La introducción de los INI ha resultado ser un gran avance en la terapia antirretroviral, ampliando el abanico de opciones terapéuticas que se reducía a las tres familias clásicas de fármacos, los análogos y no análogos de nucleótidos y los inhibidores de la proteasa. Aunque hoy en día son perfectamente conocidas las rutas de resistencia a RAL, todavía se desconoce el papel que juega la presencia de los polimorfismos basales en la región de la integrasa en el fracaso al tratamiento antirretroviral. Aunque en la actualidad las guías terapéuticas no aconsejan el estudio de transmisión de mutaciones de resistencia a los INI en pacientes naive, a raíz de los dos primeros casos publicados de transmisión de mutaciones de resistencia en pacientes nuevos diagnósticos, las guías de la DHHS, en su actualización de Enero de 2011, abren la posibilidad de incluir el estudio de la región de la integrasa en los test de transmisión de resistencias primarias en pacientes naive. En este estudio hemos analizado la secuencia del gen de la integrasa del VIH-1 de pacientes naive con petición de estudio de resistencias basales con el fin de evaluar la presencia de mutaciones de resistencia descritas para los inhibidores de la integrasa y caracterizar la prevalencia de polimorfismos naturales en la región de la integrasa, evaluando la influencia de los factores clínicos y sociodemograficos más importantes de nuestra población de estudio, especialmente la influencia del subtipo y de la presencia de mutaciones de resistencia basales a otros ARV. Todo ello mediante las técnicas genotípicas de secuenciación de población y secuenciación masiva. En nuestro estudio tan sólo se encontraron algunas mutaciones de resistencia secundaria descritas como variantes polimórficas y no polimórficas por diferentes autores pero con escasa o nula influencia sobre la actividad de los INIs. No se aislaron mutaciones primarias de resistencia. Estos resultados siguen la idea general de que la presencia de mutaciones de resistencia en pacientes sin experiencia a INIs es anecdótica y con escasa influencia en la actividad de esta familia de antirretrovirales.