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AVANCES EN LA IMPLEMENTACIÓN GRIN GLOBAL RRGG E-IQUIZE y A BLANCO

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AVANCES EN LA IMPLEMENTACIÓN DEL SISTEMA DE
DOCUMENTACIÓN GRIN-GLOBAL EN EL BANCO
NACIONAL DE RECURSOS GENÉTICOS DE BOLIVIA.
Alfonso Blanco1 y Edwin Iquize1
1
Instituto Nacional de Innovación Agropecuaria y Forestal
ablanco03@yahoo.com; e_iquize_v@hotmail.com
Resumen
Con el objetivo de implementar el sistema de documentación GRIN-Global al Banco Nacional de
Germoplasma de Bolivia, para coadyuvar la conservación de los recursos genéticos administrados por
el INIAF, se evaluó el GRIN-Global teniendo los siguientes procedimientos: Revisión de manuales e
instalación de programas; En el manejo de programa se definió Usuarios; Introducción de datos en la
herramienta Curador y Administrador; Identificación de Accesiones; Taxonomía; Pasaporte; Caracterización
y Evaluación; Inventario, Informes e Inclusión de fotografías. Asimismo para usuarios externos se
dispone de un portal en formato Web donde se visualiza información de las accesiones incluyéndose
su distribución en un mapa. Todo este procedimiento se aplicó en primera instancia a la Colección de
Tubérculos y Raíces. Se tiene planificado vaciar la información del Banco Nacional de Germoplasma
en el siguiente orden: Granos Altoandinos, Tubérculos y Raíces, Hortalizas, Cereales y Leguminosas,
Forestales y Frutales. Entre las conclusiones preliminares se tiene que el GRIN-Global: es una poderosa
herramienta, bajos costos de implementación, es flexible y posible de adecuar al requerimiento del banco
y permitirá coadyuvar a los Curadores.
Palabras claves: GRIN-Global, Sistema de documentación, Conservación de Recursos Genéticos, Base de datos de Recursos
Genéticos.
Introducción
Obsérvese en el manejo de los Recursos Genéticos
se considera cuatro pilares o áreas (Conservación,
Documentación,
Promoción
del
Uso
e
Investigación), donde cada una de ellas presenta
una serie de actividades y con ellas una serie de
variables, todas ellas relacionadas por el código de
la Accesión. En ese sentido, la Base de Datos de
estos recursos genéticos tiene gran relevancia en
la Documentación además de generar información
resumida (estadística descriptiva) que permite al
Responsable o Curador del Banco tomar decisiones
referidas a actividades de conservación (Engels y
Visser 2007; Iquize, 2013).
Bajo estos antecedentes se tiene el objetivo de
implementar el sistema de documentación GRINGlobal al Banco Nacional de Germoplasma.
Materiales y métodos
El GRIN-Global
El GRIN-Global es un sistema de documentación
que permite a los Bancos de Germoplasma almacenar
y gestionar su información de recursos genéticos
(o germoplasma) y mostrar esa información en
la Internet. Este sistema está siendo desarrollado
mediante un esfuerzo conjunto entre el Fondo para
la Diversidad de Cultivos (Global Crop Diversity
Trust), Bioversity Internacional, y el Servicio de
Investigación Agrícola (ARS) del Departamento
de Agricultura de los Estados Unidos (USDA)
(GRIN-Global, 2010).
Estructura del GRIN-Global
La arquitectura del sistema utiliza tres niveles de:
base de datos, negocios y presentación (Figura
1) que se puede desarrollarse y modificarse
independientemente.
Memoria 2014 INIAF
129
Estructura del GRIN-Global
La arquitectura del sistema utiliza tres niveles de: base de datos, negocios y presentación
(Figura 1) que se puede desarrollarse y modificarse independientemente.
130
Nivel de Presentación
(Navegador Web)
Nivel de Presentación
(Cliente de Escritorio)
Nivel de Presentación
(PDAs)
Nivel de Negocios
(Servicios Web)
Nivel de Base de Datos
(MS SQL Server, Postgre SQL, My SQL y Oracle)
Figura 1. Estructura
los niveles
del sistema
dededocumentación
GRIN-Global.
Figura 1. de
Estructura
de los niveles
del sistema
documentación GRIN-Global.
El Nivel
de de
Base
de Datos.
Está formada
o más
motores de
bases de datos
que
El Nivel
de Base
Datos.
