MEMORIA DE ACTIVIDADES 2014 INSTITUTO UNIVERSITARIO DE BIOLOGÍA MOLECULAR (IUBM-UAM) 1 INDICE Personal Departamentos de investigación del IUBM en el CBMSO 2) Departamento de Biología Celular e Inmunología 3 5 6 1.1 Grupo de “GLICOGENÓMICA FUNCIONAL” 1.2 Grupo de “INTERACCIÓN CITOESQUELETO-MEMBRANA PLASMÁTICA” 1.3 Grupo de “GENÉTICA DE LA SUSCEPTIBILIDAD EN ENFERMEDADES COMPLEJAS. LÍNEA PRINCIPAL: LINFOMAS LINFOBLÁSTICOS DE CÉLULAS T. LÍNEA SECUNDARIA: ENFERMEDADES PSIQUIÁTRICAS MAYORES” 1.4 Grupo de “REGULACIÓN Y FUNCIÓN DE MEDIADORES PROINFLAMATORIOS Y SU IMPLICACIÓN EN ENFERMEDADES DE ETIOLOGÍA INFLAMATORIA E INMUNE” 1.5 Grupo de “ACCIONES DE LOS PROSTANOIDES EN PROCESOS INFLAMATORIOS” 1.6 Grupo de “MECANISMOS DE SEÑALIZACIÓN Y REGULACIÓN DE RECEPTORES ACOPLADOS A PROTEÍNAS G“ 1.7 Grupo de “CÉLULAS TRONCALES TUMORALES” 2) Departamento de Virología y Microbiología 2.1 Grupo de “BASES MOLECULARES DE LA PATOGENIA Y DEL POTENCIAL ANTI-CÁNCER DE LOS PARVOVIRUS” 2.2 Grupo de “BIOLOGÍA MOLECULAR DE EXTREMÓFILOS” 2.3 Grupo de “BIOTECNOLOGÍA Y GENÉTICA DE BACTERIAS TERMÓFILAS EXTREMAS” 2.4 Grupo de “EXPRESIÓN GÉNICA EN STREPTOMYCES Y LEVADURAS” 2.5 Grupo de “INGENIERÍA DE VIRUS Y NANOTECNOLOGÍA” 2.6 Línea de “ESTRUCTURA DEL mRNA Y CONTROL TRADUCCIONAL EN SISTEMAS BIOLÓGICOS” 11 3) Departamento de Neurobiología Molecular 3.1 Grupo de “NEUROTRANSPORTADORES DE GLICINA: ESTRUCTURA MOLECULAR, BIOGÉNESIS Y REGULACIÓN “ 3.2 Grupo de “BASES GENÉTICAS DE LA ENFERMEDAD DE ALZHEIMER: ESTUDIO GENÓMICO DE MODELOS CELULARES PATOGÉNICOS.” 3.3 Grupo de “REPARACIÓN NEURONAL Y TERAPIA MOLECULAR EN NEURODEGENERACION. ATAXIAS ESPINOCEREBELOSAS” 3.4 Grupo de “BASES MOLECULARES DE LA PLASTICIDAD NEURONAL” 3.5 Grupo de “BASES MOLECULARES DE LAS SINAPSIS GLUTAMINÉRGICAS: ESTUDIO DE LOS TRANSPORTADORES DE GLUTAMATO Y GLICINA” 3.6Grupo de “BIOLOGÍA DE CÉLULAS TRONCALES NEURALES HUMANAS. POTENCIAL PARA REPOSICIÓN CELULAR Y TERAPIA GÉNICA EN NEURODEGENERACIÓN” 3.7 Grupo de “SEÑALIZACIÓN MITOCONDRIAL DEL CALCIO Y SEÑALIZACIÓN DE INSULINA / LEPTINA EN ENVEJECIMIENTO” 4) Departamento de Dinámica y Función del Genoma 15 21 4.1 Grupo de “PROTEINAS VIRALES QUE ALTERAN LA EXPRESION GENÉTICA” 4.2 Grupo de “BIOGÉNESIS Y FUNCIÓN DE LA MITOCONDRIA Y SU REPERCUSIÓN EN PATOLOGÍA” 4.3 Grupo de “REGULACIÓN POST-TRANSCRIPCIONAL DE LA EXPRESIÓN GÉNICA EN LEVADURAS” 4.4Grupo de “REGULACIÓN DE LA EXPRESIÓN GÉNICA EN LEISHMANIA“ 4.5 Grupo de “BASES MOLECULARES DE LAS ENFERMEDADES METABÓLICAS HEREDITARIAS E INVESTIGACIÓN EN NUEVAS TERAPIAS” Investigadores del IUBM trabajando en líneas de investigación dirigidas por miembros del CSIC o desarrollando el trabajo experimental fuera del CBM 25 Proyectos de Investigación dirigidos por miembros del IUBM Publicaciones Científicas IUBM durante 2014 Tesis Doctorales dirigidas o tutoradas por miembros del IUBM durante 2014 31 35 43 2 PERSONAL INVESTIGADOR DEL INSTITUTO UNIVERISITARIO DE BIOLOGÍA MOLECULAR ALMENDRAL DEL RIO, JOSE MARÍA ALVAREZ GÓMEZ, ENRIQUE AMILS PIBERNAT, RICARDO ARAGÓN RUEDA, CARMEN BENÍTEZ MORENO, MARÍA JOSÉ BERENGUER CARLOS, JOSÉ BLANCO GANVAN, NOELIA BERLANGA CHIQUERO JUAN JOSÉ BOGÓNEZ PELAEZ, ELENA BONAY MIARONS, PEDRO BULLIDO GÓMEZ-HERAS, Mª JESÚS CARRASCO LLAMAS, LUIS CADENAS, SUSANA CARRASCOSA BAEZA, JOSÉ Mª CONTRERAS BALSA, LAURA CORREAS HORNERO, ISABEL CUBELOS ALVAREZ, BEATRIZ CUEZVA MARCOS, JOSÉ MANUEL DÍAZ NIDO, JAVIER DÍEZ GUERRA, FRANCISCO JAVIER ESTELLA, CARLOS LÓPEZ CORCUERA, BEATRIZ LÓPEZ GUERRERO, JOSE ANTONIO LORIA SALINAS, FRIDA LUQUE GONZALEZ, CARLOS MARTÍNEZ SERRANO, ALBERTO MARTINEZ REYES, INMACULADA MAYOR MENÉNDEZ, FEDERICO MENCIA CABALLERO, MARIO MONTEJO DE GARCINI, ESTEBAN MURGA MONTESINOS, CRISTINA PARDO MERINO, BEATRIZ PENELA MÁRQUEZ, PETRONILA PEREZ ALVAREZ, MARIA JOSE PÉREZ FERNÁNDEZ, REBECA PÉREZ GONZÁLEZ, BELEN PEREZ LUZ, SARA PÉREZ PEREIRA, MARTA PUCCIARELLI, M. GRACIELA REMACHA MORENO, MIGUEL REQUENA ROLANIA, JOSÉ MARÍA RIBAS NÚÑEZ, CATALINA 3 FERNÁNDEZ LOBATO, MARÍA FERNÁNDEZ PIQUERAS, JOSÉ FORMENTINI, LAURA FRESNO ESCUDERO, MANUEL GAMEZ ABASCAL, ALEJANDRA GARCÍA LÓPEZ, SILVIA GARCÍA MATEU, MAURICIO GIMÉNEZ MARTIN, CECILIO- DIRECTOR GIRONÉS PUJOL, NURIA GRANDE PARDO, CRISTINA GÓMEZ DEL ARCO, PABLO HERNÁNDEZ PÉREZ, FÉLIX HERRERO SOLANS, PILAR HIDALGO HUERTAS, AURELIO ÍÑIGUEZ PEÑA, MIGUEL ANGEL IZQUIERDO ROJO, MARTA KATSU JIMENEZ, YURIKA MARIA LLORENTE-FOLCH, IRENE LOPEZ BUENO, ALBERTO RICHARD RODRÍGUEZ, EVA RORÍGUEZ GABRIEL, MIGUEL ANGEL RODRÍGUEZ POMBO, PILAR RUIZ DESVIAT, LOURDES RUIZ GÓMEZ, ANA RUIZ PÉREZ, JAVIER SANCHEZ ARAGÓ, MARIA SANDONÍS MARTÍN, VIRGINIA SANTOS HERNÁNDEZ, JAVIER SATRÚSTEGUI GIL-DELGADO, JORGINA SIERRA PÉREZ, JOSÉ MANUEL SOTO ÁLVAREZ, MANUEL VALBUENA RODRÍGUEZ, ALEJANDRO VENTOSO BANDE, IVÁN VEDARETHINAM, INDUMATHI VILLA MORALES, MARÍA MARÍA YAÑEZ MO (solicitada) ZAFRA GÓMEZ, FRANCISCO PERSONAL DE ADMINISTRACIÓN DEL INSTITUTO UNIVERISITARIO DE BIOLOGÍA MOLECULAR MONTSERRAT BARBERO MATURANA Mª CRUZ VALLADARES BARTOLOMÉ MARIA CAZORLA SILVIA VILLABA GARCIA 4 DEPARTAMENTOS DE INVESTIGACIÓN INSTITUTO UNIVERSITARIO DE BIOLOGÍA MOLECULAR Los grupos de investigación dirigidos por miembros del IUBM se agrupan dentro de cuatro Departamentos de investigación del CBMSO: Biología Celular e Inmunología Virología y Microbiología Dinámica y Función del Genoma Neurobiología Molecular Miembros IUBM integrados en grupos liderados por miembros del CSIC A continuación se detalla la diferentes líneas de investigación que componen el Instituto Universitario de Biología Molecular UAM, así como la relación de tesis doctorales dirigidas y tutoradas durante este ejercicio 2013 y las publicaciones científicas correspondientes a este mismo periodo. 5 1) Departamento de Biología Celular e Inmunología 1.1 Grupo de “GLICOGENÓMICA FUNCIONAL” Jefe de Línea Pedro Bonay Miarons Personal Científico Manuel Soto Álvarez Carlos Alonso Bedate Resumen de investigación El laboratorio tiene como objetivo fundamental el entender como el sistema inmune innato reconoce patógenos mediante los receptores de superficie – básicamente los CLRs o lectinas tipo C y galectinas- de las células involucradas, principalmente Células Dendríticas. En el curso del último año hemos desarrollado un sistema de estudio que comprende el complemento completo (hasta el momento) de todas las proteínas de reconocimiento de glicanos (humano y murino) inmovilizadas en formato microarray que nos permitirá obtener una instantánea de cómo un determinado patógeno es “visto” por el sistema inmune. Los resultados de estudios empleando este sistema pueden proveer claves predictivas en cuanto a polarización de la respuesta inmune generada frente a un patógeno en particular. Un segundo objetivo es definir las rutas de señalización/transducción inducidas en células presentadoras de antígenos por la interacción de lecitinas tipo C y galectinas con sus haptenos glicanos. Conocer la naturaleza de tales rutas es esencial en la identificación de moléculas del patógeno que actúen como reguladores/moduladores inmunes y dianas terapéuticas potenciales en el desarrollo de nuevos anti-inflamatorios. En tercer lugar, se propone definir como las lectinas tipo C del huésped son capaces de inducir diferentes programas de activación celular que conducen a una disminuida respuesta pro-inflamatoria a ligandos TLR. En particular, se está estudiando cual combinación de lectinas tipo C/galectinas-TLR es requerida para una determinada respuesta inmune. Es decir, ligandos/glicanos obtenidos de patógenos, ¿podrían ser usados como adyuvantes Th1 o Th2? Una aproximación que permitiría responder esta pregunta, es intentar direccionar la interacción de antígenos previamente demostrados con cierta actividad protectora de Leishmania sp. Hacia Células Dendríticas de piel mediante su fusión a ligandos de CLRs con el objeto de estimular una respuesta inmune específica. 1.2 Grupo de “INTERACCIÓN CITOESQUELETO-MEMBRANA PLASMÁTICA” Jefe de Línea Isabel Correas Hornero Personal Científico Jaime Millán Martínez Carlos M. Luque Postdoctorales Ana Ruiz Sáenz (desde Diciembre 2012) Resumen de investigación El control de la morfología celular y organización tisular se lleva a cabo a través de múltiples interacciones de proteínas y lípidos de la membrana plasmática con el citoesqueleto subyacente. Esta coordinación membrana-citoesqueleto es esencial para múltiples procesos celulares como la 6 migración, la adquisición de polaridad, el mantenimiento de las barreras epiteliales y endoteliales, o la división o el transporte vesicular e intracelular. Los intereses de nuestro grupo en los últimos años se centran en caracterizar la organización de la membrana plasmática y/o el citoesqueleto en diferentes procesos celulares, con un interés particular en el estudio de la función en la migración celular y en el mantenimiento de la barrera endotelial de las proteínas de la superfamilia 4.1, las cuales conectan el citoesqueleto subcortical y la membrana plasmática, a través de sus dominios FERM (four-point-one, ezrin-radixin-moesin). Durante el periodo 2011-2012 hemos determinado que la proteína 4.1R es clave para la migración y la polaridad celular a través del reclutamiento de la proteína IQGAP1 en el lamelipodio. Además, la proteína 4.1R también controla la dinámica de los microtúbulos y de las plataformas corticales, que constituyen dominios de anclaje de esta red citoesquelética a la membrana plasmática en contacto con la matriz extracelular. Estos datos indican que 4.1R actúa como proteína de andamiaje en el lamelipodio celular. Hemos iniciado estudios paralelos en Drosophila melanogaster con el fin de comprender la función de Coracle/4.1. Un ejemplo paradigmático de la importancia que tiene la interacción membrana-citoesqueleto es el mantenimiento de la barrera endotelial y su alteración durante la inflamación. En este periodo hemos caracterizado una nueva organización de los complejos de unión célula-célula tipo adherens que mantienen la integridad de las monocapas endoteliales y cuya dispersión en respuesta a estímulos inflamatorios como el TNF- , contribuyen al aumento de la permeabilidad endotelial. Hemos demostrado además que la disfunción de la barrera en respuesta a esta citoquina requiere la activación en los bordes celulares de las proteínas de la familia 4.1 ezrina, radixina y moesina. 1.3 Grupo de “GENÉTICA DE LA SUSCEPTIBILIDAD EN ENFERMEDADES COMPLEJAS. LÍNEA PRINCIPAL: LINFOMAS LINFOBLÁSTICOS DE CÉLULAS T. LÍNEA SECUNDARIA: ENFERMEDADES PSIQUIÁTRICAS MAYORES” Jefe de línea José Fernández-Piqueras Personal Científico de Plantilla Javier Santos Hernández María Villa Morales Contratados post-doctorales Laura González Sánchez (Doctora Contratada, CIBERER) Elena González Gugel (Doctora Contratada, CIBERER) Pilar López Nieva (Doctora Contratada con cargo a proyecto) María de los Ángeles Cobos Fernández (Doctora Contratada con cargo a proyecto) Resumen de investigación Nuestro equipo ha trabajado durante los últimos dos años en linfomas linfoblásticos T murinos (T-LBL) que surgen espontáneamente en algunos tipos de ratones KO, o que son inducidos mediante radiación gamma en cepas consanguíneas sensibles y resistentes, así como en líneas consómicas y congénicas derivadas. Los resultados obtenidos se confirmaron en muestras representativas de linfomas primarios humanos equivalentes. La aplicación de diferentes aproximaciones genómicas (cDNA-expression y CGH-arrays) y análisis epigenéticos nos han permitido identificar múltiples genes codificantes y no-codificantes (miRNAs) implicados en la susceptibilidad al desarrollo de este tipo de linfomas. Entre nuestros principals logros caben destacar: la demostración de que la sobre-expresión del oncogen c-Myc está controlada por el efecto combinatorio de multiples miRNAs, la identificación de un nuevo gen causal en la deleción 6q de los linfomas humanos, la identificación de mutaciones clave implicadas en la disfunción de la vía apoptótica Fas/FasL, y la identificación de varios genes y polimorfismos génicos implicados en la susceptibilidad al desarrollo de varias enfermedades complejas o en la resistencia a drogas. Nuestros objetivos actuales se centran en: (1) demostrar el potencial 7 oncogénico de la sobre-expresión de los alelos salvajes de oncogenes críticos que presentan tasas de mutación muy bajas en los tumores, mediante estrategias de transferencia adoptiva con células troncales hematopoyéticas modificadas genéticamente; (2) identificar las principales alteraciones genéticas y epigenéticas que caracterizan cada etapa del desarrollo tumoral; (3) analizar las causas y efectos de la des-regulación de la vía Fas/FasL en el desarrollo de los T-LBL humanos; (4) explotar el daño colateral ocasionados por las deleciones más comunes para eliminar específicamente las células tumorales; y (5) integrar los resultados derivados de las diferentes aproximaciones genéticas y genómicas en un mapa de alteraciones genéticas y epigenéticas, que permita introducir mejoras en el pronóstico y diagnóstico de este tipo de linfomas, y el desarrollo de nuevas y más eficaces estrategias terapéuticas. 