UNIVERSIDAD NACIONAL ABIERTA Y A DISTANCIAUNAD ESCUELA DE CIENCIAS BASICAS, TECNOLOGÍA E INGENIERIA ESPECIALIZACION EN PROCESOS DE ALIMENTOS Y BIOMATERIALES BIOTECNOLOGIA AVANZADA NELLY MORALES PEDRAZA BOGOTA D.C. FEBRERO 2009 14 TABLA DE CONTENIDO UNIDAD 1. LA BIOTECNOLOGÍA Y LA VIDA Capitulo 1. Lección 1. Biotecnología Lección 2. Antecedentes de la Biotecnología Lección 3. La vida y su manipulación Capitulo 2. Lección 4. Que es la vida Lección 5. Ácidos nucleicos Lección 6. Reproducción asexual Capitulo 3. Lección 7. Replicación Lección 8. Nomenclatura gráfica de los ácidos Nucleicos Lección 9. Estudio de caso UNIDAD 2. LOS MICROORGANISMOS Y SU TECNOLOGIA Capitulo 4. Lección 10. Las enzimas y su tecnología Lección 11. Modificación de las enzimas Lección 12. Efectos de la temperatura y el PH en Las reacciones Enzimáticos. Capitulo 5. Lección 13. Los microorganismos Lección 14. Los microorganismos y su tecnología Lección 15. Las Bacterias Capitulo 6. Lección 16. Modelos cinéticos de crecimiento Lección 17. Tecnología de fermentación. Lección 18. Ejercicios Balance de materia ANEXOS: Estudios de caso 15 UNIDAD UNO LA BIOTECNOLOGÍA Y LA VIDA Por la prisa de vivir se olvidan a menudo las razones de la vida. Hanotaux BIOTECNOLOGÍA Introducción Esta unidad define la Biotecnología no como una ciencia nueva, sino como un nombre nuevo que se le ha dado a la reciente evolución e interacción de varios campos de las ciencias y las ingenierías, resultante del desarrollo científico acumulativo iniciado por Mendel en 1886, con los principios de la herencia; y continuado, entre otros, por Watson y Crick, con la estructura de doble hélice del ADN en 1953; por Sanford en 1984, con la transformación genética de plantas mediante el bombardeo de proyectiles y por Williams en 1990, con el desarrollo tecnológico para marcaje y mapeo de genes (Parra et al., 1998). Incluye además una visión histórica y el panorama nacional, de tal forma que permite visualizar el impacto que ha tenido el uso de la biotecnología moderna en diferentes sectores de la producción, así como identificar las políticas y estrategias que posee Colombia en cuanto a biociencia y biotecnología, contribuyendo al desarrollo integral del profesional en las dimensiones cognoscitiva, social y cultural. Objetivo Al terminar la unidad el profesional debe estar en capacidad de describir el desarrollo histórico, la situación actual y las perspectivas de la Biotecnología, así como de identificar las políticas y estrategias que posee Colombia en cuanto a biociencia y biotecnología. 16 Contenido • Biotecnología • Perspectivas de la Biotecnología en Colombia • Antecedentes • Programa Nacional de Biotecnología • Simbiosis • Comunidad Biotecnológica • Marco legal • Bibliografía de apoyo • Bibliografía • Trabajo de complementación Bibliografía recomendada 1. Cohn, David. The life and time of Louis Pasteur. 1996. www. louiville. edu/library/ 2. Colciencias. Tecnologías de la Vida para el Desarrollo. Bases para un Plan del Programa Nacional de Biotecnología. Colombia. 1993. 3. Colciencias. Simbiosis. www. colciencias.gov.co 4. Harshbarger, David; Hunter, Kim; Meinel, Richard; Reed, Charles and Schlager, Steve. Biotech: What the Chemical. Chemical Engineering. Edited by Agnes Shaley. November. 1995. TUS COMPROMISOS Para con el grupo • • Reseñe la biografía de Louis Pasteur, James D. Watson, Francis H. Crick, Sir Alexander Fleming, Gregor Mendel, Eduard Buchner o Gobind Khorana. Presentar por ejemplo, la historia de Levapán S. A., Instituto Colombiano del Petróleo, Sucromiles, Centro de Investigación de Agricultura Tropical, Laboratorio de genética y reproducción de la Universidad de Antioquia, Instituto de investigaciones inmunológicas de la Universidad de Cartagena, Histolab. 17 Para aprender a aprender BIOTECNOLOGÍA • • • • • Analice Comuníquese Confirme Experimente Organícese El término biotecnología podría entenderse ampliamente como la comercialización de los procesos biológicos, los cuales engloban descubrimientos técnicos y científicos que han conducido al umbral de la revolución bioindustrial (Montoya, 1989). Sin embargo si revisamos su etimología viene de las palabras griegas que significan: bio: vida, tecno: arte y logía: ciencia; entonces sería la ciencia que estudia el arte de la vida. De acuerdo con el informe de Spinks en 1980 la biotecnología se define como la utilización de organismos vivos, o bien sistemas o procesos biológicos para la producción industrial o su empleo en los servicios de saneamiento (Wiseman, 1986). Hacking en 1986 definió la biotecnología como la aplicación de los principios básicos de las ciencias e ingenierías al procesamiento de materiales y agentes biológicos para proveer bienes y servicios, e indicó que posee las siguientes características: Es multidisciplinaria, emplea diferentes técnicas, presenta diferentes estados de desarrollo y es multisectorial (Montoya, 1989). Según Salazar en 1997 la biotecnología es el uso integrado de la bioquímica, la microbiología y la ingeniería química, para encontrar aplicaciones tecnológicas a las capacidades de los microbios y de las células; globaliza una serie de técnicas y experiencias con tres objetivos particulares: 1. El aislamiento y propagación de células de tejidos animales o vegetales y de microorganismos. 2. La obtención de productos metabólicos a partir de las células vivas aisladas que los producen espontáneamente bajo ciertas condiciones o con técnicas de ingeniería genética. 3. El logro de reacciones bioquímicas con células vivas o con enzimas sintetizadas por las células. 18 Todo lo anterior busca obtener sustancias biológicas exclusivas, útiles para la producción de alimentos, para la industria farmacéutica y para diversos procesos industriales (Salazar, 1997). Según la serie de monografías concisas de ILSI Europa, traducidas por ILSI SurAndino Colombia 2000. define el término Biotecnología como acuñado por el Húngaro Kart Ereky, hacia fines de la primera guerra mundial Kart Ereky utilizó esta palabra para referirse a métodos agrícolas intensivos. Desde, entonces, la biotecnología ha sido definida ha sido definida de diversas formas, sin embargo, casi siempre ha sido asociada con la producción de alimentos y su procesamiento. En particular, la biotecnología generalmente ha abarcado la manufactura tradicional del pan, vino, queso y otros alimentos fermentados. Sobre estas bases, la biotecnología puede reconstruir sus raíces miles de años atrás hasta los antiguos sumerios que fabricaban cerveza con levaduras producidas naturalmente. Las fermentaciones practicadas en la antigüedad no siempre llegaron a buen resultado, los microbios que caían en la tinaja donde se hacía el vino, podían producir la más fina cosecha o transformar todo el producto en vinagre. En el siglo XIX, Lous Pasteur sentó las bases de la microbiología e identificó a los microorganismos- bacterias, hongos, algas y protozoos, como la causa de los cambios tanto deseables como indeseables en los alimentos. La aplicación de la investigación de Pasteur llevó a un procesamiento más seguro y confiable y ayudó a asegurar la consecuente alta calidad de, por ejemplo, vinos y quesos. Pasteur aseguraba que los procesos de fermentación estaban vinculados estrechamente con las actividades de los microbios vivos. Hacia fines del siglo pasado, se descubrió que extractos libres de células provenientes de levaduras, también podían originar cambios químicos sin la intervención de los microbios de los cuales provenían. Los componentes activos de dichos extractos fueron denominados enzimas (enzima significa ”en levadura”), las enzimas son proteínas producidas por los seres vivos, que catalizan reacciones químicas específicas. Sin darse cuenta, los productores de queso siempre han utilizado una mezcla de enzimas naturales –cuajo- para transformar la leche en cuajada y suero líquido. Durante los años cuarenta se han desarrollados equipos para la fermentación a gran escala, lo que condujo a la producción industrial eficiente, mediante la utilización de microorganismos, de enzimas puras, aditivos y otros compuestos valiosos (como las vitaminas) para su uso en los alimentos. Así como las cervecerías tienen sus propias cepas de levaduras patentadas, las cuales son mantenidas cuidadosamente, los productores de enzimas, cultivas 19 cepas especialmente seleccionadas de los microorganismos escogidos: Durante muchos años se han hecho avances para mejorar la eficiencia en la producción, seguridad, calidad y espectro de productos microbianos disponibles. Sin embargo, todavía se depende, en gran medida, de hechos fortuitos seguidos para el aislamiento sistemático de los organismos que posean las características deseadas. Durante los años setenta se obtuvo la capacidad para hacer cambios precisos en el material genético, la biotecnología había sido transformada. El desempeño de los organismos ahora puede ser “sintonizado finamente” y con ello ahora la biotecnología casi se ha convertido en un sinónimo de “modificación genética”. En 1980, un influyente informe británico(el “Informe Spinks”) intentó encapsular casi medio siglo de pensamiento europeo y estaudinense, definiendo a la biotecnología como “La aplicación de organismos, sistemas o procesos biológicos a las industrias manufactureras y de servicios”. Esta amplia definición sirve a nuestros propósitos, ya que incluye la producción de alimentos a través de organismos vivos, su consiguiente procesamiento de la calidad y seguridad de estos, utilizando las herramientas de la biología molecular. PERSPECTIVAS DE Castellanos O2 LA BIOTECNOLOGIA EN COLOMBIA. Villate S1 – Hace dos siglos Malthus afirmaba que el crecimiento de la población mundial superaría al suministro de alimentos. este pronostico no se ha cumplido porque la actividad agrícola ha aumentado considerablemente, gracias a factores como la mecanización, técnicas agrícolas intensificadas y la utilización de abonos entre otros. Los sistemas agrícolas actuales, aunque son capaces de generar excedentes regionales en los países desarrollados, dejan a la cuarta parte de la población mundial subalimentada y es incierto si se abastecerán sus necesidades para el 2030. Es así como la biotecnología bajo sus diferentes formas, se puede evitar un empobrecimiento catastrófico de la humanidad y su medio natural. En cierto sentido, la biotecnología tiene una historia tan larga como la fabricación del pan y la cerveza y se remonta a la época indígena con la elaboración de productos alimenticios y bebidas como la chicha, obtenida por fermentación del jugo de maíz. La producción industrial usando procesos tecnificados con microorganismos se empieza a encontrar a finales del siglo pasado y ha recibido un gran impulso en los años 50 de nuestro siglo cuando la naturaleza y la función de los ácidos nucleicos fueron explicadas, abriéndose camino a la descripción del código genético y a la tecnología del ADN 1 2 Bac: Docente Universidad Colegio Mayor del Cundinamarca. Ph. D. Docente Universidad Nacional de Colombia 20 reconbinante. Entre los 70 y 80, llegó hacerse posible la producción de genes en masa y transferirlos a otros organismos como en bacterias, levaduras, plantas y animales. En este contexto, la biotecnología se define como la aplicación de organismos, sistemas y procesos biológicos a la producción de bienes y servicios en beneficio del hombre con el fin de aumentar la productividad, el rendimiento y resolver problemas de abastecimiento de alimentos a la población en general. La biotecnología cambia, de forma espectacular, las vías mediante las cuales los científicos pueden conocer las estructuras y las funciones de los sistemas biológicos, implicando la revolución del conocimiento con consecuencias científicas, éticas y sociales que irán mucha más allá que los efectos económicos. (OCDE, 1993). La biotecnología alimentaría ofrece vastas posibilidades en la mejora de la calidad, el valor nutricional, el estado sanitario y la conservación de los alimentos. pero ninguna introducción biotecnológica tendrá por si misma un impacto decisivo en la industria, ya que dicha industria es demasiado diversificada y amplia como se muestra a continuación: a. Las enzimas en el. sector alimentario tienen numerosas aplicaciones en la industria de los alimentos y de las bebidas, para la transformación y producción de aromas y sus productos intermedios, tienen una creciente importancia para los avances científicos y técnicos. Esos progresos están ligados a los biorreactores, a la capsulación de enzimas innovadoras, más eficaces con procesos de biocatálisis. b. La biotecnología ofrece nuevos sistemas de conservación biológica a través de microorganismos alimentarios modificados que tienen la capacidad de proporcionar conservación de alimentos sin utilizar aditivos químicos. c. Los nuevos alimentos son transformados gracias a la biotecnología, la cual ofrece nuevos recursos para crear nuevos nutrientes de calidad para el hombre con una imagen positiva para la salud a partir de materias primas baratas, como proteínas fúngicas con textura adecuada para imitar a la carne. d. Los cultivos de células vegetales ofrecen la oportunidad de obtener gran diversidad de productos alimenticios intermedios y de moléculas nutritivas que pueden ser obtenidas mediante el cultivo celular. e. Las microalgas, que han sido la base de la alimentación humana tradicional en muchos países, también pueden ser cultivadas para 21 producir una amplia gama de productos útiles, teniendo algunas un gran interés como elementos para la alimentación humana o como moléculas nutritivas especiales. Actualmente el desarrollo de la biotecnología alimentaría en Colombia es evidente y se evidencia en los diferentes renglones de la economía nacional. entre las industrias que producen o consumen en el sector podemos encontrar las de cerveza, productos lácteos, jugos y concentrados de frutas, panificadoras, tejido de cultivos De acuerdo con el Convenio de las Naciones Unidas sobre biotecnología, se entiende toda aplicación tecnológica que utilice sistemas biológicos y organismos vivos para la creación o modificación de productos o procesos para usos específicos, por ejemplo, introducir un gen que produce cáncer en un ratón para producir ratones con predisposición al cáncer. Los sectores industriales en los que se está aplicando la biotecnología son: farmacéutico, agrícola y medio ambiente. Enriquezca su vocabulario buscando las siguientes definiciones: Anticuerpo monoclonal: _______________________________________________________ _______________________________________________________ Germoplasma: _______________________________________________________ _______________________________________________________ Hibridoma: _______________________________________________________ _______________________________________________________ __________________ Variedad híbrida: _______________________________________________________ _______________________________________________________ ____________ 22 LECCION DOS ANTECEDENTES DE LA BIOTECNOLOGIA La historia de la biotecnología se divide en cuatro períodos: 1. Era anterior a Pasteur: Sus comienzos se confunden con los de la humanidad y se extiende hasta la segunda mitad del siglo XIX. Incluye las prácticas empíricas de selección de plantas y animales, así como la fermentación orientada a preservar y enriquecer el contenido proteínico de los alimentos (Cohn, 1996). 2. Era de Pasteur: Se desarrolló a partir de la segunda mitad del siglo XIX cuando Pasteur y otros científicos de la época consolidaron las disciplinas de microbiología, bioquímica e ingeniería química. Corresponde a la llamada biotecnología industrial. Se caracteriza por la aplicación de las técnicas de fermentación a la industria alimentaría y al desarrollo industrial de productos como levaduras, ácido cítrico, ácido láctico, acetona, butanol y glicerol. Incluye el descubrimiento de las enzimas y su utilización (Cohn, 1996). 3. Era de los antibióticos: Se inicia en la primera mitad del siglo XX cuando Fleming descubre la penicilina y fija las bases para la producción en gran escala (hacia la década de los cuarenta) de antibióticos; continúa con la aplicación de las variedades híbridas, iniciando el camino hacia la revolución verde (Scragg, 1996). 4. Era actual: Se ubica en la segunda mitad del siglo XX e incluye el descubrimiento de la doble estructura del ácido desoxirribonucleico (ADN), la inmovilización de enzimas, los primeros experimentos de ingeniería genética y la aplicación en 1975 de la técnica del hibridoma para la producción de anticuerpos monoclonales (Villé, 19??). PROGRAMA NACIONAL DE BIOTECNOLOGÍA Cinco tareas principales conforman los ejes de la estrategia propuesta para la promoción de la investigación y el desarrollo en el ámbito de la biotecnología en Colombia: 1. Formación de investigadores calificados al más alto nivel en las diversas disciplinas que confluyen en la biotecnología. 2. Consolidación de la comunidad biotecnológica nacional. 23 3. Fortalecimiento de los vínculos entre el sector productivo y los investigadores. 4. Desarrollo de un sistema legislativo que reglamente la propiedad intelectual, la bioseguridad y el uso del germoplasma. 5. Generación de una capacidad de monitoreo de la actividad científica e industrial en todas las disciplinas, técnicas e industrias relacionadas con la biotecnología que permita el análisis de tendencias internacionales predominantes de investigación y desarrollo, y la visualización de las oportunidades de mercados y clientes potenciales. Las propuestas del Programa Nacional de Biotecnología están orientadas hacia: 1. Nuevas tecnologías para la salud humana: Trabaja con anticuerpos monoclonales y técnicas de ingeniería genética (Orozco, 1992). 2. Biotecnología vegetal: Se dedica a las técnicas de desarrollo de nuevas variedades de las plantas, desde los orígenes de la agricultura, alrededor de 10 mil años atrás los agricultores han estado tratando de mejorar sus cultivos. Inicialmente, se replantaban las semillas de las mejores plantas, llevando al mejoramiento gradual de las cepas.. alrededor del siglo XIX, se comenzaron a comprender los principios científicos que rigen la herencia y la crianza de plantas comenzó a ser desarrollada sobre bases más sistemáticas. La mutación y la selección inducidas artificialmente, como la aplicada a las cepas microbianas, han producido más variedades productivas de los cereales principales del mundo. Los métodos de mapeo genético similares a aquellos utilizados para determinar con exactitud los genes humanos, han permitido a los científicos de manera precisa aquellas plantas que llevan genes específicos deseables. Dichas técnicas han permitido progresos en la producción, calidad y resistencia a las enfermedades. Por tanto, es probable que se hereden características indeseables junto con las deseables. la mutación inducida artificialmente, algunas ocasiones, produce mejoramientos; sin embargo es más común que las mutaciones tengan un efecto nocivo. La crianza tradicionalmente de plantas sigue siendo un proceso tediosamente lento, rígido, principalmente por el tiempo que le toma crecer a la planta y colocar semillas. La modificación genética, probablemente nunca remplazará a los métodos tradicionales, complementa a estos últimos y ofrece la oportunidad de superar algunas de sus limitaciones. Alrededor del 80% de la investigación contemporánea en biotecnología de plantas se dirige hacia el mejoramiento de plantas que sirven como alimento; el 24 20% restante se relaciona con productos no alimenticios, como el algodón, tabaco, plantas ornamentales y medicinas. Generalmente, el énfasis inicial de la biotecnología de plantas ha sido dirigida al mejoramiento de cualidades agronómicas. La segunda y tercera generaciones de plantas alimenticias modificadas genéticamente traerán ventajas directas al consumidor y al procesador comercial. Dentro de la biotecnología vegetal, las principales áreas de aplicación son la propagación vegetativa, la liberación de patógenos, la conservación del germoplasma, la obtención de variabilidad genética con características seleccionadas, la resistencia a pestes, tolerancias a los herbicidas, resistencia a las enfermedades y la obtención de metabolitos secundarios de interés industrial. Como tecnologías complementarias se tienen la obtención de biopesticidas, el desarrollo y utilización de biofertilizantes, el desarrollo de sistemas diagnósticos para evaluación y certificación fitosanitaria del material vegetal, tratamientos biológicos para degradación y utilización de residuos de cosecha, la biodegradación de plaguicidas y otros compuestos orgánicos y la utilización de las plantas como fuente de proteínas específicas (Hodson de Jaramillo, 1992). 3. Biotecnología animal: En esta línea se están estudiando, os probióticos, las bacterias del rumen, las hormonas bovinas del crecimiento, salud y crianza de los animales 4. Biotecnología industrial: Para desarrollar mercados en el sector farmacéutico, agrícola, en la industria química, de alimentos, en la minería (Montoya, 1992). ¡Un momento!. ¿Cuál es su opinión? _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ SIMBIOSIS Es un sistema de información especializado en Biotecnología y Tecnología de Alimentos para América Latina y el Caribe, organizado bajo el patrocinio del Programa Regional de Desarrollo Científico y Tecnológico, del Departamento de 25 Asuntos Científicos y Tecnológicos de la Organización de los Estados Americanos (OEA). El nodo Colombia ha sido preparado y puesto en ejecución por el Programa Nacional de Biotecnología y la División de Sistemas de Información Científica y Tecnológica del Instituto Colombiano para el Desarrollo de la Ciencia y la Tecnología, Francisco José de Caldas, COLCIENCIAS, en noviembre de 1996. Agrupa las tecnologías que forman parte de la biotecnología en seis grupos: 1. Cultivos de tejidos y células para la rápida micro propagación “in vitro” de plantas, la obtención de cultivos sanos, el mejoramiento genético por cruza amplia, la preservación e intercambio de germoplasma, la biosíntesis de metabolitos secundarios de interés económico y la investigación básica. 2. El uso de enzimas o fermentación microbiana, para la conservación de materias primas definidas como sustratos en determinados productos, la recuperación de estos productos, su separación de caldos de fermentación y su purificación final. 3. Tecnología del hibridoma, que se refiere a la producción, a partir de clones, de anticuerpos de acción muy específica que reciben el nombre de anticuerpos monoclonales. 4. Ingeniería de proteínas, que implica la modificación de la estructura de las proteínas para mejorar su funcionamiento o para la producción de proteínas totalmente nuevas. 5. Ingeniería genética o tecnología del ADN, que consiste en la introducción de un ADN híbrido, que contiene los genes de interés para determinados propósitos, para capacitar a ciertos organismos en la elaboración de productos específicos, ya sean estos enzimas, hormonas o cualquier otro tipo de proteína u organismo. 6. Bioinformática, que se refiere a la técnica basada en la utilización de proteínas en aparatos electrónicos, particularmente censores biológicos y biochips, es decir, microchips biológicos, capaces de lógica y memoria (Colciencias, 19??). Considerando que usted se está capacitando como investigador en el área de biotecnología, ubique a nivel internacional, tres personas que trabajen en el campo. _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ 26 _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ COMUNIDAD BIOTECNOLÓGICA Las empresas colombianas dedicadas a trabajar en el área de biotecnología, se pueden agrupar según su actividad en productivas, centros de investigación y centros académicos. En el primer caso se encuentran entre otras, Bioingeniería Ltda., Laboratorios Veterinarios Biológicos Laverlam S.A., Vecol S.A., Levapan S. A., Sucromiles, Histolab, Bavaria S.A. En el segundo instituciones como: 1. 2. 3. 4. Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria - CORPOICA Centro de Investigación de Abastecimiento y Remoción de Agua - CINARA Instituto Colombiano del Petróleo - ICP Centro de Investigación de Agricultura Tropical - CIAT Y en el tercero están: 1. Universidad de Antioquia: Laboratorio de genética y reproducción; laboratorio centro de investigaciones ambientales. 2. Pontificia Universidad Javeriana: Programa de saneamiento y biotecnología ambiental. 3. Universidad de la Salle: Facultad de ingeniería ambiental y sanitaria. 4. Universidad de los Andes: Centro de investigaciones microbiológicas - CIMIC. 