Está formada
por uno por
• uno
Cliente
de escritorio
(Herramienta
Curador):
realizan
todo
el
almacenamiento
de
datos,
reciben
solicitudes
de
almacenamiento
o
o más motores de bases de datos que realizan todo
permite trabajar en un propio computador,
recuperación de
de datos,
información
desde el Nivel
de su
Negocio
[Microsoft
SQL Server,
Postgrea
el almacenamiento
reciben solicitudes
de
distribución
es limitada,
está orientada
SQL
(sistema
de
gestión
de
base
datos
relacional
y
multiusuario
de
código
abierto),
almacenamiento o recuperación de información
usuarios que tienen un conocimiento básicoMy
de
SQL
(sistema
de
gestión
de
bases
de
datos
relacional,
y multiusuario
dediseñada
Oracle
desde el Nivel de Negocio [Microsoft SQL Server,
manejo multihilo
de Recursos
Genéticos. Está
Corporation)
y Oracle].
Postgre
SQL (sistema
de gestión de base datos
para el manejo de la base de datos, es decir
relacional
y de
multiusuario
abierto),
permite
insertar,
actualizar y eliminar
registros.
El Nivel
Negocios. de
Estecódigo
Nivel se
comunica con
el Nivel
de Presentación,
para recibir
las
My solicitudes
SQL (sistema
de
gestión
de
bases
de
datos
y presentar los resultados; y con el Nivel de Base de Datos, para solicitar al
• Cliente basado en un explorador web: Es la
relacional,
y datos,
multiusuario
de Oracle
gestor multihilo
de base de
almacenar
o recuperar datos de él [XML (Lenguaje de marcas
página web que puede ser visitada por cualquier
Corporation)
y Oracle].
extensible,
desarrollado por World Wide Web]. tipo de usuario. Diseñado para la búsqueda y
El Nivel
de Presentación.
Conocida
gráfica de
y debe
tener la característica de
El Nivel
de Negocios.
Este Nivel se
comunicacomo
con interfaz
realización
pedidos.
ser "amigable"
(entendible
y fácil
de usar), se presenta como una página web.
el Nivel
de Presentación,
para recibir
las solicitudes
GRIN-Global
y presentar
los resultados;
y con el Nivel
de Base Implementación
 Cliente
de escritorio
(Herramienta
Curador): permitedel
trabajar
en un propio
de Datos, para solicitar al gestor de base de datos,
computador, su distribución es limitada, está orientada a usuarios que tienen un
almacenar o recuperar datos de él [XML (Lenguaje de Según el Manual de Procedimientos y
conocimiento básico de manejo de Recursos Genéticos. Está diseñada para el manejo de
marcas extensible, desarrollado por World Wide Web]. Recomendaciones para empezar con el GRINla base de datos, es decir permite insertar,Global
actualizar
y eliminar
(2014),
cuandoregistros.
una institución o banco

Cliente
basado
en
un
explorador
web:
Es
la
página
web
que
ser base
visitada
por
con una
de datos
El Nivel de Presentación. Conocida como de germoplasma comienzapuede
cualquier
tipotener
de usuario.
Diseñado
para lanueva
búsqueda
y realización
pedidos.
o vacía,
es necesariodeseguir
un orden para
interfaz gráfica
y debe
la característica
de ser
la
introducción
correcta
de
su
información,
a
“amigable”
(entendible
y
fácil
de
usar),
se
presenta
Implementación del GRIN-Global
continuación
se
describe
estos
pasos:
comoSegún
una página
web. de Procedimientos y Recomendaciones para empezar con el GRIN-Global
el Manual
(2014), cuando una institución o banco de germoplasma comienza con una base de datos
a. nueva
Taxonomía
h. la
Usuarios
o vacía, es necesario seguir un orden para
introducción correcta de su información,
a
continuación
se
describe
estos
pasos:
b. Grupos de código y Códigos.
i. Seguridad.
c. Sitios y códigos de sitio.
j. Descriptores de cultivos.
d. Cooperadores.
k. Códigos y Origen del Hábitat.
e. Políticas de mantenimiento de Inventario.
l. Pasaporte de datos
f. Métodos.
m. Información general de Inventario.
g. Región y Geografía.
n. Ordenes en general.
Colecciones administradas por el INIAF
A continuación se presenta las colecciones que se
Memoria 2014 INIAF
introducirán al sistema de documentación GRINGlobal. Nótese que éstas están digitalizadas en
formatos de Excel y Access.
