PRÁCTICA DE REDES SOCIALES CON GEPHI

PRÁCTICA DE REDES SOCIALES CON
GEPHI
Manual elaborado por Beatriz Patraca Dibildox
Introducción
• Ahora analizaréis vuestra propia red social a partir de un mapa que
generaréis por medio de un programa de visualización de redes
llamado Gephi.
• Gephi es una plataforma interactiva de código abierto (open source)
para la visualización y exploración de todo tipo de redes y sistemas
complejos con gráficos dinámicos y jerárquicos.
• Por medio de los siguientes pasos lograréis obtener una red con los
atributos más comunes a partir de un fichero que
confeccionaremos para elaborar la matriz de datos.
Paso 1: Instalar el programa
• Lo primero que haréis es bajar el programa de la
siguiente dirección: http://gephi.org/users/download/ e
instalarlo como se indica.
• Esta versión tiene la opción de elegir “español” como
idioma de la interfaz. Con esa versión se ha elaborado
este manual. Si os quedáis con la versión por defecto, en
inglés, la disposición de los elementos es la misma.
Paso 2. Generar una matriz de datos
• Empezaréis generando una matriz de datos de
nuestra propia red social.
• Enumeraréis 20 personas que puedan responder
afirmativamente al menos una de las siguientes
preguntas:
• ¿Si me ausento de casa podría venir a regar mis
plantas?
• ¿Me prestaría dinero para una emergencia?
• ¿Estaría dispuesto a escuchar mis problemas?
Paso 2. Generar una matriz de datos
• Crearéis en Excel una hoja de cálculo especificando
los nombres de las personas que responderían
positivamente a la pregunta.
• Estos nombres son los nodos de la red.
• Haréis dos columnas, una para Id y otra para Label.
En "Id" enumeraremos para identificar las etiquetas
con los nombres (label).
Paso 2. Generar una matriz de datos
Paso 2. Generar una matriz de datos
• Guardamos como hoja (no como libro) en
formato .csv y cerramos el archivo
Paso 2. Generar una matriz de datos
• Ahora desarrollaréis la parte de la matriz que
corresponde a los enlaces.
• Como esta es una red personal (egored) no aparecéis
vosotros pero queréis conocer la relación que tienen
entre sí los miembros de vuestra red.
• Abriréis otra hoja de Excel y con tres columnas:
Source, Target y Weight .
Paso 2. Generar una matriz de datos
• Ahora empezaréis a plasmar las relaciones con la
siguiente pregunta:
¿Juan (1) conoce a Francisco (2)?
Si la respuesta es sí, Anotamos la relación (source – target).
• Y continuáis: ¿1 conoce a 3? ¿a 4? etc.
• Después: ¿Francisco (2) conoce a Adriana (3)? (No es
necesario repetir que 2 conoce a 1 porque esa relación
ya se estableció, así que seguimos escalonadamente)
Paso 2. Generar una matriz de datos
Paso 2. Generar una matriz de datos
• Para ponderar el peso (weight) de los enlaces o
aristas haréis la siguiente pregunta:
• “Si no fuera por mí ¿Juan (1) y Francisco (2) se
conocerían?” y asignaremos los siguientes valores:
• 1 Improbable
• 2 Probable
• 3 Seguramente
Paso 2. Generar una matriz de datos
En este caso pondremos
“undirected” ya que la red
no es dirigida al permitirse el
flujo de ambos lados. Es
decir, si Juan conoce a
Francisco
es
porque
Francisco conoce a Juan.
Paso 3. Abrir los archivos en Gephi
• Abrís Gephi: Archivo -> Nuevo proyecto.
• En la pestaña de “Laboratorio de datos” iréis a “Tabla
de datos”.
Paso 3. Abrir los archivos en Gephi
Haced clic en la
pestaña
“Importar
hoja de cálculo” para
que se abra una
ventana como la de la
ilustración.
