Tema 2. Biomoléculas compuestas orgánicas: Proteínas y biocatalizadores. PAU Biología. CEA “García Alix” PROTEÍNAS Y BIOCATALIZADORES (2011-12) 15.- Aminoácidos proteicos: Estructura general. Carácter anfótero. Clasificación según la cadena lateral: apolar, polar sin carga y polar con carga (ácida o básica). Aminoácidos esenciales (concepto). 16.- Enlace peptídico. Péptidos y proteínas. 17.- Niveles de organización de las proteínas: estructura primaria (secuencia de aminoácidos), secundaria (α-hélice y β-laminar), terciaria (enlaces que estabilizan la estructura, proteínas globulares y fibrosas) y cuaternaria (hemoglobina). 18.- Propiedades de las proteínas: solubilidad, des y renaturalización. Clasificación de las proteínas (holo y heteroproteínas) y función de las mismas (transportadora, reserva, estructural, enzimática, hormonal, defensa, contráctil). 19.- Concepto de Biocatalizador. Enzimas: Definición y características (actividad y especificidad enzimática). Factores que regulan la actividad enzimática (concentración de sustrato, Tª, pH, inhibidores y cofactores). Las vitaminas: Definición, clasificación (hidrosolubles y liposolubles) y función como coenzimas. 1 Eva Palacios Muñoz Tema 2. Biomoléculas compuestas orgánicas: Proteínas y biocatalizadores. PAU Biología. CEA “García Alix” 15.- Aminoácidos proteicos: Estructura general. Carácter anfótero. Clasificación según la cadena lateral: apolar, polar sin carga y polar con carga (ácida o básica). Aminoácidos esenciales (concepto). 2. 3. 1. PROTEÍNAS: Biomoléculas (macromoléculas) orgánicas más abundantes de la materia viva, compuestas por C, H, O y N. Son polímeros de más de 50 aminoácidos. AMINOÁCIDOS (aa): Son los componentes de las proteínas. Son moléculas sencillas, no hidrolizables DEFINICIÓN Compuestos orgánicos sencillos de bajo peso molecular. Sólidos, cristalinos, de elevado punto de fusión y solubles en agua. Tienen actividad óptica y son anfóteros. COMPOSICIÓN Bioelementos C, H, O y N QUÍMICA Fórmula general H2N-CHR-COOH ESTRUCTURA Contienen varios grupos unidos por 1 grupo carboxilo, 1 grupo amino y enlace covalente a un átomo de C- una cadena lateral o grupo R CLASIFICACIÓN Según formen parte Aminoácidos Según su Polar Neutros Sin más grupos carboxilos Glicina (Gly) de las proteínas o no proteicos grupo R ni amino. Dan enlace de H (20) Ácidos Con grupos -COOH Aspártico y glutámico Básicos Con grupos –NH2 Lisina, asparagina e histidina Apolar Cadena Alifáticos (lineales) Ala (alanina),Val, Leu, Ile, Met, (no polares o hidrocarbonada Trp, hidrofóbicos) Aromáticos (con ciclos Phe (fenilalanina), derivados del benceno) Pro (prolina) Aminoácidos Algunos son intermediarios en reacciones metabólicas no proteicos (150) PROPIEDADES Isomería Presentan actividad Dextrógiros (+) El C- es óptica Levógiros (-) asimétrico Hay 2 configuraciones D Pueden ser + o Grupo -NH2 a la derecha o estereoisómeros L Pueden ser + o Grupo -NH2 a la izquierda (la mayoría) Comportamiento Son anfóteros en Pueden ionizarse En medio ácido Se comporta como base Los grupos amino captan H+, químico disolución acuosa. como ácidos y/o bases quedando como –NH3+ (regulan el pH) según sea el pH En medio básico Se comporta como ácido Los grupos carboxilo liberan H+, quedando como –COOEn medio neutro Se comporta como ácido Se ionizan doblemente, apareciendo y base a la vez un zwitterion o forma dipolar iónica: +H3N-CHR-COOPunto isoeléctrico Es el valor de pH para el cual un determinado aminoácido no tiene carga eléctrica neta Aminoácidos No pueden ser Deben ingerirse en la En el hombre son 8 Fenilalanina Isoleucina Metionina esenciales sintetizados por dieta Leucina Treonina Valina los animales Lisina Triptófano 2 Eva Palacios Muñoz Tema 2. Biomoléculas compuestas orgánicas: Proteínas y biocatalizadores. PAU Biología. CEA “García Alix” PROTEÍNAS: AMINOÁCIDOS (versión inicial sin color) DEFINICIÓN Compuestos orgánicos sencillos de bajo peso molecular. Sólidos, cristalinos, de elevado punto de fusión y solubles en agua. Son los componentes de las proteínas. Tienen actividad óptica y son anfóteros. COMPOSICIÓN Bioelementos C, H, O y N QUÍMICA Fórmula general H2N-CHR-COOH ESTRUCTURA Contienen varios grupos unidos por 1 grupo carboxilo, 1 grupo amino y enlace covalente a un átomo de C una cadena lateral o grupo R CLASIFICACIÓN Según formen Aminoácidos Según su grupo R Alifáticos Neutros Sin más grupos carboxilos ni amino. parte de las proteicos Acidos Con grupos -COOH proteínas o no (20) Básicos Con grupos –NH2 Aromáticos Con ciclos derivados del benceno Heterocíclicos Con ciclos complejos Aminoácidos Algunos son intermediarios en reacciones metabólicas no proteicos (150) PROPIEDADES Isomería Presentan actividad Dextrógiros (+) El C- es óptica Levógiros (-) asimétrico Hay 2 configuraciones D Pueden ser + o Grupo -NH2 a la derecha o estereoisómeros L Pueden ser + o Grupo -NH2 a la izquierda (la mayoría) Comportamiento Son anfóteros en Pueden ionizarse En medio Se comporta Los grupos amino captan H+, químico disolución acuosa. como ácidos y/o bases ácido como base quedando como –NH3+ (regulan el pH) según sea el pH En medio Se comporta Los grupos carboxilo liberan H+, básico como ácido quedando como –COOEn medio Se comporta Se ionizan doblemente, apareciendo neutro como ácido y un zwitterion o forma dipolar iónica: base a la vez +H3N-CHR-COOPunto Es el valor de pH para el cual un determinado isoeléctrico aminoácido no tiene carga eléctrica neta Aminoácidos No pueden ser Deben ingerirse en la En el hombre Fenilalanina Treonina esenciales sintetizados por dieta son 8 Leucina Triptófano los animales Lisina Metionina Isoleucina Valina 3 Eva Palacios Muñoz Tema 2. Biomoléculas compuestas orgánicas: Proteínas y biocatalizadores. PAU Biología. CEA “García Alix” AMINOÁCIDOS: ESTRUCTURA GENERAL, CLASIFICACIÓN (Más detallado) CLASIFICACIÓN Polares Apolares (no polares o hidrofóbicos) CADENA LATERAL R Es una cadena con radicales que forman puente de H con el agua (son más solubles) Neutros CARACTERÍSTICAS (CARGA ELÉCTRICA,…) Sin carga Tiene un grupo ácido (-COOH) Tiene un grupo básico (-NH2) Es una cadena hidrocarbonada Ácidos Básicos Alifáticos Aromática Con carga Con carga + Lineales Con ciclos derivados del benceno ISOMERÍA CON O SIN CARBONOS ASIMÉTRICOS (C*) Sin C* Con un C*- alfa Gly (glicina) Casi todos los aminoácidos Con 2 C* Ile (isoleucina) y Trh (treonina) TIPOS EJEMPLOS EJEMPLOS Gly, Ser, Thr, Cys, Gly (glicina), Cys (cisteína), Asn, Asn, Gln, Tyr Gln Con un grupo -OH Ser, Tyr (tirosina), Thr Asp (ácido aspártico), Glu (ácido glutámico) Lys (lisina), Arg (arginina), His (histidina) Ala (alanina), Val, Leu, Ile, Met Phe, Pro, Trp ESTEREOISÓMEROS (configuraciones) No hay configuraciones Hay 2 configuraciones (L y D) Todos loa aminoácidos que forman parte de las proteínas son de forma L 4 Eva Palacios Muñoz Tema 2. Biomoléculas compuestas orgánicas: Proteínas y biocatalizadores. PAU Biología. CEA “García Alix” 16.