Genética poblacional y filogeografía de Caretta caretta

TESIS DE GRADO CIENTÍFICO
DOCTOR EN CIENCIAS BIOLÓGICAS
“Genética poblacional y filogeografía de Caretta caretta (Linnaeus, 1758)
y Chelonia mydas (Linnaeus, 1758): Una perspectiva regional con énfasis
en el suroeste de Cuba”
Autor: Lic. Ariel Ruiz Urquiola
Tutores: Dra. Georgina Espinosa López1
Dr. Federico Alberto Abreu Grobois2
1Facultad
de Biología, Universidad de La Habana
Mazatlán, Instituto de Ciencias del Mar y Limnología,
Universidad Nacional Autónoma de México
2Unidad
Centro de Investigaciones Marinas
Universidad de La Habana
La Habana, 2008
A la memoria de:
Osniel Marínez Pelikián
Lutgarda C.. González Géigel
Pedro Blanco Blanco
Armelio Frometa Fals
A las causas de los imposibles
La diversidad genética significa para las poblaciones silvestres
Lo mismo que la Libertad para el Homo sapiens
Un H. sapiens sin pensamiento es víctima de las circunstancias
y con pensamiento lo es de sí mismo, es más libre
AGRADECIMIENTOS
Si fuera católico tendría que creer que este acto de defensa es un milagro y en consecuencia, tendría que agradecer
además de a la santísima Trinidad, a las once mil vírgenes y no sé cuántos santos. Al creer en la naturaleza como
máxima expresión de la divinidad entonces, creo que este acto de defensa es el fruto de energías impartidas desde
muchos cuerpos y posiciones geográficas disímiles, y entonces tengo que agradecer al menos a los animados que de
una forma u otra han contribuido a que este tercer tema fraguara en medio de tempestades, cuyo meollo no ha sido
otra cosa que el compromiso más que con la verdad científica per se, con la clarificación de una problemática
ambiental que ha sido en gran medida obsesión de mis últimos diez años, desde que era estudiante de la Facultad de
Biología de la Universidad de La Habana: el uso sostenible de las tortugas marinas en Cuba. Si mis modestos
esfuerzos, aunque con inversiones energéticas desmedidas de mi persona, no hubieran contribuido a aportar
información útil para evaluar el uso consuntivo de las tortugas marinas en lo que a principios de este año se
reconoce como veda permanente e indefinida a la pesquería de este recurso, jamás hubiera defendido una tesis
académica de esta naturaleza.
Dra. Georgina Espinosa, tutora de esta tesis y madraza del autor, quien ha representado en primera instancia un
ejemplo genuino de la dignidad de un científico, albergando un profundo pensamiento y un compromiso exclusivo
con los resultados de la investigación y de la repercusión de éstos en la sociedad, donde en definitivas cuentas, se
han de tomar las decisiones derivadas. Cualquier calificativo positivo como profesora y ser humano sería incompleto
para referirme a tan distinguido, y cada vez más raro ejemplar dentro de la sociedad del hombre nuevo, por eso, he
de concluir sencillamente con una frase: gracias por existir y formar hombres de bien, aunque excepcionalmente y por
fortuna, algunos no hayamos perdido la capacidad de recalcitrar.
Dr. F. Alberto Grobois, también tutor de esta tesis y padrazo del autor, con quien he lidiado en contiendas
académicas por la búsqueda, única y exclusivamente, de la mayor aproximación a la verdad científica más allá de
cualquier posición de fuerza. A través de su guardarraya he podido abrirme paso en la comunidad científica
internacional y como si fuera poco, encontrar abrigo en su guarida y con su querida y heterogénea familia. También
le doy mis gracias por apoyar en la formación de mis estudiantes y ayudar a mi familia en la medida de sus
posibilidades.
Dr. Erik García, oponente en el acto de predefensa de esta tesis, por contribuir de forma significativa a mi
formación como obrero de la ciencia desde tempranos momentos, cuando parecería un loquillo investigando raros
lagartijos endémicos de nuestro archipiélago. Sus aportaciones han sido esenciales para mejorar la calidad de mis
investigaciones, y ahora, del documento defendido. Muchas gracias por mantenerse como formador a pesar de las
circunstancias.
Dr. Vicente Berovides, también oponente en el acto de predefensa de esta tesis, por su excelente crítica para mejorar
la calidad del documento defendido y por sus extenuantes preguntas, que aún me llevan a la reflexión.
Dra. Clara González, oponente a petición en el acto de predefensa de esta tesis, en primera instancia por aún ser
formadora de generaciones de biólogos. Las correcciones derivadas de la exhaustiva revisión del documento
realizadas por su persona, han sido responsables de la notoria mejoría con que ahora se vuelve a presentar. También
quiero agradecer por la conformación de un examen de especialidad, conjuntamente con los profesores Dr. Erik
García y MC. Rina Pedrol, que me preparó sólidamente para la discusión de la tesis.
Dra. Aymée Robainas, por contribuir en calidad de oponente y revisora de varias de las tesis de mis estudiantes,
cuyas correcciones están reflejadas explícitamente en esta tesis. Además de admirarla como profesional, también
fenotípicamente, he de reconocer sus valores excepcionales entre los que resalto la amistad, cualidad compartida con
los distinguidos miembros de su familia cercana.
Dra. Ana M. Suárez, sin su ayuda no hubiera llegado y más que pasar la meta, hacerlo con alegría a pesar de las
circunstancias. Creo que su ejemplo en todos los campos me ha servido de pie de amigo, sobre todo para balancear la
otra cara de la enfermedad.
Dra. María Eugenia Alonso, en primera instancia por encausar mis mejores energías para hacer frente a la
enfermedad y luego, por torearme en ausencia de mi madraza para llegar a pesar de la arbitrariedad, que siempre
disocia.
MC. Rina Pedrol, por su excelencia como pedagoga, ejercida con particular elegancia.
Dra. María Elena Ibarra, por contribuir a abrir un espacio dentro del ámbito universitario para la investigación de
las tortugas marinas. Estaría insatisfecho si no expresará también mi gratitud por la ayuda recibida en el plano
familiar y por los logros de conjunto en tiempos pasados.
Especialmente, a mis estudiantes cuyas tesis han tenido que ver directamente con el desarrollo de las investigaciones
biológicas y de conservación de las tortugas marinas: MC. Idania Lee, MC. Emir Pérez, MC. Roberto C. Frías,
MC. Maribel González, Lic. Javier Rodríguez, Lic. Frander B. Riverón, Lic. Mayumi Vega, Lic. Talia Pérez, Lic.
Juan Solano, Lic. Yuzneydy Pereira, y Diseñadores Néstor Navarro y Marwin Sánchez. Sin el aporte de ellos, esta
contribución sería no sólo incompleta, sino pobre.
En particular, he de destacar la ayuda en la búsqueda de información y contribución científica del MC. Emir Pérez,
por demás, hermano en los avatares de la vida a pesar de tener una formación ideológica diferente, quizás más
encausada.
Dra. Nancy N. FitzSimmons y Dr. James W. Wiley, por la revisión de parte de la información científica generada
para esta tesis, facilitación de bibliografía y consejos impartidos para llegar.
Dr. Rogelio Díaz, de quien siempre recibí buenos consejos sensus latior a pesar de discrepar en un principio sobre la
permisividad del uso consuntivo de Eretmochelys imbricata. Creo que fue muy paciente conmigo. Parte de las
muestras aportadas para este trabajo fueron colectadas por su persona, y generosamente ha permitido el uso de sus
datos originales que le sirvieron para obtener el grado científico de Doctor, con una sola condicionante: el
alumbramiento de información confiable para la actualización del plan de manejo de E. imbricata en Cuba. A su
persona le debo gestos humanos para contrarrestar la enfermedad, que me permitieron continuar con mi actividad
científica. Nunca lo podré olvidar.
Lic. Madelín Ramos, cuyas manos formaron parte del procesamiento de varias de las muestras de esta tesis y
también ayudaron en la colecta, en condiciones difíciles, junto a otros amigos como Barbarita, Elier y Daniel.
Bibliotecaria Yuriem Lezcano del CIM-UH, por su enriquecedora revisión de las referencias bibliográficas. También
por su apoyo en momentos difíciles.
Bibliotecaria Clara Ramírez de la UNAM, por su ayuda profesional para optimizar la búsqueda de bibliografía,
sobre todo de los clásicos.
MC. Sylvia Leal, por su apoyo en la corrección de los artículos a publicar. También por su cariño.
Lic. Gonzalo Nodarse, Téc. Biología Marina Erick Escobar, MC. Julia Azanza y personal de apoyo a la
investigación, cuyos nombres a veces son sustituidos por los jefes de proyectos, por la facilitación de buena parte de
las muestras procesadas en esta tesis.
A los pescadores de la Empresa Pesquera Industrial de Camagüey: Miguel Camps, Juan Pajares, Amado Blanco,
Jorge L. Fals, Idilberto Fals, Osvaldo Fals, el niño y sus esposas, en particular Norma, Clarita, Blanquita y
Mayda, y a su dirección: en particular al Ing. Ángel Freyre (Director), Ernesto Aguilar (Subdirector de Operaciones
Pesqueras), Juan Miguel (Subdirector económico) y a los entonces Jefes de Flota (Armelio Frometa) y transporte
(Jorge Beber), al igual que a los pescadores de la unidad pesquera de Cocodrilo, pertenecientes a la Empresa
Pesquera de la Isla de la juventud: Alexis Meneses, Fulgencio, Abel, Gerardo y Eltón, y a Mirta, la directora de
entonces, por facilitar la infraestructura para la toma de muestras y por la información aportada en relación a la
pesquería, aspectos biológicos y comercialización de las tortugas marinas.
A mis colegas Dra. Graciela Olmedo y Dra. Olimpia Carrillo, cuya excelencia en su investigación arrojó luz sobre los
conceptos de “tradición” y “valor nutricional”, aplicados como uno de los basamentos para mantener el uso
consuntivo legal de las tortugas marinas en Cuba.
A las profesoras del Instituto Superior de Diseño, Dis. Michel Miyarez y MC. Lucila Fernández, por la
profesionalidad con la que asumieron la emprendedora y exhaustiva Campaña de Bien Público para la Conservación
de las tortugas marinas en Cuba.
Lic. Sergio Álvarez por su ayuda para que fluyera la presentación de la tesis durante el acto de predefensa y por su
amistad.
A mi enigmática MC. Olivia Millán, por nuestras pláticas exigentes sobre temáticas de genética y por compartir
momentos especiales a la sombra de un té de café, en compañía de la querida MC. María de los Ángeles, MC. Nadia
y Lic. Ricardo, a los cuales también debo mi subsistencia en tierras aztecas.
Natalia, sin su abrigo no hubiera llegado.
MC. Raquel Briseño por aunar a la mayoría del gremio de tortugas marinas y encausarnos por el camino más recto,
por su sensatez y acertados juicios que con su glamour nos ha mejorado a todos.
Hada Marydele Donnelly, MC. Fernando Bretos y Dr. David Gugenheim por el apoyo material y espiritual en pos
de la capacitación y desarrollo de proyectos de jóvenes científicos cubanos.
MC. Leandro Bombino, por tratar de llevar a vías de hecho un macroproyecto para la conservación de las tortugas
marinas en los archipiélagos cercanos al Camagüey y por su ayuda extraordinaria para encausar algunos de nuestros
trabajos de investigación, en la cual también ha estado involucrado el aliviar el peso de la enfermedad.
Susana, Celia y Fausto, a quienes debo la impresión y fotocopia de la documentación requerida para la predefensa.
Ahora de nuevo a Susana y nuevos colaboradores Olguita, Jorge y Berta.
Carpintero Marcial Blanco, otro padrazo de la Ciénaga de Zapata con quien hice el amadrinador de tortugas
marinas, instrumento de gran utilidad para el manejo de estos animales que ha sido objeto de atención para otros
investigadores.
Mayda Pelikián, madre de un gran amigo, devenido en un pescador responsable, y madraza del autor, por su enorme
capacidad de recuperación que inspira a cualquier semilla. Por ayudarme a frenar el avance de la enfermedad.
Tía-Mayra y Fela, otras madrazas pinareñas, sin las cuales no hubiera podido avanzar contra la enfermedad.
A mis compañeros de trabajo más cercanos del CIM-UH, que prefiero no nombrar en mi paranoia, por el
intercambio académico, por compartir gratos momentos y por ayudarme contra la enfermedad.
MC. Patricia González y MC. Silvia Díaz, hermana y madre en difíciles circunstancias.
Dra. Concepción Campa, sin su ayuda hoy no estaría aquí, tampoco los miembros más queridos de mi familia.
A mis hermanos de aquí no mencionados con anterioridad: René, Jorge Luis, Liuba, Rosita, Maite, Alejandro,
Maickel y Oscar, y a los desperdigados: Susana, Ernesto, Pedro Pablo, Adyari, Erwin, Omar, Daniel, Daylin,
Gabriel, Margarita, Armando, Idabel e Hidalgo. Sin ellos tampoco estaríamos aquí.
A mis amigos foráneos Olga, Jimena, Benjamín, Julien, Constanza, Cecilia, Martín, Rosalba, Germán, Carlos,
Mary, Ingmar, Marfer, Antonio y Ruco, colaboradores en disímiles circunstancias.
A los médicos Fleites, Jorge Luis, Areces, Rubio, Juanca, Tania, Barroso y Luis, a las farmacéuticas María
Antonieta y Arays, y a las enfermeras Adalgiza, Giselle, Aidita, Lucy y Martica, sin la contribución de ellos
tampoco estaríamos aquí.
A los que ya no están y dedico esta contribución científica, que no voy a nombrar porque quiero que sigan en paz,
por ellos también estoy aquí.
A mi hermana, madre, padre y tío por perseverar ante lo extremo, que se contrapone a la existencia. En la balanza
de cargas nefastas, ha sido el peso de ustedes el que me ha evitado perder el equilibrio y sacar ese extra en mi cuarto
e indeseado tema, que sin lugar a dudas me hizo mejor persona y me fortaleció mi capacidad de denuncia, ya grande.
Si algunos nombres han escapado de mis agradecimientos, sobre todo aquellos que de una forma u otra han estado
relacionados con mi proyecto de investigación, las personas a las que distinguen no han de sentirse excluidos. En mis
circunstancias no he podido dejar de asumir el reto de nombrar y asumo la responsabilidad de cualquier descuido.
Por último y no por considerarlo menos importante, a la naturaleza cubana de quien se ha servido íntegramente este
trabajo y quien me flechó desde muy temprano y para siempre.
Índice
Nomenclatura, abreviaturas, y algunas conceptualizaciones empleadas……………...………..…….i
SÍNTESIS..........................................................................................................................................ii
I. INTRODUCCIÓN..........................................................................................................................01
Hipótesis de trabajo.........................................................................................................................05
Novedad científica...........................................................................................................................05
Importancia teórica..........................................................................................................................06
Importancia práctica........................................................................................................................06
II. REVISIÓN BIBLIOGRÁFICA
II.1 Estatus de las poblaciones de anidación en el Atlántico
II.1.1 Chelonia mydas................... .................................................................................................08
II.1.2 Caretta caretta.......................................................................................................................11
II.2 El mtDNA como marcador molecular en la biología poblacional y evolutiva...................13
II.3 Marcadores moleculares: herramientas útiles para la conservación................................15
II.4 Descripción de la RNC del mtDNA
II.4.1 Chelonia mydas.....................................................................................................................17
II.4.2 Caretta. caretta......................................................................................................................18
II.5 Estructura poblacional en el Atlántico
II.5.1 Chelonia mydas.....................................................................................................................18
II.5.2 Caretta caretta.......................................................................................................................20
II.6 Diversidad genética en el Atlántico
Chelonia mydas y Caretta caretta..................................................................................................24
II.7 Filogenia y Filogeografía
II.7.1 Chelonia mydas.....................................................................................................................26
II.7.2. Caretta caretta......................................................................................................................29
III. MATERIALES Y MÉTODOS
III.1 Obtención y procesamiento de las muestras.....................................................................32
III.2 Análisis de los datos.............................................................................................................35
IV. RESULTADOS
IV.1 Análisis de secuencias
IV.1.1 Chelonia mydas……............................................................................................................42
IV.1.2 Caretta caretta……..............................................................................................................45
IV.2 Estructura poblacional
IV.2.1 Chelonia mydas……............................................................................................................48
IV.2.2 Caretta caretta……..............................................................................................................50
IV.3 Diversidad genética
IV.3.1 Chelonia mydas……............................................................................................................56
IV.3.2 Caretta caretta……..............................................................................................................58
IV.4 Relaciones filogenéticas y filogeográficas
IV.4.1 Chelonia mydas……............................................................................................................61
IV.4.2 Caretta caretta……..............................................................................................................64
V. DISCUSIÓN
V.1 Análisis de secuencias.........................................................................................................69
V.2 Estructura poblacional.........................................................................................................72
V.3 Diversidad genética.............................................................................................................79
V.4 Relaciones filogenéticas y filogeográficas.......................................................................90
V.5 Implicaciones para la conservación..................................................................................94
VI. CONCLUSIONES...................................................................................................................97
VII. RECOMENDACIONES.........................................................................................................99
VIII. REFERENCIAS BIBLIOGRÁFICAS
AUTOBIBLIOGRAFÍA
Publicaciones que forman parte de la tesis
Otras publicaciones relacionadas con el tema
Secuencias inscritas en el Genbank
Trabajos presentados en eventos científicos relacionados con el tema de tesis
NOMENCLATURA, ABREVIATURAS, Y ALGUNAS CONCEPTUALIZACIONES ________________________________________
i
Nomenclatura, abreviaturas, y algunas conceptualizaciones empleadas:
A
AMOVA
C
conducta de reproducción
en el lugar de origen (Inglés.
Natal homing)
CpG
Cuenca
ddNTP
DNA
dNTP
Fidelidad por el sitio de
anidación
Filopatría
G
Indel
Linaje
MA
Mediterráneo, a
mtDNA
nDNA
pb
PCR
Población
RNC
scnDNA
SP
Stepping-stone model
T
Adenina
Análisis de la varianza molecular
Citosina
Término construido por el autor en calidad de análogo del término inglés “natal homing”
aplicado a tortugas marinas por ser especies filopátridas y fieles al sitio de anidación según
Carr (1967 & 1975).
Gen. Formalmente isla CpG. Dícese de la región de DNA de al menos 200 pb, con un
porcentaje de GC mayor de 50 y con un promedio de CpG observado/esperado mayor de
0.6 adaptado de Gardiner-Garden & Frommer (1987) y Takai & Jones (2002).
Del lat. Concha: f. Territorio cuyas aguas afluyen todas a un mismo río, lago o mar.
• cuenca atlántica; dícese de los territorios cuyas aguas confluyen finalmente en el
océano Atlántico, i.e. costa este de América, islas del mar Caribe y Golfo de México, y
costas oeste de África y Europa.
• cuenca del mar Mediterráneo; dícese de los territorios cuyas aguas confluyen finalmente
en el mar Mediterráneo.
Didesoxinucleótidos
Ácido desoxirribonucleíco
Desoxinucleótidos
Capacidad de discriminar el lugar de anidación respecto al primer sitio de puesta, una vez
el individuo encuentra el área de reproducción (anidación) (adaptado de Carr (1967 &
1975))
Capacidad de discriminar la región donde se ubica el área de reproducción (anidación), una
vez el individuo completa la migración (adaptado de Carr (1967 & 1975))
Guanina
Inserción/ deleción – plural: indeles
Del prov. linhatge o cat. Llinyatge: m. Ascendencia o descendencia de cualquier familia.
Evol. Series de poblaciones ancestrales y descendientes a través del tiempo. Usualmente
se refiere a la evolución de una sola especie o a varias especies descendientes de un
ancestro común. Gen. Estirpe de variantes genéticas que comparten un ancestro común,
donde median de uno a dos cambios entre las vecinas, rara vez tres.
• mediterráneos americano – Viejo Mundo; dícese del linaje cuyos haplotipos pertenecen
a colonias de anidación con costas en el mar Caribe, Golfo de México, costa atlántica de
la península de la Florida y mar Mediterráneo.
• Atlántico Sur; dícese del linaje cuyos haplotipos pertenecen a colonias de anidación de
América del Sur con costas en el océano Atlántico.
• Atlántico – península de la Florida; dícese del linaje cuyos haplotipos pertenecen a
colonias de anidación con costas en el océano atlántico y ambas costas de la península
de la Florida.
Millones de años
Del lat. Mediterraneus: adj. Dícese de lo que está rodeado de tierra e.g., mar Mediterráneo.
Ú. t. c. s. m. p. us. Dícese también de lo que está en el interior de un territorio e.g., Ciudad
Mediterránea. Perteneciente al mar Mediterráneo, o a los territorios que baña.
• Mediterráneo del Viejo mundo; dícese de las colonias de anidación con costas en el mar
Mediterráneo.
• Mediterráneo americano; dícese de las colonias de anidación con costas en el mar
Caribe, Golfo de México, y costa atlántica de la península de la Florida.
ADN mitocóndrico
ADN nuclar
Pares de bases
Reacción en cadena de la polimerasa
Del lat. populatio, -onis: f. Acción y efecto de poblar. Conjunto de personas que habitan la
Tierra o cualquier división geográfica de ella. Evol. Dícese de un grupo de individuos
conespecíficos que ocupan una región geográfica más o menos definida y exhiben una
reproducción continua de generación en generación; las interacciones ecológicas y
reproductoras son más frecuentes entre estos individuos que con otros miembros de otras
poblaciones de la misma especie.
Región no codificadora
copia simple de DNA nuclear, es decir, amplificación de un fragmento, locus o loci en una
cadena.
Sitio polimórfico – plural: SPs
Traducción en este documento como modelo de pasarela.
Timina
Nota: Estas aclaraciones están hechas con la intención de que pueda arbitrarse el documento a partir del conocimiento de la línea de
pensamiento del autor y sus asunciones, teniendo en cuenta la diversidad de criterios según la bibliografía consultada.
SÍNTESIS________________________________________________________________________________________________
ii
SÍNTESIS
El manejo efectivo para la conservación de las tortugas marinas depende del
entendimiento de las interconexiones demográficas entre las poblaciones. En este trabajo
se determinaron la estructura poblacional, la diversidad genética y las relaciones
filogenéticas y filogeográficas entre las principales colonias de anidación cubanas de
Chelonia mydas y Caretta caretta, y se compararon en un contexto regional, a partir de la
secuenciación de la primera mitad de la región no codificadora del DNA mitocóndrico, con
vistas a un manejo sostenible. En las colonias de anidación cubanas de ambas especies
estuvieron presentes los haplotipos más distribuidos y representados de los linajes de
cada especie informados para la región. No obstante, las colonias de C. mydas también se
destacaron por la presencia de haplotipos endémicos. Estas constituyeron poblaciones
panmictas y estuvieron estructuradas significativamente con las restantes poblaciones de
anidación de la región, como consecuencia de un porcentaje de variación mayor dentro
que entre las colonias de anidación. Por consiguiente, las colonias de anidación cubanas
constituyen poblaciones que han intercambiado migrantes limitadamente con las restantes
del Mediterráneo americano. El grado de diferenciación genética (F- Φ ST) estuvo
positivamente correlacionado con la distancia geográfica entre las colonias de anidación
de la región, cumpliéndose el modelo pasarela congruente con los patrones de corrientes
marinas imperantes en la región. Existieron fallos a la conducta de reproducción en el
lugar de origen dentro de cada especie, que condujeron a dispersiones de los haplotipos
más distribuidos y representados entre los que se encontraron los ancestros de cada
linaje. Estos fallos pudieron ser provocados por las fluctuaciones climáticas durante el
Pleistoceno, que conllevaron a sucesivas recolonizaciones de hábitat en función de las
características óptimas para la anidación. Consecuentemente, las huellas de las
expansiones demográficas han quedado difusas, a pesar de la estructura genética
significativa y presencia de endemismo en la mayoría de las poblaciones de anidación. A
partir del análisis filogeográfico de clados anidados se corroboró un flujo genético
restringido por aislamiento por distancia, con fragmentación pasada y colonizaciones a
grandes distancias o una de estas dos últimas variantes. Finalmente, las poblaciones de
anidación cubanas, a pesar de compartir un pasado histórico común con las restantes
poblaciones de anidación de la región, constituyeron unidades genéticas singulares
consideradas Mus, que deben ser manejadas cuidadosamente para evitar pérdida de la
variabilidad genética del genofondo de cada especie de tortuga marina.
INTRODUCCIÓN__________________________________________________________________________________________
1
I. INTRODUCCIÓN
Las tortugas marinas: caguama, Caretta caretta (Linnaeus, 1758); carey, Eretmochelys
imbricata (Linnaeus, 1766); golfina, L. olivacea (Eschscholtz, 1829); lora, Lepidochelys
kempii (Garman, 1880); tinglado, Dermochelys coriacea (Vandelli, 1761); tortuga plana,
Natator depressus (Garman, 1880); y tortuga verde, Chelonia mydas (Linnaeus, 1758);
cuyas formas actuales datan de varios millones de años, presentaban poblaciones
numerosas antes que el hombre desarrollara las flotas de navegación y perfeccionara las
artes de pesca. Paradójicamente, con el devenir de la civilización, diezman los tamaños
poblacionales y algunas colonias de anidación fueron extirpadas de sus regiones nativas
(Meylan, 1999a; Meylan & Donnelly, 1999; Seminoff, 2002; Heppell et al., 2003;
Witherington & Frazer, 2003). Es hasta hace poco, cuando la escasez o el colapso de los
recursos naturales que el hombre venía aprovechando repercuten negativamente en la
supervivencia de las sociedades, que el pensamiento humano toma conciencia colectiva
sobre el uso sostenible de los recursos renovables (Caughley & Gunn, 1996). Los efectos
negativos e irreversibles de la explotación desmesurada de la generalidad de estos
recursos, ha implicado fragmentación de las poblaciones y deterioro de los hábitat. Razón
por la cual, gran parte de los especialistas en tortugas marinas dudan de la sostenibilidad
de un uso extractivo de estas especies (Campbell, 2003; Heppell et al., 2003)
considerando: la magnitud de la reducción poblacional en correspondencia con la historia
natural, las limitaciones y lagunas en el conocimiento disponible, las dificultades prácticas
de implementar un manejo que abarque la distribución total de cada una de las
poblaciones, la maduración sexual tardía y los diversos hábitat que utilizan en su complejo
ciclo de vida. Es por esto que todas las tortugas marinas se encuentran inscritas como
especies amenazadas de extinción (Baillie & Groombridge, 1996) y se prohíbe el comercio
internacional de las mismas, manifiesto en la inclusión de éstas en el apéndice I de la
Convención sobre el Comercio Internacional de Especies Amenazadas de Fauna y Flora
Silvestres
(CITES) a partir de la década de los setenta del pasado siglo (Meylan &
Donnelly, 1999).
Debido a que las tortugas marinas son fieles a la conducta de reproducción en el lugar de
origen (Carr, 1967 & 1975; Pritchard, 1976; Limpus et al., 1992), verificada por la
diferenciación genética significativa que existente entre las colonias de anidación (Meylan
INTRODUCCIÓN__________________________________________________________________________________________
2
et al., 1990; Bowen et al., 1992, 1993, 1994, 1995; Broderick et al., 1994; Norman et al.,
1994; Encalada et al., 1996 y 1998; Bass et al., 1996), la marcación de los individuos en
las áreas de anidación, alimentación y desarrollo, ya sea a través de marbetes (Limpus et
al., 1992; Meylan, 1999b; Balazs, 2000;) y marcadores moleculares (FitzSimmons et al.,
1995; Bowen et al., 2004), ha constituido una forma viable para estimar los tamaños
poblacionales, comportamiento migratorio y demás patrones demográficos por regiones de
anidación.
La filopatría y la característica poco migratoria dentro de las áreas cálidas de alimentación
de los estadios más avanzados de crecimiento y desarrollo de algunas poblaciones de C.
mydas (Limpus & Walter, 1980; Balazs, 1982; Mendoca & Ehrhart, 1982; Green, 1993;
Limpus et al., 1994b) y E. imbricata (Doi et al., 1992; Limpus, 1992; Broderick et al., 1994;
Heppell & Crowder, 1996; Carrillo et al., 1999; Díaz-Fernández et al., 1999), también han
conllevado a la defensa del uso sostenible de las tortugas marinas por parte de científicos,
comunidades rurales y gobiernos (Márquez, 1990; Cornelius et al., 1991; Doi et al., 1992;
Ruiz, 1994; Clifton et al., 1995; Campbell, 1998; Evans & Vargas, 1998; Anónimo, 1998;
Carrillo et al., 1999; Díaz-Fernández, 1999; Mohadin, 2000). Considerando la variabilidad
estacional y etológica en las poblaciones de estas especies, y la falta de integración
regional en el conocimiento del recurso renovable compartido, las propuestas defendidas
no han aportado datos suficientemente convincentes para lograr un consenso en la
comunidad científica a favor del uso sostenible, independientemente de que se reconozca
el carácter tradicional de la pesquería para muchos asentamientos costeros (Crouse,
1999; Meylan, 1999a y b; Campbell, 2002; Heppell et al., 2003). No obstante el uso
continuado de estos recursos a escalas nacionales por asentamientos costeros y países
(Thorbjarnarson et al., 2000a y b; Campbell, 2003), varias poblaciones de tortugas marinas
muestran crecimientos sostenidos después de implementar programas de conservación
durante décadas, como son los casos de L. olivacea del Pacífico mexicano (PeñafloresSalazar et al., 2001), algunas poblaciones de E. imbricata en el Caribe (Garduño et al,
1999; IUCN, 2002); de C. mydas en Estados Unidos de América (USA) (Seminoff, 2002) y
Costa Rica (Bjorndal et al., 1999); y de L. kempii en México (Márquez et al., 1999). Un
manejo adecuado de las pesquerías de tortugas marinas no tiene por qué afectar la
supervivencia de las poblaciones (Anónimo, 1998).
INTRODUCCIÓN__________________________________________________________________________________________
3
En el Atlántico, el Mediterráneo americano ha constituido una importante región de
anidación para C. mydas (Seminoff, 2002), C. caretta (Ehrhart et al., 2003) y E. imbricata
(Mortimer & Donnelly, 2007). Particularmente, el archipiélago de Cuba es reconocido como
un sitio importante de anidación, alimentación y pesquería de E. imbricata (Anónimo, 1998;
Bass, 1999; Carrillo et al., 1999; Meylan, 1999a; Meylan & Donnelly, 1999; Moncada et al.,
1999). Sin embargo, no se conoce una publicación científica que aborde la anidación de C.
mydas y C. caretta de manera concluyente en Cuba. Razón por la cual, se clasifica la
anidación del archipiélago cubano como secundaria (Seminoff, 2002; Ehrhart et al., 2003).
No obstante, el occidente de Cuba ha sido reconocido a nivel nacional como un sitio de
importancia para la anidación de C. mydas y C. caretta, destacándose áreas del
archipiélago de los Canarreos como Cayo Largo del Sur, donde han sido informados más
de 2000 nidos de C. mydas por temporada de anidación (Nodarse, com. pers.); Cayo Real
de la Cayería de San Felipe, donde han sido informados 43 nidos de C. mydas durante 15
días del final de la temporada de anidación de 1998; y la playa “El Guanal” del sur de la
Isla de la Juventud, donde han sido marcados 98 ovíferas de C. mydas en el intervalo de
1989 hasta 1996 (Nodarse et al., 2000a) y han sido informados 174 nidos de C. caretta en
el período de anidación de 1989 (Nodarse et al., 2000b); así como la península de
Guanahacabibes, donde han sido informados 638 anidaciones y han sido marcadas 172
ovíferas de C. mydas durante el 2002 (Azanza et al., 2003). Paradójicamente, se
desconoce la estructura poblacional de las colonias de anidación dentro de las áreas de
anidación cubanas, y por consiguiente, las relaciones de estas colonias con las restantes
del Mediterráneo americano así cómo la contribución de éstas a las áreas marinas de
agregación de la cuenca atlántica. Este aspecto adquiere extraordinaria importancia
debido a que cientos de estos animales caen anualmente en redes de pescadores
(Campbell, 2003), sin poder determinar adecuadamente los niveles de impacto en las
poblaciones afectadas ni en los asentamientos costeros beneficiados, con vistas a lograr
un manejo sostenible a nivel regional.
Considerando la contribución significativa de cada colonia de anidación de tortugas
marinas al genofondo de la metapoblación en el Mediterráneo americano, como
consecuencia de la estructuración genética existente entre la generalidad de éstas, y la
INTRODUCCIÓN__________________________________________________________________________________________
4
problemática del declive de las tortugas marinas por diversos factores, se propone
determinar comparativamente las relaciones genéticas entre las principales colonias
de anidación de C. mydas y C. caretta del suroeste de Cuba en el contexto del
Mediterráneo americano, empleando secuencias de la RNC mtDNA, con vista a un
manejo sostenible.
El objetivo general se desglosa en los siguientes objetivos específicos con sus respectivas
tareas:
1. Determinar la estructura poblacional de colonias de anidación cubanas de C. mydas
y C. caretta en un contexto regional.
• Colecta y procesamiento biológico – molecular de muestras de tejido en áreas de
anidación para obtener secuencias de la RNC del mtDNA.
• Comparación de las secuencias con los haplotipos informados por la literatura y
bases de datos para identificar la identidad de los individuos procesados.
• Comparación estadística a los niveles colonia (incluyendo aquellas con las cuales
las cubanas han intercambiado genes), área y región de anidación (mediante
métodos de agrupamiento jerárquico), para determinar el nivel población.
2. Caracterizar la diversidad genética de colonias de anidación de C. mydas y C.
caretta en el archipiélago cubano.
• Exploración la diversidad genética con índices preestablecidos, que incluyen desde
la propia heterogeneidad hasta el tamaño efectivo de ovíferas a los niveles colonia
y población de anidación.
• Comparación de la diversidad genética de las entidades cubanas respecto a las de
la región del Mediterráneo americano con las cuales han intercambiado genes.
3. Dilucidar las relaciones filogenéticas y filogeográficas entre haplotipos de C. mydas
y C. caretta, y entidades poblacionales determinadas en un contexto regional.
• Construcción del camino evolutivo más probable de los genes y de éstos dentro de
las poblaciones de anidación del Mediterráneo americano, mediante relaciones de
ancestría a través de métodos de distancia y cladísticos.
4. Comparar la estructura poblacional, diversidad genética, y relaciones filogenéticas y
filogeográficas determinadas entre C. mydas y C. caretta en un contexto regional.
INTRODUCCIÓN__________________________________________________________________________________________
5
• Integración de los resultados obtenidos en las tareas anteriores a través de una
discusión interespecífica, considerando además resultados análogos informados
para otras especies de tortugas marinas.
Hipótesis de trabajo.
Hipótesis nula:
•
Si la generalidad de las colonias de anidación del Mediterráneo americano de C.
caretta y C. mydas, especies filopátridas y fieles al sitio de anidación, están
integradas fundamentalmente por haplotipos comunes de los linajes de la cuenca
atlántica como consecuencia de fallos a la filopatría entonces, considerando la
geografía del archipiélago de los Canarreos así como los fallos a la fidelidad por el
sitio de anidación, las colonias cubanas no mostrarán estructura genética
significativa con poblaciones de anidación vecinas de la región y exhibirán un
modelo evolutivo semejante a nivel interespecífico.
Hipótesis alternativa:
•
Si la generalidad de las colonias de anidación del Mediterráneo americano de C.
caretta y C. mydas, especies filopátridas y fieles al sitio de anidación, están
estructuradas genéticamente en el espacio de forma significativa aunque están
integradas fundamentalmente por haplotipos comunes de los linajes de la cuenca
atlántica entonces, a pesar de la geografía del archipiélago cubano así como de los
fallos a la filopatría y fidelidad por el sitio de anidación, las colonias cubanas
mostrarán estructuración genética significativa con las poblaciones de
anidación de la región y exhibirán un modelo evolutivo particular en al menos
una especie según su corología.
Novedad científica:
•
Por primera vez se describen clinas geográficas en áreas de anidación
continentales de C. mydas y C. caretta.
•
Por primera vez se determinó espacialmente la estructura poblacional de las
principales colonias de anidación de C. mydas y C. caretta del suroeste de Cuba y
en el contexto del Mediterráneo americano.
INTRODUCCIÓN__________________________________________________________________________________________
•
6
Por primera vez se caracterizó la diversidad genética de las principales colonias de
anidación de C. mydas y C. caretta del suroeste de Cuba.
•
Por primera vez se integraron en la filogenia y filogeografía de C. mydas y C.
caretta las principales colonias de anidación cubanas y sus genes en el contexto del
Mediterráneo americano.
Importancia teórica: A la luz de los resultados de esta investigación fue generada la
información que faltaba sobre estructura y diversidad genética, para comprender el modelo
poblacional y las relaciones genéticas (filogenia y filogeografía) entre las poblaciones de
anidación de C. mydas y C. caretta y sus genes en el Mediterráneo americano. A partir del
conocimiento de la estructura poblacional regional, pudo constatarse que el patrón de
corrientes que circula por el mar Caribe, Golfo de México y costas atlánticas de USA,
constituye una barrera efectiva para el flujo de migrantes entre colonias de anidación
vecinas geográficamente de C. mydas y C. caretta e.g. colonias de anidación de México y
Cuba, y de las costas oeste y este de la península de la Florida. Por consiguiente, el
modelo pasarela podría no ajustarse, aunque sea el más probable, en dependencia de
cómo sean tomadas las unidades a comparar.
Importancia práctica: El conocimiento aportado a la estructura, diversidad y relaciones
genéticas en C. mydas y C. caretta, a partir del estudio de las principales colonias de
anidación del archipiélago cubano, constituye una información valiosa para el
establecimiento de las unidades de manejo dentro y fuera del archipiélago cubano. De
forma clara se precisan las continuidades genéticas de las colonias de anidación de C.
mydas y C. caretta dentro del archipiélago de los Canarreos, que deberán tenerse en
cuenta en programas de manejo - conservación.