1.4 Grupo de “REGULACIÓN Y FUNCIÓN DE MEDIADORES PROINFLAMATORIOS Y SU IMPLICACIÓN EN ENFERMEDADES DE ETIOLOGÍA INFLAMATORIA E INMUNE” Jefe de Línea Manuel Fresno Escudero Plantilla Nuria Gironés Pujol Pablo Gómez del Arco Contratados Postdoctorales Ruth Alvarez Díaz Konstantinos Stamatakis Adriani Resumen de Investigación Existen similitudes entre el reconocimiento de patógenos por los TLR, la respuesta inmune a la infección y la inflamación crónica. Estamos analizando la ruta TLR/NIK/c-rel-NFAT/Cox2/prostaglandinas (PGs) en nuevas funciones del sistema inmune y en enfermedades inflamatorias como Aterosclerosis, Obesidad, Cáncer y Enfermedad de injerto contra huésped. Hemos empezado a descifrar las conexiones entre TLRs y la activación de c-rel y NFAT. Estos dos factores de transcripción regulan mediadores inflamatorios como Cox-2 aumentando las respuestas inflamatorias. Además, PGE2 inducen la migración y función de macrófagos y linfocitos T incluyendo la duración de la interacción entre células dendríticas y linfocitos T en los ganglios linfáticos. TLR2-TLR4/NFATc2NFATc4 controlan diferencialmente la expresión de genes adipogénicos y reprimen los antiadipogénicos, en adipocitos promoviendo o evitando la obesidad. Además hemos identificado moléculas inducidas por Cox-2 como PMEPA1 y DUSP10 que controlan diferenciación y respuesta a estrés, respectivamente, claves en las propiedades tumorigénicas de carcinoma de colon y ovario. Existen diferentes linajes genéticos de Trypanosoma cruzi, causante de la Enfermedad de Chagas, pero no se conoce su biología comparada ni tampoco su potencial patogenicidad. Hemos definido el papel del NO y de la Arginasa I producidas por las células mieloides supresoras (MDSC), así como otros mecanismos inmunopatogénicos. El balance Th1/Th17/Treg/MDSC determina la resistencia/ susceptibilidad, dependiendo de la genética del hospedador y del parasito. En general, Th1 son protectivas pero necesitan ser compensadas por Tregs para evitar demasiada inflamación. El efecto de Th17 depende factores genéticos del hospedador y el parasito. Las MDSC Arginasa I+ son perjudiciales y su bloqueo mejora la enfermedad. También estudiamos cómo el parásito entra, infecta, escapa a la destrucción y se replica en células mieloides demostrando que SLAMF1 es un nuevo receptor de T.cruzi, Todo ello con el objetivo final de comprender mejor y prevenir la Enfermedad de Chagas. 8 1.5 Grupo de “ACCIONES DE LOS PROSTANOIDES EN PROCESOS Jefe de Línea Miguel Ángel Íñiguez Peña Becarios Predoctorales Elena Hernández Subirá Raquel Nieto Pintado Resumen de Investigación Los prostanoides y los derivados del colesterol son mediadores lipídicos que juegan un papel esencial en los procesos inflamatorios asociados a diversas patologías, como las enfermedades cardiovasculares. Los prostanoides participan en la respuesta inflamatoria y ejercen acciones importantes en la fisiopatología cardiovascular, regulando la homeostasis vascular y participando en la patogénesis de enfermedades vasculares. Su importancia en la inflamación se pone de relieve por la experiencia clínica con fármacos inhibidores de su producción como los AINEs. A pesar de sus conocidas propiedades anti-inflamatorias, estudios recientes han demostrado que los AINEs selectivos de la ciclooxigenasa-2, presentan un riesgo de efectos secundarios a nivel cardiovascular. Por otro lado, los oxiesteroles y drogas que actúan como ligandos de LXR, juegan un papel regulador central en el metabolismo y transporte de lípidos, a través de sus propiedades como reguladores transcripcionales. Además de su función en el metabolismo de lípidos, los LXRs presentan propiedades como moduladores de la respuesta inmune y la inflamación. Estas propiedades han incentivado el estudio de estos agentes con fines terapéuticos en enfermedades cardiovasculares. Los principales objetivos de nuestra línea de investigación incluyen: el análisis de los efectos de los prostanoides y los ligandos de LXR en diferentes tipos celulares como leucocitos y cardiomiocitos, entre otros; el estudio de las vías de señalización que median los efectos hipertróficos de los prostanoides en los cardiomiocitos; y la investigación de la contribución de los prostanoides y los ligandos de LXR a la progresión del aneurisma aórtico abdominal, mediante el uso de modelos celulares y animales. El conocimiento de las bases moleculares y celulares de las acciones de prostanoides y ligandos de LXRs en la fisiopatología cardiovascular tiene especial relevancia, dado el creciente interés sobre las bases moleculares de las patologías cardiovasculares y sobre los mecanismos de intervención farmacológica en las mismas. 1.6 Grupo de “MECANISMOS DE SEÑALIZACIÓN Y REGULACIÓN DE RECEPTORES ACOPLADOS A PROTEÍNAS G“ Jefe de Línea Federico Mayor Menéndez Personal Científico Cristina Murga Petronila Penela Catalina Ribas Postdoctoral Rocio Vila-Bedmar Resumen de Investigación Las GRKs (G protein-coupled receptor kinases) son importantes nodos en las redes de señalización celular. Tras identificarse inicialmente como reguladores de receptores acoplados a proteínas G (GPCR) más recientemente se han puesto de manifiesto (con la activa participación de 9 nuestro grupo) nuevas funciones, en particular para la ubicua y esencial isoforma GRK2. Esta quinasa puede fosforilar sustratos no-GPCR o interaccionar con diversas proteínas señalizadoras, y estas nuevas interacciones contribuyen a explicar la participación de GRK2 en procesos celulares básicos como ciclo celular, migración o resistencia a insulina. También se han descrito complejos mecanismos de regulación de la expresión y actividad de GRK2, y esos parámetros estén alterados en diversas enfermedades de gran relevancia. El descifrado del interactoma de GRK2 relevante en distintos tipos celulares y/o contextos fisiológicos y patológicos específicos puede ayudar a entender aspectos claves acerca de la organización de las redes de señalización celular. Por otra parte, el uso combinado de modelos celulares y animales con expresión o funcionalidad de GRK2 alterada (a nivel sistémico o de forma específica de tipo celular) permitirá evaluar la contribución de esta quinasa a procesos celulares esenciales, así como el impacto funcional de cambios en los niveles de GRK2 en patologías cardiovasculares, inflamatorias, diabetes/obesidad o progresión tumoral. Estos aspectos son críticos para explorar la posibilidad de utilizar GRK2 como biomarcador y/o el diseño de nuevas estrategias terapéuticas basadas en la modulación de la actividad, niveles o interacciones específicas de esta proteína. Además, nuestro grupo también está implicado en la identificación de nuevas vías de señalización cardiovascular mediadas por GPCR acoplados a Gq y en el desarrollo de estrategias terapéuticas basadas en una familia de inhibidores de p38MAPK patentada por nuestro laboratorio. 1.7 Grupo de “CÉLULAS TRONCALES TUMORALES” Jefe de Línea Marta Izquierdo Rojo Resumen de Investigación Hemos estudiado el potencial terapéutico de la inhibición de la proteína nucleostemina en células troncales tumorales (CSCs, del inglés cancer stem cells) procedentes de pacientes con glioblastomas. La nucleostemina está presente en los nucleolos de células troncales (de ahí su nombre, nucleolo y stem) y en muchos tipos de células tumorales, pero no está presente en las células de los tejidos diferenciados. Hemos utilizado shARNs (ARNs de interferencia) para inhibir la nucleostemina en CSCs encontrando que uno de los shARN diseñados contra la nucleostemina (shRNA22) provoca apoptosis en las células CSCs de pacientes y retrasa significativamente la formación de tumores in vivo. Sin embargo este shRNA22 no parece disminuir ni las concentraciones de ARNm de la nucleostemina ni la proteína correspondiente. La hipotésis de que el shRNA22 podría estar ejerciendo su acción fuera de diana nos impulsó a realizar numerosos experimentos para intentar descubrir la verdadera diana del ARN interferente: Se analizaron los cambios en la actividad transcripcional provocada por el shRNA22 en las CSCs a nivel de genoma completo (GeneChip Gene 1.0 ST Array System for Human, Affymetrix). El análisis de los resultados nos indicó que la diana primaria pudiera ser un factor de transcripción relacionado con la vía de señalización de las MAP-quinasas. No se ha podido confirmar o identificar este factor de transcripción. El shRNA22 podría estar actuando como un miRNA. Se realizó una búsqueda en la base de datos PITA en la que se pedían posibles dianas del shRNA22 actuando como miRNA. También se tuvo en cuenta la posible contribución de estructuras secundarias en forma de lazos en los mensajeros. Aunque en principio se obtuvieron varios candidatos, éstos se han ido descartando sucesivamente concluyendo que el shRNA22 no actúa como miRNA en su acción contra los glioblastomas. En la actualidad se barajan nuevas hipótesis para explicar el comportamiento del shNM22 que seran objeto de una futura investigación. 10 1.8. Grupo de “FISIOPATOLOGÍA MITOCONDRIAL” Jefe de Línea Susana Cadenas Resumen de Investigación Research in our group is focused on the function of mitochondria within cells and their implication in the development of pathological conditions. Mitochondria are a major source of reactive oxygen species (ROS) in cells. Uncoupling proteins 2 and 3 (UCP2, UCP3) might be involved in controlling the production of mitochondrial ROS and protecting against oxidative stress, although the mechanism is unclear. UCPs are activated by superoxide and the lipid peroxidation product 4-hydroxy-2-nonenal (4-HNE), to induce proton leak leading to membrane depolarization (mild uncoupling) and the decrease in ROS production. In addition, UCP2 and UCP3 are controlled by covalent modification by glutathione. We have recently found that the transcription factor Nrf2 (nuclear factor erythroid 2-related factor 2), a master regulator of the cellular antioxidant response, induces UCP3 expression under conditions of oxidative stress (Anedda et al., Free Radic. Biol. Med. 2013). We are currently investigating the effects of 4-HNE on UCP3 expression and function in cardiomyocytes and their functional consequences. Ischemia-reperfusion (IR) injury in myocardial infarction is caused, in part, by oxidative damage. It has been shown that 4-HNE-induced Nrf2 activation protects against cardiac IR. We aim to determine the potential cardioprotective role of UCP3 against IR damage and its role during ischemic preconditioning (IPC), a protective mechanism that consists of brief ischemic episodes prior to prolonged ischemia, in the intact perfused mouse heart. Other redox-sensitive signaling pathways involved in IPC, such as PTEN oxidation and PI3K/Akt activation, are also the focus of our investigation. 2) Departamento de Virología y Microbiología 2.1 Grupo de “BASES MOLECULARES DE LA PATOGENIA Y DEL POTENCIAL ANTICÁNCER DE LOS PARVOVIRUS” Jefe de Línea José M. Almendral del Río Investigador Posdoctoral Jon Gil-Ranedo Virginia Sandonís Resumen de investigación La investigación del laboratorio está focalizada en dos temas parcialmente solapantes: (A) dinámica evolutiva en enfermedades causadas por parvovirus, y (B) interacciones virus-huésped implicadas en el oncotropismo de estos virus. Ambas estrategias están destinadas finalmente al desarrollo de herramientas biológicas anti-cáncer seguras. Nuestro modelo viral es el parvovirus diminuto del ratón (MVM) en infecciones de ratones normales e inmunodeficientes. Los principales temas que estamos abordando actualmente son: (I) Patogénesis y Evolución: las poblaciones de MVM asociadas con el desarrollo de una enfermedad hemopoyética severa en ratón se caracterizan por una elevada heterogeneidad genética localizada en el determinante de tropismo de la cápsida. Un objetivo de 11 nuestra investigación es entender el papel de este dominio en la patogénesis viral. (II) Análisis estructura-función de la cápsida: estamos estudiando las señales de proteínas que regulan el tráfico intracelular y el ensamblaje del virión, en relación con el diseño racional de dominios que incrementen el oncotropismo viral. (III) Propiedades anti-cáncer: se está realizando un análisis amplio de las interacciones de MVM con glioblastomas humanos para intentar identificar dianas terapéuticas potenciales de cáncer involucradas en la regulación del ciclo vital de MVM. . 2.2 Grupo de “BIOLOGÍA MOLECULAR DE EXTREMÓFILOS” Jefe de Línea Ricardo Amils Pibernat Personal científico en plantilla Aldo González Becerra Posdoctorales Moustafa Malki Monika Oggerin de Orube Enoma Omoreggie (Marie Curie) Cristina Moraru (Marie Curie) Resumen de investigación Ecología Molecular de Ambientes Extremos: Este área de investigación persigue los siguientes objetivos: Acidófilos: ecología microbiana convencional, ecología molecular, biología molecular y biotecnología (biolixiviación, secuestro específico de metales y fitorremediación) de ambientes ácidos extremos (la cuenca del Río Tinto, actividades mineras de la Faja Pirítica Ibérica, río Agrio (Argentina) y la Antártida). - Caracterización geomicrobiológica de ambientes extremos como modelos de habitabilidad: la cuenca del Tinto (análogo de Marte), depósitos de sulfuros metálicos de la Antártida (análogo de Marte), la laguna hipersalina de Tirez (análogo de Europa) en colaboración con la profesora I. Marín (UAM), el salar de Uyuni (análogo de Europa) en colaboración con la profesora I. Marín, y zonas de permafrost de Alaska (análogos de Marte). - Geomicrobiología del subsuelo de la Faja Pirítica Ibérica (IPB): caracterización del bio-reactor subterráneo en la IPB responsable de las condiciones extremas del Río Tinto. Este trabajo se está desarrollando en colaboración con el Centro de Astrobiología (Proyecto ERC IPBSL). - La línea de ecología microbiana de ambientes anaerobios, dirigida por el profesor J.L. Sanz (UAM), se está desarrollando en los laboratorios que el Departamento de Biología Molecular tienen en el edificio de Biología. Este trabajo está centrado en la caracterización de las actividades anaerobias en los distintos modelos de estudio del grupo de investigación (cuenca del Tinto, subsuelo de la IPB). Micología. Este área de investigación está dirigida por el Dr. Aldo González y tiene los siguientes objetivos: - Genética molecular y microbiología de Basidiomicetos (Pleurotus ostreatus como sistema modelo de estudio). - Uso de hongos filamentosos como fuente de metabolitos secundarios, enzimas lignolíticas y para secuestro específico de metales. - Control y eliminación de hongos de aire de interior. - Transcriptómica y proteómica para el estudio del secretoma. 