- Enlace peptídico. Péptidos y proteínas 2. 3. 2. PROTEÍNAS: ENLACE PEPTÍDICO Y PEPTIDOS ENLACE PEPTÍDICO: Unión de dos aminoácidos. (Importante) DEFINICIÓN Unión covalente (enlace amida)entre el grupo carboxilo de un aminoácido y el amino del siguiente, perdiendo una molécula de agua (y formando un dipéptido) REACCIÓN Se unen el C (del COOH) con el N (del NH2) del segundo aminoácido. H2N-CHR-COOH + H2N-CHR’-COOH = QUÍMICA = H2N-CHR-CO-HN-CHR’-COOH + H2O PROPIEDADES Es un enlace covalente C-N Es más corto que la mayoría de los enlaces C-N Posee cierto carácter de enlace No puede girar libremente doble Los 4 átomos (C = O y N- H) se Mantienen distancias y ángulos fijos. hallan en un mismo plano Sólo pueden girar algo los enlaces del C alfa (C- C y C- N) PEPTIDOS: Polímeros hidrolizables que por hidrólisis (reacción contraria al enlace peptídico) total originan aminoácidos DEFINICIÓN CLASIFICACIÓN Compuestos formados por la unión de aminoácidos (residuos) por enlace peptídico Según el nº de aa Oligopéptidos Contienen de 2 a 9 residuos Dipéptidos Tripéptidos CARACTERES FUNCIONES Polipéptidos Contienen más de 10 residuos N-terminal Amino terminal Carboxilo terminal Transportadora C-terminal Oxitocina Insulina Glucagón Glutatión Antibióticos Valinomicina Presentan 2 extremos Hormonal Se empiezan a numerar los residuos por este extremo. Transporta aminoácidos hacia el exterior de las células 5 Eva Palacios Muñoz Tema 2. Biomoléculas compuestas orgánicas: Proteínas y biocatalizadores. PAU Biología. CEA “García Alix” 17.- Niveles de organización de las proteínas: estructura primaria (secuencia de aminoácidos), secundaria (α-hélice y β-laminar), terciaria (enlaces que estabilizan la estructura, proteínas globulares y fibrosas) y cuaternaria (hemoglobina). 2. 3. 3. PROTEÍNAS: La forma de las proteínas, responsable de su función, se debe a su secuencia (orden de aa en la cadena) y organización tridimensional o estructura. ESTRUCTURA DE LAS PROTEINAS: Disposición en el espacio de las moléculas proteicas. La estructura primaria determina la secundaria y la terciaria. TIPOS DE PROTEÍNAS QUE LAS DEFINICIÓN TIPOS CARACTERES TIPO DE ENLACES QUE EJEMPLOS ESTRUCTURAS PRESENTAN ESTABILIZAN PRIMARIA Todas Secuencia de aminoácidos La secuencia de una proteína de la proteína se escribe como los péptidos (desde el extremo N- terminal al extremo C-terminal) SECUNDARIA Proteínas filamentosas Disposición de la secuencia hélice Se forma por enrollamiento Enlaces o Entre 2 aa: el – (sin estructura terciaria) de aminoácidos o estructura helicoidal de la estructura puentes de H CO de un aa y y segmentos de muchas primaria en el espacio primaria. intracatenarios el –NH2 del 4º proteínas globulares. (3,6 aa/ vuelta) aa Hélice de colágeno Se forma por enrollamiento No se pueden formar fácilmente Colágeno (asociación de 3 helicoidal de la estructura los puentes de H intracatenarios, hélices) primaria, pero es más debido a la abundancia de aa con alargada R de gran tamaño (Prolina e (3 aa/ vuelta) hidroxiprolina) Conformación o lámina plegada TERCIARIA CUATERNARIA ¡Sólo presentan estructura Disposición de la estructura Tramos hélice o terciaria las proteínas secundaria de un rectos lámina plegada globulares! polipéptido (plegamiento sobre sí “Codos” Sin estructura mismo para adoptar forma determinada globular). Dominios estructurales: combinaciones de -hélice o lámina plegada estables, globulares, que son monómeros de varias proteínas globulares. ¡Sólo la presentan las Unión de varias cadenas proteínas complejas! polipeptídicas (subunidades o protómeros) para formar un complejo proteico. Cadena en zig-zag (conservan su estructura primaria) La forma globular permite su solubilidad en agua y disoluciones salinas y, por tanto, sus funciones biológicas. Puentes de H intercatenarios Entre cadenas (No hay puentes de H intracatenarios) Enlaces entre los radicales R de los aa por: Covalente fuerte: Puente disulfuro Proteínas filamentosas como la .- queratina de la seda o fibroína. Proteínas globulares como las globulinas Débiles: Puentes de H Fuerzas de Van der Waals. Interacciones iónicas e hidrofóbicas. Unión débil de Puentes de H protómeros Fuerzas de Van der Waals Dímeros tetrámeros polímeros 2 protómeros Hemoglobina, Cápsida viral 6 Eva Palacios Muñoz Tema 2. Biomoléculas compuestas orgánicas: Proteínas y biocatalizadores. PAU Biología. CEA “García Alix” ESTRUCTURA DE LAS PROTEINAS: (muy completa) Es la disposición en el espacio que adoptan estas moléculas. Todas las proteínas tienen, al menos, estructura primaria y secundaria. Las proteínas globulares tienen primaria, secundaria y terciaria. Todas las proteínas pueden tener e. cuaternaria. La estructura primaria determina la secundaria y la terciaria. GRADO DE TIPOS DE DEFINICIÓN ESTRUCTURAS/ Enlaces ORGANIZACIÓN PRIMARIA Secuencia Secuencia lineal de (Enlaces peptídicos) aminoácidos de la proteína SECUNDARIA Conformación Disposición (Puentes de H) (forma espacial de la tridimensional) secuencia de aminoácidos o ¡Sólo proteínas estructura primaria filamentosas y en el espacio segmentos de muchas proteínas globulares! TERCIARIA (Enlaces (covalentes o no covalentes) entre los radicales R de los aa) CUATERNARIA (Uniones débiles, no covalentes de las subunidades) Conformación ¡Sólo presentan estructura terciaria las proteínas globulares! Asociación Disposición de la estructura secundaria de un polipéptido. Plegamiento espacial sobre sí mismo para adoptar forma globular. Unión de varias cadenas ¡Sólo la presentan polipeptídicas las proteínas (subunidades o complejas, monómeros o (fibrosas o protómeros) para globulares)! formar un complejo proteico TIPOS élice- (Hélice de colágeno) Hoja plegada (Conformación o lámina plegada) Tramos rectos “Codos” hélice o hoja plegada Sin estructura determinada CARACTÉRES La secuencia de una proteína se escribe como los péptidos (desde el extremo N- terminal al C-terminal) 3,6 aa/ vuelta Se forman por enrollamiento Es más alargada helicoidal de la (3 aa/ vuelta) estructura primaria. Cadena en zig-zag (conservan su estructura primaria en zig-zag) ¡La forma globular (interior apolar y exterior hidrófilo) permite su solubilidad en agua y disoluciones salinas y, por tanto, sus funciones biológicas (enzimática, hormonal, transportadora)!. TIPO DE ENLACES EJEMPLOS (QUE MANTIENEN ESTA ESTRUCTURA) Enlaces peptídicos Los aa que componen la proteína y en el orden: Ala- Gly- Ile…. Enlaces o puentes Entre el – CO de un aa Ej.