Los resultados presentados en esta tesis han formado parte de tres artículos científicos
publicados en revistas arbitradas (Revista Cubana de Química (2004), Revista de
Investigaciones Marinas (2008a y b)), uno en reemisión (Conservation Genetics (2008)), y
tres secuencias inscritas en 1) GenBank (http://ncbi.nlm.nih.gov) y 2) The Archie Carr
Center
for
Sea
Turtle
Research
(ACCSTR)
(http://www.accstr.com,
accstr@zoology.ufl.edu), y han formado parte del trabajo “Estudio y Conservación de las
INTRODUCCIÓN__________________________________________________________________________________________
7
Tortugas Marinas en Cuba. Siete Años de trabajo”, premiado como el Mejor Resultado en
la protección del Medio Ambiente de La Universidad de La Habana en el 2005. También
han sido presentadas 43 ponencias en varios eventos científicos nacionales e
internacionales.
-Molecular Evolution Meeting, Sorrento, Italia (2002).
- Opciones ambientales para la Industria Pesquera, La Habana, Cuba (2003).
-Taller internacional para la conservación de las tortugas marinas en Guanahacabibes,
Pinar del Río, Cuba: Primera edición (2003) y Segunda edición (2005).
-GEO Juvenil, La Habana, Cuba (2005).
- Evento Nacional de la Náutica Recreativa, La Habana, Cuba (2006).
- MARCuba, La Habana, Cuba (2006, 2003).
-Annual Symposium on Sea Turtle Biology and Conservation: 28th Loreto, Mexico
(2008); 26th Crete, Greece (2006); 25th Savanna, Georgia, USA (2005); 24th San
José, Costa Rica (2004).
-VIII Congreso Latinoamericano de Herpetología, Varadero, Cuba (2008).
Este documento está conformado por 99 páginas, distribuidas en introducción, revisión
bibliográfica (RB), materiales y métodos (MM), resultados (R), discusión, conclusiones y
recomendaciones. En la RB, MM y R se insertan dos, dos y trece figuras respectivamente.
En R también se insertan nueve tablas. Formando parte del documento no paginado se
incluyen los acápites índice, nomenclatura – abreviaturas – conceptualizaciones, síntesis y
referencias bibliográficas correspondientes a las citas (285), al final del documento.
REVISIÓN BIBLIOGRÁFICA_________________________________________________________________________________
8
II. REVISIÓN BIBLIOGRÁFICA
II.1 Estatus de las colonias de anidación en el Atlántico.
II.1.1 Chelonia mydas.
Las colonias de anidación de C. mydas han declinado en todas las cuencas oceánicas
como consecuencia de la sobreexplotación de los huevos e individuos, y en menor
cuantía, de la pesquería incidental y la degradación de los hábitat marinos (Seminoff,
2002). Por consiguiente, la población global de C. mydas ha disminuido entre un 37 y 61%
durante las últimas tres generaciones de la especie, i.e. 141 años atrás (Seminoff, op.cit.).
Consecuentemente, se ha sido ratificada la condición de especie en Peligro (Endangered
(EN)) según la Unión para la Conservación de la Naturaleza y los Recursos Naturales
(IUCN) (Baillie & Groombridge, 1996; Hilton-Taylor, 2000). A su vez, y considerando que
C. mydas constituyó un recurso pesquero dentro de la pesquería legal de un número
significativo de países y que aún se pesca en unos pocos, la Convención sobre el
Comercio Internacional de Especies en Peligro (CITES) la inscribió en el Apéndice I para
evitar su uso como producto mercantil y de esa forma poder contribuir a su conservación.
En la actualidad, las principales poblaciones de anidación de la cuenca atlántica, i.e.
poblaciones de anidación con más de 500 ovíferas por año (Seminoff, 2002), se localizan
en Isla Ascensión (Gran Bretaña) (Mortimer & Carr, 1987); Isla Trindade (Brasil) (Moreira
et al., 1995; Moreira, 2001); Tortuguero (Costa Rica) (Carr et al., 1982; Bjorndal et al.,
1999); Isla de Bioko (Guinea Ecuatorial) (Thomas et al., 1999); Archipiélago Bijagos
(Guinea-Bissau) (Barbosa et al., 1998); Surinam (Schulz, 1982); sur de la península de la
Florida (USA) (Ehrhart & Witherington, 1992; Meylan et al., 1994) y Turquía (Geldiay,
1987; Kasparek et al., 2001). En estas poblaciones se han conducido programas de
seguimiento con asesoría científica desde hace algunas décadas por lo que se consideran
poblaciones de anidación índices para evaluar las tendencias demográficas de C. mydas
(Seminoff, 2002). Otras poblaciones de anidación clasificadas como secundarias en la
actualidad, i.e. poblaciones de anidación con menos de 500 ovíferas por año, se suman a
la lista de poblaciones índices debido a la información demográfica disponible (Seminoff,
op.cit.): Isla de Aves (Venezuela) (Sole, 1994; Lagueux, 2001) y península de Yucatán
(México) (López, 2000). Existen numerosas colonias de anidación secundarias en las islas
del Caribe (Seminoff, 2002). No obstante, éstas han sido pobremente estudiadas de forma
REVISIÓN BIBLIOGRÁFICA_________________________________________________________________________________
9
general (Seminoff, op.cit.). A pesar de que existen pocas publicaciones científicas sobre la
anidación de C. mydas en el archipiélago de Cuba, el occidente de éste es reconocido a
nivel nacional como un importante sitio de anidación para la especie, destacándose áreas
del archipiélago de Los Canarreos como Cayo Largo del Sur, donde han sido informados
más de 2000 nidos por temporada de anidación (Nodarse, com. pers.); Cayo Real de la
Cayería de San Felipe, donde han sido informados 43 nidos durante quince días en el
último mes de la temporada de anidación de 1998 (Ruiz et al., 2003) y la playa “El Guanal”
del sur de la Isla de la Juventud, donde han sido marcadas 98 ovíferas en el intervalo de
1989 hasta 1996 (Nodarse et al., 2000a), así como la península de Guanahacabibes,
donde han ido informados 638 anidaciones y marcadas 172 ovíferas durante el 2002
(Azanza et al., 2003).
Como C. mydas es filopátrida y fiel al sitio de anidación (Carr & Ogren, 1960; Carr, 1967,
1975; Carr et al., 1978; Carr et al., 1982; Dodd, 1988), las colonias de anidación de la
cuenca atlántica constituyen una metapoblación (Encalada et al., 1996). Por consiguiente,
los estudios poblacionales conducidos en cada área de anidación han sido representativos
para los análisis de las tendencias poblacionales de la especie. Por otra parte, algunas de
las poblaciones de anidación más importantes del Atlántico en tiempos pasados ya no lo
son, e.g. la colonia de anidación de Islas Caimán (Gran Bretaña), considerada en el
pasado entre las más grandes del mundo (Lewis, 1940; Parsons, 1962). En la actualidad,
ésta ha sido prácticamente extirpada como consecuencia de la depredación humana y la
pérdida de hábitat (Lewis, op.cit.; Parsons, op.cit.), desconociéndose el origen de la
repoblación. En esta isla se ha comprobado a través de la presencia de los haplotipos más
distribuidos y representados de los linajes de la cuenca atlántica, que la repoblación fue
consecuencia de fallos a la conducta de reproducción en el lugar de origen (Lahanas et al.,
1994). Los fallos de la especie a la conducta de reproducción en el lugar de origen han
facilitado la fundación de nuevas colonias (Carr, 1967). Estos fallos, que han traído
consigo la anidación en otras playas frecuentadas por la especie o la colonización de
nuevas, también han sido documentados por Bowen et al. (1992), Encalada et al. (1996) y
Bass et al. (1998). Otras tres poblaciones de anidación han experimentado una reducción
del tamaño poblacional en el siglo pasado: Bioko (Thomas et al., 1999) e Isla de Aves
(Sole, 1994). Para otras colonias de anidación de C. mydas como las cubanas, han sido
REVISIÓN BIBLIOGRÁFICA_________________________________________________________________________________
10
testimoniadas observaciones sobre la abundancia de las anidaciones en las crónicas de
las Indias Occidentales. Eran tan abundantes, que conllevó a la aprobación del uso de las
ovíferas como alimento para la dotación esclava de los ingenios azucareros. Por
consiguiente, la clasificación acorde a la importancia de las poblaciones de anidación
según la magnitud de ésta no debe primar sobre los análisis de tendencias poblacionales
(Seminoff, 2002).
Los fallos a la filopatría en C. mydas, han estado influenciados de alguna forma por la
complejidad del ciclo biológico, que incluye amplias migraciones entre las áreas de
desarrollo y de anidación siguiendo rutas que abarcan de cientos a miles de kilómetros
(Meylan, 1982). Ambas clases sexuales migran (Carr, 1986; Mortimer & Portier, 1989), con
un intervalo de remigración de 2.86 años de acuerdo con Hirth (1980), Dodd (1988) y Van
Buskirk & Crowder (1994). Una vez que las hembras llegan a las áreas de anidación,
anidan de dos a siete veces, poniendo cerca de 100 huevos con un intervalo de
reanidación intra-estacional de doce días (Hirth, op.cit.; Dodd, op.cit.; Van Buskirk &
Crowder, op.cit.). Tanto las ovíferas como los machos reproductores regresan a las áreas
de alimentación distantes en un período de tiempo impreciso (Hirth, 1997). Después de un
período de incubación de ocho semanas los neonatos emergen, abandonan las playas de
anidación y comienzan una fase oceánica (Carr, 1987). Los juveniles de C. mydas reclutan
los hábitat neríticos, que son ricos en pastos marinos, cuando alcanzan los 30 a 40 cm de
largo curvo del carapacho o más (Bjorndal & Bolton, 1988; Keinath & Musick, 1991;
Limpus et al., 1994a). A menudo estos hábitat son clasificados como de desarrollo. En
éstos, los juveniles forrajean y crecen hasta alcanzar la madurez sexual (Musick & Limpus,
1997). Los estimados publicados de la primera edad de madurez sexual se encuentran en
el intervalo de 27 a 33 años en el Atlántico (Frazer & Ladner, 1986), 30 o más años en
Australia (Limpus & Walter, 1980) y de 9 a 58 años en Hawai (USA) (Balazs, 1982). Una
vez que alcanzan la madurez comienzan a migrar entre las áreas de forrajeo y las áreas
de anidación para el apareamiento. Estas migraciones comprenden intervalos de años
múltiples e irregulares (Hirth, 1997). Durante los períodos de no apareamiento, los adultos
residen en las áreas neríticas de alimentación que en ocasiones coinciden con hábitats de
desarrollo de juveniles (Limpus et al., 1994b). Finalmente, el balance entre la fidelidad por
el sitio de anidación y la dispersión a largas distancias son la clave fundamental para
REVISIÓN BIBLIOGRÁFICA_________________________________________________________________________________
11
entender la filogeografía de las poblaciones de anidación de C. mydas del Atlántico
(Encalada et al., 1996.)
II.1.2 Caretta caretta.
La supervivencia de las poblaciones de anidación de C. caretta está afectada en la
actualidad fundamentalmente por la alta demanda de su carne para el consumo humano
en regiones en vías de desarrollo (Perran, 1982), la pérdida de áreas de anidación como
consecuencia del desarrollo turístico, la contaminación marina con residuos químicos y
productos no biodegradables que reciben los océanos, mares y zonas costeras; y la
captura incidental, particularmente cuando se usa el arte de pesca palangre que, según
National Research Council (1990), genera más muertes que las restantes fuentes
antrópicas de mortalidad. Razones por las cuales, en la actualidad C. caretta está
categorizada globalmente como especie en peligro de extinción (EN) según la UICN
(Hilton-Taylor, 2000) e inscrita en el Apéndice 1 de CITES para evitar su uso como
producto mercantil.
C. caretta se distribuye globalmente, a lo largo de las latitudes tropicales y subtropicales,
así como en áreas templadas (Pritchard & Trebbau, 1984). En el Atlántico, la generalidad
de las colonias de anidación ha sido localizada en latitudes subtropicales y templadas
(Pritchard, 1979; Francisco et al., 1999). Las mayores concentraciones de anidación se
ubican al sureste de USA, comprendiendo aproximadamente el 90% del esfuerzo
reproductor en esta cuenca oceánica (más de 10 000 ovíferas anuales), seguida por las
poblaciones de anidación de Carolina del Norte (USA) e Islas de Cabo Verde, que reciben
hasta 1000 ovíferas cada año (U.S. Fish & Wildlife Service, 2002). Las colonias de
anidación de Quintana Roo (México) y Bahía (Brasil) han sido consideradas como
secundarias, con alrededor de 300 a 400 ovíferas por año, respectivamente (Zurita et al.
1993). En el Mar Mediterráneo, Bahía Kiparissia (Grecia) es una de las mayores colonias
de anidación con 300 a 400 ovíferas por año (Groombridge, 1990; Margaritoulis, 1998),
seguida por las colonias de anidación de Turquía (Baran & Kasparek, 1989; Gerosa et al.,
1998) y Chipre (Demetropoulos & Hadjichristoporou, 1989; Broderick & Godley, 1996).
Agrupaciones más pequeñas, aproximadamente de hasta 100 ovíferas arriban anualmente
a las playas del norte de la península de la Florida (USA), Banco Cayo Sal (Bahamas),
REVISIÓN BIBLIOGRÁFICA_________________________________________________________________________________
12
Yucatán (México), Sergipe y norte de Bahía (Brasil), sur de Bahía a Río de Janeiro
(Brasil). Agregados de anidación pequeños, pero significativos, también han sido
informados para Bahamas, Cuba y el occidente de África (Dodd, 1988).
C. caretta, al igual que el resto de las tortugas marinas, manifiesta filopatría (Bowen &
Avise, 1995) y la mayoría de las ovíferas son fieles al sitio de anidación (Bjorndal et al.,
1983; Dodd, 1988), por lo que los estudios de las colonias de anidación son básicos para
analizar las tendencias poblacionales de la especie. En la actualidad, algunas de las
colonias de anidación específicas de la subpoblación norteña de la península de la Florida
han sido catalogadas como colonias en declive, particularmente los pertenecientes a los
estados de Georgia y Carolina del Sur (Frazer, 1986; Hopkins-Murphy & Murphy, 1988;
National Research Council, 1990; NMFS & FWS, 1995; Turtle Expert Working Group,
2000). Hopkins-Murphy et al. (2001) informaron un 5% de declive por año entre 1980 –
1997 para la población de Carolina del Sur, y un 2.6% por año entre 1964 y 1995 para la
colonia de anidación de Little Cumberland Island (Georgia) (Frazer, 1983; Turtle Expert
Working Group, 1998).
No obstante, la filopatría de C. caretta puede variar en el entorno de 100 a 400 km según
estudios de marcación en la Florida (Bowen & Avise, 1995) e.g., de miles de individuos
marcados en el sureste de USA, unas pocas que anidaban originalmente en Georgia
fueron relocalizadas anidando en el sur de la Florida (Bowen et al., 1993). Por lo que estas
relocalizaciones ocasionales han podido indicar una “habilidad” de C. caretta para
colonizar nuevas áreas de anidación en un tiempo evolutivo relativamente corto (Encalada
et al., 1998). Estos fallos a la filopatría han traído consigo la anidación en otras playas
frecuentadas por la especie o la colonización de nuevas playas (Encalada et al., op.cit.).
Los fallos filopátridos en C. caretta han estado influenciados de algún modo por la
complejidad del ciclo biológico, que incluye migraciones de más de 2600 km entre las
áreas de forrajeo y las de anidación. C. caretta es una especie transoceánica, i.e., en el
Atlántico los neonatos del sureste de USA, una vez emergidos, entran en la corriente de la
Florida y posteriormente a la corriente del Golfo siendo transportados hasta el Atlántico
oriental (Bolten et al., 1998). Luego de pasar por las islas oceánicas de Azores y Madeira,
REVISIÓN BIBLIOGRÁFICA_________________________________________________________________________________
13
y Canarias, son llevados por la Corriente Ecuatorial del Norte de regreso al Atlántico
occidental, completando el "giro Atlántico Norte". En el Pacífico, las poblaciones
anidadoras del Japón migran hacia las regiones de alimentación del Pacífico Oriental
siguiendo la Corriente Kuroshio, y posteriormente la corriente Pacífico del Norte (Musick &
Limpus, 1997), retornando a sus playas de origen por la Corriente Ecuatorial del Norte.
Ambas clases sexuales migran, por lo menos distancias pequeñas, desde las áreas de
alimentación a las áreas de apareamiento. Posteriormente, los machos regresan a las
áreas de alimentación y las hembras a las de anidación (Miller, 1985; Limpus & Miller,
1993) con un intervalo de remigración de 2.59 años según Hirth (1980), Dodd (1988) y Van
Buskirk & Crowder (1994). C. caretta reanida en un intervalo de distancia de 290 km
aproximadamente, sugiriendo que la especie es capaz de transitar grandes distancias a
pesar de ser pocos los individuos que realizan los movimientos (Bjorndal et al., 1983).
II.2 El mtDNA como marcador molecular en la biología poblacional y evolutiva.
El DNA mitocóndrico (mtDNA) ha sido usado con frecuencia para dilucidar identidades
poblacionales y caminos evolutivos de linajes de animales por poseer un conjunto de
características específicas entre las que se encuentran: 1) herencia materna en asociación
con la falta de recombinación, 2) rápida tasa de divergencia por mutación. El mtDNA es
una molécula haploide sin recombinación y en la generalidad de los casos, solo una
fracción de la población, la mitad (hembras) si la proporción entre los sexos es (1:1)
trasmite sus genes a la descendencia. Por consiguiente, los genomas de mtDNA
diferenciados no serán contenidos en el mismo cigoto a no ser que ocurra un fenómeno de
heteroplasmia producto de una pequeña contribución del macho, o se produzcan
mutaciones en el citosol durante la reproducción sexual. Incluso si los eventos de
recombinación ocurrieran, es improbable que los productos de recombinación representen
nuevos genotipos y no serán reconocidos como recombinantes (Harrison, 1988), i.e. no
existe recombinación efectiva. Todo lo cual ha condicionado una moderada tasa de
variabilidad en el mtDNA y una filogenia matriarcal. Como consecuencia, el tamaño
efectivo estimado con este marcador es menor que el que ha sido estimado para los alelos
de los genes nucleares (FitzSimmons et al., 1996), y los procesos estocásticos serán
particularmente importantes para determinar las frecuencias de los genotipos del mtDNA
(Birky et al., 1983; Avise et al., 1984). A su vez, estas frecuencias deberían ser más
REVISIÓN BIBLIOGRÁFICA_________________________________________________________________________________
14
fuertemente influenciadas por los efectos de la deriva genética y los cuellos de botella
poblacionales (Karl et al., 1992), por lo que el mtDNA puede actuar como un excelente
identificador de los patrones de colonización, incluyendo los eventos fundadores y por
ende, de los caminos evolutivos de los linajes (Harrison, 1988). Razones por lo cual el
mtDNA ha sido considerado como una unidad genealógica no recombinante con múltiples
alelos o haplotipos (Avise, 2004)
Estudios comparativos tempranos sobre la evolución del mtDNA en primates han sugerido
una tasa de divergencia de secuencias de 5 a 10 veces superior a la encontrada en
scnDNA (Brown et al., 1979 y 1982). Sin embargo, esta característica contrasta con la baja
variabilidad deducida a partir de su herencia materna y la falta de recombinación, a lo que
se suma que es una molécula especialmente compacta con pocas secuencias intergenes
como los intrones, y exceptuando la RNC, presenta pocas inserciones o duplicaciones
(Brown et al., op.cit.). No obstante, se ha demostrado que durante una fase inicial rápida
de divergencia, el mtDNA acumula sustituciones nucleotídicas a una tasa de 0.5-1.0% por
linaje por millón de años, la cual es considerablemente más rápida que el promedio para
scnDNA (Wilson et al., 1985; Moritz et al., 1987). Una deficiencia de los mecanismos de
reparación ha sido sugerida como base para explicar la mayor tasa de sustituciones
nucleotídicas en el mtDNA respecto al nDNA en vertebrados (Brown, 1983; Cann et al.;
1987; Moritz et al., 1987). Estas razones justifican que exista una considerable variabilidad
entre los diferentes taxa respecto a la tasa de evolución relativa y absoluta del mtDNA
(Britten, 1986; Moritz et al., 1987a), por lo que un reloj molecular universal sobre la base
del mtDNA no puede ser asumido (Harrison, 1988).
La tasa de evolución de secuencias varían a lo largo de la molécula de mtDNA e.g., las
secuencias de los genes que codifican para los RNA ribosomales grandes y pequeños son
altamente conservadas, mientras que en la RNC se acumulan rápidamente las
sustituciones de base y los reordenamientos (Brown, 1983; Moritz et al., 1987). Debido a
esta alta variabilidad intramolecular, la comparación de secuencias de diferentes regiones
de la molécula de mtDNA puede proveer información muy útil para analizar diferentes
niveles de divergencia desde la escala más básica, la población, hasta categorías
taxonómicas más integradoras. Para taxa recientemente divergentes la sustitución de
REVISIÓN BIBLIOGRÁFICA_________________________________________________________________________________
15
bases ha ocurrido primariamente en las secuencias intergenes, en la RNC o en sitios
dentro de la región codificadora que no resulten en un reemplazamiento de aminoácidos
(Brown, op.cit.; Moritz et al., op.cit.). Por consiguiente, la variación intramolecular del
mtDNA también adquiere importancia notable desde la perspectiva de la conservación de
los recursos bióticos porque una reducción drástica de ésta podría identificar causas
recientes que afectan el equilibrio de la naturaleza como el creciente impacto antrópico y
facilitar la toma de decisiones efectivas (Allendorf & Luikart, 2007).
El análisis de los genotipos de mtDNA dentro y entre poblaciones ha proveído una
información importante para el estudio de la estructura poblacional, la dispersión, la
variación geográfica, la filogenia y la zoogeografía (Avise, 1986; Moritz et al., 1987). En
adición, la tasa de mutación relativamente rápida de la RNC ha permitido la resolución de
poblaciones a escala fina, pues ayuda a discriminar pequeñas diferencias genéticas que
han ido apareciendo en el tiempo evolutivo. Todo lo cual ha viabilizado las
reconstrucciones de filogenias (Encalada et al., 1996) y de eventos biogeográficos (Bowen
et al., 1992). Por esta razón, la secuenciación de la RNC ha sido convertida en una de las
opciones como método para la definición de poblaciones con mtDNA (Harrison, 1988). No
obstante, este marcador tiene la limitación de no incluir la variación aportada por la clase
sexual macho en la generalidad de los taxa, por lo que una combinación con marcadores
nucleares multilocus sería ideal si se trata de evaluar la población y procesos
demográficos en su conjunto (Allendorf & Luikart, 2007).
II.3 Marcadores moleculares: herramientas útiles para la conservación.
La determinación del nivel población y los modelos evolutivos en una especie son
esenciales para la conservación de la diversidad biológica (Allendorf & Luikart, 2007). La
identificación y protección de poblaciones locales intraespecie constituyen foco esencial
para la conservación porque ayudan a maximizar el potencial y minimizar los riesgos de
extinción (Hughes et al., 1997; Hilborn et al., 2003; Luck et al., 2003). Por consiguiente, la
población local a menudo es considerada la unidad funcional del ecosistema (Allendorf &
Luikart, 2007). Es por esto, que de la correcta delimitación del nivel poblacional
dependerá, en gran medida, el éxito de los programas de manejo y monitoreo (Allendorf &
Luikart, op.cit.). Dentro de una metapoblación, la conservación suele ser aún más
REVISIÓN BIBLIOGRÁFICA_________________________________________________________________________________
16
compleja por la existencia de otros niveles como las unidades evolutivas de significación
(ESUs, Ryder (1986)) o segmentos poblacionales distintos (DPS) (Allendorf & Luikart,
2007), a menudo reconocidos con estatus taxonómico de subespecie.
Cuatro niveles de biodiversidad se reconocen como básicos para la conservación: genes,
poblaciones, especie y ecosistema (Hughes et al., 1997; Luck et al., 2003). Mientras la
especie revela los patrones históricos de un pasado evolutivo, el ecosistema soporta la
biota en el presente y los genes representan la garantía de la biodiversidad en la tercera
escala temporal o futuro (Bowen, 1999). Por consiguiente, la conservación de poblaciones
genéticamente diferentes es imprescindible para garantizar la supervivencia de especies y
el funcionamiento del ecosistema no sólo en el presente sino para el futuro (Luck et al.,
2003).
La descripción de las relaciones genéticas intraespecies y la reconstrucción de las
filogenias son cruciales en el diseño de una estrategia de conservación (Allendorf &
Luikart, 2007), dando lugar a la identificación de las ESUs aplicado a un conjunto de
poblaciones que meritan ser atendidas en un aparte y de forma prioritaria dentro de una
estrategia de conservación a partir de reconocerse un aislamiento y divergencia
adaptativa. Parecido a las ESU, las unidades de manejo (MUs) no muestran evolución
independiente ni fuerte divergencia adaptativa a pesar de que las poblaciones o demos
que integren cada una estén estructurados significativamente entre sí (Moritz, 1994). Por
consiguiente, la MU se convierte en una entidad más manejable en términos prácticos que
la ESU, porque espacialmente es considerablemente más pequeña y a menudo,
pertenece a la jurisdicción política-administrativa de un país o de unos pocos entre los
cuales existen relaciones fronterizas para la protección de la integridad de cada nación por
lo que los planes de manejo suelen viabilizarse i.e., dos ESU son reconocidas para C.
mydas, una en el Atlántico y la otra en el Indopacífico (Karl & Bowen,1999). Dentro de
cada una de estas ESU se han reconocido más de diez Mus, con frecuencia asociadas a
áreas de anidación pertenecientes a un país.
REVISIÓN BIBLIOGRÁFICA_________________________________________________________________________________
17
II.4 Descripción de la RNC del mtDNA.
II.4.1 Chelonia mydas.
El genoma mitocóndrico de tortugas en general se ha caracterizado por bajas tasas de
evolución y diversidad inusuales con respecto a los demás vertebrados (Avise et al.,
1992). En el caso particular de C. mydas, Encalada et al. (1996) han reportado una tasa
de cambio evolutivo para la región no codificadora del mtDNA de 0.012 – 0.024
sustituciones por locus por millón de años, basados en el reloj molecular calibrado con
RFLP de 0.2 – 0.4% de divergencia por millón de años para Testudines (Avise et al.,
1992a; Bowen et al., 1993).
La RNC de C. mydas tiene una longitud de ca. 981 pb aproximadamente, flanqueada por
los genes de tRNA treonina (Thr) y prolina (Pro) (Kumazawa & Nishida, 1999) (Fig. 1).
Contiene una región hipervariable de aproximadamente 640 pb, tres secuencias
conservadas: CSB-1, CSB.2 y CSB-3 de 23, 15 y 17 pb respectivamente, así como un
grupo de repeticiones del dinucleótido TA, que abarca alrededor de 50 pb.
tRNA-Thr→ ATT CTAGTAGCTT AACCCTAAAG
CATTGGTCTT GTAAACCAAA GATTGAAAAC
GGACTTAAAC CTTCATCCCC GGTCCCCAAA
1
ACACAGGAA± ±±AAGTGTCC A±CACAAACT
61 GAACAATACC CGCAATACCT ATCTATGTAT
121 TATGACCAGT AATGTTAACA GTTGATTTGG
181 T±AAATATTT TAACAACATG AATATTAAGC
241 TAAAATTAAA CTATTATACT CAACCATGAA
301 TAGCTATTCA CGAGAAATAA GCAACCCTTG
361 CCCATTCAGT CTGTGGCGTA CATAATTTGA
421 CACATACAAG TAACGACGTT CATTCGTTCC
481 CTATACATTA AATTTATAAC CTGGCATACG
541 TCTCTCTGTG TTCTCAGGCC CACATAACTG
601 CGTTTAAATA TGATTGGCCG TGCAAACTGA
661 GACATAGAAT TTCACAATTA AACCTAAACA
721 TACTTTTTAG CTAAACCCCC CTACCCCCGT
781 TACTTCTCGC CAAACCCCTA AATCCGAGAC
841 AGCATCACAC AAATCAATAG GATACTTACA
901 AACACCTCTA CCACACCTCA ACCAATATAT
961 ATTATATATA TTATATATAT AATATGTTAT
1021AAGATGCCAA GATGGGTAAT AAACATACCC
TATAACCTTC CTAGAATAAT
ACCGGAATCC TATAATTAAA
AACTACCTAA ATTCTCTGCC
TATTGTACAT CTACTTATTT
CCCTAAACAT ±AAAAATCAT
AGAGGATTAA AAGTGAAATG
TATCGTCACA GTAATTGGTT
TTAGTAAGAT ACAACATTAC
TCTATTCTGG CCTCTGGTTA
CCTTTAAAAG GCCTTTGGTT
GTAGTTTTAC TTGCATATAG
ATACCTGCCG ATTCAGTGAA
TTAATGGTAT TATTAAGTTA
ATGATCTACA ACCTAACTCA
TAAAGTCAAC ACCAGCCCGC
TGACCAAACT GACATAATAT
CTAATATTTA AAAAGTACTA
ATATATATTA TACATTATAT
TGTAGCTTAT TATATTAAAG
CAAAAACA →tRNA-Phe
CAAAAGAGAA←tRNA-Pro
CTATCCTTTG
GTGCCCAACA
ACCAATAGCA
TGAATTTACA
ACATAGGACA
ATTTCCTAAA
CAGTTTCAAG
GTTTTTCAGG
G±AATGAGTT
TAGTTTTTTT
ACTGGACTTA
ATGCTTATAA
TTATTAACTG
TATAGCCATT
CAACTGCATA
TACAATTCAA
ATATATATAT
CACGGCACTG
Fig. 1. Secuencia nucleotídica de la RNC del mtDNA en C. mydas, flanqueada por genes de tRNA, con de
78 SPs según compilación de resultados de: Allard et al. (1994); Lahanas et al. (1994, 1998); Norman et al.
(1994); Encalada et al. (1996); Dutton et al. (1996); Bjorndal & Bolten (1988). La numeración de los sitios
polimórficos se realiza tomando como referencia la base primera base (1) de la RNC del mtDNA según Kumazawa & Nishida (1999).
Secuencias repetidas (TA).
.. SP
± indel (analizado como un SP).
REVISIÓN BIBLIOGRÁFICA_________________________________________________________________________________
18
II.4.2 Caretta caretta.
La RNC del mtDNA de C. caretta varía en longitud desde 1230 hasta 1630 pb
aproximadamente (Fig. 2), flanqueada por los genes de tRNA prolina (Pro) y fenilalanina
(Phe) (Laurent et al., 1998). Contiene los principales dominios conservados, i.e. las tres
secuencias CSB-1, CSB-2 y CSB-3 y la secuencia putativa TAS, y una región repetitiva
(TATATTATAT) en el extremo 3’. Esta repetición varía en una longitud de 300 a 700 pb y
condiciona la heterogeneidad en la dimensión de la RNC (Laurent et al., op.cit.).
Considerando la tasa de cambio evolutivo para la RNC del mtDNA de C. mydas (0.012 –
0.024 sustituciones por locus por millón de años) según Avise et al. (1992), Bowen et al.
(1993) y Encalada et al. (1996), se han analizado los tiempos de divergencia de
secuencias de C. caretta (Encalada et al., 1998).
1
9
69
129
189
249
309
369
429
489
549
609
669
729
789
849
909
tRNA–Pro→ A TCAAAANNNN
CCTTCATCTC CGGTCCCCAA AACCGGAATN CTTCCAATTA AACTACCCTT
GAAGCGCCAA CATGTAAATT TACCTATATT CTCTGCCGTG CCCAACAGAA
AATACCTATC TATGTATTAT CGTACATCAA CTTATTTACC ACTAGCATAT
GTTGTCGATT AATCTGACCT TAAACATAAA AACTTATTAA TTTTGCATAA
TTACATGACT ATTATACAGG TAATAGGAAT GAAATGATAT AGGACATAAA
TATTCTCAAC CATGAATATC GTTACAGTAA TAGGTTATTT CTTAGTTCAG
GAAATAAGCA ATCCTTGTTA GTAAGATACA ATATTACCAG TTTCAAGTCC
GTCGTACATA ACTGATCTAT TCTGGCCTCT GGTTGGTTTT TTCAGGCACA
AAAGTTCATT CGTTCCTCTT TAAAAGGCCT CTGGTTGCAA GTAAATGAGT
AAATTTATAA CCTGGCATAC GGTGGTTTTA CTTGCATGTG GTAGTCTTTT
GTGTTCTCAG GCCCACATAA CTGATACCTG CCGAATTGAT GAAACTGAGC
AATGATTGGC CGTGCAGAAT ACTTAATGGT ATTATTTAAT TAATGCTTTT
TTTTTATAAA AACTCACAAC AGTTATTTAC AAGCTAAAAC CCATTACAAC
AGTTAAACCC CCCCACCCCC ATAAACTAAC ATTATGCCCG AATAGCTATT
CAAACCCCTA AATCCGAGAC TAACTAAACT GACACAACAT TAATCGCATA
AAACTAATGA AACACTTACA CTAATACCTA AAAAGTACTA AAAACAATTC
TACTACACCC AACTAACCAA ACATTATATT ATATATACAA TGTTATTGTA
AAGCACGGCA CTGAAGATGC CAAGATGGGT AAACACACA →tRNA–Phe
AGGGTTCAAA
TGACGCAAAA
TAATATCCAT
GATCAGTAAT
ACTGTTTTAG
ATTAAACCAT
CTCATCACGA
ATTAAGTCAT
TTAAGGCAGT
TCTATACATT
TTTTCTCTTT
CTACGTTCAA
AGGACATATA
CATACTTTTT
CACTTCTCGT
AGCATTACAC
ATCACACCTC
GCTTATCACA
Fig. 2. Secuencia nucleotídica de la RNC del mtDNA de C. caretta, flanqueada por genes de
tRNA, con un total de 56 SPs según compilación de los resultados de Bolten et al. (1998),
Encalada et al. (1998), Laurent et al. (1998), Dutton et al. (1996), Bowen et al. (1995). La numeración
de los sitios polimórficos se realiza tomando como referencia la base primera base (1) de la RNC del mtDNA según
Laurent et al. (1998). Secuencias repetidas (TA).
.. SP
± indel (analizado como un SP).
REVISIÓN BIBLIOGRÁFICA_________________________________________________________________________________
19
II.5 Estructura poblacional en el Atlántico.
II.5.1 Chelonia mydas.
Allard et al. (1994) realizaron un análisis de las colonias de anidación de la Florida (USA) y
Costa Rica, mediante técnicas de secuenciación de la RNC del mtDNA, con el propósito
de determinar cuán distintas eran estas dos colonias en términos de genealogía de
mtDNA, como predice la conducta de reproducción en el lugar de origen. Encontraron 3
SPs, que definieron cuatro haplotipos de los cuales dos fueron exclusivos de la Florida, y
otro de Costa Rica. El cuarto fue compartido por ambas poblaciones. Las frecuencias
haplotípicas de estas colonias fueron significativamente diferentes. La colonia de
anidación de la Florida resultó ser cinco veces más polimórfica y de mayor diversidad
nucleotídica que la de Costa Rica. Sin embargo, las variaciones intrapoblacionales fueron
solamente del 0.01% en la primera, sugiriendo un ancestro común relativamente reciente,
lo cual se opone a lo predicho por la teoría de la neutralidad en relación al tamaño actual
de las poblaciones. Por lo que los autores puntualizaron que cualquier explicación con
relación a este fenómeno debe tener implícito el tamaño de la población de anidación de la
Florida (350 a 400 ovíferas), así como el tiempo relativamente corto transcurrido desde el
establecimiento de esta población en el área (menor de 10 000 años).
Lahanas et al. (1994) haciendo uso de la secuenciación de la RNC del mtDNA examinaron
la evolución molecular y la genética poblacional de C. mydas en el “Gran Caribe”.
Reconocieron seis haplotipos definidos a partir de 12 SPs. Las colonias de Isla de Aves
(Venezuela) y Surinam presentaron un haplotipo común. Las cuatro poblaciones
estudiadas se subdividieron en los grupos Occidental y Oriental (Costa Rica/ Florida e Isla
de Aves/ Surinam respectivamente), puesto que se obtuvieron diferencias significativas
entre las frecuencias haplotípicas de todos los pares de colonias, excepto para las
comparaciones entre estos dos grupos de colonias citadas anteriormente. La
diferenciación entre las poblaciones del este y el oeste fue por lo menos seis veces mayor
que dentro de cada región. Además, las dos regiones estuvieron caracterizadas por tasas
de migración (0.1-0.2 migrantes/ generación) menores que las requeridas para
contrarrestar los efectos de la deriva genética (Barton & Slatkin, 1986; Slatkin & Barton
1989).
REVISIÓN BIBLIOGRÁFICA_________________________________________________________________________________
20
Encalada et al. (1996) emplearon la secuencia de la RNC del mtDNA para dilucidar la
estructura genética y la filogeografía en colonias de anidación de C. mydas del océano
Atlántico y el mar Mediterráneo. Encontraron veinte polimorfismos en 19 SPs, que
definieron 18 haplotipos. Las frecuencias haplotípicas de las colonias de México y la
Florida, Surinam e Isla de Aves, Isla Ascensión y Guinea Bissau no mostraron diferencias
significativas, lo cual fue interpretado como resultado de un intercambio de genes continuo
entre estos pares de colonias o consecuencia de un aislamiento reciente. Sin embargo,
entre estos pares los autores encuentran sendas diferencias significativas, lo cual les
permite reconocerlos como poblaciones de anidación con independencia demográfica.
II.5.2 Caretta caretta.
Encalada et al. (1998) realizaron una prospección genética de C. caretta de áreas de
anidación atlánticas y mediterráneas, secuenciando la RNC del mtDNA (5’- 380 pb), para
dilucidar la estructura poblacional y patrones filogeográficos de la especie. Analizaron las
mismas diez áreas de anidación prospectadas genéticamente con RFLP por Bowen et al.