Cuadro 1. Colecciones que se documentaran con el GRIN-Global.
Colecciones
Tubérculos y raíces
Granos alto andinos
Forestales
Cereales y leguminosas
Hortalizas
Nombre común de las Especies
Papa, Oca, Papalisa, Isaño, Arracacha, Achira, Ajipa, Yacón, Maca y Walusa
Amaranto, Cañahua, Paico y Quinua
Maderables y no maderables, alimenticios e industriales
Trigo, Maíz, Arveja, Haba, Tarwi, Frijol, Maní,
Aji (Capsicum), Cucúrbitas, …
Resultados y discusión
almacenamiento 20 GB en disco.
Manejo del GRIN-Global
Revisión de manuales
•
En primera instancia la revisión del Manual de
Procedimientos Recomendados para empezar
con el GRIN-Global (2014) y posteriormente los
siguientes documentos: El Manual de Instalación
del GRIN-Global; y El Manual de Administración
del GRIN-Global
Se instalaron los prerrequisitos del GRINGlobal; Visual Studio Tools for Applications
2.0, SQL Server 2008, Framework 3.5 (Service
Pack 1) y otros.
•
Posteriormente se instálalo el actualizador
del GRIN-Global (GRIN Global Updater
programa) y este a sus vez instala los programas:
GRIN-Global Admin (Administrador del
GRIN-Global), GRIN-Global Base de datos,
GRIN-Global Search tols, GRIN-Global
Website (Local) y GRIN-Global Curator tools
(Herramienta de manejo del curador)
Existen varios manuales específicos que se
consultaron como la; Guía para importar datos
masivos al GRIN-Global, Guía para adicionar
usuario e implementar la seguridad y otros.
Instalación del GRIN-Global
Definición de Usuarios
El sistema de documentación GRIN-Global
trabaja en ambiente de redes (Intranet e Internet)
y por seguridad el sistema tiene previsto la
definición de usuarios para el uso del mismo como:
Definición de Usuarios
• El equipo debe tener un procesador mayor a Administradores, Curadores, Manejo de los datos
El Intel
sistema
GRIN-Global
en ambiente de redes (Intranet e
Coredei7 documentación
y sistema operativo
“Windows trabaja
y usuarios invitados.
Internet)
y porcomo
seguridad
el sistema
tiene previsto
la definición de usuarios para el uso del
Ultímate”
mínimo.
Capacidad
de
En la instalación del sistema de documentación
GRIN-Global en una computadora (Figura 2), se
consideraron los siguientes pasos:
mismo como: Administradores, Curadores, Manejo de los datos y usuarios invitados.
Figura 2. Ventana del actualizador (GRIN-Global Updater) para instalar los diferentes
Figura 2. Ventana del actualizador (GRIN-Global Updater) para instalar los diferentes programas del sistema.
programas
del sistema.
Introducción de datos
Memoria 2014 INIAF
Se está introduciendo los datos de las colecciones de Granos Antoandinos y Tubérculos y
Raíces. Asimismo por la cantidad de información que se tiene y la disponibilidad en
formato digital se está haciendo el uso herramientas para introducir datos en forma masiva
y no individualmente a través de GRIN-Global Admin.
131
132
Introducción de datos
Se está introduciendo los datos de las colecciones
de Granos Antoandinos y Tubérculos y Raíces.
Asimismo por la cantidad de información que se tiene
y la disponibilidad en formato digital se está haciendo
el uso herramientas para introducir datos en forma
masiva y no individualmente a través de GRIN-Global
Admin.
Codificación o identificación de las Accesiones
La identificación de las Accesiones, el GRIN-Global
tiene previsto el uso de un Prefijo, un Número y un
Sufijo de las Accesiones, esta identificación es única.
Así: Prefijo de la Accesión “BOL”, sigla asignada
internacionalmente a Bolivia; Número de Accesión,
empezando con 1 e indefinidamente hasta la última
accesión, no se repite; y Sufijo de la Accesión, por
ejemplo la colección de Tubérculos y Raíces es TR.
instalación. Se ha verificado previamente la taxonomía
de cada una de las accesiones que se introduzcan, debe
estar en el Sistema de lo contrario no es reconocida
por la base de datos del GRIN-Global y estas se
introducirán manualmente.
