Transcripción [Modo de compatibilidad]

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Transcripción y Procesamiento
del RNA
Transcripción
Síntesis de RNA a partir de DNA
DNA
Transcripción
RNA de
transferencia tRNA
Otros
snRNA, snoRNA,
siRNA, miRNA
RNA mensajero
mRNA
RNA ribosomal
rRNA
Estructura química del RNA
RNA puede formar estructuras
secundarias
Transcripción
• Solamente los segmentos de DNA que corresponden a
genes son copiados a RNA
Una de las dos cadenas de DNA es copiada a RNA
Cadena codificante
Cadena molde
La secuencia de RNA es complementaria
a la cadena molde e idéntica a la cadena
codificante
RNA polimerasa procariotes
RNAP holoenzima α2ββ´σ ≈ 460 kDa
La RNA pol cubre aprox.60 nt
40 upstream y 20 downstream
Gen
Producto
Función
rpoA
2 subunidades
α (37kDa)
ensamblaje de las unidades
rpoB
Subunidad
β(151kDa)
Centro catalítico
rpoC
β´ (157kDa)
Centro catalítico
rpoD
σ (32-90kDa)
Reconocimiento del promotor
(especificidad)
Promotores bacterianos
Promotor
Secuencia -10 o caja Pribnow TATAAT
Secuencia -35
TTGACAT
• Secuencias conservadas en promotores de procariontes
Promotor fuerte
Promotor débil
Factores sigma
σ
Fac. σ
σ70
σ32
σ24
σ54
σ28
Gen Masa (kDa)
Uso
rpoD
70
general
rpoH
32
choque térmico
rpoE
24
choque térmico
rpoN
54
nitrógeno
fliA
28
flagelar
Etapas de la transcripción
Iniciación
Elongación
Terminación
Reconocimiento y formación del complejo cerrado
Burbuja de 17pb
Elongación
Termino de la transcripción
Terminadores intrínsecos
Termino de la transcripción
Dependiente de Rho
Fidelidad de la transcripción
Las RNA polimerasas no tienen actividad de edición por tanto son
menos fieles
Transcripción en eucariotes
Eucariotes tienen 3 tipos de polimerasas nucleares
Tipos
Localización
Transcritos
Copias/ cél
I
Nucleolo
rRNA 18S, 5.8S y 28S 40,000
II
Nucleoplasma
mRNA
40,000
III
nucleoplasma
tRNA y rRNA 5S
20,000
Todas las RNA polimerasas eucariotas son proteínas grandes en forma de
agregados de 500 kDa ó más. Generalmente tienen de 8 a 14 subunidades
Promotores eucariotes
Caja TATA o caja Hogness -25 / -35
Elementos regulatorios URE
Enhancers
•
Todas las RNA polimerasas requieren factores transcripcionales basales (TF)
Formación del complejo de iniciación RNApol II
Factores transcripcionales basales de RNA pol II
Polimerasa
Promotor
Factores transcripcionales basales
RNA pol I
No tiene caja TATA
UBF, SL1
RNA pol III
Promotores internos
TBP
TF III A, TF III B y TF IIIC rRNA 5S
TF III B y TF IIIC
tRNA
También existen factores moduladores
PROCESAMIENTO POST-TRANSCRIPCIONAL
DEL RNA
• RNA ribosómico rRNA
•
•
•
•
Más abundante en la célula
Principal componente de los ribosomas
Procariotes 16S, 23S , 5S
Eucariotes 18S, 28S, 5.8S, 5S
RNA transferencia tRNA
Más pequeño ≈75nt
Transporta aminoácidos hasta el ribosoma
Extremo 3´ tiene el triplete característico CCA
Independientemente del aminoácido que transporte
Procesamiento RNA transferencia y
ribosomal
Eucariotes
y
procariotes
Procesamiento RNA ribosomal
procariote
Región
espaciadora
30S
Metilación preRNA
II II
II III II II III
Corte específico RNasaIII, RNasaP y Rnasa E
II II
II III II II III
Otras nucleasas
II II
II III II II III
Procesamiento RNA ribosomal
eucariote
Nucleolo
Región
espaciadora
45S
II II
II II
II II
Los cortes son catalizados por RNAs
pequeños del nucleolo snoRNAs y
proteínas del spliceosoma
II III II
II III II
II III II
II III
II III
II III
Procesamiento RNA transferencia
eucariote
Cortes endonucleolíticos seguidos
reacción de ligación
Procesamiento RNA transferencia
Procesamiento del
extremo 5´
RNasa P
Se encuentra en todos
los organismos
Ribonucleopoteína
RNA (ribozima)
377 nt (actividad
catalítica)
Proteína 20kDa
Nucleasas
RNasa D
Procesamiento
extremo 3’
Nucleasas eliminan
un grupo de bases
RNasa D elimina
nucleótidos
restantes
Procesamiento RNA transferencia
tRNA
nucleotidiltransferasa
Transfiere la secuencia
CCA característica de
TODOS los tRNA
maduros
Metilacióno desaminación de
bases
Bases pseudouracilo y
dihidrouracilo
Bases modificadas presentes en los tRNA
Procesamiento mRNA eucariote
Capping
Procesamiento mRNA eucariote
Poliadenilación 3´
Procesamiento mRNA eucariote
Splicing
Remoción de intrones
Procesamiento mRNA eucariote
Splicing
Remoción de intrones
Splicing alternativo
Resumen procesamiento mRNA eucariote
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