- queratina de H intracatenarios y el –NH2 del 4º aa Los enlaces o puentes de H no se pueden formar fácilmente debido a Hay puentes de H intercatenarios Abundancia de aa con R de gran tamaño (Prolina e hidroxiprolina) ¡No hay enlaces o puentes de H intracatenarios! Una molécula de colágeno = asociación de 3 hélices Enlaces entre los radicales R de los aa Puente disulfuro (covalente) Puentes de H. Fuerzas de Van der Waals Interacciones iónicas e hidrofóbicas (no covalentes). Unión débil de protómeros por: Puentes de H. Fuerzas de Van der Waals Ej. globulinas Dominios estructurales: Unidades estructurales con funciones específicas. Son combinaciones de -hélice o lámina plegada estables, globulares, que son monómeros de varias proteínas globulares. Son “clichés estructurales” de elevada eficacia biológica. Dímeros (2 protómeros) trímeros (colágeno) tetrámeros (hemoglobina) polímeros (cápsida viral) Proteínas filamentosas (sin estructura terciaria) Ej .- queratina de la seda o fibroína. 7 Eva Palacios Muñoz Tema 2. Biomoléculas compuestas orgánicas: Proteínas y biocatalizadores. PAU Biología. CEA “García Alix” PROTEÍNAS FILAMENTOSAS TIPOS ALFAQUERATINAS BETAQUERATINAS RICAS EN Cys 22% 10-14% No contienen Cys ENLACES PROPIEDADES ESTRUCTURA SECUNDARIA Puentes disulfuro transversales entre cadenas polipeptídicas adyacentes Se estiran cuando se calientan (pelo...). Forma estirada es inestable hélice Las cadenas peptídicas se hallan retorcidas o arrolladas de forma diferente (al estirar la lana y el pelo, se parecían a la queratina) Lámina plegada Puentes de H intracatenarios No poseen puentes disulfuro transversales No se estiran cuando se calientan Puentes de H intercatenarios COLÁGENO Prolina e Hidroxiprolina Triple hélice Las fibrillas de colágeno se hallan dispuestas de modo diferente según sea la función: EJEMPLOS Duras y frágiles Haces de Blandas y flexibles macrofibrillasfibrillas más delgadashaces paralelos de filamentos proteicos Cuernos, uñas Piel, pelo y lana Fibroína de la seda Hilo de arañas Escamas, garras y picos de reptiles y aves Tendones: haces paralelos- estructuras muy resistentes; pero poca o nula capacidad de estiramiento. 8 Eva Palacios Muñoz Tema 2. Biomoléculas compuestas orgánicas: Proteínas y biocatalizadores. PAU Biología. CEA “García Alix” 18.- Propiedades de las proteínas: solubilidad, des y renaturalización. Clasificación de las proteínas (holo y heteroproteínas) y función de las mismas (transportadora, reserva, estructural, enzimática, hormonal, defensa, contráctil). 2. 3. 4. PROPIEDADES DE LAS PROTEINAS (II): Dependen básicamente de la naturaleza de los radicales R SOLUBILIDAD PROPIEDADES Depende de la proporción de aa con radicales polares DESNATURALIZACIÓN Reversible (pérdida de la estructura terciaria y (renaturalización) cuaternaria) Irreversible CAUSAS Los grupos -R polares o hidrófilos se hallan hacia fuera y CONSECUENCIAS EJEMPLOS Las proteínas se rodean de una capa Proteínas filamentosas de agua que impide su precipitación (estructurales) Forman puentes de H Cambios de: -pH -Concentración - Temperatura agitación molecular Rotura de los enlaces que mantienen las estructuras secundarias (a veces), terciarias y cuaternarias Disminuye su solubilidad: precipitación Proteínas globulares (dinámicas) Proteínas globulares (ovoalbúmina, etc)---Proteínas filamentosas Insolubles Solubles Pierde su forma nativa (la más estable) y pasa a forma filamentosa Pierde su actividad biológica ESPECIFICIDAD De función De especie CAPACIDAD AMORTIGUADORA (comportamiento anfótero) Posición de determinados aa de su secuencia lineal Hay proteínas exclusivas de cada especie y Proteínas homólogas (hacen = función en especies diferentes; pero son diferentes) Sus aa son anfóteros Se pueden comportar como ácidos o como bases Pérdida de algunos aa Pérdida de la función Por eso puede haber rechazo en trasplantes de órganos Son disoluciones tampón o amortiguadoras, es decir, amortiguan las variaciones del pH del medio 9 Eva Palacios Muñoz Tema 2. Biomoléculas compuestas orgánicas: Proteínas y biocatalizadores. PAU Biología. CEA “García Alix” 2. 3. 4. PROPIEDADES DE LAS PROTEINAS (muy completo): Dependen básicamente de su composición química (la naturaleza de los radicales R) y su estructura. PROPIEDADES DEFINICIÓN TIPOS CAUSAS Solubilidad Capacidad de disolverse en Insolubles Depende de los aa con radicales polares agua, que depende del pH, Tª, que, al ionizarse, establecen puentes de salinidad, etc. H con el agua Solubles Desnaturalización Especificidad Capacidad amortiguadora Pérdida de su configuración Reversible espacial característica (de su (renaturalización) forma nativa y adopción de una forma al azar) debido a agentes físico-químicos y, pérdida de su Irreversible actividad. Las proteínas son específicas, es De función decir, se diferencian por la secuencia polipeptídica (a diferencia de glúcidos y lípidos), por eso hay un gran De especie polimorfismo proteico Comportamiento anfótero (son disoluciones tampón o amortiguadoras, es decir, amortiguan las variaciones del pH del medio) Cambios de: -pH -Concentración - Temperatura agitación molecular Rotura de los enlaces que mantienen las estructuras secundarias (a veces), terciarias y cuaternarias Hay aa que determinan la conformación espacial y su alteración produce patologías Hay proteínas exclusivas de cada especie (e incluso de individuo) y Proteínas homólogas (hacen = función en especies diferentes; pero son diferentes) Sus aa son anfóteros, es decir, se pueden comportar como ácidos o como bases (liberan o toman H+) CONSECUENCIAS Las proteínas se rodean de una capa de agua que impide su precipitación. Las proteínas son macromoléculas, por lo que forman disoluciones coloidales. EJEMPLOS Proteínas Insolubles filamentosas (estructurales) Proteínas Solubles globulares (dinámicas) Disminuye su solubilidad: precipitan Coagulación por calor de la clara del huevo: Pierde su forma nativa (la más estable) y pasa a forma filamentosa Proteínas globulares (ovoalbúmina, etc)-- Proteínas filamentosas Pierde su actividad biológica (no depende de su secuencia polipeptídica, sino de su configuración tridimensional) La pérdida de algunos aa => Pérdida de la función La anemia falciforme es una enfermedad hereditaria debida al cambio de sólo un aa de la Hb Por eso puede haber rechazo en trasplantes de órganos y transfusiones sanguíneas 10 Eva Palacios Muñoz Tema 2. Biomoléculas compuestas orgánicas: Proteínas y biocatalizadores. PAU Biología. CEA “García Alix” Clasificación de las proteínas (holo y heteroproteínas) y función de las mismas (transportadora, reserva, estructural, enzimática, hormonal, defensa, contráctil). CLASIFICACIÓN DE LAS PROTEÍNAS CLASE (composición) HOLOPROTEÍNAS (sólo aminoácidos) SUBCLASES Proteínas globulares Proteínas filamentosas HETEROPROTEÍNAS (aminoácidos y otras moléculas denominadas grupo prostético) Cromoproteínas ( grupo prostético es un pigmento) Glucoproteínas (glúcido) Lipoproteínas (ácidos grasos) Nucleoproteínas (ácidos nucleicos) Fosfoproteínas (ácido ortofosfórico) EJEMPLOS Histonas Albúminas Globulinas Queratina Colágeno Miosina Elastina Porfirínicas Hemoglobina Mioglobina No porfirínicas Hemocianina Rodopsina Hormona estimulante del folículo Hormona luteinizante Glucoproteínas de membrana Inmunoglobulinas Mucus Líquido sinovial, etc. Lipoproteínas sanguíneas FUNCIÓN Estructural Transporte y reserva de aminoácidos Anticuerpos Estructural Contracción muscular Estructural Transporte de oxígeno Visión Biocatalizadores, etc. Transporte Asociaciones ADN- histonas Regulación genética Caseína, vitelina Reserva de aminoácidos 11 Eva Palacios Muñoz Tema 2. Biomoléculas compuestas orgánicas: Proteínas y biocatalizadores. PAU Biología. CEA “García Alix” 2. 