Recombinación homóloga Loci múltiples y equilibrio de ligamiento •Cada gen está ligado a otros mediante asociaciones físicas. •Cuando dos genes se encuentran muy juntos en el mismo cromosoma se dice que son ligados. •Las frecuencias de los diferentes tipos de gametos depende de la distancia entre los genes. •Los alelos de los genes ligados se encuentran en asociación no-aleatoria en los gametos. La asociación no al azar de los alelos se llama Desequilibrio de ligamiento (DL). Biológicamente DL significa que la frecuencia del genotipo A1B1 / A2B2 no es igual a la frecuencia del genotipo A1B2 / A2B1. A1 B1 A1 B2 A2 B2 A2 B1 no recombinante recombinante •frecuencia de A1B1 = P11 •frecuencia de A2B2 = P22 •frecuencia de A1B2 = P12 •frecuencia de A2B1 = P21 DL = P11 P22 - P12 P21 Si DL = 0 ⇒ los alelos se distribuyen de manera independiente en los gametos ⇒ Equilibrio de ligamiento (EL) Equilibrio de ligamiento (EL) Si DL = 0 cada locus se encuentra en equilibrio de HardyWeinberg (EHW). El EHW se alcanza en una o pocas generaciones mientras que el EL se alcanza gradualmente. La frecuencia de recombinación, r, es la proporción de gametos que llevan una combinación de alelos no presentes en los cromosomas parentales. 0 <= r <= 0,5 r = 0 cuando los genes están completamente ligados. r = 0,5 cuando los genes están muy lejos uno del otro en el mismo cromosoma o están en cromosomas diferentes. Ejemplo •genes de los grupos sanguíneos humanos MN y Ss (determinados por genes muy ligados en el cromosoma 4). •muestra de 1000 británicos •Número de personas por tipo cromosomal: MS: 474, Ms: 611, NS: 142, Ns: 773 DL = (474 x 773 - 611 x 142) / (2000)2 = 0,0699 ¿Es DL = 0,0699 diferente de 0? ρ = DL / √p1p2q1q2 X2 = ρ 2 * n Frecuencias alélicas M = 474 + 611 / 2000 = p1 = 0,543 N = 142 + 773 / 2000 = p2 = 0,458 S = 474 + 142 / 2000 = q1 = 0,308 s = 611 + 773 / 2000 = q2 = 0,692 ρ = DL / √p1p2q1q2 ρ = 0,0699 / √0,543 * 0,458 * 0,308 * 0,692 = 0,304 X2 = ρ2 * n = (0,304)2 * 2000 = 184,83 X2 = 184,83 con 1 g.l. = p < 0,0001 Respuesta D = 0,0699 es estadísticamente diferente de 0, lo cual significa que los genes para los grupos sanguíneos MN y Ss están ligados. DL es frecuentemente 0 o muy cercano a 0, a menos que los genes estén separados por distancias menores a 100 kb. DL es frecuentemente 0 o muy cercano a 0, a menos que los genes estén separados por distancias menores a 100 kb. Otras causas de DL •genes que están presentes en dentro o muy cerca de inversiones cromosomales, •plantas que sufren regularmente auto-fertilización (la endogamia severa recombinación), reduce las oportunidades de Otras causas de DL •poblaciones recién fundadas con muy pocos individuos, •mezclas de dos poblaciones las cuales individualmente están en EHW pero tienen diferentes frecuencias alélicas, •especies (principalmente microorganismos) con reproducción asexual (clonal), •poblaciones en las cuales la selección natural favorece ciertos genotipos en detrimento de otros.