(1994): Quintana Roo, México; Bahía, Brasil; Bahía Kiparissia, Grecia; USA: noroeste de la
Florida, Georgia, Carolina del Sur y Carolina del Norte, sureste y suroeste de la península
de la Florida). Comparando la composición haplotípica por pares de áreas/ colonias de
anidación a través de la Prueba X2, los autores concluyeron que en las cuencas atlántica y
mediterránea hay seis cohortes (unidades) demográficas independientes: México; Brasil;
Grecia; USA: noroeste de la Florida, sur de la Florida, y desde el noreste de la Florida
hasta Carolina del Norte. La existencia de una discontinuidad filogeográfica entre áreas de
anidación del noreste de la Florida hasta Carolina del Norte y sur de la Florida, evidenció
una ruptura entre Cabo Cañaveral y Jacksonville (Encalada et al., 1998). Los autores
plantearon que esta ruptura concordó con las evidencias: 1) estudios de campo han
indicado una relativa continuidad en las anidaciones de C. caretta a lo largo de la costa sur
de la Florida, desde Dade hasta Brevord Counties, decreciendo la densidad de los nidos
hacia Cabo Cañaveral; y 2) semejante disrupción filogeográfica ha sido encontrada para
otros organismos costeros (Avise, 1992; Karl & Avise 1992; Lamb & Avise 1992). A pesar
de que las comparaciones genéticas entre el área de anidación noroeste de la Florida y las
colonias de anidación que integran la unidad noreste de la Florida hasta Carolina del Norte
no mostraron significación, Encalada et al. (1998) concluyeron que ambas áreas de
REVISIÓN BIBLIOGRÁFICA_________________________________________________________________________________
21
anidación constituían unidades demográficas independientes basado en: 1) la alta
significación de la comparación entre éstas (X2=17.53; p<0.001), i.e. sumando la
composición haplotípica de las colonias de anidación en la unidad noreste de la Florida
hasta Carolina del Norte, y 2) la diferenciación genética significativa de estas unidades,
distantes geográficamente, con las áreas de anidación vecinas de la “unidad demográfica”
(población de anidación) sur de la Florida. Encalada et al. (op.cit.) reafirmaron esta
conclusión con la aplicación de un Análisis de la Varianza Molecular jerarquizado en el
cual se atribuye el 64% de la variación total a las diferencias significativas entre las seis
unidades demográficas genéticamente definidas a partir de un limitado número de
migrantes intercambiados.
Por otra parte, Encalada et al. (op.cit.) plantearon que la baja diversidad genética entre las
colonias de anidación localizadas en la unidad noreste de la Florida hasta Carolina del
Norte proporciona una resolución inadecuada para detectar divisiones poblacionales,
siendo probable la existencia de una división demográfica dentro de esta región.
Finalmente Encalada et al. (op.cit.) plantearon que la estructura poblacional encontrada en
su estudio concordó con el patrón predominante revelado por los estudios de marcaciónrecaptura (Bowen et al., 1993). Encalada et al. (1998) puntualizaron que la transferencia
de algunas ovíferas entre playas de anidación se refleja quizás en los altos estimados de
razones de migración entre colonias de anidación. Mientras la conducta de reproducción
en el lugar de origen predomine, estas relocalizaciones raras podrían indicar una habilidad
para colonizar nuevos hábitat en una gran escala de tiempo evolutivo y una condición de
desequilibrio resultado de un reciente evento de colonización, o unas de éstas variantes
(Encalada et al., op.cit.).
Laurent et al. (1998) realizaron una prospección genética de C. caretta en áreas de
anidación en el Atlántico Norte y en el mar Mediterráneo, empleando la RNC del mtDNA
(5’- 420 pb), para estimar la estructura poblacional de las colonias de anidación de las
costas del mar Mediterráneo y evaluar la contribución de éstas a los agregados de
pesquería. Ellos analizaron las colonias de anidación de USA: Georgia/ Carolina, y sur de
la Florida, mar Mediterráneo: Grecia, Chipre, Turquía y cuenca del sureste. Laurent et al.
(op.cit.) integraron las muestras provenientes de colonias de anidación de Libia, Italia e
REVISIÓN BIBLIOGRÁFICA_________________________________________________________________________________
22
Israel en la unidad cuenca del sureste, como consecuencia de los pequeños tamaños
muestrales de cada una y de estar ubicadas geográficamente en la misma cuenca.
Empleando la probabilidad de Fisher por pares de colonias de anidación y el Φ ST, los
autores encontraron que las colonias de anidación de las costas del Atlántico occidental y
del mar Mediterráneo estaban significativamente estructuradas, excepto las colonias de
anidación del sur de la península de la Florida y Grecia, donde el Φ ST fue no significativo.
Según los autores, estos resultados se ratificaron con la significación de un AMOVA
jerarquizado entre las regiones de anidación americana (Georgia/ Carolina y sur de la
Florida) y del mar Mediterráneo (Grecia, Chipre, Turquía y cuenca del sureste).
El 41% de la variación genética total ocurrió entre grupos ( Φ CT =0.41; p<0.001), lo cual
indicó la existencia de dos agregados diferentes de C. caretta. En las costas del mar
Mediterráneo existieron dos agrupaciones ( Φ ST =0.33; p<0.001), una integrada por la
generalidad de las colonias de anidación y la otra por Turquía (Laurent et al., 1998).
Dentro de la cuenca del Mediterráneo, el 33% de la variación total fue encontrado entre las
áreas de anidación, lo cual indicó una estructuración poblacional significativa. Los autores
plantearon que la falta de divergencia genética entre las áreas de anidación de Chipre,
Grecia y cuenca del sureste necesariamente no tiene que implicar panmixia debido a que
diferencias potenciales pudieron permanecer indetectables, como consecuencia de las
limitaciones del tamaño muestral o la pérdida de resolución del marcador. Además,
Laurent et al. (op.cit.) informaron que las diferencias significativas en los tamaños de
ovíferas de diferentes áreas de anidación de Chipre, Grecia y Libia según Laurent et al.
(1995) y Broderick & Godley (1996), soportan fuertemente la estructuración poblacional.
Laurent et al. (1998) destacaron que dentro de las áreas de anidación es posible que
ocurra diferenciación poblacional entre sitios de anidación adyacentes, teniendo en cuenta
los resultados obtenidos en Turquía por Schroth et al. (1996), mediante la aplicación de
análisis sobre la base de marcadores nucleares y mitocondriales.
Francisco et al. (1999) dilucidaron la identidad poblacional de las colonias de anidación de
Volusia County. Estos autores compararon las frecuencias haplotípicas determinadas en la
RNC del mtDNA (5’- 380 pb) de las colonias de anidación norte y sur de Jetty
respectivamente, a través de la Prueba X2. Francisco et al. (op.cit.) concluyeron que
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23
ambas colonias de anidación pertenecen a una misma población de anidación,
considerada como una unidad de manejo independiente. Posteriormente, esta población
(sumando las contribuciones de las colonias de anidación norte y sur de Jetty) fue
comparada con las unidades demográficas independientes determinadas en Norteamérica
por Encalada et al. (1998), para contribuir a la definición del límite de la estructura genética
de la costa este de la península de la Florida (poblaciones de anidación sureñas y
norteñas). Francisco et al. (1999) concluyeron que la estructura genética entre las
unidades de manejo independientes Volusia y sur de la Florida es dudosa (X2=10.44,
p=0.042).
Francisco & Bowen (2001) realizaron un análisis de genética poblacional con las colonias
de anidación de la península de la Florida sobre la base del estudio de secuencias de la
RNC del mtDNA (5’- 380 pb) para evaluar la estructura de las colonias/ áreas de anidación
de la península y cayos adyacentes, i.e. Dry Tortugas. Ellos diseñaron los análisis
estadísticos teniendo en cuenta la existencia de barreras biogeográficas latitudinales tanto
en la costa oeste como en la este de la península de la Florida según Avise (1992) y
Briggs (1974), y entre el oeste y este del sur de la propia península según Muss et al.
(2001). En el caso particular de la población de anidación noreste de la Florida hasta
Carolina del Norte, Francisco & Bowen (2001) incluyeron a las colonias de anidación de
Volusia County (muestra sumada) sobre la base de su ubicación al norte del límite
biogeográfico de cabo Cañaveral según Briggs (1974) y Avise (1992). Francisco & Bowen
(2001) discutieron la incertidumbre en la determinación de la posición de Volusia, al norte
o al sur de la península, debido a que cuando se compara Volusia con Amelia Island no se
obtuvo significación de la Prueba X2 al igual que con Melbourne Beach. Por lo que los
autores plantearon que como consecuencia de que Volusia presenta haplotipos con
frecuencias intermedias es posible que no pertenezca a ninguna de las dos unidades de
manejo. Francisco & Bowen (op.cit.) incrementaron los tamaños muestrales de algunas
colonias de anidación peninsulares analizadas previamente por Encalada et al. (1998), i.e.
Melbourne Beach y Sarasota County, esgrimiendo que el tamaño muestral del estudio
anterior fue un factor que pudo limitar el poder estadístico para detectar divisiones
poblacionales entre las áreas de anidación. Al estudio se sumó la colonia de anidación
peninsular de Cabo San Blas (Francisco & Bowen, 2001). Finalmente ratificaron las
REVISIÓN BIBLIOGRÁFICA_________________________________________________________________________________
24
unidades demográficas propuestas por Encalada et al. (1998), agregando otra integrada
por las colonias de anidación de Dry Tortugas.
II.6 Diversidad genética en el Atlántico.
Chelonia mydas y Caretta caretta.
En la generalidad de los estudios llevados a cabo en la cuenca atlántica con C. mydas, se
han encontrado altos valores de diversidad genética del mtDNA para las colonias de
anidación con menores tamaños censales de hembras, i.e. las colonias de anidación de la
península de la Florida (Allard et al., 1994; Lahanas et al., 1994), Isla de Aves (Lahanas et
al., op.cit.; Encalada et al., 1996) y México (Encalada et al., op.cit.). Este resultado ha
contrastado con los menores valores de diversidad encontrados para las colonias de
anidación con mayores tamaños censales de hembras, i.e. las colonias de Costa Rica
(Allard et al., 1994; Lahanas et al., 1994; Encalada et al., 1996) y Surinam (Lahanas et al.,
op.cit.; Encalada et al., op.cit.). Lahanas et al. (op.cit.) plantearon que los menores valores
de diversidad genética caracterizan a las grandes poblaciones, contrario a lo que ocurre
con las poblaciones pequeñas. En éstas la alta diversidad se debe a dos causas
diferentes: en el primer caso, a la existencia de un haplotipo único que se diferencia del
resto en once mutaciones y en el segundo, a la existencia de varios haplotipos que difieren
entre sí solamente en una o dos mutaciones. Para explicar la alta diversidad genética en
poblaciones de anidación de pequeño tamaño y en el caso particular de la colonia de
anidación de la península de la Florida, Allard et al. (1994) propusieron tres hipótesis. La
primera planteó un aumento en la tasa de mutaciones del mtDNA en la población, lo que
se contrapone con los bajos coeficientes de evolución y diversidad del mtDNA en las
tortugas respecto al resto de los vertebrados (Avise et al., 1992). La segunda hipótesis se
basó en que la mayor diversidad es el resultado de la mezcla reciente o todavía en
proceso, de hembras provenientes de otras poblaciones del Atlántico occidental que ha
podido facilitarse por el patrón de corrientes oceanográficas locales y geomorfología de la
propia península. Estas alteraciones dentro de la conducta filopátrida son esenciales para
la fundación de nuevas colonias en ambientes cambiantes. En la tercera hipótesis se
consideró que la colonia de la Florida derivó de una población ancestral mayor. De
acuerdo con la misma, los niveles actuales de diversidad del mtDNA reflejan una
población históricamente grande en las vecindades de la colonia actual. Los registros
REVISIÓN BIBLIOGRÁFICA_________________________________________________________________________________
25
históricos de grandes poblaciones en las cercanías de la península de la Florida, por
ejemplo en localidades del Caribe como las ubicadas en Islas Caimán y Dry Tortugas
(Parsons, 1962), han apoyado la existencia de esta supuesta gran población (Allard et al.,
1994). Finalmente Allard et al. (1994) señalan la importancia para la conservación del
genofondo de las colonias de anidación de la Florida en el plan de manejo de la especie.
La alta diversidad genética de la colonia de anidación de la Isla de Aves ha sido explicada
por la hipótesis de la mezcla (Lahanas et al., 1994), evidenciada por la presencia de dos
haplotipos correspondientes cada uno a los linajes de C. mydas de la cuenca atlántica, los
cuales se compartieron con las colonias de anidación de la región. En correspondencia,
Lahanas et al. (op.cit.) llegaron a la conclusión de que la colonia de esta área tiene una
antigüedad superior a los 300 000 años, lo cual es poco probable debido a la inestabilidad
de estas islas. Por tanto, estos autores valoraron como más probable la hipótesis de que
el origen de los haplotipos fue a partir de una mezcla entre los linajes “occidental y
oriental” [linajes de la cuenca atlántica]. Ellos acentúan que la mayor diversidad genética
en el par de colonias de anidación con menores tamaños poblacionales resulta
contradictorio con la teoría de neutralidad génica (Kimura, 1983). Ellos reconocen que
existen fallos a la conducta de reproducción en el lugar de origen (Carr, 1967 y 1975)
[Hipótesis de mezcla], los cuales tienen mayores probabilidades que ocurran de colonias
de anidación grandes hacia otras de menor tamaño, donde el impacto de la inmigración
ocasional es mayor. También señalan que la baja diversidad genética puede ser
consecuencia de efectos fundadores o de cuellos de botella como plantean Nei & Graur
(1984) y Avise et al. (1988). Respecto al efecto fundador, encuentran fundamento en que
mientras
la
población
crece
exponencialmente,
las
mutaciones
se
acumulan
aritméticamente a muy baja tasa lo cual tiene un efecto connotado sobre la diversidad
genética del mtDNA de C. mydas considerando largos tiempo generacional y ciclo
reproductor, y relativa baja tasa de mutación del marcador en cuestión.
En la especie C. caretta, los valores de diversidad genética del mtDNA para las colonias
de anidación del Atlántico, son comparables, aunque ligeramente más bajos que aquellos
informados para C. mydas y Eretmochelys imbricata (Bass et al., 1996; Encalada et al.,
1998). Particularmente en la península de la Florida, la diversidad nucleotídica dentro de
REVISIÓN BIBLIOGRÁFICA_________________________________________________________________________________
26
poblaciones ha sido alta (Francisco & Bowen, 2001), como consecuencia de tener
representados dos linajes filogenéticamente diferentes (Encalada et al., 1998). Sin
embargo, el intervalo de la diversidad haplotípica en las poblaciones de anidación de la
península de la Florida ha sido muy variable: desde 0 hasta 0.714 (Francisco & Bowen,
2001).
II.7 Filogenia y Filogeografía.
II.7.1 Chelonia mydas.
Chelonia comúnmente ha sido considerado un género monotípico integrado por C. mydas.
Sin embargo, producto de la variación de la talla, forma y coloración de los individuos
según la región de distribución, han sido determinadas subespecies (Carr, 1975; Pritchard
& Trebbau, 1984; Márquez, 1990): C. m. viridis en el Caribe, C. m. mydas en el Atlántico
Sur, C. m. japonica en el Índico-Pacífico Oeste, C. m. carinegra en el Golfo de California, y
C. m. agassizi en el Pacífico Este. Para algunos autores la tortuga del Pacífico C. m.
agassizi constituye una especie. No obstante, no hay suficientes evidencias que
argumenten esta designación e incluso algunas la contradicen (Mrosovsky, 1983; Bowen &
Karl, 1997). Estudios genéticos recientes con mtDNA han fundamentado la existencia de
linajes de C. mydas dentro de los sistemas Atlántico – Mediterráneo e Índico-Pacífico, pero
no han argumentado el estatus taxonómico de C. m. agassizi (Bowen et al., 1992, 1993).
Bowen et al. (1992), utilizando técnicas de RFLP para dilucidar la filogeografía global de
Chelonia, encontraron separación filogenética entre las dos mayores cuencas oceánicas:
El océano Atlántico y el mar Mediterráneo, y los océanos Índico y Pacífico. Todos los
individuos en estos dos grupos fueron separados por cinco o más cambios por sitios de
restricción. Los autores plantearon que ese patrón genético es consistente con los límites
climáticos y geográficos que comúnmente definen la distribución de C. mydas, y que las
poblaciones de estas dos regiones probablemente estuvieron separadas por las
condiciones de bajas temperaturas que aún persisten alrededor de los extremos sur
continentales de África y especialmente de América, considerando que no existen
actualmente barreras físicas para el movimiento dentro de las cuencas oceánicas Atlántico
– Mediterráneo o Indo-Pacífico. Para esta especie no es suficiente la influencia de la
corriente de Agujas proveniente del Ecuador (Tomczack, 2000) por el sureste de África
REVISIÓN BIBLIOGRÁFICA_________________________________________________________________________________
27
que contrarresta el efecto de la corriente circumpolar Antártica. El efecto de la corriente
cálida sobre la fría ha condicionado el paso de varias especies marinas desde el océano
Índico hasta el Atlántico (Briggs, 1974).
Encalada et al. (1996) realizaron un estudio para resolver la filogeografía de C. mydas en
el Atlántico y el Mediterráneo utilizando la secuenciación de la RNC del mtDNA. Ellos
encontraron dos linajes en el Atlántico, uno correspondiente al oeste del Caribe y el
Mediterráneo y el otro que incluye el este del Caribe, el Atlántico Sur y las colonias del
oeste de África [un linaje se refiere a mediterráneos americano – Viejo mundo, y el otro, a
Atlántico Sur]. Ambos linajes estuvieron separados por al menos seis mutaciones,
mientras que los haplotipos dentro de cada grupo difirieron en un máximo de cinco. Los
autores puntualizaron que el caso de intercambio de haplotipos entre los dos principales
grupos filogeográficos por un simple individuo de México e Isla de Aves, podría indicar el
bajo nivel de intercambio genético entre regiones diferentes geográficamente, ilustrando la
estructura dinámica de las colonias de C. mydas en escalas de tiempo evolutivo.
Basados en el reloj molecular de RFLP provisional (Avise et al., 1992; Bowen et al., 1993)
y utilizando la información sobre el incremento en la divergencia de la RNC del mtDNA
encontrado en su estudio, Encalada et al. (1996) calcularon una tasa de evolución de
0.012-0.024 sustituciones por locus por millón de años para la misma. Sobre la base de
esta información propusieron un tiempo de divergencia estimado para los linajes de C.
mydas de la cuenca atlántica en ca. 0.3-0.7 millones de años, y la divergencia con
respecto al grupo externo del Pacífico en aproximadamente 1.8-3.7 millones de años.
Además señalaron que sus resultados y los obtenidos por Bowen et al. (1992) indicaron
que las colonias de anidación de C. mydas del Atlántico y las del Pacífico se aislaron
probablemente durante el Pleistoceno temprano (ca. 2.0 MA atrás). Encalada et al. (1996)
propusieron que la genealogía obtenida en su estudio permitió discernir entre dos posibles
modelos para la distribución de los linajes del mtDNA en la cuenca atlántica. Uno explicó
la distribución disyunta de organismos en términos de hábitat antiguamente continuo y
separado por cambios geológicos o climáticos (escenario vicariante) y el otro enfatizó la
habilidad de los organismos para dispersarse más allá de los límites tradicionales de su
distribución histórica (escenario dispersionista).
REVISIÓN BIBLIOGRÁFICA_________________________________________________________________________________
28
Los hábitat de C. mydas se han restringido a zonas tropicales y subtropicales. En los
tiempos de los episodios de máxima glaciación, el avance de la capa de hielo continental y
la consecuente reducción del nivel del mar (aproximadamente 100 m por debajo del nivel
actual (Bowen, 1978), redujeron probablemente los hábitat de forrajeo y de anidación para
C. mydas, restringiéndolos a las zonas tropicales. Los registros climáticos para la
glaciación de Wisconsin, i.e. última glaciación (18 000 años atrás), han indicado que el
hielo marino se extendió al menos diez grados de latitud más cercanos al Ecuador del que
lo está hoy día (Gates, 1993). Bajo estas condiciones de bajas temperaturas y elevada
aridez, no existió disponibilidad de hábitat aptos para la anidación de C. mydas en los
sitios de anidación contemporáneos de las latitudes altas del Atlántico donde se localizan
las actuales colonias de anidación de las penínsulas de la Florida y Yucatán, así como de
Chipre (Encalada et al., 1996). Las regiones ecuatoriales pudieron haber servido como
refugios para la especie durante las glaciaciones, con subsecuentes colonizaciones en las
altas latitudes durante los períodos interglaciales (Encalada et al., op.cit.). Por
consiguiente, la dispersión a largas distancias durante los retiros glaciares (con los
consecuentes aumentos de temperatura y la disponibilidad de alimento y condiciones de
anidación), ha estado fuertemente implicada con la colonización de las colonias de
anidación del oeste del Caribe y del Mediterráneo. Aprovechando estas condiciones
durante los períodos interglaciales precursores de los haplotipos CM-A13 y 14
probablemente colonizaron el mar Mediterráneo, como ha sido indicado por los registros
climáticos y las cercanas relaciones entre los haplotipos de Chipre y el Caribe (Encalada
et al., op.cit.). Aunque la más reciente capa glaciar comenzó a retirarse hace
aproximadamente 18 000 años, el evento Younger Dryas representó un fenómeno de
enfriamiento global que ocurrió entre once y 10 000 años atrás (Engstrom et al., 1990;
Kudrass et al., 1991; Gates, 1993). Por lo que los eventos de colonización al noroeste del
Caribe y el Mediterráneo ocurrieron más probablemente dentro de los últimos 10 000
años. (Encalada et al., 1996).
Dentro de la región ecuatorial precursores de haplotipos CM-A5, 6 y 7 pudieron haber
colonizado la costa noreste de América del Sur (colonias actuales de Surinam y Guyana)
(Encalada et al., op.cit.). Moll (1983) sugirieron que durante los tiempos de la disminución
de los niveles del mar los recursos de forrajeo disponibles para C. mydas en Brasil e Isla
REVISIÓN BIBLIOGRÁFICA_________________________________________________________________________________
29
Ascensión se fraccionaron al norte y al sur, induciendo entonces la colonización de estas
áreas. Aunque este escenario vicariancista puede considerarse para la colonización de las
áreas de alimentación del norte durante las glaciaciones, la dislocación gradual de los
agregados de alimentación no es probable que se tenga en consideración para la
colonización de colonias distantes a altas latitudes (Encalada et al., 1996). Finalmente,
considerando la información derivada de los estudios del mtDNA según Meylan et al.
(1990), Bowen et al. (1992) y Encalada et al. (1996), se concluye que la filogenia
matriarcal global de C. mydas ha sido moldeada por la separación de las cuencas
oceánicas y por la conducta de reproducción en el lugar de origen.
II.7.2. Caretta caretta.
La reciente historia evolutiva de C. caretta en el Atlántico y el Mediterráneo ha estado
fuertemente vinculada a la historia climática y geológica de la región (Bowen et al., 1994).
Con la técnica de RFLP aplicada al marcador mtDNA se han reconocido dos linajes,
separados por una distancia nucleotídica neta dA=0.009 la cual permitió estimar un tiempo
de divergencia promedio de 3 MA (Bowen et al., op.cit.). Ambos linajes estuvieron
representados en los océanos Atlántico e Índico, mientras que en el Pacífico sólo se
encontró uno.
La estructuración entre la generalidad de las colonias de anidación ha sugerido un
connotado aislamiento entre las cuencas oceánicas en la escala ecológica del tiempo
(Encalada et al., 1998). Sin embargo, en la escala evolutiva han estado conectadas.
Durante los períodos fríos que se sucedieron en el Pleistoceno, las poblaciones de la
especie en cada océano quedaron aisladas geográficamente (Bowen et al., 1994). El linaje
representado por los haplotipos CC-A1-3 y 6 evolucionó en la cuenca atlántica, mientras
que el otro lo hizo en la indo-pacífica. Subsecuentes aumentos de la temperatura durante
los períodos interglaciales facilitaron la expansión del hábitat para la especie hacia
latitudes más altas, y el establecimiento de un corredor marino alrededor de Sudáfrica. La
transferencia efectiva entre cuencas oceánicas a través del corredor también pudo
facilitarse debido a que la especie posee amplia plasticidad para soportar aguas
templadas con relación a las restantes tortugas marinas.
REVISIÓN BIBLIOGRÁFICA_________________________________________________________________________________
30
En estos períodos un precursor del haplotipo CC-A6 del linaje de la cuenca atlántica, pudo
colonizar la cuenca índica, y un precursor de los haplotipos CC-A4 y 5 del linaje indopacífico pudo colonizar la cuenca atlántica sobre la base de que el primer linaje está
ampliamente distribuido en el Atlántico y representado escasamente en el Indo-Pacífico
por un solo haplotipo, y de que el segundo está ampliamente distribuido en el IndoPacífico y en el Atlántico con un haplotipo común y otro raro (Bowen et al., op.cit.). La baja
diversidad de los linajes en las cuencas oceánicas invadidas indica que las colonizaciones
ocurrieron probablemente en los últimos 20 000 años.
La colonización del Mediterráneo debió ser aún más reciente (Bowen et al., 1994),
después de concluir la última glaciación, debido a que el desarrollo embrionario sólo es
posible a temperaturas mayores o igual que 25oC según Buckley et al. (1982). Sin
embargo, la especie pudo establecerse durante los períodos glaciales en el sur de la
Florida, no así en las actuales locaciones de Georgia y Carolina del Norte, donde el
establecimiento definitivo debió ser concomitante con la colonización del mar
Mediterráneo. Esto se corrobora con la baja diversidad genética de las colonias
establecidas en estas latitudes como consecuencia de sucesivos cuellos de botellas
(Bowen et al., 1993).
Con la técnica de secuenciación aplicada al marcador RNC del mtDNA (380 pb) Encalada
et al. (1998) reconocieron dos linajes en la cuenca atlántica. Ambos linajes se separaron
por una d(A)=0.05, la cual permitió estimar un tiempo de divergencia promedio de 3.2 MA
(similar al determinado por Bowen et al. (1994), teniendo en cuenta que la divergencia
entre secuencias de la RNC es seis veces mayor que el análisis de RFLP sobre mtDNA
(Encalada et al., 1998). El primer linaje está representado estrictamente en la cuenca
atlántica, mientras que el otro lo está en las cuencas mediterráneas americana y del Viejo
mundo. Inusualmente, haplotipos de linajes independientes anidan en la misma playa.
Dada la estructuración significativa entre las colonias del sur y del nordeste de la
península de la Florida hasta el estado de Carolina del Norte, fue encontrada una
discontinuidad filogeográfica la cual ha sido reportada para otras especies (Avise, 1992;
Karl & Avise, 1992; Lamb & Avise, 1992). Durante las glaciaciones del Pleistoceno los
linajes pudieron sobrevivir en latitudes ecuatoriales, con climas más estables (Encalada et
REVISIÓN BIBLIOGRÁFICA_________________________________________________________________________________
31
al., 1998). Subsecuentemente, durante los períodos interglaciales la especie pudo
conquistar latitudes más altas. Un linaje ecuatorial, precursor del haplotipo A, pudo haber
colonizado las latitudes más norteñas como por ejemplo, las caribeñas. Desde esta área,
consecuentes colonizaciones pudieron ocurrir hacia las costas occidental y oriental de la
Florida, y al norte, donde la severidad climática pudo ser la máxima responsable de
sucesivos cuellos de botellas que se evidencian con la baja diversidad genética de las
colonias de anidación actualmente establecidas en estas latitudes.
Por otra parte, Encalada et al. (op.cit.) plantearon que una trasplantación del precursor del
haplotipo B hacia el Atlántico occidental también pudo ocurrir a partir de un ancestro indopacífico, vía corredor del sur de África, como sugiere Bowen et al. (1994). Las colonias del
norte de la península de la Florida y de los estados actuales de Georgia y Carolina del
Norte no debieron establecerse hasta que concluyó la última glaciación, al igual que la
trasplantación del haplotipo B hacia la cuenca mediterránea del Viejo mundo. La amplia
distribución de este haplotipo evidencia que la especie ocasionalmente ha sido propensa a
realizar largas migraciones y colonizaciones en períodos evolutivos relativamente cortos.
MATERIALES Y MÉTODOS__________________________________________________________________________________
32
III. MATERIALES Y MÉTODOS.
III. 1 Obtención y procesamiento de las muestras.
Muestras de tejidos de las
N
extremidades
II
correspondientes
embriones
a
de
57(1)
56(1)
I
nidos
diferentes,
pero
concomitantes
en
estadio
de
fueron
colectadas
en
playas del suroeste del
archipiélago
cubano
1(11)
HIFL
28(1)
A
17(2)
18(3)
16(1)
15(1)
5(1)
1(7)
2(1)
3(8)
27(1)
el
desarrollo,
3(12)
1(3)
48(2)
B
SWCUB
48(3)
3(8)
3(5)
QRMEX
(Figs. 3 y 4):
• Chelonia mydas: once
en playa Boba [21º
58’N; 83º 36’O] (Cayo
Real,
Cayería
Felipe),
San
4(1)
durante
TORCR
agosto de 1998, y 17
3(40)
en la península de
Guanahacabibes
durante el 2000: tres
en playa Antonio [21°
91’N;
catorce
84°
en
65’O]
y
playa
Caleta de los Piojos
[21° 82’N; 84° 87’O].
Las muestras de estas
dos últimas colonias
de anidación fueron
juntadas en una sola
0 km 200
400
600
Fig. 3. Distribución y representación de los haplotipos (frecuencias
absolutas y relativas representadas respectivamente por el número entre
paréntesis y por matices en el pastel) de colonias de anidación de C.
mydas en el Mediterráneo americano. El análisis se basó en secuencias
de la RNC del mtDNA (ca. 490 pb).
Linajes de la cuenca atlántica (Encalada et al., 1996): I- Caribe oriental – Atlántico Sur; IICaribe occidental – Mar Mediterráeo.
Áreas/ colonias de anidación: HIFL- Hutchinson Island (USA); QRMEX- Quintana Roo
(México); SWCUB- suroeste de Cuba/ A- Península de Guanahacabibes, B- Cayería San
Felipe; TORCR- Tortuguero (Costa Rica). Los datos de HIFL corresponden a Allard et al.
(1994), QRMEX a Encalada et al. (1996) y TORCR a Lahanas et al. (1998) y Allard et al.
(1994). Colonias de anidación: CL- Cayo Largo, GU- Guanahacabibes, IJ- Isla de la
Juventud y SF- San Felipe. Cuando aparecen dos gráficos por colonia de anidación, el
superior se corresponde con los datos deC. mydas, mientras que el inferior con los de C.
caretta.
Haplotipos: CM-A1 – 4 (Allard et al., 1994); CM-A5 (Lahanas et al., 1994); CM-A15 – 18
(Encalada et al., 1996); CM-A27 y 28 (Bjorndal & Bolten, inscritos en el GenBank 2001); CMA48, 56 y 57 (Espinosa et al., inscritos en el GenBank 2003). Por conveniencia sólo se
representan los números ordinales que identifican a cada haplotipo delante del paréntesis.
localidad denominada península de Guanahacabibes, debido a que ha sido
MATERIALES Y MÉTODOS__________________________________________________________________________________
33
documentado el intercambio de ovíferas entre playas dentro la misma estación de
anidación y entre años a través del programa de marcación – recaptura implementado
por el Centro de Investigaciones Marinas en la península hace casi una década
(Azanza, com. pers.). Adicionalmente ambas playas pertenecen a un mismo accidente
geográfico con características paisajísticas similares del tipo llanura sumergida de la
plataforma insular sometida a un oleaje interno fuerte de los subtipos (Mateo, 1989): 1)
con débil cobertura vegetal, sobre roca y arena carbonatada y 2) ídem, pero sólo sobre
roca.
• Caretta caretta: seis en Cayo Real [21º 58’N; 83º 36’O](Cayería San Felipe), en junio y
agosto de 1998; diez en la península de Guanahacabibes [21º 56’N; 84º 30’O] durante
las temporadas de anidación comprendidas entre el 2000 y 2006; doce en El Guanal
[21º 30’N; 82º 41’O] (Playa Larga, Isla de la Juventud) desde junio hasta agosto de
2006; ocho en playa Los Cocos [21º 38’N; 81º 28’O] (Cayo Largo del Sur) en marzo y
junio de 2006.
Las muestras fueron conservadas en etanol (90%), a temperatura ambiente. La extracción
del DNA fue realizada a partir del método propuesto por Hillis et al. (1996). Se amplificó la
mitad 5’ de la RNC del mtDNA (ca. 493 y 380 pb en C. mydas y C. caretta
respectivamente) a través de la reacción en cadena de la polimerasa (PCR), empleando
los pares de cebadores L15926 (Kocher et al., 1989) y TCR6 (Norman et al., 1994) en C.
mydas, y TCR5 y TCR6 (Norman et al., op.cit.) en C. caretta para hacer comparables los
fragmentos con los publicados para cada linaje. La PCR fue desarrollada en 50 µL de
volumen de reacción, integrado por 2 unidades de Taq polimerasa, 1x PCR tampón II
(Promega), 2.5 mM MgCl2, 0.2 mM de dNTP y 0.2 µM de cada cebador por 10-500 ng de
DNA genómico. El proceso fue realizado en un termociclador automático (MJ Research),
utilizando un paso de desnaturalización inicial de 4 min a 94 oC, seguido de 40 ciclos de
94 oC por 1 min, 45 oC por 45 s, 72 oC por 1 min; y 10 min a 72 oC de extensión final de la
reacción. El producto de la PCR fue visualizado en una electroforesis sobre gel de agarosa
con bromuro de etidio y la cantidad fue estimada a partir de comparaciones con un
marcador de bajo peso molecular (Gibco BRL).
MATERIALES Y MÉTODOS__________________________________________________________________________________
I II
N
1(8)
I
BI
CR
2(1)
2(1) 7(1)
1(19)
1(20)
7(1)
3(1)
1(4)
CI
1(12)
AI
TB
2(2)
SJ
NWFL
1(8)
NEFL-NC
10(2)
3(1) 13(1)
2(13) 1(32)
CSB
10(1)
NJt
14(1) SJt
2(4) 1(9)
11(1)
7(1) 20(1)
2(3) 1(4)
1(9)
7(2) 14(1)
3(3)
SWFL
1(9)
1(42)
)
2(1)
EA
CpL
TI
2(8)
SEFL
MB
2(17) 1(25)
1(15) SC
HI 2(5)
1(4)
5(1)
3(1)
KI
1(5)
2(9)
PE
1(3)
2(6)
10(2)
9(2) 1(4)
DT
12(1)
2(50)
2(3)
10(1)
14(3)
8(1)
GU
1(3)
2(7)
IJ
CL
2(9)
QRMEX 10(5)
9(1)
8(1)
2(5)
SF
14(3)
SWCUB
2(11)
3(2)
0 km
200
400
600
Fig. 4. Distribución y representación de los haplotipos (frecuencias absolutas y relativas representadas
respectivamente por el número entre paréntesis y por matices en el pastel) de C. caretta en áreas/
colonias de anidación (representadas con siglas) del Gran Caribe y la costa este de USA. El análisis se
basó en secuencias de la RNC del mtDNA (ca. 380 pb).
Linajes de la cuenca atlántica (Encalada et al., 1996; Laurent et al., 1998): I- Atlántico Sur y Norte; II- Gran Caribe y Mar
Mediterráneo.
Áreas / colonias de anidación: Carolina del Sur/ CR- Cape Romain; DT- Dry Tortugas; Georgia/ CI- Cumberland Island; NC- Carolina
del Norte/ BI- Balhead Island, CpL- Cape Lookout y TI- Topsail Island; NEFL- noreste de la Florida/ Amelia Island; NWFL- noroeste
de la Forida/ CSB- Cape San Blas, EA- Eglin Air Force Base, SJ- St Joseph's y TB- Tyndall Beach; QRMEX- Quintana Roo
(México); SEFL- sureste de la Florida/ MB- Melbourne Beach, HI- Hutchinson Island, NJt- norte de Jetty, PE- Port Everglades, y SJtsur de Jetty; SWCUB- suroeste de Cuba/ CL- Cayo Largo, GU- Guanahacabibes, IJ- Isla de la Juventud y SF- San Felipe; SWFLsuroeste de la Florida/ KI- Key Island y SC- Sarasota County. La generalidad de los datos de las colonias de anidación
corresponden a Encalada et al. (1998), excepto en NJt y SJt (Francisco et al., 1999); MB y SC (Francisco & Bowen, 2001; Encalada
et al., 1998); CSB y DT (Francisco & Bowen, 2001). Las líneas discontinuas indican las barreras biogeográficas de las costas oeste
y este (Briggs, 1974) y de forma escalonada entre éstas (Muss et al., 2001) de la península de la Florida.
Haplotipos: CC-A1; 2; 3; 5 – 10 (Encalada et al., 1998; Bolten et al., 1998); CC-A12 – 14 (Bolten et al., 1998) y CC – A20 (Bowen,
inscritos en el Archie Carr Center). Por conveniencia sólo se representan los números ordinales que identifican a cada haplotipo
delante del paréntesis.
34
MATERIALES Y MÉTODOS__________________________________________________________________________________
35
El producto de la PCR fue purificado usando columnas Quick spin G50 (Boehringer
Mannheim) y fue secuenciado cíclicamente (Sanger et al., 1977) usando el kit Thermo
Sequenase (Amersham) con ddNTPs marcados con P33. El producto de secuenciación de
cada muestra fue corrido en una electroforesis vertical en gel de poliacrilamida al 6%. Los
geles fueron expuestos a placas fotosensibles. En el caso de C. caretta la secuenciación
fue automática (compañía Macrogen), debido a que en el momento del procesamiento de
estas muestras se dispuso de un procedimiento más eficiente en términos económicos.
Estas secuencias fueron rectificadas visualmente con los cromatogramas mediante el
programa BioEdit Sequence Alignment Editor (Hall, 1999). Cada muestra fue secuenciada
en ambas direcciones para solucionar ambigüedades de posiciones nucleotídicas.