3. 5. CLASIFICACIÓN DE LAS PROTEÍNAS Y FUNCIONES (II) Sus funciones más importantes son la estructural y enzimática; pero también transporte, almacenamiento, movimiento, reserva, defensa, protección, recepción y transmisión de estímulos, regulación hormonal y control del crecimiento y diferenciación. CLASE COMPOSICIÓN H Sólo aminoácidos O L O P R O T E Í N A S (proteínas simples) TIPOS Proteínas globulares CARACTERES/ GRUPO PROSTÉTICO Solubles en agua y con funciones dinámicas EJEMPLOS Histonas Básicas Albúminas Globulinas Proteínas filamentosas CARACTERÍSTICAS/ TIPOS Insolubles en agua y con Queratina funciones estructurales y de protección. Casi sólo en Colágeno animales. Miosina Elastina LOCALIZACIÓN FUNCIÓN Estructural Ovalbúmina Lactalbúmina Seralbúmina Ovoglobulina Lactoglobulina Asociadas a los ácidos nucleicos Clara de hiuevo Leche Sangre Clara de hiuevo Leche Seroglobulinas Sangre Muy resistente a sustancias químicas Anticuerpos Estructural Muy resistente a tracción Contráctil Epidermis de vertebrados Tejidos conectivos Músculos Muy elástica Vasos sanguíneos Transporte y reserva de aminoácidos Estructural Contracción muscular Estructural 12 Eva Palacios Muñoz Tema 2. Biomoléculas compuestas orgánicas: Proteínas y biocatalizadores. PAU Biología. CEA “García Alix” 2. 3. 5. CLASIFICACIÓN DE LAS PROTEÍNAS Y FUNCIONES (II) CLASE H E T E R O P R O T E Í N A S COMPOSICIÓN Aminoácidos y otras moléculas denominadas grupo prostético (G.P.) TIPOS Cromoproteínas (su grupo prostético es un pigmento o sustancia coloreada) CARACTERES/ G. PROSTÉTICO Porfirínicas (porfirina o anillo tetrapirrólico + + catión metálico) EJEMPLOS Hemoglobina Mioglobina Con grupo prostético llamado hemo (ferroporfirina = porfirina + Fe2+) Citocromos Las más importantes tienen un catión metálico No porfirínicas Hemocianina Con metal (Cu) Rodopsina Glucoproteínas Glúcido CARACTERÍSTICAS/ TIPOS Pigmento respiratorio formado por: 4 cadenas polipeptídicas globulares (globinas) + 4 grupos hemo Con 1 cadena polipeptídica + + grupo prostético hemo Interconversión de Fe 2+ a Fe3+ Pigmento respiratorio de algunos invertebrados Sin metal Pigmento fotosensible Su G. P. deriva de Vit A Glucoproteínas de membrana Mucus Hormonas gonadotróficas LOCALIZA CIÓN Sangre de vertebrados Músculos En “sangre” de algunos invertebrados Retina Hormona estimulante del folículo (FSH) Hormona luteinizante (LH) Inmunoglobulinas o anticuerpos Lipoproteínas Ácidos grasos Lipoproteínas sanguíneas Nucleoproteínas Ácidos nucleicos Asociaciones ADN- histonas Fosfoproteínas Ácido ortofosfórico Caseína, vitelina Transporte de oxígeno Transporte de oxígeno Transporte de e- en respiración celular Transporte de oxígeno Visión Receptores Digestivo, respiratorio Peptidoglicanos FUNCIÓN Protección Biocatalizadora Paredes bacterianas Protección Defensiva ante antígenos Transporte Regulación genética Reserva de aminoácidos 13 Eva Palacios Muñoz Tema 2. Biomoléculas compuestas orgánicas: Proteínas y biocatalizadores. PAU Biología. CEA “García Alix” 2. 3. 5. CLASIFICACIÓN DE LAS PROTEÍNAS Y FUNCIONES (muy completa) CLASE COMPOSICIÓN TIPOS CARACTERES/ EJEMPLOS GRUPO PROSTÉTICO H Sólo aminoácidos Proteínas globulares Solubles en agua y con Histonas O funciones dinámicas L Albúminas O P R Globulinas O T E Í Proteínas Insolubles en agua y con Queratina N filamentosas funciones estructurales y de A protección. Casi sólo en Colágeno S animales. Miosina (proteínas simples) Elastina H E T E R O P R O T E Í N A S Aminoácidos y otras moléculas denominadas grupo prostético Cromoproteínas (El grupo prostético es un pigmento) Porfirínicas (porfirina o anillo tetrapirrólico + catión metálico) Hemoglobina Mioglobina Con grupo prostético hemo Citocromos No porfirínicas Glucoproteínas Glúcido Hemocianina Con metal (Cu) Rodopsina Sin metal Hormona estimulante del folículo Hormona luteinizante Glucoproteínas de membrana Inmunoglobulinas Mucus Líquido sinovial, etc. CARACTERÍSTICAS/ TIPOS Básicas LOCALIZACIÓN FUNCIÓN Estructural Ovalbúmina Lactalbúmina Seralbúmina Ovoglobulina Lactoglobulina Asociadas a los ácidos nucleicos clara de hiuevo leche sangre clara de hiuevo leche Seroglobulinas sangre Muy resistente epidermis de vertebrados tejidos conectivos Músculos Anticuerpos Estructural Muy resistente Contráctil Muy elástica Pigmento respiratorio formado por 4 cadenas polipeptídicas globulares (globinas) + 4 grupos hemo (ferroporfirina) Con 1 cadena polipeptídica + grupo prostético hemo Interconversión de Fe 2+ a Fe3+ Pigmento respiratorio de algunos invertebrados Pigmento fotosensible vasos sanguíneos en sangre de vertebrados en músculos “sangre” de algunos invertebrados Retina Transporte y reserva de aminoácidos Estructural Contracción muscular Estructural Transporte de oxígeno Transporte de oxígeno Respiración celular Transporte de oxígeno Visión Biocatalizadores, etc. 14 Eva Palacios Muñoz Tema 2. Biomoléculas compuestas orgánicas: Proteínas y biocatalizadores. PAU Biología. CEA “García Alix” Lipoproteínas Ácidos grasos Lipoproteínas sanguíneas Transporte Nucleoproteínas Ácidos nucleicos Fosfoproteínas Ácido ortofosfórico Asociaciones ADNhistonas Caseína, vitelina Regulación genética Reserva de aminoácidos 15 Eva Palacios Muñoz Tema 2. Biomoléculas compuestas orgánicas: Proteínas y biocatalizadores. PAU Biología. CEA “García Alix” FUNCIONES DE LOS PRÓTIDOS FUNCIONES ESTÁTICAS ESTRUCTURAL A nivel celular A nivel histológico ACTIVAS FISIOLÓGICA RESERVA Ovoalbúmina, vitelina CONTRÁCTIL Actina y miosina Tubulina, dineína, flagelina Insulina, Tiroxina, Hormona de crecimiento. Proteínas reguladoras del pH HORMONAL DEFENSA TRANSPORTE REGULACIÓN GENÉTICA ENZIMÁTICA O CATALIZADORA INMUNITARIA EJEMPLOS Glucoproteínas de membrana Microtúbulos del citoesqueleto, cilios y flagelos Histonas Queratina, elastina, colágeno. A nivel celular A nivel sanguíneo Permeasas Pigmentos respiratorios Seroalbúmina Transferrina Lipoproteínas Tripsina, ribonucleasa, Catalasa, peroxidasa, citocromos Inmunoglobulinas, Toxinas. 16 Eva Palacios Muñoz Tema 2. Biomoléculas compuestas orgánicas: Proteínas y biocatalizadores. PAU Biología. CEA “García Alix” 19.