Datos pasaporte
Los datos pasaporte es la información que identifica
a las accesiones de un banco, en estas se detallan su
taxonomía, procedencia, nombres, pedigrí y otros
datos más. El GRIN-Global, tiene un orden de
introducción de datos de accesiones, estas deben
coincidir con la información que se está introduciendo.
En algunos casos se deben incluir en el GRIN-Global
la información que se está introduciendo. Se está
utilizando la herramienta “Admin Tools” para la
introducción masiva de datos al Sistema GRIN-Global.
Datos de caracterización y evaluación
Taxonomía
Los datos de Caracterización y Evaluación, tal vez son
los más útiles para nuestros usuarios finales, permite
ELLos
GRIN-Global
permite instalar la taxonomía
(datostal vez son los más útiles para nuestros usuarios
datos de Caracterización
y Evaluación,
identificar sus características y potencialidades de
Orden,
Familia,
Género,
Especies ysus
Subespecie),
al
finales,
permite
identificar
características
potencialidades
de las accesiones.
Porlos
lasyaccesiones.
Por Metodología,
se ha definido
momento de instalar el Sistema debe seleccionarse la
Metodología, se ha definido los descriptores dedescriptores
caracterización,
para el cultivo
de Papa
se
de caracterización,
para el cultivo
de Papa
opción de base de datos taxonomía en el proceso de
expone según al siguiente detalle:
se expone según al siguiente detalle:
Datos de caracterización y evaluación
•
•
•
•
 Nombre
Nombre
cultivo
deldel
cultivo
 Categoría
Categoría
descriptor
deldel
descriptor
 Nombre
Nombre
del descriptor
del descriptor
 Título del descriptor
Título del descriptor
•
•
•
•
 Descripción
Descripción
descriptor
deldel
descriptor
 Tipo
Tipodede
dato
dato
 SiSiesescodificado
codificado
 Código
Código
• Nombre
Nombredel
delcódigo
código

Título
del
código
• Título del código
 Descripción del código
• Descripción del código
 Idioma
• Idioma
Figura 3. Ventana
para
el cultivo
FiguraCurator
3. VentanaTool,
Curatorcon
Tool,descriptores
con descriptoresintroducidos
introducidos para
el cultivo
de Papade Papa
SeSe
estáestá
procediendo
a la aintroducción
masivamasiva
con la con
herramienta
“Admin “Admin
Tools” losTools”
datos descriptores
procediendo
la introducción
la herramienta
los datos
teniendo
en
cuenta
los
siguientes:
descriptores teniendo en cuenta los siguientes:
• Cultivo
Cultivo
Nombredel
del código
código
• Nombre
 Identificación de inventario
Datos de Inventario
Memoria
2014 INIAF
Los datos
de inventario,
•
•
Identificación de inventario
• Código
 Método (metodología
de caracterización)
 Códigode • Valor numérico
Método (metodología
caracterización)  Valor numérico
permite conocer con exactitud la ubicación y la existencia de
semilla que se tiene en el banco. Asimismo permite almacenar los datos de germinación y
calidad del inventario. En la colección de Tubérculos y Raíces se ha identificado que
existen datos de inventario en Campo, In Vitro e Invernadero de acuerdo al siguiente detalle
Datos de Inventario
Los datos de inventario, permite conocer con exactitud la ubicación y la existencia de semilla que se
tiene en el banco. Asimismo permite almacenar los datos de germinación y calidad del inventario. En la
colección de Tubérculos y Raíces se ha identificado que existen datos de inventario en Campo, In Vitro e
Invernadero de acuerdo al siguiente detalle de sus descriptores e introducida los datos masivamente con
la herramienta “Admin Tools”:
•
Códigos Accesión (Prefijo, Numero y Sufijo)
•
Disponible en la Web
•
Códigos Inventario (Prefijo, Numero y Sufijo)
•
Cantidad
•
Tipo de inventario
•
Unidad de distribución
•
Es distribuible
•
Cantidad critica de distribución
•
Es auto deducible
•
Cantidad critica de regeneración
•
Está disponible
•
Método de mantenimiento
•
Fecha de disponibilidad
•
Y otros más.
Reportes o Informes
Los reportes o informe, es la presentación de la
información resumida de datos específicos del
Banco que se imprimirá, como por ejemplo:
Impresión de etiquetas para la cosecha; Lista de
existencia de la cantidad de accesiones por especie;
Las accesiones que deben regenerarse; y Otros
más. Para este propósito en GRIN-Global utiliza
el Software (Programa) Crystal Report, que se
complementa al sistema.