5. Universidad del Valle: Laboratorio de biotecnología ambiental 6. Universidad Industrial de Santander: Laboratorio de investigaciones en microbiología industrial: LIMI 7. Universidad Nacional de Colombia: Instituto de ensayos e investigación - IEI, unidad de ingeniería ambiental; Instituto de biotecnología - IBUN. MARCO LEGAL La biotecnología en Colombia tiene como marco regulatorio para su desarrollo la adhesión a acuerdos internacionales y regionales: 27 Fech Acuerdos a los que está adherido a Colombia 1994 Acuerdo general sobre aranceles y comercio (GATT). - Ley 70 de 1994 1996 Convenio de París. 1996 Convenio internacional para la protección de las obtenciones vegetales (UPOV). El grupo de los tres (G3) cuenta con algunas normas relacionadas. Marco regulatorio Obtenciones Vegetales Propiedad intelectual Protección de obtenciones vegetales Propiedad industrial Además, de las decisiones emanadas en la Junta del Acuerdo de Cartagena, las cuales comenzaron a regir, a partir del 29 de octubre de 1993: Decisión Régimen Común sobre 344 Propiedad Industrial 345 Protección a los derechos de los obtentores de variedades vegetales 391 Acceso a los Recursos Genéticos En materia de introducción, transporte, uso, manejo, producción, liberación y comercialización de organismos vivos modificados (OVMs), se cuenta, para fines agrícolas, con la resolución 00342 del antiguo Instituto Colombiano Agropecuario - ICA (Colciencias, 19??). 28 BIBLIOGRAFÍA DE APOYO 1. Colciencias. Bases para un plan del programa nacional de biotecnología. Tecnología de la vida para el desarrollo. 1993. 2. Colciencias. Diez casos exitosos de innovación Tecnológica. 1994. 3. Colciencias. Biotecnología: Legislación y Gestión para América Latina y el Caribe. Programa multinacional de Biotecnología y Tecnología de Alimentos. Programa Nacional de Biotecnología. 1995. 4. Colciencias. Directorio de biotecnología. Programa Nacional de Biotecnología. 1995a. 5. Corporación para Investigaciones Biológicas (CIB). www.fsm.net/biologicalcontrol 6. Etall Ramos, Daniet. Fronteras de la Ciencia y la Tecnología. España. No. 14. Enero - Marzo. 1997. 7. Sasson A. Biotechnologies: challenges and promises. 2. Editado por la UNESCO. 1985. BIBLIOGRAFÍA 1. Universidad Nacional . Revista Colombiana de Biotecnología. Volumen I. Número 2. 1998. 2. ILSI Sur –Andino. Serie de Monografias Concisas de ILSI Europa. “Biotecnología de los Alimentos” 2000. 3. Cohn, David. The life and time of Louis Pasteur. 1996. www.louiville.edu/library/ 4. Colciencias. Simbiosis. www.colciencias.gov.co. 5. Hodson de Jaramillo, Elizabeth. Tecnologías de la Vida para el Desarrollo. Biotecnología Vegetal: alcances, limitaciones y perspectivas en Colombia. Colciencias. Colombia. 1992. 6. Montoya, Dolly. Las Fermentaciones como Soporte de los Procesos Biotecnológicos. Universidad Nacional de Colombia. Bogotá, D.E. 1989. 7. Montoya, Dolly y Buitrago, Gustavo. Tecnologías de la Vida para el Desarrollo. Biotecnología Industrial en Colombia. Colciencias. Colombia. 1992. 8. Orozco, Oscar. Tecnologías de la Vida para el Desarrollo. Nuevas Biotecnologías y Salud Humana en Colombia. Colciencias. Colombia. 1992. 9. Palmer, Dennis. Proyecto Zero Universidad de Harward. Estrategias de Evaluación Cualitativa para la Educación Superior Abierta y a Distancia. UNAD. 2000. 10.Parra y otros. Incorporación de la Biotecnología en la Educación Básica y Media. Revista Colombiana de Biotecnología. Julio. 1998. 11.Salazar Cáceres, Julio Roberto. Curso General de Biotecnología. Corporación Tecnológica de Bogotá. 1997. 29 12.Scragg, Biotecnología para Ingenieros. Sistemas Biológicos en Procesos Tecnológicos. Editorial Limusa. México. 1996. 13.Villé. Biología de Villé. 19?? 14.Wiseman, Alan. Principios de Biotecnología. Editorial Acribia. Zaragoza. 1986. TRABAJO DE COMPLEMENTACIÓN 1. Colciencias y el Programa Multinacional de Biotecnología y Tecnología de Alimentos (PMBTA, OEA) financiaron la investigación titulada “Extracción y caracterización de las pectinas de frutas tropicales”. Elabore un cuadro sinóptico que permita visualizar sus resultados. www.colciencias.gov.co/simbiosis. 2. ¿Qué opciones tiene la bioindustria en América Latina? 3. ¿Qué perspectivas le ve usted a la biotecnología de alimentos en Colombia e indique qué papel desempeña de biotecnología en su campo de especialización? 4. Investigue 3 métodos utilizados en la biotecnología 5. En que consiste la tecnología del antisentido y como puede mejorar la calidad de los alimentos de dos ejemplos 6. Defina los términos prebiótico y probiótico y explique como pueden actuar tanto en animales como en el hombre. 7. Reporte o construya una base de datos que incluya revistas de biotecnología. 8. Visite diez páginas web que hablen sobre biotecnología y sean de su interés; inicie la construcción de un portafolios3. www.google Características distintivas de un portafolios: Los estudiantes coleccionan una diversidad de trabajos que han llevado a cabo. Realmente reúnen lo que se ha dado en llamar “biografías de los trabajos” o “rangos de trabajos” y sus reflexiones. La biografía de un trabajo revela la geología de los diferentes momentos que subyacen en la producción de cualquier proyecto principal; puede incluir notas, diagramas, borradores y la versión final de un documento. Las reflexiones se resumen en documentos que se producen cuando se retorna a las colecciones de trabajo, para tomar el papel de crítico o de un autobiógrafo y resaltar lo que es característico, lo que ha cambiado con el tiempo y lo que aún está por hacerse. La organización del portafolio incluye: establecer el propósito del mismo, seleccionar y organizar el material pertinente, establecer puntos críticos para la reflexión y análisis de los resultados del trabajo, así como plantear estrategias para mejorar los resultados (Palmer, 2000). 3 30 LECCION TRES No hay que temer en la vida, hay que comprender. Marie Curie LA VIDA Y SU MANIPULACIÓN Esta temática estudia los principios que rigen la vida y su manipulación, así como los beneficios que ésta puede generar, planteando desafíos y problemas científicos, éticos, sociales e industriales, cuyo análisis conducirá a ampliar las oportunidades de progreso que este campo ofrece al país. Contenido 1. 2. 3. 4. 5. 6. 7. 8. 9. ¿Existe vida en Marte? ¿Qué es la vida? Las moléculas de la vida La célula Reproducción de las células y organismos Los cromosomas El ADN Dogma central de la biología molecular Manipulaciones in vitro 31 Fundamente sus conocimientos Describa brevemente las teorías sobre el origen de la vida Teoría Cosmozoica Descripción De generación espontánea De Oparín De evolución Cuál es la suya? Para posteriormente facilitar la comprensión del tema a tratar, escriba la estructura de: 1. un hidrocarburo alifático y la de uno aromático 2. la estructura de la glucosa 3. La estructura de un ácido graso 4. la estructura y la naturaleza de los 20 aminoácidos esenciales y explique ¿Por qué se dice que los aminoácidos presentan isómeros ópticos? 5. Para apoyar sus conceptos, represente gráficamente las estructuras primaria, secundarias, terciaria y cuaternaria de una proteína. 6. Escriba las estructuras de los ácidos nucleicos y haga un cuadro donde explique las especificidades de cada uno 7. Explique en que consiste y los pasos a seguir en la manipulación in Vitro 8. Busque un artículo que describa el proceso de clonación vegetal y con él construya un documento gráfico que permita identificar cada parte del proceso; defina términos. 32 9. La pectina es un componente esencial de muchas frutas, degradada naturalmente por las enzimas poligalacturonasa y es posible utilizar la tecnología antisentido para “neutralizar” la producción de poligalacturonasa, retardando la maduración de las frutas una vez han sido cosechadas. Explique entonces, el principio de la tecnología antisentido? BIBLIOGRAFÍA RECOMENDADA 1. Martínez de la Cuesta, Pedro J. y Rus Martínez, Eloisa. La Replicación de los Ácidos Desoxirribunocleicos y su Importancia en la Síntesis de Proteínas. Alimentación: Equipos y Tecnología. Abril. 1999. 2. Old, R. y Primrose, S. B. Principios de Manipulación Genética. Editorial Acribia. 3. Horton, Robert; Moran, Laurence; Ochs, Raymond; Rawn, David y Scrimgeour, Gray. Bioquímica. Prentice-Hall Hispanoamericana, S. A. México. 1995. 4. Watson, James; Toose, John; Kurtz, David. ADN Recombinante. Introducción a la Ingeniería Genética. Labor. 1988. 5. Wiseman, Alan. Principios de Biotecnología Industrial. Editorial Acribia. Zaragoza. 1986. BIBLIOGRAFÍA DE APOYO 1. Chandra, P y Appel, W. Métodos de Biología Molecular. Editorial Acribia. 2. Krautwurst, Hans; Encinas, María Victoria; Marcus, Frank; Latshaw, Steven; Kemp, Robert; Frey, Perry and Cardemil, Emilio. Saccharomyces cerevisiae Phosphoenolpyruvate Carboxykinase: Revised Amino Acid Sequence, SiteDirected Mutagenesis, and Microenvironment Characteristics of Cysteines 365 and 458. Biochemistry. 1995. 34. 6382 - 6388. 3. Martínez de la Cuesta, Pedro J. y Rus Martínez, Eloísa. La Replicación de los ácidos desoxirribonucleicos y su importancia en la síntesis de proteínas. Alimentación: Equipos y Tecnología. Abril 1999. 4. Pellón y otros. La Ingeniería Genética y sus Aplicaciones. Editorial Acribia. 5. Scragg. Biotecnología para Ingenieros. Sistemas Biológicos en Procesos Tecnológicos. Editorial Limusa, S.A. de C.V. Grupo Noriega Editores. México. 1996. 6. Werner, R. Fundamentos de Bioquímica Moderna. Editorial Acribia. BIBLIOGRAFÍA 1. Bernal Villegas, Jaime. Genética Inmunológica. Principios básicos y aplicaciones clínicas. Editorial Norma. 1982. 2. García Pelayo, Ramón y Gross. Nuevo Larousse Manual Ilustrado. Editorial Larousse. 33 3. Hodson, Elizabeth. Presentación. Tecnologías de la Vida para el Desarrollo. Bases para un Plan del Programa Nacional de Biotecnología. Colciencias. 1993. 4. Horton, Robert; Moran, Laurence; Ochs, Raymond; Rawn, David y Scrimgeour, Gray. Bioquímica. Prentice-Hall Hispanoamericana, S.A. México. 1995. 5. Kimball. Biología. Cuarta Edición. Fondo Educativo Interamericano. México. 1982. 6. Madden, Dean. Biotecnología de los Alimentos. Introducción. ILSI Europa. Bélgica. 2000. 7. Montoya, Dolly. Las fermentaciones como soporte de los procesos biotecnológicos. Universidad Nacional de Colombia. Bogotá, D.E. 1989. 8. Watson, James; Tooze, John y Kurtz, David. ADN Recombinante. Introducción a la ingeniería genética. Primera edición. Editorial Labor, S.A. 1988. 9. Wiseman, Alan. Principios de Biotecnología. Editorial Acribia, S.A. Zaragoza. 1986. 34 LA VIDA Y SU MANIPULACIÓN Introducción En la unidad anterior se estableció que la biotecnología moderna, gracias a su potencial e impacto en aspectos económicos, sociales, culturales y políticos, abrió un sinnúmero de oportunidades para los países en desarrollo; entre otros, en los campos de la salud, agricultura, industrias farmacéutica y de alimentos, manejo ambiental y energía, razón por la cual no se puede ser indiferente con sus avances (Hodson, 1993). No obstante, cuando el húngaro Karl Ereky acuñó el término biotecnología a finales de la Primera Guerra Mundial, refiriéndose a métodos agrícolas intensivos, no esperaba que ésta ciencia obtuviera la capacidad para hacer cambios precisos en el material genético, ni que garantizara el desempeño de los organismos tan finamente (Madden, 2000). Por tanto, la presente unidad estudia los principios que rigen la vida y su manipulación, así como los beneficios que ésta puede generar, planteando desafíos y problemas científicos, éticos, sociales e industriales, cuyo análisis conducirá a ampliar las oportunidades de progreso que este campo ofrece al país. Objetivo Al terminar la unidad el profesional debe estar en capacidad de comprender y explicar el dogma de la biología molecular y de utilizar los conceptos de manipulación genética para el mejoramiento de alimentos y biomateriales. Contenido ¿Existe vida en Marte? ¿Qué es la vida? Las moléculas de la vida La célula Reproducción de las células y organismos Los cromosomas El ADN Dogma central de la biología molecular Manipulaciones in Vitro Bibliografía de apoyo Bibliografía Trabajo de complementación 35 Bibliografía recomendada 6. Martínez de la Cuesta, Pedro J. y Rus Martínez, Eloisa. La Replicación de los Ácidos Desoxirribunocleicos y su Importancia en la Síntesis de Proteínas. Alimentación: Equipos y Tecnología. Abril. 1999. 7. Old, R. y Primrose, S. B. Principios de Manipulación Genética. Editorial Acribia. 8. Horton, Robert; Moran, Laurence; Ochs, Raymond; Rawn, David y Scrimgeour, Gray. Bioquímica. Prentice-Hall Hispanoamericana, S. A. México. 1995. 9. Watson, James; Toose, John; Kurtz, David. ADN Recombinante. Introducción a la Ingeniería Genética. Labor. 1988. 10.Wiseman, Alan. Principios de Biotecnología Industrial. Editorial Acribia. Zaragoza. 1986. TUS COMPROMISOS Para abordar el capitulo Revisar un libro de bioquímica Haber estudiado los items correspondientes a los siguientes temas: • ¿Existe vida en Marte? • ¿Qué es la vida? • Las moléculas de la vida • La célula • Reproducción de las células y organismos Para con el grupo Preparar un documento de una página sobre: • PCR • Eelectroforesis • Blotting. 36 ¿EXISTE VIDA EN MARTE? El 20 de julio de 1976, a las 11:53 tiempo de Greenwich, y el 3 de septiembre del mismo año, a las 10:39 TG, los módulos idénticos de dos naves espaciales no tripuladas, Vikingo 1 y Vikingo 2, se posaron suavemente sobre la superficie del planeta Marte. Cada módulo contenía cierto número de experimentos diseñados para obtener más conocimientos sobre el planeta. Cinco de tales experimentos buscaban pruebas significativas para dar respuesta a la pregunta: ¿Existe vida en Marte? Ellos fueron: 1. Colocar una cámara de televisión: Si de pronto la lente de la cámara captaba un marciano mirando hacia ella, la pregunta hubiese encontrado una respuesta definitiva. Sin embargo esto no ocurrió, ni tampoco la cámara reveló signos de actividades de seres vivos. Se observó una multitud de piedras, pero nada que pudiera parecerse a un perro. 2. Probar la presencia de moléculas orgánicas en una muestra de suelo marciano: Una de las características más sobresalientes en cuanto a la composición química de los seres vivos de nuestro planeta, es la presencia de moléculas que contienen átomos de carbono. Así por ejemplo, las rocas están formadas incluso por átomos de carbono, pero a menos que procesos biológicos sean los responsables de su presencia en las rocas, éstas no contienen moléculas orgánicas. 3. Hallar indicios sobre la existencia de algo en el suelo capaz de sintetizar moléculas orgánicas complejas a partir de compuestos simples del carbono, tales como bióxido de carbono y monóxido de carbono: En este experimento se introdujo una mezcla de CO2 y CO radiactivos (en la proporción de 95:5) en un recipiente que contenía una pequeña muestra de atmósfera y de suelo marcianos. La síntesis de moléculas orgánicas a partir de precursores simples requiere energía, y la forma principal de la energía utilizada aquí en la Tierra es la luz solar (se utiliza en la fotosíntesis). Por lo tanto, la mezcla de incubación se iluminó con una lámpara de arco brillante. Después de cinco días, la muestra de suelo se calentó para extraer las moléculas orgánicas radiactivas que hubieran podido sintetizarse a partir del CO2 (y/o CO) radiactivos por seres vivientes presentes en el suelo marciano. El experimento buscaba evidencia de actividad metabólica que comprendería la síntesis de sustancias complejas a partir de sustancias simples, es decir, mostraría indicios de anabolismo. 4. Buscar indicios de catabolismo, es decir, de metabolismo de descomposición: En este experimento, una muestra de suelo se incubó conjuntamente con un caldo diluido de moléculas orgánicas radiactivas. Después de diez días, la atmósfera que rodeaba la muestra fue investigada a intervalos regulares para determinar la presencia de gases radiactivos tales como el bióxido de carbono. La existencia de gases radiactivos sería la prueba de descomposición de las moléculas orgánicas radiactivas con las cuales estaban empapadas las muestras de suelo. 37 5. Comprobar metabolismo en el suelo marciano: En este experimento se colocó una mezcla de gases previamente conocida, sobre una muestra de suelo y se analizó luego periódicamente para ver si algunos gases (por ejemplo, CO2) habían desaparecido de la mezcla o habían sido añadidos a ésta. Si el suelo por sí sólo hubiese fallado en producir un cambio en la composición gaseosa (no ocurrió esto, al principio se produjeron grandes cantidades de oxígeno), entonces se hubiera agregado un caldo de nutrientes al suelo. Si hubiesen existido organismos para catabolizar las moléculas orgánicas presentes en el caldo, algunos de los productos del catabolismo tendrían que ser gases y su presencia sería detectable por los equipos (Kimball, 1982). ¿Sabe usted qué resultados arrojaron los experimentos? ___. Descríbalos. Internet es un buen punto de partida. www. Altavista.com __________________________________________________________ __________________________________________________________ __________________________________________________________ __________________________________________________________ __________________________________________________________ __________________________________________________________ __________________________________________________________ __________________________________________________________ __________________________________________________________ __________________________________________________________ __________________________________________________________ __________________________________________________________ __________________________________________________________ __________________________________________________________ __________________________________________________________ __________________________________________________________ 38 CAPITULO 2 ORIGEN DE LA VIDA No hay que temer en la vida, hay que comprender. Marie Curie ¿QUÉ ES LA VIDA? Generalmente es más fácil reconocer la vida que definirla. El diccionario Larousse la define como “Conjunto de los fenómenos que concurren al desarrollo y la conservación de los seres orgánicos”, Kimball la presenta teniendo en cuenta las características biológicas: Organización compleja de la vida, metabolismo, reproducción, irritabilidad y evolución. La organización compleja de la vida Las células, generalmente demasiado pequeñas para poder ser observadas a simple vista, están organizadas en tejidos, los cuales a su vez, forman órganos. Varios órganos, funcionan conjuntamente y constituyen un sistema (Kimball, 1982). Células Tejidos Órganos Sistemas Metabolismo Se presenta como un intercambio rápido o lento de materiales en los seres vivos y se manifiesta en dos fases diferentes: 39 • Anabolismo: Síntesis de sustancias complejas. • Catabolismo: Degradación de sustancias (Horton et al., 1995). Biomoléculas Alimentos Anabolismo Trabajo celular Catabolismo Energía Energía Luminosa (Organismos Fotosintéticos) Alimentos Desechos Bloques de construcción Reproducción Es la duplicación auto controlada de las estructuras características. Requiere que el organismo tome materiales del medio ambiente, los procese y no los regrese en su totalidad, es decir, que crezca y que cada cierto tiempo produzca réplicas capaces de vivir con independencia. Puede ser asexual, en organismos poco complejos, partiendo de un progenitor y dando origen a hijos idénticos; o sexual, en organismos complejos, partiendo de dos progenitores y dando origen a hijos que presentan rasgos característicos (González, 2000). Irritabilidad Todos los seres vivos están capacitados para responder, de acuerdo con patrones definidos, a ciertos cambios (estímulos) de su ambiente, pues cuentan con medios para percibirlos (detectores) y con efectores para ejecutar la respuesta. Ésta debe ser coordinada y el sistema de coordinación consume energía (González, 2000). 40 Organismo vivo Estímulo Detectores Coordinadores Efectores Alteración Comportamiento Perro Llamada a comer Oídos, ojos y nariz Sistema nervioso y hormonas Los músculos y las glándulas El perro se mueve El perro siempre va a comer Entonces, el ser vivo presenta una manifestación activa y crea un cambio en sus relaciones con respecto a su ambiente exterior inmediato. Evolución Cuando los organismos se auto reproducen, su patrón estructural se duplica con exactitud maravillosa. Sin embargo a través de largos períodos de tiempo ocurren cambios que dan origen a la evolución de los organismos. A menudo ésta ha sido adaptativa; es decir, los cambios han capacitado a los organismos para vivir en su medio más eficientemente de lo que sus antecesores pudieron haberlo hecho en el mismo medio (Kimball, 1982). Asimismo, ha habido una proliferación de especies y organismos, el número de especies que ahora habitan en la Tierra son muchas más que el número de especies existentes hace 500 millones de años. Fundamente sus conocimientos Describa brevemente las teorías sobre el origen de la vida Teoría Cosmozoica Descripción De generación espontánea De Oparín De evolución Cuál es la suya? 41 LAS MOLÉCULAS DE LA VIDA Hidrocarburos Son compuestos constituidos exclusivamente por carbono e hidrógeno, donde los átomos de carbono pueden unirse unos con otros mediante enlaces covalentes dobles o sencillos. Pueden existir en cadena abierta (Alifáticos) o en cadena cerrada (Aromáticos). Para posteriormente facilitar la comprensión del tema a tratar, escriba la estructura de un hidrocarburo alifático y la de uno aromático, así como los nombres correspondientes según la IUPAC Hidrocarburo alifático Hidrocarburo aromático Lípidos Son componentes importantes de las membranas biológicas. Los más sencillos son los ácidos grasos. Estos son hidrocarburos de cadena larga con un grupo carboxilo en uno de los extremos. Los ácidos grasos se encuentran con más frecuencia como una parte de moléculas más grandes que se denominan glicerofosfolípidos, los cuales consisten en glicerol 3-fosfato y dos grupos acilo grasos. Los glicerofosfolípidos son componentes importantes de las membranas biológicas (Horton et al., 1995). Los lípidos de las membranas tienen por lo regular una cabeza polar, hidrofílica capaz de interactuar con un ambiente acuoso y una cola no polar, hidrofóbica. Las colas hidrofóbicas de tales lípidos se asocian, generan láminas de bicapas lipídicas, las cuales forman las membranas. Estas membranas sirven para separar una célula y se llaman membranas plasmáticas (Horton et al., 1995). Para entender la organización de una membrana plasmática, escriba la estructura de un ácido graso y su nombre correspondiente, 42 la estructura de un triacilglicérido y su nombre, la estructura de un glicerofosfolípido y su nombre. Ahora, elabore un diagrama que describa la estructura general de una membrana plasmática Carbohidratos Son un grupo de Biomoléculas abundante y diverso que comparten la propiedad común de estar compuestos de carbono, oxígeno e hidrógeno. Los carbohidratos incluyen azúcares sencillos, sus polímeros y otros derivados de azúcar, los cuales a menudo contienen varios grupos oxidrilo. Uno de los componentes principales de las paredes celulares de las plantas, la celulosa, es la macromolécula biológica más abundante. Otros polímeros de carbohidratos desempeñan también un papel en la estructura de las células y los tejidos, y algunos, como el glicógeno y el almidón, sirven como moléculas de almacenamiento (Horton et al., 1995). Para facilitar su discernimiento sobre las moléculas de la vida escriba la estructura de la glucosa utilizando las proyecciones de Fischer y de Haworth 43 Proyección de Fischer Proyección de Haworth Así como la estructura de un polisacárido e indique cómo se estabilizan los polímeros mediante puentes de hidrógeno Proteínas Aproximadamente el 50% del peso seco de la materia viva está compuesta de proteínas y éstas son polímeros de aminoácidos. Entonces, para fundamentar sus conceptos, describa la estructura y la naturaleza de los 20 aminoácidos esenciales y explique ¿Por qué se dice que los aminoácidos presentan isómeros ópticos? Abreviaturas para representar los aminoácidos: Tamaño - Polaridad Pequeños no polares Grandes no polares Con polaridad intermedia Grandes polares Aminoácido Cisteina Prolina Alanina Treonina Valina Isoleucina Leucina Metionina Fenilalanina Triptófano Histidina Tirosina Arginina Lisina Glutamina Abreviatura 1 Cis (Cys)a Pro Ala Tre (Thr) Val Ile Leu Met Fen (Phe) Trp His Tir (Tyr) Arg Lis (Lys) Gln Abreviatura 2 C P A T V I L M F W H Y R K Q 44 Glutamato Glu E N Asn Asparagina D Asp Aspartato G Gli (Gly) Glicina S Ser Serina a Entre paréntesis, abreviaciones corrientes en inglés, cuando difieren de las españolas. Pequeños polares Estructura de los polipéptidos: La gran mayoría de las proteínas se componen de los mismos veinte aminoácidos, pero la proporción de cada aminoácido varía de una proteína a otra. Los aminoácidos se unen mediante enlaces peptídicos para formar polipéptidos. El resultado es una cadena de aminoácidos, o más precisamente, de residuos de aminoácidos. En uno de los extremos de la cadena se encuentra expuesto un grupo amino. Este recibe el nombre de terminal amino o N-terminal del polipéptido. El otro extremo lleva expuesto el grupo carboxilo y se denomina terminal carboxilo o C-terminal. Hay proteínas de muchos tamaños: los polipéptidos que las conforman contienen desde 30 o 40 hasta 3000 aminoácidos. La mayor parte de las proteínas se componen de una sola cadena polipeptídica, pero otras muchas se forman por agregación de cadenas de secuencia diferente sintetizadas por separado, indicando que existen diferentes niveles de estructura en estas moléculas poliméricas. Para cimentar sus conocimientos, describa en un péptido la estructura del enlace peptídico Estructura primaria: Determinada por la secuencia de los aminoácidos en la proteína y la localización de los puentes bisúlfidos. Estructura secundaria: Determinada por distribuciones ordenadas de aminoácidos en la cadena polipeptídica y pueden ser: 1. La configuración hélice alfa: Como el enlace peptídico es bastante rígido, con todos los átomos situados en un mismo plano. La única oportunidad para obtener flexibilidad en el polipéptido se presenta en los enlaces situados en el carbono “alfa”. Esta flexibilidad se utiliza en la formación de un pliegue helicoidal en la cadena polipeptídica, con las siguientes características: Todos los grupos R de los aminoácidos se orientan hacia afuera; la hélice da una vuelta cada 3.6 residuos; la hélice es diestra, al desenvolverse se vuelve a torcer en el sentido de las manecillas del reloj; el grupo -C=O de cada enlace peptídico se orienta paralelamente al eje de la hélice y apunta 45 directamente al grupo -NH del enlace peptídico, situado a cuatro aminoácidos de distancia en la hélice. Tanto el oxígeno como el nitrógeno son átomos bastante electronegativos, de modo que un enlace de hidrógeno se forma entre estos grupos: -C=O ... H-N-. 