BQ 28. BASES MOLECULARES DE LAS ENFERMEDADES POR EXPANSIÓN DE NUCLEÓTIDOS (Dr Glez Castaño). I) INTRODUCCIÓN: BASES MOLECULARES EN GENERAL: Existen regiones en el DNA donde un determinado triplete se encuentra repetido. El número de repeticiones en la población normal es variable, pero nunca sobrepasa un determinado dintel. Por eso se dice que ese número de repeticiones es polimórfico pero estable. Cuando el número de repeticiones se expande y sobrepasa ese límite superior, entramos en un estado de inestabilidad génica en el que sigue siendo fenotípicamente normal, pero es ya una premutación. Por esa inestabilidad, el número de repeticiones puede dar otro salto en la siguiente generación y superar otro dintel para la aparición de la clínica. Con el paso de generaciones el número de repeticiones va aumentando; consecuentemente se producirá inicio más temprano de la enfermedad y una mayor gravedad (a esto se le llama anticipación). Es por ello por lo que decimos que la expansión de una secuencia repetida de trinucleótidos es una mutación dinámica: no permanece en el tiempo. Debido al cambio que supone pertenecer a una determinada generación, estás enfermedades se dice que tienen patrones inusuales de herencia, incluyendo dentro de ellos la anticipación. Existen dos tipos: Tipo 1.- la expansión del triplete en el DNA se traduce en su correspondiente expansión del aminoácido en la proteína porque tiene lugar en una región codificante. P.e: Enfermedad de Huntington. Tipo 2.- región que no se va a traducir: no afecta proteína. P.e: ataxia de Friedrich. Y es que la región repetida puede encontrarse en cualquier lugar de la cadena de DNA: - En un exón:, como es una región traducible, los tripletes repetidos darán lugar al correspondiente aminoácido repetido en la proteína. Es el caso de las enfermedades por expansión de repeticiones del triplete CAG (glutaminas): Enfermedad de Huntington, Atrofia muscular espino bulbar, Ataxia espino-cerebelosa tipos 1-7, Enfermedad de Machado Joseph, atrofia dentro-rubro-palidal. - En regiones de DNA que no se traducen: 1.- Región 5’ no traducible: ejemplo: Epilepsia progresiva mioclónica (EPM1). Cistatina B. Región 5’ flanqueante. Promotor con repeticiones de un dodecámero muy rico en G+C. 2.- En un intrón: GAA: Ataxia de Friedreich 2.- Región 3’ no traducida: CTG : Distrofia miotónica 3.- Región 5’ no traducida: CGG : Síndrome de X frágil, sitio frágil 11B. 4.- Región 3’ no transcrita: fuera de la región codificante. Sitio frágil 16A. 5’ no traducido AUG CGG 3’ no traducido GAA Ataxia de Friedriech Síndrome del X frágil Epilepsia progresiva mioclónica UAA CAG CTG Distrofia miotónica Atrofia muscular espino-bulbar Ataxia espinocerebelosa tipo 1-7 Enf. De Machado – Joseph Enf. De Huntington Atrofia dento – rubro - paloidal 1 Casi todas estas enfermedades son de herencia autosómica dominante (excepto el X frágil ligada al cromosoma X y la ataxia de Friedrich que es autosómica recesiva ), por tanto los genes afectos se expresan en TODAS las células del organismo. El diagnóstico de las enfermedades por expansión de tripletes repetidos es facilísimo. Se hace con PCR. La expansión del triplete repetido produce un aumento del tamaño de la molécula, por lo que cuando se corre el gel, los alelos expandidos migran menos que los alelos normales. Si existen dudas de las expansiones: secuenciar. Para entender este capítulo es importante tener claros una serie de conceptos básicos de la genética: 1.- anticipación: la expansión del triplete aumenta de generación en generación. El primer paso antes de que se manifieste la enfermedad es un estado de premutación, en el que existe un elevado número de copias pero todavía está por debajo del número patológico; el fenotipo del individuo será normal pero inestable. La premutación también se expande hasta que se manifieste la enfermedad; cuanto mayor sea el número de repeticiones antes se producirá la clínica. 