Paso 3. Abrir los archivos en Gephi
Separador: Coma. Tabla: Tabla de nodos
Clic en “Siguiente”
Dejad sin marcar la casilla de la siguiente pantalla “Forzar que los nodos sean
creados nuevos” y Clic en “Terminar”
Paso 3. Abrir los archivos en Gephi
• Haced lo mismo con el archivo de “enlaces” o aristas.
Fijándoos bien que en la opción aristas aparezca “Tabla de
aristas”. Ahora veréis en la tabla de datos una pestaña que nos
muestra los nodos exportados y otra con las aristas.
Paso 4: Primera visualización
Ahora podréis ver una red densa similar a esta:
TIP: Notad que en la parte superior derecha de la pantalla hay un apartado que pone
“Contexto” y que nos da el número de nodos, de enlaces y el tipo de red que estamos
trabajando .
Paso 5: Familiarizarse con la
visualización
• Usad el ratón para moveros por la visualización: la rueda para
el zoom y el botón derecho con arrastre para recorrer el
gráfico.
• Localizad el regulador de espesor de las aristas en la parte
inferior
• Si perdéis el gráfico, restableced vuestra posición con el icono
de la lupa:
Paso 6: Control de la distribución
El propósito de las propiedades de la distribución es que
toméis el control del algoritmo para hacer una representación
estética más agradable. Abrid la pestaña “Vista general” y en
la ventana de distribución ubicada en la parte inferior
izquierda veréis una serie de opciones al desplegar la opción
“elige una distribución”.
En este caso trabajaremos con la
opción “Force Atlas”
Paso 6. Control de la distribución
• Seleccionaréis la opción “Force Atlas” y pondréis la fuerza de
repulsión a 200000
• Clic en “Ejecutar” y Parar cuando veamos que los nodos se
han separado entre sí.
Paso 7: Configurar la Clasificación
El módulo de clasificación os ayudará a configurar el tamaño y el color de los
nodos.
• Localizad el “módulo de clasificación” en la
parte superior izquierda.
• Elegid grado como parámetro de rango.
(Clasificación> Nodos> Grado)
Obtendréis el siguiente panel de configuración:
Clicad en Aplicar para ver el resultado.
Paso 7: Configurar la clasificación
• Vamos a configurar los colores
Moved el ratón sobre el componente para graduar.
Doble clic en los triángulos para configurar el color.
• Cuando esté listo, seleccionad aplicar
•
Tip: para seleccionar otras gamas de colores, dad clic con el botón sobre la palabra
color. En la opción por defecto, aparecen diferentes combinaciones.
Paso 8: Calcular medidas
• En el lado derecho de nuestro ordenador, podemos encontrar dos
pestañas: filtros y estadísticas. Con la función de Estadística calcularéis
medidas importantes para analizar nuestra red.
• Empezaréis con la medición de Longitud media de camino. Se calcula la
longitud del camino para todos los pares posibles y da información sobre
la cercanía de los nodos.
• Seleccionad Ejecutar y espera a que aparezca
el siguiente cuadro de diálogo.
Paso 8: Calcular medidas
Antes de dar clic en Aceptar, es importante leer el
contenido de esta ventana pues nos indica qué estamos
midiendo y nos da definiciones básicas sobre las
principales medidas de las redes.
Paso 8: Calcular medidas
• Obtendréis un cuadro de medidas como este:
Paso 9: Configurar las medidas de los
nodos
Las medidas producen informes generales pero también pueden aplicarse a
cada nodo en particular, así tres nuevos valores han sido creados por el
algoritmo Longitud media de camino:
-Betweeness centrality (Intermediación)
-Closeness centrality (Cercanía)
- Eccentricity (Excentricidad)
Estas medidas indican la influencia de los nodos que tienen mayor valor.
En clasificación, seleccionad betweeness centrality en la lista.
Paso 10: Configurar las medidas de los
nodos
Ahora podéis fijar el tamaño de los nodos.
• Seleccionad en la barra de herramientas el icono de diamante para el
tamaño.