2. La placa de plegamiento beta: Cuando las cadenas se disponen paralelamente, se mantienen unidas mediante los enlaces de hidrógeno que se forman entre los grupos -C=O y -N-H de una cadena con los grupos -N-H y -C=O de la cadena adyacente (Kimball, 1982). Estructura terciaria: Se presenta cuando las proteínas requieren estar disueltas en el agua para poder cumplir sus funciones. Estas proteínas tienden a ser globulares con cadenas polipéptidas intensamente plegadas, formando una molécula compacta (Kimball, 1982). Consta de dos fibras beta conectadas por un segmento de hélice alfa donde las tres piezas encajan entre sí cómodamente cuando se disponen en determinados ángulos. Una faceta estructural de esta clase, que típicamente comprende entre 30 y 150 aminoácidos, se llama dominio y puede considerarse una unidad, pues su conformación está determinada casi exclusivamente por su propia secuencia de aminoácidos. La disposición geométrica de los dominios constituye la estructura terciaria (Doolittle, 1985). Estructura cuaternaria: Está determinada por la presencia de sub unidades distintas que le imprimen un nivel superior de organización (Kimball, 1982); su estructura resulta de la elaboración de la molécula con posterioridad a la síntesis; consta de varias cadenas polipeptídicas, unidas entre sí por una variedad de enlaces débiles y, a veces, estabilizadas por enlaces disulfuro. En ocasiones contienen componentes no peptídicos como iones metálicos, esenciales para la actividad de ciertas enzimas, una estructura denominada anillo de porfirina, o cadenas de moléculas de azúcar, localizadas en la superficie de la proteína (Doolittle, 1985). Para apoyar sus conceptos, represente gráficamente las estructuras primarias, secundarias, terciarias y cuaternarias de una proteína 46 Y de igual forma, defina: ¿Qué es un Dalton? ________________________________________________________________ ________________________________________________________________ ________________________________________________________________ ________________________________________________________________ ________________________________________________________________ ________________________________________________________________ ________________________________________________________________ ________________________________________________________________ ________________________________________________________________ ________________________________________________________________ Para visualizar tamaños, formas y propiedades de las proteínas, complete el siguiente cuadro: Proteína 1 Peso Molecular1 Estructura Expresado en Daltons (Da) Ahora, para ampliar sus horizontes, describa: ¿Cómo se puede utilizar en biotecnología la microscopía electrónica y la cristalografía de rayos X? e indique ¿Cuáles son los instrumentos a emplear? ________________________________________________________________ ________________________________________________________________ ________________________________________________________________ ________________________________________________________________ ________________________________________________________________ ________________________________________________________________ ________________________________________________________________ ________________________________________________________________ ________________________________________________________________ ______________________________________________________ 47 Bases nitrogenadas Son moléculas planas, en forma de anillo, que contienen carbono y nitrógeno. Buscando la comprensión de los ácidos nucleicos, escriba la estructura de las bases nitrogenadas Purinas Adenina (A) Guanina (G) Pirimidinas Citosina (C) Uracilo (U) Timina (T) Nucleósidos Cada nucleósido contiene un azúcar (ribosa o desoxirribosa) y una base purínica o pirimidínica. Para posteriormente representar los ácidos nucleicos, escriba la estructura de un nucleósido Nucleótidos Cada nucleótido contiene un grupo fosfato y un nucleósido. Para basar un ácido nucleico, escriba la estructura de un nucleótido Nomenclatura de bases, Nucleósidos y nucleótidos 48 Base Adenina Guanina Citosina Uracilo Base Ribonucleósido Ribonucleótidos Adenosina Guanosina Histidina Uridina AMP, ADP, ATP GMP, GDP, GTP CMP, CDP, CTP UMP, UDP, UTP Desoxirribonucleósido Desoxirribonucleótidos Adenina Desoxiadenosina Guanina Desoxiguanosina Citosina Desoxicitidina Timina Desoxitimidina o timidina Fuente: Horton et al., 1995 dAMP, dADP, dATP dGMP, dGDP, dGTP dCMP, dCDP, dCTP dTMP, dTDP, dTTP 49 LECCION CINCO ACIDOS NUCLEICOS En los seres vivos se hallan dos clases de ácidos nucleicos: El ácido desoxirribonucleico o ADN y el ácido ribonucleico o ARN. Cada una de estas sustancias es un polímero lineal no ramificado de muchos nucleótidos unidos entre sí. Diferencias entre el ADN y el ARN Diferencia ADN ARN En el núcleo En el núcleo y en el Se encuentra citoplasma Desoxirribosa Ribosa Azúcar Bases nitrogenadas Adenina y guanina Adenina y guanina 1.Purinas Citosina y timina Citosina y Uracilo 2.Pirimidinas Los nucleótidos de los ácidos nucleicos están unidos regularmente por enlaces fosfodiéster 5’-3’; es decir, en el ADN, el grupo fosfato une el carbono 5’ de una desoxirribosa al carbono 3’ del nucleótido siguiente. Por otro lado, las cuatro bases pueden estar unidas a este esqueleto en cualquier orden y esta variabilidad hace distintas y específicas las moléculas de ADN y ARN. Escriba las estructuras de los ácidos nucleicos ADN ARN 50 LA CÉLULA Las células son las unidades más pequeñas de la vida, con diámetros muy por debajo del milímetro. Fueron vistas por primera vez, al poco tiempo de la construcción de los microscopios. A mediados del siglo XIX estaba claro que todos los seres vivos se componen de células (Watson et al., 1988). Todo organismos es, o bien una sola célula o está compuesto de muchas células. Las células se presentan en una considerable variedad de formas y tamaños. A pesar de tal diversidad, se pueden clasificar como: 1. Procarióticas: (Del griego, pro, antes; Kayron, núcleo) por lo regular son organismos de una sola célula y carecen de núcleo unido a una membrana (Horton et al., 1995). 2. Eucarióticas: (Del griego, eu, característico) son por lo general más grandes y tienen casi siempre un núcleo unido a una membrana. Por lo regular, contienen, a su vez, membranas internas que dividen la célula en organelos con funciones específicas, necesarias para la vida de la célula (Horton et al., 1995). PARTES DE LA CÉLULA Membrana celular Función Actúa a manera de interfase entre el interior de la célula y el fluido acuoso que la rodea. Citoplasma Describe todo cuanto se halla en el interior de la célula, excepto el núcleo. La mayor parte de sus funciones están dadas por las funciones de los organelos. Núcleo Es el centro de regulación de la célula. Contiene el material genético. EL NÚCLEO Membrana nuclear Nucleolo Observaciones Dentro de esta se encuentra un medio semifluído, en el cual se suspenden los cromosomas. Se utiliza el término cromatina para referirse a los cromosomas cuando se hallan en esta condición. En él se sintetizan varios tipos de moléculas de ARN. Parte de este ARN se utiliza en la configuración de los ribosomas. 51 EL CITOPLASMA Observaciones Citosol o hialoplasma Es el fluido en el cual se hallan suspendidos los organelos del citoplasma. Aquí está presente un buen número de enzimas cruciales para el metabolismo celular. Organelos Son estructuras claramente definidas. ORGANELO Mitocondrias Cloroplastos Ribosomas Retículo endoplasmático Aparato de Golgi Lisosomas Peroxisomas Vacuolas Función Convierten la energía potencial de alimentos en una forma de energía utilizable por las células, para llevar a cabo sus diversas actividades. Es el sitio donde ocurre la fotosíntesis. La clorofila atrapa la energía del sol y hace posible que ésta se utilice en la síntesis del alimento. En los ribosomas tiene lugar la síntesis de proteínas y están adheridos a la membrana del retículo endoplasmático. Son complejas membranas internas propias de las células eucarióticas. Los ribosomas adheridos al retículo endoplasmático áspero aparentemente depositan las cadenas polipeptídicas recientemente sintetizadas. El retículo endoplasmático liso probablemente toma parte en la síntesis de otros tipos de moléculas tales como grasas, fosfolípidos y esteroides. Las proteínas del retículo endoplasmático áspero son transferidas al aparato de Golgi, donde pueden agregarse carbohidratos a las proteínas. Es el sitio donde tiene lugar la síntesis de polisacáridos. Encierran enzimas hidrolíticas. Contribuyen a la desintegración de las células en deterioro o muertas. Pueden contribuir al proceso de conversión de las grasas en carbohidratos y en la ruptura de las purinas en el interior de las células. En su interior pueden hallarse sustancias alimenticias o desperdicios. 52 Para entender el cómo alterar la naturaleza esquematice la estructura esencial de las células bacterianas, animales y vegetales. Lo esencial de la célula es su capacidad de crecer y dividirse para producir células hijas, que puedan propagarse. Por consiguiente, las células son fábricas diminutas que crecen incorporando moléculas sencillas, como glucosa y anhídrido carbónico, a las que transforman en las miles de moléculas carbonadas necesarias para su funcionamiento. Al crecer y dividirse necesitan también una fuente de energía externa que asegure que las reacciones químicas celulares ocurran en la dirección de biosíntesis deseada. Las células se gobiernan, por las mismas leyes de la termodinámica que rigen la energía de los átomos en física y la energía de las moléculas en química. La mayoría de ellas obtienen la energía necesaria de la descomposición de moléculas de alimento, pero las células fotosintéticas usan directamente la energía solar. Por su tamaño, las moléculas de una célula se pueden clasificar en dos grupos muy diferentes. Uno es el de las moléculas pequeñas o metabolitos, como los azúcares, aminoácidos y ácidos grasos. En casi todas las células se encuentran por lo menos 750 metabolitos diferentes. El otro es el de las macromoléculas, entre las que destacan las proteínas y los ácidos nucleicos. En la mayoría de las células, el número de macromoléculas diferentes supera al de metabolitos diferentes. La suposición actual es que existen más de dos mil macromoléculas diferentes por célula (Watson et al., 1988). Las células, por tanto, son químicamente muy complejas, aunque no fuera más que por el número y tamaño de sus moléculas. Sin embargo, su especificidad química no reside tanto en la complejidad de sus moléculas como en la naturaleza de las reacciones químicas que convierten unas moléculas en otras. Las más importantes de estas reacciones son: 1. Las que descomponen los alimentos para dar moléculas que se puedan volver a usar como componentes vitales 2. Las que adquieren parte de la energía liberada por la digestión o por la absorción de luz y la transfieren después de asegurar que las reacciones celulares ocurran en la dirección deseada 3. Las que sintetizan los monómeros de las macromoléculas 4. Las que unen esos monómeros para formar macromoléculas definidas (Watson et al., 1988). Cada una de las miles de moléculas distintas existentes en una célula podría reaccionar de muchas maneras con otras moléculas. Pero en cada célula sólo se da a velocidad detectable una proporción pequeñísima de esas reacciones potenciales, porque la mayoría de las reacciones químicas tienen poca probabilidad de ocurrir sin ayuda a temperaturas fisiológicas. Las reacciones que se dan a velocidades compatibles con la vida son enormemente aceleradas por las enzimas, catalizadores exclusivos de las células. Las enzimas actúan 53 ligando a su superficie los reactivos (sustratos) con los que han de reaccionar (Watson et al., 1988). Todos los organismos han evolucionado a partir de un ancestro antiguo La idea de que la información es pasada de generación en generación implica que la progenie hereda copias exactas de los genes de sus padres. Esto puede ser cierto en un corto plazo, pero no a una escala de millones de años. La información genética puede ser alterada por mutación, y las mutaciones nuevas pueden convertirse en fijas en una población por medio de la selección natural y la deriva genética (Horton et al., 1995). Gradualmente, poblaciones de organismos similares divergen unas de otras y evolucionan nuevas especies. La evolución biológica se puede rastrear a través del registro de fósiles o por comparación directa de las secuencias de genes y de proteínas. Estas observaciones sugieren que todas las especies, millones de ellas, que ahora existen descienden de un solo ancestro que vivió hace varios miles de millones de años. Esta célula ancestral antigua fue sin duda capaz de realizar la glucólisis (la degradación de la glucosa) y muchos otros procesos bioquímicos fundamentales que son comunes a todas las células. Podría haber sintetizado aminoácidos y lípidos y casi con certeza utilizó el ATP como la unidad fundamental de energía. Utilizó el mismo código genético que encontramos en sus descendientes modernos. ¿Cómo la célula ancestral evolucionó desde los organismos más simples? es un problema que todavía no se ha podido resolver (Horton et al., 1995). Clasificación de organismos vivos El sistema popular de clasificación en cinco reinos que se describe en la mayoría de los textos coloca a los procariotes en un sólo reino que se denomina Monera. Los eucariotes quedan distribuidos en cuatro reinos: Fungi, Plantae, Animalia y Protista. Hace poco, los datos moleculares aclararon las interrelaciones de muchos grupos de bacterias que eran difíciles de clasificar, sobre la base única de la morfología. Un esquema de clasificación que promovió Carl Woese y sus colaboradores divide a los organismos a un nivel por arriba de los reinos en tres dominios filogenéticos que son los más evolutivamente divergentes. Dentro de los tres dominios, los organismos se dividen en reinos, que no corresponden por completo a los habituales del sistema de cinco reinos (Horton et al., 1995). 54 Dominios Eubacterias Archaea Eucarya Procariotes Eucariotes Reinos Protista Monera Fungi Animalia Plantae Fílum Los organismos descienden de un ancestro que vivió hace cientos de millones de años. Clase Defina:___________________________________________________ Orden Defina:___________________________________________________ Familia Defina:___________________________________________________ Género Organismos cuya divergencia ha sido relativamente reciente Eubacteria: Bacterias comunes, incluyendo aquellas especies que dieron origen a las mitocondrias y a los cloroplastos dentro de las células eucarióticas. Archaea: Procariotes que viven en lo que parecen ser ambientes primitivos Eucarya: Eucariotes Protista: La mayor parte de ellos son organismos unicelulares. 55 Para una mejor comprensión del esquema anterior, consulte las normas internacionales de clasificación y complete el siguiente cuadro, indicando en la columna correspondiente las características de cada grupo: Categoría Taxón Ejemplo 1 Característica s Reino Fungí Fílum Subfílum Grupo Ficomícetes Superclase Clase Zigomícetes Subclase Orden Mucorales Familia Mucoráceas Subfamilia Tribu Género Especie Mucor Mucor mucedo Taxón Ejemplo 2 Característica s Micomícetes “Hongos con puente”. Forman zigoesporas y poseen un micelio sin tabiques Ascomícetes Protascales Endomícetales El micelio es unicelular ..... Una única célula puede transformarse en un asca Endomycetaceas Saccharomycoid ea Saccharomycete ae Saccharomyces Saccharomyces cerevisiae Resuma los aspectos más importantes a tener en cuenta para la clasificación sistemática internacional __________________________________________________________ __________________________________________________________ __________________________________________________________ __________________________________________________________ __________________________________________________________ __________________________________________________________ 56 Características más importantes de los cinco reinos: Protista Tipo celular Envoltura nuclear Mitocondrias Cloroplastos Multicelularidad Sistema nervioso Nutrición Motilidad Medios de recombinación celular Pertenecen Monera Procariótico Ausente Ausente Ausente (Membranas fotosintéticas en algunos tipos) Unicelulares Ausente Ondulación y contracción de la membrana y del citoplasma Bipartición Bacterias y algas azuladas Fungi Eucariótico Presente Presente Ausente Eucariótico Presente Presente Ausente o presente (algas verdes) Unicelulares y pluricelulares Ausente Unicelulares y pluricelulares Ausente Fijos Cilios y flagelos 9+2, ameboides, fibrillas contráctiles Bipartición, mitosis Esporulación y gemación Levaduras, mohos, ficomicetos, ascomicetos, basidiomicetos Ciliados, flagelados, sarcodarios, algas diatomeas, filamentosas, rojas, marrón y verdes Animalia Eucariótico Presente Presente Ausente Plantae Eucariótico Presente Presente Presente Pluricelulares Pluricelulares Presente Quimiosintética Miembros adaptados a su ambiente natural Ausente Fotosintética Fijas Geotropismo fototropismo Fecundación meiosis Invertebrados, vertebrados y y Fecundación y meiosis Briofitas, pteridofitas, gimnospermas, angiospermas 36 REPRODUCCIÓN DE LAS CÉLULAS Y ORGANISMOS Enriquezca su vocabulario definiendo los siguientes términos: Centrómero: _______________________________________________________________ _______________________________________________________________ _______________________________________________________________ Cigote: _______________________________________________________________ _______________________________________________________________ _______________________________________________________________ Cofia (de la raíz): _______________________________________________________________ _______________________________________________________________ _______________________________________________________________ Injerto: _______________________________________________________________ _______________________________________________________________ _______________________________________________________________ Isogameto: _______________________________________________________________ _______________________________________________________________ _______________________________________________________________ Meristemo: _______________________________________________________________ _______________________________________________________________ _______________________________________________________________ Sinapsis: _______________________________________________________________ _______________________________________________________________ _______________________________________________________________ REPRODUCCIÓN DE LAS CÉLULAS Y ORGANISMOS Tipo de organismos Tipo de Reproducción Método Fundamento 96 Unicelulares 1. Fisión 2. Gemación Pluricelulares Asexual 1. Gemación 2. Esporulación 3. Fragmentación Mitosis Sexual Meiosis LECCION SEIS REPRODUCCIÓN ASEXUAL En organismos unicelulares • Fisión: La célula se alarga y divide por la mitad, incluso el núcleo, formándose dos partes iguales que acaban por separarse para vivir independientemente una de otra. • Gemación: En la célula madre se forma una especie de tubérculo que crece, se desarrolla y acaba por constituir un ser independiente. Las dos partes producidas no son de igual tamaño. En organismos pluricelulares • Gemación: El organismo produce yemas. • Esporulación: La reproducción se efectúa Éstas son cuerpos pequeños que contienen porción de citoplasma. • Fragmentación: En estas especies el cuerpo en varias partes; cada una de ellas puede estructuras del organismo adulto. por formación de esporas. un núcleo y una pequeña del organismo se fragmenta luego regenerar todas las Todos los tipos de reproducción asexual discutidos se llevan a cabo por mitosis. Además, la mitosis es el mecanismo responsable del crecimiento. Mitosis Célula 2N (2 pares de cromosomas) Profase 4N Metafase 4N Anafase 4N Telofase y división celular 2N 97 2N Para prepararse adecuadamente, explique que ocurre en cada una de las etapas de la mitosis _______________________________________________________________ _______________________________________________________________ _______________________________________________________________ _______________________________________________________________ _______________________________________________________________ _______________________________________________________________ Mitosis en las plantas: En el extremo de la raíz se halla un meristemo que produce las células a partir de las cuales aparecerán las primeras estructuras de la planta. En él, las células experimentan mitosis, aumentando la longitud de la raíz y posteriormente se inicia un proceso de diferenciación que comprende el desarrollo de estructuras especializadas tales como células epidérmicas y pelos radicales. Un patrón similar de crecimiento vertical ocurre en los ápices de los tallos, donde por mitosis del meristemo apical del tallo o yema terminal se produce un conjunto de células nuevas que periódicamente dan origen a hojas. Nuevos meristemos en forma de yemas laterales se desarrollan exactamente encima del punto en donde se inserta la hoja (Kimbal, 1982). Con miras a aplicar el concepto anterior en una propagación in vitro, ¿Cómo se diferencian y separan las células de la raíz? _______________________________________________________________ _______________________________________________________________ _______________________________________________________________ _______________________________________________________________ _______________________________________________________________ _______________________________________________________________ _______________________________________________________________ _______________________________________________________________ _______________________________________________________________ _______________________________________________________________ REPRODUCCIÓN SEXUAL Los nuevos individuos se originan por unión de dos juegos de información hereditaria (ADN). Por lo general, cada uno de estos juegos está contenido dentro de una célula especializada denominada gameto y cada gameto se produce en un individuo separado. Para combinar su información hereditaria, los dos gametos tienen que unirse en primer lugar, proceso que se conoce con el nombre de fertilización. En la mayoría de los organismos se producen dos tipos diferentes de gametos: los espermatozoos y los óvulos, que por su apariencia disímil, se dice que son heterogametos. El producto de la 98 fertilización es el cigote, pero cuando se fusionan los heterogametos no se habla de cigote sino de óvulo fecundado. En muchos organismos, tanto los gametos masculinos como los femeninos se producen en un solo individuo, caso en el cual se conocen como hermafroditas, pero aún en estos casos, dos individuos suelen contribuir a la formación del cigote, dando origen a la fertilización cruzada (Kimball, 1982). Gametos (Células especializadas que Contienen la información hereditaria) Espermatozoos (Masculinos) Óvulos (Femeninos) Fertilización Cigote (Óvulo fecundado) La reproducción sexual posibilita entonces la unión de dos gametos y proporciona el mecanismo por medio del cual los rasgos de dos progenitores distintos pueden combinarse, originando descendencia con características diferentes a aquellas de sus progenitores, lo cual a la vez implica variabilidad dentro de la especie. En los animales, la meiosis conduce directamente a la producción de gametos; en las plantas se utiliza en la producción de esporas que después dan lugar a los gametos; en los hongos y en las algas suele ocurrir inmediatamente después de la formación del cigote. 