- Concepto de Biocatalizador. Enzimas: Definición y características (actividad y especificidad enzimática). Factores que regulan la actividad enzimática (concentración de sustrato, Tª, pH, inhibidores y cofactores). Las vitaminas: Definición, clasificación (hidrosolubles y liposolubles) y función como coenzimas. ENZIMAS: BIOCATALIZADORES O CATALIZADORES BIOLÓGICOS: Sustancias químicas orgánicas que aumentan la velocidad de reacción (catalizan) las reacciones biológicas CATALIZADORES ENZIMAS NO BIOLÓGICOS SEMEJANZAS Función Aumentan (aceleran) la velocidad de reacción. Energía de activación Disminuyen la energía de activación necesaria para llegar al estado de transición. ¿Se consumen? Cantidad necesaria No se consumen durante la reacción, sino que se recuperan intactas al final del proceso. Se requieren cantidades muy pequeñas para acelerar la reacción. DIFERENCIAS Especificidad - Son muy específicas Tª a la que actúan Actividad - Actúan a Tª ambiente Son muy activas Peso molecular - Tienen un peso molecular muy elevado TIPOS DE BIOCATALIZADORES TIPOS COMPOSICIÓN QUÍMICA ENZIMAS Proteínas globulares VITAMINAS ARN (ribozimas) Glúcidos o lípidos sencillos HORMONAS Proteínas o esteroides, generalmente. Derivados de aminoácidos o de ácidos grasos Actúan sólo en una reacción determinada, (para cada sustrato y para cada reacción) Se desnaturalizarían a altas temperaturas Aumentan la velocidad de la reacción hasta más de un millón de veces (mucho más que los catalizadores no biológicos) -- PROPIEDADES ¿LOS PODEMOS SINTETIZAR (SOLUBILIDAD) LOS ANIMALES? Solubles en agua, Sí, son sintetizadas por el difunden fácilmente en los organismo líquidos orgánicos. Hidrosolubles y liposolubles No, hay que obtenerlas en la dieta Sí ¿CÓMO ES SU SÍNTESIS? Como cualquier proteína, pues van codificadas genéticamente _ ACTUACIÓN Catalizan de forma específica determinadas reacciones bioquímicas uniéndose a la molécula a transformar (S) Actúan como coenzimas Son sintetizadas en glándulas endocrinas y vertidas al medio interno (sangre) Son mensajeros químicos. Sólo actúan en su órgano blanco o diana (receptores específicos) 17 Eva Palacios Muñoz Tema 2. Biomoléculas compuestas orgánicas: Proteínas y biocatalizadores. PAU Biología. CEA “García Alix” Enzimas: Definición y características (actividad y especificidad enzimática). Factores que regulan la actividad enzimática (concentración de sustrato, Tª, pH, inhibidores y cofactores). 3. 1. ENZIMAS: DEFINICIÓN Y CARACTERÍSTICAS. Son catalizadores orgánicos coloidales, de naturaleza proteica, producidos por los seres vivos. Son proteínas globulares (salvo ribozimas), solubles en agua y difunden fácilmente en los líquidos orgánicos. TIPOS DE ENZIMAS POR SU ESTRUCTURA: COFACTORES ENZIMÁTICOS TIPOS DE ENZIMAS COMPOSICIÓN UNIONES DE TIPOS DE COFACTORES Y COFACTOR ENZIMAS 1.Estrictamente proteicas 2.HOLOENZIMAS = = Apoenzima + + Cofactor Una o más cadenas polipeptídicas Apoenzima (parte proteica) Cofactor (parte no proteica) DEFINICIÓN/ PROPIEDADES - - - - - - Débil 1.Activadores inorgánicos Ión metálico u oligoelemento 2.Coenzimas Moléculas orgánicas complejas. COENZIMAS EJEMPLOS DE HOLOENZ. TIPOS CLASES EJEMPLOS - - - - Mg2+ Nucleótidos Adenosínfosfatos Nucleótidos y PiridínSon inespecíficas (un coenzima derivados de nucleótidos puede actuar como cofactor de Vitaminas Flavínmuchas apoenzimas diferentes. nucleótidos Ej. ATP). - Quinasas ATP NAD NADP FMN FAD Coenzima A Se alteran durante la reacción; pero luego se regeneran y vuelven a ser funcionales. Fuerte (covalente): el cofactor se llama grupo prostético 3.Grupos prostéticos Derivados de Vitaminas - Derivados de Vit B12 Grupo hemo (ferroporfirina = porfirina + Fe2+) Citocromos (poseen un grupo prostético ferroporfirínico que actúa como cofactor) 18 Eva Palacios Muñoz Tema 2. Biomoléculas compuestas orgánicas: Proteínas y biocatalizadores. PAU Biología. CEA “García Alix” Enzimas: Definición y características (actividad y especificidad enzimática). 2. ENZIMAS. CENTRO ACTIVO: Región de la enzima que se une al sustrato y que suele ser una depresión en la superficie de la E CARACTERÍSTICAS DEL CENTRO ACTIVO TAMAÑO ESTRUCTURA CONSTITUCIÓN Muy pequeño Tridimensional, con forma de hueco Aminoácidos que quedan próximos debido a plegamientos de la cadena polipeptídica TIPOS DE AMINOACIDOS DE LAS ENZIMAS LOCALIZACIÓN TIPOS DE AMINOACIDOS Fuera del centro activo AA estructurales En el Centro Activo AA de fijación AA catalizadores FUNCION DE AA Dan la forma a la enzima, no son dinámicos Unión del E y el S Catálisis: rompen algunos de los enlaces del S. No deben estar necesariamente cerca en la secuencia; pero sí tras el plegamiento de la cadena polipeptídica. ¿SE UNEN AL SUSTRATO? No Sí ¿CÓMO SON LAS UNIONES E-S? Débiles (se unen débilmente al S) Débiles o fuertes ESPECIFICIDAD DE LAS ENZIMAS EN LA REACCIÓN QUE CATALIZAN: La actividad enzimática depende de la configuración tridimensional, ya que la desnaturalización supone pérdida de la actividad. La especificidad depende de la forma tridimensional del centro activo, que es complementaria a la molécula del S al que se une. MODELOS QUE EXPLICAN LA ESPECIFICIDAD E-S M. de la “llave y la cerradura”. Fischer (1890) M. del ajuste inducido (del “guante y la mano”) M. de la “tensión sobre el sustrato” EXPLICACIÓN ¿CAMBIA LA FORMA DEL …? ¿CUANDO APARECE LA COMPLEMENTARIEDAD E-S? La llave es el Sustrato y la Antes de unirse E y S. cerradura es la Enzima. La mano es el Sustrato y el guante es la Enzima. Sólo después de haberse unido E y Hay un cambio de S. conformación de la enzima tras unirse al sustrato CENTRO ACTIVO DEL ENZIMA? No SUSTRATO? No No Sí, algunas enzimas modifican la forma de sus centros activos para adaptarse mejor al S Sí, los enlaces también provocan un cambio en la forma del S (tensan) 19 Eva Palacios Muñoz Tema 2. Biomoléculas compuestas orgánicas: Proteínas y biocatalizadores. PAU Biología. CEA “García Alix” Enzimas: Definición y características (actividad y especificidad enzimática). Factores que regulan la actividad enzimática (concentración de sustrato, Tª, pH, inhibidores y cofactores). ENZIMAS. ACTIVIDAD ENZIMÁTICA. MECANISMO DE ACCIÓN: E + S = ES = EP = E + P Nº DE MECANISMO DE ACCIÓN SUSTRATOS / 1º. INICIACIÓN 2º. TRANSFORMACIÓN REACCIÓN Un sustrato (S) 1º- Fijación al sustrato en su superficie Se debilitan los enlaces del 3º. Formación del 4º. Formación del (adsorción) sustrato complejo enzimacomplejo enzima – E + S = ES = E + P 2º - Unión del S al E mediante enlaces sustrato (ES) producto (EP) Se requiere mucha menor débiles (S + E) energía para llegar al complejo activado (C. A.) Dos sustratos (A, B) Mecanismo 1.Fijación de los dos Aumenta la probabilidad de Complejo ABE Complejo CDE normal sustratos en su superficie que se encuentren y reaccionen E (adsorción) los sustratos A+B =C+D Mecanismo 1.Fijación de un S _ Complejo AE y Complejo BE y E “ping-pong” primero y después, el liberación de C y E