Marcadores Moleculares

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Marcadores Moleculares
¿Que son los marcadores
moleculares?
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Evolución
Ecología
Bio-Medicina
Ciencias Forenses
Estudios de diversidad
Localización y Aislamiento de Genes
• Directos (ADN)
• Indirectos (proteínas)
• Capacidad de detectar polimorfismos en
loci únicos o múltiples
• Dominantes o Codominantes
Tipos de Genoma
• ADN nuclear
• ADN de cloroplastos
• ADN mitocondrial
Isoenzimas/Aloenzimas
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Selectivamente neutras
Codominantes
Técnica laboriosa
frecuencias alelicas y genotípicas
Heterocigosis
Diversidad genética
Diferenciación genética
Isoenzimas/Aloenzimas
• Otras medidas de variación genética intra e
interpoblacional
• Biología evolutiva
• Relaciones fenotipo-ambiente
• Filogenias
• Interacción Planta-Animal
Isoenzimas/Aloenzimas
PCR
RAPDs
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Dominante
Oligonucleotidos 10 pb
Polimorfismo debido a sitios de acoplamiento
HW (estimación de frecuencias)
Tamaños efectivos
Estructura poblacional
RAPDs
• Regiones codificantes y No codificantes
(niveles de variación más altos que RFLPs e
Isoenzimas)
• Sin conocimiento previo de genoma
• Sin reproducibilidad
• Homología de bandas
RAPDs
Microsatélites
• SSRs STR
• 1-4 pb (TT) (AT) (AAGG)
• Varían en tamaño por el numero de veces que
se repite el motivo
• Se encuentran en regiones codificantes y
regiones no codificantes
• Geles de Poliacrilamida (nitrato de plata,
radioactividad)
• Codominantes
Microsatélites
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Fuente:http://www.monografias.com/trabajos37/marcadoresmoleculares/Image8136.gif
Microsatélites
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Secuencias flanqueantes conservadas
Mas polimorficos que AFLPs, RAPDs y RFLPs
Lectura de bandas clara y fácil interpretación
Selectivamente neutros
Variación genética intra e interespecífica
Análisis de linajes y Sistemas reproductivos
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SSRc SSRm (demográficos y mutaciones)
Monitoreo de flujo genético
Análisis de Paternidad
Inferencias de parámetros demográficos
Patrones evolutivos (origen de especies,
formas o razas)
• Estudios comparativos entre especies o
géneros de un mismo grupo
• Mutación homogénea (mayoría mutaciones
de un paso)
• Reconstrucciones de árboles de genes (Teoría
de coalescencia)
• Se necesita conocer secuencia de región a
analizar (cebadores)
Microsatélites
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Fuente Orona-Castro et al 2006 Molecular characterization of commercial
and elite genotypes of potato (Solanum tuberosum L.) in Mexico
SNP´s
• http://cmbi.bjmu.edu.cn/cmbidata/snp/images/SNP.gif
• 1% de la población
• Los SNP constituyen hasta el 90% de todas las
variaciones genómicas humanas
• Codificantes y No codificantes
• estudios de poblaciones
• Pruebas genéticas
• Investigación médica
• Desarrollo de fármacos
• Varias formas de identificación (RFLPs,
secuencias)
ANALISIS DE SECUENCIAS DE ADN
ITS (ADN ribosomal nuclear)
Fuente: Collins 1990
ADN Mitocondrial
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Fuente:http://3.bp.blogspo
t.com/_ud1zAGJBkYE/TLJvi
s2aY3I/AAAAAAAAABQ/yJi
D8PIdCrw/s1600/Genoma
Mitocondrial.jpg
Microarreglos (Microarrays)
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Tecnica de microarrays para detectar niveles de expresion de genes,
Fuente: pagina web del Instituto de Neurobiologia, UNAM)
Microarreglos (Microarrays)
¿preguntas?
¡Gracias!
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