Terapia génica Antonio Martínez Laborda Área de Genética Departamento de Biología Aplicada Universidad Miguel Hernández de Elche Campus de Sant Joan d’Alacant Terapia génica Terapia génica Introducción • Medicina molecular: Dilucidación de las bases genéticas de las enfermedades, técnicas de diagnóstico y diseño de terapias adecuadas. Patología molecular Introducción - Terapia génica: Utilización de ácidos nucleicos con fines terapéuticos. Incluye: - Restaurar la función de un gen defectuoso. - Incrementar la función de un gen endógeno con fines terapéuticos. - Eliminar la expresión de un gen endógeno con efecto patológico o la expresión del gen/es de un patógeno. Requiere un profundo conocimiento de las causas moleculares de la enfermedad: - Identificación de células o tejido diana. - Identificación de los genes y proteínas implicados Introducción • La terapia génica, según la naturaleza de las células diana, la podemos clasificar en dos clases: - Terapia génica de células somáticas. Las células diana son células no germinales (no implicadas en la producción de gametos). Coherente con las técnicas generales de terapia médica, en las que el tratamiento no alcanza más allá del individuo afectado. - Terapia génica de células germinales. Implica la potencial modificación de la descendencia del individuo. En la actualidad, no se contempla dentro de la práctica médica, además de chocar con cuestiones éticas. Introducción • La terapia génica consiste en una serie de estrategias con finalidad terapéutica, basadas en la transferencia de material genético a un individuo. Esto se puede conseguir mediante técnicas in vivo y ex vivo. in vivo ex vivo Células del paciente X- Algunas células son ahora X+ Estrategias de terapia génica • Terapia de aumento génico (GAT) La terapia de aumento génico (GAT) consiste en la introducción y expresión de la versión silvestre de un gen para corregir enfermedades debidas al déficit de un determinado producto Estrategias de terapia génica • Terapia de aumento génico (GAT) - Problemas ocasionados por la pérdida de función del gen. - Copias adicionales el alelo normal aumenta la cantidad de producto funcional hasta un punto en el que se restablece el fenotipo normal. - Trastornos recesivos en los que una expresión modesta del gen introducido puede suponer una diferencia sustancial. - Las mutaciones dominantes por haploinsuficiencia no son buenas candidatas a tratarse con esta estrategia. Estrategias de terapia génica • Supresión dirigida de células específicas - Se ha utilizado en tratamientos de cánceres. - La eliminación directa consiste en la transferencia a las células de genes que codifican toxinas (genes suicidas) o agentes que confieren sesibilidad al tratamiento con determinados fármacos (prodrogas). - La eliminación indirecta consiste en la transferencia de un gen cuyo producto va a dirigir una respuesta inmune contra las células diana. Estrategias de terapia génica • Supresión dirigida de células específicas Eliminación directa de células Estrategias de terapia génica • Supresión dirigida de células específicas Eliminación indirecta de células Estrategias de terapia génica • Supresión dirigida de células específicas Eliminación directa de células Mecanismo de acción de Cerepro. Se trata de un vector adenoviral con el gen de la kinasa de timidina del virus herpes simple. La enzima convierte el ganciclovir en un producto tóxico para la célula. Estrategias de terapia génica • Inhibición dirigida de la función génica Gen antisentido m Inhibición Si las células enfermas presentan un nuevo producto génico o la expresión inadecuada de un gen, como en muchos casos de cáncer o en enfermedades infecciosas, se pueden diseñar estrategias para bloquear la expresión de un único gen en el DNA, el RNA o la proteína Estrategias de terapia génica • Inhibición dirigida de la función génica RNA antisentido y Ribozimas Estrategias de terapia génica • Inhibición dirigida de la función génica Interferencia de RNA (shRNA, siRNA, miRNA) Estrategias de terapia génica • Inhibición dirigida de la función génica Fosforotiorato Apuntes históricos de la Terapia Génica • 1967. El premio Nobel Marshall Niremberg argumenta las posibilidades y peligros de la terapia génica. • 1989. Steven A. Rosenberg llevó a cabo la primera transferencia génica aprobada en humanos. • 1991. Anderson y col. realizan el primer ensayo terapéutico con transferencia génica en pacientes de ADA. • 1999. Muerte de Jesse Gelsinger en un ensayo clínico para el tratamiento de una deficiencia parcial en la enzima ornitina transcarbamilasa. La muerte se produce por la respuesta inmunológica al vector adenoviral empleado. • 2000. Curación de la XSCID en los ensayos de terapia génica. No obstante, varios niños desarrollan leucemia por la integración de la secuencia introducida cerca de un protooncogén. Muere uno de ellos. Apuntes históricos de la Terapia Génica • 2003. Se aprueba en China el primer medicamento basado en técnicas de terapia génica (Gendicine). Se trata de un vector adenoviral en el que se sustituye la secuencia del gen E1 por la del gen supresor de tumores p53. Diseñado para el tratamiento de cánceres de cabeza y cuello. No obstante, se aprobó sin la realización de un ensayo clínico de fase III estándar. • 2012. El EMA (European Medicines Agency) aprueba el uso con restricciones de Glybera en la UE. Glybera se basa en un vector AAV que lleva un alelo de ganancia de función del gen para la enzima lipoproteína lipasa. Apuntes históricos de la Terapia Génica Vitravene es un oligonucleótido antisentido que inhibe la replicación del citomegalovirus (CMV), cuyas infecciones causan retinitis (deriva en ceguera en enfermos de SIDA) Macugen se ha diseñado para tratar la mácula degenerativa. Se trata de un aptámero que se une a la proteína VEGF (vascular endothelium growth factor), inhibiendo su función. VEGF tiene efectos angiogénicos y proinflamatorios que contribuyen a la patología. Vectores • La terapia génica requiere la introducción de ácidos nucleicos en células diana y, en ocasiones, la expresión funcional de las secuencias introducidas. • Los vectores son vehículos que facilitan la transferencia de ácidos nucleicos al interior de las células. • Los sistemas de vectores empleados en terapia génica pueden clasificarse en dos tipos: - Vectores virales. - Vectores no virales. Vectores. Liposomas • Vesículas esféricas compuestas de bicapa lipídica sintética que mimetiza la estructura de las membranas biológicas. • Clases de liposomas: - Aniónicos. Carga negativa. - Catiónicos. Carga positiva. La carga positiva estabiliza la unión del ADN con carga negativa. Vectores muy utilizados en los intentos de terapia in vivo. Vectores. Liposomas Vectores retrovirales Glicoproteína Reconocimiento de la célula hospedadora Receptor celular Virus de RNA Vectores retrovirales (gammaretrovirus) LTR Gag Pol LTR Env Promotor Proteínas de Retrotranscriptasa Glicoproteína la cápside Integrasa de la envuelta PBS Retrovirus MLV Sitio de poliA PPT Transgén. Hasta 8 kb Riesgos derivados de la inserción en el genoma de la célula receptora Sólo sirve para células que se están dividiendo (uso normal para terapia génica ex-vivo) Vectores retrovirales (gammaretrovirus) La secuencia U3 se duplica durante la transcripción inversa, por lo que aparece también en el LTR 5’ del provirus. Esta región contiene elementos esenciales para la transcripción del virus. Se deleciona para construir los vectores retrovirales SIN (selfinactivating) Vectores retrovirales (gammaretrovirus) Los vectores SIN utilizan un promotor fuerte CMV en lugar del promotor retroviral, lo que da lugar a mejores