99 Meiosis Célula 2N Profase I 4N Metafase I 4N Anafase I 4N Telofase I y división celular 2N 2N Metafase II 2N 2N Telofase II y división celular N N N N Gametos Haploide: Que posee un juego sencillo de cromosomas (n), tal como ocurre en los gametos. También se emplea el término monoploide. Diploide: Que posee el doble de cromosomas respecto del número de cromosomas presentes en los gametos 2n, con excepción de los cromosomas sexuales. Para acrecentar su saber, explique que ocurre en cada una de las etapas de la meiosis _________________________________________________ _______________________________________________________________ _______________________________________________________________ 100 _______________________________________________________________ _______________________________________________________________ _______________________________________________________________ _______________________________________________________________ _______________________________________________________________ _______________________________________________________________ LOS CROMOSOMAS Más o menos para cuando Mendel hacía sus observaciones, se supo que la herencia se transmitía por los óvulos y espermatozoides; y que éstos últimos, en comparación con su núcleo, contienen relativamente poco citoplasma, llevando a los investigadores a comprender que la función del núcleo era la de contener los determinantes genéticos de la célula. Poco después, utilizando tintes especiales, se visualizaron pares de cromosomas (2N) con tamaño y aspecto diferente; además se descubrió que las células de los individuos de una especie contienen un número constante y que éstos son capaces de duplicarse antes de la división celular (mitosis) para volver exactamente a su forma original una vez se presente. Asimismo, estudios posteriores determinaron que las células sexuales, óvulos y espermatozoides, tienen exactamente el número haploide N; que el reparto de los cromosomas en la mitosis es exacto, recibiendo cada célula hija una copia de los de la célula original y, que durante la formación de las células sexuales (meiosis) el número de cromosomas baja a N para durante la fertilización del óvulo por el espermatozoide restaurar el 2N, característico de las células somáticas (Watson et al., 1988). Gameto Núcleo Cromosomas Genes Número de cromosomas presentes en diferentes organismos 101 Organismo Cangrejo Cebolla Hombre Mosca Drosophila melanogaster Pares de cromosomas > 100 8 23 No. de cromosomas > 200 16 46 4 8 En los cromosomas se encontraron casi invariablemente dos componentes, el ácido desoxirribonucleico (ADN) y un grupo de proteínas pequeñas, llamadas histonas, cuyo carácter básico neutraliza la acidez del ADN. Ahora se sabe que cada cromosoma contiene una molécula de ADN y que además de los cromosomas principales (con unos cuatro millones de pares de bases) es frecuente encontrar en las bacterias muchas moléculas circulares de ADN con sólo unos millares de pares de bases. Estos minicromosomas, llamados plásmidos, portan genes que confieren resistencia a antibióticos como las tetraciclinas o la kanamicina y en cada célula hay mucho mayor número de copias de los genes de los plásmidos que de los del cromosoma principal (Watson et al., 1988). EL ADN El ADN consta de dos cadenas polinucleótidicas enrolladas (doble hélice), con direcciones opuestas, unidas mediante puentes de hidrógeno entre los pares de bases, donde los pares A-T se separan más fácilmente que los pares G-C, debido a que tres puentes de hidrógeno unen la guanina a la citosina, mientras que entre la adenina y la timina únicamente se forman dos. Los apareamientos no sólo se dan entre bases de cadenas opuestas, sino que pueden formarse también dentro de una cadena si por suerte hay secuencias repetidas invertidas (palíndromos) que permiten la formación de horquillas. Es posible que la disociación local de regiones palindrómicas conduzca a la formación de lazos cruciformes semiestables que pudieran ser reconocidos por proteínas específicas. En los procariotes generalmente se pliega en forma circular; en los eucariotes el empaquetamiento es más complejo y compacto, necesita de la presencia de proteínas como histonas o protaminas y da origen a la cromatina con sus diferentes niveles de organización: nucleosoma, collar de perlas, fibra cromatínica, bucles radiales y cromosoma. Cuando se somete a procesos de calentamiento, se rompen los puentes de hidrógeno que unen las cadenas, se separan las dos hebras y se desnaturaliza el ADN. Sin embargo, el ácido 102 nucleico desnaturalizado retorna a su forma original al bajar la temperatura y si el procedimiento se realiza con ADNs de diferente naturaleza, se obtienen dobles hélices híbridas. Entonces, las cadenas de ADN se pueden disociar y reasociar, almacenan la información genética y sirven con mucha frecuencia como una plantilla para las reacciones que necesitan acceso a esa información. Virus: No son procariotes. No poseen maquinaria enzimática con la cual sintetizar ATP o efectuar otras funciones metabólicas. Son incapaces de reproducirse entre sí. En realidad, podría argumentarse que fallan en cubrir tantos de los criterios de la vida que no pueden inclusive considerarse como organismos vivientes. Tienen dos fases en su existencia, una dentro de las células vivas, y otra fuera de ellas. Fuera de las células de huésped, constan de un núcleo interior de ácido nucleico (ADN o ARN) y de una cubierta de proteína, denominada cápsida, la cual protege al núcleo de ácido nucleico, define a que tipo de célula puede adherirse un virión (partícula viral) determinado y ayuda de una u otra manera a la inserción de la partícula viral en la célula huésped. Algunos virus poseen otros compuestos, por ejemplo: lípidos, en sus cápsidas, y estas sustancias se pueden derivar de constituyentes celulares del huésped (Kimbal, 1982). Para proyectar lo aprendido, ¿Cómo se extrae el ADN en el laboratorio? _______________________________________________________________ _______________________________________________________________ _______________________________________________________________ _______________________________________________________________ Enriquezca su vocabulario Genotipo: Constitución genética de un organismo. Fenotipo: (gr. phainein, mostrar, y tipos, tipos) Apariencia de un organismo, resultante de la interacción del genotipo y del ambiente. Genoma: Juego completo (haploide) de genes. En los procariotes existen aproximadamente 2000 genes por genoma. La mayor parte de estos son genes constitutivos, que codifican proteínas o moléculas de ARN que son indispensables para las actividades normales de todas las células vivas. Gen: Secuencia de ADN que se transcribe. Gen estructural: Serie de nucleótidos que contienen los códigos para un solo producto génico, es decir, que se transmite en una molécula ARN. Gen operador: El gen que activa o inactiva los genes estructurales adyacentes. 103 Gen regulador: Gen que produce un represor. DOGMA CENTRAL DE LA BIOLOGÍA MOLECULAR El flujo de la información biológica va del ADN al ARN y del ARN a las proteínas. La información genética se mantiene de generación en generación por la replicación del ADN y la complementariedad del ADN es el fundamento de su replicación. Replicación ADN Transcripción ARN Traducción Proteína Enriquezca su vocabulario Replisoma: Máquina proteica que lleva Contiene las polimerasas de replicación. una de las dos horquillas de replicación. Primosoma: Es parte del replisoma síntesis de un cebador corto de ARN cada segundo. a cabo la reacción de polimerización. Un replisoma está localizado en cada y contiene la primasa. Cataliza la de aproximadamente 10 nucleótidos DNA polimerasas: Familia de enzimas que participan en la síntesis y reparación del ADN. DNA ligasa: Enzima que cataliza la formación de fosfodiésteres entre los nucleótidos. 104 Cadena conductora: La nueva cadena sintetizada, formada por la polimerización 5’→3’ en la dirección del movimiento de la horquilla de replicación. Cadena retardada: La nueva cadena sintetizada, formada por la polimerización 5’→3’ en la dirección opuesta al movimiento de la horquilla de replicación. Fragmentos de Okazaki: Pedazos cortos de ADN que son unidos por la acción combinada de DNA polimerasa I y DNA ligasa. Cada fragmento tiene aproximadamente 1000 nucleótidos. Marco de lectura: Punto de partida de una secuencia única de palabras de tres letras. 105 CAPITULO TRES REPLICACIÓN: El ADN puede ser lineal o circular y su replicación suele empezar en un punto determinado llamado origen dentro de ella y alejarse bidireccionalmente hasta completar la duplicación en un sitio de terminación. Cada cadena sirve como una matriz para la síntesis de una cadena hija complementaria. La ADN polimerasa cataliza la reacción de polimerización en una horquilla de replicación. Después de una ronda de replicación, cada cadena de las moléculas hijas contiene una cadena de la molécula madre y una cadena recién sintetizada. ADN Replisoma Sitio de origen Topoisomerasas Desenroscado del ADN Helicasas Ruptura de los enlaces de hidrógeno Tetrámeros SSB Fijación de las horquillas de replicación Holoenziama de la DNA polimerasa III Cebadores de ARN Síntesis simultánea de las cadenas conductora y retardada en la horquilla de replicación Holoenzima de la DNA polimerasa III Exonucleasa DNA ligasa Revisión y reparación Mutación DNA polimerasa I DNA ligasa Unión de fragmentos de Okazaki 106 ADN replicado Para establecer un paralelo, ¿La replicación del ADN en los eucariotes es similar a la replicación del ADN en los procariotes? _________________ _______________________________________________________________ _______________________________________________________________ _______________________________________________________________ _______________________________________________________________ _______________________________________________________________ _______________________________________________________________ _______________________________________________________________ _______________________________________________________________ 5’ 3’ 5’ 3’ 5’ 3’ Fragmentos de Okasaki Mutaciones Son las principales causas de variación en la naturaleza y en el laboratorio, pueden incrementarse utilizando productos químicos, mutagénicos y radiación. A nivel celular, una mutación es un cambio de secuencia en las bases de ADN y resulta de un error en la replicación (Smith et al., 1998). Cambio en el marco de lectura: A pesar de los sistemas destinados a prevenir y corregir los posibles errores, de vez en cuando se produce alguno en la réplica, bien por colocarse una citosina en lugar de una timina, o una adenina en lugar de una guanina; porque el mecanismo de replicación se salta algunas bases y aparece una mella en la copia, o porque se unen dos bases de timina formando un dímero. 107 Debió leer y Leyó CCAGTAC GGTCATG CCAGTAC GGTCGTG CGAAGCTA GCTTCGAT CGAAGCTA G C T-T C G A T Formación de un dímero de timina Delección: Implica la pérdida de un trozo de cromosoma; los efectos que se producen en el fenotipo están en función de los genes perdidos A B C D E A B C E Duplicación: Se repite un trozo de cromosoma A B C D E A B C D E D E Enriquezca su vocabulario Operón: Es una unidad de transcripción. Promotores: Sitios de iniciación de la transcripción. En las bacterias, con frecuencia se cotranscriben diversos genes, a partir de un solo promotor. En las células eucarióticas, por lo general cada gen tiene su propio promotor. 108 TRANSCRIPCIÓN Es el proceso en el cual la información almacenada en el ADN es transferida al ARN, la ARN polimerasa, una proteína multimérica, cataliza la síntesis del ARN. La transcripción se inicia en las secuencias promotoras, se puede regular y su terminación requiere de secuencias especiales (Horton et al., 1995) ADN T G G G T T A A C G T A ARNm A C C C A A U U G C A U ADN Promotor - Operón ARN polimerasa El reconocimiento de promotores dependen de una subunidad de la ARN polimerasa El complejo de transcripción es ensamblado en las secuencias promotoras Formación de la burbuja de transcripción y síntesis de un cebador Operon La transcripción de genes se puede regular Secuencia de - Los activadores incrementan la velocidad terminación de transcripción de promotores débiles. - Los represores pueden inhibir la Transcripción ARN Enriquezca su vocabulario 109 Intrones: Secuencias de ARN sin información que no forman parte de la molécula madura de ARNm. Exones: Secuencias de bases que codifican proteínas. Sitios de empalme: Uniones de intrones y exones, en éstos sitios el precursor de ARNm se cortará y unirá. Spliceosomas: Complejo de multisubunidades proteína grande-ARN (3x106 Da), compuesto por 45 proteínas y 5 moléculas de ARN cuya longitud total es de 5000 nucleótidos; cataliza las reacciones de corte y empalme de ARNm, ayuda a retener los productos intermedios y a situar los sitios de corte y empalme de modo que los exones puedan unirse con precisión. PROCESAMIENTO DEL ARN Muchas trascripciones iniciales de ARN no son liberadas del complejo de transcripción en una forma por completo activa; más bien, son en extremo alteradas antes que puedan adoptar sus estructuras y funciones maduras. Se requieren muchas etapas diferentes de procesamiento para producir ARNt y ARNr, estas caen dentro de tres categorías generales: 1. Remoción de nucleótidos de transcripciones iniciales del ARN. 2. Adición de nucleótidos con secuencias no codificadas por los genes correspondientes 3. Modificación covalente de ciertas bases. El procesamiento de las moléculas eucarióticas de ARNm comprende modificación covalente, adición de nucleótidos y empalme (Horton et al., 1995). Exones 110 Intrones Entonces, para apropiarse del conocimiento, explique mediante un diagrama la conversión del ARN sintetizado a ARN maduro Ahora, represente gráficamente los ARN maduros: ARNt, ARNr y ARNm ARNt ARNr ARNm Y sobre los diagramas previamente elaborados ubique: Rama anticodón: Rama que contiene el anticodón. Rama TΨC: Rama que contiene timina y pseudouridina seguida de citidina Rama D: Rama con residuos de dihidrouridina, su longitud varía. Rama variable: Esta ubicada entre la rama anticodón y la TΨC. Puede tener una longitud de alrededor de 3 a 21 nucleótidos. Enriquezca su vocabulario Codones: El código genético está formado por palabras de tres letras, que no se superponen. Codón de iniciación: Es el codón de la metionina (AUG), se utiliza para indicar el sitio de iniciación de la síntesis de proteínas. Codones de terminación: UAA, UGA y UAG, es decir los que especifican Paro Codones sinónimos: Codones diferentes que especifican los mismos aminoácidos. 111 Anticodón: Rizo de cadena sencilla opuesto al tallo aceptor que se fija a un codón complementario en el ARNm. ARNt iniciador: Moléculas de ARN que reconocen el codón AUG Secuencia de Shine-Dalgarno: Región del ARNm rica en purinas que precede el codón de iniciación y sobre la cual se fija el ribosoma para iniciar la traducción. TRADUCCIÓN La secuencia de nucleótidos de un gen es información codificada que especifica el orden de los aminoácidos en un polipéptido. Esta información codificada se copia al ADN y se transcribe, en un mensaje (ARNm) que luego se traduce en los ribosomas de la célula. Con algunas excepciones, todos los organismos vivos utilizan el mismo código genético para especificar la secuencia de aminoácidos de una proteína. La lectura de este código genético, y por tanto, la traducción de la secuencia de los ácidos nucleicos a una secuencia de aminoácidos es mediada por las moléculas de ARNt, las cuales actúan como interfase entre el ARNm y las proteínas sintetizadas (Horton et al., 1995). Código genético universal Primera Base U C A G 112 U Fenilalanina Fenilalanina Leucina Leucina Leucina Leucina Leucina Leucina Isoleucina Isoleucina Isoleucina Inicio - Met Valina Valina Valina Valina Segunda Base C A Tirosina Serina Tirosina Serina Serina Pare Serina Pare Histidina Prolina Histidina Prolina Glutamina Prolina Glutamina Prolina Treonina Asparagina Treonina Asparagina Lisina Treonina Lisina Treonina Asparagina Alanina Asparagina Alanina Á. Alanina glutámico Alanina Á. glutámico G Cisteina Cisteina Pare Triptófano Arginina Arginina Arginina Arginina Serina Serina Arginina Arginina Glicina Glicina Glicina Glicina Tercera Base U C A G U C A G U C A G U C A G Codón ARNm Aminoácidos A C Tr C C A Glu A U U Leu G C A U His Antes de continuar, para tener una idea concisa, revise las diferentes estructuras que poseen los ribosomas. Éstas son las fábricas de proteínas. 113 LECCION OCHO NOMENCLATURA GRÁFICA DEL ARN Aminoácido Ribosoma ARNt ARNm El ribosoma se mueve a lo largo de la cadena de ARNm 114 Síntesis de proteínas en los ribosomas ARNm ARNt Ribosoma Aminoácidos Proteínas Enriquezca su vocabulario Diana: Secuencia determinada de ADN. Restrictasas: Nucleasas que rompen los enlaces fosfodiéster de los ácidos nucleicos; algunas de ellas son BamH1, BalI, EcoRI, HaeII, HaeIII, HhaI, HindII, HindIII, HpaI, HpaII, PstI, SalI, XorII. Las hay de corte liso o cohesivo. Mapas de restricción: Ubica las dianas de la restrictasa en el ADN. Ejemplos de restrictasas y sus dianas Microorganismo Bacillus amyloliquefaciens H Brevibacterium albidum Abreviatura BamH1 BalI Diana 5’ → 3’ 3’ → 5’ G↓GATCC CCTAG↑G TGG↓CCA ACC↑GGT Fuente: Watson et al., 1988 Para mayor comprensión adjunte un mapa de restricción, indicando su procedencia y describa un método de secuenciación del ADN con base en los fragmentos de restricción. 115 MANIPULACIONES in Vitro Los actuales éxitos de la biología se deben al desarrollo de métodos para secuenciar ácidos nucleicos, cortes específicos de ADN con restrictasas, métodos de secuenciación de ADN basados en fragmentos de restricción, síntesis química de oligonucleótidos, replicación del ADN utilizando enzimas, uso de plásmidos pequeños como vectores para clonar genes y análisis molecular del ADN de los organismos superiores (Watson et al., 1988). De ahí la importancia de las manipulaciones genéticas in vitro (también conocidas como clonaje de ADN, clonaje de genes, tecnología de ADN Recombinante o, de una manera un tanto evocadora aunque inexacta, ingeniería genética), éstas permiten en primer lugar evitar los múltiples mecanismos que restringen la transferencia de genes entre organismos no relacionados y, en segundo lugar, que se lleven a cabo manipulaciones extraordinariamente precisas y sutiles aprovechando la extremadamente precisa y sutil naturaleza del proceso de recombinación. Estas técnicas consisten en cortar el ADN en fragmentos específicos utilizando endonucleasas de restricción y ligando los fragmentos a un vector, es decir, una molécula de ADN que es capaz de ser incorporada y replicada por la célula hospedadora (Wiseman, 1986). Pasos para la manipulación genética in vitro 1. Corte y ligadura del ADN: Endonucleasas de restricción 2. Definición de vectores: Vectores para la transferencia de ADN clonado, vectores de expresión y vectores de secreción 3. Identificación de los recombinantes: Determinación de secuencias de bases 4. Estrategias de la manipulación genética in vitro: Obtención de fragmentos de ADN, uso de enzimas de restricción, obtención del ADN complementario 5. Expresión: Consiste en conseguir el gen clonado (Wiseman, 1986). TÉCNICA DEL ADN RECOMBINANTE Permite transferir genes de un organismo a otro, utilizando para ello vehículos, por ejemplo plásmidos o fagos, que permiten introducir un gen extraño a un microorganismo y obligar a esta a producir algo que normalmente no produce, en pocas palabras se construye un nuevo microorganismo con características especiales (Montoya, 1989). Clonación del ADN Recombinante: Los plásmidos experimentan rompimientos por la acción de la endonucleasa que produce cortes disparejos, de modo que se forman extremos de una sola cadena. La misma enzima se utiliza para preparar una muestra de ADN foráneo. Los dos fragmentos de ADN se juntan luego con ayuda de bases complementarias con respecto a las 116 bases presentes en los extremos disparejos y de la enzima ADN ligasa. Los plásmidos híbridos se reintroducen en las células bacterianas, entonces, células individuales, provistas cada una de su fragmento de ADN Recombinante, pueden reproducirse fácilmente en clonos con cualquier número de células que se desee. En algunos casos, el ADN foráneo en el plásmido puede ser transcrito y traducido. En algunos casos se pueden producir enormes cantidades del gen, el cual puede utilizarse luego en el desarrollo de procedimientos bioquímicos, por ejemplo, el análisis secuencial. Obsérvese, sin embargo, que no es posible predecir, antes de examinar el clono cuál fragmento particular del ADN foráneo se incorporó en el plasmido híbrido (Kimball, 1982). ADN extraño Vector: Plásmido Cortar con Endonucleasas de restricción Fragmentos de ADN con corte cohesivo Unir con ADN Ligasas ADN Recombinante Introducción en células hospedadoras: Células bacterianas Expresión del gen clonado en las células hospedadoras Duplicación del ADN o Duplicación del ADN Transcripción Traducción Selección de las células que contienen ADN Recombinante 117 Aplicaciones del clonaje de ADN: Aumento de la producción de una determinada enzima, transferencia de la capacidad para producir un producto biológico específico a un organismo que crezca fácilmente, por ejemplo, para la producción de somatostatina, vacunas víricas, hormona del crecimiento humano, insulina e interferón (Wiseman, 1986). Amplíe lo aprendido explicando mediante un diagrama qué son y cómo se utilizan las sondas para genes clonados. Muta génesis in Vitro: El enfoque genético clásico era inducir in vivo y al azar mutaciones por todo el genoma y aislar aquellas que tuvieran un fenotipo determinado. Hoy se puede inducir in Vitro en un segmento de ADN cambios específicos y analizar sus efectos in vivo una vez introducido el ADN mutante en un organismo. Entonces se pueden mutar lugares predeterminados del ADN creando delecciones, inserciones y sustituciones específicas. Enriquezca su vocabulario Plasmocito: Célula productora de anticuerpos. Anticuerpo o inmunoglubulina: Proteína capaz de reconocer específicamente determinadas moléculas o partes de moléculas, los antígenos. Se produce como resultado de la presencia de un antígeno y está en capacidad de combinarse con él. Antígeno: Sustancia capaz de provocar una respuesta inmune. Inmunización: Procedimiento que lleva a que un individuo produzca anticuerpos determinados. Mielomas: Tumores de células productoras de anticuerpos. Todas las células de un mieloma obtenido de un animal descienden de una sola célula cancerosa inicial. 118 Para tener una visión de conjunto del sistema inmune indique: 1. La diferencia entre los linfocitos T y β, así como su cooperación. 2. El comportamiento de las células inmunocomponentes: Receptores de superficie, control genético, eventos intracelulares, homeostasis. 