CSIC Instituto de Investigaciones Marinas de Vigo.

Beatriz Novoa Novoa & Figueras’ lab Grupo Inmunología y Genómica Ins=tuto de Inves=gaciones Marinas, Vigo CSIC -­‐ Laboratorio Nacional de Referencia de enfermedades de moluscos -­‐  MOLUSCOS -­‐ Respuesta inmune y resistencia frente a enfermedades -­‐ Genoma del mejillón gallego (M. galloprovincialis) -­‐ Genómica y transcriptómica -­‐ Pép?dos an?microbianos. Las mi?cina Secuenciaciones masivas. Genómica y transcriptómica (Proyecto Consolider) -­‐ PECES -­‐ Secuenciación del genoma de rodaballo -­‐ Respuesta inmune de peces y aplicación a vacunación e inmunomodulación (también pez cebra). -­‐ Pez cebra: estudios orientados a biomedicina: FishforPharma MOLUSCOS -­‐ Laboratorio Nacional de Referencia de enfermedades de moluscos -­‐ Respuesta inmune y resistencia frente a enfermedades -­‐ Genoma del mejillón gallego (M. Galloprovincialis) -­‐ Genómica y transcriptómica -­‐ Pép?dos an?microbianos. Las mi?cina Enfermedades de moluscos de declaración obligatoria en la UE: Direc=va 2006/88/CE modificada por la Direc=va 2008/53/EC España: Real Decreto 1614/2008 No exó=cas (en determinadas zonas dentro de la UE) •I  nfec?on with Marteilia refringens • Infec?on with Bonamia ostreae Exó=cas (no se han detectado en Europa) -­‐ Infec?on with Bonamia exi1osa • Infec?on with Perkinsus marinus •I  nfec?on with Microcytos mackini Enfermedades emergentes • Herpes virus µvar •(  Regula?on 175/2010) Política de zonificación según estatus
zoosanitario para regular movimiento de
stocks: zonas libres / no libres. Sistema de no=ficación de enfermedades de declaración obligatoria en la UE Laboratorios autorizados Autoridades veterinarias locales Auto
ri
vete dades rinar
centr ias ales Laboratorio Nacional de Referencia (NRL) Productores Comision Europea Laboratorio Europeo de Referencia - El Laboratorio Europeo de Referencia y Laboratorios Nacionales y autorizados
deben contribuir a la uniformidad de los resultados: Deben operar bajo las
directrices de la norma ISO 17025 (requerimientos tanto técnicos como de
gestión)
Laboratorio Nacional de Referencia (LNR):
CSIC
- Coordinación de los métodos de diagnóstico
- Formación de expertos patólogos
- Participar en las pruebas de intercomparación
- Organizar pruebas de intercomparación a nivel
nacional y colaborar con el LER
-­‐ Laboratorio Nacional de Referencia de enfermedades de moluscos INVESTIGACIÓN -­‐ Respuesta inmune y resistencia frente a enfermedades -­‐ Genoma del mejillón gallego (M. galloprovincialis) -­‐ Genómica y transcriptómica -­‐ Pép=dos an=microbianos. Las mi=cina Moluscos: No tienen respuesta inmune
adaptativa (anticuerpos)
Cultivo en mar NO VACUNAS
NO TRATAMIENTOS
¿Cómo luchar contra la enfermedad?
Técnicas rápidas de diagnóstico
Evaluación del nivel de salud de los animales
Podríamos identificar genes que se expresan en respuesta a patógenos y
utilizarlos como marcadores del estado inmunológico?
MUCHOS ESTUDIOS DE PATOLOGÍA Y DE RESPUESTA INMUNE SIN EMBARGO… BASES MOLECULARES DE LA RESPUESTA INMUNE: POCO CONOCIDAS: NO HOMOLOGÍA CON GENES INMUNES DE VERTEBRADOS PROYECTOS: PN: BASES MOLECULARES DE LA RESPUESTA INMUNE DE MOLUSCOS BIVALVOS 2003-­‐2006 PN: GENES DE MOLUSCOS BIVALVOS IMPLICADOS EN LA RESISTENCIA FRENTE A ENFERMEDADES Y EN LA INTERACCIÓN CON AGENTES PATÓGENOS (2009-­‐2011) EU: IMPROVED IMMUNITY OF AQUACULTURED ANIMALS (IMAQUANIM) 2005-­‐2010 EU: CONTROLLING INFECTIOUS DISEASES IN OYSTERS AND MUSSELS IN EUROPE (BIVALIFE) 2011-­‐2014 EU: RESEARCH TO IMPROVE PRODUCTION OF SEED OF ESTABLISHED AND EMERGING BIVALVE SPECIES IN EUROPEAN HATCHERIES (REPROSEED) 2010-­‐2014 XUNTA DE GALICIA: SECUENCIACIÓN DEL GENOMA DEL MEJILLÓN GALLEGO 2010-­‐2013 Mi=cina C La mayor parte de los genes expresados en mejillón son pép?dos an?microbianos: MITICINA C -­‐ elevada variabilidad. -­‐modulación del sistema inmune -­‐acción directa frente a bacterias y frente a virus