III.2 Análisis de los datos.
Las secuencias obtenidas en las colonias de anidación del suroeste cubano fueron
identificadas y caracterizadas a través de un alineamiento con los haplotipos que tipifican
el linaje restringido al hemisferio Norte para C. mydas (CM-A1 – 4, Allard et al., 1994; CMA13 – 18, Encalada et al., 1996; CM-A22, 26 – 31 y 34, Bjorndal & Bolten, inscritos en el
GenBank 2001 y http://accstr.ufl.edu/cmmtdna.html), utilizando el programa Clustal X 1.8
(Thompson et al., 1997). Para esta selección fue considerada la disyunción genética entre
los linajes de C. mydas de las cuencas Atlántica e Indopacífica (Bowen et al., 1992) y
entre los linajes del Caribe occidental – Mar Mediterráneo y del Caribe oriental – Atlántico
Sur (Encalada et al., 1996) (ver Fig. 3). Los alineamientos se rectificaron visualmente.
Para C. caretta el alineamiento fue hecho con los haplotipos que tipifican los linajes
restringidos uno, al Atlántico – península de la Florida y el otro, a los mediterráneos
americano – Viejo mundo (CC-A1 – 10, Encalada et al. (1998); CC-A11 – 17, Bolten et al.
(1998); CC-A18, Bass et al. (2004); CC-A26 – 32, Carreras et al. (2006); CC-A37 y 40,
Roberts et al. (2005); CC-A44, Reece et al. (2005); CC-A48, Laurent et al. (1998); CC-A19
– 23, 24 y 25, 36 y 41, 42, 43, 45, 49 y 50 según Bowen, Bass, Bolten, Carreras,
Shamblin, Mazzarella, Monzon, Roberts & Casale respectivamente (inscritos en el Archie
Carr Center for Sea Turtle Research (ACCSTR): http://accstr.ufl.edu/cmmtdna.html)). Para
esta selección fue considerada la disyunción genética entre los linajes de las cuencas del
Atlántico e Indo-Pacífico (Bowen et al., 1994) y entre las colonias de anidación de los
mediterráneos americano y del Viejo mundo (Encalada et. al., 1998; Laurent et al., 1998)
MATERIALES Y MÉTODOS__________________________________________________________________________________
36
(ver Fig. 4), así como la ubicación geográfica de Cuba, próxima a las colonias de
anidación de la península de la Florida y cayos adyacentes, que a su vez estuvieron
integradas por haplotipos de ambos linajes.
La numeración de los SPs fue realizada tomando como referencia la primera base de la
RNC del mtDNA (C. mydas según Kumazawa & Nishida (1999) (ver Fig. 1); C. caretta
según Laurent et al. (1998) (ver Fig. 2)). En el caso en que existió un indel de más de una
base, el SP se identificó con el número correspondiente al primer nucleótido, manteniendo
en el próximo SP una correspondencia entre la numeración del nucleótido de la secuencia
original y el SP en cuestión. A los efectos del procesamiento estadístico, cada indel
(independiente de su tamaño) se recodificó como si fuera una sola transversión. La
posición de los haplotipos de las colonias de anidación del suroeste cubano fue dilucidada
mediante la construcción de un árbol con las menores mediciones entre los haplotipos del
linaje (Rohlf, 1973).
Para determinar la estructuración genética entre las colonias de anidación del suroeste
cubano y las estudiadas previamente en el Atlántico el análisis fue limitado a aquellas
colonias que al menos compartieron un haplotipo con las del suroeste cubano; i.e., C.
mydas (ver Fig. 3): Tortuguero, Costa Rica; Quintana Roo (X’Cacel e Isla Cozumel),
México; Florida, USA; según Allard et al. (1994), Encalada et al. (1996) y Lahanas et al.
(1998); C. caretta (ver Fig. 4): USA: Melbourne Beach, Hutchinson Island, Port Everglades,
norte y sur de Jetty, Key Island, Sarasota County, Cape San Blas, St. Joseph's, Tyndall
Beach, Eglin Air Force Base, Georgia, Dry Tortugas, y México: Quintana Roo; según
Encalada et al. (1998), Francisco et al. (1999) y Francisco & Bowen (2001). El grado de
diferenciación genética (FST convencional para C. mydas, debido a que prácticamente
existe un solo tipo de cambio (transición) como consecuencia de estar representada por
dos linajes naturalmente emparentados; Φ ST para C. caretta, utilizando el método de
Tamura (Tamura, 1992), debido a la existencia de diversos tipos de cambios como
consecuencia de estar representada por dos linajes naturalmente no emparentados) fue
estimado según Slatkin (1991) y los intervalos de confianza fueron obtenidos a través de
1000 permutaciones aleatorias, utilizando el programa Arlequin ver. 3.11 (Excoffier et al.,
2005). Asumiendo un modelo de isla, el F- Φ ST fue utilizado para estimar el número
MATERIALES Y MÉTODOS__________________________________________________________________________________
37
absoluto de migrantes intercambiados entre dos poblaciones por generación. Las
frecuencias haplotípicas entre localidades fueron comparadas utilizando la prueba de
independencia X2 (Sokal & Rohlf, 1981), corregida con el procedimiento de Bonferroni
(Rice, 1989) con 1000 simulaciones (Roff & Bentzen, 1989), a través del programa
CHIRXC (Zaykin & Pudovkin, 1993). En el caso de la colonia de anidación de C. mydas de
Tortuguero fue preferido comparar los resultados con los de Allard et al. (1994) y Lahanas
et al. (1998), teniendo en cuenta que los tamaños muestrales utilizados por estos autores
fueron similares a los de las otras colonias de anidación y que la composición haplotípica
no fue afectada significativamente (X2(8)=13.79, p=0.11; a partir los datos originales y
tabulados en Bjorndal et al. (2005) para los años 2001, 2002 y 1988-1996) cuando el
tamaño de la muestra fue aproximadamente diez veces mayor, de acuerdo con Bjorndal et
al. (op.cit.). Del análisis en C. mydas fue excluida la Isla de Aves (Venezuela) debido a que
Lahanas et al. (1994) demostró que esta colonia de anidación fue colonizada
recientemente por los haplotipos más ampliamente distribuidos y mejor representados en
el Mediterráneo americano y áreas de anidación adyacentes de Surinam.
La estructura genética de las colonias de anidación del suroeste cubano fue analizada
jerárquicamente para comprobar si las colonias de anidación cubanas de cada especie
constituyeron una población panmicta dentro de la macro estructura genética de la región,
aplicando un análisis de la varianza molecular (AMOVA) (Excoffier et al., 1992) con 1000
permutaciones aleatorias, mediante el programa Arlequin ver. 3.11. Tres escenarios
hipotéticos fueron considerados para C. mydas: las colonias de anidación del suroeste
cubano junto con las otras colonias de anidación del Mediterráneo americano son
localidades geográficas dentro de una población panmicta (Mediterráneo americano) (I);
las colonias de anidación del suroeste cubano son localidades dentro de una población
panmicta cubana y conjuntamente con las restantes poblaciones del Mediterráneo
americano forman una metapoblación (II), y las colonias de anidación del suroeste cubano
y la de la península de la Florida son localidades dentro de una población panmicta y
conjuntamente con las restantes poblaciones del Mediterráneo americano forman una
metapoblación (III). Para C. caretta, también fue probado el escenario hipotético de la
existencia de una población panmicta entre las colonias de anidación del Mediterráneo
americano (I), que comparten al menos un haplotipo con las cubanas, y fue comprobado si
MATERIALES Y MÉTODOS__________________________________________________________________________________
38
las colonias de anidación del suroeste de Cuba constituyen una población panmicta dentro
de la macro estructura genética reconocida para la región (escenario hipotético II),
considerando: 1) las poblaciones panmictas (unidades demográficas independientes)
propuestas por Encalada et al. (1998), Francisco & Bowen (2001) y Bowen (2004), i.e.
noroeste de la Florida (Cape San Blas, St. Joseph's, Tyndall Beach, Eglin Air Force Base),
sur de la Florida (Melbourne Beach, Hutchinson Island, Port Everglades, norte y sur de
Jetty, Key Island y Sarasota County), noreste de la Florida hasta Carolina del Norte
(Georgia en representación de las restantes del norte de la Florida y Carolina del Norte y
del Sur), Dry Tortugas y México, y 2) los resultados de la diferenciación por pares de
colonias de anidación. Adicionalmente, fue aplicado otro AMOVA jerarquizado (escenario
hipotético III), semejante al segundo, pero segregando las colonias de anidación del
suroeste y sureste de la Florida. La muestra dentro del área de anidación noreste de la
Florida hasta Carolina del Norte fue simplificada a la colonia de anidación de Georgia
(selección al azar), considerando que una agrupación de muestras integradas por el
mismo haplotipo puede provocar una significación del Φ SC (error de tipo I).
También fue analizada la contribución por locus a la estructura poblacional siguiendo el
algoritmo propuesto en el mismo programa Arlequin ver. 3.11. Aquellos loci que incidieron
significativamente en los índices de fijación fueron reflejados en el texto, considerando los
niveles jerárquicos de los escenarios hipotéticos. La prueba de Mantel (también del
programa Arlequín ver. 3.11) fue aplicada para determinar la dependencia entre las
medidas de diferenciación genética (F- Φ ST y dA de Nei) y la distancia geográfica por
pares de colonias de anidación con 10 000 permutaciones aleatorias (Smouse et al.,
1986).
Una vez dilucidada la estructura genética de las colonias de anidación, la diversidad
genética de éstas fue caracterizada. Para ello fueron calculados los porcentajes de
endemismo haplotípico (número de haplotipos endémicos/ total de haplotipos) y de
individuos endémicos (número de individuos con haplotipos endémicos/ total de
individuos). Además fueron estimados los índices de diversidad genética ( Ĥ ) (Nei, 1987)
y nucleotídica ( πˆ n) (Tajima, 1983; Nei, op.cit.) y fue corroborado que las mutaciones
detectadas en la región no codificadora estudiada en cada población fueran
MATERIALES Y MÉTODOS__________________________________________________________________________________
39
selectivamente neutrales, mediante los estadísticos D de Tajima (Tajima, 1989, 1996) y Fs
de Fu (Fu, 1997) con 1000 simulaciones (Stewart, 1977) mediante el programa Arlequin
ver. 3.11.
Considerando que en marcadores haploides selectivamente neutrales, el tamaño efectivo
de la población puede expresarse como un medio de la razón de la correlación de genes
de diferentes individuos en la misma población ( θˆ ) versus la tasa de mutación (µ) a partir
de la formulación original (Watterson, 1975), este parámetro fue calculado por estación
reproductora para cada colonia de anidación teniendo en cuenta una media de
remigración de 3 años (Van Buskirk & Crowder, 1994; Miller, 1997) y una tasa de mutación
de 1.2% por locus por MA por pares de linajes, informada para C. mydas según Avise et
al. (1998) a partir de la metodología de Avise et al. (1992) y según datos de Bowen et al.
(1992), adaptados a secuencias de mtDNA según Encalada et al. (1996) y de 0.83 % para
C. caretta (Encalada et al., 1998). Esta tasa de mutación se correspondió a la cota
superior de 3.0 MA y no al promedio del intervalo de tiempo propuesto para la constitución
del istmo interoceánico (3.0-2.5 MA) según Lundelius (1987) y empleado por Avise et al.
(1992) y fue corregida con el tiempo promedio de vida de una generación (47 y 45 años
para C. mydas y C. caretta respectivamente), calculado según Pianka (1974) y empleando
una media de maduración sexual de 37.5 y 35 años para C. mydas (Limpus & Chaloupka,
1997; Bjorndal et al., 2000) y C. caretta (ALRTM, 2003) respectivamente, y una media de
vida reproductora de 19 y 20 años para C. mydas (Chaloupka et al., 2004) y C. caretta
(ALRTM, 2003) respectivamente. Theta fue calculado según el número de sitios
segregativos ( θˆ S) y la diversidad nucleotídica ( θˆ π), mediante el programa Arlequin ver.
3.11.
Para analizar la demografía histórica de las poblaciones fue calculada la distribución del
número observado de diferencias entre pares de haplotipos mediante el modelo de
expansión súbita (Rogers & Harpending, 1992). Su significación fue examinada usando la
desviación estándar de la suma de cuadrados entre las desigualdades observadas y
esperadas (Ssd) a través del programa Arlequin ver. 3.11. Mediante este modelo fueron
obtenidos el tamaño efectivo de la colonia de anidación antes de la expansión (N ( θˆ 0)) y el
intervalo temporal en años donde ocurrió la expansión (t). En esta última variable fueron
MATERIALES Y MÉTODOS__________________________________________________________________________________
40
referidos los valores considerando el intervalo de confianza (IC) para alpha igual a 0.05 (Li,
1977). En el caso de que Theta tomó valor cero al inicio de la expansión, el tamaño
efectivo al inicio de la expansión fue calculado con el valor medio del IC del estadístico con
igual alpha. En el análisis de expansión demográfica también fue tenido en cuenta la
significación de la Prueba de Fu.
Las relaciones filogenéticas entre los haplotipos informados para las poblaciones de
anidación de los linajes de la cuenca atlántica (Encalada et al., 1996) fueron inferidas
utilizando los métodos de distancia UPGMA (Sneath & Sokal, 1973) y NJ (Saitou & Nei,
1987), a través del programa MEGA ver. 3.0 (Kumar et al., 1993). Fueron reconstruidos
dos filogramas enraizados de haplotipos (por conveniencia para la representación gráfica,
sólo fue mostrado el resultado del UPGMA) con los haplotipos correspondientes a las
poblaciones de anidación que comparten al menos un haplotipo con las cubanas),
empleando como grupo externo al haplotipo CMU40436 y B de linajes del Pacífico de C.
mydas (Dutton et al., 1996) y C. caretta (Hatase et al., 2002) respectivamente. El soporte
estadístico para los nodos fue estimado mediante un "bootstrapping" no paramétrico
(Felsenstein, 1985) utilizando 1000 pseudo-réplicas. Los tiempos de divergencia entre los
haplotipos fueron calculados a partir del intervalo superior de tiempo propuesto para la
constitución del istmo de Panamá (Lundelius, 1987). También fue calculada la divergencia
de secuencias mediante las distancias dentro y entre las poblaciones de anidación (Nei,
1987: fórmulas 10.19 y 10.20 respectivamente) y el número neto de sustituciones
nucleotídicas entre dos poblaciones (Nei & Li, 1979). Éste último fue utilizado para estimar
los tiempos de divergencia entre las poblaciones de anidación (Nei, 1987: fórmula 10.22).
La interpretación de los árboles de distancia no constituye per se una estimación formal
para verificar hipótesis filogeográficas, además de no incluir una metodología para la
interpretación de los modelos observados (Templeton, 2004). Por esta razón también fue
aplicado el Análisis Filogeográfico de Clados Anidados (NCPA) (Templeton et al., 1987)
con los haplotipos de las colonias de anidación que al menos compartieron un gen con las
del suroeste de Cuba. Para ello fueron tenidos en cuenta los haplotipos encontrados en el
presente estudio y aquellos publicados para el linaje mediterráneos americano – Viejo
Mundo, con sus respectivas frecuencias según datos originales de Allard et al. (1994),
MATERIALES Y MÉTODOS__________________________________________________________________________________
41
Encalada et al. (1996) y Lahanas et al. (1998) para C. mydas, y de Encalada et al. (1998),
Laurent et al. (1998), Francisco et al. (1999) y Francisco & Bowen (2001) para C. caretta.
Por lo tanto, en este análisis fueron incluidas las poblaciones de anidación de Lara
(Chipre) para C. mydas y C. caretta, además de Grecia, Turquía y Brasil para esta última,
porque sus haplotipos pertenecieron al mismo linaje y en algunos casos coincidieron con
la representación de las colonias de anidación cubanas. Primeramente, el número máximo
de conexiones entre pares de secuencias fue calculado bajo un criterio de “parsimonia”, a
partir del número de mutaciones en relación con la probabilidad de parsimonia (Templeton
et al., 1992), así como el haplotipo de mayor peso como grupo externo (Castelloe &
Templeton, 1994). Este proceso resultó en un dendrograma no enraizado, con nueve
pasos correspondientes al 95% del límite de conexiones, a través del programa TCS ver.
1.21 (Clement et al., 2000). Seguidamente, dos series de clados anidados jerárquicamente
fueron definidos según las reglas de anidación propuestas por Templeton et al. (1992) y
Templeton & Sing (1993), los cuales fueron analizados estadísticamente en términos de
relaciones entre la genealogía de los haplotipos y la distancia geográfica de conexión más
probables entre las colonias, con el programa GEODIS ver 2.5 (Posada et al., 2000). Los
clados con valores significativos de distancias de clados fueron interpretados mediante el
empleo de la clave de inferencia para el NCPA (Templeton, 2004), versión 11 noviembre
2005.
El valor de probabilidad (p) para cada estadístico fue obtenido cuando el valor aleatorio de
las permutaciones fue menor o igual al observado, excepto en los estadísticos F- Φ CT y FΦ SC donde el valor de p fue obtenido cuando la proporción fue mayor e igual porque se
asume para el primer caso, que las poblaciones son reales y las agrupaciones regionales
son artificiales y para el segundo caso, que las regiones son reales y las poblaciones
dentro de cada región son artificiales. La significación de los estadísticos fue considerada
cuando los valores de p fueron menores que 0.05.
RESULTADOS____________________________________________________________________________________________
42
IV. RESULTADOS.
IV.1 Análisis de secuencias.
IV.1.1 Chelonia mydas.
Los haplotipos encontrados
en
el
suroeste
23
linaje
mediterráneos americano –
3). Se informan tres nuevos
haplotipos endémicos para
las colonias de anidación
CM-A48, 56 y 57, acorde con
37
36*
25
294
470*
470*
171
x
385*
384
44
9
nomenclatura
233
Turtle
38
410
33
433
431
propuesta
Research
e
inscritos en el GenBank con
27
96
AJ543730,
AJ543732
AJ543735.
Otros
y
Linaje II
22
149
365
13
93
272
28
14
16
371
250
250
17
250
250
166*
56
18
48 470*
172*
2
93
57
149
96
x
los números de accesión:
49
384
278*
por el Archie Carr Center for
Sea
43
488
204*
284
la
173
410
367
32
20
6
410 410
367
173
365
39
133
7
171
133
45
50
5
448
35
133
46
470*
55
42
11
365
410
365
8
366*
40
230*
470*
374*
373
113
cubanas, designados como
36
113
428*
437*
272
10
x
Viejo Mundo (Fig. 5; ver Fig.
24
12
x
al
Cuba
x
pertenecen
de
21
41
Linaje I
15
365
184*
3 438* 30
294
39*
233
373
31
113
149
1
93
294
26
93
52
357*
53
29
dos
4
34
51
47
haplotipos (CM-A27 y 28; Fig. 5. Dendrograma no enraizado de máxima parsimonia basado en
inscritos
2001),
en
el
las diferencias nucleotídicas por pares de haplotipos de linajes de C.
GenBank, mydas en la cuenca atlántica. El análisis se basó en haplotipos de la
encontrados
en
la
colonia de anidación de la
península
Guanahacabibes,
de
también
podrían ser endémicos si sus
RNC del mtDNA (ca. 493 pb).
Círculo, indica al iésimo haplotipo; a rayas, haplotipos de origen desconocido; # fuera del
círculo representa una mutación (transición), con un cuadrado una transversión, con una
x un indel, y con un asterisco (*) un cambio diagnóstico.
Linajes de la cuenca atlántica (Encalada et al., 1996): I- Caribe oriental – Atlántico Sur; IICaribe occidental – Mar Mediterráeo.
Haplotipos: CM-A1, 2, 4, 8 – 18 (Encalada et al., 1996); CM-A3 (Allard et al., 1994); CMA22 (Bass y Witzell, 2000); CM-A23 – 34 (Bjorndal & Bolten, inscritos en el GenBank
2001); CM-A35 – 46 y 50 – 53 (Formia, inscritos en el Archie Carr Center); CM-A48, 56 y
57 (Espinosa et al., inscritos en el GenBank 2003); CM-A49 (Bagley, 2003); CM-A54
(Meylan, inscritos en el Archie Carr Center); CM-A55 (Naro-Maciel et al., 2007).
descriptores (Bjorndal y Bolten) los encontraron en un área marina de agregación.
Solamente uno de los haplotipos endémicos (CM-A48), presente en áreas de desarrollo de
la Florida (Bagley, 2003), se comparte entre las dos colonias de anidación del suroeste de
Cuba.
RESULTADOS____________________________________________________________________________________________
43
Los cinco haplotipos endémicos encontrados en las colonias de anidación del suroeste
cubano están interconectados en una red donde existen uno o dos cambios por pares de
haplotipos vecinos (ver Fig. 5), con respecto a los dos haplotipos más ampliamente
distribuidos y mejor representados (CM-A1 y 3; i. e., centros de diversificación) en el linaje
y en las colonias de anidación del Mediterráneo americano. El número de cambios que
existe entre los haplotipos del linaje con respecto a los haplotipos CM-A1 y 3,
considerando el camino más parsimonioso, es independiente del centro de diversificación
(X2(4)=5.67, p=0.24). Cuando fueron discriminados los cambios con respecto a la posición
(interna o externa) de los haplotipos, tampoco se encuentra dependencia en el número de
cambios entre los haplotipos internos y los centros de diversificación (X2(4)=0). Sin
embargo, se encuentra dependencia entre el número de cambios entre los haplotipos
externos y los centros de diversificación (X2(4)=9.52, p=0.03), siendo más frecuente un
cambio con respecto a CM-A3 y dos con respecto a CM-A1. Por consiguiente, se designa
a CM-A1 como haplotipo ancestral del linaje II. Un tercer centro de diversificación se
Frecuencia relativa de mutaciones (%)
encuentra alrededor del haplotipo CM-A13 del Mediterráneo del Viejo Mundo.
30
a) Linaje I
25
b) Linaje II
c) Linajes I y II
20
15
10
5
0
50 100 150 200 250 300 350 400 450 500
I-50
I-150I-200I-250I-300
I-400I-450I-500
as par
Longitud
secue
(p
es de mtDNA
la
50 100 150 200 250 300 350 400 450 500
I-150
I-50I-100
I-150I-200
I-150
0
I-500
I-400
I-450
L secuen
d eldmtDNA
itud
d itud itud
b)
50 100 150 200 250 300 350 400 450 500
I-400I-450I-500
I-50I-100I-150I-200I-250I-300
Longitud de secuencias (pb)
ngitud
secue
s pars del mtDNA (p
Fig. 6. Distribución de mutaciones en linajes de la cuenca atlántica de C. mydas. El análisis se basó en haplotipos
de la RNC del mtDNA (ca. 493 pb).
Transición, líneas inclinadas a la izquierda, por debajo de una línea negra continua y gruesa; Transversión, líneas inclinadas a la derecha; indel, a
cuadros; cambios diagnósticos de haplotipo y de haplotipo dentro de linaje en gris y gris y negro respectivamente; cambios diagnósticos entre
linajes en líneas negras oscuras.
Del total de sustituciones (31), aproximadamente el 94% son transiciones repartidas con
mayor frecuencia entre los 350 y 400 pb (Fig. 6b), excepto entre los 300 y 350 pb,
existiendo similar balance entre purinas y pirimidinas, así como entre los sentidos de las
sustituciones en relación al camino más parsimonioso respecto al ancestro CM-A1: T→C
RESULTADOS____________________________________________________________________________________________
44
(6) y C→T (8); A→G (7) y G→A (8). Las restantes sustituciones corresponden a una
transversión en el SP 365, que también constituye una transición para otras relaciones
como ocurre en el haplotipo CM-A4, y a un indel de seis pb (CAATGG) en el SP 470. A su
vez, el 31% aproximado de estas sustituciones representan cambios diagnósticos para los
haplotipos (ver Fig. 5). La inserción antes mencionadas lo es de CM-A48, mientras que las
transiciones (8) en los SPs 39, 166, 172, 184, 357, 374, 438 y 459 lo son de CM-A31, 34,
2, 15, 29, 22, 30 y 54 respectivamente. De éstas, las sustituciones entre purinas y
pirimidinas están en proporción 5:3. El sentido de las sustituciones diagnósticas en
relación al camino más parsimonioso con respecto al haplotipo ancestral es diferente entre
las transiciones de pirimidinas: T→C (3) y C→T (0); A→G (3) y G→A (2).
Entre los haplotipos correspondientes a las colonias de anidación del Mediterráneo
americano se determina un máximo de 17 SP. Tabla 1. Estos SP se clasifican en 15
transiciones, una transversión en la posición 284 y el indel anteriormente mencionado en
la posición 470. La transversión pertenece al haplotipo CM-A5, raro en la colonia de
anidación de Quintana Roo.
sólo
persisten 4 SPs (93, 149,
250 y el indel).
Para el otro linaje, que no
está representado en las
colonias
cubanas,
de
anidación
el
mayor
porcentaje de mutaciones
A
CM-A2
C
A
CM-A3
T
A
G
G
A
T
T
C
G
G
G
T
T
C
G
G
A
T
T
C
493
cubano
C
470
suroeste
CM-A1
433
atlántica. En la muestra del
431
cuenca
410
la
de
Sitios polimórficos
371
linajes
los
367
entre
365
diagnósticos
284
SPs
272
constituyen
433,
250
y
la base 1 de la región de control del mtDNA (Kumazawa y Nishida, 1999). ±, indel de
CAATGG.
Haplotipos: CM-A1 – 4 (Allard et al., 1994); CM-A5 (Lahanas et al., 1994); CM-A15 – 18
(Encalada et al., 1996); CM-A27 y 28 (Bjorndal & Bolten, inscritos en el GenBank 2001);
CM-A48, 56 y 57 (Espinosa et al., inscritos en el GenBank 2003).
184
431
americano. La numeración de los sitios polimórficos se realiza tomando como referencia
172
posiciones
las
149
de
133
transiciones
Tabla 1. Polimorfismo en la mitad 5’ de la RNC del mtDNA (ca. 490 pb)
las de C. mydas, determinado en colonias de anidación del Mediterráneo
96
y
93
cambio
Haplotipo
Este
T
C
G
G
T
A
G
-
A
T
C
G
G
T
A
G
-
A
T
C
G
G
T
A
G
-
A
CM-A4
T
A
G
G
A
T
T
C
T
T
G
G
T
A
G
-
A
CM-A5
C
G
A
G
A
T
C
C
G
C
A
G
C
G
A
-
G
CM-A15
T
A
G
G
A
C
T
C
T
C
G
G
T
A
G
-
A
CM-A16
C
A
G
A
A
T
C
T
T
C
G
G
T
A
G
-
A
CM-A17
C
A
G
A
A
T
C
C
T
C
G
A
T
A
G
-
A
CM-A18
C
G
G
G
A
T
T
C
T
C
G
G
T
A
G
-
A
CM-A27
C
A
G
G
A
T
C
C
T
C
G
G
T
A
G
-
A
CM-A28
T
A
G
G
A
T
C
C
T
C
G
G
T
A
G
-
A
CM-A48
C
A
G
G
A
T
T
C
T
C
G
G
T
A
G
+
A
CM-56
C
A
G
A
A
T
T
C
T
C
G
G
T
A
G
-
A
CM-57
T
A
G
A
A
T
T
C
T
C
G
G
T
A
G
-
A
RESULTADOS____________________________________________________________________________________________
45
también estuvo representado por transiciones repartidas, con mayor frecuencia, entre los
150 y 500 pb (Fig. 6a), excepto entre los 300 y 350 pb. Las transversiones y los indeles
se encontraron sólo entre 350 y 500 pb.
IV.1.2 Caretta caretta.
Los haplotipos encontrados en el suroeste de
Linaje I
21
península de la Florida y el otro, mediterráneos
22
3
23
CC-A1, 2, 8, 10, 12 y 14. El CC-A12, informado
15
189* 280*
294*
326
150*
americano – Viejo Mundo (Fig. 7; ver Fig. 4), i.e.
27
1
435*
40
suroeste
cubano
están
interconectados, dentro de cada linaje, en una
red donde existen generalmente uno o dos
cambios por pares de haplotipos vecinos (ver
Fig. 7), con respecto a los dos haplotipos más
49
206
470
161
9
29
268*
393*
320*
172*
428*
26
272*
142*
229
2
369*
470
16
161
468
206
468 206
42
43
30
207
423*
365*
del
50
46
48
31
44
471*
Los haplotipos encontrados en las colonias de
anidación
25
Linaje II
28
24
326
47
473*
472*
18
199*
4
205*
41
según Bolten et al. (1998), resulta ser endémico
188
11 354
272
246*
320*
para las áreas de forrajeo de Azores y Madeira
de la Cayería San Felipe.
14 229* 37
17
20
19
271*
x
x
Cuba pertenecen a dos linajes: uno, Atlántico –
8
473*
298
188
10
431 422
161
173*
3
13
298
6
7
12
468 431
422
298
188
5
x
36
32
45
distribuidos y mejor representados (CC-A1 y 2; i. Fig. 7. Dendrograma no enraizado de máxima
e., centros de diversificación) en el linaje y en las parsimonia basado en las diferencias
colonias
de
anidación
del
Mediterráneo
americano. En el linaje del Atlántico – península
de la Florida se encuentran tres centros de
diversificación alrededor de los haplotipos CCA1, 11 y 4, con mayores probabilidades de
ancestría para el caso de los dos primeros
centros de diversificación. El número de cambios
entre los haplotipos de este linaje con respecto a
los haplotipos CC-A1 y 11, considerando el
nucleotídicas por pares de haplotipos de linajes
de C. caretta en la cuenca atlántica. El análisis
se basó en haplotipos de la RNC del mtDNA
(ca. 380 pb).
Círculo, indica al iésimo haplotipo – a rayas, haplotipos de
origen desconocido; # fuera del círculo representa una
mutación (transición), con un cuadrado una transversión,
con una x un indel, y con un asterisco (*) un cambio
diagnóstico dentro de cada linaje.
Linajes de la cuenca atlántica (Encalada et al., 1996;
Laurent et al., 1998): I- Atlántico Sur y Norte; II- Gran Caribe
y Mar Mediterráneo.
Haplotipos: CC-A1 – 10 (Encalada et al., 1998); CC-A11 –
17 (Bolten et al., 1998); CC-A18 (Bass et al., 2004); CC-A26
– 32 (Carreras et al., 2006); CC-A37 y 40 (Roberts et al.,
2005); CC-A44 (Reece et al., 2006); CC-A48 (Laurent et al.,
1998); CC-A19 – 23, 24 y 25, 36 y 41, 42, 43, 45, 49 y 50
según Bowen, Bass, Bolten, Carreras, Shamblin,
Mazzarella, Monzon, Roberts y Casale respectivamente
(inscritos en el Archie Carr Center).
camino más parsimonioso, es dependiente del centro de diversificación (X2(3)=14.79,
RESULTADOS____________________________________________________________________________________________
46
p<0.001). Cuando un análisis similar al anterior se realiza discriminando los cambios con
respecto a la posición (interna o externa) de los haplotipos, no se encuentra dependencia
para el número de cambios entre los haplotipos internos y los centros de diversificación
(X2(2)=0). Sin embargo, se encuentra dependencia para el número de cambios existentes
entre los haplotipos externos y los centros de diversificación (X2(3)=19.33, p<0.001), siendo
más frecuente un cambio con respecto a CC-A1 y dos con respecto a CC-A11. Por
consiguiente, designamos a CC-A11 como haplotipo ancestral del linaje I. En el linaje
mediterráneos americano – Viejo Mundo sólo existe un centro de diversificación alrededor
del haplotipo ancestral CC-A2, lo cual simplificó su designación como haplotipo ancestral
Del total de
sustitucion
es
del
linaje
Atlántico –
península
de
la
Florida
25
a) Linaje I
el
son
b) Linaje II
c) Linajes I y II
20
15
10
5
0
100 150 200 250 300 350 400
ngitud
aproximada
88%
30
I-150I-200-250I-300I-350I-400
(14),
mente
Frecuencia relativa de mutaciones (%)
del linaje.
s par NC del m
100 150 200 250 300 350 400 450 500 100 150 200 250 300 350 400 450 500
I-150I-200I-250-300I-350I-400I-450I-500
L ecuen
gitud
d s parc
l de
es deNC
DNA (
I-150I-200I-250I-300I-350-400I-450I-500
Longitud de secuencias (pb)
gitud
de ) (
L ecues pars deNC tDNA
ecue s de
Fig. 8. Distribución
de mutaciones en linajes de la cuenca atlántica de C. caretta. El
análisis se basó en haplotipos de la RNC del mtDNA (ca. 380 pb).
Transición, representadas en líneas inclinadas a la izquierda, por debajo de una línea negra continua y gruesa;
Transversión, líneas inclinadas a la derecha; indel, a cuadros; cambios diagnósticos de haplotipo y de haplotipo
dentro de linaje en gris y gris y negro respectivamente; cambios diagnósticos entre linajes en líneas negras
oscuras o retículos en blanco y negro.
transiciones, repartidas con mayor frecuencia entre los 150 y 350 pb (Fig. 8a), con igual
balance entre purinas y pirimidinas, pero no entre los sentidos de las sustituciones en
relación al camino más parsimonioso respecto al ancestro CC-A11: T→C (4) y C→T (2);
A→G (4) y G→A (2). Las restantes sustituciones corresponden a dos transversiones en
los SPs 150 y 205. A su vez, el 64% aproximado de estas sustituciones representan
cambios diagnósticos para los haplotipos (ver Fig. 7). Las transversiones antes
mencionadas lo son de CC-A23 y 47, mientras que las transiciones (7) en los SPs 189,
199, 229, 246, 280, 294 y 320 lo son de CC-A21, 24, 37, 27, 17, 22 y 41 respectivamente.
De éstas, las sustituciones entre purinas y pirimidinas están en proporción 3:4. El sentido
RESULTADOS____________________________________________________________________________________________
47
de las sustituciones diagnósticas en relación al camino más parsimonioso con respecto al
haplotipo ancestral es diferencial entre las transiciones de purinas en comparación con las
de pirimidinas: T→C (2) y C→T (2); A→G (3) y G→A (0). Dos de estas transiciones (SPs
189 y 320) se han fijado en al menos uno de los otros linajes.
En el linaje mediterráneos americano – Viejo Mundo del total de sustituciones (39),
aproximadamente el 82% de las mutaciones se corresponde con transiciones repartidas,
con mayor frecuencia entre los 150 y 500 pb (Fig. 8b) excepto entre los 300 y 350 pb. La
mayor parte de las transiciones han ocurrido entre purinas respecto a pirimidinas, con
similar balance entre los sentidos de las sustituciones en relación al camino más
parsimonioso respecto al ancestro CC-A2: T→C (6) y C→T (6); A→G (9) y G→A (11). Las
restantes sustituciones corresponden a cuatro transversiones y dos indeles en los SPs 435
y 471-3, y 431 y 473 respectivamente. A su vez, el 44% aproximado de estas sustituciones
representan cambios diagnósticos para los haplotipos (ver Fig. 7). Las transversiones
antes mencionadas lo son de CC-A40 y 18, el indel en el SP 473 lo es de CC-A5, mientras
que las transiciones (11) en los SPs 142, 172, 173, 268, 271, 272, 320, 365, 369, 393, 423
y 428, lo son de CC-A20, 30, 63, 44, 8, 26, 31, 48, 19, 50, 28, y 29 respectivamente. De
éstas, las sustituciones entre purinas y pirimidinas están en proporción 5:7. El sentido de
las sustituciones diagnósticas en relación al camino más parsimonioso con respecto al
haplotipo ancestral es diferencial entre las transiciones de purinas y pirimidinas: T→C (5) y
C→T (2); A→G (1) y G→A (4). Cuatro de estas transiciones (SPs 142, 173, 271 y 369) se
fijaron en al menos uno de los otros linajes.
Entre los haplotipos correspondientes a las colonias de anidación del Mediterráneo
americano y la costa este de USA se determina un máximo de 26 SPs. Tabla. 2. Estos
SPs se clasifican en 22 transiciones, una interna dentro del indel 465 en la posición 468 y
otros cuatro indeles. Los indeles de las posiciones 163, 404 y 465 constituyen SPs
diagnósticos entre los linajes representados, al igual que las transiciones de las posiciones
145, 147, 163, 214, 340, 356, 424 – 27, y 437. Los SPs 320 y 369 pudieran ser
diagnósticos entre linajes, pero constituyen transiciones diagnósticas de los haplotipos
CC-A19 y 31 pertenecientes al linaje II. En la muestra del suroeste cubano persisten la
generalidad de los sitios polimórficos, menos los SPs 206, 298, 422 y el diagnóstico 473.
RESULTADOS____________________________________________________________________________________________
48
Tabla 2. Polimorfismo en la mitad 5’ de la región de control del mtDNA (ca. 380 pb) de C. caretta,
determinado en colonias de anidación del Mediterráneo americano. La numeración de los sitios polimórficos se
realiza tomando como referencia la base 1 de la región de control del mtDNA (Laurent et al., 1998). ±, indel de GCAAGT, con una
transición interna en el SP 358.
Haplotipos: CC-A1 – 10 (Encalada et al., 1998); CC-A11 – 14 (Bolten et al., 1998); CC-A20 (Bowen, inscrito en el Archie Carr
Center).