3. Cómo funciona el sistema de amplificación. TÉCNICA DE HIBRIDOMAS La técnica de hibridomas consiste en combinar la habilidad de las células β para producir anticuerpos, con la “inmortalidad” de las células cancerosas, las cuales a diferencia de las células normales, se pueden cultivar en el laboratorio bajo condiciones apropiadas para dividirse y crecer de manera indefinida, dando lugar a una célula híbrida que tiene propiedades de las células originales, produce anticuerpos y vive mucho tiempo. A estos híbridos se les ha denominado anticuerpos monoclonales (Montoya, 1989). Células β: productoras de anticuerpos + Células cancerosas: inmortales Célula híbrida = anticuerpo monoclonal BIBLIOGRAFÍA DE APOYO 7. Chandra, P y Appel, W. Métodos de Biología Molecular. Editorial Acribia. 8. Krautwurst, Hans; Encinas, María Victoria; Marcus, Frank; Latshaw, Steven; Kemp, Robert; Frey, Perry and Cardemil, Emilio. Saccharomyces cerevisiae Phosphoenolpyruvate Carboxykinase: Revised Amino Acid Sequence, SiteDirected Mutagenesis, and Microenvironment Characteristics of Cysteines 365 and 458. Biochemistry. 1995. 34. 6382 - 6388. 9. Martínez de la Cuesta, Pedro J. y Rus Martínez, Eloísa. La Replicación de los ácidos desoxirribonucleicos y su importancia en la síntesis de proteínas. Alimentación: Equipos y Tecnología. Abril 1999. 10.Pellón y otros. La Ingeniería Genética y sus Aplicaciones. Editorial Acribia. 11.Scragg. Biotecnología para Ingenieros. Sistemas Biológicos en Procesos Tecnológicos. Editorial Limusa, S.A. de C.V. Grupo Noriega Editores. México. 1996. 12.Werner, R. Fundamentos de Bioquímica Moderna. Editorial Acribia. 119 BIBLIOGRAFÍA 10.Bernal Villegas, Jaime. Genética Inmunológica. Principios básicos y aplicaciones clínicas. Editorial Norma. 1982. 11.García Pelayo, Ramón y Gross. Nuevo Larousse Manual Ilustrado. Editorial Larousse. 12.Hodson, Elizabeth. Presentación. Tecnologías de la Vida para el Desarrollo. Bases para un Plan del Programa Nacional de Biotecnología. Colciencias. 1993. 13.Horton, Robert; Moran, Laurence; Ochs, Raymond; Rawn, David y Scrimgeour, Gray. Bioquímica. Prentice-Hall Hispanoamericana, S.A. México. 1995. 14.Kimball. Biología. Cuarta Edición. Fondo Educativo Interamericano. México. 1982. 15.Madden, Dean. Biotecnología de losAlimentos. Introducción. ILSI Europa. Bélgica. 2000. 16.Montoya, Dolly. Las fermentaciones como soporte de los procesos biotecnológicos. Universidad Nacional de Colombia. Bogotá, D.E. 1989. 17.Watson, James; Tooze, John y Kurtz, David. ADN Recombinante. Introducción a la ingeniería genética. Primera edición. Editorial Labor, S.A. 1988. 18.Wiseman, Alan. Principios de Biotecnología. Editorial Acribia, S.A. Zaragoza. 1986. TRABAJO DE COMPLEMENTACIÓN 1. Busque un artículo en inglés que describa el proceso de clonación vegetal y con él construya un documento gráfico que permita identificar cada parte del proceso; defina términos. 2. Explique mediante un ejemplo como las sondas de ADN pueden ser utilizadas para detectar genes o fragmentos de ADN particulares que han sido aislados de algunos organismos, permitiendo que las características genéticas se confirmen rápidamente, sin necesidad de hacer crecer una planta hasta la madurez. 3. Explique mediante un ejemplo, en qué consisten la transgenia y la mutación sitio-dirigida. 4. La pectina es un componente esencial de muchas frutas, degradada naturalmente por las enzimas poligalacturonasa y es posible utilizar la tecnología antisentido para “neutralizar” la producción de poligalacturonasa, retardando la maduración de las frutas una vez han sido cosechadas. Explique entonces, el principio de la tecnología antisentido? 120 LECCION NUEVE ESTUDIO DE CASO : ESTUDIO Y PUESTA A PUNTO DE UN MÉTODO “ELISA” PARA LA DETERMINACIÓN DE AFLATOXINAS EN CHORIZOS Las aflatoxinas son compuestos químicos, cumarinas intensamente sustituidas, estructuralmente relacionadas con compuestos tóxicos producidos por ciertas cepas de Aspergillus flavus y Aspergillus parasiticus. En la actualidad se conocen por lo menos 8: B1 (carcinogénica), B2, B2a, G1, G2, G2a, M1 y M2. Éstas pueden estar presentes en los productos cárnicos, bien en forma indirecta, como residuo en el tejido de los animales que han consumido alimentos contaminados con ella o en forma directa, cuando los mohos crecen sobre los productos, caso en el cual su desarrollo depende de factores tales como potencial genético, condiciones ambientales (sustrato, humedad, temperatura, pH) y tiempo de contacto entre el hongo y el sustrato. Objetivo Definir si el método de extracción propuesto para la obtención de aflatoxina a partir de una muestra de chorizo es el correcto, y si el test AFLA-10 CUP diseñado para determinar la presencia de aflatoxinas B1, B2 y G1 en cereales, cacahuetes y pienso, puede aplicarse a productos cárnicos. Materiales y métodos Métodos analíticos Para determinar la presencia de hongos potencialmente productores de aflatoxinas: Se utiliza la técnica de siembra en placa en medio Czapek Solution Agar6 preparado de acuerdo con la fórmula dada por Thom y Church, incubando a T1 = ambiente y T2 = 30ºC. Para determinar la presencia de aflatoxinas: Se utiliza el test AFLA-10 CUP, el cual proporciona resultados en 5 minutos, sin contar el tiempo de preparación de la muestra ni el de los extractos. El método se basa en la técnica ELISA, donde una cantidad control de anticuerpo se halla en el disco central de un pocillo que sólo reaccionará frente a la aflatoxina, detectando niveles de toxina entre 5 y 100 ppb, en muestras de alimentos y piensos. Su grado de exactitud se acerca al 100%. Éste medio produce un desarrollo moderadamente vigoroso de casi todos los saprofíticos Aspergilli y produce micelas y conidios característicos, útiles para estudios comparativos. 6 121 Materiales y reactivos: Kit AFLA-10 CUP el cual proporciona pocillos con anticuerpo para aflatoxina, enzima marcada, soluciones control (negativo), para lavado, sustrato A, sustrato B y tampón para dilución de la muestra. Todos los componentes del Kit se deben almacenar sin congelar, entre 4 y 8ºC. Muestras: Para determinar la presencia de hongos en el chorizo se tomaron muestras tanto en la superficie como en el interior del producto. Para comprobar si el método ELISA era aplicable a productos cárnicos crudos y curados, se tomaron ejemplares del embutido y a algunos de ellos se añadió aflatoxina B1 cristalina disuelta. Preparación de la muestra: La extracción se realiza con una solución metano : agua (80 : 20), teniendo en cuenta que sólo se usan extractos acuosos con pH entre 5 y 10. Es importante, entre muestra y muestra, limpiar el material con lejía al 30%, así como utilizar los reactivos a temperatura ambiente. Una vez transcurrido el plazo necesario para que la extracción de la muestra sea completa, se procede a una dilución total del extracto con tampón de dilución y a la aplicación del test, realizando paralelamente una prueba control. Aplicación del test: Una solución control (negativo) de aflatoxina o la muestra preparada del alimento a analizar se añade al pocillo, posteriormente se agrega la enzima marcada y a continuación la solución de sustrato. Cantidades crecientes de toxina originan en el pocillo una coloración más débil (blanco); su ausencia, reporta un color azul intenso (control negativo). Los pasos a seguir en orden riguroso y cronometrado son: 1. Aplicar 100 µl de la dilución total en el centro del pocillo, esperar 1 minuto y añadir otros 100 µl. 2. Aplicar 2 gotas de enzima en el centro del pocillo. Esperar 1 minuto como tiempo de reacción (tras la segunda gota) antes de continuar. 3. Lavar el pocillo con 30 gotas de la solución de lavado, utilizando cada vez, tres series de 10 gotas. 4. Preparar la solución de sustrato en un tubo de ensayo pequeño, mezclando 10 gotas de la solución de sustrato A, con 10 gotas de la solución de sustrato B; ésta mezcla se debe realizar máximo 10 minutos antes de utilizarla. 5. Añadir todo el contenido de la solución de sustrato al pocillo y usando el cronómetro, esperar 1 minuto. 6. Leer e interpretar los resultados. 122 Como usted debe medir microlitros, consulte: ¿Qué tipos de transferpipetas encuentra en el mercado?, ¿cuáles son sus rangos de aplicación? y ¿cuál es su costo? Resultados Presencia de hongos en el chorizo Tipo de muestra Superficie Superficie Interior Diluciones de Desarrollo Desarrollo Características de los hongos a 30ºC la muestra a Tambiente 4 10 + + Colonias filamentosas y + + blanquecinas, con cabeza negra 104 + + en el extremo superior del 104 filamento Directamente + + Filamentosos, algodonoso + + semiesférico, blanquecino, con ligero tono verde en el centro 4 10 + Pequeñas colonias blanquecinas estriadas y muy extendidas 104 Análisis Las colonias de aspecto filamentoso y blanquecino con cabeza negra en el extremo superior de cada filamento, sugieren que el hongo superficial del chorizo es el Krhizopus nigricans. Además, la siembra directa de los mohos superficiales, presenta el aspecto característico de las colonias en procesos de curado de embutidos cárnicos, es decir, colonias filamentosas de aspecto algodonoso, semiesféricas, blanquecinas con un ligero tono verde en el centro. Nótese que en ningún caso se encontraron colonias típicas de hongos productores de aflatoxinas. Sin embargo, es importante considerar que aunque estos microorganismos específicos no se encuentran en el alimento, éste sí puede estar contaminado con la toxina, ya que el embutido pudo perder su contaminación fúngica superficial, mediante técnicas de lavado, raspado o de altas temperaturas. Presencia de aflatoxinas en el chorizo Tanto en las muestras control como en las que contenían sólo embutido, una vez transcurrido el tiempo necesario de reacción se observó una coloración azul intensa que iba aumentando conforme pasaba el tiempo. Esto indica que 123 las muestras de chorizo analizadas no contenían aflatoxina. Sin embargo, los tests realizados sobre muestras con aflatoxina, dieron resultado positivo. Análisis ______________________________________________________________________ ______________________________________________________________________ ______________________________________________________________________ ______________________________________________________________________ ______________________________________________________________________ Conclusión El método de extracción de la muestra para obtener la aflatoxina, en caso de que la hubiera, es el correcto y el test AFLA-10 CUP puede aplicarse a productos cárnicos. ¿Qué otras técnicas de ELISA conoce? _______________________________ ______________________________________________________________________ ______________________________________________________________________ ______________________________________________________________________ Discuta la siguiente afirmación: “Las técnicas enzimoinmunocitoquímicas utilizan anticuerpos marcados con enzimas para localizar los constituyentes presentes en los tejidos o en las células, o alternativamente para demostrar los anticuerpos anticonstituyentes celulares presentes en los sueros de ciertos enfermos”. ________________ ______________________________________________________________________ ______________________________________________________________________ ______________________________________________________________________ La experiencia muestra que ciertos anticuerpos monoclonales pierden totalmente su actividad después del acoplamiento a marcadores, ya sea a macromoléculas como las enzimas o a haptenos como la biotina o la fluoresceína. Proponga entonces, una explicación a este fenómeno. __________________________________________________________ ______________________________________________________________________ ______________________________________________________________________ ______________________________________________________________________ 124 Bibliografía recomendada 1. Scragg. Biotecnología para Ingenieros. Sistemas Biológicos en Procesos Tecnológicos. Editorial Limusa, S. A. Grupo Noriega Editores. México. 1996. 2. Alguacil, M.; Fidalgo, M. y Jiménez, J. Detección de Brettanomyces/Dekkera en instalaciones de vendimia mediante PCR. Alimentación: Equipos y Tecnología. Octubre. 1998. 3. Pájaro, J. C.; Santos, V. y Vásquez, M. Producción Biotecnológica de asta xantina por phaffia rodozyma. Alimentación: Equipos y Tecnología. Enero/Febrero. 1996. 4. Prieto, Juan Carlos y Bermúdez, Ana Silvia. Producción de almidón bajo en proteínas a partir de harina de arroz. Alimentos Hoy. 5. Sutherland, Ian y Tait, Michael. Biopolymers. Encyclopedia of Microbiology. Volumen 1. Academic Press, Inc. 1992. TRABAJO DE COMPLEMENTACIÓN 1. Elabore un cuadro sinóptico que permita visualizar las diferentes aplicaciones de la biotecnología en la industria de alimentos. 2. Proponga un procedimiento biotecnológico para producir almidón bajo en proteínas. 3. Construya un caso similar a los presentados. Describa el proceso de producción de dextran utilizando Leuconostoc mesenteroides. 4. Explique el principio de la tecnología de fermentación anaerobia para el tratamiento de aguas contaminadas con materia orgánica. 5. Describa la técnica para cuantificar glucosa en los alimentos, utilizando glucosaoxidasa peroxidasa. 125 96 UNIDAD 2 Me atreveré a todo lo que pueda hacer un hombre. Quien se atreva a más es un insensato. Shakespeare 96 CAPITULO 4 LECCION DIEZ LAS ENZIMAS Y SU TECNOLOGÍA Introducción En la década de 1940, se inició el desarrollo de equipo apropiado para la producción a gran escala, conduciendo a la fabricación industrial eficiente y dando origen al uso entre otros, de enzimas puras en la industria de alimentos. Bajo esta perspectiva, los productores de proteína comenzaron a cultivar cepas de microorganismos especialmente seleccionados, y a hacer grandes progresos en la mejoras de eficiencia productiva, seguridad, calidad y espectro de productos disponibles (Madden, 2000). Así pues, la presente unidad permite aprender de las enzimas, aspectos tales como naturaleza, procedencia comercial, procesos de producción, cinética e inmovilización, los cuales permitirán entender su funcionamiento para posteriormente aplicarlas al procesamiento de alimentos y biomateriales. Objetivo Al terminar la unidad el profesional debe estar en capacidad de definir la naturaleza de los enzimas y sus diferentes aplicaciones, de describir los mecanismos de síntesis, extracción y purificación, así como de aplicar los conceptos de cinética, inmovilización y modificación enzimática a procesos industriales. Contenido Naturaleza química de las enzimas Procedencia comercial de las enzimas Producción de enzimas Cinética enzimática Inmovilización enzimática Aplicaciones industriales Bibliografía de apoyo Bibliografía Trabajo de complementación 97 Bibliografía recomendada 1. Finchman, J.R.S y Ravetz, J.R. Genetically Engineered Organisms: Benefits and Risks. Council for Science and Society/Open University Press, Milton Keynes. 1991. 2. Gacesa, Peter y Hubble, John. Tecnología de las enzimas. Editorial Acribia. Zaragoza. 1990. 3. Grebeshova, R.; Castellanos, Oscar; y Salcedo, L. Estudio de las propiedades catalíticas de las proteasa B. Subtilis. Revista Colombiana de Biotecnología. Santafé de Bogotá, D. C. Vol. 1; 1; Enero, 1998. pp 57 – 62. 4. Hagenimana, Vital; Vézina, Louis-P y Simard Ronald E. Sweetpotato α- and β-Amilases: Characterization and Kinetic Studies with Endogenous Inhibitors. Journal of Food Science. Volumen 59. No. 2. 1994. 5. Madden, Dean. Biotecnología de los Alimentos. Introducción. ILSI Europa. Bélgica. 2000. 6. Marquez Moreno, M. C. y Fernández Cuadrado, V. Los Hidrolizados Enzimáticos de Alimentos y su Aplicación en la Industria Alimentaria. Alimentación: Equipos y Tecnología. Año XI. No. 4. Mayo. 1992. 7. Nakano, Hirofumi. Recent Japanese Development in the enzymatic production and application of oligosaccharides. Japan International Cooperation Agency. 8. Organización Mundial de la Salud. Strategies for Assessing the Safety Foods Produced by Biotechnology. OMS. Ginebra. 1991. 9. Organization for Economic Cooperation and Development. Safety Evaluation of Foods Derived by Modern Biotechnology. Concepts and Principles. OECD. París. 1993. 10.Scragg. Biotecnología para Ingenieros. Sistemas Biológicos en Procesos Tecnológicos. Editorial Limusa, S. A. Grupo Noriega Editores. México. 1996. 98 TUS COMPROMISOS Para abordar el capítulo Hacer la ficha técnica de una enzima Copiar el artículo de Grebeshova, Castellanos y Salcedo relacionado en la bibliografía recomendada. Con el grupo Presentar la técnica para determinar experimentalmente las actividades catalíticas siguientes: • La actividad lipolítica • La actividad proteolítica • La actividad de la amilasa • La actividad de la pululanasa • La actividad de la glucoamilasa Para aprender a aprender • • • • • 99 Identificar el problema a resolver Informarse sobre como se resuelve Analizar las formas para resolverlo Decidir la mejor alternativa Aplicar la información adquirida para ejecutar la alternativa seleccionada NATURALEZA QUÍMICA DE LAS ENZIMAS Al mismo tiempo que crece la proteína por incorporación de sucesivos aminoácidos se multiplican las posibilidades de participar en interacciones intramoleculares. Estas interacciones se materializan con la formación de enlaces de hidrógeno que sirven de apoyo a las llamadas estructuras secundarias (formas α y β) y muy probablemente su generación tentativa sirve de germen a la estructura definitiva de la proteína. A continuación vienen las interacciones entre cadenas laterales de los residuos de aminoácidos, originando plegamiento de los diversos tramos de estructura secundaria hasta generar regiones autónomas de la molécula proteíca dotadas de una estructura supersecundaria característica, denominada dominio o centro de unión. Estas regiones son como proteínas globulares en miniatura que se construyen de acuerdo con principios generales de montaje (cuentan con un núcleo hidrofóbico, residuos polares expuestos al disolvente acuoso y una capacidad de unión específica con un determinado ligando). Dependiendo del tamaño de la cadena polipeptídica, pueden coexistir mayor o menor número de regiones autónomas que dotan la molécula de mayor o menor número de funciones y dan nacimiento a la estructura terciaria, donde se observan interacciones entre dominios, de las cuales depende la actividad biológica propia de la proteína. Un caso extremo de este aspecto lo constituyen las proteínas multifuncionales, que presentan numerosos dominios de unión y variadas actividades enzimáticas con sede en una misma cadena polipeptídica. Sin embargo, en la mayoría de los casos, se acumulan distintas funciones en la misma molécula proteíca utilizando un recurso distinto: se produce en la célula la agregación espontánea y altamente específica de varias cadenas polipeptídicas, cada una de las cuales aporta sus propios dominios con áreas de unión específicas que permiten el ensamblaje de subunidades y de cuyas interacciones depende la llamada estructura cuaternaria de la proteína. En otros casos, parece más probable que la trascendencia de la estructura cuaternaria derive de la estructura oligomérica ya que la gran mayoría de las proteínas con estructura cuaternaria son ologómeros (Cardenas, 1980). 100 PROCEDENCIA COMERCIAL DE LAS ENZIMAS Tradicionalmente se han obtenido pocas enzimas de origen animal debido a que éstas pueden ser reemplazadas por otras similares derivadas de microorganismos; pero aunque los sustitutos microbianos son catalíticamente eficaces presentan diferencias sutiles en sus propiedades. Las plantas también han sido fuente tradicional de un cierto número de enzimas, así del látex producido por la papaya o por la piña, se han aislado, sobre todo, cisteinproteasas. Como regla general, el látex se deja secar al sol o, si es necesario, puede incluso usarse como preparación enzimática cruda (González, 2000). Para ejemplificar lo anterior, enuncie dos enzimas de origen animal y dos de origen vegetal; en cada caso indique su aplicación Enzima Origen Aplicación Ahora visualice su mercado: ¿El empleo industrial de éstas enzimas está aumentando o disminuyendo? _______________________________________________________ ¿Por qué? _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ Sin embargo, los microorganismos producen una enorme gama de enzimas potencialmente útiles, muchas de las cuales son segregadas al exterior celular; además, son capaces de desarrollarse fácil y rápidamente en su medio de cultivo y la tecnología al respecto, a gran escala, se encuentra bien establecida (Gacesa et al., 1990). Complemente sus conocimientos indicando las enzimas que pueden extraerse de los diferentes microorganismos Microorganismo 101 Enzima Microorganismo Enzima Represente gráficamente las estructuras típicas de las paredes celulares de: a. Un hongo b. Una bacteria gram-positiva c. Una bacteria gram-negativa. Cuando la enzima ha sido segregada por un microorganismo, lo habitual es que pueda difundirse libremente a través de la pared celular. En el caso de hongos y bacterias gram-positivas, llega al medio externo o permanece asociada a estructuras de la pared celular. En las bacterias gram-negativas la secreción es más compleja debido a la presencia de una membrana externa, la cual retiene a menudo, en el espacio periplásmico, las enzimas segregadas en lugar de liberarlas al medio de cultivo (González, 2000). Enzimas extracelulares Son aquéllas que han cruzado la membrana celular o, en muchos casos se encuentran asociadas a ella y no liberadas al medio de cultivo, se obtienen por secreción co-translacional o mediante secreción y modificación posttranslacional, dependiendo de la naturaleza del microorganismo de donde provienen. En general, la membrana extra y la diferente localización de las proteínas ha restringido el uso de los microorganismos gram-negativos para la obtención de enzimas extracelulares; de hecho, la única enzima relevante producida por una bacteria gram-negativa es la pullulanasa, de la Klebsiella pulmoniae. A nivel industrial presentan las siguientes ventajas: 1. Dado que la molécula es segregada fuera de la célula, no se requieren técnicas de ruptura celular, difíciles de aplicar a gran escala. 102 2. El número de proteínas segregado es limitado y por eso es relativamente fácil aislar una enzima concreta a partir de la mezcla. 3. Las enzimas extracelulares suelen presentar una estructura más compacta y son menos susceptibles a la desnaturalización que las correspondientes intracelulares (Gacesa et al., 1990). Secreción co-translacional de las proteínas bacterianas Formación del complejo de iniciación ribosoma-ARNm Comienzo de la biosíntesis proteica ocurre antes de que el complejo (dirigido por el péptido señal N-terminal) se asocie a la membrana celular El péptido señal N-terminal dirige la ligadura del ribosoma a la membrana plasmática Separación del péptido señal mediante una proteinasa ligada a la membrana Terminación de la biosíntesis proteica Para asimilar lo aprendido, enuncie tres microorganismos que den origen a enzimas extracelulares e indique que enzimas se produce industrialmente a partir de ellos: _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ __________________________________ 103 Secreción co-translacional de las proteínas fúngicas y eucarióticas Formación del complejo de iniciación ribosoma-ARNm Comienzo de la biosíntesis proteica Introducción de la cadena peptídica en un lumen del retículo endoplasmático Procesamiento de la enzima a través del aparato de Golgi, dando origen a modificaciones translacionales Exportación de la enzima mediante vesículas hacia la membrana celular. Para confirmar lo aprendido: Enuncie y explique las diferencias existentes entre la secreción cotranslacional de las proteínas bacterianas y la de las proteínas fúngicas y eucarióticas _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ Explique que quiere decirse cuando se habla de modificaciones cotraduccionales y posttraduccionales de las proteínas _______________________________________________________ 104 _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ MODIFICACIÓN DE LAS ENZIMAS Modificaciones post-translacionales que pueden sufrir las enzimas eucariotas al atravesar el retículo endoplasmático y el aparato de Golgi: Glucosilación Formación de puentes disulfuro Adición de lípidos Sulfatación Recorte de cadenas glucosídicas laterales Glucosilación terminal Procesamiento proteolítico Concentración Descarga exocitósica 105 Estas modificaciones suelen tener influencia sobre la estabilidad y propiedades de la enzima. ¿Qué sustancias actúan como inhibidores en las síntesis de enzimas? _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ Enzimas intracelulares Defina las enzimas intracelulares: _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ Para ejemplificar lo anterior, enuncie tres microorganismos que den origen a enzimas intracelulares e indique que enzimas se produce industrialmente a partir de ellos: _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ La mayoría de las enzimas que son comercialmente importantes se producen a partir de un número limitado de microorganismos. Algunas pueden sintetizarse durante la fase de crecimiento activo (exponencial) del microorganismo, otras no aparecen sino hasta la fase estacionaria. Además, la presencia de un compuesto carbonado simple como la D-glucosa, puede reprimir dicha síntesis. Pero en cualquier caso, éstas enzimas pueden ser: 1. Constitutivas: están implicadas con aspectos centrales del metabolismo, se producen continuamente, al margen de la presencia o no del sustrato. 