imagen no fuera correcto, se descarta esa imagen y se continúa
con la siguiente.
Fichero CSV
El fichero csv permite definir un conjunto de datos georreferenciados para ser añadidos a una
especie en un documento. La información de cada fila se introduce en la distribución de la
especie con los datos indicados para el documento señalado en la fila. Solo se procesará un
fichero con extensión “.csv” localizado en el fichero zip.
Un ejemplo del fichero csv podría ser:
#Documento;Codigo Especie;Nombre especie;Nombre subnomine;
#Codigo documentojustifica;Ano cita;UTMx;UTMy;Precision;Confianza;
#Nidificacion;Extincion;Varamiento
A00005;A07244;;;;2015;458248,75;3114173,97;1;2;true;false;false
A00001;C00744;Abortiporus biennis (Bull.) Sing;;;2015;649930;3231685;1;2;true;false;false
A00001;C00744;Abortiporus biennis (Bull.) Sing;;;2015;647258;3216750;1;2;false;true;false
A00001;C00744;Abortiporus biennis (Bull.) Sing;;;2015;616909;3197363;1;2;false;false;true
A00001;C00744;Abortiporus biennis (Bull.) Sing;;;2015;630262;3200854;1;2;false;false;false
120
Manual de usuario - ATLANTIS 3.3
El formato de cada línea son un conjunto de datos o campos separados por el carácter “;”.
Deben estar presentes todos los campos esperados (aunque estén vacíos) y en el orden
indicado. Si falta un campo o tiene datos no válidos, no se procesa esa línea y se pasa a la
siguiente.
El orden los campos esperados es el siguiente:
1. Código documento: campo obligatorio y no debe ser vacío
2. Código especie/subespecie: campo obligatorio y no debe ser vacío
3. Nombre de la especie/subespecie: campo opcional y puede ser vacío. Actualmente no
se procesa.
4. Nombre de sub nomine: campo opcional y puede ser vacío. Actualmente no se
procesa.
5. Código de documento que justifica el sub nomine: campo opcional y puede ser vacío.
Actualmente no se procesa.
6. Año de la cita: campo obligatorio y no debe ser vacío. Su contenido debe ser numérico.
7. UTMx: coordenada x en UTM de la posición de la especie. Campo obligatorio y no
debe ser vacío. Su contenido debe ser numérico.
8. UTMy: coordenada y en UTM de la posición de la especie. Campo obligatorio y no
debe ser vacío. Su contenido debe ser numérico.
9. Nivel precisión: campo obligatorio y no debe ser vacío. Su contenido debe ser
numérico. Puede tener los valores 1,2,3 ó 4
10. Confianza: campo obligatorio y no debe ser vacío. Su contenido debe ser numérico.
Puede tener los valores 1,2 ó 3. El valor 1 indica “Seguro”, el 2 ·Dudoso” y el 3
“Equívoco”.
11. Nidificación: campo opcional y puede ser vacío. Sus valores deben ser “true” o “false”.
12. Extinción: campo opcional y puede ser vacío. Sus valores deben ser “true” o “false”.
13. Varamiento: campo opcional y puede ser vacío. Sus valores deben ser “true” o “false”.
Las líneas que empiezan por el símbolo “#” no se procesan porque se consideran comentarios.
También tener en cuenta que el contenido de los campos no deben contener el carácter “;” ya
se considera un delimitador de campo y produciría un error en esa fila.
Cuando la aplicación termina de procesar el fichero zip, envía a la dirección de correo
electrónico un informe del resultado de la carga de datos. Dicho informa indica el fichero zip
procesado, la tarea que hizo la carga a efectos de auditoría, el número de líneas procesadas, el
número de ficheros y los errores que se han detectado tanto en el fichero csv como en las
imágenes.
Como resultado del procesamiento del fichero zip, todas las líneas del fichero csv o las
imágenes que hayan producido un error (se mencionan en el email de resultado) no se han
procesado correctamente y no se han introducido en la aplicación, El resto de líneas del fichero
CSV y las imágenes se han procesado correctamente y han sido introducidas en la aplicación.
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