Iván Ferrer Rodríguez, Ph.D. Catedrático Introducción al metabolismo Capítulo 8 Reece, Urry, Cain, Wasserman, Minorsky, Jackson, 2009 Campbell Biology 9th Edition Introducción El metabolismo es el conjunto de todas las reacciones químicas (miles) que ocurren en un organismo: Bacteria Protista Hongo Planta Cuerpo humano 2 Ejemplos Reacciones Metabólicas Unión de amino ácidos para formar proteínas. Figura 8.1 Rompimiento de proteínas para generar amino ácidos. Conversión de azúcares a amino ácidos. Conversión de amino ácidos a azúcares. Respiración celular y fotosíntesis. 3 Bioluminiscencia por un hongo o un animal. Rutas metabólicas El metabolismo es como un mapa de carretera. Los puntos representan moléculas. Las líneas representan las reacciones químicas que transforman estas moléculas. Las reacciones ocurren en una secuencia lógica llamada ruta metabólica. 4 Rutas metabólicas Cada paso es catalizado por una enzima. Al igual que las luces controlan el tránsito, los mecanismos que controlan las enzimas balancean el suplido metabólico. Las enzimas son proteínas que catalizan las reacciones químicas, o sea, ayudan a que ocurran con mayor rapidez. 5 Metabolismo El metabolismo se puede dividir en: 1) Reacciones catabólica 2) Reacciones anabólica 1) Catabólica - son reacciones metabólicas donde se libera energía rompiendo moléculas en compuestos más simples. Ejemplo: Respiración celular - la glucosa se rompe a CO2 y agua y se libera energía, que estará disponible para la célula hacer trabajo. 6 Respiración celular Metabolismo El metabolismo se puede dividir en: 1) Reacciones catabólica 2) Reacciones anabólica 2) Anabólica - son reacciones metabólicas donde se absorbe energía para producir moléculas complejas a partir de moléculas simples. 7 Ejemplo: Fotosíntesis: proceso mediante el cual las plantas consumen energía del sol y la convierten en energía química contenida en los enlaces de las moléculas de azúcar. Metabolismo El metabolismo se puede dividir en: 1) Reacciones catabólica 2) Reacciones anabólica 2) Anabólica - son reacciones metabólicas donde se absorbe energía para producir moléculas complejas a partir de moléculas simples. Ejemplo: Síntesis de proteínas a partir de amino ácidos. 8 Energía La energía es un componente esencial al proceso metabólico. Energía se define como la capacidad para causar cambios. La célula maneja los materiales y recursos de energía que tiene, transforma la energía presente en los alimentos y la pone a su disposición para hacer trabajo. Energía cinética es energía del movimiento, está presente en cualquier cuerpo que se mueve. Energía potencial es la energía presente en un cuerpo que está quieto Ejemplo: Arco y flecha 9 Energía Cuando se hala el arco, transforma energía cinética en energía potencial. 10 Cuando se suelta el arco, transforma energía potencial en energía cinética. Transformación de energía Figura 8.2 Ejemplo: Cuando se sube al tope, transforma energía cinética (al caminar) en energía potencial (cuando está en el tope). Cuando se baja, transforma energía potencial en energía cinética (al bajar). 11 Transformación de energía Energía química es una forma de energía potencial, está almacenada en las moléculas como resultado del arreglo de sus átomos. Esta energía potencial puede ser convertida en energía cinética. Ejemplo: Glucosa (respiración celular). La energía potencial en la glucosa es transformada en la célula y se libera energía, que estará disponible para hacer trabajo en la célula. 12 Transformación de energía Ejemplo: Hidrocarburos (compuestos de carbono e hidrógeno, principal componente del petróleo). La energía potencial en los hidrocarburos de la gasolina son transformados en el motor del carro a energía cinética que mueve los pistones. La energía potencial en los 13 alimentos (energía química) se libera energía y transforma. Chita Termodinámica La termodinámica es el estudio de las transformaciones de energía que ocurren en la materia. Sistema cerrado - no intercambia energía con los alrededores. Sistema abierto - intercambia Términos importantes: Sistema - es el objeto estudiado (una célula, un animal o el planeta). Alrededores - el resto del universo. 14 energía con los alrededores. Entropía - es una medida del desorden y está aumentando en el universo. Leyes de termodinámica Hay dos leyes de termodinámica que rigen las transformaciones de energía (Figura 8.3). Primera ley de termodinámica - es el principio de conservación de energía. La energía puede ser transferida y transformada, pero no creada o destruida. La energía del universo es constante. Segunda ley de termodinámica - las transferencias o transformaciones de energía aumentan la entropía (desorden) del universo. 