envueltos. Almeja japonesa (Moreira et al., 2012) Describimos unas 50.000 nuevas secuencias en R .philliphinarum.Alrededor de un 10% son genes potencialmente inmunes: Rutas del complemento, TLRs, apoptosis, etc REPROSEED: Research to improve produc=on of seed of established and emerging bivalve species in European hatcheries . UE, 245119 OBJETIVO: U?lizar aproximaciones teóricas y aplicadas para estudiar los procesos biológicos complejos del desarrollo larvario e implementar nuevas tecnologías que permitan aumentar la producción de semillas de bivalvos en Europa. ESPECIES: almeja, mejillón, vieira Nuestra tarea: desarrollo de herramientas genómicas para determinar perfiles de expresión génica asociada a dis?ntos procesos o fases de la producción de semilla: Ej: -­‐Perfil de expresión génica asociado a la calidad de los gametos -­‐Ontogenia del sistema inmune -­‐Perfil de expresión génica asociado a la metamorfosis. -­‐Cambios relacionados con sistemas de recirculación del agua PROBLEMAS: Escaso número de secuencias en las bases de datos SOLUCIÓN: Secuenciaciones masivas en las 3 especies Proyectos de “Acercamiento” entre el sector y la inves=gación EU: GENOMIC IN FISH AND SHELLFISH: FROM RESEARCH TO AQUACULTURE (AQUAGENOME) 2006-­‐2008 EU: INTEGRATED KNOWLEDGE ON FUNCTIONAL GENOMICS IN SUSTAINABLE AQUACULTURE (AQUAFUNC) 2005-­‐2007 EU: BRIDGING THE GAP BETWEEN SCIENCE AND PRODUCERS TO SUPPORT THE EUROPEAN MARINE MOLLUSC PRODUCTION SECTOR (EUROSHELL) 2012-­‐2014 PECES Secuenciaciones masivas. Genómica y transcriptómica (Proyecto Consolider) -­‐ Secuenciación del genoma de rodaballo -­‐ Respuesta inmune de peces y aplicación a vacunación e inmunomodulación (también pez cebra). -­‐ Pez cebra: estudios orientados a biomedicina: FishforPharma TRANSCRIPTOMA ANTIVIRAL DE RODABALLO -­‐ Healthy turbot larvae at early developmental stages (un=l 1 month) -­‐Nodavirus (AH95-­‐NorA) -­‐ VHSV (UK-­‐860/94) -­‐ Poly I:C -­‐ pMCV 1.4-­‐ empty -­‐ pMCV 1.4-­‐G860 Brain: 24 h and 3 d p.i. Gills, liver, spleen and head kidney: 1 h, 6 h, 24 h, 3 d, 7 d y 14 d p.i. Rodaballo   Perfil transcriptómico de familias de rodaballo resistentes y sensibles a VHSV •  Se iden?ficaron marcadores transcriptómicos relacionados con la resistencia a VHSV •  Selección reproductores Rodaballo   Análisis de los perfiles transcriptómicos asociados a la protección proporcionada por una vacuna de DNA frente a VHSV en rodaballo Desarrollo de una vacuna de ADN altamente efec?va frente a VHSV PERFIL TRANSCRIPTÓMICO ASOCIUDO A LA VACUNACIÓN Y A LA INFECCION VIRAL -­‐ SELECCIÓN DE ADYUVANTES PARA INCREMENTAR LA EFICACIA DE VACUNAS O PARA SU USO COMO INMUNOESTIMULANTES -­‐ GENES MARCADORES PECES Secuenciaciones masivas. Genómica y transcriptómica (Proyecto Consolider) -­‐ Secuenciación del genoma de rodaballo -­‐ Respuesta inmune de peces y aplicación a vacunación e inmunomodulación (también pez cebra). -­‐ Pez cebra: estudios orientados a biomedicina: FishforPharma Pez cebra: respuesta inmune frente a patógenos. La inflamación Inflamación -­‐ Caracterización y señalización de dis?ntas citoquinas inflamatorias: IL6, IL22, C3 (Rodriguez et al., 2008, 2009; Novoa et al., 2009, Varela et al, 2012; Novoa & Figueras, 2012; Costa et al., 2013; : Dios et al, submiqed, Forn-­‐Cuní et al., submiqed). -­‐ Obesidad: perfiles de expresión y relación de la obesidad con la respuesta inmune Modelo en infecciones virales (Novoa et al., 2006; Dios et al., 2010; Encinas et al., 2010; Varela et al., submiqed) Inflamación crónica: La obesidad y su relación con la respuesta inmune Hígado de peces normales Hígado de peces gordos 2 meals/day
8 months
5 meals/day
8 months
{
{
Contro
P BS ip
LP S ip
Fat hist
P BS ip
LP S ip
Secuenciación de genomas:  Secuenciación del genoma del mejillón gallego . Xunta de Galicia, 10 PXIB 402 096 PR , con la Uvigo  Secuenciación del genoma del rodaballo. Consolider Aquagenomics, CSIC. Con la USC.