2.-penetrancia (de un gen): fenómeno que se refiere a la expresión observable de un fenotipo (capacidad de expresión fenotípica de un gen). Puede existir una expresión total o falta de expresión. Es una medida de la proporción de individuos que, portando un determinado alelo de un gen muestra el fenotipo que corresponde a ese alelo. 3.- expresividad: variación en el fenotipo asociado a un alelo particular, debido al ambiente o al background genético (conjunto de otros genes que influyen en la transcripción ). Es la fuerza con la que se manifiesta un determinado gen penetrante. La mayor parte de enfermedades dominantes muestran expresividad variable. II) BASES MOLECULARES DE CADA PATOLOGÍA CONCRETA: SINDROME DE X FRAGIL ( FRAXA ) 5 ‘ UTR Afectados > 200 Premutación 55-200 FMR – 1 gen N: 6-55 (CGG) n - - Ligado al cromosoma X (dominante ligada a X). Causado por mutaciones en el gen FMR-1, que se expresa de forma elevada en el testículo y en el cerebro, y de forma ubicua en el embrión. Normal tiene en la región 5’-UTR (no traducida ) repeticiones de CGG polimórficas en la población ( rango entre 6 y 55 repeticiones ). La premutación tiene 55-200 y la patología más de 200 (hasta 1000 repeticiones descritas). Es por ello del tipo 2. Mecanismo: la expansión impide la normal expresión del gen (silenciamiento transcripcional porque interfiere con la maquinaria). 2 - Más frecuente en varones. Es la segunda causa más frecuente de retraso mental en varones ( 1/1250 nacimientos varones ) y la segunda causa más FREC de RMn de origen genético (tras Down). - Retraso mental moderado-severo, retraso del desarrollo y autismo. Las mujeres con un cromosoma afectado y los varones con premutaciones pueden mostrar defectos cognitivos moderados y rasgos esquizoides. Características de la anticipación y herencia ligada al X: aumento de la penetrancia en generaciones sucesivas y el paso a través de la mujer aumenta el riesgo para la siguiente generación. DISTROFIA MIOTÓNICA Afectados > 75 Premut 4575 Gen DM protein K (CTG) n N: 5-30 - Autosómica dominante Se produce por mutaciones en DM-1 o gen de miotonina, proteina kinasa, que se expande en cerebro, corazón y músculo. El gen normal tiene repeticiones de CTG en 3’-UTR, que nuevamente es polimórfico en la población y oscila entre 5-30 repeticiones. Es por ello tipo 2 también. La premutación 45-75 y los pacientes desde 76 hasta cientos. - Mecanismo: una disminución en la cantidad de mRNA: el gen codifica para una proteinkinasa, que no se ha visto que sirva para nada. Estamos en una región 3’ que teóricamente debería ser silente. Cuando aumenta el número de repeticiones aumenta la inestabilidad de los mensajeros de ese gen que no salen al citoplasma y se acumulan en el núcleo donde parece que secuestran TFs generales (Sp1, RAR gamma, STAT1) lo que produce un descenso en la transcripción. - No se sabe exactamente por qué afecta s/t corazón, músc esquelético y ojos. Parece que depende s/t de señales externas. - Es la forma más común de distrofia muscular del adulto. - Miotonía con debilidad muscular progresiva. - Otras manifestaciones clínicas: · alteraciones esqueléticas, cardíacas y oculares ( cataratas ) · cambios cognitivos, incluído retraso mental - Comienzo de síntomas leves y tarde en la primera generación. Paulatinamente evoluciona hasta que después de 3-4 generaciones aparecen ya síntomas en neonatos en asociación con retraso mental ATAXIA DE FRIEDRICH Afectados > 500 Premutación 42-60 Gen de la frataxina N: 7-29 EXON 1 3 EXON 2 - Es la única AR. Enfermedad de tipo 2: expansión del triplete en un intrón. Causada por mutaciones en el gen de la frataxina, proteína mitocondrial