106 2. Inductivas: son sintetizadas en baja proporción hasta cuando el sustrato adecuado o un producto derivado de su degradación este disponible para inducir un incremento de la síntesis (González, 2000). Busque un artículo que describa la secreción de una enzima y preséntelo junto con un diagrama explicativo Sin embargo, es posible la incorporación de un gen animal o vegetal a un microorganismo, la transferencia de genes de enzimas procedentes de microorganismos patogénicos a huéspedes más aceptables (Gacesa et al., 1990) y la mutagénesis sitio-dirigida para producir enzimas modificadas (Horton et al., 1995). Mutagénesis sitio-dirigida Aislar el gen que codifica una enzima Secuenciar del gen Sintetizar la enzima en células bacterianas insertando el gen en un vector adecuado, por ejemplo en un virus Preparar el ADN con la secuencia de bases alterada para codificar una proteína modificada Comprobar que la bacteria sintetizó la enzima no modificada Infectar las bacterias con el nuevo ADN Aislar la proteína mutante Comprobar su estructura por cristalografía de rayos X para asegurar que la mutación no alteró su conformación 107 Probar la proteína mutante Purificar la enzima Fuente: Horton et al., 1995. LECCION DE ONCE PRODUCCIÓN DE ENZIMAS Se producen por lo general en fermentación sumergida aerobia convencional, proceso que presenta mayor control de las condiciones de crecimiento que la fermentación en estado sólido o semisólido propia de la producción de lactasa, α-amilasa, pectinasa y cuajo. Utiliza microorganismos productores de enzimas que cumplan con las siguientes propiedades: • Cepas no esporulantes ni formadoras de metabolitos tóxicos o inmunogénicos • Cepas fisiológicamente estables y fácilmente aceptadas por las autoridades encargadas de controlar los alimentos y fármacos • Cepas hiperproductoras de enzimas que pueden ser mutantes estables con centros represores inactivos, baja represión por catabolitos, retroinhibición o resistencia a la inhibición por producto final • Cepas que presenten facilidad y rapidez de crecimiento en fermentadores grandes con nutrientes sencillos y relativamente baratos que no necesiten de inductores • Cepas que den origen a productos fáciles de aislar, purificar y concentrar Tipo de microorganismo Aplicación Microorganismos marinos Bacteria patógena del ruibarbo isomaltulosa enzimas clorantes enzima Microorg. que crece a 250ºC en fuentes volcánicas enzimas estables al calor Microorg. del intestino del gusano que perfora la madera enzimas que degradan la celulosa y fijan nitrógeno Durante su producción se distinguen cuatro etapas: 108 productora de 1. Generación o producción: Fermentación en el caso de enzimas microbianas; producción agropecuaria o cultivo in vitro en el caso de enzimas de tejidos. 2. Recuperación: Separación, concentración, extracción. 3. Purificación: Varía según el tipo de catalizador enzimático que se use; puede incluir varias etapas o no existir. 4. Formulación: Acabado y normalización del producto enzimático. Enzimas extracelulares Fermentación Torta celular residual Separación Sólido-líquido Concentración A Purificación o Formulación Enzimas intracelulares Fermentación Torta celular residual Separación Sólido-líquido (Almacenamiento) Extracción Separación Sólido-líquido 109 Caldo gastado Tejido vegetal o animal Concentración A Purificación o formulación Generación de enzimas La célula microbiana puede ser visualizada como una compleja maquinaria que transforma los nutrientes a su disposición en masa celular, productos extracelulares (principalmente proteínas) y metabolitos terminales (CO2 y H2O en metabolismo aerobio), utilizando básicamente dos tipos de control: 1. Inducción: Consiste en que ciertas enzimas, denominadas inducibles, son sólo sintetizadas en respuesta a un estímulo ambiental (inductor). En este modelo se considera la existencia de un gen controlador que produce una proteína represora que, en ausencia del inductor, se ubicará en un lugar genético denominado gen operador, impidiendo el desplazamiento de la enzima ARN polimerasa desde su sitio de unión en el ADN (gen promotor) hacia los genes estructurales, impidiendo por tanto la transcripción y traducción de dichos genes. En presencia del inductor, la proteína represora será inactivada, impidiendo su unión al gen operador, permitiendo el desplazamiento de la ARN polimerasa hacia los genes estructurales y la transcripción y traducción subsecuente de dichos genes. 2. Represión catabólica: Permite a la célula diferenciar entre los distintos sustratos, reprimiendo la síntesis de aquellas enzimas involucradas en el catabolismo de sustratos más difícilmente asimilables. El mecanismo genético postulado propone que la asimilación de un sustrato rápidamente metabolizable (por ejemplo, glucosa) provocaría la disminución del contenido de AMP cíclico (regulando la actividad de la enzima adenilato ciclasa: ATP ------> AMP cíclico + PPi), el cual es requerido en el proceso de transcripción de los genes estructurales que codifican la síntesis de las enzimas. El AMP cíclico, el GMP cíclico u otro nucleótido polifosforilado actuaría como facilitador o modulador positivo a nivel de gen promotor, acomplejándose a una proteína receptora específica. Los controles metabólicos están orientados hacia el uso eficiente de los recursos para la propagación celular evitando la acumulación de metabolitos específicos; pueden obviarse mediante mutación, dando origen a cepas constitutivas que no requieran la adición de un inductor para sintetizar una determinada enzima, a cepas insensibles a la represión catabólica que puedan sintetizar la enzima en presencia de sustratos rápidamente metabolizables o también, a cepas con permeabilidad alterada que excreten al medio una enzima originalmente intracelular. 110 Para mayor comprensión, describa como actúa el represor lac en E. coli. _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ ______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ ______________________________________________________ Recuperación de enzimas En la recuperación de una enzima se engloban todas aquellas operaciones que van desde el proceso de síntesis por parte del organismo productor hasta la obtención de un preparado capaz de ser sometido a purificación o a formulación, de acuerdo con las exigencia del caso. Las operaciones de recuperación dependen de la localización celular de la enzima (extracelular o intracelular: periplásmica, citoplásmica o asociada a membranas). La extracción celular es crítica dentro del proceso de producción enzimática, no por la ausencia de sistemas eficientes de disrupción celular, sino porque las condiciones de extracción deben ser compatibles con la preservación de la actividad enzimática. A continuación se muestran los procedimientos más comunes para la lisis celular y la correspondiente extracción de enzimas: Procedimientos para lisis celular y extracción de enzimas: Tipo de enzima Extracelular liberada al medio Extracelular no liberada al medio Intracelular De tejidos animales 111 Tipo de lisis celular Método de extracción Centrifugación Requieren la destrucción parcial o total de la célula Disrupción mecánica Sonicación Tratamiento con detergentes Choque osmótico Homogenización del tejido en una solución tampón Centrifugación diferencial para seleccionar la adecuada De tejidos vegetales subfracción o el orgánulo apropiado La fuerza requerida desnaturaliza las enzimas deseadas. Contienen compuestos fenólicos que son oxidados enzimáticamente (polifenol oxidasas) por la presencia de oxígeno molecular formando productos que pueden inactivar rápidamente un número elevado de enzimas. Como se observa, los sistemas de extracción pueden clasificarse en: 1. Métodos físicos o mecánicos: Aquellos que producen fragmentación del envoltorio celular por aplicación de esfuerzos cortantes. Entre éstos están la presión, la homogenización, la molienda y la sonicación. 2. Métodos químicos o enzimáticos: Aquellos que producen digestión del envoltorio celular. Principales sistemas de disrupción celular y sus características: Método Presión Homogenización Molienda Sonicación Decompresión Congelacióndescongelación Digestión alcalina Digestión con solventes Autolisis enzimática Lisis enzimática exógena Principio de ruptura Compresión, esfuerzo de corte Esfuerzo de corte, cavitación Compresión, esfuerzo de corte Cavitación Explosión por decompresión Esfuerzo de corte Digestión pared celular Digestión membrana celular Digestión pared celular y ruptura osmótica Digestión pared celular y ruptura osmótica Aplicación a gran escala Poco probable Factible Factible Factible Poco probable Improbable Improbable Poco probable Factible Factible Separación sólido-líquido: La separación de las células del caldo gastado es el primer paso en la recuperación de la enzima, sea ésta extracelular o intracelular. 112 De las operaciones de separación sólido-líquido, la filtración y la centrifugación son las más empleadas, aunque ambas ofrecen dificultades debido al pequeño tamaño de las células, a su baja densidad y a su compresibilidad. La filtración es adecuada a la separación de microorganismos de morfología multicelular (hongos, actinomicetes); en estos casos la baja densidad del micelio puede hacer imposible la separación por centrifugación. El tipo de filtro recomendado en estos casos depende del tamaño de la operación: a escala piloto se utiliza el filtro de plato y marco; mientras que en escala industrial resulta más conveniente el uso de equipos continuos como el filtro rotatorio a vacío. En el caso de muchas enzimas hidrolíticas provenientes de microorganismos de morfología unicelular (levaduras y bacterias), la proteína se puede liberar en el medio de cultivo y debe separarse de las células mediante centrifugación siendo ésta la única etapa necesaria. Normalmente, es esencial que el medio de extracción tenga además del pH y la fuerza iónica adecuada, los estabilizadores apropiados, de tal forma que se genere un cierto grado de floculación (Gacesa et al., 1990). A nivel piloto se emplea de preferencia la centrifuga tubular y a escala industrial el equipo más empleado es la centrífuga de discos, operando en forma continua o semicontinua. Compuestos utilizados en los tampones de extracción: Tipo de estabilizante Adsorbentes Agentes quelantes Compuestos tiólicos Detergentes Inhibidores Sustratos Análogos sustrato 113 Ejemplo Polivinil pirrilidona EDTA Usos Fija compuestos reactivos, es útil para extractos vegetales. Quelantes catiónicos, particularmente de metales pesados. Ditiotreitol Protección frente a la oxidación de grupos lugares activos con sulfhidrílicos. Tween 20 Solubilización de proteínas unidas a membrana o disrupción de vesículas. EDTA o reactivos Inhibidores de enzimas degradantes alquilantes tales como proteasas y ciertas glicosidasas Sustratos Generalmente ayudan a estabilizar a la Inhibidores enzima frente a la inactivación térmica competitivos o frente a pH extremos. Una alternativa interesante a la filtración convencional, para la separación tanto de células como de fragmentos celulares en la recuperación de enzimas intracelulares es la filtración cruzada o tangencial, empleando membranas microporosas. Aquí la suspensión de células o fragmentos celulares es alimentada en forma tangencial a la membrana de separación, provocando un flujo de permeación perpendicular al flujo de alimentación. Poco después del inicio del proceso, el flujo cae desde el nivel correspondiente al obtenido para el agua pura, hasta un valor mucho menor que va descendiendo lentamente con el tiempo. Las causas de este descenso son: • Polarización por concentración: es decir, la acumulación de solutos retenidos reversiblemente cerca de la superficie de la membrana. • Los fenómenos de ensuciamiento: tales como la adsorción, el bloqueo de poros y la deposición de solutos solidificados que, a lo largo del tiempo, pueden ser procesos más o menos irreversibles (Torres et al., 1996). Para fundamentar sus conocimientos: Elabore un documento donde explique dos de los procesos de filtración por membranas: microfiltración y ultrafiltración _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ ______________________________________________________ Describa los diferentes tipos de membranas utilizados en procesos de microfiltración y ultrafiltración _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ Describa los procedimientos utilizados para caracterizar membranas poliméricas _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ 114 EJEMPLO DE FLOTACIÓN (Separación de proteínas) Ejemplo Cepa estable de Bacillus subtilis Conservada liofilizada a 4ºC Fermentar En erlenmeyer de 750 ml, con volumen efectivo = 50 ml Velocidad de agitación = 180 rpm T = 37ºC pH = 7,5 Tiempo = 48 h Centrifugar a 5000 g Sobrenadante Biomasa Concentrar el sobrenadante en un secador al vacío Tratar con etanol V del medio/V etanol = 1: 3,5 T = 4ºC Preparar sln enzimática al 1% Filtrar la sln enzimática Centrifugar la sln enzimática a 5000 g por 10 min. 115 Determinar la actividad catalítica Método de Anson modificado Fuente: Grebeshova et al., 1998. También se ha estudiado como alternativa para la separación de células de caldos fermentados, la flotación mediante inyección de aire o gas inerte con o sin adición de agentes de flotación, donde la separación eficiente de las células, requiere de tamaños de burbuja muy pequeños (del orden de 10 mm), lo que hace preciso un diseño muy cuidadoso del difusor. La extracción de proteína y la desnaturalización enzimática siguen determinados comportamientos cinéticos, de modo que si se dispone de modelos matemáticos que los describan, es posible optimizar el proceso de extracción. Purificación enzimática El extracto enzimático, contiene muchos otros componentes celulares, así por ejemplo, las células bacterianas lisadas liberan cantidades superiores de ácidos nucleicos, esto hace posible pensar que si una enzima presenta una elevada importancia, entonces, ella debería ser purificada hasta homogeneidad. Sin embargo, para muchos propósitos biotecnológicos esto no es necesario y una amplia variedad de procesos resultarían antieconómicos si la enzima fuese completamente pura. Para la mayoría de las aplicaciones probablemente es suficiente un menor grado de purificación aunque existan algunas actividades contaminantes que no afecten al sustrato(s), al producto(s) o a la enzima(s) involucrada en un proceso específico (Gacesa et al., 1990). A nivel laboratorio, un proceso de purificación está concebido como una secuencia de operaciones o etapas en las cuales los contaminantes (especialmente proteicos) van siendo subsecuentemente removidos aumentando la actividad específica de la enzima. Cada etapa de purificación significa, sin embargo, una pérdida de actividad enzimática, por lo que esta estrategia no es necesariamente adecuada al escalar un proceso de purificación a nivel productivo. Normalmente, es necesario para aislar cada una de las enzimas un proceso de purificación diferente: 1. Fraccionamiento con sulfato amónico: El método depende de la capacidad que presentan las concentraciones elevadas de sulfato amónico para captar las moléculas de agua presentes y así evitan de manera efectiva 116 2. 3. 4. 5. 6. 7. la solvatación de las proteínas. Tiene como ventaja que reduce el volumen de material. Dentro de sus desventajas esta que el sulfato amónico contiene trazas de metales pesados que pueden ser suficientes para inactivar a un enzima y que la preparación enzimática contiene una concentración elevada de sulfato amónico y normalmente esta sal debe eliminarse mediante diálisis, ultrafiltración o columnas de desalado antes de continuar con la siguiente etapa de la purificación. Fraccionamiento con solventes orgánicos: Utiliza acetona o alcoholes para precipitar las proteínas. Los solventes deben ser usados a temperaturas bajas (<0ºC), de otra manera la mayoría de las enzimas de desnaturalizan. Cromatografía de líquidos de alta resolución: La aplicación de la cromatografía líquida de alta resolución para la separación de proteínas todavía está en una fase experimental. Cromatografía de intercambio iónico: Las proteínas, como biomoléculas cargadas que son, se pueden retener e intercambiar con resinas de intercambio iónico (Díaz et al., 1999). Las proteínas se aplican a la columna bajo condiciones que faciliten al máximo las uniones y se eluyen selectivamente mediante cambios en las condiciones iónicas. Generalmente es mejor eluirlas utilizando un gradiente continuo que uno discontinuo. Cromatoenfoque: Las proteínas son eluidas de una columna de intercambiador iónico utilizando un amortiguador cuidadosamente seleccionado, y como el nombre del método lo indica un efecto de enfoque tiene lugar. En el cromatoenfoque la columna se equilibra con un tampón y después de la aplicación de la muestra, se utiliza un segundo, amortiguador de pH diferente para la elución. Cromatografía de filtración en gel: El método está basado en la capacidad de una molécula determinada para penetrar en los poros de las partículas del gel. Esta metodología puede permitir etapas de purificación en donde el porcentaje de recuperación de la actividad enzimática sea del 100%. Cromatografía de afinidad: Este método utiliza la interacción específica entre una enzima y un ligando adecuado inmovilizado como puede ser el propio sustrato, el producto, el coenzima o algún otro compuesto, por ejemplo, ciertos colorantes orgánicos. La cromatografía de afinidad funciona más adecuadamente cuando la constante de disociación para la interacción entre la solución ligando libre y enzima es del orden de 10-4 a 108 mol/l (González, 2000). Para la purificación a gran escala es importante considerar el factor de purificación (FP) y el rendimiento (R), además de los siguientes aspectos: 117 1. La liberación de enzimas intracelulares por medios mecánicos está bastante restringida al uso de molino de bolas y a homogenizadores. 2. La centrifugación de los materiales también presenta un problema en los procesos a gran escala. 3. Una alternativa a la centrifugación es la filtración de las muestras a través de filtros con diferentes matrices tales como Celita. 4. La diálisis y la concentración de soluciones diluidas en enzima son llevadas a cabo más adecuadamente empleando aparatos de ultrafiltración. 5. Un método que puede servir y ser de utilidad para la obtención y purificación de enzimas a gran escala es la extracción líquida en sistemas de fase acuosa. Generalmente, los sistemas de dos fases pueden ser producidos utilizando combinaciones diversas bien de polietilenglicol/fosfato potásico o de polietilenglicol/dextrano crudo. 6. Una alternativa a la cromatografía de columna es utilizar grupos de procesos en tanques de agitación (Gacesa et al., 1990). Formulación de preparados enzimáticos comerciales Acabado: Las operaciones de acabado tienen por objeto dar forma definitiva al producto enzimático y están orientadas a la preservación de la actividad durante el almacenamiento y la comercialización. Las enzimas se comercializan en estado líquido o sólido, por lo que las operaciones de acabado dependen del estado físico del producto. Entre ellas deben destacarse la desalinización, la esterilización, la concentración (y secado), la estabilización y el recubrimiento. Operaciones de acabado: 1. Desalinización: Puede efectuarse por diálisis, ultrafiltración o mediante resinas de intercambio iónico o exclusión molecular. 2. Esterilización: Se logra mediante filtración en filtros profundos de material fibroso, frecuentemente de tipo celulósico. 3. Concentración: La evaporación al vacío y la ultrafiltración son las más empleadas. 4. Secado: Similares a los empleados en la industria de alimentos y farmacéutica. Puede utilizarse la aspersión o la liofilización La enzima se estabiliza para el almacenaje y para la utilización, teniendo en cuenta que la estabilidad enzimática varía con el pH, la concentración del reactivo y la presencia de agentes desestabilizantes. Por lo tanto, una vez obtenido el preparado enzimático en su forma final, es necesario garantizar una vida útil que permita márgenes razonables de almacenamiento y tiempos 118 de distribución y consumo. Como regla, se espera obtener tiempos de vida media de almacenamiento superiores a un año. A fin de lograr este propósito, es práctica usual la adición de preservantes. Estabilización para la utilización: Las enzimas estables se encuentran generalmente en organismos adaptados a vivir en condiciones hostiles, por lo tanto son éstos los microorganismos más adecuados para su síntesis. No obstante hay dos formas generales para la preparación de enzimas estabilizadas: la modificación de la enzima mediante ingeniería genética o mediante reacciones químicas. Una de las reacciones químicas es el entrecruzamiento de la enzima original. Mediante éste método es posible introducir enlaces covalentes en la molécula de proteína, la cual estabiliza la conformación activa. Se ha encontrado que in vitro el entrecruzamiento de las moléculas de enzima generalmente incrementa su estabilidad y uno de los reactivos de entrecruzamiento efectivo y más ampliamente usado es el glutardialdehído. Sin embargo, el entrecruzamiento de las moléculas de enzima a través de sus cadenas laterales de aminoácidos, varias de las cuales juegan un papel en la catálisis o en el mantenimiento de una conformación activa enzimáticamente, frecuentemente origina pérdidas significativas de la actividad enzimática (Cesi et al., 1993), así, en muchos casos la concentración de reactivo influye significativamente en la estabilidad enzimática o restringe la elección de las condiciones y la configuración del reactor. Por ejemplo, la utilización de bajas concentraciones de agentes quelantes puede ser adecuada en unos casos, pero otros estos aditivos son inaceptables por razones de salud y seguridad. Para visualizar la naturaleza química y la función estabilizadora de los diferentes agentes estabilizantes, complete el siguiente cuadro: Agentes de estabilización: TIPO DE AGENTE UTILIZADO NATURALEZA Preservantes de la configuración activa de Sales la molécula enzimática Proteínas inertes Polímeros Azúcares Glicoles Preservantes que impiden el deterioro por Sales agentes microbianos Inhibidores reversibles 119 EJEMPLOS NaCl o (NH4)2SO4 Albúmina Polivinil alcohol Polivinil pirrolidona Polietilenglicol CMC Sacarosa Glicerol Sorbato Benzoato Sales de amonio cuaternario Cofactores Reactivos sulfhidrilos Agentes quelantes La formulación de preparados enzimáticos en forma sólida tiene ventajas desde el punto de vista del empaquetado y transporte, ya que el producto es con frecuencia más estable. Sin embargo, sus principales desventajas son de tipo sanitario y toxicológico, puesto que la formación de aerosoles, durante su producción o uso, puede causar severos problemas alérgicos, especialmente en personas sensibilizadas. Estabilización para el almacenaje: La mayoría de las enzimas han demostrado ser moderadamente estables en el intervalo de 0 - 4ºC, al igual que en presencia de estabilizantes como glicoles, compuestos sulfhidrilo, polímeros orgánicos, antioxidantes y agentes quelantes. Normalización: En el producto enzimático se debe al menos indicar su actividad específica (por unidad de peso o volumen de preparado) y estabilidad de almacenamiento. A fin de elaborar el producto con una actividad específica invariable, el preparado enzimático debe ser diluido con material inerte hasta su valor de comercialización. Es usual que se empleen los mismos conservantes para normalizar. CINÉTICA ENZIMÁTICA Al estudiar la aplicabilidad comercial de un catalizador enzimático deben tenerse en cuenta los siguientes aspectos: 1. La actividad catalítica: Velocidad de reacción 2. La constante de equilibrio: Extensión de la reacción 3. La estabilidad: Duración de la actividad catalítica Velocidad de reacción Enzima + Reactante <=====> Complejo ---------> Enzima + Producto [E] [R] [ER] [E] [P] El aumento de la velocidad se atribuye al descenso de la energía de activación de la reacción. La etapa de formación del complejo es considerablemente reversible, ya que el complejo tiene un estado energético semejante a la mezcla enzima-reactante. La rotura subsiguiente del complejo para rendir los productos se considera exotérmica, esta etapa puede ser prácticamente irreversible en muchos casos (Gacesa et al., 1990). 