Colecciones y su codificación
El Banco Nacional de Germoplasma de Bolivia
mantiene las colecciones (Cuadro 2) donde se
detalla las especies y la cantidad de accesiones que
se tiene.
Cuadro 2. Relación de recursos genéticos por Bancos de Germoplasma y especies.
Banco
Granos alto andinos
Tubérculos y raíces
Hortalizas
Forestales
Cereales y leguminosas
Especies
Amaranto, Cañahua, Paico y Quinua
Papa, Oca, Papalisa, Isaño, Arracacha, Achira, Ajipa, Yacón,
Maca y Walusa
Aji (Capsicum), Cucúrbitas, Solanum, ..
Maderables y no maderables, alimenticios e industriales
Trigo, Maíz, Arveja, Haba, Tarwi, Frijol, Mani,
Para una correcta identificación de las accesiones,
el personal de Recursos Genéticos definió para el
Banco de Germoplasma los siguientes aspectos:
El uso del Prefijo de la Accesión “BOL”, asignada
internacionalmente a Bolivia; y Número de
Accesión, empezando con 1 indefinidamente hasta
la última accesión, no se repite este número. Las
nuevas accesiones que llegaría el Banco, usarían
el Prefijo de Accesión “BOL”, el Número de
Accesión será correlativo a la última Accesión de
la última colección y el Sufijo de Accesión usara el
identificador de la colección.
Sufijo
GA
TR
HT
FO
CL
Publicación en la Web
A través de los servicios Web, los clientes
pueden acceder a la información del Banco de
Germoplasma; buscar por el número de accesión,
especie, nombre común, etc., para ver sus
características de ubicación y disponibilidad en el
inventario, imágenes y otras. Asimismo se puede
apreciar los datos de caracterización y evaluación.
Por último, es posible apreciar la distribución de
una especie en el Google Maps.
Memoria 2014 INIAF
133
Germoplasma; buscar por el número de accesión, especie, nombre común, etc., para ver sus
características de ubicación y disponibilidad en el inventario, imágenes y otras. Asimismo
se puede apreciar los datos de caracterización y evaluación. Por último, es posible apreciar
la distribución de una especie en el Google Maps.
134
Figura
4. Página
Web delde
Banco
de Germoplasma
Bolivia y datos
de una
Figura 4. Página
Web
del Banco
Germoplasma
dedeBolivia
y datos
deaccesión
una accesión
Figura 5. Página
delWeb
Banco
de deGermoplasma
de Bolivia
mostrando
la distribución
FiguraWeb
5. Página
del Banco
Germoplasma de Bolivia
mostrando
la distribución
geográfica de Solanum tuberosum
subsp
andigenum
geográfica de Solanum tuberosum subsp andigenum
Conclusiones
Conclusiones
GRIN-Global. 2013. MULTI-CROP PASSPORT
El GRIN Global es una poderosa herramienta queDESCRIPTORS.
permite manejar la
información del
www.ars-grin.gov/npgs/
El Banco
GRIN Global
es una
poderosa herramienta
que Posee gringlobal/docs/gg_multi_crop_passport_
Nacional
de Germoplasma
de Bolivia.
bajos costos de implementación para
las instituciones.
Es flexible
posible
de adecuar al descriptors_MCPD.pdf).
requerimiento del Banco
Nacional
permite
manejar la información
delyBanco
Nacional
(Marzo
2014, de
Germoplasma
de
Bolivia.
de Germoplasma de Bolivia. Posee bajos costos de
implementación
para las instituciones. Es flexible GRIN-Global. 2014. Inventory. (Acceso Marzo 2014,
Referencias citadas
y Engels,
posible de
adecuar
al requerimiento del Banco
www.ars-grin.gov/npgs/gringlobal/docs/gg_
J.M.M. y Visser, L. (eds.). 2007. Guía para el manejo eficaz de un banco de
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documento
Manuales
Germoplasma
No. en
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MULTI-CROP
PASSPORT
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Administrator’s
Quick
Guide
grin.gov/npgs/gringlobal/docs/gg_multi_crop_passport_descriptors_MCPD.pdf).
de manejo de información(Marzo
de los2014,
recursos
for Adding Users and Implementing Security.
genéticos
administrados
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Desarrollo Rural y Tierras. Estado Plurinacional
Agropecuaria
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Memoria 2014 INIAF
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