rendimientos. Además, presentan la deleción de la región U3. Una vez insertados, se minimizan los riesgos de movilización del vector y de activación de protooncogenes. Vectores retrovirales (lentivirus) A diferencia de los gammaretrovirus pueden infectar a células que no se dividen Vectores adenovirales P 36 kb de ADN bicatenario lineal E1 ITR E2 L1 L2 L3 L4 E2 E3 L5 E4 ITR Adenovirus Responsables de enfermedades respiratorias, conjuntivitis y gastroenteritis. Dan lugar a una fuerte respuesta inmunológica. P ITR E1 Prom cDNA E2 L1 L2 L3 L4 E2 E3 L5 E4 ITR 5,1 Kb Los vectores adenovirales de primera generación sustituían el gen E1 para acomodar hasta 5,1 kb, o sustituían los genes E1 y E3 para acomodar hasta 8,3 kb. Fuerte respuesta del sistema inmunitario. Se producen linfocitos T citotóxicos que eliminan a las células Infectadas. Vectores adenovirales Los vectores adenovirales de segunda generación se diseñaron con la intención de producir una respuesta inmunológica menos aguda. Eliminan los genes E1, E3, E2 y E4, lo que permite incorporar hasta 14 kb de inserto. No obstante, siguen produciendo respuesta citotóxica. Los vectores adenovirales de tercera generación sustituyen todas las secuencias del adenovirus, excepto las imprescindibles para la replicación del DNA viral (ITR) y para el empaquetamiento en la cápside () por un inserto de hasta 37 kb. Siguen produciendo respuestas inmunológicas debido a la cápside viral. Estos vectores permiten la transformación tanto de células en división como de células que no se dividen. Se pueden emplear in vivo y ex vivo. El DNA terapéutico no se inserta en el genoma de las células hospedadoras, quedando como episoma. Debido a la respuesta del sistema inmunológico contra el vector y las células infectadas, la expresión del transgén suele ser transitoria. Vectores AAV (virus asociados a adenovirus) ITR Rep Cap ITR AAV El genoma está formado por 4,7 kb de DNA lineal. Para su replicación precisa la colaboración de otro virus (adenovirus o herpesvirus). Las secuencias ITR son necesarias para la replicación, el empaquetamiento y la integración en un sitio específico del cromosoma 19. Los genes Rep y Cap determinan proteínas implicadas en la replicación y de la cápside. ITR Promot cDNA ITR Vector AAV Los vectores AAV sustituyen las secuencias Rep y Cap por el cDNA del gen terapéutico con un promotor y secuencias de poliadenilación. Mantienen las ITR. Se mantienen en la célula como episomas (al carecer de función Rep no se integra en el cromosoma 19). La expresión puede ser persistente . Pueden empaquetar hasta 4,5 kb de inserto. Vectores AAV (virus asociados a adenovirus) Hay al menos12 serotipos diferentes (AAV1-AAV12). El más utilizado es el AAV2. Sin embargo, cápsides de diferentes serotipos muestran distintos reconocimientos celulares. Por ello, se emplean vectores pseudotipos, que tienen secuencias ITR de AAV2 y la cápside de otro serotipo. Vectores empleados en los ensayos clínicos Las estrategias más empleadas de transferencia génica en los ensayos clínicos han sido los adenovirus, los retrovirus y el DNA desnudo. Ensayos clínicos de terapia génica Los ensayos clínicos se realizaban inicialmente para el tratamiento de enfermedades monogénicas raras, pero actualmente la mayoría de los ensayos están encaminados al tratamiento de diferentes tipos de cánceres. El primer éxito de la terapia génica: XSCID Los afectados de la inmunodeficiencia severa combinada ligada al X (XSCID o SCID-X1) son niños burbuja que carecen de la función de la subunidad gamma del receptor de interleucina 2 (IL2-RG o c). Por ello, carecen de linfocitos T, B, NK (natural killer) y otras células de defensa. Terapia génica empleada: introducción ex-vivo del cDNA que codifica la subunidad gamma con un vector retroviral (MFG(B2)‐γC) en células madre/progenitoras