120 Para poder entender, escriba la ecuación de Michaelis - Menten y explique cada uno de sus términos: Para predecir el comportamiento de un sistema enzimático es necesario determinar Vmáx y Km para una enzima en particular y Km? ¿Cómo pueden determinarse Vmáx ___________________________________________________________ ________________________________________________________________ ________________________________________________________________ ________________________________________________________________ ________________________________________________________________ ________________________________________________________________ ________________________________________________________________ ________________________________________________________________ Escriba la ecuación de Lineweaver-Burk e indique cada uno de sus términos: ¿Para qué sirve? ______________________________________________________ ________________________________________________________________ ________________________________________________________________ ________________________________________________________________ ________________________________________________________________ ________________________________________________________________ La reacción puede ser efectuada en presencia de inhibidores capaces de combinarse con la enzima y formar un complejo inactivo. 121 Inhibición acompetitiva: Cuando una concentración de reactante elevada conduce a la unión de una segunda molécula a la enzima. Inhibición por producto: Es frecuente que la molécula inhibidora sea similar en estructura al reactante para competir con él por el sitio activo de la enzima. Escriba la expresión de velocidad para un sistema con inhibición acompetitiva e indique cada uno de sus términos: Escriba la expresión de velocidad para un sistema de inhibición por producto e indique cada uno de sus términos: Describa el procedimiento que usted realizaría para determinar las constantes de inhibición para cada uno de los casos estudiados: ________________________________________________________________ ________________________________________________________________ ________________________________________________________________ ________________________________________________________________ ________________________________________________________________ ________________________________________________________________ ________________________________________________________________ 122 LECCION DOCE EFECTOS DE LA TEMPERATURA Y PH EN REACCIONES ENZIMÁTICAS La ecuación de Michaelis-Menten muestra que la velocidad de una reacción enzimática es k2[ER] Por lo tanto, la velocidad de la reacción dependerá de la concentración de [ER] y el valor de k2. En un esquema simplificado, la variación de la velocidad de la reacción enzimática con la temperatura puede ser descrita en términos de cambios en el valor de k2. Como en las reacciones químicas sencillas, ésta puede ser descrita por la relación de Arrhenius. Para fijar bases, escriba la relación de Arrhenius y explique cada uno de sus términos: Determinación de la termoestabilidad de las enzimas Incubación de la solución enzimática Rango de T = 20 - 60ºC con intervalo de 10ºC Tiempo = 24 h con toma de muestras cada hora Determinar la actividad enzimática Determinación de la estabilidad al pH Incubación de la solución enzimática Rango de pH = 6,0 - 11,0 Tiempo = 24 h con toma de muestras cada hora 123 Determinar la actividad enzimática INMOVILIZACIÓN ENZIMÁTICA Cuando una enzima es inmovilizada los procesos pueden operar en continuo y ser controlados fácilmente, las enzimas pueden reutilizarse, los productos se separan con facilidad, se minimizan los problemas de manejo de efluentes y de materias primas y, en muchos casos, las propiedades de las enzimas (actividad y estabilidad) pueden ser alteradas favorablemente (Berrueta et al., 1992) como resultado del acoplamiento a un soporte insoluble, de la coinmovilización sobre residuos químicos específicos o del uso de ingeniería proteica. Ahora bien, cada vez que una enzima es inmovilizada la actividad de la preparación es siempre diferente a la de la forma natural debido a: 1. Efectos conformacionales: Ocurren cuando hay perturbaciones estructurales de la proteína y/o limitación del acceso del reactivo al centro activo de la enzima 2. Efectos de partición: Ocurren cuando hay interacciones electrostáticas o hidrofóbicas, y dependiendo del componente indicado, los efectos de partición pueden intensificar o rebajar la velocidad de la reacción observada. 3. Efectos difusionales o de transferencia de masa: Pueden ser internos o externos. La resistencia externa proviene de la presencia de una película de líquido inmóvil alrededor de la partícula de enzima inmovilizada, la cual permite que la velocidad de conversión catalítica sobrepase la velocidad de difusión del reactivo en esta capa, que la concentración de reactivo en la superficie sea más baja que en la solución y que el espesor de la capa inmóvil esté correlacionado con las propiedades de flujo de la solución alrededor de la partícula. La resistencia interna a la transferencia de masa surge cuando las enzimas quedan atrapadas en polímeros, entonces, la velocidad de reacción puede eliminar más rápido el reactivo de lo que se difunde a través del gel (Gacesa et al., 1990). Los métodos comunes de inmovilización de enzimas son: 1. Adsorción: Las enzimas pueden ser adsorbidas sobre la superficie de un soporte. 2. Unión covalente: La unión covalente de enzimas solubles a un soporte insoluble es el método más común para la inmovilización de enzimas habiéndose utilizado una amplia gama de técnicas y soportes para este propósito. 124 3. Atrapamiento: En este caso la enzima permanece en un estado sin modificar, pero es atrapada en una gotita de disolvente dentro de una matriz polimérica. Puede atraparse en microcápsulas, mediante reticulación o por entrecruzamiento. APLICACIONES INDUSTRIALES Además de su aplicación en las industrias de alimentos, detergentes, cueros, textiles, manufactura del papel, antibióticos y cefalosporinas, las enzimas se utilizan para análisis clínico, usos médicos, catálisis en química orgánica, síntesis de compuestos radiactivos, análisis de ADN, procesado bioquímico, producción de ácidos orgánicos y aminoácidos, extracción de productos naturales, procesado de proteínas, así como en la elaboración de saborizantes y aromatizantes (Cheetham, 19??). Análisis clínicos Las enzimas se aceptan como reactivos estándar en los laboratorios de bioquímica para el diagnóstico de enfermedades, para el control y seguimiento de una enfermedad y de la respuesta de los pacientes a la terapia, y para la identificación y control de la concentración de drogas o sus metabolitos en la sangre o en otros fluidos corporales. Las técnicas enzimáticas también se utilizan en la detección de drogas, análisis de antibióticos, detección de antígenos o anticuerpos, o en la detección de enzimas y metabolitos en los fluidos intracelulares, y son usualmente más rápidas que el inmunoanálisis, más específicas que los análisis fotométricos y más baratas que los cromatográficos o los inmunoanálisis con sustancias radiomarcadas (Cheetham, 19??). Para visualizar el procedimiento, describa mediante un diagrama de bloques el procedimiento que seguiría durante la elaboración de una prueba de ELISA 125 Tratamientos terapéuticos con enzimas Hasta el momento más de ciento cincuenta enfermedades metabólicas se han atribuido a defectos enzimáticos específicos. En muchos de ellos la alteración se debe a la falta total de la enzima, mientras que, en otros, la causa es su sustitución por una isoenzima relativamente inactiva. En teoría, y una vez conocido el defecto, debería ser posible administrar la enzima “ausente” al paciente y aliviar o eliminar los síntomas de la alteración. Sin embargo, en la práctica hay lesiones, particularmente el desarrollo del cerebro, que son irreversibles. No obstante, existe un grupo significativo de enfermedades que responderían a la terapia enzimática. El fundamento de esta forma de terapia es simplemente la administración de una enzima concreta a un paciente, esperando con optimismo que se produzca una progresiva mejoría en el mismo. Otra forma de utilizar las enzimas desde el punto de vista tratamiento terapéutico es para sustituir algunas funciones del riñón y el hígado, pues con ellas se han desarrollado órganos artificiales (Gacesa et al., 1990). Para complementar, dé dos ejemplos de enzimas que se usen para tratamientos terapéuticos: 1. _____________________________________________________ _______________ 2. _____________________________________________________ _______________ Sensores basados en enzimas Una de las primeras áreas de aplicación de las enzimas fue en el campo del análisis, en él, existen un cierto número de ensayos químicos colorimétricos que implican una etapa previa de transformación enzimática. El procedimiento más sencillo consiste en usar una enzima adecuada para convertir un compuesto que no puede ser detectado fácilmente en un producto o subproducto que sí lo es. Aunque existen muchos casos en los que esto no puede lograrse en una sola reacción, es posible encadenar una secuencia de reacciones de tal forma que el producto de la última reacción si puede ser medido (Gacesa et al., 1990). Ahora bien, para el control de procesos de fabricación de alimentos y para la evaluación de la calidad de los productos, la determinación de compuestos orgánicos y de algunos iones inorgánicos es importante y el uso de sensores enzimáticos que midan directamente dichos compuestos es la mejor respuesta. Estos sistemas presentan ventajas respecto a los métodos tradicionales de 126 análisis, debidas a las propiedades de las enzimas (sensibilidad, selectividad, especificidad, etc.) y están disponibles en el mercado en kits de enzimas solubles o de electrodos enzimáticos que permiten el análisis simple, rápido y fiable de un gran número de componentes de los alimentos, incluyendo casos cuya determinación por métodos convencionales sería difícil, si no imposible. Así, por ejemplo, las muestras a analizar no requieren tratamientos de separación de compuestos, ya que las reacciones de detección son posibles sin ninguna interferencia en presencia de componentes afines (Berrueta et al., 1992). Aplicaciones en la industria química La aplicación más conocida de las enzimas es la producción de agentes enzimáticos para el lavado (detergentes “biológicos”). En ellos, se utilizan proteasas para hidrolizar las manchas proteicas provenientes de hierba, sangre, huevo y sudor humano; lipasas para eliminar las manchas grasas; amilasas para eliminar residuos de alimentos ricos en almidón, así como celulasas para intensificar el color y eliminar partículas de suciedad que se encuentren atrapadas entre la red de microfibrillas. Además, existen diversas aplicaciones en la industria textil (desencolar, proporcionar un aspecto suave y brillante a la tela (biopolishing), dar a prendas informales el aspecto de gastado o bien neutralizar el agente blanqueante (H2O2) con catalasa para producir menos volumen de aguas residuales), en la papelera (para eliminar lignina de la pasta Kraft, haciéndola más propensa a los agentes de blanqueo químicos; para reducir el consumo de resina depositable sobre los rodillos y demás partes del equipo mediante degradación de los triacilglicéridos propios de la pasta o para modificar los almidones utilizados en el estucado del papel) y en la del cuero, durante las operaciones de rendido, remojo, depilado y desengrase (Novo Nordisk, 1988). Aplicaciones en la industria alimentaria Las industrias alimentarias constituyen hoy en día el más amplio campo de aplicación de los procesos enzimáticos, a excepción del uso de proteasas alcalinas, en la industria de los detergentes. Las razones más importantes para su utilización son los efectos fisicoquímicos u organolépticos de su acción sobre los alimentos: • • • • • Disminución de la viscosidad Mejora de la filtrabilidad Disminución de la tendencia a la cristalización Clarificación y estabilización de líquidos con vistas a su conservación Mejora de la fermentabilidad 127 • • • • • Mejora de la estabilidad bacteriológica Corrección de las deficiencias enzimáticas de origen natural Mejora de la digestibilidad Mejora de la textura y las características organolépticas Aumento del poder edulcorante (Berrueta et al., 1992). En este momento el principal usuario a nivel mundial, de las enzimas, es la industria del almidón, especialmente debido al éxito del proceso de obtención de jarabes de glucosa con el sistema α-amilasa/amiloglucosidasa; éxito que continuo con la utilización de glucosa isomerasa inmovilizada para la producción de los jarabes ricos en fructosa; sin embargo, pese al gran desarrollo internacional, Colombia apenas inicia su exploración. Casos similares se observan en el uso de enzimas como antioxidantes (glucosa oxidasa, superóxido dismutasa, catalasa, glutatión peroxidasa y colesterol oxidasa), las cuales evitan la oxidación espontánea de los alimentos por el oxígeno atmosférico o disuelto, o bien, en el uso de enzimas para preparados proteicos, donde se utilizan ampliamente para incrementar el valor y la disponibilidad de las proteínas. Sin embargo es importante mencionar que industrias de procesado de pulpas de fruta, cerveza, vinos, fermentaciones alcohólicas, lácteos, panadería y refinación de azúcar, actualmente presentan un mercado interesante para el país (González et al., 2000). Función que cumplen las diferentes enzimas en la industria de alimentos: Producto Aceite Enzima Celulasa y pectinasa Alginatos Celulasas Carne tierna Papaína o bromelina Cerveza Proteasas microbianas Amilasas Edulcorantes Amilasas Glucoamilasas Celulasas 128 Función Hidrolizan la celulosa y la pectina. ⇒ aumentan el rendimiento durante la extracción. Rompen el tejido de la pared celular de las algas marinas. ⇒ aumentan la extracción de alginato. Hidrólisis de proteínas. ⇒ ablandan la carne y sirve para elaborar salsas. Hidrólisis de proteínas solubles. ⇒ evitan la opacidad de la cerveza durante el enfriamiento. Rompe el almidón hasta azúcares solubles. ⇒ aumentan la producción de alcohol. Rompen los enlaces α-(1,4) internos del almidón. ⇒ producen dextrinas. Rompen los enlaces α-(1,4) externos del almidón. ⇒ producen glucosa. Rompen los enlaces β-(1,4) internos de la celulosa. ⇒ producen glucosa. Hidrolizan la celulosa ⇒ liberan azúcar fermentable y productos nitrogenados. Frutas Celulasas Están implicadas en la solubilización de las frutas. También se emplean en algunos procesos relacionados como la extracción de pigmentos y pectinas presentes en la piel de la fruta. Hidrolizan el gluten de la masa Pan Proteinasas ⇒ controlan la viscosidad durante la manipulación e incrementan la textura y apariencia final. Amilasas Rompen los almidones liberando azúcares reductores ⇒ Promociona las reacciones de Maillard. Productos no Proteinasas Hidrólisis de la gelatina. gelificados ⇒ evita la gelificación posterior de los productos. Queso Quimosina Precipita la caseína. Lipasas Hidrolizan el componente graso lácteo, proporcionando cambios característicos en el sabor. ⇒ se acelera la maduración de los quesos. Vinos y Pectinasas y Reducen la viscosidad o liberan pulpa Zumos de amilasas ⇒ mejoran la clarificación y filtrabilidad. frutas aumentan la productividad. 1 Ensilado: Es un producto para alimentación animal que se obtiene de la fermentación de la hierba. Ensilado1 Celulasas Además, la hidrólisis enzimática presenta indudables ventajas frente a la tradicional hidrólisis química, ácida o alcalina, entre las que cabe mencionar las siguientes: 1. Selectividad: las enzimas son específicas para un tipo determinado de enlace y, por tanto, no es frecuente la aparición de productos de degradación. En cambio, la poca selectividad de los ataques ácido y básico y su difícil control conduce inevitablemente a la aparición de productos de degradación que pueden llegar a ser tóxicos. 2. Condiciones moderadas de temperatura y pH: la hidrólisis enzimática transcurre a temperaturas próximas a la ambiente, generalmente en el intervalo de 40 a 60ºC, y pH comprendido entre 4 - 8. 3. No se añaden sustancias extrañas: salvo la enzima. Evidentemente no es así en los procesos de hidrólisis química, ya que la necesaria neutralización posterior eleva considerablemente el contenido en sales. 4. Se mantiene el valor nutritivo: ya que no se produce degradación de los componentes separados, mientras que en la hidrólisis alcalina de proteínas se suelen destruir los aminoácidos arginina y cisteína y en la 129 hidrólisis ácida se destruye el triptófano, que es un aminoácido esencial para el hombre. No obstante, en la hidrólisis enzimática es necesario separar o desnaturalizar la enzima, sobre todo en el caso de las proteasas, y trabajar en condiciones asépticas, ya que por ser un proceso relativamente lento, puede producirse contaminación microbiana de la mezcla reaccionante. Sin embargo, la desnaturalización térmica de las enzimas o su separación por ultrafiltración son temas resueltos por la tecnología actual y la necesidad de asepsia es una característica general de la industria alimentaria (Camacho et al., 1992). Tratamiento de los residuos La creciente conciencia medioambiental ha llevado consigo una intensificación de la investigación sobre tecnologías alternativas limpias. Muchos creen que la tecnología enzimática podrá facilitar algunas de estas alternativas, reemplazando gradualmente procesos industriales químicos. Esta tendencia ya es clara. Un ejemplo es el procesado de almidón donde las enzimas han sustituido casi completamente los ácidos agresivos y las altas temperaturas utilizadas para degradar el almidón (Novo Nordisk, 1988). De otro lado, existen numerosas industrias de procesamiento de alimentos que generan residuos poliméricos complejos, mismos que deben ser tratados para incrementar su posterior degradación microbiológica. Actividad industrial Material de residuo Enzima a utilizar Pan, harina Papel, madera Matadero, carnicería, vaquería, aves de corral, cuero, gelatina Matadero, carnicería almidón Celulosa Proteínas α-amilasa Celulasa Proteasas Grasas Aves de corral, vaquería, procesamiento de pescado, procesamiento de semillas, alimentos con cereales, compuestos alimentarios terminados Industrias cuyos efluentes Aceites Lipasas asociadas con cultivos bacterianos para eliminar los depósitos de grasa procedentes de las paredes de las tuberías que transportan el efluente Lipasas Fenoles y aminas Peroxidasa 130 presentan fenoles y aminas aromáticas aromáticas Así por ejemplo, las semillas de uvas constituyen un importante subproducto de la vinificación y de las industrias alcoholeras (2-4% del peso total de las uvas), tienen un aprovechamiento posterior muy bajo en la elaboración de abonos, sin embargo la mayor parte de ellas son quemadas, pese a presentar un alto contenido de proteína y de aceite. La proteína, aunque deficitaria en aminoácidos azufrados y lisina, contiene todos los aminoácidos esenciales. El aceite presenta propiedades como elevado contenido de ádico linoleico, ácido graso esencial en la dieta humana; ausencia de linolénico que le confiere alta estabilidad, favorecida aun más por la presencia de tocoferol, que lo protege de la oxidación; bajo contenido en ácidos grasos saturados; una digestibilidad similar a la del aceite de oliva crudo y menos calorías que el aceite de semilla convencional. Todas estas propiedades, junto con su agradable olor y sabor, lo hacen adecuado para consumo crudo en alimentación. Debido a su color claro y limpio se utiliza también para corregir el color de aceites de otras semillas. Ahora bien, dado que la pepita de uva no es una oleaginosa típica, su preparación es fundamental y precisa de un grado de molturación mayor que otras oleaginosas como soja o girasol, debido al elevado grosor y dureza de la cubierta. Así, las etapas empleadas para la obtención del aceite por el procedimiento convencional consisten en clasificar la materia prima procedente de las bodegas o destilerías, separando el bagazo de los granos de uva por un proceso de lavado, secado y tamizado. La extracción del aceite puede hacerse por los métodos clásicos o bien utilizando enzimas; con este último método se aumenta sensiblemente el rendimiento de extracción y el ataque enzimático separa de las paredes celulares el aceite de las proteínas, eliminando sustancias no deseadas y evitando el uso de temperaturas altas. Por tanto, además del aceite se extrae como en los procesos convencionales, una harina comestible rica en proteínas o si se concentra, un producto proteico más puro (Rodríguez et al., 1997). BIBLIOGRAFÍA DE APOYO 1. Barfoed, H. C. Production of Enzimas by Fermentation. Essays in Applied Microbiology. J. Willey and Sons. London. 1981. 2. Gil, M. J.; Callejo, M. J.; Rodríguez, G. y Ruiz, M. V. Influencia de las Enzimas en la Firmeza y Elasticidad del Pan de Molde Durante su Conservación. Alimentación, Equipos y Tecnología. Noviembre. 1998. 3. González Tello, P.; Camacho Rubio, F. y Robles Medina, A. Hidrolizados Enzimáticos de Interés en la IAA. (I) Hidrolizados de Cereales. Alimentación, Equipos y Tecnología. VIII. 3. 1989. 131 4. Hornby, W. E. y Goldstein, L. Inmobization of Enzymes on Nylon. Methods Enzymol., 44: 118 - 134. 1976. 5. Howell, J.A.; Velicangil, O.; Le, M. S. y Herrera Zeppelin, A. L. Ultrafiltration of Protein Solutions. Annals New York Academy of Science. 1981. 6. Katoh, S. y Terashima, M. Purification of Secret α-amylases by Immunoaffinity Chromatography with Cross-reactive Antibody. Appl. Microbiol. Biotechnolo. 42: 36-39. 1994. 7. Krautwurst, Hans; Encinas, María Victoria; Marcus, Frank; Latshaw, Steven; Kemp, Robert; Frey, Perry; Cardemil, Emilio. Saccharomyces cerevisiae Phosphoenolpyruvate Carboxykinase: Revised Amino Acid Sequence, SiteDirected Mutagenesis, and Microenvironment Characteristics of Cysteines 365 and 458. Biochemistry, 34: 6382-6388. 1995. 8. Levapan. Las Enzimas en Panadería. Revista Pan Caliente. Levapan. No. 44: 16 -18 Marzo. 1998. 9. Lewis, C. y Kristiansen, B. Chemicals manufacture via biotechnology. 1985. 10.Nakano, Hirofumi. Recent Japanese Development in the Enzymatic Production and Application of Oligosaccharides. Japan International Cooperation Agency. Osaka Municipal Technical Research Institute. 11.Pifferi, P.G. y Preziuso, M. Immobilization of endo-poligalacturonase on γalumina for the treatment of fruit juice. Lebensm. Wiss. Technol. 20: 137142. 1987. 12.Pinzón, Gerardo. Aplicación de la Enzima Glucosa-oxidasa en la industria de alimentos. Alimentaria. 7. 36. 1993. 13.Waterfield, M. D. Separation of mixtures of proteins and peptides by high performance liguid chromatography, in Practical Protein Chemistry. De. Darbee. Wiley & Sons. 1986. 14.Wrolstad, Ronald; Wightman, Jolynne and Durst, Robert. Glycosidase Activity of Enzyme Preparations Used in Fruit Juice Processing. Food Technology. November. 1994. BIBLIOGRAFÍA 1. Berrueta, J.; Labajos, B. y Coca, J. Utilización de enzimas en las industrias alimentarias. Alimentación, Equipos y Tecnología. XI, 10, 1992. 2. Camacho Rubio, F.; González Tello, P.; Márquez Moreno, M.C. y Guadix Escobar, E. M. Hidrolizados enzimáticos de interés en la I.A.A. (II) Hidrolizados enzimáticos de proteínas. Alimentación, Equipos y Tecnología. XI. 10. 1992. 3. Cardenas, Eduardo. Enzimas Alostéricos. Libros de Investigación y Ciencia. 1980. 4. Cesi, V.; Kozulic, B. y Barbaric, S. A Process for Satabilization of Glycopropeins. Stability and Stabilization of Enzymes Proceedings of an International Symposium held in Maastricht. 1993. 132 5. Cheetman, Peter. Aplicación de los enzimas en la industria. Tate & Lyle. Grupo de investigación y desarrollo, Philip Lyle. Memorial Research Laboratory. Inglaterra. 6. Díaz, M. y Rendueles, M. Separación en columna por cromatografía de intercambio iónico en la industria alimentaria. Equilibrio, cinética y bases de diseño. Alimentación, equipos y tecnología. Editorial Alción, S. A. Año XVIII. No. 7. Septiembre. 1999. 7. Gacesa, Peter y Hubble John. Tecnología de las Enzimas. Editorial Acribia, S. A. Zaragoza. 