12 2.3 Grupo de “BIOTECNOLOGÍA Y GENÉTICA DE BACTERIAS TERMÓFILAS EXTREMAS” Jefe de Línea José Berenguer Carlos Personal científico Aurelio Hidalgo Huertas Postdoctorales Carolina Elvira César Leticia Luciana Torres Eloy Roberto Ferreras Puente Resumen de investigación En nuestro laboratorio estudiamos (1) el metabolismo anaerobio de bacterias termófilas extremas, (2) su transferencia horizontal, y (3) desarrollamos aplicaciones biotecnológicas derivadas de su utilización o de la de sus enzimas. Como modelo principal utilizamos la bacteria termófila extrema Thermus thermophilus (Tth) por ser excepcionalmente manipulable en comparación otros termófilos extremos. Su filogenia ancestral y la estabilidad de sus componentes hacen de Tth uno de los modelos favoritos tanto en Biología Evolutiva como en Biología Estructural. En los últimos dos años hemos centrado nuestros esfuerzos en el análisis de las enzimas implicadas en los pasos finales de la desnitrificación y en su transferencia horizontal (LGT). Hemos caracterizado la nitrito y la óxido nítrico reductasas codificadas en un agrupamiento génico susceptible de LGT, pero de expresión dependiente del agrupamiento para la respiración de nitrato. Hemos empezado también a estudiar los mecanismos de LGT de ambos agrupamientos, identificando como vía principal el contacto directo célula-célula que, sin embargo, no implica homólogos de proteínas propias de sistemas de conjugación clásicos. También hemos iniciado estudios sobre las barreras que protegen a estas bacterias frente a la entrada de DNA exógeno empleando interferencia mediada por guías de ácidos nucleicos. En la línea más aplicada, nuestros esfuerzos se han concentrado principalmente en dos aspectos. Por un lado, hemos procedido a la selección de variantes termoestables de proteínas mediante la utilización de técnicas de interferencia de plegamiento (ej. Esterasa I de P. fluorescens), o diseño racional (ej. proteínas fluorescentes). Por otro, hemos caracterizado y utilizado varias enzimas termoestables de interés biotecnológico, tales como una penicilina acilasa o tres nucleósido fosforilasas. En los próximos años profundizaremos en los mecanismos de LGT y las barreras frente a éstos, e iniciaremos un proyecto para la identificación y selección in vitro de enzimas termoestables mediante nuevos sistemas de generación de señal. 2.4 Grupo de “EXPRESIÓN GÉNICA EN STREPTOMYCES Y LEVADURAS” Jefe de Línea María Fernández Lobato Resumen de Investigación Trabajamos con microorganismos de interés biotecnológico, básicamente Streptomyces y levaduras, productores de compuestos bioactivos (entre ellos antibióticos y moléculas con actividad prebióticas). Tratamos de conectar la generación de conocimiento con el desarrollo de aplicaciones biotecnológicas, y básicamente nos centramos en la caracterización de nuevas enzimas productoras 13 de compuestos bioactivos, el análisis de sus determinantes estructurales-funcionales, su mejora funcional utilizando herramientas de biología molecular y en la obtención y caracterización de nuevas moléculas con actividad biológica de posible utilidad industrial. Hemos patentado ya en distintos países la aplicabilidad industrial de la mayoría de las proteínas caracterizadas y diseñado un método eficaz para su fijación a soportes sólidos. Durante los últimos dos años hemos estado caracterizando y estudiando distintas proteínas de levaduras no convencionales (géneros Xanthophyllomyces, Schwanniomyces, Rhodotorula, etc.) con actividad glicosiltransferasa, aplicables en la producción de azúcares con propiedades prebióticas. Todas ellas son glicosilhidrolasas (GH) estructuralmente incluidas en las familias GH32, 31, 1 y 2. Hemos resuelto la estructura 3D de la primera proteína de levadura incluida en la familia GH32, asignado una función al dominio beta-sandwich que está presente en todos los miembros de la familia y probado que la oligomerización está implicada directamente en el reconocimiento del sustrato y especificidad. Hemos obtenido numerosas variantes de estas enzimas que aumentan o alteran el patron de productos obtenidos en reacción biosintética. Aislado y caracterizado los productos sintetizados y optimizado las condiciones para las reacciones biosintéticas. Pretendemos extender nuestro estudio a hidrolasas incluidas en otras familias estructurales, y aumentar/modificar la actividad transferasa de las enzimas ya estudiadas para favorecer su utilización biotecnológica y escalar hasta un nivel industrial tanto su producción como la de los productos generados. 2.5 Grupo de “INGENIERÍA DE VIRUS Y NANOBIOTECNOLOGIA” Jefe de Línea Mauricio García Mateu Postdoctorales Milagros Castellanos Molina Verónica Rincón Forero Resumen de investigación Objetivos científicos principales: Utilizamos técnicas de ingeniería de proteínas y análisis bioquímicos, biofísicos y biológicos para el estudio del ensamblaje, estabilidad y dinámica conformacional de virus (revisado en Mateu (2013) Arch.Biochem.Biophys., en prensa); Además nos basamos en los resultados de estos estudios para el diseño y análisis de partículas víricas genética y estructuralmente modificadas con vistas a aplicaciones en biomedicina y bionanotecnología (revisado en Mateu (2011). Prot.Eng.Des.Sel. 24, 53-63). Relevancia científica e implicaciones tecnológicas: Conocimiento en profundidad de ciertas etapas clave del ciclo vírico, incluyendo ensamblaje, reordenamientos estructurales y desensamblaje de virus; aplicación de este conocimiento al diseño de vacunas, fármacos antivirales y nanopartículas para la liberación dirigida de fármacos. Algunos resultados recientes: i) Mediante ingeniería de proteínas hemos aumentado la estabilidad térmica del virus de la fiebre aftosa frente a su disociación en subunidades. Estamos investigando las bases moleculares de esta termoestabilización y las posibilidades vacunales de estos virus modificados. ii) En colaboración con otros grupos, estamos investigando las bases moleculares del ensamblaje de la cápsida del virus de la inmunodeficiencia humana (HIV) y modos de inhibir este proceso, con vistas al diseño de nuevos fármacos anti-HIV. iii) En colaboración con un grupo de físicos, estamos investigado mediante microscopía de fuerzas atómicas (técnica que utilizamos en nuestro laboratorio) la relación entre propiedades mecánicas (elasticidad) de partículas víricas y la estabilidad y dinámica conformacionales de estas. Para estos estudios utilizamos el virus diminuto del ratón (MVM) como modelo. Los objetivos básicos de este estudio son determinar si las propiedades mecánicas de los virus tienen un papel en la biología del virus y, de tenerlo, cuál es ese papel. Además, estos estudios se orientan al diseño de nanopartículas víricas con propiedades mejoradas para usos biomédicos (liberación dirigida de fármacos) y nanotecnológicos (nuevos nanodispositivos). 14 2.6 Línea de “ESTRUCTURA DEL MRNA Y CONTROL TRADUCCIONAL EN SISTEMAS BIOLÓGICOS” Jefe de Línea Iván Ventoso Posdoctorales René Toribio López Resumen investigación Nuestra línea de investigación se consolidó como independiente en 2011, y desde entonces hemos profundizado en los aspectos estructurales, funcionales y evolutivos de la traducción en sistemas eucarióticos durante la respuesta al estrés. La inactivación transitoria del factor de traducción eIF2 por fosforilación juega un papel fundamental en la remodelación traduccional en respuesta al estrés, bloqueando la traducción de la mayoría de los mRNA celulares y activando al mismo tiempo la traducción de una grupo de mRNAs implicados en la respuesta al estrés. Existe una importante conexión entre la respuesta al estrés y la respuesta antiviral en mamíferos, de modo que muchos virus han desarollado estrategias traduccionales para superar esta respuesta y colonizar nuevos hospedadores. En el laboratorio estudiamos la traducción de los mRNAs de algunos arbovirus de los géneros Alphavirus y Flavivirus como modelos biológicos de interacción parásito-hospedador, y con la intención de identificar los elementos estructurales en los mRNA que promueven la traducción independiente del factor eIF2. Nuestras principales aportaciones en los dos últimos años han sido: 1) La descripción cualitativa y cuantitativa de la remodelación traduccional en células humanas y murinas en repuesta al estrés de retículo endoplásmico (UPR), identificando más de 300 mRNAs cuya traducción se activa por la fosforilación de eIF2. 2) Hemos propuesto un escenario evolutivo que describe molecularmente cómo los Alphavirus (ej. Sindbis) pudieron adaptar la traducción de sus mRNA durante la colonización de hospedadores vertebrados en el pasado. 3) Estamos describiendo un mecanismo de iniciación de la traducción no canónico que opera en ciertos mRNA virales (Alphavirus y Flavivirus), y probablemente en algunos mRNA celulares (ej. ATF4) implicados en la respuesta al estrés. Este tipo de iniciación requiere la acción de estructuras de RNA de tipo stem-loop (DLP) situadas por detrás del codon de iniciación en el mRNA. 3) Departamento de Neurobiología Molecular 3.1 Grupo de “NEUROTRANSPORTADORES DE GLICINA: ESTRUCTURA MOLECULAR, BIOGÉNESIS Y REGULACIÓN “ Jefe de Línea Carmen Aragón Rueda Personal Científico Beatriz López-Corcuera Resumen de investigación Nuestro interés es el estudio del mecanismo funcional, biogénesis, tráfico intracelular y regulación de los transportadores de glicina, GlyTs (GlyT1 y GlyT2) del SNC, proteínas de la membrana plasmática de neuronas y astrocitos responsables de la finalización de la transmisión glicinérgica inhibidora. Nuestra investigación está orientada a patologías del SNC de mamíferos asociadas a disfunciones de las vías glicinérgicas, principalmente alteraciones neuromusculares como 15 la hiperplexia hereditaria humana y dolor neuropático. Mutaciones en el gen de GlyT2 (SLC6A5) son causantes de la hiperplexia humana y la distonía muscular congénita tipo 2 en terneros. Mediante estudios estructurales y dinámicos utilizando modelos 3D de GlyTs, que hemos generado y validado experimentalmente en colaboración con el Dr. Antonio Morreale (Unidad de Bioinformática del CBMSO), hemos identificado una región en el vestíbulo extracelular de GlyT2 implicada en la selectividad de cationes y en el mecanismo de acoplamiento del transporte de glicina. Nos interesa el estudio del tráfico intracelular de GlyT2 en la terminal sináptica por ser un mecanismo fundamental en el control de la actividad glycinérgica ya que proporciona una forma rápida para modular la actividad del transportador en la superficie celular. Hemos descrito los mecanismos moleculares de endocitosis constitutiva y regulada por PKC a través de los cuales GlyT2 recicla entre la superficie y el interior celular así como el papel que los subdominios rafts de membrana plasmática y la ubiquitinación desempeñan en la internalización constitutiva y regulada del transportador, respectivamente. Hemos descrito una regulación paracrina coordinada y antagónica de la actividad de GlyT1 y GlyT2 a través de receptores purinérgicos P2Y1. Este mecanismo produce un incremento de la neurotransmisión glicinérgica inhibidora y una reducción de la neurotransmisión glutamatérgica excitadora lo que podría conducir a anti-nocicepción. Recientemente hemos identificado una nueva mutación dominante en el gen de GlyT2 en ocho pacientes de hiperplexia. La expression heteróloga y caracterización de la mutación (Y705C) nos ha permitido determinar alteraciones en el tráfico y en las propiedades bioquímicas y de maduración del transportador mutante. 3.2 Grupo de “BASES GENÉTICAS DE LA ENFERMEDAD DE ALZHEIMER: ESTUDIO GENÓMICO DE MODELOS CELULARES PATOGÉNICOS.” (*Directora de proyecto, aún no reconocida como,Jefe de Línea en el CBMSO) Jefe de Línea María Jesús Bullido Gómez-Heras Investigadores Postdoctorales Jesús Aldudo Soto María Recuero Vicente Resumen de investigación En los últimos años nuestro grupo se ha centrado en la búsqueda de factores de riesgo y/o genes implicados en la enfermedad de Alzheimer (EA), partiendo de modelos celulares para la obtención de candidatos que se validan mediante asociación genética en pacientes. Uno de los principales objetivos del grupo es establecer la implicación en la patogénesis de la EA de dos factores asociados al envejecimiento, el estrés oxidativo (EO) y la infección por HSV-1. Hemos demostrado en los modelos celulares que el EO regula el tráfico, degradación y procesamiento proteolítico de la proteína precursora del péptido Aβ (APP), y que esta regulación implica a los dos principales sistemas proteolíticos celulares: ubiquitin/proteasoma y autofagia/lisosoma. Por su parte, HSV-1 es capaz de reproducir la mayor parte de las anomalías que presentan los cerebros de pacientes con EA, como la hiperfosforilación de la proteína tau y alteraciones del proceso autofágico que conducen a la acumulación intracelular de Aβ, de forma más acentuada en presencia de EO. Tras el análisis genómico de los modelos, nos hemos centrado en la lista de genes cuya expresión se modula por HSV-1 en presencia de EO para su posterior validación funcional y por asociación con riesgo genético, ya que ésta sería la situación más parecida a la infección durante el envejecimiento: La función “inflamación mediada por citocinas” está muy enriquecida en esta lista, lo que concuerda con las conclusiones de los últimos estudios de asociación genómica (GWAs) y sugiere que HSV-1 podría participar en la patogénesis de la EA esporádica. Otros trabajos del grupo en este período incluyen el análisis de modelos celulares de EA monogénica y la participación en estudios colaborativos de asociación genética -principalmente con grupos de CIBERNED y como parte del consorcio europeo EADI- que están revelando nuevos factores de riesgo de EA. 16 3.3 Grupo