Epidemiología veterinaria, primer semestre de 2013. Daniel

Epidemiología veterinaria, primer semestre de 2013. Daniel Martínez Bello.
Universidad Cooperativa de Colombia, Bucaramanga.
Medidas de frecuencia
Periodo estudio: para determinar una medida de frecuencia de enfermedad para uso en
un estudio, se debe determinar el periodo de tiempo durante el cual el estudio se debe
realizar, se determina usualmente en términos de tiempo calendario, pero puede ser un
punto en el tiempo.
Periodo de riesgo: es el tiempo durante el cual el individuo puede desarrollar la
enfermedad de interés.
Población cerrada: es una población en la cual no hay adiciones por la duración del
estudio y existen pocas pérdidas o ninguna. La duración del estudio puede definirse en
términos de tiempo calendario (ejemplo, hatos de vacas lecheras seguidas durante un
año, o hembras porcinas de reproducción seguidas por seis meses), o en términos de
algún evento en la vida de los animales (hembras lecheras en los primeros dos meses de
lactancia, o hembras porcinas en el periodo de lactancia).
Población abierta: es una población en la cual los animales están dejando o entrando a
la población a través del periodo de estudio (los casos que llegan a una clínica
veterinaria).
Incidencia
Corresponde al número de eventos nuevos (casos nuevos de una enfermedad) en una
población definida dentro de un periodo especifico de tiempo.
Riesgo de incidencia (incidencia acumulada) (riesgo): es la proporción de individuos
inicialmente susceptibles en una población quienes llegan a ser nuevos casos durante un
periodo definido de seguimiento.
𝑅𝑖𝑒𝑠𝑔𝑜 𝑑𝑒 𝑖𝑛𝑐𝑖𝑑𝑒𝑛𝑐𝑖𝑎 =
𝑁ú𝑚𝑒𝑟𝑜 𝑑𝑒 𝑐𝑎𝑠𝑜𝑠 𝑖𝑛𝑐𝑖𝑑𝑒𝑛𝑡𝑒𝑠
𝑁ú𝑚𝑒𝑟𝑜 𝑑𝑒 𝑖𝑛𝑑𝑖𝑣𝑖𝑑𝑢𝑜𝑠 𝑖𝑛𝑖𝑐𝑖𝑎𝑙𝑚𝑒𝑛𝑡𝑒 𝑒𝑛 𝑟𝑖𝑒𝑠𝑔𝑜
Para poblaciones cerradas, el denominador simplemente es el número de individuos libres
de la enfermedad presentes al momento de inicio de periodo de seguimiento.Como
ejemplo se puede considerar como población cerrada, un hato de ganado lechero, si solo
se consideran las hembras que tienen parto en el periodo de estudio.
Para poblaciones abiertas, se debe tener en cuenta los individuos que entran y salen de la
población. Como ejemplo, si se consideran todas las hembras que componen un hato
lechero, ya sea que estaban lactando y luego entraban en secado, y posteriormente
entraban nuevamente a lactancia.
Tasa de incidencia (densidad de incidencia) (incidencia): es el número de casos
nuevos de la enfermedad que ocurren por unidad de tiempo de los individuos a riesgo
durante un periodo definido de seguimiento.
𝑇𝑎𝑠𝑎 𝑑𝑒 𝑖𝑛𝑐𝑖𝑑𝑒𝑛𝑐𝑖𝑎 =
𝑁ú𝑚𝑒𝑟𝑜 𝑑𝑒 𝑐𝑎𝑠𝑜𝑠 𝑖𝑛𝑐𝑖𝑑𝑒𝑛𝑡𝑒𝑠
𝐶𝑎𝑛𝑡𝑖𝑑𝑎𝑑 𝑑𝑒 𝑡𝑖𝑒𝑚𝑝𝑜 𝑑𝑒 𝑙𝑜𝑠 𝑖𝑛𝑑𝑖𝑣𝑖𝑑𝑢𝑜𝑠 𝑒𝑛 𝑟𝑖𝑒𝑠𝑔𝑜
Ejemplo
Condiciones generales, hato 17 hembras en producción. El evento de interés es mastitis.
Periodo de estudio 01 de junio de 2011 a 31 diciembre de 2011.