hematopoyéticas (HSPC) de la médula ósea de los pacientes y reintroducción de las células transfectadas sin quimioablación previa de las células de la médula ósea. Terapia génica para la XSCID Empaquetamiento del vector con el gen terapéutico en la cápside retroviral en una línea celular de ratón. Terapia génica para la XSCID PMBC: células mononucleadas de sangre periférica CD3: linfocitos B CD19: linfocitos T CD14: monocitos CD15: granulocitos CD56: células NK CD34: células de la médula ósea PCR semicuantitativa para detectar la expresión del transgén en diferentes tipos celulares de los dos pacientes. Terapia génica para la XSCID Abundancia de los diferentes tipos de linfocitos en los dos pacientes. Conteos de linfocitos T (CD3, CD8 y CD4), linfocitos B (CD19) y células NK (CD16, CD56). Ambos pacientes dejaron el aislamiento protector entre los días 90 y 95 después de la terapia. En el momento de la publicación, llevaban alrededor de un año viviendo en casa. Terapia génica para la XSCID De los 2 pacientes iniciales llevan el ensayo a un total de 10 pacientes. Terapia génica para la XSCID A) Los pacientes P4 y P5 mostraron una proliferación de linfocitos T muy rápida después de la terapia génica. B) Estos niños desarrollaron proliferación clonal incontrolada de linfocitos T a los 30 y 34 meses después de la terapia génica. Terapia génica para la XSCID Activación aberrante del protooncogén LMO2 que codifica un regulador central de la hematopoyesis. Las células que tienen esta activación proliferan más rápidamente y causan leucemia. Terapia génica para la XSCID Seguimiento, tras al menos 9 años después de iniciarse la terapia, de los pacientes tratados en los artículos anteriores. De los pacientes tratados 8 mostraron corrección inicial de la enfermedad. Uno de ellos dio resultado negativo y recibió trasplante de médula ósea (P3). Cuatro de los pacientes desarrollaron leucemia (P4, P5, P7 y P10) de los cuales uno falleció (P4). Siete pacientes, incluyendo los tres que sobrevivieron a la leucemia, han reconstituido su sistema inmune. Tres de éstos requirieron terapia de reemplazo de inmunoglobulina (P6, P7 y P10). Terapia génica para la ADA-SCID La inmunodeficiencia severa combinada por deficiencia de la enzima desaminasa de adenosina produce un fallo en el desarrollo y función de los linfocitos, así como otras anomalías físicas. Se ha utilizado terapia de reemplazo con PEG conjugado a ADA. La terapia génica se realiza sobre dos pacientes sin posibilidad de trasplante de médula ósea ni terapia de reemplazo. La terapia consiste en la introducción de un transgén ADA mediante un vector retroviral en células madre hematopoyéticas (HSC) y reintroducción en el paciente tras acondicionamiento no mieloablativo. Terapia génica para la ADA-SCID Vector empleado en el ensayo. Terapia génica para la ADA-SCID Neutrófilos y Plaquetas Linfocitos Linfocitos T, Linfocitos NK y Linfocitos B Reconstitución de la hematopoyesis y de linfocitos tras la terapia génica. Terapia génica para la ADA-SCID Linfocitos T Granulocitos HST Linfocitos NK Linfocitos T HST Linfocitos B Paciente 1 Linfocitos B Linfocitos NK Granulocitos Determinación de células con el vector mediante RT-PCR. Paciente 2 Terapia génica para la ADA-SCID Glóbulos rojos Linfocitos Actividad ADA Terapia génica para la ADA-SCID Amplían el estudio anterior a diez niños. Todos ellos están vivos tras un seguimiento desde 1,8 a 8 años, según los individuos. Nueve pacientes reconstituyeron un sistema inmune activo y protección activa contra infecciones, uno de éstos (paciente 2) tuvo que recibir tratamiento de reemplazo enzimático con PEG-ADA a 4,5 años del inicio de la terapia génica. El paciente 8 presentó episodios recurrentes de anemia hemolítica y trombocitopenia autoinmunes. Tuvo que ser tratado y no se pudo