37
51
53
63
78
96
104
161
162
188
210
230
244
246
259
294
312
314
315
317
327
355
363
35
358
32
Haplotipo
Sitios polimórficos
CC-A1
T
G
T
T
T
A
G
A
A
C
G
G
C
C
G
C
A
-
A
A
T
A
C
-
CC-A2
C
A
C
C
-
G
G
A
G
T
A
G
T
T
A
T
G
G
A
G
C
G
T
+
A
A
CC-A3
C
A
C
C
-
G
G
A
G
T
A
A
T
T
A
T
G
G
A
G
C
G
T
+
A
A
CC-A5
C
A
C
C
-
G
G
A
G
T
A
G
T
T
A
T
G
G
A
G
C
G
T
+
A
-
CC-A7
C
A
C
C
-
G
G
A
G
T
A
G
T
T
A
T
G
G
G
G
C
G
T
+
A
A
CC-A8
C
A
C
C
-
G
G
A
G
C
A
G
T
T
A
T
G
G
A
G
C
G
T
+
A
A
CC-A9
C
A
C
T
-
G
G
G
G
T
A
G
T
T
A
T
G
G
A
G
C
G
T
+
A
A
CC-A10
C
A
C
C
-
G
G
A
G
T
A
G
T
T
A
T
G
G
A
G
C
G
T
+
G
A
CCA11
T
G
T
T
T
A
G
A
A
C
A
G
C
C
G
C
A
-
A
A
T
A
C
-
CCA12
C
A
C
C
-
A
G
A
G
T
A
G
T
T
A
T
G
G
A
G
C
G
T
+
G
A
CC-A13
C
A
C
C
-
G
A
A
G
T
A
G
T
T
A
T
G
G
A
G
C
G
T
+
A
A
CC-A14
T
G
T
T
T
A
A
A
A
C
A
G
C
C
A
C
A
-
A
A
T
A
C
-
CC-A20
T
A
C
C
-
G
G
A
G
T
A
G
T
T
A
T
G
G
A
G
C
G
T
+
A
A
A
A
A
IV.2 Estructura poblacional.
IV.2.1 Chelonia mydas.
Las colonias de Tabla 3. Comparación por pares de colonias de anidación de C. mydas del
anidación
suroeste
no
del
cubano
están
estructuradas
significativamente
Mediterráneo americano, a partir de haplotipos de la RNC del mtDNA (ca. 490 pb).
Las localidades están organizadas latitudinalmente en los titulos de la tabla. Arriba de la diagonal:
comparación de las frecuencias haplotípicas empleando la Prueba X2 corregido por el procedimiento de
Bonferroni a través del método Monte Carlo (1000 simulaciones). El primer número se corresponde con el
valor del estadígrafo, los grados de libertad (entre paréntesis) seguido de la probabilidad (/ valor). Debajo
de la diagonal: número absoluto de migrantes intercambiados en la parte superior, prueba de
diferenciación por pares de colonias de anidación (FST) basada en permutaciones no paramétricas,
seguida de la probabilidad (/ valor). Los datos incongruentes entre ambas pruebas estadísticas por pares
de colonias de anidación se representan en negrita, y en itálica, aquellos cuya probabilidad fue
significativa. Los datos de las colonias con superíndices 1, 2 y 3 son según Allard et al. (1994), Encalada
et al. (1996) y Lahanas et al. (1998), respectivamente.
(Tabla
3).
Localidades
Tampoco
se
Tortuguero1, 3
(Costa Rica)
Quintana Roo1
(México)
encuentra
estructura
significativa entre
colonias
19.96(7) /
<0.001
0.44
0.53/ <0.001
Guanahacabibes
0.86
(Cuba)
0.37/ <0.001
genética
las
Tortuguero2, 3 Quintana Roo2 Guanahacabibes
(Costa Rica)
(México)
(Cuba)
de
anidación de la
San Felipe
(Cuba)
Cuba
suroeste
Florida1
(USA)
25.82(7) /
<0.001
12.03(2) /
0.007
21.60(7) /
<0.001
25.37(3) /
<0.001
16.16(11) /
0.04
17.55(7) /
0.002
23.69(11) /
0.002
12.51(7) /
0.03
6.20(6)/
0.43
13.16
0.04/ 0.12
San Felipe
(Cuba)
1.03
0.33/ 0.005
1.86
0.21/ 0.001
Cuba suroeste
3.48
0.12/ 0.02
4.03
0.11/ 0.006
Florida 2
(USA)
0.56
0.47/ <0.001
12.54
0.04/ 0.14
11.51(7) /
0.04
16.23
0.03/ 0.22
12.73(3) /
0.004
14.92(7) /
0.004
14.36
0.03/ 0.18
1.95
0.20/ 0.01
5.06
0.09/ 0.03
península de Guanahacabibes y las peninsulares del continente (Florida y Quintana Roo),
RESULTADOS____________________________________________________________________________________________
49
ya que aunque la probabilidad del X2 es significativa en ambas interacciones, la cota
superior del intervalo de confianza es igual al valor crítico de no significación (0.03 – 0.05).
Del análisis se infiere un flujo de migrantes en el orden de las docenas de individuos por
generación. Sin embargo, la colonia de anidación de San Felipe está estructurada
significativamente con las colonias de anidación peninsulares del continente, por lo que el
flujo de migrantes entre estas colonias es pequeño. Cuando se juntan las colonias de
anidación en un sola entidad, se mantiene la estructura genética significativa con las
restantes colonias de anidación del Mediterráneo americano. Similar comportamiento
también ocurre con la colonia de anidación de Tortuguero.
0,6
(FST)
0,5
por
pares
de
colonias
de
anidación está correlacionado con la
distancia geográfica (r=0.93, p=0.02),
con
baja
dispersión
de
las
interacciones (Fig. 9), y no con la
distancia neta promedio basada en el
número de sustituciones nucleotídicas
(r=0.83, p=0.07). Las distancias neta
promedio basada en el número de
sustituciones
geográfica
nucleotídicas
tampoco
correlacionadas (r=0.74, p=0.08).
y
están
Índice de diferenciación poblacional ( F ST )
El grado de diferenciación genética
0,4
0,3
0,2
y=
3x
E28
0.
.07
-0
0,1
0,0
-0,1
0
200
400
600
800
1000 1200 1400 1600 1800 2000 2200 2400
Distancia geográfica en km
95% confianza
Fig. 9. Regresión lineal entre la diferenciación genética
(FST estimado a partir de haplotipos de la RNC del mtDNA,
ca. 493 pb) versus la distancia geográfica por pares de
colonias de anidación de C. mydas localizadas en el
Mediterráneo americano.
Líneas: continua, curva de regresión lineal; discontinua, límite de
confianza.
La estructuración genética significativa encontrada entre las colonias de anidación
integradas bajo la unidad poblacional suroeste cubano y las restantes del Mediterráneo
americano, así como entre las colonias de esta región,
se confirma por un valor
significativo de FST en todas las estructuras hipotéticas jerarquizadas (Tabla 4), con un
porcentaje de variación casi cuatro veces mayor dentro que entre colonias de anidación. A
esta variación contribuye significativamente el 35% de los SPs en las tres estructuras
hipotéticas, que no son loci diagnósticos (93: FST=0.36, p<0.001; 96: FST=0.18, p=0.003;
149: FST=0.08, p=0.02; 250: FST=0.12, p=0.009 y 371: FST=0.06, p=0.03) entre haplotipos y
RESULTADOS____________________________________________________________________________________________
el
diagnóstico
locus
50
470 Tabla 4. Resultados del análisis jerárquico de varianza molecular
bajo tres niveles hipotéticos de estructura geográfica en colonias
(FST=0.18, p=0.001) del haplotipo de anidación de C. mydas del Mediterráneo americano. El análisis
endémico
CM-A48
colonias
de
de
las
anidación
del
suroeste cubano.
se basó en haplotipos de la RNC del mtDNA (ca. 490 pb).
Áreas de anidación/ colonias de anidación: QRMEX- Quintana Roo (México);
sureste de la Florida (USA)/ HIFL- Hutchinson Island; SWCUB- suroeste de Cuba/
GU- Guanahacabibes, SF- San Felipe; TORCR- Tortuguero (Costa Rica). Los
datos de HIFL corresponden a Allard et al. (1994), QRMEX a Encalada et al. (1996)
y TORCR a Allard et al. (1994) y Lahanas et al. (1998). p, probabilidad.
Fuente de variación
Al agruparse jerárquicamente las
muestras de las colonias de
anidación del suroeste cubano
(estructura
obtiene
el
hipotética
mismo
significación
y
II),
nivel
p
F estadísticos
Varianza
% total
I. Estructura hipotética: colonias de anidación del SWCUB (GU y SF) y las
de la región (HIFL, QRMEX y TORCR) constituyen una población panmicta
Entre poblaciones
0.07
25.55
Dentro de las poblaciones
0.22
74.45
semejante
<0.001
Entre regiones
0.06
20.20
0.20
0.30
Entre poblaciones/ regiones
0.02
5.93
0.07
0.22
Dentro de poblaciones
0.22
73.87
0.26
<0.001
III. Estructura hipotética: colonias de anidación del SWCUB y HIFL
constituyen una unidad demográfica respecto a QRMEX y TORCR
porcentaje de variación dentro
de las colonias (ver Tabla 4),
0.26
II. Estructura hipotética: colonias de anidación del SWCUB constituyen una
unidad demográfica respecto a HIFL, QRMEX y TORCR
se
de
Partición observada
Entre regiones
0.05
16.74
0.17
0.20
Entre poblaciones/ regiones
0.03
11.02
0.13
0.04
Dentro de poblaciones
0.22
72.24
0.28
<0.001
pero sin la contribución del locus
371 (FST=0.07, p=0.06). En esta hipótesis el FSC y el FCT no son significativos. Sin
embargo, cuando las colonias de anidación del suroeste cubano se agrupan con la colonia
de anidación de la península de la Florida (estructura hipotética III) el FSC es significativo,
como consecuencia de la contribución significativa del SP no diagnóstico 93 (FSC=0.02,
p<0.001). Consecuentemente con este resultado, la estructura hipotética II es aceptada.
IV.2.2 Caretta caretta.
Tabla 5. Comparación por pares de colonias de anidación de C. caretta
Las colonias de anidación en el suroeste de Cuba, a partir de haplotipos de la RNC del mtDNA (ca.
del suroeste de Cuba no
están
estructuradas
significativamente entre sí
( Φ ST(gl=35)=-0.006, p=0.41).
Tabla
5.
Tampoco
encuentra
se
estructura
genética entre las colonias
de
anidación
pertenecientes
a
una
380 pb). Las colonias de anidación están organizadas longitudinalmente en los titulos de
la tabla. Arriba de la diagonal: comparación de las frecuencias haplotípicas empleando la
2
Prueba X corregido por el procedimiento de Bonferroni, a través del método Monte Carlo
(1000 simulaciones). El primer número se corresponde con el valor del estadígrafo, entre
paréntesis los grados de libertad, seguido de la probabilidad (/ valor). Debajo de la
diagonal: número absoluto de migrantes intercambiados en la parte superior, prueba de
diferenciación por pares de colonias de anidación (ФST) basada en permutaciones no
paramétricas, seguida de la probabilidad (/ valor).
Colonias de
anidación
Cayo Largo
0.38(1)/
0.65
Cayo Largo
Isla de la Juventud
San Felipe
Guanahacabibes
Isla de la
Juventud
Inf
-0.08/ 0.65
12.61
0.11/ 0.38
3.99
0.11/ 0.23
7.03
0.07/ 0.11
7.03
0.08/ 0.11
San Felipe
Guanahacabibes
6.34(4)/
0.14
7.88(4)/
0.05
6.19(2),/
0.06
6.12(2)/
0.05
7.04(4)/
0.05
10.25
0.05/ 0.24
RESULTADOS____________________________________________________________________________________________
51
misma población de anidación del Mediterráneo americano, excepto entre Eglin Air Force
Base versus Cape San Blas pertenecientes al noroeste de la Florida según la prueba X2.
Tabla 6.
Tabla 6. Comparación por pares de colonias de anidación de C. caretta en Mediterráneo americano, a partir de
haplotipos de la RNC del mtDNA (ca. 380 pb). Las localidades están organizadas latitudinalmente en los titulos de la tabla. Arriba de la
diagonal: comparación de las frecuencias haplotípicas empleando la Prueba X2 corregido por el procedimiento de Bonferroni, a través del método
Monte Carlo (1000 simulaciones). El primer número se corresponde con el valor del estadígrafo, entre paréntesis los grados de libertad, seguido
de la probabilidad (/ valor). Debajo de la diagonal: número absoluto de migrantes intercambiados en la parte superior, prueba de diferenciación por
pares de colonias de anidación (ФST) basada en permutaciones no paramétricas, seguida de la probabilidad (/ valor). Los datos incongruentes
entre ambas pruebas estadísticas por pares de colonias de anidación se representan en negrita, y en itálica, aquellos cuya probabilidad fue
significativa. Colonias de anidación: QRMEX- Quintana Roo (México); SWCUB- suroeste de Cuba; USA: CSB- Cape San Blas, DT- Dry Tortugas,
EA- Eglin Air Force Base, GE- Georgia, HI- Hutchinson Island, KI- Key Island, MB- Melbourne Beach, NJt- norte de Jetty, PE- Port Everglades,
SC- Sarasota County, SJ- St Joseph's, SJt- sur de Jetty, y TB- Tyndall Beach. La generalidad de los datos de las colonias de anidación
corresponden a Encalada et al. (1998) – Francisco y Bowen (2001), excepto en NJT y SJT (Francisco et al., 1999).
Sureste de Florida
Colonias QRMEX SWCUB
17.34 (7)/
0.002
QRMEX
2.76
SWCUB 0.15/ 0.01
GE
HI
MB
SJT
NJT
KI
SC
CSB
SJ
TB
EA
19.72(5)/
0
12.53(6)/
0.01
12.94(5)/
0.01
34.38(9)/
0
18.45(5)/
0
27.13(6)/
0
12.07(5)/
0.01
24.86(7)/
0
14.73(5)/
0.005
23.61(5)/
0
18.76(6)/
0.001
37.33(6)/
0
58.77(5)/
<0.001
15.30(6)/
0.006
8.97(6)/
0.21
8.42(5)/
0.20
27.24(8)/
0
19.35(5)/
0
32.20(7)/
0
10.44(6)/
0.07
27.13(7)/
0
10.86(5)/
0.11
24.15(5)/
0
23.38(7)/
0
41.74(6)/
0
63.84(5)/
0
11.62(4)/
0.07
10.71(3)/
0.04
38.59(7)/
0
26.42(3)/
0
43.15(5)/
0
12.67(4)/
0.02
41.76(6)/
0
14.7(3)/
0.02
33.98(3)/
0
33.98(5)/
0
57.1(4)/
0
82.05(3)/
0
1.18(2)/
1.00
7.51(6)/
0.39
4.87(3)/
0.15
8.82(5)/
0.10
2.19(3)/
0.78
7.91(5)/
0.13
1.67(2)/
0.78
5.97(2)/
0.04
6.38(4)/
0.15
15.22(3)/
0
29.11(2)/
0
1.57(5)/
0.73
2.04(2)/
0.51
3.31(4)/
0.63
0.80(2)/
1
3.51(4)/
0.50
1.25(1)/
1
3.04(1)/
0.14
4.49(3)/
0.22
10.29(2)/
0.003
20.66(1)/
0.001
491(6)/
0.62
8.21(48)/
0.31
6.79(6)/
0.46
7.61(6)/
0.25
0.67(5)/
1.00
3.02(5)/
0.70
10.32(6)/
0.16
10.12(5)/
0.03
22.46(5)/
0
1.28(4)/
1.0
5.04(3)/
0.14
5.24(5)/
0.44
0.82(2)/
0.75
1.33(2)/
0.80
4.94(4)/
0.40
6.22(3)/
0.05
12.68(2)/
0.001
6.63(4)/
0.12
7.24(6)/
0.22
1.27(4)/
0.81
1.45(4)/
0.87
7.39(5)/
0.26
7.77(5)/
0.08
14.28(4)/
0
5.12(4)/
0.25
1.39(2)/
0.75
6.13(2)/
0.02
5.30(3)/
0.15
16.01(3)/
0
30.00(2)/
0
1.91(4)/
0.87
3.76(4)/
0.50
1.12(4)/
0.95
9.20(4)/
0.02
22.36(4)/
0
1.30(1)/
0.33
3.00(3)/
0.55
6.37(2)/
0.04
13.44(1)/
0.007
3.54(3)/
0.49
1.97(2)/
0.68
4.20(1)/
0.10
5.04(3)/
0.14
15.51(3)/
0.007
21.93
0.02/ 0.05
4.39
0.10/ 0.007
PE
1.22
0.29/ 0.02
Inf.
-0.04/ 0.51
HI
0.55
0.48/ 0.001
11.51
0.75
Inf
0.04/ 0.20 0.40/ 0.007 -0.07/ 0.63
2.21
0.18/ 0.04
4.80
0.09/ 0.13
Inf
-0.03/ 0.45
MB
0.58
0.47/ 0
2.00
0.20/ 0
0.58
0.46/ 0
SJT
0.29
0.63/ 0
1.39
0.26/ 0.004
0.32
0.61/0
3.15
0.14/ 0.07
Inf
Inf
-0.01/0.31 -0.04/ 0.59
NJT
0.39
0.56/ 0
1.27
0.28/ 0
0.39
0.56/ 0
2.40
0.17/ 0.05
21.09
0.02/ 0.23
1.22
Inf.
0.29/ 0.009 -0.01/ 0.33
0.60
0.45/ 0
SC
CSB
1.72
0.23/ 0.01
0.61
0.45/ 0
Inf
Inf
-0.09/ 0.89 -0.07/ 0.69
9.28
0.05/ 0.22
0.28
2.55
0.38
21.80
0.64/ 0.005 0.38/ 0.08 0.57/ 0.002 0.02/ 0.33
0.11
0.16/ 0
SJ
2.62
0.16/ 0.007
0.58
0.46/ 0
3.27
0.77/ 0
0.86
0.37/ 0.03
0.29
2.54
0.39
22.29
0.63/ 0.002 0.17/ 0.09 0.56/ 0.001 0.02/ 0.23
TB
Noroeste de Florida
PE
DT
KI
Suroeste de Florida
DT
EA
0.07
0.87/ 0
0.35
0.58/ <0.001
0.12
0.82/ 0
GE
0.02
0.95/ 0
0.18
0.73/ 0
0.06
0.89/ <0.001
Inf
Inf
-0.01/ 0.53 -0.05/ 1.00
5.93
0.08/ 0.10
2.86
3.85
0.11/ 0.09 0.15/ 0.05
Inf
Inf
Inf
Inf
12.62
-0.05/ 0.62 -0.02/ 0.64 -0.03/ 0.53 -0.006/ 0.31 0.04/ 0.22
Inf
-0.11/ 1.0
Inf
-0.09/ 1.00
Inf
Inf
70.13
-0.11/1.00 -0.08/ 0.81 0.007/ 0.36
Inf
-0.09/ 0.93
2.22
0.18/ 0.15
8.29
0.06/ 0.13
Inf
Inf
-0.10/ 0.69 -0.07/ 0.43
0.48
0.33/ 0.02
0.09
0.08/ 0.09
17.55
0.03/ 0.33
Inf
Inf
Inf
Inf
78.03
-0.11/ 0.41 -0.09/ 0.72 -0.10/ 0.70 -0.07/ 0.44 0.006/ 0.30
Inf
-0.10/1.00
Inf
-0.16/ 1.00
16.53
0.03/ 0.18
0.40
0.77
2.28
3.10
0.56/ 0.001 0.39/ 0.01 0.18/ 0.009 0.14/ 0.09
0.14
0.79/ 0
0.23
0.68/ 0
0.95
0.34/ 0
3.86
0.11/ 0.05
0.50
0.50/ 0
1.73
0.22/0.006
1.62
0.24/ 0.10
Inf
-0.04/ 0.57
1.63
0.23/ 0.06
0.74
1.23
0.40/ 0.002 0.29/ 0.001
0.19
0.72/ 0
0.68
0.42/ 0
0.36
0.58/ 0.007
2.59
0.16/ 0.12
0.37
0.58/ 0.004
2.39(2)/
0.41
22.14
0.02/ 0.16
El suroeste de Cuba sólo no está estructurado significativamente con las colonias de
anidación Port Everglades y Hutchinson Island (sureste de la Florida). Tampoco están
estructurados significativamente Key Island del suroeste de la Florida, ni Cape San Blas
del noroeste de la Florida. También existe una incongruencia entre la significación de
ambas pruebas para el suroeste de Cuba y Tyndall Beach, obteniéndose estructura
genética significativa con el X2. Otras incongruencias ocurren entre Dry Tortugas versus
Quintana Roo y Port Everglades. En la primera interacción el X2 es significativo a
diferencia de la segunda, donde la significación es aportada por el FST. No obstante, Dry
Tortugas y Quintana Roo están estructuradas con la generalidad de las colonias de
anidación (85.71 y 92.86 %, respectivamente). Entre las colonias de las áreas de
RESULTADOS____________________________________________________________________________________________
52
anidación que integran el sur de la Florida no hay estructura genética significativa.
Tampoco se encuentra significación entre las colonias de anidación del noroeste de la
Florida versus la generalidad (71.88%) de las colonias de anidación de las otras áreas de
la península. Las frecuencias relativas de los haplotipos presentes en las colonias de
anidación de USA, a partir de datos originales de Francisco & Bowen (2001), Francisco et
al. (1999) y Encalada et al. (1998), constituyen una variación clinal latitudinal de los
haplotipos más distribuidos y representados de los linajes presentes en ambas costas de
la península de la Florida (ver Fig. 4), i.e. el haplotipo CC-A1 del linaje Atlántico –
península de la Florida aumenta con el incremento de la latitud mientras que el CC-A2 del
linaje mediterráneos americano – Viejo Mundo disminuye. Esta variación tiene un punto de
inflexión en la colonia de anidación más sureña Dry Tortugas, donde el haplotipo CC-A2
alcanza la frecuencia mayoritaria y en las colonias de anidación de Carolina del Sur y del
Norte donde el haplotipo CC-A1 tiene frecuencia unitaria.
En cada costa de la península de la Florida está correlacionado el grado de diferenciación
genética ( Φ ST) con la distancia geográfica (costa del Golfo México: r=0.70, p<0.001; costa
atlántica: r=0.73, p<0.001) y con la distancia neta promedio basada en el número de
sustituciones nucleotídicas (costa del Golfo México: r=0.91, p<0.001; costa atlántica:
r=0.92, p<0.001), a pesar de cierta dispersión de las interacciones (Fig. 10). La distancia
geográfica también está correlacionada con la distancia neta promedio basada en el
número de sustituciones nucleotídicas en ambas costas (costa del Golfo México: r=0.71,
p<0.001; costa atlántica: r=0.79, p<0.001) (ver Fig. 10). Solamente se mantiene
dependencia entre el Φ ST y la distancia neta promedio basada en el número de
sustituciones nucleotídicas cuando se incluyen todas las colonias de anidación de USA
(r=0.90, p<0.001), a pesar de cierta dispersión de las interacciones (Fig. 11). [ Φ ST versus
distancia geográfica (r=0.18, p=0.05); distancia geográfica versus neta promedio basada
en el número de sustituciones nucleotídicas (r=0.13, p=0.10)]. Sin embargo, cuando se
aplican las pruebas de correlación analizando todas las colonias de anidación del
Mediterráneo americano vuelve a obtenerse significación para el Φ ST versus distancia
geográfica y dA, y para estas últimas (r=0.31, p=0.001; r=0.91, p<0.001; r=0.31, p<0.001;
respectivamente), aunque con coeficientes de correlación menos altos en dos de las
interacciones como consecuencia de una mayor dispersión de las interacciones.
RESULTADOS____________________________________________________________________________________________
costa oeste
1,0
costa este
1,0
0,8
53
0,8
y=
0,6
8E
0.5
-3
.04
-0
0,6
0,2
7
0.0
Fst
x.7 1
y=0
0,4
0,2
0,0
0,0
-0,2
-0,4
-100
0
100
200
300
400
500
600
700
dgeog
800
900
1000
-0,2
0
200
Distancia geográfica en km
1,2
400
600
800
1000
1200
1400
1600
dgeog
1,0
1,0
x
.8
19
y=
0,8
+
08
0.
0,8
x
.92
24
y=
0,6
.04
+0
0,6
0,4
Fst
Fst
Índice de diferenciación poblacional (ФSTFst)
0,4
0,4
0,2
0,2
0,0
0,0
-0,2
-0,4
-0,005
0,000
0,005
0,010
0,015
0,020
0,025
0,030
0,035
0,040
0,045
-0,2
-0,01
0,00
0,01
0,02
0,03
0,04
0,05
0,06
dneta promedio basada en el número de sustituciones nucleotídicas
dneta
Distancia neta
(dA)
0,06
0,045
0,05
0,035
0,04
0,030
y=
0,025
x
-4
9E
0.2
-0
.01
0,03
dneta
dneta
Distancia neta promedio (dA)
0,040
0,020
0,02
0,015
0,010
y=
0,005
-4x
6E
0.2
04
0.0
0,01
0,00
0,000
-0,005
-100
0
100
200
300
400
500
dgeog
600
700
800
900
1000
-0,01
-200
0
200
Distancia geográfica en km
400
600
800
dgeog
1000
1200
1400
1600
1800
95% confianza
Fig. 10. Regresión lineal entre la diferenciación genética ( Φ ST estimado a partir de haplotipos de la RNC del mtDNA,
ca. 380 pb) versus las distancias geográfica y neta promedio basada en el número de sustituciones nucleotídicas, y
entre ambas distancia, por pares de colonias de anidación de C. caretta localizadas en la península de la Florida.
Líneas: continua, curva de regresión lineal; discontinua, límite de confianza.
RESULTADOS____________________________________________________________________________________________
54
Mediterráneo americano
1,2
0,06
1,0
Distancia neta promedio (dA)
0,05
0,8
0,04
-3x + 0
.14
0,03
dneta
E
y=0.14
0,4
y=0.6
0,02
0,2
4
+ 0.00
7E-5x
0,01
0,0
0,00
-0,2
-0,4
0
300
600
900
1200
1500
1800
dgeog
2100
2400
2700
-0,01
0
300
Distancia geográfica en km
600
900
1200
1500
1800
2100
2400
1,2
.4
19
y=
1,0
+
6x
8
0.0
2700
dgeog
1,2
1,4
USA
1,0
2
y=
6x
1.9
+
0.0
6
0,8
0,8
0,6
0,6
Fst
Fst
Índice de diferenciación poblacional (ФST)Fst
0,6
0,4
0,4
0,2
0,2
0,0
0,0
-0,2
-0,2
-0,4
-0,01
0,00
0,01
0,02
0,03
dneta
0,04
0,05
0,06
-0,4
-0,01
0,00
0,01
0,02
0,03
0,04
0,05
0,06
95% confianza
Distancia neta promedio basada en el número de sustituciones nucleotídicas (dA)
Fig. 11. Regresión lineal entre la diferenciación genética ( Φ ST estimado a partir de haplotipos de la RNC del mtDNA,
ca. 380 pb) versus las distancias geográfica y neta promedio basada en el número de sustituciones nucleotídicas por
pares de colonias de anidación de C. caretta localizadas en el Mediterráneo americano. Líneas: continua, curva de regresión
dneta
lineal; discontinua, límite de confianza.
La estructura genética encontrada se confirma por un valor significativo de Φ ST en todas
las hipótesis de estructuración jerárquicas (Tabla 7), con un porcentaje de variación casi
dos veces mayor dentro que entre colonias de anidación. A esta variación contribuyen
significativamente el 84% de los SPs integrados por los loci no diagnósticos (32:
Φ ST=0.38; 35: Φ ST=0.38; 37: Φ ST=0.38; 51: Φ ST=0.35; 53: Φ ST=0.38; 63: Φ ST=0.37; 78:
Φ ST=0.17; 104: Φ ST=0.38; 161: Φ ST=0.36; 162: Φ ST=0.42; 210: Φ ST=0.38; 230:
Φ ST=0.38; 244: Φ ST=0.42; 246: Φ ST=0.38; 259: Φ ST=0.38; 294: Φ ST=0.38; 314:
Φ ST=0.38; 315: Φ ST=0.38; 317: Φ ST=0.38; 327: =0.38; 355: Φ ST=0.33; todos con
p<0.001) entre haplotipos. De éstos, la mayoría de los loci son diagnóstico entre linajes
excepto los SPs 78, 162 y 244, y los loci 32, 63 y 161 que son “diagnósticos” solamente
RESULTADOS____________________________________________________________________________________________
dentro
55
linaje Tabla 7. Resultados del análisis jerárquico de varianza molecular bajo
del
tres niveles hipotéticos de estructura geográfica en colonias de
mediterráneos americano – anidación de C. caretta del Mediterráneo americano. El análisis se basó
Viejo
Mundo
de
los
haplotipos CC-A20, 12 y 8
respectivamente. A su vez,
los dos primeros haplotipos
son
endémicos
colonias
de
de
las
anidación
Melbourne Beach ( USA) y
San
Felipe
(suroeste
cubano).
Al agruparse las muestras
de las colonias de anidación
del suroeste cubano en una
población respecto a las
preestablecidas,
i.e.
en haplotipos de la RNC del mtDNA (ca. 380 pb). Áreas/ colonias de
anidación: QRMEX- Quintana Roo (México); SWCUB- suroeste de Cuba/ CL- Cayo Largo
del Sur, GU- Guanahacabibes, IJ- Isla de la Juventud, y SF- San Felipe; USA: DT- Dry
Tortugas; NEFL-NC- noreste de la Florida - Carolina del Norte/ GE- Georgia; NWFLnoroeste de la Forida/ CSB- Cape San Blas, EA- Eglin Air Force Base, SJ- St Joseph's y
TB- Tyndall Beach; SEFL- sureste de la Florida/ HI- Hutchinson Island, MB- Melbourne
Beach, PE- Port Everglades, NJt- norte de Jetty, y SJt- sur de Jetty; SWFL- suroeste de
la Florida/ KI- Key Island y SC- Sarasota County. Los datos de QRMEX se correspoden
a Encalada et al. (1998), y los demás de USA a estos autores y a Francisco & Bowen
(2001), y Francisco et al. (1999). p, probabilidad.
Partición observada
p
Φ estadísticos
Varianza
% total
I. Estructura hipotética: colonias de anidación del SWCUB (CL, GU, IJ y SF) y las
de la región (CSB, DT, EA, GE, HI, KI, MB, NJt, PE, QRMEX, SC, SJ, SJt y TB)
constituyen una población panmicta
Entre poblaciones
1.95
37.14
0.37
<0.001
Dentro de las poblaciones
3.31
62.86
II. Estructura hipotética: colonias de anidación del SWCUB constituyen una
unidad demográfica respecto a SFL (HI, MB, PE, NJt, SJt, KI y SC), NEFL-NC
(GE), NWFL (CSB, EA, SJ, y TB), DT y QRMEX
Entre regiones
2.38
39.38
0.39
<0.001
Entre poblaciones/ regiones
0.18
3.01
0.05
0.001
Dentro de poblaciones
3.46
57.61
0.42
<0.001
III. Estructura hipotética: colonias de anidación del SWCUB constituyen una
unidad demográfica respecto a SEFL (HI, MB, PE, NJt y SJt), SWFL (KI y SC),
NEFL-NC (GE), NWFL (CSB, EA, SJ, y TB), DT y QRMEX
Entre regiones
2.02
36.91
0.37
0.002
Entre poblaciones/ regiones
0.18
3.22
0.05
0.54
Dentro de poblaciones
3.28
59.87
0.40
<0.001
Fuente de variación
sur,
noroeste y noreste de la Florida; Dry Tortugas; y Quintana Roo; se obtienen porcentajes
de variación semejantes dentro de las colonias de anidación, entre colonias de anidación
por regiones y entre regiones (ver Tabla 7), a los cuales contribuyen los mismos loci
anteriormente citados exceptuando el locus 78 para Φ SC y Φ CT. El locus 96 se vuelve
significativo ( Φ CT=0.06, p=0.001) para el caso del índice de diferenciación entre regiones.
A pesar de que la probabilidad del índice de diferenciación entre grupos rechaza la
hipótesis nula, el índice de diferenciación entre poblaciones dentro de los grupos también
rechaza la hipótesis nula. Por consiguiente, el escenario hipotético II se desecha. Sin
embargo, cuando se segregan las colonias de anidación del oeste y este del sur de la
Florida (escenario hipotético III), el índice de diferenciación entre poblaciones dentro de
grupos acepta la hipótesis nula manteniéndose significativo sólo el locus no diagnóstico
312. Adicionalmente, el locus 188 se vuelve significativo ( Φ CT=0.05, p=0.02) para el caso
del índice de diferenciación entre regiones. Por consiguiente, este escenario es escogido
como la estructura poblacional más probable.
RESULTADOS____________________________________________________________________________________________
56
IV.3 Diversidad genética.
IV.3.1 Chelonia mydas.
La población de anidación del suroeste cubano se caracteriza por un alto porcentaje de
endemismo haplotípico (71.43%) y un moderado porcentaje de individuos endémicos
(32.14%) en relación a las poblaciones de anidación de la especie. Dentro de la población
de anidación del suroeste de Cuba, la colonia de anidación de la península de
Guanahacabibes presenta una diversidad genética que aproximadamente duplica la de la
colonia de anidación de la Cayería San Felipe (Tabla 8), donde sólo se encontraron dos
haplotipos. Esta colonia tiene una diversidad genética similar a la población de anidación
de la Florida. A pesar de que la diversidad haplotípica de la colonia de anidación de
Guanahacabibes es tan alta como la de la población de anidación de Quintana Roo, para
un número igual de haplotipos, la diversidad nucleotídica es aproximadamente la mitad y
el número de sitios segregativos es casi un cuarto. Esta proporción se mantiene cuando
los datos de las colonias de anidación del suroeste cubano son integrados en una
población de anidación. Solamente disminuye la diversidad haplotípica.
Tabla 8. Medidas de diversidad genética e índices demográficos de colonias/ poblaciones de anidación de C.
mydas localizadas en el Mediterráneo americano. El análisis se basó en haplotipos de la RNC del mtDNA (ca.
490 pb). Los datos de las colonias con superíndices 1, 2 y 3 son según Allard et al. (1994), Encalada et al. (1996) y Lahanas et al. (1998)
respectivamente. El tamaño efectivo de las colonias/ poblaciones de anidación está calculado por estación reproductora. Los tamaños
censales de hembras por estación reproductora están tomados según compilación de Seminoff (2002), excepto para la colonia de anidación
de Guanahacabibes (Ibarra, 2005).
D, Prueba de Tajima; Fs, Prueba de Fu; H, número de haplotipos; Ĥ , diversidad haplotípica; IC, intervalo de confianza para un alpha igual a
0.05; N, tamaño muestral; Ne(f), tamaño efectivo estimado de la colonia de anidación; Nef, tamaño censal de hembras de la colonia de
anidación; N ( θˆ 0), tamaño censal antes de la expansión; p, probabilidad; S, suma de cuadrados; s, sitios segregativos; Sd, desviación
estándar; superíndice a, indica parámetro del modelo de expansión súbita estimado sin la contribución del haplotipo A5; t, tiempo donde
comenzó la expansión expresado en 1000 años (KA); θˆ , estimador de theta: subíndices S y 0 se corresponden con el número de sitios
segregativos y el tamaños inicial de la población durante la expansión respectivamente; πˆ , diversidad nucleotídica; τ , tiempo de la
expansión medido en 1/2u de generaciones; !, el procedimiento del mínimo cuadrado para ajustar el modelo de distribución desigual y la
distribución observada no convergió después de los 1800 pasos.
Distribución desigual
Ne(f)
Nef
(Modelo de expansión súbita)
Región de
D (p)/
N H
N
Ĥ ±Sd( Ĥ ) πˆ n±Sd( πˆ n) s
Fs (p)
Histórico
colecta
Ssd (p)
t(IC)
θˆ S/ θˆ π / actual
( θˆ 0)
τ
Guanahacabibes
(Cuba)
17
7
0.7647 ± 0.0943 0.0024 ± 0.0018
4
-0.02 (0.48)/
709/ 708
-3.34 (0.002)
/ 213
!
San Felipe (Cuba) 11
2
0.4364 ± 0.1333 0.0018 ± 0.0015
2
0.85 (0.81)/
409/ 525
2.01 (0.83)
?
2.9
0.16
(0.02)
-
-
28
7
0.6481 ± 0.0890 0.0022 ± 0.0017
4
0.07 (0.58)/
616/ 635
-2.67 (0.03)
?
1.5
0.03
(0.13)
131
(21-312)
62
Península Florida1
24
(USA)
3
0.5616 ± 0.0468 0.0012 ± 0.0011
2
0.28 (0.72)/
408/ 364 366/ 759 0.8
0.29 (0.51)
0.04
(0.002)
-
-
Cuba suroeste
2
a
a
Quintana Roo
(México)
20
7
0.8158 ± 0.0575 0.0051 ± 0.0032 14
-1.36 (0.08)/
-0.56 (0.38)
2,364/
1,500
82/ 298
!
1.8a
0.02
(0.22)
154
(40-335)
49a
Tortuguero1, 3
(Costa Rica)
41
2
0.0488 ± 0. 0459 0.0001 ± 0.0002
-1.12 (0.14)/
-1.47 (0.03)
140/ 29
25,000/
3.0
58,000
0
(0.16)
253
(37-254)
4
1
RESULTADOS____________________________________________________________________________________________
57
La variación observada en las secuencias parciales analizadas es selectivamente neutral
para cada población de anidación del Mediterráneo americano (ver Tabla 8). En todas las
poblaciones de anidación, la composición de A+T es aproximadamente el triple que la de
G+C. La media y la variación sobre la media de cada base nucleotídica son: A
(35.89±0.03), T (30.74±0.08), G (13.80±0.03) y C (19.56±0.07). Entre las poblaciones de
anidación los porcentajes de composición nucleotídica son similares.
Los tamaños efectivos de las poblaciones de anidación estimados según theta, ya sea por
el número de sitios segregativos o por la diversidad nucleotídica (π), son del mismo orden
de magnitud (ver Tabla 8). La población de anidación de Tortuguero es la excepción, i.e.,
el tamaño efectivo considerando theta a partir del número de sitios segregativos es
aproximadamente el cuádruplo. El tamaño efectivo estimado según theta a partir de la
diversidad nucleotídica ( θˆ π) para la colonia de anidación de la península de
Guanahacabibes es tres veces mayor que el tamaño censal actual de hembras. Para la
población de Quintana Roo la desproporción es cinco veces mayor. En las otras dos
poblaciones de anidación la desproporción es en sentido inverso: la población de
anidación de la Florida tiene un tamaño censal actual de hembras que duplica el tamaño
efectivo ( θˆ π), mientras que en la población de anidación de Tortuguero el tamaño censal
actual de hembras es dos mil veces mayor que el tamaño efectivo ( θˆ π). Sólo en la
población de la Florida, el tamaño efectivo ( θˆ π) equivale al tamaño censal histórico.