que se expresa en todos los tejidos, pero es más abundante en cerebro, corazón y músculo. El gen normal tiene repeticiones GAA en el intrón 1 (7-29 repeticiones ), la premutación va de 42 a 60 y la pg >500 e incluso hasta miles. Curiosidad: existen homozigotos compuestos con esta enfermedad que en un alelo tienen una expansión y en el otro una mutación puntual que afecta a la secuencia codificante que hace que muchas veces la proteína no sea funcional (la proteína se queda en el citoplasma y no llega a la mitocondria) igual que ocurre cuando están los dos alelos expandidos. También hay heterocigotos normal-mutación puntual. - El mosaicismo es frecuente. - Mecanismo: disminución de la cantidad de mRNA y de la proteína: defecto transcripcional por DNA sticky en repeticiones. La amplificación del triplete GAA por encima de 500 repeticiones hace que el DNA tenga las dos hebras más unidas en esta región= DNA sticky. Esto disminuye la transcripción del gen, baja la frataxina en la mitocondria que es una proteína fundamental en el transporte al exterior de la mitocondria de 2 Fe lo que conlleva acúmulo de Fe en las mitocondrias de los pacientes (que produce alteración fosforilación oxidativa y estrés oxidativo que puede matar a la célula). - Es la ataxia hereditaria más frecuente. - Manifestaciones cerebelosas, esqueléticas, cardíacas y pancreáticas: ataxia cerebelosa y otros problemas como cardiopatías, diabetes... - Presenta anticipación: la gravedad de la enfermedad se correlaciona con el grado de expansión, cuanto mayor es la expansión se produce un comienzo más temprano y con una progresión más rápida a la pérdida de la marcha ATROFIA MUSCULAS ESPINO-BULBAR ( ENFERMEDAD DE KENNEDY ) Afectados 39-60 N: 13-28 Receptor de andrógenos (CAG) n (Gln) n - - Rara y ligada al cromosoma X. Enfermedad tipo 1: repeticiones del triplete CAG dentro de un exón del gen del receptor de andrógenos, lo que da lugar a poliglutaminas. El gen normal tiene un número de repeticiones que oscila entre 13-28. Los pacientes tienen entre 39-60. Degeneración de motoneuronas de comienzo tardío asociado con retraso mental e insensibilidad a andrógenos. 4 - IMP!!!!! Muestra anticipación, pero la gravedad de los síntomas no se correlaciona con el grado de expansión. Se está estudiando su posible aumento en el Ca de próstata. ENFERMEDAD DE HUNTINGTON Etiología: - Autosómica dominante. - Se produce una mutación en el gen IT15 del cromosoma 4 (en el telómero), que codifica para la huntingtina - El gen normal es polimórfico, con 11-34 repeticiones CAG. En la enfermedad de Huntington no está muy claro que exista un estado premutacional. Pacientes: 37-86 repeticiones que se traducen en expansión de poliglutaminas en la proteína. Patogenia: - Parece que en C.N la huntingtina está implicada en procesos de tránsito vesicular por lo que en su alteraciones podrían estar alterados los procesos de formación de vesículas en las neuritas lo que las lesionaría. Al ser AD está claro que la proteína mutada es capaz de excluir a la proteína sana. - La proteína normal tiene unas cuantas glutaminas; la enferma tiene expansión de glutaminas. Esta expansión se encuentra en la región amino terminal de la proteina y la alteración produce que la región adquiera una estructura en hoja ß. ¿Cómo si no son secuencias hidrofóbicas como el caso del beta-amiloide? Realmente actúa como una cremallera de Gln que se apila y funciona como una hoja beta sin serlo estrictamente (por ej es mucho más polar). - Esta cremallera polar produce un cambio conformacional y alteraciones en las interacciones con otras proteínas. A continuación se produce un ataque proteolítico por caspasas (cisteín proteasas que cortan donde está el ácido aspártico), que cortan el extremo amino terminal donde está la expansión. Esta