liberación de D y E otro 3º. FINALIZACIÓN 5º. Liberación de la enzima intacta (E) y el producto (P) Liberación de la enzima intacta (E) y los productos (C y D) TIPOS DE ENZIMAS POR SU ACTIVIDAD TIPOS DE DEFINICIÓN EJEMPLO ENZIMAS Zimógenos o Se producen de forma inactiva y, por hidrólisis parcial, se transforman en la forma activa. Pepsinógeno (inactivo) ----HCl----> pepsina (activa) proenzimas Sólo son activas cuando actúan sobre ellas otras enzimas o iones. Isoenzimas Enzimas que realizan la misma función Lactato deshidrogenasa En músculo Tiene una > afinidad por el S, (forma ácido láctico a esquelético <KM por tanto > velocidad partir de pirúvico) Pero en distintos órganos (o en diferentes Formas moleculares En miocardio Tiene una < velocidad momentos de la vida) tienen distintas las: Vmáx y KM > KM 20 Eva Palacios Muñoz Tema 2. Biomoléculas compuestas orgánicas: Proteínas y biocatalizadores. PAU Biología. CEA “García Alix” Enzimas: Definición y características (actividad y especificidad enzimática). Factores que regulan la actividad enzimática (concentración de sustrato, Tª, pH, inhibidores y cofactores). MECANISMO DE ACCIÓN DE LAS ENZIMAS. REACCIÓN ENZIMÁTICA Y SU CINÉTICA: Estudio de la velocidad de las reacciones enzimáticas que se define como la cantidad de materia transformada en función del tiempo y se mide por la desaparición de un S o coenzima o por la aparición del P, en función del tiempo. La representación gráfica de la cinética enzimática suele ser una hipérbola: la velocidad de la reacción aumenta de forma lineal hasta la saturación de la enzima. CONSTANTES/ OTROS Vmáx DEFINICIÓN Velocidad máxima que alcanza la reacción enzimática Constante de Michaelis-Menten (Km) Concentración del S para la cual la velocidad de la reacción es la mitad de la Vmáx.-> La Km indica la afinidad del E por su S (cada enzima posee una Km característica para cada S). La Km se puede determinar gráficamente. Ecuación de Michaelis-Menten V = Vmáx . (S)/ KM + (S) Sucede cuando hay saturación de la enzima A < KM EXPLICACIÓN Todas las moléculas de la enzima están ocupadas por moléculas de sustrato > Afinidad hay entre Son inversamente el S y la E proporcionales > Velocidad (> Eficacia catalítica) Esta ecuación permite calcular la velocidad de la reacción en función de las distintas concentraciones del S 21 Eva Palacios Muñoz Tema 2. Biomoléculas compuestas orgánicas: Proteínas y biocatalizadores. PAU Biología. CEA “García Alix” Enzimas: Definición y características (actividad y especificidad enzimática). Factores que regulan la actividad enzimática (concentración de sustrato, Tª, pH, inhibidores y cofactores). PROPIEDADES DE LAS ENZIMAS PROPIEDADES TIPOS Especificidad de la catálisis enzimática De acción De sustrato Reversibilidad - Eficacia - Gran poder catalítico - DEFINICIÓN La enzima sólo cataliza una determinada reacción La enzima sólo actúa sobre un determinado sustrato GRADOS DE ESPECIFICIDAD _ ¿LA ENZIMA RECONOCE UN TIPO DE UN TIPO DE MOLÉCULAS? ENLACE? _ _ EJEMPLO ENZIMA SUSTRATO Oxidación de un aa, … Especificidad absoluta (la más específica) Sí, sólo un sustrato determinado _ Ureasa Urea Especificidad de grupo (más amplia) Sí, un tipo de moléculas que tengan una característica estructural común _ Proteínas con aa aromáticos Especificidad de clase (la menos específica) _ Sí, independientemente del tipo de molécula Quimiotripsina (hidroliza enlaces peptídicos diferentes) Fosfatasas (separan fosfatos de cualquier S) Grupos fosfato Un enzima cataliza por igual la reacción (en ambos sentidos). No cambia la cte. de equilibrio. Una sola molécula de enzima puede catalizar la reacción de miles de moléculas de S Superior al de catalizadores no biológicos (multiplica la v por 1 millón o más) 22 Eva Palacios Muñoz Tema 2. Biomoléculas compuestas orgánicas: Proteínas y biocatalizadores. PAU Biología. CEA “García Alix” 6. FACTORES QUE INFLUYEN EN LA VELOCIDAD DE LAS REACCIONES O REGULAN LA ACTIVIDAD ENZIMÁTICA: (Concentración de sustrato, Tª, pH, inhibidores y cofactores) (Importante) La velocidad de la reacción varía con la concentración del E y del S, y es modificada por las condiciones del medio. VELOCIDAD SUSTRATO (S) TEMPERATURA pH DE REACCIÓN ¿Qué efecto produce Si aumenta la concentración del S-> Si aumenta la Tª -> Cambia las cargas eléctricas un cambio en cada aumenta la velocidad -> Aumenta la movilidad molecular-> superficiales de las enzimas factor? hasta la saturación de la enzima -> Acelera las reacciones químicas. (hipérbola) -> Cambia la conformación en estructura terciaria y cuaternaria de la E.-> -> Altera el centro activo -> -> Cambia su actividad biológica 1º. Valor < óptimo Aumenta o no Aumenta la velocidad Aumenta la movilidad molecular-> Desnaturalización ->Aumenta la velocidad de formación del producto. 2º.Valor óptimo Velocidad máxima Vmáx Cada enzima tiene una Tª óptima a la que Cada enzima tiene un pH su actividad es máxima óptimo para el que su eficacia Suele ser la Tª corporal de seres vivos: Tª es máxima óptima < 50- 60 ºC 3º. Valor > óptimo Se mantiene o cesa Saturación de la E Desnaturalización de las enzimas Desnaturalización proteicas (pérdida de actividad enzimática) INHIBIDORES ENZIMÁTICOS TIPOS DE TIPOS DE EFECTO INHIBIDORES ENLACE I-E SOBRE EL CENTRO ACTIVO ¿Alteran su ¿Permanece el efecto? estructura? Irreversibles o Unión fuerte Sí Sí, el veneno se fija venenos covalente permanentemente al centro activo del E Reversibles Unión débil no covalente No No, sólo se impide temporalmente el funcionamiento normal del E CLASES DE INHIBIDORES (REVERSIBLES) (según compitan o no con el S) - Competitivos No competitivos Compiten con el S (conformación espacial similar al S) No compiten con el S (se unen en otra zona del E) ¿SE UNE EL I AL CENTRO ACTIVO DEL E? INHIBIDORES Disminuyen o impiden completamente la actividad de una E. Pueden ser perjudiciales. o beneficiosos. EFECTOS Inutiliza a la E permanentemente SÍ No Complejo E-S Otra zona del E Disminuyen la velocidad de la reacción Impiden la separación de E-S y formar el P Impiden el acceso del S al centro activo - - - EJEMPLO El ión cianuro (inhibe a la citocromoxidasa de la respiración aerobia) Sulfamidas _ _ 23 Eva Palacios Muñoz Tema 2. Biomoléculas compuestas orgánicas: Proteínas y biocatalizadores. PAU Biología. CEA “García Alix” CONTROL DE LA ACTIVIDAD ENZIMÁTICA: La actividad enzimática se puede regular de forma general por variaciones de pH, Tª, etc. ; pero a veces se necesita un control más específico, mediante: efectores alostéricos y modificaciones covalentes. TIPOS DE CONTROL DE LA ACTIVIDAD E. Muy general 1. Factores que regulan la actividad E (Variaciones de pH, Tª, etc.) Más específico 2.Efectores alostéricos (regulación alostérica o alosterismo) 3.Modificaciones covalentes TIPOS EXPLICACIÓN Activadores o efectores Suelen ser los S Inhibidores Suelen ser los P REVERSIBLES Si se introduce un grupo funcional, fosfato,… IRREVERSIBLES Zimógenos o proenzimas Se producen de forma inactiva y, por hidrólisis parcial, se transforman en la forma activa. 