La prueba de distribución desigual del número observado de diferencias por pares de
secuencia se cumple en la población del suroeste cubano y en la de Tortuguero (Fig. 12).
En ambos casos la curva es unimodal con moda en cero diferencias. En la primera y
contrariamente a la segunda, la expansión fue dos veces más reciente y a partir de un
tamaño efectivo moderadamente pequeño, a pesar de que los intervalos de confianza del
tiempo de expansión se superponen en cierta medida entre las poblaciones de anidación
(ver Tabla 8). No obstante, este resultado no se corresponde con la prueba de Fu (ver
Tabla 8), sensible a la expansión demográfica, considerando que la significación de ésta a
nivel 5% se obtiene para valores de probabilidad menores de 0.02 (Schneider et al., 2000).
Cuando se analiza el procedimiento del mínimo cuadrado para ajustar la distribución
RESULTADOS____________________________________________________________________________________________
desigual esperada y la
anidación
Guanahacabibes
de
y
la
población de anidación
de Quintana Roo, no hay
convergencia. Cuando la
contribución
haplotipo
del
CM-A5
se
Frecuencia relativa (%)
de
90
90
70
70
50
50
30
30
0
prueba
de
distribución
desigual de frecuencias.
Sin embargo, la prueba
3
0
1
Frecuencia modelada
95% confianza
Quintana Roo1
50
10
no significación de la
2
70
modelo
súbita se cumple por la
1
90
30
expansión
10
10
elimina en esta última, el
de
Tortuguero2, 3
Cuba suroeste
observada en la colonia
58
0
1
2
3
4
5
Número de diferencias
Fig. 12. Distribución desigual del número de diferencias observado entre
pares de haplotipos de poblaciones de anidación de C. mydas del
Mediterráneo americano. El análisis se basó en haplotipos de la RNC del
mtDNA (ca. 490 pb). La N de las poblaciones con superíndices 1, 2 y 3 son según
Encalada et al. (1996), Allard et al. (1994) y Lahanas et al. (1998) respectivamente. La
distribución desigual representada en la población de anidación mexicana, excluye al
haplotipo CM-A5.
de Fu no muestra significación estadística (Fs=-0.80; p=0.29). En la colonia de anidación
de San Felipe no se cumple el modelo de expansión súbita, pues la desviación de la suma
de cuadrados es significativa al igual que en la población de anidación de la Florida.
IV.3.2 Caretta caretta.
La población de anidación del suroeste cubano se caracteriza por bajos porcentajes de
endemismo haplotípico (16.67%) y de individuos endémicos (2.78%) en relación a las
poblaciones de anidación de la especie. Dentro de la población de anidación del suroeste
de Cuba, la colonia de anidación de la Cayería San Felipe presenta una diversidad
genética que aproximadamente duplicó la de las restantes colonias de anidación del
Archipiélago de los Canarreos (Tabla 9), en correspondencia con un mayor número de
haplotipos. Contrariamente, la diversidad nucleotídica es más pequeña en un orden
fraccionario, en correspondencia con un pequeño número de sitios segregativos. La
diversidad genética de las colonias de anidación del suroeste cubano es alta cuando se
integran en una población de anidación al igual que en las demás poblaciones de la
región, salvo el noreste de la Florida hasta Carolina del Norte.
RESULTADOS____________________________________________________________________________________________
59
Tabla 9. Medidas de diversidad genética e índices demográficos de colonias/ poblaciones de anidación de C.
caretta localizadas en el Mediterráneo americano. El análisis se basó en haplotipos de la RNC del mtDNA (ca.
380 pb). Los datos de las unidades demográficas con superíndices 1, 2 y 3 son según Encalada et al. (1998), Francisco et al. (1999) y
Francisco & Bowen (2001) respectivamente. El tamaño efectivo de las colonias/ poblaciones de anidación está calculado por estación
reproductora. Los tamaños censales de hembras por estación reproductora están tomados según compilación de Ehrhart et al. (2003).
D, Prueba de Tajima; Fs, Prueba de Fu; H, número de haplotipos; Ĥ , diversidad haplotípica; IC, intervalo de confianza para un alpha igual a
0.05; N, tamaño muestral; Ne(f), tamaño efectivo estimado de la colonia de anidación; Nef, tamaño censal de hembras de la colonia de
anidación; N ( θˆ 0), tamaño censal antes de la expansión; p, probabilidad; S, suma de cuadrados; Sd, desviación estándar; s, sitios
segregativos; t, tiempo donde comenzó la expansión expresado en 1000 años (KA); θˆ , estimador de theta: subíndices S y 0 se corresponden
con el número de sitios segregativos y el tamaños inicial de la población durante la expansión respectivamente; πˆ , diversidad nucleotídica;
τ , tiempo de la expansión medido en 1/2u de generaciones; !, el procedimiento del mínimo cuadrado para ajustar el modelo de distribución
desigual y la distribución observada no convergió después de los 1800 pasos.
Distribución desigual
Ne(f)
Nef
(Modelo de expansión súbita)
Región de
D (p)/
N H
N
Ĥ ±Sd( Ĥ ) πˆ n±Sd( πˆ n) s
Fs (p)
Histórico
colecta
Ssd (p)
t(IC)
θˆ S/ θˆ π - actual
( θˆ 0)
τ
Cayo Largo del Sur
8
(Cuba)
2
0.5357 ± 0.1232 0.0286 ± 0.0166 19
2.02 (0.99)/
9.97 (0.99)
8,667/
12,711
?
6.0
0.37
(0.002)
-
-
10
2
0.4667 ± 0.1318 0.0263 ± 0.0149 20
1.50 (0.95)/
11.01 (0.99)
8,356/
11,689
?
3.1
0.29
(0.009)
-
-
Isla de la Juventud
12
(Cuba)
2
0.4091 ± 0.1333 0.0218 ± 0.0123 19
1.03 (0.88)/
11.04 (1)
7,467/
9,689
?
3.0
0.23
(0.009)
-
-
San Felipe (Cuba)
6
4
0.8000 ± 0.1721 0.0032 ± 0.0027
3
-0.44 (0.34)/
-1.45 (0.04)
1,556/
1,422
?
!
-
-
-
Cuba suroeste
36
6
0.5333 ± 0.0890
0.0205 ± 0.011
21
1.75 (0.95)/
7.98 (0.98)
6,000/
9,111
100
6.0
0.12
(0.12)
42
(7-36)
1,239
20
5
0.6526 ± 0.0927 0.0024 ± 0.0019
5
-1.14 (0.14)/
-1.43 (0.10)
1,689/
1,022
<33
!
-
-
-
58
4
0.2541 ± 0.0735 0.0079 ± 0.0046 21
-1.20 (0.09)/
5.35 (0.96)
5,378/
3,289
3.0
0.03
(0.07)
11
(1-15)
242
44
5
0.6480 ± 0.0429 0.0280 ± 0.0144 23
3.26 (0.99)/
15.02 (0.99)
6,267/
12,444
1,700
6.0
0.20
(0.02)
-
-
114 10
0.5595 ± 0.0302
24
3.50 (1)/
12.52(0.98)
5,377/
11,778
18,967
6.2
0.25
(0.005)
-
-
47
4
0.3959 ± 0.0818 0.0199 ± 0.0105 22
1.64 (0.96)/
13.52 (1)
5,911/
8,844
3.0
0.12
(0.06)
11
(2-17)
264
100
2
0.0200 ± 0.0195 0.0011 ± 0.0011 20
-2.59 (0.001)/
1.81 (0.70)
4,578/
474
3.0
0.0005
(0.01)
-
-
Guanahacabibes
(Cuba)
1
Quintana Roo
(México)
Dry Tortugas
(USA)
3
Florida suroeste
(USA)
1,3
1,2,3
Florida sureste
(USA)
Florida noroeste
(USA)
Florida noreste
(USA)
0.0265 ±0.0135
1,3
1
2,067
La variación observada en las secuencias parciales analizadas es selectivamente neutral
para cada población de anidación del Mediterráneo americano y la costa atlántica de la
Florida (ver Tabla 9), exceptuando al noreste de la Florida según el estimador de Tajima.
En todas las poblaciones de anidación la composición de A+T es aproximadamente el
doble de G+C. La media y la variación sobre la media de cada base nucleotídica son: A
(34.01±0.09), T (34.79±0.10), G (14.95±0.36) y C (16.25±0.18). Entre las poblaciones de
anidación los porcentajes de composición nucleotídica son similares.
Los tamaños efectivos de las poblaciones de anidación estimados según theta, son
mayores considerando la diversidad nucleotídica que el número de sitios segregativos en
la generalidad de los casos (ver Tabla 9), excepto en las poblaciones del noreste de la
RESULTADOS____________________________________________________________________________________________
60
Florida y Dry Tortugas donde es a la inversa, y en la colonia de anidación de San Felipe y
en la población de anidación de Quintana Roo donde son del mismo orden de magnitud.
Los tamaños efectivos estimados según theta a partir de la diversidad nucleotídica ( θˆ π)
para las poblaciones de anidación del suroeste cubano, Quintana Roo y el suroeste de la
Florida son ca. noventa, treinta y siete veces mayores que el tamaño censal actual de
hembras respectivamente. En las poblaciones de anidación del sureste y noreste de la
península de la Florida la desproporción es en sentido inverso, siendo el tamaño censal
actual de hembras del noreste ca. el cuádruplo del tamaño efectivo ( θˆ π).
Dry Tortugas2
Frecuencia relativa (%)
90
Florida noroeste1,2
90
70
70
50
50
30
30
10
10
0
1
2
3
0
20
1
2
3
Cuba suroeste
90
4
20
21
Frecuencia modelada
95% confianza
70
50
30
10
0
1
2
3
4
5
6
18
19
20
Número de diferencias
Fig. 13. Distribución desigual del número de diferencias observado entre pares de haplotipos de poblaciones de
anidación de C. caretta del Mediterráneo americano. El análisis se basó en haplotipos de la RNC del mtDNA (ca. 380
pb). Los datos de las unidades demográficas con superíndices 1 y 2 son según Encalada et al. (1998) y Francisco y Bowen (2001) respectivamente.
La prueba de distribución desigual del número observado de diferencias por pares de
secuencia de frecuencias se cumple en las poblaciones de anidación del suroeste cubano,
Dry Tortugas y noroeste de la península de la Florida (Fig. 13). La curva es unimodal con
moda en cero diferencias. En la población de anidación del suroeste cubano la expansión
ocurrió cuatro veces antes, previa a la última glaciación, y a partir de un tamaño efectivo
grande, a pesar de que los intervalos de confianza del tiempo de expansión se
superponen en cierta medida entre las poblaciones de anidación (ver Tabla 9). No
obstante, este resultado no se corresponde con la prueba de Fu (ver Tabla 9), sensible a
RESULTADOS____________________________________________________________________________________________
61
la expansión demográfica. Cuando se analiza el procedimiento del mínimo cuadrado para
ajustar la distribución desigual esperada y la observada en la población de anidación de
Quintana Roo, no hay convergencia.
IV.4 Relaciones filogenéticas y filogeográficas.
IV.4.1 Chelonia mydas.
Las
relaciones
filogenéticas entre
los
haplotipos
determinados
dA/2 (%)
T (años)
100%
0.54
450,000
0.48
400,000
0.42
350,000
en
las
poblaciones
de
anidación,
0.36
300,000
estimadas a partir
0.30
250,000
de
0.24
200,000
0.18
150,000
0.12
100,000
0.06
50,000
métodos
de
distancia, permite
distinguir sólo dos
agrupaciones
(Fig.
14).
Una
integrada por el
haplotipo CM-A5,
3
3 27
2, 3
28 56
57 1 48
Cuba suroeste
1
2
3
Florida
3 15
1
1
18 16
17
5
1
Quintana Roo
Fig. 14. Diagrama sobre las relaciones filogenéticas entre haplotipos y poblaciones
perteneciente
linaje
4
Tortuguero
al de anidación de C. mydas del Mediterráneo americano, estimadas con métodos de
Atlántico reconstrucción sobre la base de matrices de distancia de secuencias de la RNC del
mtDNA (ca. 490 pb). Reconstrucción sobre la base del número neto de sustituciones nucleotídicas
Sur (Encalada et
al., 1996), y la
otra que incluye a
todos
los
haplotipos
del
entre dos poblaciones (Nei & Li, 1979) y p estimada mediante el método Tamura (Tamura, 1992). Sólo se
indica aquel porcentaje de bootstrap mayor que 50 %. Los trazos continuos definen la divergencia entre
los haplotipos y los discontinuos entre las poblaciones. Los trazos oscuros representan haplotipos no
compartidos entre poblaciones de anidación y los grises, haplotipos compartidos por varias poblaciones
de anidación. La N de las poblaciones con superíndices 1, 2 y 3 son según Encalada et al. (1996), Allard
et al. (1994) y Lahanas et al. (1998) respectivamente. dA/2, valor medio de aglomeración; T, tiempo de
divergencia.
Haplotipos: CM-A1 – 4 (Allard et al., 1994); CM-A5 (Lahanas et al., 1994); CM-A15 – 18 (Encalada et al.,
1996); CM-A27 y 28 (Bjorndal y Bolten, inscritos en el GenBank 2001); CM-A48, 56 y 57 (Espinosa et al.,
inscritos en el GenBank 2003).
linaje mediterráneos americano –Viejo Mundo, cuya topología interna es variable en
correspondencia con los bajos valores de bootstrap determinados en cada reconstrucción.
La generalidad de los haplotipos diverge de su ancestro más cercano entre los 180 000 y
los 93 000 A, exceptuando al haplotipo CM-A5, que lo hace tempranamente en el orden de
los 800 000 A.
RESULTADOS____________________________________________________________________________________________
62
Entre las poblaciones de anidación se reconocen tres agrupaciones, cuya divergencia es
al menos tres veces más reciente que la de los haplotipos determinados en las mismas
(ver Fig. 14). La población de Tortuguero está separada de las restantes por una
dA=0.06%, a partir de la cual se estima un tiempo de divergencia en el orden de los 30
000 A. La población de Quintana Roo está separada de la población del suroeste cubano y
de la Florida por una dA dos veces y media menor que la divergencia de la población de
anidación de Tortuguero. Con este dato se estima un tiempo de divergencia de 11 000
años aproximados para la población de anidación de Quintana Roo. Las poblaciones de
anidación del suroeste cubano y de la Florida están separadas por una dA dos veces
menor que la que separa a Quintana Roo de éstas. Esta distancia representa
aproximadamente unos 5000 años de divergencia. Las colonias de anidación del suroeste
cubano aún no evidencian internamente señales de divergencia. Las posiciones de las
poblaciones de anidación de Quintana Roo y Tortuguero se intercambian cuando las
relaciones filogenéticas entre las poblaciones de anidación se reconstruyen con el método
de NJ (Saitou & Nei, 1987).
En el NCPA, la anidación de los clados (0 – pasos) concluye en agrupaciones de
haplotipos con orígenes diferentes exceptuando los clados 1 – 3 y 1 – 4, cuyos haplotipos
son endémicos de la población de anidación del suroeste cubano (Fig. 15a). En el clado
más interno (1 – 1) se encuentra el segundo haplotipo más distribuido y mejor
representado del linaje (CM-A1), agrupado con otros haplotipos endémicos de las
poblaciones de anidación del suroeste cubano, Florida y Quintana Roo. Este haplotipo es
reconocido como ancestro del linaje mediterráneos americano – Viejo Mundo. El clado 1 –
2 tiene una integración similar, pero con el haplotipo más ampliamente distribuido y mejor
representado (CM-A3) agrupado con otros haplotipos endémicos de las poblaciones de
anidación de Quintana Roo y Tortuguero. En el clado restante del nivel (1 – 5) se agrupan
haplotipos endémicos de las poblaciones de Quintana Roo y Lara.
Entre la generalidad de los clados procesados estadísticamente se encuentra una
asociación geográfica significativa (Fig. 15b), en correspondencia con una dependencia
entre la representatividad y distribución de los haplotipos en las colonias de muestreo.
RESULTADOS____________________________________________________________________________________________
a)
57
1-2
excepción,
ya
que
la
de
no
17
1-5
nula
48
aceptada. En el clado 1 –
se
infiere
un
15
distancias
larga
para
de
las
que
resultan:
el
segundo
haplotipo
2
E
18
E
48
I–E
representado dentro del
y
en
el
clado
del
clado,
cuanto
a
y
larga
la
en
menos
las
externas dentro del clado
anidado. En el clado 1 – 5
también se infiere un flujo
genético
restringido
comprometido
espacio
en
con
dispersión,
que
27
el
alguna
abarcó
largas
distancias
áreas
intermedias
sobre
no
ocupadas por la especie, o
en el tiempo con un flujo
Clados de 1 – paso
Clado
Dc
Dn
Dn
L
533.55
490.97
453.57
460.07
72.22
P
1,818.83
P
2,096.72
P
543.41
1-2 I
1,138.88
56 y 57 dentro de la misma población
1-3 I
0
1,650.71
27 y 28 dentro de la misma población
1-4 I
0
1,650.71
1-5 I
6,379.44
2 – 3 – 4 (No)
3I
E
4
E
15
I–E
1,146.16
0
0
1,146.16
1,136.56
772.22
951.57
274.67
X2=12.47, p=0.15
P
Ho Aceptada
distancia
media entre las posiciones
internas
1-4
1-1 I
anidado, pequeña para el
haplotipo CM-A48 dentro
Haplotipos
Dc
L
560.61
0
0
P
0
L
560.61
X2=23.26, p<0.001
más
ampliamente distribuido y
clado
28
4
flujo
restringido con aislamiento b) Clado
1I
por distancia, a partir de la
E
significación
16
14
x
asociación geográfica es
1
13
2
1
3
hipótesis
63
56
1-1
18
El clado 1 – 2 es la
1-3
13I
E
14
E
16
E
17
I–E
P
0
0
0
0
0
P
4,306.12
2,870.75
9,569.17
L
9,985.22
P
-3,796.46
X2=12.00, p=0.008
2 – 3 – 5 – 6 – 7 – 8 (Sí)
L
8,816.07
L
X2=143.23, p<0.001
2 – 3 – 5 – 15 (No)
Fig. 15. Análisis filogeográfico de clados anidados del linaje de C. mydas
representado en poblaciones de anidación de los mediterráneos
americano y del Viejo Mundo, sobre la base de haplotipos de la RNC del
mtDNA (ca. 490 pb).
a) Árbol de haplotipos con diseño de clados anidados.
b) Resultados del NCPA.
Cuadrado, identifica al haplotipo ancestral; círculo, identifica al iésimo haplotipo; –
representa una mutación, con un cuadrado una transversión y con un asterisco (*), una
adición (CAATGG); figuras geométricas con líneas finas indican la relación entre haplotipos
mediada por una mutación; con líneas gruesas indican 1 paso entre los clados, equivalente
al total del cladograma. El tamaño de las figuras geométricas es proporcional a la
representatividad del haplotipo. Dc y Dn, distancias promedio dentro del clado y en el clado
anidado respectivamente; I y E, posición interna o externa del clado; I – E, distancia
promedio entre los clados interior menos exterior dentro de un clado anidado; superíndices
P y L, junto con datos sombreados, indican que la distancia es significativamente pequeña o
larga. En el lugar de cada Ho rechazada se refieren números correspondientes al empleo de
la clave de inferencia biológica según Templeton (2004). Haplotipos: CM-A1 – 4 (Allard et
al., 1994); CM-A13 – 18 (Encalada et al., 1996); CM-A27 y 28 (Bjorndal & Bolten, inscritos
en el GenBank 2001); CM-A48, 56 y 57 (Espinosa et al., inscritos en el GenBank 2003).
RESULTADOS____________________________________________________________________________________________
64
genético pasado seguido de extinciones en poblaciones intermedias, a partir de la
significación de las distancias pequeñas del haplotipo CM-A13 dentro del clado y del clado
anidado, larga del haplotipo CM-A17 en el clado anidado y pequeña distancia media entre
las posiciones internas menos las externas dentro del clado anidado. Entre los clados
anidados totalmente (clados de 1 – paso) se infiere una fragmentación pasada y
colonización o movimientos a largas distancias una de estas dos últimas variantes, a
partir de la significación de distancias pequeñas dentro de los clados 1 – 1 y 1 – 2 y en
éstos anidados, y largas dentro del clado 1 – 5 y en éste anidado.
IV.4.2 Caretta caretta.
Las relaciones filogenéticas entre los haplotipos determinados en las poblaciones de
anidación, estimadas a partir de métodos de distancia, permite distinguir sólo dos
agrupaciones (Fig. 16). Una integrada por los haplotipo CC-A1, 11 y 14, pertenecientes al
linaje Atlántico – península de la Florida, y la otra que incluye a la mayoría de los
haplotipos de origen conocido del linaje mediterráneos americano – Viejo Mundo, cuya
topología interna es variable en correspondencia con los bajos valores de bootstrap
determinados en cada reconstrucción. La generalidad de los haplotipos diverge de su
ancestro más cercano entre los 158 000 y los 500 000 años dentro de cada linaje. Entre
ambos linajes la divergencia es en el orden de los 3 MA.
Entre las poblaciones de anidación se reconocen cinco agrupaciones, de las cuales los
grupos distintivos de poblaciones de anidación de la península de la Florida y el
Mediterráneo americano divergen dos veces más reciente que cuando ocurrió la
diversificación de los haplotipos dentro de cada linaje (ver Fig. 16). Las agrupaciones de
poblaciones de anidación sureñas y norteñas dentro del grupo de la península de la
Florida divergen en el mismo orden en que los haplotipos divergieron dentro de cada
linaje. Las demás poblaciones de anidación divergen antes de la diversificación de los
haplotipos dentro de cada linaje. Las poblaciones de anidación norteñas y sureñas de la
península de la Florida están separadas por una dA=0.74%, a partir de la cual fue
estimado un tiempo de divergencia en el orden de los 440 000 A. Dentro de cada
agrupación latitudinal, las poblaciones de anidación están separadas por una dA=0.52%
mucho mayor entre las poblaciones de anidación norteñas respecto a la dA=0.02%
RESULTADOS____________________________________________________________________________________________
dA/2 (%)
DT3
X
SEFL1,2,3
SWCUB
1
1
14
1
11
14
SWFL1,3
1
14
NEFL1
NWFL1,3
1
1
65
T (años)
0.06
100,000
0.12
78%
200,000
0.18
0.24
300,000
0.30
400,000
0.36
500,000
0.42
1.12
1,300,000
2.76
3,000,000
100%
1.12
1,300,000
0.42
500,000
0.36
400,000
0.30
0.24
300,000
0.18
200,000
0.12
100,000
0.06
2 3 8 10 9
QRMEX1
2
10 9
DT3
2
8 12 10
SWCUB
2 3 5
7 10 11 13 20
SEFL1,2,3
2
3
7
SWFL1,3
2
NEFL1
2
3
7
NWFL1,3
Fig. 16. Diagrama sobre las relaciones filogenéticas entre haplotipos y unidades demográficas de C. caretta del
Mediterráneo americano, estimadas con métodos de reconstrucción sobre la base de matrices de distancia de
secuencias de la RNC del mtDNA (ca. 380 pb). Reconstrucción sobre la base del número neto de sustituciones nucleotídicas entre
dos poblaciones (Nei & Li, 1979) y p estimada mediante el método Tamura (Tamura, 1992). Sólo se indica aquel porcentaje de bootstrap mayor
que el 50 %. Los trazos continuos definen la divergencia entre los haplotipos y los discontinuos entre las poblaciones. Los trazos oscuros
representan haplotipos no compartidos entre poblaciones de anidación y los grises, haplotipos compartidos por varias poblaciones de anidación.
La N de las unidades demográficas con superíndices 1, 2 y 3 son según Encalada et al. (1998), Francisco et al. (1999) y Francisco & Bowen
(2001) respectivamente. dA/2, valor medio de aglomeración; T, tiempo de divergencia.
Haplotipos: CC-A1 – 10, Encalada et al. (1998); CC-A11 – 14, Bolten et al. (1998); CC-A20, según Bowen (inscrito en el Archie Carr Center).
RESULTADOS____________________________________________________________________________________________
66
encontrada entre las poblaciones de anidación sureñas. A partir de estos valores de
aglomeración son estimados tiempos de divergencia entre las poblaciones de anidación
dentro de cada agrupación latitudinal en los órdenes 150 000 y 12 000 años
respectivamente. Dentro del Mediterráneo americano, la población de anidación del
suroeste cubano diverge primero que Quintana Roo y Dry Tortugas con dA=0.21 y 0.02%
respectivamente, lo cual representa tiempos de divergencia de 126 000 y 12 000 años
respectivamente. Las colonias de anidación del suroeste cubano aún no evidencian
internamente señales de divergencia.
En el NCPA, la anidación de los clados (0 – pasos) concluye en agrupaciones de
haplotipos con orígenes diferentes (Fig. 17a). En el clado interno (1 – 1) se encuentra el
haplotipo más distribuido y mejor representado del linaje mediterráneos americano – Viejo
Mundo (CM-A2), agrupado con otros haplotipos entre los que se encuentran los
endémicos CC-A5, 13 y 20 endémicos de Port Everglades y norte de Jetty pertenecientes
a la población de anidación del sureste de la Florida, y del suroeste de Cuba,
respectivamente. Este haplotipo es reconocido como ancestro del linaje. Otros clados
integrados por haplotipos de este linaje son los consecutivos 2 y 3. El clado 1 – 2 está
integrado sólo por el haplotipo CC-A9, representado en las poblaciones de anidación de
Dry Tortugas y Quintana Roo. El clado 1 – 3 está integrado por los haplotipos CC-A10,
ampliamente distribuido pero mal representado, y por el CC-A12, endémico del suroeste
de Cuba. Los clados restantes (1 – 4 y 5) están integrados por haplotipos del linaje
Atlántico – península de la Florida. El clado 1 – 4 está integrado por los haplotipos CCA11, pobremente distribuido y representado que resulta el ancestro del linaje; y CC-A1,
mejor distribuido y representado del linaje. El otro clado (1 – 5) está integrado por dos
haplotipos alopátridos disyuntos, i.e. CC-A4 endémico y único haplotipo de la población de
anidación de Bahía (Brasil) y por el CC-A14 del Mediterráneo americano.
La anidación de los clados (1 – pasos) concluye en dos agrupaciones de haplotipos
correspondiente a cada linaje (ver Fig. 17a). El clado 2 – 1 integra a los clados de un paso
pertenecientes al linaje mediterráneos americano – Viejo Mundo, mientras que el clado 2 –
2 integra a los clados pertenecientes al linaje Atlántico – península de la Florida. Entre
éstos media un mínimo de 16 pasos.
RESULTADOS____________________________________________________________________________________________
a)
9
1-1
3
5
6
x
x
1-2
7
2-1
12
1-3
1-5
10
8
67
13
4
14
20
2-2
11
1-4
16
2
b)
Clado
2I
E
3
E
5
E
6
E
7
E
8
E
13
E
20
I–E
Haplotipo
Dc
5,811.10
L
7,453.00
0
L
8,807.20
1,018.00
397.00
0
0
-115.86
1
Dn
5,825.50
L
6,566.58
4,358.64
5,883.97
4,877.00
4,822.84
4,380.33
4,356.43
P
-198.93
X2=259.32, p=0.03
Clado
1-1I
Clados de 1 - paso
Dc
Dn
5,892.42
L
Clados de 2 - pasos
Clado
Dc
Dn
5,830.51
L
1 – 2 – 11(sí)
E
9
10 I
E
12
I–E
E
506.40
E
2,560.18
L
3,742.99
1-2
2,764.42
0
2,764.42
4,375.78
2,640.45
1,524.73
1,115.73
X2=5.45, p=0.58
1-3
I–E
Ho aceptada
P
P
4,735.53
L
1,166.92
X2=40.34, p=0.25
1
11I
I
893.69
0
892.37
607.26
E
5,795.40
E
1,543.12
2-1
L
5,218.58
P
3,203.00
L
1 – 2 – 3 – 4 (No)
X2=7.76, p=0.82
1-4I
P
891.51
1,234.04
P
Ho aceptada
4I
E
14
I–E
P
0
P
666.54
P
-666.54
X2=19.00, p<0.001
1 – 19 (No)
L
4,629.69
L
5,343.98
S
-714.29
E
L
L
1-5 4,968.46
5,125.71
I – E -4,076.95P -3,891.67P
X2=191.27, p<0.001
1 – 2 – 11 (Sí) – 12 (No)
2-2
P
2
X =304.40, p<0.001
1 – 2 – 11 (Sí) – 12 (Sí)
Fig. 17. Análisis filogeográfico de clados anidados de los linajes de C. caretta representado en poblaciones de
anidación de los mediterráneos americano y del Viejo Mundo, sobre la base de haplotipos de la RNC del mtDNA
(ca. 380 pb).
a) Árbol de haplotipos con diseño de clados anidados.
b) Resultados del NCPA.
Para interpretar la simbología y nomenclatura ver Figura 14. Haplotipos: ver Figura 15.
RESULTADOS____________________________________________________________________________________________
68
Entre la generalidad de los clados procesados estadísticamente se encuentra una
asociación geográfica significativa (Fig. 17b), en correspondencia con una dependencia
entre la representatividad y distribución de los haplotipos en las colonias de muestreo. En
los clados de un paso 1 – 3 y 4, las hipótesis nulas de no asociación geográfica son
aceptadas. En el clado 1 – 1 se infiere una expansión contigua del rango de distribución de
los haplotipos, a partir de la significación de las distancias que resultaron: largas para el
haplotipo CC-A3, larga dentro del clado para el haplotipo CC-A6, y pequeña en cuanto a la
distancia media entre las posiciones internas menos las externas en el clado anidado. En
el clado 1 – 5 también se infiere una fragmentación alopátrida, a partir de la significación
de las distancias pequeña dentro del clado y grande en el clado de los haplotipos
integrantes, así como distancias pequeñas entre las posiciones internas menos las
externas dentro del clado anidado. En los clados de dos pasos, se infiere un flujo de genes
restringido con aislamiento por distancia entre las colonias de anidación para el clado 2 –
1, a partir de la significación de las distancias largas para el clado 1 – 1 y entre las
posiciones internas menos las externas en el clado anidado, y pequeñas para el clado 1 –
3. En el clado 2 – 2 también se infiere una expansión contigua del rango de distribución de
C. caretta a partir de la significación de las distancias pequeñas para el clado 1 – 4 y entre
las posiciones internas menos las externas en el clado anidado, y largas para el clado 1 –
5. Este resultado también se obtiene entre los clados anidados totalmente (clados de 2 –
pasos), a partir de la significación de distancias largas para el clado 2 – 1 y pequeñas para
el clado 2 - 2.
DISCUSIÓN______________________________________________________________________________________________
69
V. DISCUSIÓN.
V.1 Análisis de secuencias.
El alto porcentaje de transiciones que se encuentra en las secuencias de la primera mitad
de la RNC del mtDNA, ha sido informado para C. mydas (Lahanas et al., 1994; Encalada
et al., 1996), C. caretta (Encalada et al., 1998; Laurent et al., 1998), E. imbricata (Frías et
al., 2006; Bowen et al., 2007) y otras especies marinas (Brown et al., 1993; Wenink et al.,
1994) y particularmente, para la RNC del mtDNA en póngidos (Brown et al., 1982), el
hombre (Tamura & Nei, 1993) y en roedores (Brown et al., 1986). Una proporción similar
también ha sido informada para el DNA nuclear (Anagnostopoulos et al., 1999; Graur & Li,
2000; Nachman & Crowell, 2000) y para pseudogenes en varias especies (Graur & Li,
op.cit.; Nachman & Crowell, op.cit.). Existen dos vías principales por las cuales ocurren las
mutaciones puntuales (Topal & Fresco, 1976). En la primera, las transiciones devienen de
asociaciones erróneas de purina – pirimidina, y pueden ocurrir en cualquier cadena. En la
segunda, las transversiones devienen de asociaciones erróneas purina – purina, y sólo
pueden ocurrir si la purina reside en la cadena molde. Por consiguiente, si la transversión
tiene baja probabilidad de ocurrencia, entonces, cuando aparece, debe ser diagnóstica
como ocurre en el haplotipo CM-A36 y entre linajes de C. mydas, en los haplotipos CCA18, 23, 40 y 47 de C. caretta, y EI-ABI1 y EI-EATL1 de E. imbricata (Bowen et al., 2007).
Los porcentajes equitativos de transiciones entre purinas y pirimidinas que se encuentran
en estas tortugas marinas concuerdan con la abundancia de A y T, y con la predisposición
a la conversión de CpG. La desproporción entre las sumas de A y T respecto a G y C ha
sido informada previamente para C. mydas por Lahanas et al. (1994) y para otras especies
marinas (Saccone et al., 1987; Arnason et al., 1993; Brown et al., 1993; Sang et al., 1994).
En pseudogenes, la riqueza de A y T ha concordado con la tendencia al cambio de C y G
a T y A respectivamente. Este fenómeno también puede ocurrir en la RNC del mtDNA
porque no está sujeta a restricción funcional (Graur & Li, 2000). La transición de C a T
puede facilitarse a través de la conversión de residuos de C metilada a residuos de T por
desaminación (Coulondre et al., 1978; Razin & Riggs, 1980), la cual ha sido más frecuente
en CpG por el alto porcentaje de metilación de C (Razin & Riggs, op.cit.). Como
consecuencia y considerando la selectividad neutral sobre esta región, aumenta la
probabilidad de transiciones recientes en las bases más abundantes (A y T). Por otro lado,
DISCUSIÓN______________________________________________________________________________________________
70
la abundancia de A y T ha sido una consecuencia de la predisposición histórica a la
conversión de CpG. Entonces se cumplen las dos igualdades fCT= fGA y fTC= fAG. Por esta
razón, los cambios diagnósticos que se encuentran en los haplotipos de C. mydas y C.
caretta son consecuencia de transiciones generalmente en los sentidos A→G y T→C.
Estos cambios concomitan con la edad del haplotipo y su frecuencia se relaciona con la
riqueza del contenido de A y T más que con la predisposición a la conversión de CpG.
En C. mydas se infiere que el indel correspondiente al SP 470 es una inserción porque no
se presenta en el haplotipo ancestral, y su frecuencia es exclusiva de un solo haplotipo
derivado en el linaje mediterráneos americano – Viejo Mundo. Otras dos inserciones han
sido informadas para el mismo SP en haplotipos del linaje Atlántico Sur de esta especie:
CM-A7, como una repetición en tándem de diez pb [CCTTTGGTTG] (Lahanas et al.,
1994); CM-A25 y CM-A42, como repeticiones de diez [CAATGGGTTG] y cuatro [CAGG]
pb (Formia & Bruford, 2002). Estas inserciones sólo han sido encontradas en uno y dos
individuos respectivamente. Consecuentemente, el haplotipo CM-A7 es considerado raro
(Lahanas et al., 1994). Curiosamente, esta adición presente en el haplotipo CM-A7
también ha sido encontrada en los haplotipos CM-PE1 y 2, endémicos y bien
representados en el linaje del Pacífico dentro del Atolón de la Micronesia (Moritz et al.,
2002). En esta misma posición se ha informado otra repetición en tándem para el
haplotipo EI-A25 de E. imbricata (Díaz-Fernández, 1999) del linaje “Caribe B” (Okayama et
al., 1999). En C. caretta también se infiere que los indeles correspondientes a los SPs 431
y 473 del linaje mediterráneos americano – Viejo Mundo son inserciones porque tampoco
se presentan en el haplotipo ancestral y ocurren en sólo tres haplotipos del linaje. Otro
indel en la posición 163, no informado por ser diagnóstico entre los linajes de la cuenca
atlántica, también constituye una adición para el linaje Atlántico – península de la Florida
porque no se comparte con el linaje naturalmente emparentado del Pacífico. Sin embargo,
los indeles de uno y seis pares de bases en los SPs 404 y 465, tampoco informados por la
misma razón antes esgrimida, no pueden clasificarse porque sólo se presentan en el linaje
mediterráneos americano – Viejo Mundo. Las duplicaciones en el mtDNA han tenido una
distribución geográfica y filogenética restringida también en otras especies (Moritz &
Brown, 1987; Wallis, 1987). Moritz & Brown (1987) proponen que estas duplicaciones
tienen una corta vida en relación a la escala de tiempo evolutivo. Otra inserción de diez pb
DISCUSIÓN______________________________________________________________________________________________
71
se encuentra en la secuencia del haplotipo CM-A25 de C. mydas (Bjorndal & Bolten,
inscrito en el Archie Carr Center for Sea Turtle Research). En C. mydas, al igual que en E.
imbricata, son frecuentes las repeticiones nucleotídicas continuas en los treinta pb
antecesores a la inserción. También ocurre en las antecesoras a las adiciones y al indel de
seis pares de bases del linaje mediterráneos americano – Viejo Mundo de C. caretta.
Estas áreas son ricas en GT. En microsatélites de otras especies, la aparición de nuevas
variantes genéticas ha sido explicada por el mal apareamiento de las bases, provocado
por el deslizamiento de la cadena durante la replicación en áreas ricas en GT (Goldstein &
Schlotterer, 1999). En levaduras se ha observado, que la enzima incrementa la frecuencia
de mutaciones en tramos con abundancia de GT (Strand et al., 1993). Adicionalmente, en
fragmentos de secuencias con repeticiones se han incrementado las mutaciones
puntuales de 130 – 240 veces, porque la DNA polimerasa delta pierde la capacidad de
corregir errores (Morrison et al., 1993). Por consiguiente, la presencia de indeles en C.
mydas, C. caretta y otras especies de tortugas marinas como E. imbricata, podría ser más
probable en un área específica de la RNC con repeticiones, y su composición debería
también ser similar. De hecho una de estas inserciones es común en linajes alopátridos de
C. mydas de las cuencas atlántica y pacífica. La frecuencia significativa de los haplotipos
endémicos que portan las inserciones en C. mydas, tanto en las colonias del suroeste
cubano como en la Micronesia, es otra evidencia de que en las islas pueden fijarse
variantes raras durante las fluctuaciones demográficas, y cambiar sus frecuencias por
acción de la deriva genética en ausencia de migraciones significativas.