15 Leyes de termodinámica Ejemplos: 1) Edificio viejo sin mantenimiento - se desintegra su apariencia (se puede ver el desorden por la apariencia física). 2) Cuando en el motor del carro, la energía potencial en los hidrocarburos de la gasolina son transformados a energía cinética, parte de esa energía es liberada al medio ambiente en forma de calor (energía termal) que aumenta la entropía del universo. Cuando la energía se convierte de una forma a otra, parte de la energía disponible para hacer trabajo se degrada a una forma menos útil (calor) que se dispersa a los alrededores. 16 Leyes de termodinámica Estas transformaciones NO son 100% eficientes. La energía liberada al medio ambiente NO estará disponible para hacer trabajo, desde el punto de vista biológico. Esta energía es menos utilizable, es más difusa o está menos organizada que la energía que se puede usar para hacer trabajo. La energía organizada y utilizable tiene baja entropía. La energía desorganizada y no utilizable tiene alta entropía. 17 Energía libre Habíamos definido energía como la capacidad para causar cambios. Energía libre (G) es la cantidad de energía de un sistema que se puede utilizar para hacer trabajo, cuando la temperatura es uniforme a través de todo el sistema. Se le llama energía libre porque está disponible para hacer trabajo, no porque se pueda gastar sin ningún costo. Relación entre energía libre, estabilidad, capacidad de trabajo y reacción espontánea (Figura 8.5). 18 Figura 8.5 La energía libre, la estabilidad, la capacidad de trabajo y los cambio espontáneos se relacionan. Los sistemas inestables son ricos en energía: Movimiento gravitacional Difusión Reacción química – rompimiento de glucosa 19 Energía libre La cantidad de energía libre de un sistema se simboliza con letra G (G=H-TS) H - energía total del sistema S - es la entropía T - es la temperatura absoluta en Kelvin (K = ºC + 273) Los cambios en energía libre en el sistema se denominan ∆G. 20 Energía libre Basados en los cambios en energía libre, las reacciones químicas pueden clasificarse como (ver figura 8.6): 1) Exergónica 2) Endergónica 1) Exergónica es una reacción química espontánea en la que se libera energía al medio ambiente, se pierde energía, ∆G es negativo. Ejemplo: respiración celular (∆G = -686 Kcal/mol) C6H12O6 + O2 6 CO2 + 6 H2O + energía 21 Energía libre Basados en los cambios en energía libre, las reacciones químicas pueden clasificarse como (ver figura 8.6): 1) Exergónica 2) Endergónica 2) Endergónica - una reacción química NO espontánea en la que se absorbe energía del medio ambiente, se almacena energía, ∆G es positivo. Ejemplo: fotosíntesis (∆G = 686 Kcal/mol) 6 CO2 + 6 H2O + energía solar C6H12O6 + O2 22 Trabajo celular En la célula se hacen tres clases de trabajo: Mecánico - mover cilios y flagelos. Transporte - mover sustancias a través de la membrana contra gradiente. Químico - síntesis de polímeros a partir de monómeros. 23 Adenosina trifosfato (ATP) La fuente de energía inmediata es el ATP (adenosina trifosfato). La composición del ATP es similar a las de los nucleótidos del DNA y RNA (Figura 8.8). Tiene tres componentes: Base nitrogenada (adenina) Azúcar (ribosa) Tres grupos fosfatos El enlace del último fosfato puede ser hidrolizado: ATP ADP + Pi + energía 24 Es una reacción exergónica, libera 7.3 Kcal/mol (∆G = -7.3 Kcal/mol) Trabajo celular La Figura 8.8 explica el ciclo de ATP. Hidrólisis de ATP La energía almacenada (temporeramente) en el ATP se utiliza para realizar trabajo en la célula. Le energía liberada en reacciones catabólicas en la célula se utiliza para fosforilar (añadir fosfato) ADP y generar ATP. El ATP actúa como un enlazador de las reacciones que liberan energía con las 25 reacciones que consumen energía. Cómo ATP guía el trabajo químico Figura 8.9 26 Reacción exergónica y endergónica Exergónica y endergónica describen si en la reacción se absorbe o libera energía, pero no dicen nada de la velocidad de la reacción. Una reacción espontánea puede ocurrir tan lentamente que puede ser imperceptible. Sacarosa glucosa + fructosa (espontánea, libera energía, ∆G = -7 Kcal/mol). Esta reacción puede tardar años, si uno tiene sacarosa en solución. Si se le añade la enzima sacarasa, entonces la reacción ocurre en segundos. Las enzimas son proteínas, agentes catalíticos, que aceleran la velocidad de una reacción sin consumirse en la misma. 