Id
Detalles
Eventos
01
02
03
04
Secado 19 jun, parto 28 sep, mastitis 21 oct
Secado 24 ago, parto 18 oct
Secado 18 sep, parto 02 dic, mastitis 26 dic
Parto 01 jun, mastitis 16 julio, mastitis 12
ago,
Parto 14 jun, mastitis 03 ago,
Parto 19 jun, mastitis 02 sep ,
Parto 03 jul, mastitis 11 sep,
Parto 17 jul,
Secado 20 jun, Parto 18 ago, mastitis 14
sep,
Secado 29 jun, Parto 25 ago, muerte 05
sep,
Secado 17 jul, Parto 07 sep, mastitis 25
sep,
Secado 03 ago, Parto 24 sep,
Secado sep 18, Parto 07 oct, mastitis 18
oct, mastitis 22 nov,
Secado sep 12, Parto 22 oct,
Secado 25 ago, Parto 09 nov, vendida 14
dic,
Secado sep 23, Parto 12 nov, mastitis 03
dic,
Secado 15 oct, Parto 02 dic, babesia 28 dic,
Total
1
05
06
07
08
09
10
11
12
13
14
15
16
17
1
2
1
1
1
1
Días
en
riesgo a 31
diciembre,
múltiples
eventos
94
74
29
213
200
195
181
167
135
Días
en
riesgo a 31
diciembre,
Un
solo
evento
23
74
24
27
50
75
70
167
27
11
11
1
115
2
98
85
70
35
18
98
11
70
35
1
49
12
29
1780
21
29
830
Ejemplo de incidencia
Se va a considerar los animales que han parido en el periodo de 1 de junio a 31 de
diciembre de 2011. Se considera como una población cerrada. Se hace el cálculo
asumiendo que una hembra puede tener varios casos nuevos.
Total individuos en riesgo: 17 hembras.
Total de nuevos casos: 12 casos de mastitis.
Riesgo de incidencia (riesgo)=12/17=0.7058 = 70.5% en un periodo de seis meses.
Tasa de incidencia (incidencia) = 12 casos por 1780 vaca-día (equivalente a 2.46 casos
por vaca-año, o 1.22 casos por vaca-semestre.
Si se considera una población cerrada, y se asume que la hembra solo enfrenta un caso
nuevo. Cuando la hembra se reporta con el evento, ya no pertenece mas al grupo en
riesgo.
Total individuos en riesgo: 17 hembras.
Total de nuevos casos: 10 casos de mastitis.
Riesgo de incidencia (riesgo)=10/17=0.588 = 58.8% en un periodo de seis meses.
Tasa de incidencia (incidencia) = 10 casos por 830 vaca-día (equivalente a 4.39 casos por
vaca-año, o 2.19 casos por vaca-semestre.
Prevalencia
La prevalencia relaciona los casos de enfermedad existente en un punto específico en el
tiempo, más que los casos nuevos sobre un periodo de tiempo. La prevalencia es el
número de individuos en una población que tienen un atributo o enfermedad en un
momento particular del tiempo.
𝑃𝑟𝑒𝑣𝑎𝑙𝑒𝑛𝑐𝑖𝑎 =
𝑁ú𝑚𝑒𝑟𝑜 𝑑𝑒 𝑐𝑎𝑠𝑜𝑠 𝑑𝑒 𝑒𝑛𝑓𝑒𝑟𝑚𝑒𝑑𝑎𝑑 𝑑𝑒 𝑙𝑎 𝑝𝑜𝑏𝑙𝑎𝑐𝑖ó𝑛 𝑒𝑛 𝑢𝑛 𝑝𝑢𝑛𝑡𝑜 𝑒𝑛 𝑒𝑙 𝑡𝑖𝑒𝑚𝑝𝑜
𝑁ú𝑚𝑒𝑟𝑜 𝑑𝑒 𝑎𝑛𝑖𝑚𝑎𝑙𝑒𝑠 𝑑𝑒 𝑙𝑎 𝑝𝑜𝑏𝑙𝑎𝑐𝑖𝑜𝑛 𝑒𝑛 𝑟𝑖𝑒𝑠𝑔𝑜 𝑒𝑛 𝑒𝑙 𝑚𝑖𝑠𝑚𝑜 𝑡𝑖𝑒𝑚𝑝𝑜
Medidas de asociación
Considerando un estudio donde los sujetos están libres de una enfermedad al comienzo
del periodo de estudio, y todos son monitoreados para la ocurrencia de la enfermedad por
un periodo especifico de tiempo. Tanto la exposición, como el estado de enfermedad son
variables binarias, se pueden presentar los conteos de los sujetos en cada una de la
cuatro categorías de exposición enfermedad en una tabla 2 x 2.