C. mydas presenta una distribución similar de mutaciones en los dos linajes de la cuenca
atlántica a diferencia de C. caretta, en la que predominan los cambios diagnósticos de
forma general (de haplotipos, haplotipos dentro de linajes y entre linajes (ver Figs. 6 y 8).
Los linajes de la cuenca atlántica de C. caretta no están relacionados naturalmente, es
decir, no comparten un ancestro común como sucede en C. mydas. Por consiguiente,
entre estos linajes pueden ocurrir homoplasias y fijarse un mayor número de mutaciones,
apareciendo transversiones e indels diagnósticos de linajes en la medida en que
aumenten las distancias evolutivas entre éstos como sucede en roedores (Brown et al.,
1986). Este argumento ha sido la única razón sólida para explicar el por qué hay mayores
cambios, incluso transversiones etc. en C. caretta respecto a C. mydas. Realmente estos
DISCUSIÓN______________________________________________________________________________________________
72
mecanismos de distribución geográfica de la variación genética (vicarianza en C. mydas y
vicarianza y dispersión en C. caretta) son la causa del curso y tipo de mutaciones respecto
al ancestro más cercano. Adicionalmente, cualquier fuerza evolutiva que actúe sobre
cualquier locus afectará la historia de la molécula completa, por lo que la fijación de una
mutación ventajosa por selección, puede causar la fijación de otros polimorfismos a través
del proceso de autostop (hitchhiking) genético (Maynard & Haigh, 1974) o coadaptación
(Wallace 1991). El hecho de que exista una variación clinal de los haplotipos más
distribuidos y representados en los linajes de C. caretta podría estar asociada a una
influencia climática de la latitud, a pesar de que se supone neutralidad para la RNC, como
ha ocurrido en Crassostrea virginica (Reeb & Avise, 1990) y en Fundulus heteroclitus
(Gónzalez-Villaseñor & Powers, 1990). En vertebrados exotérmicos la tasa de sustitución
promedio es más baja que en endotermos de semejante tamaño (Martin & Palumbi,1993),
y en invertebrados haplogrupos de Drosophila son dependientes de la temperatura (Doi et
al., 1999). Razones por la que no debe asumirse una misma tasa de mutación para
calibrar el reloj molecular de diferentes especies (Ballar & Rand, 2005).
V.2 Estructura poblacional.
A partir del análisis de los resultados de estructuración genética de las colonias de
anidación de C. mydas y C. caretta del suroeste cubano se concluye que éstas constituyen
poblaciones de anidación panmictas. Las colonias de anidación del sureste de Cuba de E.
imbricata también constituyen una población panmicta (Espinosa et al., 2004; Bowen et al.,
2007a). Cuando se analiza la estructura entre las colonias de anidación cubanas y las del
Mediterráneo americano y costa atlántica de la península de la Florida para cada especie,
se encuentran estructuras genéticas significativas entre éstas. [Estas colonias de
anidación han sido consideradas poblaciones para C. mydas por Allard et al. (1994),
Lahanas et al. (1994), Encalada et al. (1996) y Bjorndal et al. (2005); para C. caretta se ha
mantenido el estatus de población para la colonias de anidación de Quintana Roo
(Encalada et al., 1998), mientras que las colonias de anidación de USA se han integrado
en poblaciones (Francisco et al., 2001); y para la otra especie de tortuga marina que anida
de forma apreciable en el archipiélago cubano E. imbricata por Bass et al. (1996), DíazFernández et al. (1999), Espinosa et al. (2004) y Bowen et al. (2007a)].
DISCUSIÓN______________________________________________________________________________________________
73
Usando dos pruebas estadísticas y considerando la presencia o ausencia del haplotipo
CM-A5 (perteneciente al otro linaje) en la población mexicana de C. mydas, se encuentra
estructura genética significativa entre la colonia de anidación de la Florida y Quintana Roo.
En contraste con este resultado, Encalada et al. (1996) no encuentra estructuración
genética significativa entre estas colonias de anidación. Los resultados de las dos pruebas
de estructuración genética difieren cuando se comparan las interacciones por pares de
colonias o poblaciones de anidación de C. mydas del suroeste de Cuba con las de la
Florida y Quintana Roo. En C. caretta también hubo incongruencias entre la significación
de la prueba X2 con respecto a la prueba Φ ST por pares de colonias de anidación. Estas
incongruencias dependieron de la resolución de cada estadístico en relación con el
tamaño de muestra y la diversidad genética, principalmente con la haplotípica en los casos
en los que el X2 fue significativo. Para tamaños de muestras dispares con haplotipos
pertenecientes a linajes diferentes y una desproporción de las frecuencias haplotípicas, el
X2 se vuelve más sensible respecto al F- Φ ST para detectar diferencias. Como era de
esperar la prueba de F- Φ ST fue menos precisa que la de X2, a pesar de que esta última
solamente considera el número y la frecuencia de los haplotipos. El F- Φ ST se expresa en
términos de tiempos de coalescencia probando la hipótesis nula por permutaciones de
haplotipos entre poblaciones (Slatkin, 1991). Por consiguiente, para la colonia de
anidación de C. mydas de la península de Guanahacabibes, respecto a las poblaciones de
anidación de la Florida y Quintana Roo, y para las interacciones entre las colonias de
anidación de C. caretta del suroeste de Cuba versus Tyndall Beach, Quintana Roo versus
Dry Tortugas, y Cape San Blas versus Eglin Air Force Base, la media del tiempo de
coalescencia de dos genes delineados en la misma población será cercana a la media del
tiempo de coalescencia de dos genes delineados en dos poblaciones a comparar,
resultando en la no significación del F- Φ ST. Estos resultados han sido consecuencia de
que los haplotipos más representados en C. mydas y C. caretta se compartan entre las
colonias de anidación y de que los restante haplotipos endémicos aparecen en baja
frecuencia. Justificación similar se puede asociar al comportamiento de la colonia
anidación de C. mydas de San Felipe respecto a la población de anidación de la Florida.
No obstante, la colonia de anidación de San Felipe está estructurada significativamente
con la población de anidación de Quintana Roo, debido a que solamente comparten uno
de los dos haplotipos mejor representados. Contrariamente, a pesar de que en la
DISCUSIÓN______________________________________________________________________________________________
74
interacción de las colonias de anidación de C. caretta de Dry Tortugas versus Port
Everglades están representados haplotipos de ambos linajes, la media del tiempo de
coalescencia de dos genes delineados en una población distará de la media del tiempo de
coalescencia de dos genes delineados en ambas poblaciones, resultando en la
significación del F- Φ ST.
Estas incongruencias quedan resueltas con la aplicación de un AMOVA, que además de
tener en cuenta el número de mutaciones entre los haplotipos, considera la varianza de las
frecuencias haplotípicas generadas en las estructuras jerárquicas (Excoffier et al., 1992).
Los resultados de esta prueba respaldan en C. mydas la estructura hipotética II, aunque el
FCT no haya sido significativo. La diferenciación regional en esta especie ha sido más
evidente cuando el grado de diferenciación entre los haplotipos se tiene en cuenta,
considerando que la distancia molecular ha sido mayor por pares de haplotipos
pertenecientes a regiones diferentes que para aquellos dentro de la misma región
(Excoffier et al., op.cit.). Como los haplotipos de C. mydas en las colonias de anidación del
Mediterráneo americano pertenecen al mismo linaje y entre éstos existen pocos cambios,
la precisión del FCT disminuye. Adicionalmente, estas colonias de anidación comparten el
haplotipo más ampliamente distribuido y mejor representado, por lo que no se ha
considerado el comportamiento estadístico del índice FCT en las estructuras hipotéticas II y
III. En C. caretta se aprueba la estructura hipotética II, con una combinación perfecta entre
el comportamiento estadístico de Φ SC y Φ CT, porque a pesar de que la mayor variación
también se produce dentro de las poblaciones, esta es dos veces menor que en C. mydas
como consecuencia de la presencia de dos linajes no emparentados naturalmente y con
distribuciones distintas, que en la península de la Florida llegan a constituir clinas. Por otra
parte, en E. imbricata, la población de anidación cubana junto con las de Puerto Rico, Islas
Vírgenes de USA, Antigua, Barbados y Venezuela, quedan dentro del grupo Caribe
oriental, sin panmixia pero distinguible significativamente del otro (Caribe occidental, que
junta las poblaciones de anidación de México, Belice y Costa Rica) (Bowen et al., 2007).
Estas agrupaciones tienen su causa en un porcentaje mayor entre que dentro de las
poblaciones de anidación (Bass et al., 1996), lo cual contrasta con la proporción de los
componentes de varianza informada para C. mydas y C. caretta.
DISCUSIÓN______________________________________________________________________________________________
75
La existencia de estructura genética significativa entre las poblaciones de anidación de
Cuba y Quintana Roo (México) para C. mydas y C. caretta, la presencia de dos linajes en
la población de anidación cubana para C. caretta, y la no existencia de estructura genética
significativa con algunas de las colonias del sur de la Florida en C. caretta, acentúan
patrones de colonización relacionados más con los que ocurrieron en la península de la
Florida que con los que ocurrieron en México, a pesar de que las poblaciones de anidación
de Cuba y México están en la misma cuenca del Mar Caribe y son las más cercanas
geográficamente. La corriente de Yucatán provee un flujo mayoritario de agua hacia el
Golfo de México que hacia el estrecho de la Florida, donde el flujo es pequeño y episódico
a través de la contracorriente cubana (Ochoa et al., 2001). A su vez, la existencia de la
corriente de lazo, que en un extremo da paso directo a la corriente de la Florida, genera un
flujo cuasi permanente de recirculación alrededor de Cuba (Gyory et al., 2005). Por
consiguiente, ha existido un flujo directo entre las aguas cercanas a Cuba con las del sur
de la Florida, principalmente con el sureste, y limitado con las de México. Todo lo cual ha
influido en la conformación de poblaciones de anidación perfectamente distinguibles en las
áreas de anidación de Cuba y México, y parecidas entre Cuba y el sureste de la Florida
para ambas especies. Este sistema de corrientes ha sido una barrera efectiva para limitar
el flujo de migrantes no sólo entre las poblaciones de anidación de Cuba y México, sino
también entre las poblaciones de México y el noroeste de la Florida de C. caretta.
La variación clinal de los haplotipos más distribuidos y representados de C. caretta en
ambas costas de la península de la Florida ha ofrecido dificultades para el establecimiento
de los límites de las poblaciones de anidación en esta región. La corriente de la Florida se
desvía de la costa cerca de los 32oN generando remolinos, que decrecen cuesta abajo
(Olson et al., 1983). Francisco & Bowen (2001) consideran que las colonias de anidación
de Volusia County debieron formar parte de la población de anidación del noreste de la
Florida hasta Carolina del Norte por estar situada al norte de Cabo Cañaveral, límite
biogeográfico reconocido según Briggs (1974) y Avise (1992). Sin embargo, Bowen (2004)
describe una estructura genética significativa entre esta área de anidación y la población
de anidación del sur de la Florida. En el presente estudio se restringe aún más la
pertenencia a la nueva población de anidación del sureste de la Florida. Al parecer, la
efectividad de la barrera marina para C. caretta está un poco más al norte (ca. 31oN), en la
DISCUSIÓN______________________________________________________________________________________________
76
irregularidad topográfica conocida como “Charleston Bump”. En esta zona, se ha descrito
un carácter bimodal de la corriente de la Florida manifiesto en estados débiles y fuertes de
desviación, pero con predominio de varios meses de los fuertes (Bane & Dewar, 1988).
Quizás, como la colonia de anidación de Cumberland Island se localiza cerca de la zona,
pueda recibir migrantes de las colonias de latitudes más bajas, aunque de forma limitada.
Por consiguiente, esta colonia de anidación y la vecina de Amelia Island constituyen el
límite inferior de la población de anidación del noreste de la Florida hasta Carolina del
Norte. Para el resto de las colonias de anidación de esa población, la barrera marina
“Charleston Bump” es muy efectiva, ya que solamente están integradas por el haplotipo
CC-A1 a pesar de tener anidaciones apreciables (TEWG, 2000) en comparación con otras
colonias del Gran Caribe. Sin embargo, a pesar de que en la costa noroeste de USA el
haplotipo CC-A2 no se anula, la indisponibilidad de sitios para la anidación (barrera
biogeográfica) en la zona central de la costa del oeste de la península de la Florida,
delimita las poblaciones de anidación del norte y del sur. En el caso del sur de la Florida, a
pesar de que no existe estructura genética por pares de colonias de anidación,
exceptuando las interacciones con Dry Tortugas, se definen con el análisis de la varianza
molecular jerarquizado tres poblaciones de anidación en lugar de las dos clásicas
(Encalada et al., 1998; Francisco & Bowen, 2001). Todo lo cual reconoce la efectividad del
desagüe de los Everglades (barrera biogeográfica) para limitar el flujo amplio de migrantes
entre las colonias de anidación del suroeste, Dry Tortugas y sureste de la Florida.
Entre la generalidad de las colonias de anidación analizadas del Atlántico Sur también se
ha encontrado estructura genética significativa para ambas especies, con la excepción en
C. mydas de los pares de colonias de anidación de las islas Guinea Bissau – Ascensión,
Ascensión – Bioko y Príncipe – Sao Tomé. En el primer caso, la posible causa se cree que
fue por un aislamiento reciente (Encalada et al., 1996); en el segundo, la colonización
reciente de la Isla de Bioko (Formia et al., 2002a); y en el tercero, el resultado de los fallos
a la conducta de reproducción en el lugar de origen (Formia et al., op.cit.). Similar
estructuración genética poblacional ha tenido lugar dentro de la cuenca indopacífica
(Norman et al., 1994; Moritz et al., 2002), donde sólo las colonias de anidación de C.
mydas del Cabo Noroeste del continente australiano y las de las islas Lacepede, cercanas
a éste, no están estructuradas significativamente, probablemente como consecuencia de
DISCUSIÓN______________________________________________________________________________________________
77
la existencia de colonias de anidación intermedias entre éstas o porque fueron colonizadas
por la misma población originaria, seguido de una segregación reciente. En el Pacífico
Norte, también se informa estructura genética significativa entre las colonias de anidación
de C. caretta del Archipiélago de Japón (Hatase et al., 2002) y entre éstas y las de
Australia (Bowen et al., 1995). Esta estructuración se corresponde con variaciones
morfométricas referidas para las colonias de anidación en cuestión (Hatase et al., 2002).
Considerando la correlación obtenida entre el grado de diferenciación genética y la
distancia geográfica por pares de colonias de anidación de C. mydas y C. caretta, y
teniendo en cuenta el patrón de distribución ecológica (discreta) en las áreas de anidación,
el modelo de flujo genético que mejor se ajusta es el de paserala. Este modelo explica la
aparición de altos niveles de significación de estructura entre las colonias de anidación
más distantes. Estos niveles son la causa del comportamiento estadístico de la correlación
cuando se involucran todas las colonias de anidación de la región del Mediterráneo
americano. Es por esto que a pesar de que el coeficiente de correlación no es alto cuando
se analizan las interacciones con la distancia geográfica, como consecuencia de la
dispersión de las interacciones, se obtuvieron diferencias significativas. Evidentemente,
esta dispersión debe incrementarse cuando se consideren sólo las poblaciones validadas
en el presente trabajo porque está explícita la similitud genética entre colonias de
anidación contiguas de USA lo cual se hace extensivo al nivel poblacional. Todo lo cual
contribuye a esclarecer los conceptos de colonia y población de anidación en términos de
la diferenciación genética. Las colonias se corresponden principalmente con la agregación
espacial de las tortugas marinas en áreas de anidación específicas, a menudo
identificadas con el nombre vernáculo de un accidente geográfico, e.g., el nombre de la
playa. La existencia de poblaciones discretas (demos) con diversos grados de
estructuración ha sido consecuencia de un aislamiento reproductivo dependiente de
barreras para la dispersión, como lo son la distancia en asociación con la conducta de
reproducción en el lugar de origen. Todo lo cual justifica la clasificación de metapoblación
(Harrison, 1991) para cada especie. Esta metapoblación es un sistema de demos en
parche con demos no equilibrados. Entre los demos en parche el flujo genético ha estado
en función de la distancia geográfica y ha sido afectado por eventos de extirpación y
recolonización en tiempos histórico y ecológico. Entre los demos no equilibrados el flujo
DISCUSIÓN______________________________________________________________________________________________
78
genético debió ocurrir en tiempo histórico como resultado de eventos de colonización.
Contrariamente, en E. imbricata la tasa de migración no es dependiente de la distancia
geográfica (Bass et al., 1996; Reece et al., 2005). Como la distribución de haplotipos y
linajes permite reconocer dos agrupaciones en el Mediterráneo americano (Bowen et al.,
2007), una que incluye las poblaciones de anidación continentales del sur y otra a las
isleñas del norte, poblaciones muy distantes geográficamente dentro de un grupo, como
las de México y Costa Rica por una parte y Cuba y Antigua por otra, van a diferir menos
genéticamente
que
las
más
cercanas
geográficamente
pero
pertenecientes
a
agrupaciones diferentes e.g. México y Cuba, y Costa Rica y Puerto Rico. No obstante,
Reece et al. (2005), asumen dentro de cada agrupación un modelo de aislamiento por
distancia, cuyas huellas pudieron alterarse durante los cambios drásticos del Pleistoceno.
Los eventos de recolonización en C. mydas, que afectaron la estructuración genética de
las colonias de anidación del Mediterráneo americano y la costa atlántica de USA,
debieron haber ocurrido antes de la diversificación de(l) (los) linaje(s). Esta interpretación
está en correspondencia con los resultados de la diversidad genética (alto endemismo y
baja a moderada representatividad de los haplotipos derivados) y filogenéticos de clados
anidados (evidencias de colonizaciones, extirpaciones y recolonizaciones en un escenario
con fragmentación histórica del hábitat). Estos resultados también son congruentes con el
bajo flujo genético entre la población de anidación de Tortuguero y las restantes del
Mediterráneo americano con las que al menos se comparte un haplotipo según Allard et al.
(1994), Lahanas et al. (1994) y Bjorndal et al. (2005). Allard et al. (1994) proveen una
alternativa apropiada para explicar los bajos valores de migrantes basada en la retención
de los haplotipos compartidos a partir de un ancestro común, más que por un limitado flujo
de genes.
En C. caretta, la dispersión de un linaje lejanamente emparentado con el linaje vicariante
del Atlántico (ancestro CC-A2), la existencia de un porcentaje de variación mayor dentro
que entre las colonias de anidación, la presencia de una clina de haplotipos en la
península de la Florida, y el bajo porcentaje de endemismo en las poblaciones de
anidación, evidencian que esta especie ha fallado históricamente más a la conducta de
reproducción en el lugar de origen. Probablemente, los fundadores del linaje dispersado
DISCUSIÓN______________________________________________________________________________________________
79
hayan tenido cierto éxito en la colonización de tierras templadas de las altas latitudes
americanas durante los períodos interglaciales, debido al desafío además de largas
distancias, de temperaturas menos cálidas al sur de África. El efecto fundador de este
nuevo linaje sería más apreciable en las áreas no ocupadas por C. caretta (altas latitudes),
que en donde hubieran existido colonias de anidación previamente establecidas
correspondiente al linaje vicariante. Una vez asentado el nuevo linaje tanto al oeste como
al este de la península de la Florida, comenzó una introgresión entre las colonias de
anidación donde ambos linajes se encuentran en frecuencia mayoritaria, dando lugar al
surgimiento de una clina geográfica latitudinal. Estos eventos han ocurrido paralelamente
en ambas costas, lo cual ha provocado falta de estructura genética significativa entre
algunas de las colonias de anidación del noroeste y noreste de la Florida, y entre todas las
colonias del suroeste y sureste. Razón por la cual, la prueba de Mantel no da significativa
cuando se aplica a todas las colonias de USA sin distinción de costa. No obstante,
Encalada et al. (1998) plantean que la relocalización de ovíferas a grandes distancias
puede explicar el alto estimado de migración entre las poblaciones de sitios opuestos de la
península. Sin embargo, los eventos de relocalización mejor documentados han ocurrido
entre playas de anidación adyacentes involucrando unas pocas decenas de kilómetros,
mientras que las que ocurren a largas distancias son menos frecuentes (Richardson,
1982). En estudios de marcación se evidencian movimientos ocasionales de ovíferas entre
playas de anidación (Bjorndal et al., 1983; Dodd, 1988), acentuándose las conductas
filopatría y fidelidad por el sitio de anidación de la especie en tiempo ecológico. La similitud
de la distribución de haplotipos entre playas de anidación ampliamente separadas, quizás
sea un remanente de un proceso histórico de colonización que un indicio de un una
migración paulatina.
V.3 Diversidad genética.
El alto endemismo haplotípico en la población de anidación de C. mydas del suroeste
cubano, algo mayor que el informado para E. imbricata (Bowen et al., 2007), es
consecuencia de la conducta de reproducción en el lugar de origen, reforzada por la
condición de insularidad y la emergencia de la isla durante los períodos interglaciales
antes de que divergieran los linajes de C. mydas (último tercio del Pleistoceno, previo la
última glaciación), al igual que por el mantenimiento de las condiciones para el éxito de la
DISCUSIÓN______________________________________________________________________________________________
80
anidación durante las glaciaciones. Incluso en las colonias de anidación del suroeste
cubano de C. caretta, especie con bajo endemismo en las colonias de anidación y menor
fidelidad por el sitio de anidación, se presenta un haplotipo endémico (CC-A12). El hecho
de que en C. caretta se haya probado una conducta migratoria transoceánica (Bowen et
al., 1995; Bolten et al., 1998) y exista una menor distribución de colonias de anidación en
la cuenca atlántica respecto a C. mydas y E. imbricata, y que estas colonias están
próximas a los circuitos principales de corrientes marinas, podría ser una consecuencia de
que esta especie hace su ciclo de vida a merced de las corrientes marinas. Quizás sea
esta conducta errante la razón por la que falle más a la conducta de reproducción en el
lugar de origen y exista una amplia distribución de haplotipos en contraposición con el
endemismo.
La diversidad haplotípica moderadamente alta de la colonia de anidación de C. mydas en
la cayería San Felipe, a pesar de que sólo comparte dos haplotipos con la colonia de
anidación de Guanahacabibes, proporciona evidencias para considerar a esta colonia
como un sumidero. La población de anidación de la Florida de C. mydas también ha sido
considerada un sumidero de acuerdo con Allard et al. (1994), quienes consideran que ésta
se formó a través de la contribución de otras poblaciones de la región. Esta contribución
debió estar influenciada por factores geomorfológicos y oceanográficos, así como por la
proximidad geográfica a las áreas de anidación fuentes, existentes en tiempo ecológico o
histórico. Es posible también que la población actual sea parte de una gran población que
haya existido en el pasado (Avise et al., 1988; Allard et al., 1994). Sin embargo, para C.
caretta la Cayería de San Felipe se comporta como fuente.
Otras poblaciones de anidación insulares de C. mydas y C. caretta [también en E.
imbricata], que no constituyeron parte de las poblaciones continentales durante las
glaciaciones ni fueron completamente extirpadas durante los períodos interglaciales,
muestran un alto endemismo haplotípico. Las islas volcánicas de Sao Tomé y Príncipe,
cuyo origen está datado entre 13 y 31 MA respectivamente (Lee et al., 1994), no quedaron
sumergidas durante los períodos interglaciales ni sus hábitats fueron afectados
drásticamente por la última glaciación. Consecuentemente, en estas islas sobrevivieron
colonias de anidación de C. mydas y se fijaron mutaciones y haplotipos. La isla de Sao
DISCUSIÓN______________________________________________________________________________________________
81
Tomé constituye probablemente una población fuente (Formia et al., 2002a), no sólo
porque presenta una alta diversidad haplotípica sino porque también es la más alejada de
las poblaciones del continente e islas adyacentes. Otras islas oceánicas, pero de la
cuenca pacífica como los atolones de la Micronesia (Norman et al., 1994; Moritz et al.,
2002) también exhiben un alto endemismo haplotípico y moderada representatividad de
individuos endémicos en C. mydas. En las islas Ogasawara (Japón) y Fragata Francesa
(Hawai), y en el Atolón de Mopelia (Polinesia Francesa), todos los haplotipos de C. mydas
son endémicos (Norman et al., 1994). El endemismo de estas islas está probablemente
relacionado además de con la condición de emergencia durante períodos interglaciales,
con un aislamiento geográfico respecto a las masas terrestres continentales, y a otras islas
con colonias de anidación establecidas. Otro argumento que ratifica esta explicación es
que los haplotipos identificados en las poblaciones de anidación de estas áreas
pertenecen a linajes raros poco diversificados y distribuidos (linajes remanentes).
Adicionalmente, estos haplotipos se diferencian por tres cambios como mínimo respecto al
posible ancestro del linaje más diversificado y distribuido de la cuenca indopacífica (datos
provenientes del análisis de los resultados de Norman et al. (op.cit.) y Moritz et al. (2002)).
En las colonia de anidación de C. caretta del archipiélago de Japón también existe un alto
endemismo haplotípico (Hatase et al., 2002), pero en este caso el endemismo se
corresponde con que estas áreas de anidación son las únicas dentro del circuito migratorio
de la especie. En E. imbricata, la generalidad de las poblaciones de anidación localizadas
en la islas del Mediterráneo americano también tienen alto endemismo haplotípico (Reece
et al., 2005).
Podría resultar contradictorio que la población de anidación de C. mydas de las playas
continentales de Michoacán (México) esté integrada solamente por haplotipos endémicos
(Chassin-Noria et al., 2004). Probablemente, si se pudieran obtener datos moleculares de
otras colonias de anidación distantes de éstas en la costa pacífica de América Central
(e.g. Costa Rica), disminuiría el por ciento de endemismo como consecuencia de
compartirse los haplotipos más distribuidos y mejor representados entre la mayoría de las
colonias de anidación. La ausencia de estructura genética significativa en las colonias de
anidación de Michoacán también podría ser una evidencia de la pérdida de variabilidad
genética y alteración de las frecuencias haplotípicas como consecuencia de la
DISCUSIÓN______________________________________________________________________________________________
82
sobreexplotación de C. mydas en la región. La sobreexplotación ha conllevado a la
extirpación de numerosas colonias y al predominio probabilístico en tiempo ecológico, de
los haplotipos más distribuidos y mejores representados en tiempo histórico. Otro caso
interesante de endemismo continental también se da en la población de anidación de E.
imbricata de Yucatán (Bass et al., 1996; Díaz-Fernández et al., 1999), pero las causas
están propiamente en el circuito particular de corrientes marinas del sur del Golfo de
México (Reece et al., 2005), que entre otras causas, ha posibilitado también la especiación
de Lepidochelys kempii.
Paradójicamente, la Isla Ascensión tiene un alto porcentaje de endemismo haplotípico en
C. mydas a pesar de presentar condiciones aptas para la anidación después de la última
glaciación (Bowen et al., 1992). Este porcentaje probablemente ha sido una consecuencia
de una rápida y reciente colonización según Bowen et al. (op.cit.). La posición geográfica
de la Isla de Ascensión en el medio de la cuenca del Atlántico Sur, con una fuerte
influencia de la corriente Ecuatorial del Sur y la contracorriente, facilitó la colonización. La
baja presión por depredadores en esta isla ha permitido una rápida tasa de crecimiento en
la población (Formia et al., 2002 b). Entonces, ¿es real este porcentaje de endemismo? El
tamaño de la muestra de esta población es aproximadamente el triple de las restantes
poblaciones de anidación, con una alta representatividad de individuos endémicos (>30%),
lo cual aumenta la probabilidad de colectar haplotipos raros dentro de la población. Por
consiguiente, aumenta la diversidad nucleotídica pero no la haplotípica. Esta ha sido la
razón por la cual Encalada et al. (1996) obtienen una diversidad haplotípica similar a la
informada por (Formia et al., 2002 b), con un tamaño de muestra menor, mientras que la
diversidad
nucleotídica
fue
menor.
Probablemente
estos
haplotipos
raros,
que
aparentemente son endémicos, pudieran estar fijados en poblaciones fuentes del Atlántico
Sur. Dado que éstos se presentan en baja frecuencia, la probabilidad de detectarlos es
mínima en muestras pequeñas. También es posible que hayan desaparecido dentro de las
poblaciones originales. En este caso se perdería la condición de fuente de la población de
anidación de Isla Ascensión. Adicionalmente, C. mydas experimenta fallos filopátridos
condicionados por factores oceanográficos y climáticos como el curso de los vientos (Hays
et al., 2003), por lo que esta isla podría comportarse como una población sumidero de las
restantes poblaciones de anidación (fuentes) de la región.
DISCUSIÓN______________________________________________________________________________________________
83
Un efecto similar puede ocurrir con la población de anidación continental de C. mydas en
Tortuguero, cuyo endemismo haplotípico es aparentemente alto (Bjorndal et al., 2005). En
esta población el tamaño de la muestra analizada fue de varios cientos de individuos, lo
cual provoca que aumente la probabilidad de colectar variantes raras o detectar fallos a la
conducta de reproducción en el lugar de origen. La mezcla de linajes obtenida por Bjorndal
et al. (op.cit.) es evidencia de estos fallos, los cuales provocan un incremento de la
diversidad nucleotídica respecto a los valores de diversidad nucleotídica calculados por
Encalada et al. (1996). Este argumento concuerda con la baja representatividad de los
haplotipos endémicos en la población de anidación de Tortuguero. En tal sentido podría
considerarse que la población original pudo experimentar drásticas variaciones
demográficas, sobreviviendo el haplotipo más representado (ancestro del linaje) y otros
raros que pudieron fijarse. Adicionalmente, la población de anidación de Tortuguero puede
tener un comportamiento dual de fuente y sumidero debido a su posición geográfica
intermedia entre las poblaciones de anidación y linajes de la especie en el norte y sur de
América. Sin embargo, el hecho de que la población de anidación de Tortuguero actúe
como sumidero no está respaldado por los resultados estadísticos de expansiones
demográficas históricas obtenidos en el presente análisis.
Contrariamente, la población de anidación de C. mydas en la Isla de Aves no presenta
endemismo haplotípico debido a su reciente colonización (Lahanas et al., 1994) por los
haplotipos más distribuidos y representados en las poblaciones vecinas, que se comportan
como fuentes. La inestabilidad geológica de la isla pudo afectar la supervivencia de las
poblaciones de anidación establecidas (Lahanas et al., op.cit.). La existencia de una
moderada diversidad haplotípica y alta diversidad nucleotídica con tan sólo dos haplotipos,
reafirma una reciente colonización. Esta colonización fue llevada a cabo por los haplotipos
más distribuidos y mejor representados de los linajes presentes en las poblaciones
cercanas geográficamente a la isla. Otras islas cuyas poblaciones de anidación de C.
mydas no tienen haplotipos endémicos como Bioko y Poilao, pudieron haber sido
colonizadas recientemente a partir de una población de anidación más diversa (Formia et
al. 2002a). La ausencia de haplotipos endémicos podría estar relacionada con una alta
dinámica costera en función de un relieve moderadamente bajo en la Isla de Bioko y bajo
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84
en la isla de Poilao, más que con sus recientes orígenes; i.e. volcánico para Bioko (Aka et
al., 2001). Otros factores relacionados con la ausencia de haplotipos endémicos son la
proximidad de estas islas al continente y la vulnerabilidad de las poblaciones de C. mydas
presentes en ellas al impacto de la depredación humana (Formia et al., 2002a). De hecho,
los haplotipos representados en estas islas son de los más distribuidos en el linaje del
Atlántico Sur. El bajo porcentaje de endemismo haplotípico en islas alcanza su mayor
expresión en las islas continentales de la cuenca indopacífica ecuatorial. Éstas estuvieron
conectadas recientemente a tierras continentales de Asia o de Australia, durante la
glaciación del Pleistoceno (Brown & Lomolino, 1998).
La población de anidación de C. mydas de Chipre no se ha considerado para reforzar la
relación entre la condición de insularidad y el endemismo, a pesar de estar integrada por
haplotipos endémicos (Encalada et al., 1996; Kaska, 2000), ya que probablemente se
pierda la condición de endemismo haplotípico cuando sean analizadas muestras de las
colonias de anidación cercanas de Turquía. La colonización de la cuenca del mar
Mediterráneo ha sido reciente (Bowen et al., 1992; Encalada et al., 1996), como
consecuencia del restablecimiento de las condiciones favorables para la anidación de C.
mydas después de la glaciación de Würm. Por esta razón, la antigüedad geomorfológica
de sus áreas de anidación no ha sido evaluada en este análisis. Como los haplotipos de la
población de anidación de Chipre tienen una representatividad similar al resto de las del
Atlántico (una variante altamente representada y otra escasa), y considerando las
relaciones filogenéticas dentro del linaje, al menos el haplotipo “ancestral” de esta
población debió surgir en el Mediterráneo americano y posteriormente haberse fijado en la
cuenca del mar Mediterráneo.
La existencia en la actualidad de dos linajes de C. mydas con distribución parapátrida, uno
en el Atlántico Norte y otro en el Sur (Encalada et al., 1996), a diferencia de C. caretta y E.
imbricata donde son simpátridos, y la baja diversidad nucleotídica evidenciada en las
poblaciones de anidación donde no existe mezcla de linajes, son indicios suficientes que
apoyan la conducta de reproducción en el lugar de origen determinada para C. mydas
(Carr, 1967; Carr et al., 1978; Bowen et al., 1992; Limpus et al., 1992). No obstante,
existen fallos históricos en C. mydas que se evidencian no sólo por la mezcla de linajes en
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85
algunas poblaciones de anidación, sino también por la amplia distribución y alta
representatividad de unos pocos haplotipos dentro de cada linaje en las poblaciones de
anidación donde están representados. En este estudio se trata de los haplotipos CM-A1 y
3. Estos haplotipos separados sólo por un cambio, son respectivamente el ancestro y un
centro de diversificación dentro del linaje mediterráneos americano – Viejo Mundo. En
adición, existen indicios fehacientes de colonización de las poblaciones del linaje
mediterráneos americano – Viejo Mundo por el haplotipo más representado en las
poblaciones norteñas del Atlántico Sur (CM-A5), cuya frecuencia va disminuyendo con la
distancia geográfica en las poblaciones de anidación más distantes con respecto a la
población fuente (Matapica, Surinam) (ver Lahanas et al., 1994; Encalada et al., 1996;
Bjorndal et al., 2005). Este haplotipo junto con el más distribuido y representado en el
linaje mediterráneos americano – Viejo Mundo (CM-A3) recolonizó Isla de Aves (Lahanas
et al., 1994). Estos fallos históricos son los responsables del incremento notable de la
diversidad nucleotídica en las poblaciones donde convergen ambos linajes (Lahanas et al.,
op.cit.). No obstante, la generalidad de los haplotipos tiene distribución restringida a una o
unas pocas poblaciones de anidación (alto endemismo), lo cual acentúa el carácter
limitado e histórico de los fallos a la conducta de reproducción en el lugar de origen en
correspondencia con el modelo de metapoblación probado en el presente estudio para el
Mediterráneo americano.
Chelonia mydas muestra alta fidelidad por el sitio de anidación (Carr, 1967 & 1975;
Pritchard, 1976; Meylan et al., 1990; Limpus et al., 1992) al igual que C. caretta, aunque
esta última falla en el orden de los cinco kilómetros (Bjorndal et al., 1983; Limpus, 1985).
Sin embargo, cuando se analizan genéticamente las colonias de anidación de C. mydas y
C. caretta del suroeste cubano, no se encuentra estructura genética significativa, a pesar
de estar distantes en el orden de los cientos de kilómetros. Similarmente Chassin-Noria et
al. (2004) no encuentran estructura genética significativa para colonias de anidación de C.
mydas separadas en el orden de los 45 km en playas continentales de Michoacán.
Bjorndal et al. (2005) tampoco encuentran significación dentro de poblaciones de tortugas
en secciones de la playa de Tortuguero donde ocurre la anidación, separadas en el orden
de los 29 km. En C. caretta no se encuentra estructura genética significativa entre colonias
de anidación pertenecientes a una misma población de anidación distribuidas en un
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86
intervalo de 150 – 700 km (ver Encalada et al. (1998), Francisco & Bowen (2001) y Hatase
et al. (2002)). Chassin-Noria et al. (2004) considerando los resultados de Encalada et al.
(1996) y FitzSimons et al. (1997) concluyen que la conducta de reproducción en el lugar
de origen en C. mydas opera sólo a grandes escalas geográficas. En contraste, con el
empleo de minisatélites multilocus se encontraron bajos niveles de dispersión de las
ovíferas de C. mydas respecto a los sitios de anidación en Tortuguero (Peare & Parker,
1996), respaldados por una correlación negativa significativa entre la similitud genética por
pares de ovíferas y la distancia entre sus nidos, ya sea dentro de una o entre dos
temporadas. No obstante, Peare & Parker (op.cit.) encuentran altos niveles de dispersión
de ovíferas respecto a los sitios de anidación en Melbourne Beach, Florida. Mediante un
programa de marcación física realizado en esta localidad se demostró fidelidad por el sitio
de anidación dentro y entre épocas reproductoras (Johnson, 1994), por lo que Peare &
Parker (1996) concluyen que los altos niveles de dispersión de las ovíferas en Melbourne
(Florida) han sido consecuencias del aumento de la perturbación antrópica en relación al
continuo desarrollo del lugar.