de “REPARACIÓN NEURONAL Y TERAPIA MOLECULAR EN NEURODEGENERACION. ATAXIAS ESPINOCEREBELOSAS” Jefe de Línea Javier Díaz Nido Postdoctorales Gloria María Palomo Carrasco Sara Pérez Luz, Frida Loría Salinas Resumen de investigación Nuestro grupo investiga, en el contexto de las enfermedades neurodegenerativas, los procesos de disfunción y muerte de las neuronas para encontrar vías de estimulación de la supervivencia y reparación neuronales, con vistas a su posible aplicación terapéutica. En particular, nos hemos enfocado en la ataxia de Friedreich, enfermedad neurogenética causada por un déficit de frataxina, una proteína mitocondrial codificada en el genoma nuclear. La ataxia de Friedreich es una enfermedad principalmente (aunque no exclusivamente) neurodegenerativa, de un inicio muy precoz, y puede servir como un modelo muy útil para otras enfermedades neurodegenerativas en las que la disfunción mitocondrial también juega un papel muy importante. En este contexto, hemos desarrollado distintos modelos celulares neurales para estudiar los mecanismos moleculares del proceso degenerativo disparado por la deficiencia de frataxina. Para ello hemos empleado cultivos primarios de neuronas de ratón y líneas celulares establecidas de neuroblastoma humano, así como cultivos de células troncales procedentes de biopsias de mucosa olfativa de donantes humanos. Estos estudios pueden llevar a la identificación de nuevas dianas terapéuticas y biomarcadores tanto para la ataxia de Friedreich como para otras enfermedades neurológicas que cursan con disfunción mitocondrial. Además, estos modelos celulares se están empleando para ensayar posibles estrategias terapéuticas con un énfasis en encontrar moléculas (fármacos o genes) capaces de compensar los déficits funcionales inducidos por la deficiencia de frataxina o bien capaces de incrementar la expresión de la frataxina de una manera eficiente. Nuestro grupo también ha considerado una aproximación de terapia génica para la ataxia de Friedreich introduciendo copias correctas del gen de la frataxina mediante la administración de vectores herpesvirales portadores del cDNA o del “locus” genómico completo de la frataxina. Ahora pretendemos optimizar las vías de aplicación y distribución de distintos vectores virales y no-virales en el sistema espinocerebelar. Además, también estamos investigando la aplicación de vectores portadores de otros genes neuroprotectores. 3.4 Grupo de “BASES MOLECULARES DE LA PLASTICIDAD NEURONAL” Jefe de Línea F. Javier Díez Guerra Resumen de investigación La plasticidad neuronal es la capacidad que tienen las células nerviosas de adaptar o cambiar sus propiedades funcionales en distintas condiciones o situaciones de actividad neural. Estos cambios pueden ser transitorios o persistentes y constituyen la base de la función cognitiva del cerebro. Nuestra investigación está dirigida hacia la comprensión de los mecanismos celulares y moleculares que operan en las redes neuronales para modular su eficacia sináptica. Nuestro objetivo actual más importante es desvelar cómo las proteínas de 17 unión a calcio cooperan en el entorno sináptico para regular la plasticidad neuronal. Los patrones de actividad neuronal desencadenan oscilaciones de calcio intracelular que modulan un gran número de vías de señalización, la mayoría de ellas reguladas por la proteína de unión a calcio Calmodulina (CaM). A pesar de su abundancia, la disponibilidad de CaM frente sus múltiples efectores está regulada por la presencia de proteínas tales como GAP-43 y neurogranina (Ng), que secuestran y acumulan CaM en el entorno pre-o post-sináptico, respectivamente. Tanto Ng como GAP 43-son abundantes en neuronas y su capacidad de acumular localmente CaM depende de bajos niveles de calcio intracelular y de su fosforilación por proteína quinasa C. Nuestra hipótesis propone que GAP-43 y Ng actúan de dos formas: una, previniendo la activación de efectores de CaM en respuesta a estímulos de baja intensidad (supresión de ruido) y, otra, favoreciendo y reforzando la activación de unas vías de señalización sobre otras. Las líneas de investigación en curso se centran en la regulación dependiente de la actividad de la traducción Ng en las dendritas y también en la regulación de su localización intracelular. En relación a este último proyecto, hemos demostrado que Ng se transloca al núcleo en respuesta a actividad sináptica y también que Ng se une específicamente a ácido fosfatídico (PA), un fosfolípido de membrana recientemente reconocido como molécula señalizadora. Para estos estudios utilizamos cultivos primarios de neuronas disociadas obtenidas a partir de corteza cerebral e hipocampo murinos, en combinación con técnicas de biología celular, bioquímica, biología molecular y microscopía avanzada. En animales de experimentación, la deficiencia en Ng está estrechamente vinculada a problemas cognitivos. Estas alteraciones se encuentran presentes en gran cantidad de trastornos neurológicos, como son las enfermedades neurodegenerativas, el hipotiroidismo o la esquizofrenia. Estamos convencidos de que Ng es una excelente diana molecular para el diseño y desarrollo de fármacos y terapias dirigidas a mejorar nuestras habilidades cognitivas. Un conocimiento más amplio y profundo de las proteínas secuestradoras de CaM en el contexto de la plasticidad neuronal y sus mecanismos, fomentará la aparición de nuevos fármacos y terapias que mejoren la calidad de vida de las personas que envejecen y los pacientes afectados de enfermedades neurológicas. 3.5 Grupo de “BASES MOLECULARES DE LAS SINAPSIS GLUTAMINÉRGICAS: ESTUDIO DE LOS TRANSPORTADORES DE GLUTAMATO Y GLICINA” Jefe de Línea Cecilio Giménez y Francisco Zafra Postdoctorales Esperanza Jiménez Resumen de investigación Durante años, el interés principal de nuestro laboratorio ha sido la comprensión de los mecanismos básicos de regulación de los transportadores de glutamato y glicina en el SNC, y cómo la desregulación de estas proteínas, o sus proteínas reguladoras asociadas, pueden contribuir a los trastornos neurológicos como la esquizofrenia, la esclerosis lateral amiotrófica, o lesiones isquémicas en el cerebro. El papel de los neurotransportadores para el glutamato (GLT1, GLAST, EAAT3) y glicina (GLYT1) es controlar los niveles de estos neurotransmisores en las sinapsis glutamatérgicas regulando de esta manera la actividad de los receptores NMDA que requiere la unión de ambos ligandos como coagonists obligatorios. Mientras que la sobreestimulación de estos receptores conduce procesos neurodegenerativos, la hipofunción se ha asociado a la esquizofrenia. Así, la actividad de estos 18 transportadores tiene un profundo impacto sobre la actividad de las vías glutamatérgicas, y su modulación se considera de gran interés en el tratamiento de las disfunciones que afectan al sistema glutamatérgico. La glicina y los transportadores de glutamato están sometidos a procesos intracelulares tráfico los cuales, a su vez, son reguladas por diversas vías de transducción de señales e interacciones con proteínas celulares que determinan finalmente la concentración y la ubicación de estos soportes en las sinapsis glutamatérgicas. Más específicamente, nuestro trabajo se ha centrado en una mejor comprensión de los mecanismos de biogénesis: salida desde el retículo endoplásmico, el tránsito a través del aparato de Golgi, y la distribución asimétrica de subdominios diferentes de la membrana plasmática, su anclaje a proteínas de andamiaje y, finalmente, la endocitosis, ya sea para degradación o reciclaje. Nuestros estudios han contribuido a la localización fina de estas proteínas en el cerebro, así como a la identificación de varias proteínas asociadas (proteínas PDZ, exocitsto) y la localización e identificación de los motivos estructurales que participan en la distribución asimétrica de estos transportadores en células polarizadas. Asimismo, hemos definido los mecanismos de regulación basados en modificaciones posttranscriptionales sobre los transportadores tales como la fosforilación y ubiquitinación / deubiquitination. Por otra parte, mantenemos interés en la función de la glicina como un neurotransmisor inhibidor y el GLYT2, transportador asociado, que participan en la enfermedad genética hiperekplexia. Estos estudios, en especial los relacionados con el tráfico de GLYT2, se han realizado en los últimos años en colaboración con el grupo de la Dra. C. Aragón. Nuestro principal objetivo de los próximos años es la identificación de nuevos mecanismos de regulación, la identificación de nuevas proteínas participantes en el interactoma de estos transportadores, aprovechando las nuevas estrategias proteómicas, y cómo estos mecanismos pueden ser modificados en modelos animales de enfermedades, más concretamente en un modelo de esquizofrenia (ratones deficientes en el transportador de glutamato vesicular vGLUT2), y en modelos de rata de isquemia cerebral (MCAO). 3.6 Grupo de “BIOLOGÍA DE CÉLULAS TRONCALES NEURALES HUMANAS. POTENCIAL PARA REPOSICIÓN CELULAR Y TERAPIA GÉNICA EN NEURO DEGENERACIÓN” Jefe de Línea Alberto Martínez Serrano Personal Científico Milagros Ramos Gómez Mª Isabel Liste Noya Marta Pérez Pereira, P.D Post-doctorales Tania Ramos Moreno Elisa García García Emma Ma González Seiz Silvia García López Indumathi Vedarethinam Resumen de investigación Las enfermedades neurodegenerativas (p.ej. Parkinson, Huntington, etc] cada vez son de mayor incidencia en países desarrollados, donde la expectativa de vida aumenta progresivamente. En algunos casos, los fármacos alivian algunos síntomas en etapas iniciales de la enfermedad, pero no la curan, al no frenar la atrofia o muerte de las neuronas implicadas. 19 La investigación en biología de células troncales humanas es de gran interés, para retrasar la progresión de estas enfermedades, o curarlas en el mejor de los casos. En nuestro grupo estamos interesados en el estudio de tres tipos de estas células: 1) Células troncales neurales, propias de tejido nervioso; 2) Células troncales derivadas de la masa celular interna del blastocisto (las llamadas “células madre embrionarias”, hES), a partir de las cuales se pueden derivar células troncales con propiedades de tejido nervioso; y 3) iPSC (induced pluripotent stem cells), muy similares a las ES pero reprogramadas desde células somáticas del adulto. Más en concreto, nos interesa el estudio de los mecanismos de auto-renovación (factores de nicho) de estas células, en especial de las células troncales neurales, y su desarrollo hacia células maduras. En el caso de neuronas, estamos particularmente interesados en la generación del fenotipo Dopaminérgico, y así poder aplicar estas células en el desarrollo de potenciales terapias en modelos de Parkinson. Otro aspecto que nos interesa es el modificar las propiedades de las células troncales mediante modificación genética, para convertirlas en “bombas biológicas” de factores terapéuticos, o bien conseguir “instruirlas/enseñarlas”, de forma que generen los tipos celulares deseados tras su implante. En este caso, estamos implantando la tecnología de nucleasas zinc-finger para poder llevar a cabo recombinación homóloga en las células humnas de interés. Por último, estamos desarrollando nanoherramientas para el estudio de la biología básica de las células, su marcaje y detección in vivo , y estudio de su biología en cultivo. 3.7 Grupo de “SEÑALIZACIÓN MITOCONDRIAL DEL CALCIO Y SEÑALIZACIÓN DE INSULINA / LEPTINA EN ENVEJECIMIENTO” Jefe de Línea Jorgina Satrústegui Gil-Delgado Personal Cientifico Jose M. Carrascosa Baeza Elena Bogónez Peláez Beatriz Pardo Merino Cayetano Von Kobbe Postdoctorales Laura Contreras Balsa Resumen de investigación La entrada de Ca2+ en mitocondrias a través del uniportador de Ca2+ (CaU) es importante para la señalización por Ca2+ pero su persistencia en la mitocondria se asocia con disfunción mitocondrial y muerte celular. Estamos estudiando sistemas de señalización mitocondrial de Ca2+ que no requieran la entrada de Ca2+ en la mitocondria, los transportadores mitocondriales de aspartato-glutamato (AGC) aralar y citrina, y los de ATP-Mg/Pi, o SCaMCs. Tanto AGCs como SCaMCs tienen dominios de union a Ca2+ hacia el espacio intermembranas y se activan por Ca2+ extramitocondrial. Aralar y citrina, los AGCs de cerebro y hígado, son componentes de la lanzadera de NADH malato aspartato. Hemos mostrado que ambos AGCs se regulan por señales de Ca2+ menores de las requeridas para activar CaU y son esenciales para la transmisión de señales de Ca2+ muy pequeñas a la mitocondria neuronal y de la célula beta secretora de insulina. Por otro lado, los SCaMCs se activan a concentraciones de Ca2+ mayores, sugiriendo que estas concentraciones pueden activar simultáneamente la entrada de Ca2+ a través de CaU y la de ATP-Mg a través de SCaMCs. Estamos desarrollando modelos murinos con deficiencias en estos transportadores mitocondriales para estudiar el papel de Aralar/AGC1 y de los SCaMCs en patología humana. El envejecimiento está asociado al desarrollo de resistencia a insulina. Recientemente describimos la presencia de hiperleptinemia en ratas viejas así como la presencia de resistencia central a la leptina y a la insulina. Nuestros resultados sugieren que la leptina podría estar implicada en el desarrollo durante el envejecimiento temprano de resistencia a insulina en el tejido adiposo, actuando a través del sistema nervioso central. Por el contrario, a edades avanzadas la leptina inhibe la acción de insulina tanto en tejido adiposo como en músculo actuando directamente sobre los tejidos. En la actualidad estamos investigando el posible papel de algunos péptidos 20 gastrointestinales (grelina y CCK), implicados en la regulación de la acción central de leptina y/o insulina, así como del comportamiento alimentario, en el desarrollo de la resistencia a la insulina con la edad y la posibilidad de revertir los cambios asociados al envejecimiento mediante restricción calórica. 