evaluar. Terapia génica para la ADA-SCID Persistencia de las células transducidas, de la actividad ADA y los metabolitos de la purina en la sangre periférica Terapia génica para la MLD La leucodistrofia metacromática es una enfermedad neurodegenerativa mortal por la carencia de función del gen ARSA, que codifica la enzima lisosomal arilsulfatasa B, implicada en el metabolismo de los esfingolípidos. No existe tratamiento farmacológico para la enfermedad. Tratamientos posibles de la enfermedad son el trasplante de células madre de la hematopoyesis (HSC) y la terapia génica de HSC del paciente. La progenie de estas células migra a los tejidos afectados. Terapia génica para la MLD Presencia del vector en células de la médula ósea y de sangre periférica. Terapia génica para la MLD Actividad de la enzima en granulocitos (CD15), monocitos (CD14) y en el líquido cefalorraquídeo (CNF). Terapia génica para la MLD Medida de la función motora Velocidad de conducción nerviosa La terapia génica proporciona un evidente beneficio terapéutico a los pacientes. Desmielinización severa asociada a atrofia cerebral Terapia génica para la MLD Porcentaje de lecturas de secuencia para cada inserción independiente. No hay ningún clon que esté sobrerrepresentado (no hay leucemia). Terapia génica para la MLD Dra. Biffi Los afectados por este síndrome a los 30 meses van en silla de ruedas, son incapaces de aguantar la cabeza y no pueden hablar. Los niños tratados en este ensayo pueden ponerse en pie, y andar y correr sin ayuda. Presentan un coeficiente intelectual, lenguaje y habilidades cognitivas normales. Terapia génica para enfermedades de la retina Utilización de un vector AAV para mediar la transferencia génica. Estos vectores son muy empleados en la terapia génica de enfermedades retinianas. Terapia génica para enfermedades de la retina Inyección del vector en el área de la retina. Terapia génica para la LCA2 La amaurosis congénita de Leber de tipo 2 (LCA2) causa ceguera por mutaciones en el gen RPE65, que codifica una enzima crítica del ciclo de los retinoides, no produciéndose 11-cis-retinal, el cromóforo de los conos y los bastones. Finalmente, hay degeneración de la retina y ceguera sobre los 30-40 años. Tratamiento mediante inyección subretinal de un vector AAV que expresa el gen RPE65 (AAV2-hRPE65v2) en el peor de los ojos a dosis baja (1,5x1010 genomas del vector), media (4,8x1010 genomas del vector) y elevada (1,5x1011 genomas del vector). Terapia génica para la LCA2 Datos de los 12 pacientes incluidos en el tratamiento Terapia génica para la LCA2 Se produce incremento de la agudeza visual en los tres pacientes que han recibido dosis baja (NP01, NP02 y NP03), tres que han recibido dosis media (NP04, CH10 y CH11) y uno al que se le ha administrado la dosis elevada (NP15). Hay disminución en un paciente (CH06). No hay variaciones significativas en el resto. Terapia génica para la LCA2 9 24 10 8 35 20 44 Diferencias en sensibilidad entre el ojo inyectado y el ojo no inyectado. La mejora en la sensibilidad es particularmente notable en los pacientes más jóvenes. Terapia Génica para la LCA2 A) Mejora de los reflejos de la pupila en respuesta a la luz. B) Correlación de la mejora en la sensibilidad a la luz y la edad del paciente. Terapia génica para la LCA2 Terapia génica para la LCA2 Tres pacientes del estudio anterior (NP01, CH11 y CH12) participan en un ensayo para establecer posibles mejoras tras una inyección con la dosis máxima (1,5x1011 genomas del vector) en el ojo no intervenido en el primer ensayo. Terapia génica para la LCA2 Características de los pacientes y detalles de la intervención. Terapia génica para la LCA2 Sensibilidad a la luz blanca (blanco y negro), Pupilometría. Amplitud de al rojo y a la luz azul (visión cromática). la constricción de la pupila tras iluminación.