27 Perfil energético El perfil energético de una reacción exergónica está dado en la Figura 8.13. Energía de activación (EA) - es la energía que se requiere para que la reacción comience o para romper enlaces en los reactivos. Los reactivos A-B y C-D tienen que 28 absorber energía del medio ambiente hasta superar la energía de activación y alcanzar un estado de transición inestable. Figura 8.13 Perfil energético Luego se rompen los enlaces entre A-B y C-D y se forman enlaces nuevos entre A-C y B-D. El producto final tiene menos energía libre, se libera energía, por lo tanto es una reacción exergónica. 29 Figura 8.13 Enzimas Las enzimas aceleran la velocidad de una reacción porque reducen la energía de activación, sin alterar el ∆G de la reacción (Figura 8.15). Gráfica color negra - reacción que no tiene enzima. Gráfica color rojo - reacción que tiene enzima. En ambos casos la energía inicial y final son las mismas, pero en la reacción catalizada por la enzima baja la energía de activación. 30 Sitio activo y ciclo catalítico Las enzimas son proteínas, moléculas tridimensionales, cuya forma (conformación) depende de las estructuras 1ria, 2ria 3ria, y 4ria de la proteína. La enzima actúa sobre una molécula, una sustancia o un reactivo que se conoce como el sustrato. La región específica de la enzima 31 que se enlaza al sustrato se conoce como el sitio activo (Figura 8.17). Sitio activo y ciclo catalítico Figura 8.15 • • • • 32 Orienta el sustrato Estabiliza el estado de transición Provee un ambiente favorable Cataliza la reacción Factores ambientales Factores ambientales que afectan el funcionamiento de una enzima: pH, temperatura (Figura 8.16). Enzimas que actúan en el cuerpo humano (temperatura óptima 37 ºC). Enzimas de bacteria que viven en calderas de aguas calientes (temperatura óptima 80 ºC). 33 Factores ambientales Pepsina - enzima que actúa en estómago en la digestión de proteínas (pH óptima ácido). Tripsina - enzima secretada por el páncreas y que actúa en intestino en la digestión de proteínas (pH óptimo básico). 34 Otros factores Hay otros factores que afectan el funcionamiento de una enzima, entre éstos están los cofactores y los inhibidores. Las enzimas requieren de ayudantes no proteicos que facilitan en enlace entre la proteína y el sustrato. Éstos se conocen como cofactores. Ejemplo de cofactores inorgánicos: Zinc (Zn), Hierro (Fe) y Cobre (Cu) Si el cofactor es una molécula orgánica, entonces se llama coenzima. 35 Inhibición de enzimas Algunas sustancias interfieren con el funcionamiento de las enzimas. Éstos se conocen como inhibidores (Figura 8.17). a) Sustrato normal y su sitio activo en la enzima. 36 Inhibición de enzimas Algunas sustancias interfieren con el funcionamiento de las enzimas. b) Sustrato normal, sitio activo en la enzima y un inhibidor competidor que se parece al sustrato y por lo tanto compite con el sustrato por el sitio activo. Este tipo de reacción se conoce como inhibición competitiva. Se puede superar la inhibición si se 37 aumenta la concentración de sustrato. Inhibición de enzimas c) Sustrato normal, sitio activo en la enzima y un inhibidor no competidor que NO se parece al sustrato y por lo tanto no compite con el sustrato por el sitio activo. El inhibidor no competidor se pega un lugar diferente al sitio activo, pero altera la conformación de la enzima y torna al sitio activo en uno no funcional. Este tipo de reacción se conoce como inhibición no competitiva. 38 Control del metabolismo ¿Cómo se controla el metabolismo? Imagínense que pasaría en la célula si un producto se formara y por otro lado se rompiera inmediatamente. Tiene que haber un control o una regulación: 1) Regulación alostérica 2) Retroalimentación negativa 3) Cooperativismo 39 Control del metabolismo 1) Regulador alostérico es una molécula que se une a la enzima, mediante enlaces débiles, y le cambia la forma y función (Figura 8.19). Cambios conformacionales en una enzima alostérica. La enzima oscila entre dos formas: activa e inactiva. Sitio activo es la región específica de la enzima que se une al sustrato. 40 Control del metabolismo Sitio alostérico es la región o el lugar al cual se pega el regulador alostérico. El regulador alostérico puede ser un: Inhibidor - estabiliza la forma inactiva de la enzima. Activador - estabiliza la forma activa de la enzima. 41 Control del metabolismo 2) Retroalimentación negativa (Figura 8.21). En esta inhibición el producto final de la reacción bloquea la reacción que dio origen al producto. http://www.quia.com/jg/119363 8list.html 42 Control del metabolismo 3) Cooperativismo (Figura 6.20). Cuando una molécula tiene múltiples subunidades, el enlace de un sustrato a un sitio activo en una subunidad provoca que todas las unidades se tornen en su conformación activa. http://meyerbio1b.wikispaces.com /Enzymes 43 Resumen 44