zona liberada (N-terminal) por las caspasas es la que formará depósitos. La zona C-terminal es degradada por el proteasoma. - A continuación son ubiquitinizados por el proteosoma, con el fin de eliminarlos, pero no puede y se trasloca al núcleo como agregados, formando los depósitos intranucleares característicos. Por tanto tendremos depósito a nivel citoplasmático y nuclear. - Con técnicas de tinción se pueden ver acúmulos de huntingtina en el SNC de los pacientes, a nivel del sistema extrapiramidal, y que son tanto intranucleares como intracitoplasmáticos. El daño se produce sobre todo a nivel del estriado. La tinción puede ser con violeta de cresilo. También ME con anti-huntingtina y anti-ubiquitina. ¿Son los agregados proteicos intranucleares e intracitoplasmáticos la causa de la muerte neuronal ? NO, porque se ha visto que son reversibles, que podemos quitar los agregados. Se hizo un experimento con un ratón transgénico de IT15 que tiene la secuencia CAG expandida en el gen de la huntingtina: este animal, con el gen “on”, desarrolla agregados de huntingtina en sus neuronas. Con doxiciclina, nosotros somos capaces de bloquear la expresión del gen y se ve que los agregados desaparecen. CONCLUSIÓN: la agregación es reversible, por tanto el daño neuronal no se produce exclusivamente por los agregados. No se conoce el mecanismo responsable de la muerte neuronal por expansión de huntingtina. Existen dos teorías en boga: 1.- ACETILACIÓN DE HISTONAS En la enfermedad de Huntington la proteína expandida tiene gran afinidad por las proteínas acetiladoras de histonas: al unirse a ellas las bloquea y predomina por tanto la desacetilación. Las acetilasas controlan el empaquetamiento de las histonas, el cual es necesario para la transcripción. Si predomina la desacetilación se produce el bloqueo de la transcripción. Este es el mecanismo más general. 2.- INTERFERENCIA CON LA MAQUINARIA DE TRANSCRIPCIÓN 5 Sobre la maquinaria basal de transcripción se produce la interferencia con la función de Sp1, que es un factor de transcripción muy general (secuencia GC) y TAFIII 130 o TAF alfa, que es un factor auxiliar de RNApoli II; ambas tienen regiones poliglutamina (poliQ) en su N-terminal. La hunting poliex inhibidora interacciona con Sp1, que así no interacciona con TAFIII130 y bloquea la transcripción de distintos genes, sobre todo del R2 de dopamina (que se expresa en el caudado). Se forma entre huntingtina y las otras dos la estructura de la cremallera polar lo que bloquea la transcripción. Clínica: - Comienzo en época juvenil o adultos jóvenes - Asociado con movimientos involuntarios (corea), trastornos de conducta y trastornos cognitivos. - IMP!!!! Presenta anticipación, pero la gravedad de la enfermedad no se correlaciona estrictamente con el grado de expansión: · niños afectados de padres afectados tienen una edad de comienzo de los síntomas más temprana que los padres. · niños afectados de madres afectadas tienen una edad de comienzo igual que las madres. Por lo tanto, el alelo materno muestra menos anticipación que el paterno. TERAPIA MOLECULAR EN ENFERMEDAD DE HUNTINGTON: 1..- Inhibidores de caspasas ( caspasa 1): en animales funciona muy bien si se inyecta intraventricularmente (ratones transgénicos). El problema es que tienen poca capacidad para atravesar la BHE (biodisponibilidad escasa). La caspasa 1 interviene en la apoptosis y además corta ese amino-terminal. Hay que disolverla en DNSO (Dimetilsulfóxido) que es un tóxico además. 2.- Inhibidores de deacetilasas: análogos del butirato= SAHA(suberoylanilida hydroxanic acid): se probó en animales y acetila sin necesidad de nada las histonas. Se probó en Drosophila transgénica. Impiden la neurodegeneración. Se utilizaba en tumores en labo (fase I) y ha empezado a probarse en Huntington. 6