Servicios Plataforma Tecnológica de Proteómica La plataforma de Proteómica tiene como objetivo dar apoyo y asesoramiento técnico y ofrecer servicios en el campo de la Proteómica, tanto a los investigadores de centros públicos como del sector privado; también desarrolla sus propios proyectos, así como en colaboración. La plataforma ofrece la tecnología para llevar a cabo análisis mediante espectrometría de masas que van desde la determinación de masas moleculares hasta análisis proteómicos complejos, como la cuantificación del nivel de expresión proteica. La unidad cuenta con infraestructura de última generación y personal calificado para la realización de servicios e para iniciar nuevos proyectos. Además, la unidad es parte de ProteoRed-ISCIII, la red Española de Proteómica, que promueve nuevas tecnologías y la excelencia en los servicios ofrecidos por los laboratorios miembros. La PT de Proteómica se compromete a ofrecer un servicio de calidad, personalizado y confidencial, con buena comunicación y flexibilidad. En la plataforma se lleva a cabo una amplia gama de actividades rutinarias relacionadas con la identificación de proteínas y el análisis de expresión diferencial de proteínas, tales como: Digestión enzimática de las proteínas. Dependiendo de la secuencia primaria de una proteína diferentes enzimas pueden ser usadas para obtener péptidos adecuados para ser analizadas por espectrometría de masas. Identificación de proteínas mediante la digestión enzimática, análisis por espectrometría de masas y la búsqueda en base de datos (los motores de búsqueda MASCOT y Sequest, y los software Proteome Discoverer y Peaks Studio están disponibles en el laboratorio. Además, tenemos acceso al motor de búsqueda Phenyx en un servidor privado). Análisis de huella peptídica y de espectros de fragmentación de péptidos (MALDI-fingerprinting-MS/MS). Se utiliza para identificar proteínas puras y/o spots de geles 2-DE. Separación de péptidos por cromatografía líquida acoplada a espectrometría de masas (LC-MS/MS). Se utiliza para identificar proteínas en muestras de complejidad moderada/alta, en términos de número de proteínas. Identificación y cuantificación relativa del nivel de expresión de proteínas mediante análisis por espectrometría de masas (LC-MS/MS). Marcaje isobárico (iTRAQ). Permite la comparación de hasta 8 muestras. Sin marcaje (label-free). Identificación y caracterización de modificaciones postraduccionales (PTMs) de proteínas (LC-MS/MS). Fosforilación con o sin enriquecimiento de fosfopéptidos con dióxido de titanio (TiO2). Acetilaciones, metilaciones. Secuenciación de péptidos por espectrometría de masas (MS/MS). Una metodología que puede utilizarse para obtener la secuencia de aminoácidos parcial o completa de péptidos. Es aplicable para péptidos con masa inferior a 3000 Da. Determinación de molecular masa por espectrometría de masas (MALDI-TOF MS). Se aplica a la caracterización de la masa molecular mediante espectrometría de masas. Preparación de muestras. Precipitación de proteínas con el fin de obtener un extracto sin contaminación de sales o lípidos. Cuantificación de proteínas totales por Bradford o similar. Eliminación de interferentes utilizando filtros, membranas, cartuchos o columnas específicas. Separación de proteínas mediante electroforesis bidimensional (2-DE). Dependiendo de la complejidad y cantidad de las muestras, la 2-DE puede hacerse en mini geles (8 x 7 cm) o en geles grandes (20 x 20 cm). Análisis de imágenes de geles (como auto-usuario). Se lleva a cabo comparando el patrón de proteínas y realizando la cuantificación relativa de la abundancia de proteínas en diferentes muestras. Asesoramiento de auto-usuarios de electroforesis bidimensional y espectrometría de masas. Proporciona acceso y asesoramiento técnico a grupos públicos y privados que no tienen la infraestructura para llevar a cabo experimentos de electroforesisis bidimensional y análisis de espectrometría de masas MALDI-TOF. Tel. +34 934 034 653 · pproteomica@pcb.ub.cat · www.pcb.ub.cat 01