4) Departamento de Dinámica y Función del Genoma 4.1 Grupo de “PROTEINAS VIRALES QUE ALTERAN LA EXPRESION GENÉTICA” Jefe de Línea Luis Carrasco Llamas Personal Científico Miguel Angel Sanz Fernández Postdoctorales Enrique Alvarez Gómez Resumen de Investigación Nuestro grupo está investigando distintas proteínas virales que producen daño en las células de mamífero durante la replicación viral. También estamos analizado los mecanismos que regulan la traducción de mRNAs virales y celulares. Nos hemos centrado en dos grupos de proteínas citopatogénicas virales: proteasas y viroporinas. Además, hemos dedicado parte de nuestros esfuerzos a elucidar la presencia de infecciones fúngicas como posibles causantes de diversas enfermedades humanas de etiología desconocida. Proteínas virales. Recientemente hemos revisado las distintas viroporinas y su modo de actuación. Estas proteínas están codificadas por distintos virus y tienen efectos adversos sobre distintas funciones celulares. La principal acción de las viroporinas en el ciclo viral es facilitar la salida de nuevas partículas virales de las células infectadas (Figura 1). Nuestro grupo ha dedicado especial atención al estudio de las proteasas de picornavirus y del HIV. Se ha estudiado el efecto de estas proteasas sobre la traducción de diversos mRNAs y su correlación con la hidrólisis de distintos factores. Notablemente hemos encontrado que las proteasas 2A y L de picornavirus son capaces de dar independencia del factor eIF2 para la traducción de los mRNAs virales. Regulación de la traducción. Hemos descrito que algunos mRNAs virales se pueden traducir por un mecanismo dual y que requieren distintos factores de iniciación en función del contexto de la traducción. El virus Sindbis constituye un buen modelo para estos estudios. La traducción del mRNA subgenómico de este virus no utiliza diversos factores de iniciación de la traducción. Recientemente hemos descrito la independencia del eIF4A en las células infectadas, pero este factor lo requiere en sistemas de traducción in vitro. Se están llevando a cabo distintas construcciones que varían la estructura de este mRNA viral para determinar con exactitud su mecanismo de traducción. 4.2 Grupo de “BIOGÉNESIS Y FUNCIÓN DE LA MITOCONDRIA Y SU REPERCUSIÓN EN PATOLOGÍA” Jefe de Línea José Manuel Cuezva Marcos Personal científico Laura Formentini María Sánchez-Aragó 21 Resumen de investigación Papel de la mitocondria en patología humana. Nuestro objetivo es la caracterización de los mecanismos celulares y moleculares que regulan la actividad de la mitocondria en células de mamífero. Fundamentalmente, estudiamos el complejo de la H+-ATP sintasa, cuello de botella de la generación de energía biológica en la fosforilación oxidativa (OXPHOS) que también está implicado en la ejecución de la muerte celular. Por la implicación evidente que la mitocondria tiene en patología humana (envejecimiento, cáncer, diabetes, neurodegeneración y enfermedades raras) hacemos especial hincapié en el estudio de aquellos mecanismos que conducen a la expresión de un fenotipo mitocondrial aberrante. En particular, de aquellos que se asocian con defectos primarios de la cantidad y/o actividad de la H+-ATP sintasa. Recientemente, hemos demostrado: (i) que la regulación de la expresión de la subunidad catalítica (β-F1-ATPase) de la H+-ATP sintasa humana se ejerce a nivel de la traducción durante el desarrollo y en oncogénesis (Fig. 1A); (ii) hemos caracterizado los mecanismos y vías de señalización que promueven la reprogramación metabólica de células tumorales (Fig. 1B) y (iii) documentado que muchos carcinomas humanos sobre-expresan el Factor de Inhibición 1 de la ATP sintasa (IF1) (Fig. 2A). Contrariamente a lo descrito previamente, hemos demostrado que IF1 actúa in vivo como un inhibidor de la actividad sintasa de la H+-ATP sintasa (Fig. 2B). La sobre-expresión de IF1 desencadena la inhibición de la OXPHOS y consecuentemente promueve la reprogramación metabólica de la célula tumoral a una glucólisis aeróbica más activa (Fig. 2B). Además, mediante la inhibición de la actividad de la H+-ATP sintasa, se genera una señal de especies reactivas de oxígeno (ROS) que desencadena en el núcleo una respuesta adaptativa, que es específica de tipo celular, encaminada a promover la proliferación y resistencia a muerte (Fig. 2B). Además, hemos desarrollado ratones transgénicos condicionales específicos de tejido que permiten la expresión regulada de IF1 para profundizar en la caracterización de las funciones biológicas de IF1. 4.3 Grupo de “REGULACIÓN POST-TRANSCRIPCIONAL DE LA EXPRESIÓN GÉNICA EN LEVADURAS” Jefes de Línea Miguel Remacha Moreno Juan Pedro García Ballesta. P. Inv CSIC Personal Científico Miguel Angel Rodríguez Gabriel Postdoctorales Antonio Jiménez Díaz Rosario Francisco Velilla Jael Sotelo Álvarez Hendricka Camargo Martínez. Resumen de investigación Se desarrollan tres líneas de investigación: A.- Ensamblaje del tallo ribosómico (TR) de Saccharomyces cerevisiae (responsable J.P.García Ballesta). Conocer el mecanismo de ensamblaje del TR es un paso necesario para comprender su función reguladora de la traducción. Se están utilizando técnicas de espectroscopia de croscorrelación de fluorescencia (FCCS) y FRET así como la expresión de modificaciones en la proteína P0, elemento central del TR con este propósito. Lo datos indican la existencia de al menos dos mecanismos alternativos de ensamblaje del TR, uno citoplasmático y otro nuclear, que pueden generar heterogeneidad ribosómica celular la cual es un elemento importante en el mecanismo de regulación de la traducción previamente propuesto por nuestro laboratorio. 22 B.- Las proteínas P y la función mitocondrial (responsable M. Remacha). En ausencia de proteínas P1/P2, las levaduras generan espontáneamente células petite, incapaces de llevar a cabo un metabolismo respiratorio. Con diferencias entre fondos genéticos, en el SK1 este porcentaje llega a alcanzar el 100%, lo que nos ha permitido estudiar a nivel molecular la relación entre las proteínas citoplasmáticas P1/P2 y la actividad mitocondrial. C.- Responsable M. A. Rodríguez Gabriel) Utilizamos las levadura Schizosaccharomyces pombe como organismos modelo en el estudio de la respuesta a estrés y la transducción de señales en células eucarióticas. Estamos interesados en los mecanismos de transducción de señales y regulación postranscripcional de la expresión génica que siguen a los estímulos ambientales. Nuestra investigación se centra en el estudio de MAPKs y proteínas de unión a RNA, tratando de elucidar las rutas bioquímicas que permiten conseguir la especificidad fisiológica a la célula. También hemos avanzado en el conocimiento de cómo la levadura es capaz de responder a distintas formas de arsénico inorgánico y qué mecanismos bioquímicos pone en marcha en respuesta a este elemento tóxico. 4.4 Grupo de “REGULACIÓN DE LA EXPRESIÓN GÉNICA EN LEISHMANIA“ Jefe de Línea José María Requena Rolanía Posdoctorales Diana Martín Lorenzo Esther Garde Contreras Resumen de Investigación Una de las características más sorprendentes de Leishmania es que carece de una regulación de la expresión génica a nivel transcripcional. En estos organismos, la expresión génica es regulada por mecanismos postranscripcionales, actualmente poco conocidos. Por este motivo, estos microorganismos constituyen modelos muy adecuados para estudiar mecanismos de regulación postranscripcional. Además, estos parásitos unicelulares son patógenos importantes en humanos. Nuestro grupo viene contribuyendo a la teoría de que la regulación génica postranscripcional en Leishmania es determinada por elementos localizados en las regiones 3’ no traducidas (3’-UTRs) de los mRNAs. Estamos estudiando proteínas de unión a RNA (RBPs), como elementos clave en la regulación de la expresión génica. En concreto, nuestro campo de estudio son las RBPs de la familia PUF. Hasta 11 proteínas PUF están codificadas en Leishmania, y gran parte de la actividad investigadora del grupo se dirige a determinar los mRNAs blanco de cada una de estas proteínas. Las proteínas PUF interaccionan con secuencias localizadas en las 3’-UTRs de sus mRNAs blanco. Sin embargo, en las bases de datos del genoma de Leishmania, no existe información sobre las regiones 5’- y 3’-UTRs de los genes. Los avances en las tecnologías de secuenciación, actualmente permiten determinar el transcriptoma de un organismo de forma sencilla. Con este objetivo, en colaboración con la unidad de Genómica y Secuenciación Masiva del CBMSO, estamos reconstruyendo el transcriptoma de varias especies de Leishmania mediante secuenciación masiva de RNA (RNA-Seq). Esta información resulta clave para determinar cómo la regulación de la expresión génica tiene lugar en el tiempo y en el espacio durante la diferenciación del parásito, así como la identificación de los elementos reguladores en los mRNAs. Por otro lado, como miembro de la red de Enfermedades Tropicales (ISCIII), nuestro grupo interviene en proyectos colaborativos dirigidos a la búsqueda de estrategias terapéuticas y de prevención de la leishmaniasis, una enfermedad que continua afectando a millones de personas en todo el mundo. 23 4.5 Grupo de “BASES MOLECULARES DE LAS ENFERMEDADES METABÓLICAS HEREDITARIAS E INVESTIGACIÓN EN NUEVAS TERAPIAS” Jefe de Línea Lourdes Ruiz Desviat Personal Científico Belén Pérez Pilar Rodríguez-Pombo Eva María Richard Alejandra Gámez Contratados postdoctorales Rocío Sánchez Resumen de investigación El grupo pertenece al CIBER de Enfermedades Raras y al Instituto de Investigación Sanitaria IdiPAZ. Nuestro trabajo se centra en el estudio de las bases moleculares de diferentes enfermedades metabólicas hereditarias (EMH), su fisiopatología y del mecanismo molecular subyacente a los distintos tipos de mutaciones con el objetivo de identificar dianas terapéuticas y desarrollar nuevos tratamientos génicos y farmacológicos. Se están empleando arrays de SNP y oligos así como secuenciación masiva para la caracterización génica de los pacientes. Se ha identificado la implicación del gen PPM1K que codifica para la fosfatasa que regula el complejo BCKDH en la enfermedad jarabe de arce. Hemos analizado el efecto de mutaciones sobre splicing, traducción y plegamiento de la proteína utilizando diferentes sistemas de expresión así como modelos celulares de enfermedad (fibroblastos de pacientes). Se ha confirmado la eficacia de la terapia antisentido para modular el splicing, aplicado a la recuperación funcional de mutaciones intrónicas y exonicas que generan sitios nuevos de splicing en diferentes EMH. Además se ha analizado la disfunción mitocondrial subyacente a varias de estas enfermedades revelando daño oxidativo reflejado por un aumento en los niveles de ROS y apoptosis que produciría la alteración en la morfología y en la respiración mitocondrial observada en las células de los pacientes. Estos resultados apuntan a la utilización de una nueva estrategia terapéutica con antioxidantes. Asimismo, se han analizado mutantes missense en aciduria metilmalónica y en defectos congénitos de glicosilación por deficiencia en la proteína fosfomanomutasa revelando un defecto en el plegamiento y estabilidad de la proteína, lo que ha conducido a la búsqueda de chaperonas farmacológicas para el tratamiento de estas enfermedades denominadas conformacionales. Por otra parte, se ha establecido la prueba de concepto del uso terapéutico de compuestos supresores de la terminación para tratar pacientes con acidurias orgánicas portadores de mutaciones nonsense. 24 INVESTIGADORES DEL IUBM INTEGRADOS EN LÍNEAS DE INVESTIGACIÓN DIRIGIDAS POR MIEMBROS DL CSIC O DESARROLLANDO ACTIVIDADES INVESTIGADORAS EXTERNAS AL CBMSO Mª José Benítez Moreno; Maria José Pérez Alvarez Grupo de “MECANISMOS MOLECULARES DE NEURODEGENERACIÓN Y REGENERACIÓN”. Jefe de Lçinea Dr. Francisco Wandosell Jurado. Prof. Investigación CSIC Resumen de Investigación Nuestro grupo se denomina -Mecanismos Moleculares de Neurodegeneración y Regeneración-, es una línea establecida en el CBM desde hace ya más algunos años. Como grupos estamos interesados en el análisis de los mecanismos moleculares disparados por procesos neurodegenerativos, intentando entender los puntos clave de estos procesos; para en un segundo intento diseñar alternativas regenerativas. Primero, estamos interesados en el estudio de los mecanismos moleculares de la degeneración y se han centrado en el papel de la ruta PI3K-Akt: GSK3 en el neurodegeneration. Hemos visto como estradiol modula elementos, tales como GSK3 y - catenin, elementos compartidos por otras vias de señalización como Wnt. Y asi hemos demostrado recientemente que el estradiol puede accionar la via Akt-mTORC1. Todos estos datos representan un nuevo sistema de señalización para esta hormona, que complementaría co las vías de IGF-1 y de Wnt. Estos resultados nos han conducido a ampliar el análisis de señalar mediado por Estradiol en fisiología neuronal normal y en algunas condiciones patológicas tales como modelos de la isquemia. . En segundo lugar y complementario estamos interesados en los mecanismos moleculares que regulan la generación y el mantenimiento de la polaridad del axonal. Esta polaridad morfológica aparece durante el desarrollo cuando la neurona distingue y comienza a extender un axon. “Se maduran” y forman posteriormente su segmento inicial del axon. Los estudios de varios laboratorios, incluyendo el nuestros han demostrado que la actividad de PI3K-kinase permite crecimiento del axonal y la determinación de polaridad del axonal (en colaboración con JJ. Grupo de Garrido´s del Instituto Cajal). Nuestro laboratorio ha ayudado a identificar algunos de los elementos que controlan polaridad, tales que GSK3. Nuestro trabajo, en este campo, tratara de identificar los elementos upstream y downstream que serían esenciales para este “proceso morfogentico”. En resumen, todos estos resultados nos han llevado a extender el análisis de la señalización mediada por neuroprotección y en condiciones patológicas; centrándonos en la vía de señalización PI3K-Akt y de los elementos por debajo de estos elementos que controlan la morfogénesis neuronal y como están modificada en patología. Juan José Berlanga Chiquero Grupo de “SÍNTESIS DE PROTEÍNAS Y SU REGULACIÓN EN EUCARIONTES”. Jefe de Línea: César de Haro Castella. Investigador CSIC. Resumen de Investigación En respuesta a distintas situaciones de estrés, incluidas infección viral, falta de nutrientes y radiación ultravioleta, la fosforilación transitoria de la subunidad del factor de iniciación de la traducción 2 (eIF2 reduce la síntesis global de proteínas, atenuando el gasto energético y facilitando la reprogramación de la expresión génica para remediar el daño. Así, la fosforilación de eIF2 mediante la activación de una de las cuatro eIF2 quinasas (HRI, PKR, PERK y GCN2) estimula la traducción de ATF4, activador transcripcional de genes implicados en la respuesta integrada al estrés. Nuestro interés se ha centrado en estas líneas: 1) Caracterización funcional del efecto antiviral de GCN2: i) GCN2 tiene efecto antiviral frente al virus de la inmunodeficiencia humana (HIV-1) y es degradado durante la infección viral; 25 ii) el RNA de HIV-1 activa GCN2, promoviendo la inhibición de la traducción del RNA viral, y la proteasa de HIV-1 degrada GCN2 para contrarrestar su efecto antiviral. 