24 Eva Palacios Muñoz Tema 2. Biomoléculas compuestas orgánicas: Proteínas y biocatalizadores. PAU Biología. CEA “García Alix” CLASIFICACIÓN DE LAS ENZIMAS POR LA REACCIÓN CATALIZADA (I) (más sencilla) TIPO REACCIONES CLASES ACCIÓN/ EJEMPLOS que catalizan I. OxidoDe oxidorreducción de Un compuesto gana ereductasas S (transferencia de H, (se reduce) y otro los O o e-) cede (se oxida) II. Transferasas o quinasas III. Hidrolasas IV. Liasas V. Isomerasas VI. Sintetasas o ligasas Transfieren grupos funcionales ( NH2, fosfato)o radicales (salvo el H) de unas moléculas a otras A-X + B = A + B-X Hidrólisis Introducen grupos – (rotura de sustratos OH y -H diversos mediante el agua disociada en sus iones) A-B + H2O = AH + BOH Rotura o soldadura de S Adición de grupos sin agua, con liberación funcionales (-NH2, de grupos químicos. CO2, H2O,…) a moléculas que tienen un doble enlace. Isomerización o transformación de moléculas en sus isómeros Síntesis de moléculas (forman enlaces) utilizando la energía de la hidrólisis de ATP COENZIMA/TIPO DE ENLACE EJEMPLO DE REACCION (el signo = indica reacción reversible) Las de respiración celular Glu + O2 = CO2 + H2O + Energía (se oxida) (se reduce) Acido aspártico + ácido pirúvico = ácido oxalacético + alanina Lipasas Énlace éster (ácido + alcohol) Carbohidrasas Glucosídicos Peptidasas Descarboxilasas Grasa + agua = glicerina + 3 ácidos grasos (Esterasa) Peptídicos Liberación de CO2 a partir de un S orgánico Acido pirúvico = acetaldehído + CO2 (Piruvato descarboxilasa) Gliceraldehído- 3- fosfato = Dihidroxiacetona –3- fosfato (Fosfotriosa isomerasa) A + B + ATP = A-B + ADP + P 25 Eva Palacios Muñoz Tema 2. Biomoléculas compuestas orgánicas: Proteínas y biocatalizadores. PAU Biología. CEA “García Alix” CLASIFICACIÓN DE LAS ENZIMAS POR LA REACCIÓN CATALIZADA (II) (muy completa) TIPO REACCIONES CLASES ACCIÓN/ EJEMPLOS que catalizan I. OxidoDe oxidorreducción Un compuesto gana Deshidrogenasas Son oxidantes: quitan H (H+ reductasas de S (transferencia e- (se reduce) y otro y e-) de una molécula de H, O o e-) los cede (se oxida) Oxidasas o Son reductoras: quitan e- del reductasas S y los ceden al oxígeno II. Transferasas Transfieren grupos funcionales o Transaminasas Transfieren grupos –NH2 o quinasas radicales (salvo el H) de unas moléculas a otras Transcarboxilasas Transfieren grupos - COOH III. Hidrolasas Hidrólisis (rotura de sustratos diversos mediante el agua) Introducen grupos –OH y -H Esterasas Carbohidrasas Peptidasas IV. Liasas V. Isomerasas VI. Sintetasas o ligasas Soldadura o rotura de S sin agua. Adición de grupos funcionales (-NH2, CO2, H2O,…) a moléculas que tienen un doble enlace. Isomerización o transformación de moléculas en sus isómeros Síntesis de moléculas con hidrólisis de ATP Nucleasas Aminasas Carboxilasas Hidratasas Lipasas Fosfatasas Sacarasa Amilasa Tripsina Pepsina Adición de –NH2 a un doble enlace Adición de –COO a un doble enlace Adición de H2O a un doble enlace COENZIMA/TIPO EJEMPLO DE REACCION DE ENLACE (el signo = indica reacción reversible) NAD, NADP Y FAD Acido málico + NAD+ = ácido oxalacético se reducen a NADH2, + NADH + H+ NADPH2 Y FADH2 (Malato- deshidrogenasa) Acido aspártico + ácido pirúvico = = ácido oxalacético + alanina Énlace éster (ácido + alcohol) Grasa + agua = glicerina + 3 ácidos grasos (Esterasa) Glucosa- 6- fosfato = glucosa + fosfato Glucosídicos Peptídicos Acido pirúvico = acetaldehído + CO2 (Piruvato descarboxilasa) Ácido fumárico + H2O = ácido málico Gliceraldehído- 3- fosfato = Dihidroxiacetona –3- fosfato (Fosfotriosa isomerasa) Acetil- CoA = Malonil- CoA (ATP --> ADP + P) 26 Eva Palacios Muñoz Tema 2. Biomoléculas compuestas orgánicas: Proteínas y biocatalizadores. PAU Biología. CEA “García Alix” 1. REGULACIÓN ALOSTÉRICA O ALOSTERISMO: Sistema de regulación enzimática muy preciso. ENZIMAS ALOSTÉRICAS: DEFINICIÓN Son las que pueden adoptar dos formas estables diferentes, permitiendo la autorregulación de la actividad enzimática (por el S y el P) FUNCIÓN EJEMPLO Catalizan reacciones importantes La 1ª E (E reguladora) de una ruta metabólica o en puntos de ramificación de las rutas metabólicas) es alostérica. CARACTERÍSTICAS DE LAS ENZIMAS ALOSTÉRICAS Dos tipos de centros 1.Centro Activo 2.Centro Regulador (centro alostérico) Allí se une el S a) Si el centro alostérico está vacío b) Si el centro alostérico está ocupado por un ligando o efector Dos formas La E cataliza a v normal. Activadores o efectores (suelen ser los S) Inhibidores alostéricos (suelen ser los P) Regulación por retroinhibición o inhibición feed-back Regulación por inducción enzimática Cambia la conformación del E de forma más o menos activa Permite regulación más rápida y con menor cantidad de activadores e inhibidores. La unión del S al centro activo de una de las subunidades, facilita la unión del S a los centros activos de otras subunidades. (El cambio de conformación de este protómero o transición alostérica, se transmite instantáneamente a los otros protómeros, activándolos) Conformación activa Alta afinidad por el S Estabilizada por activadores Conformación inactiva Baja afinidad por el S Estabilizado por inhibidores alostéricos. Estructura cuaternaria (están formadas por varias subunidades) Cada protómero del E alostérico tiene centro/ s regulador/ es (allí se puede unir un ligando o activador) Hay cooperativismo o efecto cooperativo entre las subunidades Cinética Es diferente a las demás E: es una sigmoide (no hipérbola) -> Cambio muy grande en la velocidad de reacción (“ley del todo o nada”). Acelera o inhibe la reacción El P final se fija al centro regulador -> -> cambia la configuración de la E (transición alostérica) a la forma inactiva-> ->inhibe a la E (impide la unión de E al S) El S inicial se fija al centro regulador -> -> cambia la configuración de la E (transición alostérica) a la forma activa -> -> activa a la E (favorece la catálisis) 27 Eva Palacios Muñoz Tema 2. Biomoléculas compuestas orgánicas: Proteínas y biocatalizadores. PAU Biología. CEA “García Alix” VITAMINAS: Definición, clasificación (hidrosolubles y liposolubles) y función. NOMBRE Vit C COENZIMA DERIVADO - FUNCIÓN (BIOQUÍMICA, BIOLÓGICA) Antioxidante Cofactor de hidroxilación Coenzima en la síntesis de colágeno Transferencia de grupos aldehídos Transferencia de H+ (e-) en la respiración celular B1 (Tiamina) B2 (Riboflavina) Pirofosfato de tiamina FAD, FMN B3 (Niacina) B5 (Ácido pantoténico) Transferencia de H+ (e-) en oxidaciones y en la respiración celular. Transferencia de grupos acilo, detoxificador, formación de ácidos grasos, hormonas y anticuerpos. Antiestrés. B6 (Piridoxina) NADP+, NAD+ Coenzima A (imprescindible