Los fallos a la filopatría de C. mydas son comunes y en el orden de la docena de
kilómetros. En programas de marcación física donde se han obtenido curvas de saturación
en las playas de anidación, se ha constatado que los fallos a la filopatría durante las
remigraciones son del orden del 15% y hasta el 36% en un radio de 60 km
aproximadamente, en el sur de la Gran Barrera Coralina Australiana (Limpus et al., 1994c)
y en la península de Guanahacabibes (Azanza, com. pers.) respectivamente. El caso más
extremo del fallo durante el proceso de remigración ha sido referido para una ovífera entre
dos islas del Índico Occidental separadas en el orden de los 2000 km (Le Gall & Hughes,
1987). Considerando la existencia de una barrera geográfica entre estas áreas de
anidación (isla continental Madagascar) más que la distancia que las separa, el fallo
producido a la conducta de reproducción en el lugar de origen debe ser clasificado como
filopátrido y no a la fidelidad por el sitio de anidación. De cualquier forma, este tipo de fallo
es un récord, puesto que en otras áreas de anidación con varios programas intensos de
marcación física no se ha detectado. En C. caretta, a pesar de que existe el consenso de
que es poco filopátrida, los fallos a la filopatría dependen mucho de la zona de estudio. En
Australia, durante nueve temporadas de anidación de un programa de marcación –
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87
recaptura, el 98% de las ovíferas se recapturaron en el mismo lugar (Limpus, 1985)
mientras que en Cumberland Island (Georgia, USA) el 51% retornó dentro de los ca. 17
km, el 7% dentro de ca. 50 km y el 42% lo hizo a distancias mayores del sitio de
marcación (Bell & Richardson, 1978). Por otra parte, los fallos durante las reanidaciones
son más bajos, en el orden del 5.3 % para C. mydas en un área de anidación de ca. 50 km
dentro de la península de Guanahacabibes (Azanza, com. pers.).
Ya se han analizado las relaciones entre el endemismo y 1) las distinciones establecidas
para la conducta de reproducción en el lugar de origen según Carr (1975), 2) la limitada
incidencia de los fallos a la fidelidad por el sitio de anidación durante una misma estación
reproductora en comparación con las remigraciones, y 3) la influencia de la geomorfología
y características oceanográficas de las áreas de anidación. No obstante, se considera que
el poder resolutivo y el modo de empleo del marcador molecular son tan importantes como
los aspectos ya mencionados para analizar la condición de endemismo en las colonias/
poblaciones de anidación de tortugas marinas. La tasa de mutación de la RNC del mtDNA
de tortugas marinas es baja (Avise et al., 1992a). Razón por lo cual se considera que para
evaluar la fidelidad por el sitio de anidación debe utilizarse un marcador más variable y por
ende, que modele de manera más realista la dinámica de la población en una escala de
tiempo ecológico, como es el caso de los microsatélites. En el modo de empleo de este
marcador nuclear debe de cuidarse además el número de alelos por locus en relación al
tamaño de la muestra (Kalinowski, 2002), el número de loci (Kalinowski, 2005). También
se conoce que los machos son filopátridos (FitzSimons et al., 1997), pero no se tiene la
certeza de que sean fieles al sitio de anidación en las colonias de anidación cubanas.
Por consiguiente, para estudiar la fidelidad por el sitio de anidación de las ovíferas de
tortuga marina, a partir de un marcador molecular, se deben buscar loci hipervariables,
como los microsatélites, que permitan identificar a cada individuo mediante su genotipaje;
por lo que el marcador podría carecer de valor en estudios genéticos a nivel poblacional.
Igualmente sucedería en el caso de probar la filopatría de una especie de tortuga marina
en la colonia de anidación en un tiempo ecológico y no histórico, donde se impone la
limitante temporal en el esfuerzo de la medición, pues la media y la moda de remigración
son para C. mydas de 2.86±0.23 (Van Buskirk & Crowder, 1994) y 5 (Limpus et al., 1994c)
DISCUSIÓN______________________________________________________________________________________________
88
años respectivamente y para C. caretta de 2.59±0.15 años (Dodd, 1988). Todo lo cual
determina la necesidad de grandes esfuerzos para probar la conducta de filopatría.
El tamaño efectivo de la población también es dependiente de la diversidad genética
(Avise et al., 1988). Por esta razón se obtiene, que el tamaño efectivo de la población de
anidación de C. mydas de Quintana Roo es mayor que el evidenciado en la población de
anidación de Tortuguero, al igual que en la generalidad de las poblaciones de anidación de
C. caretta en relación a las de Quintana Roo, Dry Tortugas y el noreste de la Florida. En
las poblaciones de anidación de Tortuguero y noreste de la Florida de C. mydas y C.
caretta respectivamente, el tamaño efectivo ha sido dependiente del método utilizado.
Cuando la diversidad nucleotídica es baja, el valor del estimador theta se subestima.
Consecuentemente, los tamaños efectivos de estas poblaciones de anidación no se
corresponden con los tamaños censales de hembras. Comúnmente el tamaño efectivo es
menor que el tamaño censal (Nei & Imaizumi, 1966) como consecuencia e.g., de la
superposición de generaciones, y por consiguiente de la estratificación de edades y del
incremento probabilístico de la consanguinidad. El gran tamaño efectivo de la población de
anidación de C. mydas en Quintana Roo puede ser una consecuencia de las entradas a
partir de fuentes vecinas como ha ocurrido con la colonización de Isla de Aves (Lahanas et
al., 1994). Lo mismo sucede con las poblaciones de anidación de C. caretta de la
península de la Florida y con el suroeste de Cuba donde están representados ambos
linajes. Por otro lado, mientras mayor sea el tamaño censal de la población sumidero y
menor la tasa de mutación el efecto de la colonización será menos apreciable (Lahanas et
al., op.cit.), como ha ocurrido en la población de anidación de C. mydas en Tortuguero.
Los cuellos de botella recientes e históricos sobre las poblaciones naturales (Nei & Graur,
1984) y el efecto fundador evidenciado en la colonización y recolonización de playas de
anidación por ovíferas que fallan a la fidelidad por el sitio de anidación (Lahanas et al.,
1994), podrían también reducir drásticamente la diversidad genética y por ende disminuir
el valor del tamaño efectivo de la población.
Las fluctuaciones demográficas en las poblaciones de anidación analizadas podrían
evidenciarse mediante el cumplimiento del modelo de expansión súbita a través de la
distribución desigual de frecuencias, como ocurre con la generalidad de las poblaciones
DISCUSIÓN______________________________________________________________________________________________
89
del linaje de C. mydas del Atlántico Sur (Formia et al., 2002a). Sin embargo, en las
poblaciones de anidación analizadas en ambas especies sólo se cumple para unas pocas
y durante el Pleistoceno, mucho antes de la última glaciación, excepto en las poblaciones
de C. caretta en Dry Tortugas y el noroeste de la Florida donde al parecer ocurrió
después. Consecuentemente, la actual distribución y representatividad de algunas
poblaciones de anidación de C. mydas y C. caretta podrían ser más antiguas que las
informadas por Encalada et al. (1996, 1998) respectivamente. La no correspondencia
entre la prueba de Fu y el modelo de expansión súbita en todos los casos, no proporciona
una dirección acertada sobre como estudiar la demografía histórica de las poblaciones de
anidación en estas especies. La distribución del número observado de diferencias entre
pares de haplotipos mediante el modelo de expansión súbita (Rogers & Harpending, 1992)
es menos potente que la prueba de Fu (Ramos-Onsins & Rozas, 2002), a pesar de que
ésta tiene un comportamiento mejor en muestras grandes (Fu, 1997). No obstante,
¿podrían las poblaciones de C. mydas y C. caretta del Atlántico Norte ajustarse al modelo
de expansión súbita? Si el marcador molecular es selectivamente neutral debe esperarse
que poblaciones en equilibrio no estén bajo selección o que las fuerzas evolutivas estén
compensadas. Es por esto que, si existiera migración no tendría efectos significativos
sobre la distribución de las frecuencias génicas, i.e. una población fuente cuasicerrada. La
historia natural de las tortugas marinas, apoyada por los resultados filogenéticos y
filogeográficos,
se
basa
en
un
efecto
de
colonizaciones
y
recolonizaciones.
Consecuentemente la(s) huella(s) de las fluctuaciones demográficas puede(n) ser
borradas como ha ocurrido en algunas poblaciones de la especie humana (Excoffier &
Schneider, 1999). Los resultados relacionados con el F- Φ ST indican que la diferenciación
entre las poblaciones de anidación de C. mydas y C. caretta se debe a la distribución
(redistribución) de los genes dentro de la población, más que a los cambios de éstos
(mutación). Por consiguiente, la migración ha sido la principal fuerza evolutiva que trazó
los genes en las poblaciones de anidación de estas especies. Esta fuerza evolutiva se
demuestra por fallos históricos en el retorno hacia los sitios natales de reproducción.
Durante el intervalo de remigración una hembra de tortuga marina puede viajar miles de
kilómetros (Luschi et al., 2003). Si esta hembra falla al retornar a su sitio de anidación,
podría contribuir genéticamente a alguna de las colonias de anidación cercanas dentro de
DISCUSIÓN______________________________________________________________________________________________
90
su ruta de migración. Sin embargo, las colonias de anidación tienen algún grado de
endemismo, sobre todo en C. mydas, y en las colonias de anidación localizadas en las
islas, y sus procesos evolutivos se han ajustado al modelo de flujo genético pasarela
(aislamiento por distancia dentro de grupos según Reece et al., 2005). Estas evidencias
demuestran que los fallos a la filopatría están sesgados con la distancia. Si la ovífera no
encuentra condiciones mínimas para anidar en el área donde nació entonces buscará otra
área de anidación cercana. Estos fallos pueden ser considerados una consecuencia de la
supervivencia más que fallos inherentes a la conducta de reproducción en el lugar de
origen de la especie. De hecho, Encalada et al. (1996) dudaron de la capacidad de
supervivencia de C. mydas y C. caretta en áreas de anidación en altas latitudes durante
los períodos de glaciación, donde no anida E. imbricata ni en la actualidad (Mortimer &
Donnelly, 2007). No obstante, los fallos a la filopatría ocurren e.g., las variaciones clinales
no sólo de C. caretta en la península de la Florida, sino la del haplotipo CM-A5 de C.
mydas, cuya frecuencia aumenta con la disminución en la latitud y por consiguiente, con la
disminución de la distancia geográfica entre las poblaciones de anidación considerando la
población fuente de Surinam (ver Lahanas et al. (1994) y Encalada et al. (1996)). Teniendo
en cuenta todo lo anteriormente dicho, no debe de esperarse que el modelo de expansión
súbita se ajuste para las poblaciones de anidación de C. mydas y C. caretta bajo los
escenarios demográficos siguientes: I) un fuerte evento fundador de los haplotipos más
distribuidos y mejor representados en cada uno de los linajes; II) redistribución de
individuos como consecuencia de cambios drásticos que ocurrieron durante el
Pleistoceno; III) una ruptura de las colonias como consecuencia de la colonización
europea y IV) una combinación de todos los escenarios anteriores.
V.4 Relaciones filogenéticas y filogeográficas.
En las colonias de anidación cubanas de C. caretta se presentan dos linajes, ampliamente
representados en la cuenca atlántica al igual que ocurre con E. imbricata (Okayama et al.,
1999). Únicamente en C. caretta éstos no están emparentados naturalmente (Encalada et
al., 1998; Bowen et al., 2007). Contrariamente, en C. mydas, sólo se presenta un linaje de
los dos naturalmente emparentados de la cuenca atlántica (Encalada et al., 1996; Bowen
et al., op.cit.).
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91
La elección del haplotipo CM-A1 como ancestro del linaje de C. mydas de los
mediterráneos americano – viejo mundo y costa atlántica de la península de la Florida,
contrasta con el hecho de que el haplotipo CM-A3 es el más distribuido y representado en
las poblaciones de anidación del Mediterráneo americano. El número de cambios
significativamente alto entre los haplotipos externos y CM-A1, al igual que la posición
intermedia del mismo considerando los otros dos centros de diversificación, han influido en
la identificación de este haplotipo como ancestro del linaje. En el linaje análogo de C.
caretta, la identificación del haplotipo ancestral fue sencilla porque existe un solo centro de
diversificación. Sin embargo, en el otro linaje el análisis es más complejo porque existen
tres centros de diversificación y sólo el haplotipo CC-A1 está ampliamente distribuido y
representado. Considerando que este linaje tiene una amplia distribución en las altas
latitudes, disminuyendo su representatividad hacia las zonas subtropicales, que ha sido un
colonizador reciente, y que su diversificación muestra claramente dos sub-linajes (Bowen
& Kart, 2007) a partir de los cuales ocurrió la derivación de los haplotipos concomitantes
en el tiempo; el haplotipo ancestral dentro de éste debe ser aquel que tenga una posición
intermedia e interna, i.e. el haplotipo CC-A11.
La divergencia reciente (durante el Pleistoceno Superior) entre los haplotipos de las
poblaciones de anidación del Mediterráneo americano para estas tortugas marinas está en
correspondencia con las pocas mutaciones que separan a la generalidad de éstos del
haplotipo ancestral dentro de cada linaje. Esta característica es común al linaje del
Atlántico Sur de C. mydas (Formia et al., 2002a) y también en E. imbricata (Okayama et
al., 1999; Bowen et al., 2007). No obstante, esta divergencia ocurrió mucho antes de la
separación de las actuales poblaciones de anidación en C. mydas. En C. caretta la
definición de las identidades poblacionales aparentemente ocurrió antes de la
diversificación de los haplotipos, lo cual implicaría un apreciable porcentaje de endemismo
haplotípico de los haplotipos menos representados dentro de cada linaje, aunque
supuestamente la especie fallara frecuentemente a la conducta de reproducción en el
lugar de origen en un intervalo de distancia del orden de los miles de kilómetros. La
presencia de dos linajes no emparentados naturalmente en estas poblaciones de
anidación ha sido la causa fundamental del incremento en la divergencia de secuencias.
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92
Las poblaciones de anidación de estas especies comparten con mayor representatividad
los haplotipos más distribuidos del linaje (incluido el ancestro) como consecuencia de: I)
eventos históricos de dispersión (colonización y recolonización), a partir de los cuales se
fundaron las colonias de anidación con los haplotipos más distribuidos y mejor
representados en la región, II) fluctuaciones demográficas en demos establecidos que
facilitaron la diversificación y la fijación de variantes haplotípicas reconocidas como
endemismos de baja representatividad, y III) eventos de dispersión en tiempo ecológico
(recolonización) entre colonias de anidación vecinas localizadas a lo largo de costas
continentales afectadas por semejantes procesos oceanográficos. Las primeras dos
causas responden a eventos que ocurrieron durante la época geológica, que devinieron en
la composición actual y la estructura poblacional con mayores diferencias dentro que entre
poblaciones de anidación de la región como consecuencia de un flujo genético restringido
con aislamiento por distancia. Por supuesto, no se han obviado las dispersiones en tiempo
ecológico provocadas por fallos a la conducta filopátrida de la especie, que atentan en
contra del endemismo poblacional. Sin embargo, este tipo de dispersión ha sido menos
frecuente y de ritmo lento entre las colonias de anidación localizadas en áreas de
anidación separadas ya sea geomorfológicamente o por condiciones oceanográficas
particulares, pudiéndose evidenciar en clinas a lo largo de las costas oeste y este de la
península de la Florida para C. caretta (haplotipos CC-A1 y 2) y en la costa norte de
Suramérica hasta Mesoamérica para C. mydas (haplotipo CM-A5) y en la baja diversidad
nucleotídica en la generalidad de las poblaciones de anidación que sólo están integradas
por un linaje o por una representatividad mayoritaria de uno de los linajes que se presenta.
Resulta interesante que en la cuenca del mar Mediterráneo sólo se encuentren haplotipos
de los linajes del Mediterráneo americano para ambas tortugas marinas, lo cual concuerda
con el sistema de corrientes marinas (corrientes de la Florida, el Golfo y las de Azores y
Portugal, además de las corrientes de Canarias y contracorriente Subtropical), que
conecta ambos mediterráneos después de la constitución del istmo de Panamá. En C.
mydas son endémicos, mientras que en C. caretta se comparten en su mayoría con el
Mediterráneo americano. No es de extrañar la representación del mismo linaje en C.
mydas porque en el Mediterráneo americano es evidente la presencia histórica del linaje
homónimo, con recientes colonizaciones del linaje Atlántico Sur cuyo aporte es
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93
despreciable en el análisis. La interpretación de la asociación geográfica de los haplotipos
en los clados integrados por las poblaciones de anidación de C. mydas en Chipre y
Quintana Roo, revela una antigua relación entre el centro de diversificación CM-A13 y las
poblaciones de anidación americanas. No obstante, el tiempo de diversificación de los
haplotipos de Chipre no difiere del resto de los haplotipos del linaje y es más antiguo que
la fecha en que los hábitat quedaron disponibles para la anidación de C. mydas dentro de
la cuenca del mar Mediterráneo, i.e. después de la glaciación de Würm (Encalada et al.,
1996). Adicionalmente, en la cuenca del mar Mediterráneo no anidan el ancestro (CM-A1)
ni el haplotipo más distribuido y representado del linaje (CM-A3). Consecuentemente, el
haplotipo CM-A13, debió ser originado en alguna población de anidación del Mediterráneo
americano. Entonces se puede interpretar, que la presencia de haplotipos endémicos en la
población de anidación de Chipre se debe a la fijación de genes en la cuenca del mar
Mediterráneo. Actualmente, el haplotipo CM-A13 es probablemente raro dentro de las
colonias de anidación estudiadas o poco frecuente en otras poblaciones que aún no han
sido estudiadas con marcadores moleculares en el Mediterráneo americano, una
combinación de estas dos variantes o simplemente pertenece a colonias de anidación que
se han extinguido en la actualidad. De hecho, este haplotipo fue encontrado en hábitats de
desarrollo en la parte este-central de la Florida (Bagley, 2003). Estas alternativas podrían
explicar de manera más convincente la presencia de haplotipos endémicos en otras
poblaciones localizadas en áreas de anidación con hábitat inestables para el éxito
reproductor durante las glaciaciones, más que la concepción de una gran población
ancestral (panmicta) en la Florida como sugiere Allard et al. (1994).
En C. caretta el análisis se hace complejo, pues asalta la polémica de no estar
representados ambos linajes en la cuenca del mar Mediterráneo. La colonización de esta
cuenca según Bowen et al. (1993, 1994), debió ser después de concluir la última
glaciación (10 000 A) en correspondencia con la limitante de las bajas temperaturas para
el éxito reproductor de la especie, la representación única del linaje mediterráneos
americano – Viejo Mundo, y la divergencia por una sola mutación entre el haplotipo
endémico CC-A6 del ancestro (CC-A2). No obstante, la especie pudo establecerse
durante los períodos glaciales en el sur de la Florida, no así en las actuales locaciones de
Georgia, Carolina del Sur y Carolina del Norte, donde el establecimiento del linaje Atlántico
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94
– península de la Florida debió ser concomitante con la colonización de la cuenca del mar
Mediterráneo (Bowen et al., 1993; Encalada et al., 1998). Esto se corrobora con la baja
diversidad genética de las colonias establecidas en estas latitudes como consecuencia de
sucesivos cuellos de botellas (Bowen et al., op.cit.; Encalada et al., op.cit.). Considerando
la hipótesis filogeográfica de Encalada et al. (1998), surge la interrogante de por qué, si el
linaje Atlántico – península de la Florida sólo se presenta con radiación exitosa en las
colonias de latitudes más altas y estaba establecido previamente en la cuenca atlántica,
no fue el colonizador de la cuenca del mar Mediterráneo. Sólo queda pensar en que una
vez concluida la Glaciación de Würm, cuando el mar comenzó a reestablecer los niveles
actuales, hubo un gran influjo hacia el mar Mediterráneo que arrastró numerosos
migrantes correspondientes a las colonias de anidación posicionadas en mejores
condiciones en el Mediterráneo americano y por consiguiente, con mayores tamaños
poblacionales. Estos debieron pertenecer probablemente al haplotipo más distribuido y
representado, también ancestro del linaje mediterráneos americano – Viejo Mundo. Esta
explicación concuerda con la presencia actual del haplotipo CC-A1 en las pesquerías del
mar Mediterráneo, luego de aumentar los tamaños censales en las colonias de anidación
norteñas del Mediterráneo americano. En C. mydas debió ocurrir de forma similar, pero
como es una especie más tropical debió experimentar una baja tasa de supervivencia, que
por deriva fijó aleatoriamente algún haplotipo representado en los migrantes.
V.5 Implicaciones para la conservación.
Las poblaciones de anidación cubanas de C. mydas, al igual que las de E. imbricata
(Espinosa et al., 2004), constituyen una población de variantes genéticas relictas dentro
del Mediterráneo americano, con alto endemismo genético y moderada representatividad
de individuos endémicos. Las colonias de anidación de C. caretta del suroeste cubano
también constituyen una población de anidación independiente, con la presencia de un
haplotipo endémico. Por consiguiente, ambas poblaciones deben ser consideradas como
MUs, al igual que otras en el Mediterráneo americano (Karl & Bowen, 1999), siguiendo los
criterios de Moritz (1994) y Allendorf & Luikart (2007). Estas MUs deberán tenerse en
cuenta operativamente en las estrategias de los planes de manejo tanto nacionales como
regionales de estas especies, cuya función contribuya a la preservación de la diversidad
genética y de la supervivencia de estas poblaciones de anidación.
DISCUSIÓN______________________________________________________________________________________________
95
Las colonias de anidación que conforman a estas poblaciones, al igual que otras
poblaciones de tamaño discreto, han funcionado como reservorios genéticos durante
eventos que han provocado la extirpación de grandes poblaciones de anidación como
sugiere Lahanas et al. (1994) para C. mydas. Consecuentemente, deben recibir igual
atención en los programas de conservación de estas especies, aunque los tamaños
censales de ovíferas de las poblaciones de anidación cubanas no clasifiquen entre los
más representativos de las áreas de anidación de la cuenca atlántica según Dodd (1988) y
Seminoff (2002).
Algunos de los haplotipos endémicos de la población del suroeste cubano eran de origen
desconocido (C. mydas: CM-A48 según Bagley (2003); CM-A27 y 28 según Bjorndal &
Bolten (inscritos en el GenBank 2001); C. caretta: CC-A12 (Bolten et al., 1998). Los
haplotipos de C. mydas fueron encontrados en áreas de desarrollo del este central de la
Florida por Bagley (2003), y el de C. caretta en similares áreas pero de Madeira por Bolten
et al. (1998). Los haplotipos CM-A27 y 28 también se encontraron en áreas de forrajeo en
Carolina del Norte (Bass, 1999). Conociéndose la población de anidación a la que
pertenecen estos haplotipos se podrá calcular de forma más realista la contribución de las
poblaciones de anidación a los hábitat marinos de agregación de estas especies, algunos
de éstos usados consultivamente (Campbell, 2003). Consecuentemente, este resultado
también contribuye además de al conocimiento del nicho, al de la ruta migratoria de
cualquier individuo identificado con un haplotipo endémico cubano durante su ciclo de vida
en el Mediterráneo americano. Todo esto provee una oportunidad para la colaboración
científica nacional e internacional y para el manejo sostenible de estas especies y sus
hábitat.
Finalmente, los resultados de este trabajo también aportan información útil para el diseño
de áreas marinas protegidas (MPAs) en Cuba encaminadas a la conservación de estas
tortugas marinas en declive (Seminoff, 2002), integrando los hábitat que usa en función del
nicho y considerando el potencial evolutivo de sus demos dentro del genofondo de la
metapoblación regional. Estos criterios también son relevantes para el diseño de MPAs
(Bowen & Roman, 2005), aunque la generalidad de éstas son planeadas siguiendo sólo
DISCUSIÓN______________________________________________________________________________________________
96
criterios ecológicos en función de ecosistemas particulares. El diseño de MPAs que
contemple la conservación de especies migratorias como las tortugas marinas requiere,
por la complejidad del ciclo de vida de éstas, integración de conocimientos en los campos
de la filogenia, ecología y evolución para garantizar su efectividad; por lo que el modelo
Orlog (Bowen & Roman, op.cit.) podría ser una guía eficaz para lograr la meta.
CONCLUSIONES__________________________________________________________________________________________
97
VI. CONCLUSIONES.
1. Las colonias de anidación de C. caretta y C. mydas del suroeste de Cuba
constituyen una población panmicta, como consecuencia de un amplio flujo
absoluto de migrantes (fallos a la conducta de reproducción en el lugar de origen en
tiempo histórico y ecológico) dentro de áreas geográficas con historia y patrones
físicos comunes, por consiguiente el archipiélago de los Canarreos y la península
de Guanahacabibes deben de tenerse en cuenta como una unidad territorial para el
diseño de áreas protegidas marinas en función de la conservación de las tortugas
marinas.
2. Las poblaciones de anidación de C. caretta y C. mydas del suroeste de Cuba
muestran estructura genética significativa respecto a las poblaciones de anidación
del Mediterráneo americano, como consecuencia de un flujo de migrantes
restringido entre colonias de anidación vecinas (fallos históricos a la conducta de
reproducción en el lugar de origen, que llegan a describir clinas) en
correspondencia con el modelo evolutivo pasarela, por lo que constituyen
identidades poblacionales con independencia en el tiempo ecológico, que deben ser
manejadas particularmente para evitar pérdida de la variabilidad genética dentro de
cada especie.
3. Las poblaciones de anidación de C. caretta y C. mydas del suroeste de Cuba tienen
un endemismo relativamente alto, mayor en C. mydas, porque a pesar de que las
especies fallan a la conducta de reproducción en el lugar de origen, los fallos suelen
ser más frecuentes en áreas costeras continuas (continentales), afectadas por
patrones oceanográficos comunes, que entre áreas discontinuas (islas), que no
formaron partes de otros territorios durante los períodos interglaciales del
Pleistoceno.
4. La población de anidación del suroeste de Cuba de C. caretta presenta alta
diversidad genética en comparación con las demás poblaciones de la cuenca
atlántica, mientras que la de C. mydas sólo tiene alta diversidad haplotípica, como
consecuencia de dispersiones de los haplotipos más distribuidos y representados
de los linajes, que constituyeron fallos históricos a la conducta de reproducción en
el lugar de origen que han “borrado” las huellas de expansiones demográficas. La
baja diversidad nucleotídica en la población de anidación de C. mydas es
CONCLUSIONES__________________________________________________________________________________________
98
consecuencia directa de la presencia histórica de un solo linaje en el Mediterráneo
americano.
5. Las poblaciones de C. caretta y C. mydas del suroeste de Cuba son tan antiguas
como las continentales, y las de otras islas que no quedaron sumergidas durante el
Pleistoceno, porque tienen en cada especie no sólo los haplotipos más distribuidos
y representados sino diversos haplotipos (algunos endémicos) de los linajes
existentes en el Mediterráneo americano, cuyas frecuencias son significativamente
diferentes.
RECOMENDACIONES_______________________________________________________________________________________________
99
VII. RECOMENDACIONES.
•
Emplear el concepto de poblaciones de anidación cubanas de C. mydas y C. caretta, sobre
la base de los resultados de esta tesis en las políticas de manejo y en el diseño o rediseño
de áreas protegidas marinas en el archipiélago de Cuba.
•
Determinar las contribuciones genéticas de las poblaciones de anidación cubanas de C.
mydas y C. caretta a las áreas marinas de agregación de la cuenca atlántica, así como a
las zonas de pesquerías cubanas para cuantificar la presencia de las poblaciones de
anidación cubanas en los agregados marinos con vistas a evaluar el impacto del manejo
sostenible de las poblaciones fuentes.
•
Estudiar comparativamente la estructura, diversidad y relaciones genéticas de las colonias
de anidación de C. mydas y C. caretta en los archipiélagos Jardines de la Reina y del Rey
con las poblaciones de anidación caracterizadas en el presente trabajo.
•
Emplear microsatélites como marcador molecular para el estudio de la estructura de las
colonias de anidación cubanas de tortugas marinas en tiempo ecológico, lo cual incluiría la
aportación genética de los machos, así como de las contribuciones de estas colonias a las
áreas marinas de agregación alrededor del archipiélago.
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AUTOBIBLIOGRAFÍA
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codificadora del DNA mitocóndrico en Caretta caretta y Chelonia mydas del suroeste
de Cuba: Una perspectiva regional. Rev. Invest. Mar. 29(3):pp pendiente.
Publicaciones que integrarán contenidos de la tesis:
-Ruiz, A., J. Azanza, E. Pérez, F. A. Abreu, F. B. Riverón, M. González, R. Díaz, J. M.
Alvarez, M. Jager, M. E. Ibarra, & G. Espinosa (Corresponding author). 2008.
Population genetic structure of American Mediterranean green turtles (Chelonia
mydas) based on mitochondrial DNA sequences, with an emphasis on rookeries from
southwestern Cuba. Conservation Genetics (bajo re-revisión).
- Ruiz, A., Y. Pereira, E. Quezada, E. Pérez, M. González, J. Solano, E. Fonseca, B. J.
Hernández, M. A. González, S. Tobenas, & M. E. Ibarra. Proceso de anidación de
tortuga verde (Chelonia mydas) en Cayo Real, Archipiélago de los Canarreos, Cuba.
(en preparación).
Otras publicaciones relacionadas con el tema:
-Azanza, J., Y. Ruisanchez, M. E. Ibarra, A. Ruiz, & C. Y. Luis. 2006. Indicadores del
éxito reproductivo de la tortuga verde (Chelonia mydas) en tres playas de la
Península de Guanahacabibes, Pinar del Río, Cuba. Rev. Inv. Mar. 27 (1): 69-79.
-Frías, R., A. Ruiz, Y. Pérez, & G. Espinosa. 2006. Resolución de secuencias de la
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imbricata. Rev. Cub. Quím. XIX (1): ISSN 0258-5595.
-Equipo editorial. 2006. GeoJuvenil, Cuba. Editorial Abril. 165 pp.
Secuencias inscritas en el Genbank:
-Espinosa, G., J. Azanza, A. Ruiz, M. Jager, J. M. Alvarez, & J. Deutsch. 2003.
AJ543730.
Chelonia
mydas
mitochondrial
partial
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GenBank
(http://ncbi.nlm.nih.gov).
-Espinosa, G., J. Azanza, A. Ruiz, M. Jager, J. M. Alvarez, & J. Deutsch. 2003.
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-Espinosa, G., J. Azanza, A. Ruiz, M. Jager, J. M. Alvarez, & J. Deutsch. 2003.
AJ543735.
Chelonia
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mitochondrial
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D-loop.
GenBank
(http://ncbi.nlm.nih.gov).
Trabajos presentados en eventos científicos relacionados con el tema de tesis:
-Espinosa, G., J. Azanza, A. Ruiz, M. Jager, R. Díaz, E. García, & J. M. Álvarez. 2002.
Population genetics and molecular evolution of mtDNA non-coding region in Cuban
nesting colony of Green Turtle Chelonia mydas. Molecular Evolution Meeting,
Sorrento, Italy. Libro de Resúmenes.
-Ruiz, A., Y. Pereira, E. Quezada, E. Pérez, M. González, J. Solano, E. Fonseca, B.
Hernández, M. A. González, S. Tobenas, & M. E. Ibarra. 2002. Proceso de
anidamiento de Chelonia mydas en Cayo Real, Archipiélago de los Canarreos, Cuba.
Taller Internacional “Proyecto Universitario para el estudio y conservación de las
tortugas marinas, Cuba.
-Espinosa, G., A. Ruiz, J. Azanza, A. Ramos, R. Díaz, E. García, & M. E. Ibarra. 2003.
Genética de poblaciones de tortugas marinas utilizando un marcador de mtDNA.
Primer Taller Nacional de Tortugas Marinas. Centro de Inspección y Control
Ambiental, Ministerio de Ciencia, Tecnología y Medio Ambiente.
-Ruiz, A., J. Azanza, A. Ramos, R. Díaz, E. García, M. E. Ibarra, & G. Espinosa. 2003.
Filogeografía de tortugas marinas utilizando un marcador de mt DNA. Primer Taller
Nacional de Tortugas Marinas. Centro de Inspección y Control Ambiental, Ministerio
de Ciencia, Tecnología y Medio Ambiente.
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-Ruiz, A., J. Solano, J. Azanza, T. Pérez, R. Díaz, M. E. Ibarra, & G. Espinosa. 2004.
Implicaciones de la genética poblacional de una muestra cubana de colonias de
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Cuba (Este proceso se realizó paralelo al evento nacional ECOJOVEN 2005).
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Guanahacabibes, Cuba: La participación de las comunidades locales en la
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T. Rodríguez, D. A. Hernández, A. Rosado. I. Hernández, & A. Ruiz. 2005. Avances
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Loreto, Baja California Sur, México. Libro de resúmenes.
-Lee, I., J. L. Fals, M. Camps, J. Azanza, E. Pérez, J. Rodríguez, A. M. Rodríguez, G.
Espinosa, M. E. Ibarra & A.Ruiz (corresponding author). 2008. Characterization of the
fishing stock of sea turtles in Jardines del Rey (Cuba). 28th Annual Symposium on
Sea Turtle Biology and Conservation, Loreto, Baja California Sur, México. Libro de
resúmenes.
-Pérez, E., A. Ruiz (corresponding author), I. Lee, A. Sanz, G. Espinosa & M E. Ibarra.
2008. Relationship among size and reproductive condition in the fishing stock of
Eretmochelys imbricata in Jardines del Rey (Cuba). 28th Annual Symposium on Sea
Turtle Biology and Conservation, Loreto, Baja California Sur, México. Libro de
resúmenes.
-Ruiz, A., R. C. Frías, F. A. Abreu, J. Azanza, I. Lee, R. Díaz, M. E. Ibarra & G.
Espinosa (corresponding author). 2008. Variación temporal de la población de
anidación de Eretmochelys imbricata en el Archipiélago Jardines de la Reina y su
contribución temporal al agregado pesquero del Archipiélago Jardines del Rey
(Cuba). 28th Annual Symposium on Sea Turtle Biology and Conservation, Loreto,
Baja California Sur, México. Libro de resúmenes.
-Ruiz, A, M. Vega, F. B. Riverón, F. A. Abreu, J. Solano, T. Pérez, E. Pérez, J. Azanza,
R. Frías, R. Díaz, M. E. Ibarra & G. Espinosa (corresponding author). 2008. Genetic
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Conservation, Loreto, Baja California Sur, México. Libro de resúmenes.
-Rodríguez, J., I. Lee, J. L. Fals, M. Camps, E. Pérez & A. Ruiz (autor por
correspondencia). 2008. ¿Las especies de tortugas marinas constituyen un solo
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Libro de Resúmenes.
-Rodríguez, J., I. Lee, J. L. Fals, M. Camps, E. Pérez & A. Ruiz (autor por
correspondencia). 2008. Fluctuación temporal de las frecuencias de tortugas marinas
(Caretta caretta, Chelonia mydas y Eretmochelys imbricata) en las capturas de la
zona D (Jardines del Rey, Cuba). VIII Congreso Latinoamericano de Herpetología,
Varadero, Cuba. Libro de Resúmenes.
-Lee,I., M. Navarro, E. Pérez, R. Ramos, G. González & A. Ruiz. 2008. Costo- beneficio
del uso histórico de las tortugas marinas en Nuevitas (Camagüey), Cuba. VIII
Congreso Latinoamericano de Herpetología, Varadero, Cuba. Libro de Resúmenes.
-Lee, I., J. L. Fals, M. Camps, E. Pérez, J. Rodríguez & A. Ruiz (autor por
correspondencia). 2008. Características fenotípicas de las capturas históricas de
tortugas marinas (Caretta caretta, Chelonia mydas y Eretmochelys imbricata) en la
zona d (Jardines del Rey, Cuba). VIII Congreso Latinoamericano de Herpetología,
Varadero, Cuba. Libro de Resúmenes.
-Ruiz, A., F. A. Abreu, G. Ramírez & G. Espinosa. 2008. Implicaciones del número de
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sumideros de tortugas marinas. VIII Congreso Latinoamericano de Herpetología,
Varadero, Cuba. Libro de Resúmenes.
-Ruiz, A., F. B. Riverón, T. Pérez, F. A. Abreu, R. Díaz & Georgina Espinosa López
(autor por correspondencia). 2008. Filogenia y filogeografía de tortugas marinas del
archipiélago cubano en un contexto regional. VIII Congreso Latinoamericano de
Herpetología, Varadero, Cuba. Libro de Resúmenes.
-Ruiz, A, F. B. Riverón, M. Vega, M. González, J. Solano, R. Frías, E. Pérez, F. A.
Abreu, R. Díaz & G. Espinosa
(autor por correspondencia). 2008. Genética
poblacional de tortugas marinas del archipiélago cubano en un contexto regional. VIII
Congreso Latinoamericano de Herpetología, Varadero, Cuba. Libro de Resúmenes.
-Lee, I., J. L. Fals, M. Camps, E. Pérez, J. Rodríguez & A. Ruiz (autor por
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-Frias, R. C., G. Espinosa, E. Pérez, F. B. Riverón, F. A. Abreu, T. Pérez, J. Solano, M.
González, R. Díaz & A. Ruiz (autor por correspondencia). 2008. Secuencias
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Herpetología, Varadero, Cuba.
-Espinosa, G., A. Ruiz, F. A. Abreu, R. Frias, J. Azanza, I. Lee, R. Díaz, M. E. Ibarra, G.
Ramírez, R. Briceño. 2008. El DNA mitocóndrico como marcador molecular para
estimar las contribuciones de fuentes a sumideros en la tortuga carey (Eretmochelys
imbricata). VIII Congreso Latinoamericano de Herpetología, Varadero, Cuba.
-Pérez, E., I. Lee, N. Almaguer, A. Sanz, G. Espinosa & A. Ruiz (autor por
correspondencia).
Eretmochelys
2008.
imbricata
Morfofisiología
(Testudinata:
folicular
comparativa
Cheloniidae),
Alligator
en
reptiles:
mississipiensis
(Crocodylia: Alligatoridae) y Anolis porcatus (Squamata: Polychrotidae). VIII
Congreso Latinoamericano de Herpetología, Varadero, Cuba.
-Pérez, E., I. Lee, N. Almaguer, A. Sanz, G. Espinosa & A. Ruiz (autor por
correspondencia). 2008 ¿La presencia de espermatogénesis es sinónimo de
madurez
sexual
en
tortugas
Herpetología, Varadero, Cuba.
marinas?
VIII
Congreso
Latinoamericano
de