2) Respuesta diferencial de las eIF2 quinasas de Schizosaccharomyces pombe (Gcn2, Hri1 y Hri2) a distintas situaciones de estrés: i) las eIF2 quinasas de S. pombe responden de forma diferenciada a la falta de nutrientes y están implicadas en la regulación del ciclo celular. Así, la ruta de señalización de las eIF2 quinasas modula la parada del ciclo celular en la fase G1 y la capacidad de supervivencia y de apareamiento de las células en ausencia de nitrógeno. Nuestro propósito es profundizar en el conocimiento de: i) los mecanismos moleculares de activación de las eIF2 quinasas de mamífero, identificando nuevas proteínas que modulan su actividad; ii) el papel de las eIF2 quinasas de S. pombe en la regulación del ciclo celular, así como en el desarrollo y viabilidad celular. Además, nuestro objetivo final es tratar de utilizar GCN2 como diana terapéutica frente al virus HIV-1. Beatriz Cubelos Alvárez Grupo de “MORFOGÉNESIS Y DIFERENCIACIÓN DEL SÍSTEMA NERVIOSO DE VERTEBRADOS”. Jefe de línea: Paola Bovolenta. Prof. Inv CSIC. Resumen de Investigación Las GTPasas de la subfamilia de las Ras clásicas participan en la proliferación y diferenciación de precursores que dan lugar a los distintos fotoreceptores de Drosophila. En vertebrados, se ha estudiado el efecto de la sobreexpresión de formas activas e inactivas de las Ras clásicas en la formación del cristalino, pero no ha sido bien estudiada cuál es la contribución de cada miembro de la familia en el desarrollo del ojo y mucho menos de la retina.La inactivación general de KRas resulta en letalidad durante el desarrollo embrionario mientras que la inactivación de HRas, NRas o ambos no resulta en un fenotipo claro (Xie et al., 2006). Aparte de las Ras clásicas, los tres miembros de la subfamilia de RRas podrían desempeñar un papel todavía no bien caracterizado en procesos de desarrollo. RRas2 es el miembro de la subfamilia de RRas más similar a las Ras clásicas. Mis propios datos indican que el miembro RRas2 se expresa en la capa neural de la copa óptica en embriones de día 16 (E16) y de una forma muy restringida a la capa más interna en las neuronas ganglionares del ojo adulto (figura). Esto indica que RRas2 podría desempeñar un papel en las neuronas ganglionares de la retina, por ejemplo en su supervivencia o en la especificación de sus conexiones dendríticas y/o axonales. Sin embargo, el resultado más importante que da soporte a la relevancia de esta nueva línea de investigación descansa en la observación de que los ratones Rras2─/─ adultos presentan una microftalmia muy acusada, así como un desarrollo pobre del cristalino. Estos datos indican que RRas2 puede ser necesario para el crecimiento y diferenciación del ojo, probablemente desde estadios muy tempranos. Además, los ojos de ratones RRas2─/─ adultos presentan un engrosamiento de la retina en todas sus capas, engrosamiento que afecta también a la capa de neuronas ganglionares. Experimentos preliminares de administración de BrdU durante el desarrollo embrionario para seguir el destino de precursores en proliferación nos han indicado que precursores de distintos tipos celulares de la capa neural proliferan más en ratones RRas2─/─ que en ratones RRas2+/+. Una posible explicación podría ser una re-entrada en el ciclo celular del precursor intermedio que altere su correcta diferenciación y especificación. Dado que los axones de las células ganglionares de la retina son los que al salir del disco óptico forman el nervio óptico, las alteraciones en las células ganglionares de la retina (CGR) podrían afectar a los patrones de conectividad que el nervio óptico establece en el cerebro medio y en el tálamo más concretamente en el núcleo geniculado lateral y en colículo superior. El interés de esta línea de investigación se centra en el estudio de la función de RRas2 en el desarrollo y función de la retina, pretendiendo determinar qué tipos celulares se afectan en ausencia de RRas2 y caracterizar con detalle el efecto de esta deficiencia sobre la formación de sinapsis intrarretinales por parte de las CGRs y su proyección sobre el colículo superior, núcleo geniculado lateral y la corteza visual. Por otra parte, también me propongo estudiar la función 26 general de los miembros en el desarrollo del sistema nervioso central y su participación en los programas de especificación y diferenciación neural. Felix Hernández Perez. Grupo de “FUNCIÓN DE LAS PROTEÍNAS MICROTUBULARES EN NEURONAS”. Jefe de línea: Jesús Avila de Grado. Prof. Inv CSIC. Resumen de Investigación En nuestro grupo tenemos como objetivos el estudio de la proteínas del citoesqueleto neuronal, denominadas como proteínas asociadas a los microtúbulos o MAPs. Sobre una de ellas, MAP1B, que fundamentalmente se localiza en el axón, hemos observado que tiene también un importante papel en el desarrollo de las espinas dendríticas. Por otra parte, gran parte de nuestro trabajo se centra en la MAP conocida como proteína tau, una proteína relacionada con la enfermedad de Alzheimer y otras demencias (tauopatías). La proteína tau es un buen substrato para la proteína quinasa GSK3, una proteína también relacionada con la enfermedad de Alzheimer. Hemos publicado diferentes trabajos sobre tau y GSK3, y seguimos analizando un ratón transgénico condicional que sobreexpresa GSK3. Nuestros análisis se han centrado en el estudio de la neurogénesis, en el giro dentado, de este animal transgénico. Nuestros resultados han indicado una disminución de dicha neurogénesis que da lugar a una degeneración del giro dentado. Esta degeneración se debe a muerte celular y a la indicada disminución en neurogénesis. Estos problemas dan lugar a una pérdida de memoria en el ratón. Nuestros estudios futuros buscan conocer si los problemas de memoria descritos en enfermos de Alzheimer pudieran tener un origen en una neurogénesis deficiente en dichos pacientes. Pilar Herrero Solans Grupo de “Especificación de destinos neuronales en el desarrollo del sistema nervioso central de Drosophila” Jefe de Línea Fernando Jiménez Díaz-Benjumea. Investigador CSIC. Resumen de Investigación Durante el desarrollo del sistema nervioso central de Drosophila, las células progenitoras neuronales, los neuroblastos, se dividen asimétricamente para generar neuronas y autoregenerarse. En este proceso los neuroblastos atraviesan una serie de ventanas temporales que definen el destino de las distintas neuronas que se generan. Estas ventanas temporales están definidas por la expresión temporal de un conjunto de factores de transcripción. Al mismo tiempo, la expresión de los genes HOX, a lo largo del eje anteroposterior del embrión, genera diversidad en los diferentes segmentos. Nuestro objetivo es entender los mecanismos por los que los genes Hox y los factores temporal interaccionan para definir el código combinatorial de factores de transcripción que especifica el destino de las diferentes neuronas. Nuestro sistema modelo es dos conjuntos de neuronas que se caracterizan por la expresión de los neuropéptidos Leucoquinina y CCAP. Al final de la neurogénesis embrionaria, los neuroblastos, bien mueren por apoptosis o entran en quiescencia. Más tarde en el desarrollo, en estadios larvarios, los neuroblastos reanudan la proliferación y generan, en un segunda neurogénesis, el sistema nervioso del adulto. Poco se sabe acerca de los mecanismos que controlan la entrada en quiescencia y el mantenimiento del destino celular durante la quiescencia (Figura 2). En los segmentos abdominales sólo 3 de los 30 neuroblastos presentes en cada hemisegmento experimentan quiescencia, el resto muere por apoptosis. Hemos elegido los neuroblastos abdominales como sistema modelo para estudiar en primer lugar, cómo estos dos destinos están regulados genéticamente y en segundo lugar, cuáles son los cambios celulares que implican la entrada en quiescencia. 27 Alberto Lopez Bueno Línea de “MODULACIÓN DE LA RESPUESTA INMUNE POR VIRUS”. Jefe de línea: Antonio Alcamí Pertejo. Prof. Investigación CSIC Resumen de investigación Estamos investigando mecanismos de evasión inmune utilizados por virus DNA de gran tamaño, poxvirus y herpesvirus. En concreto, estamos caracterizando proteínas virales que se secretan de la célula infectada, interaccionan con citoquinas y quimioquinas, y controlan su actividad inmunomoduladora. Trabajamos en dos sistemas virales: (1) Herpesvirus como el virus herpes simplex, un patógeno humano de relevancia clínica; y (2) Poxvirus como el virus vaccinia, la vacuna de la viruela. Estos receptores virales de citoquinas tiene propiedades inesperadas, aumentando la actividad de quimioquinas o uniéndose a la superficie celular para retenerse en los tejidos infectados, y nos dan información sobre la función de las citoquinas La contribución de los receptores virales de citoquinas a la patologénesis y modulación inmune se está estudiando en ratones infectados con el virus ectromelia, un patógeno natural del ratón que causa una enfermedad parecida a la viruela y conocida como mousepox. Los virus ofrecen una oportunidad única para desarrollar sus estrategias de evasión inmune, optimizadas durante millones de años de evolución, como nuevas aproximaciones terapéuticas. En colaboración con compañías biotecnológicas, estamos desarrollando proteínas inmunomoduladoras virales como potenciales medicamentos para tratar alergias y enfermedades autoinmunes humanas. Estamos secuenciando el genoma completo de virus DNA de gran tamaño para identificar nuevos genes virales implicados en patogénesis y modulación inmune, incluyendo aislados naturales del virus ectromelia y nuevos iridovirus que infectan peces y anfibios. Los virus son las entidades biológicas más abundantes y diversas en la Tierra. Mediante aproximaciones metagenómicas, estamos caracterizando comunidades virales complejas utilizando metodologías de secuenciación de nueva generación (454-Roche, Illumina). Describimos por primera vez la comunidad de virus en un lago de la Antártida y estamos extendiendo estos estudios a otros lagos en la Península Antártica y en el Ártico. Estamos realizando estudios metagenómicos para identificar virus asociados con patologías humanas, como la esclerosis múltiple. Jose Antonio López Guerrero DEPARTAMENTO DE CULTURA CIENTÍFICA DEL CBMSO. Investigación desarrollada en un laboratorio del Departamento de Biología Molecular en el Edificio de Biología. Director: José Antonio López Guerrero Secretaria técnica: Almudena Hernando Bellido Personal científico: Raquel Bello-Morales Arroyo Predoctorales: Antonio Jesús Crespillo Alguacil Resumen Dentro del programa de Divulgación y Fomento de la Cultura Científica del CBMSO he participado en las siguientes actividades (2011-12): 1) XI (2011) y XII (2012) Semanas de la Ciencia de Madrid. Bajo mi dirección, el CBMSO ha participado con varios proyectos –como el concurso científico-literario “Escribe Con-Ciencia” (2011-2012)- que complementan al programa de visitas guiadas que se realiza a lo largo de todo el curso, destacándose, en este sentido, del resto de Centros del CSIC y UAM. 2) Colaboración con el programa Ciencia y Sociedad de Madri+d con la coordinación de un Blog científico-cultural (premiado en 2012 por la Comunidad de Madrid) y diversos suplementos en “Notiweb” (http://www.madrimasd.org/cienciaysociedad). 3) Elaboración de la página institucional en Facebook y Twitter “Departamento de Cultura Científica. Centro de Biología Molecular”. Elaboración de una página semanal de difusión científica en la Web institucional (http://www.cbm.uam.es/ccientifica/Enlaces.html). 4) Programa semanal de cultura científica Mi+dTV y UNEDtv “Tres noticias en tres minutos en TV” (http://www.madrimasd.org/informacionidi/madrimasd-tv/default.asp). 5) Participación en diversos 28 seminarios de divulgación científica en Institutos y Centros de Educación Secundaria. 6) Videoconferencias sobre temas científicos para centros de secundaria (2011). 7) Organización (2011-2012) del curso de biotecnología “Biotechnology Explorer” para profesores de secundaria. 