• Estableced el tamaño mínimo en 10 y el máximo en 50.
• Dad clic en Aplicar para ver el resultado en la ventana del Grafo
Paso 11: Configurar las medidas de los
nodos
• Ahora veréis un gráfico más
o menos como este:
• Color: Grado
• Tamaño: Medida de intermediación
Paso 12: Mostrar etiquetas
• Exploraréis la red más a detalle ahora que los colores y el tamaño
indican los nodos centrales.
• Mostrar las etiquetas
• Poner el tamaño de las etiquetas en proporción al tamaño del
nodo(Si hay un nodo que exceda por mucho las dimensiones de
los demás, es mejor dejar todas las etiquetas del mismo tamaño)
• Ajustar el tamaño de la etiqueta con el regulador
Paso 12: Mostrar etiquetas
• En el icono que señala la flecha, podéis desplegar u ocultar el menú de las
etiquetas y seleccionar la característica que necesitéis mostrar. Lo más
común, y lo que haréis en este caso, es marcar la casilla Label que nos
muestra el nombre de nuestros contactos.
Paso 13: Detección de comunidades
• La habilidad para detectar y estudiar comunidades es fundamental en el
análisis de redes.
• Ahora colorearéis los clusters en la red. Gephi implementa el método
Louvain* disponible en el panel de ∑ Estadísticas. Clicad Ejecutar junto a
la función de Modularidad
Seleccionad Aceptar en la ventana de Parámetros de Modularidad.
*Blondel V, Guillaume J, Lambiotte R, Mech E (2008) Fast unfolding of communities in large networks. J Stat Mech:
Theory Exp 2008:P1008 (http:// findcommunities.googlepages.com)
Paso 13: Detección de comunidades
• Seleccionaréis Modularity Class.
• Ahora veréis las comunidades que encontramos.
• La propiedad aleatoria establece los colores para cada comunidad.
• Pulsad Aplicar para colorear los nodos.
• Haced clic con el botón derecho para acceder a la acción aleatoria de
colores.
Paso 14: Previsualización
• Antes de exportar el gráfico a un archivo SVG o PDF, mirad en
Previsualización para ver exactamente cómo lucirá el gráfico y darle el
último toque.
• Selecciona Previsualización en la pestaña del banner superior
• Dad clic en refrescar
Paso 14: Previsualización
• A la izquierda encontraréis el área de Configuración de la
previsualización y seleccionaréis la opción para mostrar las
etiquetas:
Configuración de la previsualización >
etiquetas de nodos >
mostrar etiquetas.
Ajustad el grosor (3.0) para apreciar mejor el
Peso de las aristas.
Paso 14: Previsualización
• De acuerdo a los valores que hayáis cambiado, vuestra red habrá variado.
Podría quedar como esta. Podéis mirar con detalle los clústers, las
conexiones y los nodos haciendo zoom en la pantalla de previsualización.
Paso 15: Exportación
•
Para visualizar, haréis clic en SVG/PDF junto a exportar. Al momento de
guardar podéis decidir en qué formato preferís guardarlo.
•
Los archivos SVG son gráficos vectoriales como los PDF. Las imágenes varían
levemente su escala por lo tanto pueden ser integradas o impresas en
presentaciones de alta resolución.
•
Podéis transformar y manipular archivos SVG en Inskape o en Adobe
Illustrator
…para finalizar
• No olvidéis guardar el proyecto periódicamente encapsulando todos los
datos en un solo archivo de sesión.
• Gephi permite hacer tomas de pantalla (Screen shots) Realizad cuantas
podáis para ver y mostrar los avances. La herramienta se encuentra en la
parte inferior de la ventana Grafo de la Vista general.
• Podéis aprender más en: Gephi website, Gephi Wiki y Gephi forum
• Sed pacientes y no tengáis miedo de experimentar. Veréis cómo al
familiarizaros con las herramientas el trabajo será más fácil y más
divertido.