Enfermo
Expuesto
a
No expuesto c
Total
a+c
No enfermo
b
d
b+d
Total
a+b
c+d
a+b+c+d=n
Se pueden calcular varias medidas de asociación:
1. Medidas de fortaleza
2. Medidas de efecto
3. Medidas de efecto total
Para calcular estas medidas de pueden calcular primero las siguientes medidas de
resumen:
Riesgo de incidencia en la población expuesta:
Riesgo de incidencia en la población no expuesta
Riesgo de incidencia en la población total
Odds de enfermedad en la población expuesta
Odds de enfermedad en la población no expuesta
Odds de enfermedad en la población total
𝑎
(𝑎 + 𝑏)
𝑐
𝑅𝑁𝐸 =
(𝑐 + 𝑑)
(𝑎 + 𝑐)
𝑅𝑡𝑜𝑡𝑎𝑙 =
(𝑎 + 𝑏 + 𝑐 + 𝑑)
𝑎
𝑂𝐸 =
𝑏
𝑐
𝑂𝑁𝐸 =
𝑑
(𝑎 + 𝑐)
𝑂𝑡𝑜𝑡𝑎𝑙 =
(𝑏 + 𝑑)
𝑅𝐸 =
Medidas de fortaleza
Razón de riesgos de incidencia: se define como el riesgo de enfermedad en el grupo
expuesto, dividido por el riesgo de incidencia de enfermedad en el grupo no expuesto.
𝑅𝑅 =
𝑅𝐸
𝑅𝑁𝐸
Razón de tasas de incidencia: se define como la tasa de incidencia en el grupo
expuesto, dividido por la tasa de incidencia de enfermedad en el grupo no expuesto.
El termino riesgo relativo se utiliza como sinónimo para las razones de riesgo de
incidencia y de tasa de incidencia. Ambas razones tienen un rango entre 0 e infinito.
Razón de Odds
La razón de odds se define como los odds de enfermedad en el grupo expuesto dividido
por los odds de enfermedad en el grupo no expuesto.
𝑅𝑂 =
𝑂𝐸
𝑎𝑑
=
𝑂𝑁𝐸 𝑏𝑐
Medidas de efecto en la población expuesta
Riesgo atribuible (tasa): se define como el incremento o disminución en el riesgo (o
tasa) de enfermedad en el grupo expuesto que es atribuible a la exposición.
𝑅𝐴 = 𝑅𝐸 − 𝑅𝑁𝐸
El número necesario a tratar (NNT), es el número de sujetos quienes debieron haber
recibido la exposición para prevenir que un resultado negativo ocurriera.
𝑁𝑁𝑇 =
1
𝑅𝐴
Medidas de efecto en la población
Riesgo atribuible a la población
Mide el incremento en riesgo de enfermedad en la población que es atribuible a la
exposición. D+ es la población enferma, mientras que E- es la población que no ha sido
expuesto, (D+|E-) es la población enferma que no se ha expuesto.
𝑅𝐴𝑃 = 𝑅𝑡𝑜𝑡𝑎𝑙 − 𝑅𝑁𝐸
Fracción atribuible en la población
Es la proporción de la enfermedad en la población que es atribuible a la exposición.
𝐹𝐴𝑃 =
𝑅𝑇𝑂𝑇𝐴𝐿 − 𝑅𝑁𝐸
𝑅𝑇𝑂𝑇𝐴𝐿
Ejemplo del libro Veterinary Epidemiologic Research, Dohoo, Martin, Stryhn, 2004, página
129. Suponga que usted desea establecer si estar sobre condicionado al momento del
parto, afecta el riesgo de la vaca de desarrollar cetosis. Una condición corporal superior a
4.0 o igual puede considerarse sobre condicionado. Se lleva a cabo un estudio de
cohortes, en un hato lechero, y todas las vacas son observadas del nacimiento a los 4
meses de lactancia. Además de registrar el número de vacas en cada grupo de condición
corporal que desarrollaron o no cetosis, se registro el número de vacas-mes en riesgo.
Una vez la vaca se diagnosticaba con cetosis, ella ya no contribuía al número de vacasmes en riesgo. Esto ocurrió en promedio a los dos meses postparto.
Cetosis +
Cetosis -
Condición corporal
≥4
<4
60
157
41
359
Vacas
101
Vaca-mes 284
Calcule medidas de frecuencia y asociación.
516
1750
Total
Total
217
400
617
2034