8) Finalmente, como miembro del CBMSO, colaboro periódicamente en temas científicos y biotecnológicos con el suplemento “El Cultural”, la revista de cultura científica Journal of Feelsynapsis, con TVE (La 2), Radio Nacional de España (Radio 5 –“Entre Probetas”- y Radio 1 –“A Hombros de Gigantes-), Radio Utopía, RadioSíntesis, Radio Círculo y Radio Alzheimer de la Fundación Alzheimer España.Más información: http://www.cbm.uam.es/ccientifica/Enlaces.html Por otra parte, en investigación, mi grupo está estudiando el papel de la infección por virus HSV-1 en neurodegeneración, desmielinización y transcitosis en células oligodendrocíticas inmaduras o diferenciadas a células productoras de Mielina, viendo el papel de moléculas como PLP o Rab27a en el proceso. Mario Mencia Caballero Grupo de “REPLICACION DEL DNA DEL BACTERIOFAGO Ø29”. Jefe de Línea: Margarita Salas. Prof. Investigación del CSIC Resumen de Investigación Hemos continuado con el estudio del mecanismo de replicación del DNA de ø29 que se inicia mediante la proteína terminal (TP). La base 3’ terminal del molde es esencial para determinar cual es el nucleótido interno que inicia la replicación del DNA de ø29. Aminoácidos de los dominios intermedio y “priming” de la TP están implicados en la formación de un heterodimero estable y funcional con la DNA polimerasa de ø29. Hemos caracterizado señales de localización nuclear (NLSs) eucarióticas en la TP de ø29 y de otros bacteriófagos cuya función puede ser facilitar la transferencia horizontal de genes entre procariotas y eucariotas. En colaboración con el Dr. Borja Ibarra hemos determinado la dinámica de la DNA polimerasa de ø29 por la que se acoplan las reacciones de replicación y apertura de cadena. Hemos analizado la localización subcelular de la proteína p6 de ø29. Al comienzo de la infección la p6 localiza en una configuración periférica tipo hélice y posteriormente es reclutada en el nucleoide bacteriano, para lo que se requiere la síntesis del DNA viral. Mediante el uso de los extremos del DNA de ø29 y el sistema de replicación de ø29 hemos obtenido amplificación de DNA heterólogo iniciada con TP. La proteína p56 de ø29 es un inhibidor de la uracil-DNA glicosilasa (UDG) de B. subtilis impidiendo su unión al DNA, evitando el efecto inhibidor de la UDG sobre la replicación del DNA de ø29. En colaboración con el Dr. Juan Luis Asensio hemos determinado la estructura tridimensional de la p56. Uno de los motivos HhH del subdominio fingers de la DNA polimerasa X de B. subtilis juega un papel en la coordinación de las actividades de polimerización, exonucleasa 3’-5’ y AP endonucleasa de este tipo de polimerasas durante la resección de extremos 3’ desapareados o en la reparación de sitios abásicos. Ana Ruiz Gómez. Carlos Estella Sagrado. Cristina Grande Grupo de “ANÁLISIS DE LA SEÑALIZACIÓN CELULAR DURANTE EL DESARROLLO DE EPITELIOS EN DROSOPHILA MELANOGASTER “. Jefe de línea: Jose F. de Celis. Prof. Investigaciçon del CSIC. Resumen de Investigación El ala de Drosophila se origina a partir de un epitelio (disco imaginal de ala) cuyo crecimiento y diferenciación depende de la actividad de rutas de señalización y factores de transcripción conservados en diferentes organismos. El objetivo de nuestra línea es caracterizar la contribución de diferentes rutas de señalización celular al desarrollo del disco imaginal de ala. Mediante mutagénesis de falta y ganancia de función hemos identificado y caracterizado las 29 funciones de los genes gmd, MAP4K3, kurtz, kismet y spalt. Los análisis funcionales que realizamos consisten en estudiar los efectos de la falta de función de estos genes, sus patrones de expresión mediante hibridación in situ, y la localización sub-celular de las proteínas correspondientes. Nuestros estudios han permitido definir su participación en las rutas de señalización de Notch (gmd), Insulina (MAP4K3), Hedgehog (kurtz y kismet) y TGFb (spalt). El análisis llevado a cabo en Drosophila permitirá el estudio de estos genes en otros organismos donde sus funciones podrían estar relacionadas con el desarrollo normal y la aparición de enfermedades de origen genético. Nuestra línea incluye también a dos contratados del programa Ramón y Cajal, Dr. Carlos Estella y Dra. Cristina Grande, que disfrutan de proyectos independientes y cuyas líneas de investigación consisten en el estudio de la formación del patrón de los apéndices de Drosophila (Dr. Carlos Estella), y el estudio de la evolución de los planes corporales en organismos bilaterales (Dra. Cristina Grande). José Manuel Sierra Grupo de “REDES REGULADORAS DE LA EXPRESIÓN GÉNICA”. Jefe de línea: Jose María Izquierdo. Cient. Titular del CSIC Resumen de investigación La regulación de la expresión génica en eucariotas superiores es un proceso multifásico que implica varios eventos complejos, tales como la transcripción, el procesamiento, la traducción y el recambio de los RNAs y de las proteínas. Actualmente está bien establecido que cada paso de este circuito informativo se modula por la acción de RNAs y/o proteínas reguladoras. Hasta ahora, cada paso ha sido estudiado de manera individual, pero poco se sabe sobre cómo el efecto combinado de todos los eventos reguladores se coordinan por la acción de proteínas multifuncionales. Por lo tanto, la cuestión fundamental de cómo la información genómica y transcriptómica se procesa en diferentes niveles reguladores en respuesta a cambios dinámicos y tensiones ambientales para obtener la diversidad proteómica específica ha quedado, por lo tanto, sin respuesta. Las proteínas T-cell intracellular antigen 1 (TIA1) y TIA1 related/like (TIAR/TIAL1) son moduladores multifuncionales de las diferentes capas que constituyen el flujo de la expresión génica y, por tanto, unos buenos candidatos para llevar a cabo estos estudios. En el núcleo, estas proteínas interaccionan tanto con el DNA como con la RNA polimerasa II regulando las velocidades de transcripción. Las proteínas TIA también funcionan como moduladores del procesamiento de los pre-mRNAs promoviendo el reclutamiento de la ribonucleoproteína nuclear U1 snRNP para cortar y empalmar exones alternativos y constitutivos. En el citoplasma, estas proteínas tienen la doble función de regular la estabilidad y/o traducción de los mRNAs implicados en respuestas celulares apoptóticas e inflamatorias. Desde un punto de vista (pato)fisiológico, estos reguladores han sido implicados en el desarrollo de procesos biológicos complejos como son la apoptosis, la inflamación, las infecciones mediadas por virus, el estrés ambiental, el desarrollo embrionario o la tumorogénesis. Sin embargo, sus efectos sobre la proliferación, la diferenciación y el crecimiento celular necesitan ser esclarecidos. 30 PROYECTOS DE INVESTIGACIÓN COMPETITIVOS dirigidos por miembros del IUBM en 2014 En la siguiente tabla se reflejan las referencias de los proyectos competitivos obtenidos por miembros del IUBM actuando como directores científicos en la correspondiente solicitud, que estuvieron activos durante el año 2014. REFERENCIA TITULO INVESTIGADOR PRINCIPAL ORGANISMO ANALISIS MOLECULARES Y PRECLINICOS SAF2011-29403 DE LA CAPACIDAD ANTICANCER DE LOS PARVOVIRUS ALMENDRAL DEL RIO, JOSE MARIA MINECO COMITE DE GESTION DE PROGRAMA: PLATAFORMA PARA EL DESARROLLO DE S2013/ABI-2906 ESTRATEGIAS DE CONTROL DE SALUD ANIMAL ALMENDRAL DEL RIO, JOSE MARIA CM CARACTERIZACION DE LA AMILS PIBERNAT, CGL2012-34020 BIODIVERSIDAD DEL AMBIENTE EXTREMO RICARDO DE RIO TINTO Y SUS APLICACIONES MINECO FP7-SPACE2013-1S SMALL OR MEDIUM-SCALE FOCUSED RESEARCH PROJECT AMILS PIBERNAT, RICARDO EUROPEO 324439 HOTDROPS BERENGUER CARLOS, JOSE EUROPEO SELECCIÓN DE ALTA EFICIENCIA DE BIOCATALIZADORES TERMOESTABLES BIO2013-44963PARA QUIMICA VERDE EMPLEANDO R MICROORGANISMOS TERMOFILOS MODIFICADOS BERENGUER CARLOS, JOSE MINECO RTC-2014-1439- BIOCONVERSION DE FITOSTEROL EN 1 PRINCIPIOS ACTIVOS FARMACEUTICOS BERENGUER CARLOS, JOSE MINECO BERENGUER CARLOS, JOSE MINECO BONAY MIARONS, PEDRO FIS BULLIDO GOMEZ-HERAS, MARIA JESUS MINECO DESARROLLO DE UN NUEVO SISTEMA BIO2013-50068- PARA UNA FACIL EDICION DE GENOMAS EXP DE MAMIFEROS BASADO EN LA PROTEINA ARGONAUTA DE BACTERIAS CARACTERIZACION DE LA INTERACCION ENTRE LECTINAS TIPO C Y PARASITOS PI11/00033 INTRACELULARES TRYPANOSOMA CRUZI Y LEISHMANIA IDENTIFICACION DE GENES ASOCIADOS A LA ENFERMEDAD DE ALZHEIMER SAF2010-15558 MEDIANTE ANALISIS GENOMICO FUNCIONAL DE MODELOS CELULARES PATOGENICOS BFU2012-31861 NUEVOS MECANISMOS DE INICIACION DE LA TRADUCCION DE MRNAS VIRALES CARRASCO LLAMAS, LUIS MINECO S2010/BMD2423 ESTUDIO DE LOS MECANISMOS DE RESISTENCIA A INSULINA: IMPLICACIONES EN OBESIDAD, DIABETES Y SINDROME METABOLICO CARRASCOSA BAEZA, JOSE MARIA CM 31 PAPEL DE LA PROTEINA 4.1 EN LA BFU2011-22859 ORGANIZACIÓN Y LA DINAMICA DE LOS MICROTUBULOS CORREAS HORNERO, ISABEL MINECO S2010/BMD2305 PROFUN II: INTERACTOMICA DEL CENTROSOMA CORREAS HORNERO, ISABEL CM SAF2012-31279 PAPEL DE RRA S2 EN EL DESARROLLO Y FUNCION DE LA RETINA CUBELOS ALVAREZ, BEATRIZ MINECO S2010/BMD2402 COMITÉ DE GESTION DE PROGRAMA: LA MITOCONDRIA Y SU IMPLICACION EN PATOLOGIA HUMANA CUEZVA MARCOS, JOSE MANUEL CM SAF201341945-R La motocondria y su difusion en patologia:papel de IF1 CUEZVA MARCOS, JOSE MANUEL MINECO SAF2012-38042 FISIOPATOLOGIA Y TERAPIA DE LA ATAXIA DE FRIEDREICH DIAZ NIDO, JAVIER MINECO DIAZ NIDO, JAVIER CM ESTELLA SAGRADO, CARLOS MINECO FERNANDEZ LOBATO, MARIA MINECO FERNANDEZ LOBATO, MARIA MINECO FERNANDEZ PIQUERAS, JOSE MINECO FERNANDEZ PIQUERAS, JOSE CM FRESNO ESCUDERO, MANUEL MINECO FRESNO ESCUDERO, MANUEL FIS S2010/BMD2331 BFU2012-34353 BIO2010-20508C04-04 BIO2013-48779C4-4-R SAF2012-36566 S2010/BMD2470 SAF201342850-R COMITÉ DE GESTION DE PROGRAMAS: REDES DE SEÑALIZACION Y VIAS EFECTORAS EN MODELOS CELULARES Y ANIMALES DE ENFERMEDADES NEURODEGENERATIVAS ESTUDIO DE LA FUNCION DEL FACTOR DE TRANSCRIPCION SP1 DURANTE LA ESPECIFICACION Y CRECIMIENTO DE LOS APENDICES BIOINGENIERIA DE GLICOSIDASAS PROCEDENTES DE LEVADURAS NO CONVENCIONALES PARA SU APLICACIÓN EN LA PRODUCCION INDUSTRIAL DE AZUCARES PREBIOTICOS Y BIOETANOL. BUSQUEDA, MEJORA Y SOBREPRODUCCIÓN DE GLICOSIDASAS DE LEVADURAS QUE PRODUZCAN COMPUESTOS BIOACTIVOS DE INTERESES EN ALIMENTACIÓN INTEGRACION DE ESTRATEGIAS GENOMICAS EN UN MAPA DE ALTERACIONES GENETICAS Y EPIGENETICAS QUE GOBIERNAN EL DESARROLLO DE LOS LINFOMAS LINFOBLASTICOS T EL CICLO CELULAR Y LOS MICRORNAS EN LA AUTORENOVACION Y DIFERENCIACION DE CELULAS PROGENITORAS PROSTANOIDES Y RECEPTORES TIPO TOLL COMO MEDIADORES CLAVE Y POTENCIALES DIANAS TERAPEUTICAS ENFERMEDADES INFLAMATORIAS CRONICAS: CANCER Y OBESIDAD RD12/0018/0004 RICET2012 32 S2010/BMD2332 REDES MOLECULARES Y CELULARES EN ENFERMEDADES INFLAMATORIAS FRESNO ESCUDERO, MANUEL CM FP7-PEOPLE2012-ITN HOMIN--HOST-MICROBE INTERACTIONS IN HEALTH AND DISEASE. INTERFACE WITH THE IMMUNE SYSTEM FRESNO ESCUDERO, MANUEL EUROPEO FRESNO ESCUDERO, MANUEL UAM-BANCO SANTANDER IDENTIFICACION DE BIOMARCADORES PARA EL SEGUIMIENTO DE PACIENTES CEAL INFECTADOS CON DISTINTOS LINAJES DE TRYPANOSOMA CRUZI Y SOMETIDOS A TRATAMIENTO FUNDAMENTOS MOLECULARES DE LAS PROPIEDADES MECANICAS Y TERMICAS BIO2012-37649 MEJORADAS DE PARTICULAS VIRICAS CON APLICACIONES POTENCIALES EN BIOTECNOLOGIA Y NANOTECNOLOGIA MECANISMOS INMUNOREGULADORES EN EL DESARROLLO DE LA PATOGENIA EN PI12/00289 LA ENFERMEDAD DE CHAGAS: APLICACIONES TRASLACIONALES DESCRIPCION DE LA RED GENICA NODAL DURANTE EL DESARROLLO CGL2011-29916 EMBRIONARIO DE LOFOTROCOZOA Y SU PAPEL EN LA REGULACION DE LA ASIMETRIA BILATERAL ANALISIS DE LA FUNCION DE GSK-3BETA EN LA NEUROGENESIS ADULTA EN BFU2013RATONES TRANSGENICOS CON 40664-P EXPRESION CONDICIONAL DE LA QUINASA COMITÉ DE GESTION DE PROGRAMA: REDES DE SEÑALIZACION Y VIAS S2010/BMDEFECTORAS EN MODELOS CELULARES Y 2331 ANIMALES DE ENFERMEDADES NEURODEGENERATIVAS ACCIONES DE PROSTANOIDES Y LIGANDOS DEL RECEPTOR LXR EN SAF2011-23971 PROCESOS INFLAMATORIOS Y SUS IMPLICACIONES EN LA FISIOPATOLOGIA CARDIOVASCULAR GARCIA MATEU, MAURICIO MINECO GIRONES PUJOL, NURIA FIS GRANDE PARDO, CRISTINA MINECO HERNANDEZ PEREZ, FELIX MINECO HERNANDEZ PEREZ, FELIX CM IÑIGUEZ PEÑA, MIGUEL ANGEL MINECO METAGENOMICA DE VIRUS EN SAF2012-38421 PATOLOGIAS FRECUENTES DE LA CAVIDAD BUCAL LOPEZ BUENO, ALBERTO MINECO ASPECTOS FISIOPATOLOGICOS DE LOS TRANSPORTADORES DE GLICINA EN LA SAF2011-28674 NEUROTRANSMISION GLICINERGICA: HIPERPLEXIA Y DOLOR LOPEZ CORCUERA, BEATRIZ MINECO RD12/0019/0013 RETICS TERCEL MARTINEZ SERRANO, ALBERTO FIS S2010/BMD2336 COMITÉ DE GESTION DE PROGRAMA: ESTUDIO DE LA BIOLOGIA DE CELULAS MADRE NEURALES PARA SU EMPLEO EN TERAPIA CELULAR EN ENFERMEDADES NEURODEGENERATIVAS MARTINEZ SERRANO, ALBERTO CM RD06/0010/0009 RED TRANSVERSAL DE TERAPIA CELULAR (TERCEL) MARTINEZ SERRANO, ALBERTO FIS 33 LA QUINASA GRK2 (G PROTEINRECEPTOR KINASE 2) COMO UN NODO SAF2011-23800 CENTRAL EN LAS REDES DE SEÑALIZACION CELULAR. PAPEL EN FISIOPATOLOGIA MAYOR MENENDEZ, FEDERICO MINECO RD12/0042/0012 RED RECAVA 2012 MAYOR MENENDEZ, FEDERICO FIS S2010/BMD2332 MAYOR MENENDEZ, FEDERICO CM PEREZ GONZALEZ, BELEN FIS PEREZ GONZALEZ, BELEN MINECO PEREZ GONZALEZ, BELEN CM REQUENA ROLANIA, JOSE MARIA FIS PI13/01239 IPT-2012-0561010000 S2010/BMD2402 REDES MOLECULARES Y CELULARES EN ENFERMEDADES INFLAMATORIAS ACIDEMIA METILMALONICA: IDENTIFICACION DE GENES RESPONSABLES, GENERACION DE MODELOS CELULARES DE ENFERMEDAD E INVESTIGACION EN TERAPIAS DESARROLLO DE CHAPERONAS FARMACOLOGICAS PARA EL TRATAMIENTO DE ENFERMEDADES RARAS NEUROMETABOLICAS COMITÉ DE GESTION DE PROGRAMA: LA MITOCONDRIA Y SU IMPLICACION EN PATOLOGIA HUMANA RD12/0018/0009 RETICS ENFERMEDADES TROPICALES SAF201347556-R ESTUDIO CLICICO-EPIDEMIOLOGICO DE REQUENA ROLANIA, JOSE LA LEISHMANIASIS EN ESPAÑA MEDIANTE MARIA SECUENCIACION MASIVA MINECO S2010/BMD2361 COMITÉ DE GESTION DE PROGRAMA: UNA NUEVA DNA PRIMASA/POLIMERASA CON UN POSIBLE PAPEL EN ENVEJECIMIENTO REQUENA ROLANIA, JOSE MARIA CM HEALTH-F32013-603181 CLINICAL STUDIES ON A MULTIVALENT VACCINE FOR HUMAN VISCERAL LEISHMANIASIS REQUENA ROLANIA, JOSE MARIA EUROPEO