en el metabolismo celular) Fosfato de piridoxal B8 (Biotina, Vit H) Biocitina B9 (Acido fólico) Acido tetrahidrofólico B12 (cobalamina) Coenzima B12 A (retinol) 11-cis-retinal D D2 (Ergocalciferol) D3 (Colecalciferol) E (Tocoferol) K (Filoquinona) 1,2-Dihidroxicolecalciferol Transferencia de grupos carboxilos, desarrollo de glándulas sexuales, sebáceas y sudoríparas Transferencia de grupos monocarbonados, antianémica, síntesis de glóbulos rojos Metabolismo de ácidos nucleicos, formación de glóbulos rojos, síntesis de neurotransmisores Ciclo visual, crecimiento, protección y mantenimiento del tejido epitelial Metabolismo del Ca2+, esencial en el crecimiento y mantenimiento de huesos - Transferencia de grupos amino en el metabolismo de aa Inhibe oxidación de ácidos grasos insaturados Imprescindible en coagulación sanguínea (síntesis de protrombina) ENFERMEDAD CARENCIAL Escorbuto, propensión a infecciones Beri-beri (polineuritis) Dermatitis, inflamación y agrietamiento de la lengua, comisura de boca, etc. Pelagra (dermatitis, diarrea y demencia) Palpitación, dolor y quemaduras en pies, alteraciones nerviosas y circulatorias Dermatitis, trastornos del aparato digestivo, convulsiones Dermatitis, caída del pelo, anemia Anemia, insomnio, depresión del sistema inmunitario Anemia perniciosa, trastornos nerviosas, ulceraciones en boca Ceguera nocturna, xeroftalmía, desecación epitelial, detención del crecimiento Raquitismo en niños, deformaciones óseas en adultos Envejecimiento celular, impide el crecimiento Retardo en coagulación sanguínea, hemorragias 28 Eva Palacios Muñoz Tema 2. Biomoléculas compuestas orgánicas: Proteínas y biocatalizadores. PAU Biología. CEA “García Alix” 1. VITAMINAS LIPOSOLUBLES NOMBRES PROVITAMINAS A (Retinol), Provitamina A o (Antixeroftálmica) Betacaroteno D (Antirraquítica) Ergosterol (D2) y D2 (Calciferol) 7-deshidrocolesterol (D3) E (Tocoferol) (Antiestéril) K ( Menadiona) (Naftoquinona) (Antihemorrágica) FUNCIÓN BIOLÓGICA Y BIOQUÍMICA AVITAMINOSIS Ciclo visual, Mantenimiento de epitelios y buen funcionamiento de todos los tejidos Antioxidante: ayuda a evitar el cáncer. Desarrollo de huesos. Metabolismo del calcio, esencial en el crecimiento y mantenimiento de huesos y dientes. Xeroftalmia, ceguera nocturna, alteraciones epiteliales, detención del crecimiento. HIPERVITAMINOSIS Caída del pelo, descamación, Debilidad, vómitos Raquitismo en niños, osteomalacia en adultos, caries, osteoporosis senil. Calcificación corazón, riñón e hígado Antioxidante (evita la oxidación de ácidos grasos insaturados y la destrucción de vit. A y C) Previene tumores y retarda el envejecimiento celular. Envejecimiento celular. Impide el crecimiento. Trastornos de la reproducción. Síntesis de protrombina que coagula la sangre. Retardo en la coagulación Hemorragias FUENTE Vegetales con carotenos (perejil, espinacas, zanahorias, orejones de albaricoque), mantequilla, hígado, huevos, leche de vaca. Mantequilla, leche, yema de huevo, levadura, cereales germinados y aceites vegetales, pescados azules, hígado. Aceites vegetales prensados en frío (germen de trigo, girasol, oliva...), semillas, germen de trigo, vegetales de hojas verdes, cacahuetes crudos, nueces, yema huevo. Vegetales hojas verdes (escarola, lechuga, espinacas), huevos, pescados 29 Eva Palacios Muñoz Tema 2. Biomoléculas compuestas orgánicas: Proteínas y biocatalizadores. PAU Biología. CEA “García Alix” 2. VITAMINAS HIDROSOLUBLES NOMBRES COENZIMA C (Acido ascórbico) (Antiescorbútica) FUNCIÓN BIOLÓGICA Y BIOQUÍMICA Antioxidante (contrarresta la formación de nitrosaminas cancerígenas) Coenzima en la síntesis de colágeno (crecimiento y reparación tejidos). Mejora el sistema inmunitario (previene y mejora el resfriado). Favorece la absorción del Fe Ayuda al funcionamiento del sistema nervioso, músculos y corazón. AVITAMINOSIS Escorbuto Infecciones respiratorias FUENTE Kiwi, guayaba, fresa, naranja, pimiento rojo, brécol, perejil. Beri-beri,(Polineuritis) y otros trastornos nerviosos Levadura de cerveza, germen de trigo, soja (envolturas de cereales y legumbres), pan y arroz integral, frutos secos sin tostar. Dermatitis (piel, boca, labios). Seborrea. B1 (Tiamina,) (Antineurítica) (Antiberibérica), vit. del estado de ánimo Pirofosfato de tiamina (Descarboxilasas : transferencia de grupos aldehído en el metabolismo de glúcidos y lípidos) B2 (Riboflavina) FAD y FMN (Deshidrogenasas: transferencia de H+ y e- en la respiración celular) Ayuda al crecimiento y a la reproducción. Favorece el buen estado de piel, cabellos y uñas. B3 (Niacina) (Antipelagrosa) NAD+ y NADP+ (Deshidrogenasas: metabolismo de glúcidos y proteínas. (Oxidaciones y respiración celular) Coenzima A (imprescindible en metabolismo celular: transporte de grupos acilos oxidación de ácidos grasos y pirúvico) Fosfato de piridoxal (Transaminasas: transferencia de grupos amino en el metabolismo de aminoácidos). Indispensable en salud del sistema nervioso. Favorece el sistema digestivo. Mejora el cutis. Detoxificador. Formación de ácidos grasos, hormonas y anticuerpos. Antiestrés. Imprescindible en la fabricación de anticuerpos y glóbulos rojos y en la síntesis de ácidos nucleicos. Ayuda a prevenir varias enfermedades nerviosas y de piel. Levadura de cerveza, almendras, germen de trigo, Queso, huevos, champiñones, leche, legumbres, castañas, etc. (Su necesidad aumenta con el estrés). (Las bacterias intestinales evitan grandes deficiencias). Pelagra (dermatitis, diarrea y Levadura de cerveza y germen de trigo, frutos demencia) secos (cacahuetes) harina integral de trigo, leche, carne Desórdenes de la piel En casi todos: (dermatitis) yema de huevo, cereales integrales, germen de Alteraciones nerviosas y trigo, frutos secos. circulatorias (anemia). Anemia, dermatitis Levadura de cerveza, germen de trigo, salvado seborreica y trastornos del de trigo, levadura de pan, frutos secos, plátano, aparato digestivo. carne, vegetales, legumbres y cereales. (Bacterias intestinales) B8 (Vit H, Biotina) Biocitina (Carboxilasas: transferencia de grupos carboxilos) Desarrollo de glándulas sexuales, sebáceas y sudoríparas. Dermatitis, caída del pelo Anemia. Levadura de cerveza, yema de huevo, frutas frescas, frutos secos, leche, arroz integral. B9 (Acido fólico) Acido tetrahidrofólico (síntesis de bases nitrogenadas de ADN y ARN) Antianémica. Formación de glóbulos rojos Anemia. Insomnio. Depresión del sistema inmunitario. Levadura, germen y salvado de trigo, escarola, cereales, brécol, endibias, espárragos, col, boniato y frutos secos. B12 (Cobalamina) (Antiperniciosa) Coenzima B12 (metabolismo de ácidos nucleicos) Formación de glóbulos rojos. Síntesis de neurotransmisores. Anemia perniciosa y daños Carne, pescado y lácteos, levadura, huevos, cerebrales, ulceraciones en la algas. boca. B5 (Acido pantoténico) B6 (Piridoxina) 30 Eva Palacios Muñoz