RD06/0021/0008 RED DE INVESTIGACION COLABORATIVA REQUENA ROLANIA, JOSE EN ENFERMEDADES TROPICALES (RICET) MARIA NUEVAS VIAS DE SEÑALIZACION INICIADAS POR INTERACCION ENTRE PROTEINAS GALFAQ Y PKCz TRAS PI11/00126 ACTIVACION POR GPCRs: SU REGULACION E IMPLICACION EN ENFERMEDADES CARDIOVASCULARES DESARROLLO DE SISTEMAS LENTIVIRALES INDUCIBLES POR SAF2012-32166 INFLAMACION Y VALIDACION EN MODELOS ANIMALES IDENTIFICACION DE PACIENTES CON MUTACIONES EN GENES IMPLICADOS EN PI12/02078 LA BIOSÍNTESIS Y TRANSPORTE DE COFACTORES DEL METABOLISMO ENERGÉTICO MITOCONDRIAL SAF201343005-R IN VIVO AND IN VITRO STUDIES OF AFFECTED CELLULAR PATHWAYS AND GENETIC THERAPIES IN FIS RIBAS NUÑEZ, CATALINA FIS RODRIGUEZ MARQUEZ, ANTONIO MINECO RODRIGUEZ POMBO, PILAR FIS RUIZ DESVIAT, LOURDES MINECO 34 NEUROMETABOLIC DISEASES CSN-UAM BFU201130456-C02-01 IDENTIFICACION DE LOS GENES IMPLICADOS EN LA RESPUESTA RADIOADAPTATIVA AL DESARROLLO DE LOS LINFOMAS LINFOBLASTICOS DE CELULAS T INDUCIDA POR LA EXPOSICION A BAJAS DOSIS DE RADIACION GAMMA FUNCION DE SCAMC3, SCAMC1 Y ARALAR/AGC1 EN SEÑALIZACION POR CA2+ A MITOCONDRIAS, EN MUERTE CELULAR DEPENDIENTE DE CA2+, Y EN NIVELES Y TRAFICO DE ASPARTATO Y NAA CEREBRALES SANTOS HERNANDEZ, JAVIER CSN SATRUSTEGUI GILDELGADO, JORGINA MINECO UAM-IIS-FJD 2013 IMPLICACION DE ARALAR/AGC1/SLC25A12 SATRUSTEGUI GILEN EL CICLO GLUTAMATO-GLUTAMINA Y DELGADO, JORGINA EN EPILEPSIA IIS-FJD S2010/BMD2402 COMITÉ DE GESTION DE PROGRAMA: LA MITOCONDRIA Y SU IMPLICACION EN PATOLOGIA HUMANA SATRUSTEGUI GILDELGADO, JORGINA CM SOTO ALVAREZ, MANUEL FIS VENTOSO, IVAN MINECO ZAFRA GOMEZ, FRANCISCO MINECO ANALISIS DE LA ANTIGENICIDAD E INMUNOGENICIDAD DE LOS FACTORES PI11/00095 DE INICIACION DE LA TRADUCCION DE LEISHMANIA REGULACION DE LA TRADUCCION EN LA RESPUESTA AL ESTRÉS EN EUCARIOTAS. BFU2013IMPLICACIONES EN ADAPTACION, 45003-R LONGEVIDAD Y PATOLOGIAS RELACIONADAS CON LA EDAD HIPOTESIS GLUTAMATERGICA DE LA ESQUIZOFRENIA: MECANISMOS SAF2011-29961 MOLECULARES DEL TRANSPORTE DE GLUTAMATO Y GLICINA EN LA SINAPSIS GLUTAMATERGICAS PUBLICACIONES 2014 1. Alonso R, Pisa D, Marina AI, Morato E, Rabano A, Carrasco L (2014a) Fungal infection in patients with Alzheimer's disease. J Alzheimers Dis 41: 301‐311 2. Alonso R, Pisa D, Rabano A, Carrasco L (2014b) Alzheimer's disease and disseminated mycoses. Eur J Clin Microbiol Infect Dis 33: 1125‐1132 3. Alvarez L, Bricio C, Blesa A, Hidalgo A, Berenguer J (2014a) Transferable denitrification capability of Thermus thermophilus. Appl Environ Microbiol 80: 19‐28 4. Alvarez L, Bricio C, Hidalgo A, Berenguer J (2014b) Parallel pathways for nitrite reduction during anaerobic growth in Thermus thermophilus. J Bacteriol 196: 1350‐1358 35 5. 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Regulación de la expresión génica por la prostaglandina F2 en linfocitosT y cardiomiciocitos: Activación de la vía de señalización de calcio/calcineurina/NFAT. Bases genéticas de la respuesta adaptativa en timocitos de ratón El ribosoma de Leishmania y su BIOCIENCIAS MOLECULARES RAMÍREZ GARCÍA, LAURA interacción con el sistema inmunológico del hospedador. Ca2+ modulation of mitochondrial function under physiological and BIOCIENCIAS MOLECULARES RUEDA DÍEZ, CARLOS pathological stimulation: Role of the ATP‐Mg/Pi carrier, SCaMC‐3. DIRECTOR MENCIÓN Manuel Fresno y INTERNACIONAL Núria Gironés Pujol. Predestinación García Rui Miguel A. Iñiguez José Fernández Piqueras/ Javier Santos/ Pablo Fernández Navarro Manuel Soto compendio publicaciones Jorgina Satrústegui/ Compendio y con Araceli del Arco/ MENCION Beatriz Pardo INTERNACIONAL. 43 SÁNCHEZ CENIZO, LAURA MERCEDES BIOLOGIA MOLECULAR BIOCIENCIAS MOLECULARES NOGUÉS VERA, LAURA Función oncogénica del inhibidor de la H+‐ATP sintasa, IF1: Desarrollo y caracterización de modelos transgénicos condicionales y tejido‐ específicos. José M. Cuezva GRK2 as a new onco‐ modulator of breast Federico Mayor y tumoural transformation Petronila Penela through the regulation of the P53/MDM2 axis. MENCION INTERNACIONAL. TESIS DOCTORALES TUTORADAS POR PROFESORES DEL I.U. BIOLOGIA MOLECULAR ‐ 2014 PROGRAMA ALUMNO TITULO DIRECTOR TUTOR MENCIÓN BIOCIENCIAS MOLECULARES AGUERRI MORENO, MIRIAM Búsqueda de perfiles moleculares diferenciales entre tolerancia y sensibilización en la respuesta alérgica. Blanca Cárdaba M.A. Iñiguez BIOLOGIA MOLECULAR ALAMEDA SERRANO, DANIEL Regulación transcripcional de la inflamación en macrófagos por el receptor X de retinoides. Mercedes Ricote Miguel A. Iñiguez ALVAREZ AYERZA, NÉSTOR Mecanismo de acción de los inhibidores de Colina Quinasa en cáncer de mama. Juan Carlos Lacal y M! Teresa Gómez del Pulgar. Isabel Correas CONFIDENCIAL Alvarez Náñez, Silvia Study of the effects of MCM downregulation in vivo usinga murine MCM3 GFP‐ Luciferase model Juan Méndez Zunzunegui BALZANO, DEBORAH Mechanistc studies on proteina kinase B regulation and insights for the dicovery of potential allosteric kinase inhibitors. Daniel Lietha Catalina Ribas BIOCIENCIAS MOLECULARES BERNARDINI, ALEJANDRA Papel de la respuesta a choque térmico en la resistencia a quinolonas de Stenotrophomonas maltophilia. José Luis Martínez Jose Berenguer BIOCIENCIAS MOLECULARES BUSNADIEGO PRIETO, OSCAR Central role for TGF‐beta in extracellular matrix homeostasis fibrotic process and vascular remodeling. Fernando Rodríguez‐ Pascual Cristina Murga Montesin os MENCIÓN DOCTORADO INTERNACIONA L BIOCIENCIAS MOLECULARES BIOCIENCIAS MOLECULARES BIOCIENCIAS MOLECULARES 44 Role of macrophages in cardiac homeostasis and repair following myocardial infarction The miR‐17‐92 cluster counteracts quiescence and chemoresistance of pancreatic cancer stem cells. Genomica and genetic dissection of pheochromocytoma and paraganglioma Mercedes Ricote Pacheco José Mª Carrascos a Christopher Heeschen Petronila Penela Mercedes Robledo José M. Cuezva DRAMCIANIN, MARIJA Structural and functional characterization of MuB protein involved in DNA targeting for transposition. Santiago Ramón‐ Maiques Miguel A. Iñiguez MENCIÓN DOCTORADO EUROPEO BIOCIENCIAS MOLECULARES DUKANOVIC, LJILJIANA Role of Aurora kinase A in the regulation of apical‐ basolateral polarity in mouse epidermal development. Mirna Pérez Moreno Isabel Correas BIOLOGIA MOLECULAR ESCOLANO ARTIGAS, AMELIA La calcineurina en macrófagos: polarización y modulación de la respesta inflamatoria. Juan Miguel Redondo Federico Mayor ESTACIO GÓMEZ, ALICIA Analysis of the specification of the abdominal leucokinergic neurons in the central nervous system of Drosophila melanogaster. Fernando J. Díaz‐ Benjumea José F. de Celis Ana Busturia Carlos Estella Maria Antonia Blasco Pablo Gómez del Arco GABANDÉ RODRÍGUEZ, ENRIQUE Alteraciones de la autofagia mediadas por la acumulación de esfingomielina en la enfermedad de Neimann Pick Tipo A. Dolores Ledesma/ Carlos Dotti Mª Jesús Bullido GÁLVEZ SANTISTEBAN, MANUEL ANGEL Molecular and mechanical control of single lumen formation during epithelial morphogenesis by Synaptotagmin‐like proteins. Fernando Martín Belmonte Beatriz López Corcuera Mención Internacional GARCÍA GALÁN, CRISTINA Whole exome sequencing of Urothelial Bladder Cancer: Identification of ARID1A and STAG2 as new, important, players. Francisco X. Real Mª Jesús Bullido GUTIÉRREZ SANZ, ÓSCAR Reconstitution of redox enzymes on gold electrods mimicking their natural environment. Antonio López de Lacey Maria Fernández Lobato MENCIÓN DOCTORADO INTERNACIONA L BIOCIENCIAS MOLECULARES Cedenilla Horcajuelo, Marta BIOCIENCIAS MOLECULARES CIOFFI, MICHELLE BIOCIENCIAS MOLECULARES DE CUBAS, AGUIRRE ANDRÉS BIOCIENCIAS MOLECULARES BIOLOGIA MOLECULAR BIOCIENCIAS MOLECULARES FERERES RAPOPORT, SOL BIOCIENCIAS MOLECULARES FORONDA ALVARO, MIGUEL BIOCIENCIAS MOLECULARES BIOCIENCIAS MOLECULARES BIOCIENCIAS MOLECULARES BIOCIENCIAS MOLECULARES dRYBP transcription‐ dependent and transcription‐independent functions in Drosophila melanosgaster. Study of impact of reduced Sox4 expression levels in homeostasis, cancer and ageing. 45 Fernando Rojo y Renata Moren o Miguel A. Rodríguez ‐Gabriel Ignacio Torres Cecilio Giménez Esteban Domingo Solans Mauricio García Mateu Mª Angeles Muñoz/ Rafael Correa Nuria Gironés Victor de Lorenzo José Berenguer Miguel Vicente y Ana I. Rico José Berenguer Biología estructural de fibras de adenovirus Mark Johan van Raajj Mauricio García Mateu LARIO LAGO, ARGENTINA Role of microtubule‐ dependent transport in synaptic plasticity in hippocampal neurons José A. Esteban Francisco Zafra MENCIÓN DOCTORADO INTERNACIONA L LÓPEZ BERNARDO, ELIA Regulation of the expresssion and function of mitochondrial uncoupling proteina UCp3 in response to oxidative stress: involvement of the transcription factor Nrf2 and implications in cardiac ischemia‐reperfusion. Susana Cadenas Susana Cadenas MENCIÓN DOCTORADO INTERNACIONA L Caracterización del sistema regulador de dos componentes híbrido, TolR, en Azoarcus sp. CIB Funciones de la calcineurina y Rcan1 en el remodelado patológico de la pared vascular. Eduardo Díaz Fernández Y Teresa Zamarro Juan M. Redondo y Miguel R. Campanero José Berenguer Miguel A. Iñiguez Análisis de los mecanismos de especificación de las neuronas CCAP/Bursicón en el sistema nervioso central de Drosophila melanogaster. Fernando J. Díaz‐ Benjumea Javier Díez Guerra BIOCIENCIAS MOLECULARES HERNÁNDEZ ARRANZ, SOFÍA BIOCIENCIAS MOLECULARES HERNÁNDEZ GARZÓN, EDWIN BIOCIENCIAS MOLECULARES HIGUERA HERNÁNDEZ, IGNACIO DE LA BIOCIENCIAS MOLECULARES JARAMILLO RUIZ, LEIDY DIDIANA BIOCIENCIAS MOLECULARES KIM, JUHYUN BIOLOGIA MOLECULAR KRUPKA, MARCIN BIOCIENCIAS MOLECULARES KUMAR SINGH, ABHIMANYU BIOCIENCIAS MOLECULARES BIOCIENCIAS MOLECULARES BIOCIENCIAS MOLECULARES MARTÍN MOLDES, ZAIRA BIOCIENCIAS MOLECULARES MÉNDEZ BARBERO, NEREA BIOCIENCIAS MOLECULARES Regulación del metabolismo del carbono en Pseudomonas putida: Estrategia del sistema regulador formado por la proteina Crc y los sRNAs CrcZ y CrcY. Regulación de la captación de glucosa en astrocitos por el eje insulina/IGF‐1 Factores determinantes del reconocimiento de nucleótidos en el virus de la fiebre aftosa Efecto de la infección por el VIH‐1 sobre el fenotipo y la funcionalidad de las células Treg (Treg). Uso de los dendrímeros carbosilano com protectores de las Treg frente a la infección por el VIH. Transcription dynamics in TOL plasmid pWW0 of the soil bacterium Psedomonas putida mt‐2 A structural switch involved in the bidiretinal polymerization and membrane attachment of the streptococcal FtsA division protein. MORIS SANZ, MARTA 46 BIOCIENCIAS MOLECULARES MORO MUÑOZ, ROSA Mª BIOCIENCIAS MOLECULARES MUDGAL, GAURAV BIOCIENCIAS MOLECULARES MUÑOZ MORENO, RAQUEL Terapia génica y celular para la corrección de la Lipodistrofia congénita generalizada. Structural insights into coronavirus binding to host aminopeptidase N and interaction dynamics. Study of autophagy regulation and innate immunity in African Swine Fever Virus infection. BIOCIENCIAS MOLECULARES NOGUÉS VERA, LAURA GRK2 as a new onco‐ modulator of breast tumoural transformation through the regulation of the P53/MDM2 axis. BIOCIENCIAS MOLECULARES ORTEGA PRIETO, ANA MARÍA Mutagénesis letal del virus de la hepatitis C. BIOCIENCIAS MOLECULARES ORTIZ BAZÁN, Mª DE LOS ANGELES BIOCIENCIAS MOLECULARES PALENZUELA MUÑOZ, ROCÍO A. BIOCIENCIAS MOLECULARES PÉREZ GARCÍA, VICENTE BIOCIENCIAS MOLECULARES BIOCIENCIAS MOLECULARES BIOCIENCIAS MOLECULARES PIÑERO LAMBEA, CARLOS REVILLA YATES, EVA RODRIGUEZ FRATICELLI, ALEJO EZEQUIEL Análisis del papel de los componentes de la ruta RAD6/RAD18 de Sacharomyces cereviasiae en la tolerancia al daño en el DNA durante la replicación cromosómica. The light chain of MAP1B: a novel modulator of AMPA receptor trafficking in hippocampal neurons Papel de la oligomerización de las PI3K de clase IA p100 y p110 en la regulación de la actividad de PTEN. Design and construction of synthetic adhesins driving the specific attachment of Escherichia coli to target surfaces, cells ,and tumors. Análisis molecular y funciona lde dachsous durante el desarrollo larvario de Drosophila melanogaster. Identificación y estudio de nuevos mecanismos moleculares implicados en la morfogénesis epitelial: mecanotransducción, orientación del huso mitótico y endocitosis. BIOCIENCIAS MOLECULARES RODRIGUEZ TORRES, Mª FERNANDA Función de los factores de transcripción Cux1 y Cux2 en la actividad neuronal y en la conectividad a través del cuerpo calloso. BIOCIENCIAS MOLECULARES ROMERA CÁRDENAS, GEMA Development of a model system to study NK cell hyporesponsiveness Fernando Larcher y Rodolfo Murillas Belén Pérez González José Mª Casasnovas Juan José Berlanga Covadonga Alonso e Inmaculada Galindo José Mª Almendral MENCIÓN DOCTORADO INTERNACIONA L Federico Mayor y Petronila Penela Federico Mayor Esteban Domingo y Celia Perales José Mª Almendral José A. Tercero Miguel A. Rodríguez ‐Gabriel José A. Esteban y Marion Benoist Cecilio Giménez Ana Clara Carrera Beatriz López Corcuera Luis A. Fernández y Gustavo Bodelón Mario Mencía MENCIÓN DOCTORADO EUROPEO Isabel Rodríguez Enriquez Carlos Estella Fernando Martín Belmonte y Miguel Angel Alonso Lebrero. Beatriz Cubelos Marta López Nieto Javier Díez Guerra Hugh T. Reyburn Antonio Rodríguez 47 RUANO GALLEGO, DAVID Engineering Escherichia coli K‐12 for the secretion of single domain antibodies against attaching and effacing bacterial pathogens and for the injection of proteins of therapeutic potential into human cells. Luis A. Fernández y Gustavo Bodelón José Berenguer BIOCIENCIAS MOLECULARES Salema, Valencio Francis Development of Escherichia coli cell surface display for selection of single domain antibodies from immune libraries Luis Ángel Fernández Herrer Jose Berenguer BIOCIENCIAS MOLECULARES SÁNCHEZ ALONSO, VERÓNICA Función de RalGDS en cáncer asociado a colitis y en el desarrollo de la célula T. Ana González García Petronila Penela BIOCIENCIAS MOLECULARES 48