1990. 8. González, Gloria. Biotecnología. UNAD. 2000. 9. Grebeshova, R.; Castellanos, O. y Salcedo, L. Estudio de las Propiedades Revista Colombiana de Catalíticas de las Proteasas Bacillus subtilis. Biotecnología. Santafé de Bogotá, D. C. Vol 1. No. 1. Enero. 1998. 10.Horton, Robert; Moran, Laurence; Ochs, Raymond; Rawn, David y Scrimgeour, Gray. Bioquímica. Prentice-Hall Hispanoamericana, S.A. México. 1995. 11.Novo Nordisk. Aplicaciones Industriales de las Enzimas. Novo Nordisk. 1988. 12.Rodríguez Llopis, Mª. I.; Acilu, M. y Aldamiz-Echebarria, P. Aplicación de Enzimas en la Industria Enológica. Alimentación, Equipos y Tecnología. Editorial Alción, S. A. Diciembre. 1997. 13.Torres, M. R.; Ramos, A. J. y Soriano, E. Ultrafiltraciones de Disoluciones Proteicas. Causas del Descenso del Flujo. Alimentación, Equipos y Tecnología. Editorial Alción, S. A. Año XV. No. 10. Diciembre. 1996. TRABAJO DE COMPLEMENTACIÓN 1. Consiga la ficha técnica de una enzima comercial e indique, nombre común, sinónimos, organismos de donde proviene, especificaciones del producto, condiciones de almacenamiento, condiciones de seguridad, precauciones de manejo, comportamiento de la enzima frente a la temperatura y al pH, inhibidores, aplicaciones. 2. De la gran variedad de enzimas disponibles, seleccione una que sea de interés para usted, de las usadas en la industria de alimentos (procesamiento de alimentos) y realice la revisión bibliográfica correspondiente, elaborando un documento donde muestre fuente, clasificación, estructura, procesos de obtención industrial (si los tiene), presentación, tipo de reacción que cataliza, forma de acción sobre el sustrato, productos que origina y aplicaciones. 3. Teniendo en cuenta que en el proceso de elaboración de una masa, la actividad enzimática se inicia tan pronto como se añade el agua a la harina: a.- Esquematice mediante una reacción actividad 133 amilolítica. b.- Describa el efecto de la dextrina y el almidón roto en el desarrollo de la masa. c.- Explique los efectos de la producción de maltosa en la fermentación de la masa. d.- Estudie el comportamiento de la actividad amilolítica durante el proceso de cocción. 4. Discuta la siguiente afirmación: “El enzima parcialmente purificado (después de la cromatografía de interacción hidrofóbica sobre Phenyl Sepharose) ha sido inmovilizado covalentemente sobre Nylon 6 (Portex Ltd., Hythe, Kent, Reino Unido) según el método descrito por Hornby & Goldstein (1976). El soporte se activa por hidrólisis controlada con HCl y los grupos NH2 liberados del nylon se acoplan a la enzima a través de reactivos bifuncionales como el glutaraldehído”. 5. En la actualidad se puede obtener quimosina pura para la fabricación de queso a partir de levaduras modificadas genéticamente, explique cómo. 134 LECCION TRECE Y que yo jamás me olvide de que la lucha por un mundo mejor es una lucha de amor. Michel Quoist LOS MICROORGANISMOS Teniendo en cuenta que Louis Pasteur en 1872 sentó las bases de la microbiología e identificó a los microorganismos como responsables de cambios tanto deseables como indeseables en los alimentos y que desde entonces, se han catalogado más de 3500 alimentos tradicionales fermentados cuyo procesamiento y preservación ha sido más segura y confiable (Madden, 2000) TEMATICA 1. Los microorganismos y su tecnología 2. Tecnología de fermentación 135 1. TERMODINÁMICA DEL CRECIMIENTO MICROBIANO Sistema termodinámico: Una reacción química, una célula o un organismo completo. Entorno del sistema: Todo aquello que no sea parte del sistema definido. La primera ley de la termodinámica establece que la energía del universo, esto es, el sistema más su entorno, es constante. Dentro de un sistema dado son posibles cambios netos de energía, así: 1. La energía absorbida en la reacción directa es exactamente igual a la energía liberada en la reacción inversa. 2. El cambio de energía interna del sistema, ∆E, antes y después del proceso se puede expresar como: ∆E = q - w donde q se define como el calor que el sistema absorbe de su entorno y w se define como el trabajo hecho por el sistema sobre su entorno. En términos matemáticos, el trabajo se puede definir como: w = P∆V + w’ donde P es igual a la presión, ∆V es el cambio en el volumen que tiene lugar durante el proceso y w’ representa el trabajo diferente al trabajo de presión-volumen. Para la mayor parte de estas reacciones, w’ = 0. Dada esta restricción, al sustituir la segunda ecuación en la primera y reacomodando se tiene: qp = ∆E + P∆V donde qp es el calor absorbido a una presión constante. Como cualquier combinación de las funciones de estado debe ser también una función de estado, qp es por consiguiente una función de estado, que se denomina el cambio de entalpía (∆H): ∆H = ∆E + P∆V. En los sistemas biológicos, el volumen permanece prácticamente constante. Así, ∆H y ∆E son equivalentes efectivamente. Proceso exotérmico: Proceso en el cual el sistema desprende calor y ese calor pasa al entorno. El ∆H es negativo. Proceso endotérmico: Proceso en el cual el calor es absorbido por el sistema a partir de su entorno. El ∆H es positivo. El criterio para espontaneidad se encuentra en la segunda ley de la termodinámica. Ella establece que en todo proceso espontáneo, la entropía (S) del universo (el sistema más su entorno) se incrementa. En los sistemas metabólicos, las fuerzas de la entropía son contrarrestadas por los procesos celulares creadores de orden. Las vías metabólicas existen en un estado estable que está lejos del estado de equilibrio. Así, por ejemplo: A 136 B C Si se considera que no hay otros reactantes, sólo B en este sistema puede estar en un estado estable. El estado estable ocurrirá si la velocidad de formación de B a partir de A es igual a la velocidad de utilización de B para formar C. Con el tiempo, la concentración de B en un estado estable no cambiará, pero A se puede agotar, y C se puede acumular. Entonces, la concentración de B es mantenida a expensas del cambio continuo en las concentraciones de A y C. Un criterio útil para estimar la espontaneidad de los procesos fue desarrollado por J. Willard Gibbs. La nueva función de estado, denominada el cambio de energía libre de Gibbs (∆G), se define en términos de H y S para los procesos que tienen lugar a presión constante y es una medida de la energía disponible para trabajar dentro de un sistema: ∆G = ∆H - T∆S donde T es la temperatura absoluta y ∆G se expresa en unidades de Kcal/mol. Procesos exergónicos: ∆G < 0. El proceso es espontáneo y se puede llevar a cabo en ausencia de energía proporcionada por el exterior del sistema. Procesos endergónicos: ∆G > 0. El proceso no puede tener lugar espontáneamente, requiere del suministro de suficiente energía externa. Proceso en equilibrio: ∆G = 0. Las concentraciones de los reactantes y de los productos están en equilibrio y las velocidades de las reacciones en ambos sentidos son iguales. El cambio de energía libre de una reacción depende de las condiciones bajo las cuales se efectúa la reacción. Por consiguiente, es útil tener un conjunto de condiciones de reacción de referencia establecidas en forma convencional. Estas condiciones de referencia se conocen como estado estándar (∆Gº’). Para una reacción, el cambio de energía libre se puede calcular como sigue: ∆G reacción = ΣG productos - ΣG reactantes Cuando el sistema se encuentra en equilibrio: ∆Gº’reacción = -2.303 RT log Keq Si se conoce ∆Gº’ para la reacción, la ecuación permite calcular Keq y viceversa. Para una reacción que no está en equilibrio: 137 Se observa una relación diferente de productos a sustratos (Q) y el cambio de energía libre se deriva de: ∆G = ∆Gº’ + 2.303 RT log Q donde Q es la relación de acción de masas. En otras palabras, el cambio de energía libre es una medida de lo lejos que está el sistema que reacciona del equilibrio. En consecuencia, es ∆G y no ∆Gº’, el criterio para evaluar la espontaneidad de una reacción y por consiguiente su dirección dentro de un sistema en particular. Entonces, las reacciones metabólicas se pueden dividir en: 1. Reacciones cerca del equilibrio: Reacciones en las cuales Q tiende a Keq. Las enzimas que catalizan las reacciones cerca del equilibrio son capaces de restablecer con rapidez los niveles de sustratos y productos a estados cercanos al equilibrio debido a la gran actividad enzimática que existe. 2. Reacciones metabólicas irreversibles: Reacciones en las cuales Q esta lejos de Keq. En las células las enzimas que catalizan las reacciones metabólicas irreversibles existen en cantidades limitantes, insuficientes para lograr estados cercanos al equilibrio para estas reacciones. Todos los puntos de control de las vías son reacciones metabólicamente irreversibles (Horton et al., 1995). Proyecte sus conocimientos discutiendo la siguiente afirmación: “La producción de calor en sistemas biológicos es usada como parámetro energético característico del crecimiento y puede utilizarse para calcular el crecimiento empleando el balance de entalpía”. 1. ¿Cuáles son los intervalos de temperatura a los cuales se desarrollan los microorganismos psicrofílicos, mosofílicos y termofílicos? 2. ¿Qué significa crecimiento balanceado y en qué etapa de crecimiento es más probable que se presente? 3. ¿Cómo las células, en un cultivo estacionario, reciben oxígeno? 4. ¿Qué factores limitan la altura de un biorreactor? 2. Algunos productos industriales (diferentes a los antibióticos) producidos por bacterias son: Producto Butanol-acetona 138 Microorganismo Clostridium Usos Solventes, manufactura acetobutylicum y otros. 2,3-butanodiol Dihidroxiacetona Bacillus polimixa, Ent. aerogenes Gluconobacter suboxydans química Solvente, humectante, intermediario químico Químico fino Ácido 2-cetoglucónico Pseudomonas sp. Intermediario para el ácido D-arabo-ascórbico G. suboxydans Intermediaria para el ácido tartárico Lactobacillus delbrueckii Productos alimenticios, textiles y lavanderías, manufactura química, curtido de pieles Ácido 5-cetoglucónico Ácido láctico Amilasa bacteriana Bacillus subtilis Modificador de almidones, encolado de papel; desencolado de textiles Proteasa bacteriana B. subtilis Dextrán Leuconostoc mesenteroides Laminado de pieles, desencolado de fibras, quita manchas, ablandador de carnes Estabilizador de productos alimenticios, sustituto de plasma sanguíneo Sorbosa G. suboxydans Manufactura de ácido ascórbico Cobalamina Ácido glutámico Streptomyces olivaceus: Propionibacterium freudenreichii Brevibacterium sp. Tratamiento de la anemia perniciosa; suplemento alimenticio Micrococcus glutamicus Aditivo de alimentos Lisina Estreptoquinasaestreptodornasa Streptococcus hemolyticus 139 Aditivo de la alimentación animal Uso médico (disolvente de coágulos sanguíneos) Fuente: Pelczar et al., 1990 140 Algunos productos industriales producidos por levaduras son: Producto Microorganism Método de preparación o Cerveza S. cerevisiae o Cebada, malta y almidones S. carisbergensis juntos mezclados con agua caliente; después de la conversión enzimática del almidón, la cerveza nueva se filtra; luego se hierve con lúpulo y finalmente se fermenta con levadura Ron Se añaden como alimentos S. cerevisiae u otras levaduras melazas que contengan 12 14% de azúcar fermentable; sulfato de amonio y ocasionalmente fosfatos; se destila después de la fermentación La masa de granos Whisky S. cerevisiae cocinados se sacarifica con escocés (generalmente malta tratada con carbón y levadura se fermenta; la tanda especial) destilada y el destilado se añejan en barricas de roble durante 3 años por lo menos; después se mezclan con whisky en grano Bourbon S. cerevisiae La masa de granos compuesta de maíz (al menos 51%); generalmente 136 Factores que influyen en la reacción Aerobiosis en los estados primarios, pero pronto se hace anaeróbico, temp. 8 12ºC, pH al principio 5.0 5.4; al final 4.0 - 4.8; la fermentación primaria por lo menos 5-9 días Función de los microorganismos Transforma azúcar en alcohol y dióxido de carbono; produce cambios en las proteínas y otros constituyentes menores que modifican el sabor Transforma azúcar en pH óptimo = 4.0 - 4.7 T inicial = 21ºC elevándola a alcohol, el cual se obtiene después por destilación la T final de 35.5ºC; fermentación por lo menos 3 - 7 días pH óptimo = 4.0 - 5.0 T inicial = 26ºC la fermentación se completa en 72 hs Produce alcohol y sustancias congéneres (ácidos, ésteres, varios alcoholes) que con la malta carbonosa dan el característico sabor del whisky escocés Lo mismo que para el whisky escocés Lo mismo que para el whisky escocés, pero el sabor es el característico Vino 137 S. ellipsoideus, varias cepas se fermenta con centeno cocido y se sacarifica con malta, se destila entre 110 y 130 grados, se madura en barricas de centeno carbonoso Las uvas deben tener concentración de azúcar superior al 22%; al licor se le agrega sulfito par reducir el índice de fermentación; se deja fermentar con cepas especiales de levaduras, o con las levaduras que existen en las uvas en forma natural; a la fermentación primaria sigue un periodo de almacenaje para maduración del bourbon Aerobiosis en los estadios iniciales, pero principalmente anaerobiosis después T inferior a 29.4ºC, pero varía de acuerdo con las condiciones locales, cepa de levadura y tipo de vino; la fermentación dura 7-11 días Transforma el azúcar en alcohol y también produce cambios en los componentes menores que modifican el sabor y bouquet; la cantidad de alcohol varía según el tipo de vino Los hongos se usan para elaborar antibióticos, algunos productos alimenticios, en la industria química y en la obtención de enzimas. Algunos productos industriales (diferentes a los antibióticos) producidos por hongos son: Producto Ácido cítrico Microorganismo Aspergillus niger o A. wentii Usos Productos alimenticios, citratos medicinales, en sangre para transfusiones Rhizopus nigricans Manufactura de resinas alquídicas, agentes humectantes A. niger Productos farmacéuticos, textiles, curtido de cueros, fotografía Ácido fumárico Ácido glucónico Ácido itacónico A. terreus Manufactura de resinas alquídicas, agentes humectantes Pectinasas A. wentii o A. aureus 11-γ-hidroxiprogesterona R. arrhizus, R. nigricans y otros Agentes clarificantes en la industria de jugos de frutas Intermediario para 17-γhidroxicorticoesterona Ácido giberélico Fusarium moniliforme Guarnición de frutas, producción de semillas Ácido láctico R. oryzae Alimentos y productos farmacéuticos Fuente: Pelczar et al., 1990 Para ampliar su conocimiento sobre el uso de microorganismos a nivel industrial. 1. Busque en una revista especializada, un artículo, que corresponda a la elaboración de cualquiera de los productos anteriores y en él analice la 96 estructura del texto, determine la finalidad del documento y subraye las partes importantes. 97 LECCION CATORCE Y que yo jamás me olvide de que la lucha por un mundo mejor es una lucha de amor. Michel Quoist 98 LOS MICROORGANISMOS Y SU TECNOLOGÍA Introducción Teniendo en cuenta que Louis Pasteur en 1872 sentó las bases de la microbiología e identificó a los microorganismos como responsables de cambios tanto deseables como indeseables en los alimentos y que desde entonces, se han catalogado más de 3500 alimentos intracelularm fermentados cuyo procesamiento y preservación ha sido más segura y confiable (Madden, 2000), la presente unidad estudia los microorganismos y su tecnología, es decir, está orientada a la ntracelularme, cultivo y ntracelul de microorganismos o metabolitos. Objetivo Al terminar la unidad el ntracelula debe estar en capacidad de identificar los factores que afectan el crecimiento microbiano; de reseñar los diferentes modelos que lo describen; de diseñar, seleccionar, adecuar y optimizar los medios de cultivo propios para el aislamiento y desarrollo de microorganismos; de describir las rutas metabólicas que originan diferentes productos de ntracelular, así como de definir los parámetros a controlar en un proceso fermentativo. Contenido Los microorganismos y su tecnología Tecnología de ntracelular Bibliografía de apoyo Bibliografía Trabajo de complementación Bibliografía recomendada 1. Andrews, G. F. The Yield Equiations in the Modeling and Control of Bioprocesses. Biotechnology and Bioengineering. Vol. 42. John Wiley and Sons, Inc. 1993. 2. Behrentz, E. Y Giraldo, E. Modelación a Escala del Proceso de Compostaje Aerobio, en Pila Estática y con ntracelu forzada. Desarrollo Teórico e Implementación de Laboratorio. Revista Colombiana de Biotecnología. Santafé de Bogotá, D. C. Vol II. No. 2. Junio, 1999. pp. 51 – 59. 99 3. Horton, Robert; Moran, Laurence; Ochs, Raymond; Rawn, David y Scrimgeour, Gray. Bioquímica. Prentice-Hall Hispanoamericana, S. A. México. 1995 4. Montoya, D.; Siera, J.; Silva, E.; ntracel, G.; y Ramos, J. Optimización de un Medio de Cultivo Industrial para la ntracelular acetobutílica (ABE). Revista Colombiana de Biotecnología. Santafé de Bogotá, D. C. Vol. II. No. 2. Junio, 1999. pp. 37 – 42. 5. Scragg. Biotecnología para Ingenieros. Sistemas Biológicos en Procesos Tecnológicos. ntracelu Limusa, S. A. Grupo Noriega Editores. México. 1996. TUS COMPROMISOS Para abordar el capítulo Con el grupo Saber como funcionan los multiplicadores de Lagrange Presentar la técnica para determinar experimentalmente biomasa por el método de: Copiar del artículo de Montoya et al., 1999; relacionado en la bibliografía recomendada Copiar del artículo de Behrentz et al., 1999; relacionado en la bibliografía recomendada • • • • • • Peso seco Proteína de Biuret DNA Proteína (Foling) Opacidad Conteo celular Para aprender a aprender • Establecer contacto con las cosas e ideas • Comprender los fenómenos y textos • Planear las acciones y solucionar los problemas por sí mismos. 100 Los microorganismos fueron descubiertos en el siglo XVII. A continuación, van Leeuwenhoek y los microscopistas que le sucedieron encontraron miríadas de pequeños organismos con características que no correspondían a ninguno de los dos reinos conocidos hasta entonces (Kimball, 1982). En 1797, Edward Jenner inoculó a modo de vacuna gotas de pus de personas contagiadas con viruela. Más tarde Pasteur realizó sus trabajos sobre microbiología y éstos pueden clasificarse en tres series: 1. Toda fermentación se relaciona con el desarrollo de un microorganismo. 2. Toda enfermedad infecciosa resulta del desarrollo en el organismo de un microbio especial. 3. El microorganismo de una enfermedad infecciosa, cultivado en condiciones determinadas, se halla atenuado en su actividad nociva. Cada una con consecuencias prácticas. El primero, proporcionó reglas para la fermentación del vinagre y la cerveza, mostrando cómo es posible preservarlos de la acción de microorganismos extraños que los alteran. El segundo, indicó las normas para resguardar los ganados de las contaminaciones del carbunco2, que causaba pérdidas inmensas en caballos, ovejas y vacas; además, abrió el camino a la cirugía aséptica, llevando al desaparecimiento de las erisipelas y de las acciones purulentas que en otro tiempo causaban frecuentemente la muerte, como resultado de las operaciones. El último, condujo a las vacunas (F.T.D., 1962). La fermentación, conocida desde los tiempos más antiguos, se mantuvo como un fenómeno inexplicable hasta el siglo XIX; gracias especialmente a los trabajos de Cagniard de Latour y Schwann, de Turpin, de Schröder, de Liebig, de Pasteur, de Nägeli, de Cohn, de De Bary, de Düclaux y de Buchner entre otros. Para visualizar el contorno histórico, profundice sobre la vida de uno de ellos. _______________________________________________________ __________________________________________________________ ________________________________________________________________ ________________________________________________________________ ________________________________________________________________ ________________________________________________________________ ________________________________________________________________ ________________________________________________________________ NOMBRES CIENTÍFICOS El nombre científico de cada especie consta de dos partes. La primera es el nombre del género al cual pertenece el organismo; la segunda es el “nombre 2 Ántrax 101 específico” e identifica la especie particular dentro del género. Ambas se escriben en latín o utilizando palabras nuevas a las que se les da forma latina3, en cursiva y con las letras del alfabeto romano, iniciando el nombre genérico con mayúscula. Ocasionalmente se incluye en el nombre científico una tercera palabra latinizada y escrita en letra cursiva, referente al nombre de la subespecie y sirve para distinguir una forma particular o local de la especie respecto de otras formas de la misma especie. En otras ocasiones, se encuentra después del nombre científico, escrito sin cursiva, un nombre o una inicial, que corresponde al nombre o a la inicial del taxónomo que acuñó el nombre científico (Kimball, 1982). Para facilitar la comprensión de lectura, ¿A qué se refiere la literatura cuando habla de las formas sp. y spp.? _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ TAXONOMÍA DE LOS MICROORGANISMOS El biólogo alemán Haeckel, hace más o menos cien años, sugirió crear el reino protista, para incluir todos aquellos organismos que no encajaban dentro de los reinos animal y vegetal; sin embargo como este artificio no explicaba las propiedades de las bacterias procarióticas, las algas azul-verdosas y los hongos, se comenzó a hablar de los reinos fungi y monera. De otro lado, el naturalista sueco Carolus Linaeus (Linneo) apreció los aspectos verdaderamente significativos en los cuales difieren o se parecen los organismos, dando origen al sistema moderno de clasificación, basado en la homología (Kimball, 1982). La clasificación de los organismos tiene dos finalidades: 1. Descriptiva: agrupa organismos de la misma clase y describe la base para este agrupamiento 2. Filogenética: hace que los sucesivos taxones (niveles de ordenación) en un árbol familiar jerárquico (especie, género, familia, tribu, orden) apunten hacia líneas de reflexión de la descendencia evolutiva Para identificar un organismo desconocido y relacionarlo con organismos previamente descritos, el taxonomista tiene que confiar en las siguientes 3 El género se escribe como sustantivo, la especie como adjetivo. 102 propiedades: rasgos visibles (forma, tamaño, color, tinción, movilidad, cápsula y morfología colonial); formación de productos químicos característicos; nutrición (con inclusión tanto de las necesidades de crecimiento como de la capacidad para utilizar diversos alimentos); presencia de macromoléculas superficiales características (detectadas por lo general inmunológicamente); hábitat (con inclusión de la capacidad de parasitar organismos superiores y causar enfermedad); patrones flagelares; vías productoras de energía y composición química (especialmente del peptidoglucano y los lípidos totales analizados por cromatografía gas-líquido); secuencias de ácidos nucleicos, y diferencias en los mecanismos reguladores de sus vías biosintéticas (González, 2000). Antes de continuar revise el origen griego o latino de las siguientes palabras, esto facilitará el manejo del vocabulario: Palabra Cocos Bacilos Vibriones Espirilos Espiroquetas Patógeno Parásitos Toxinas Origen Griego Latino Vocablo kokkos bacilus Latino Griego Griego Griego Griego Griego spirula speira pathos para sitios toxikon Definición Procariotes Poseen sólo un cromosoma, al cual no se hallan asociadas histonas y se clasifican en el reino monera. Reino Fílum Schizomycetes (bacterias) Monera Cyanophita (algas azul -verdosas) Bacterias: Las células se hallan encerradas en una pared celular. Según su especie pueden ser esféricas (cocos), en forma de bastón (bacilos) o en espiral (espirilos) y se organizan en pares, racimos, cadenas o filamentos. Se reproducen por división directa, es decir por estrangulación, pero si les falta alimento, la mayoría de ellas presenta esporulación. La clasificación de las bacterias se halla en continuo proceso de revisión: 103 Bacterias Fotosintéticas Características Usan la energía del sol para reducir el CO2 a carbohidrato. La fuente de electrones nunca es el agua, las sulfurosas púrpuras sulfurosas utilizan H2 S. Contienen formas especiales de clorofila. La mayoría son organismos anaerobios. verdes sulfurosas Quimioautotróficas Son incoloras, comparten la capacidad de manufacturar carbohidratos a partir de materiales inorgánicos, pero no sulfurosas, ferrosas, utilizan la energía lumínica sino que oxidan una sustancia nitrificantes del medio para producirla. Gram positivas Pueden ser bacilos o cocos. Gram negativas Pueden ser bacilos, cocos o espirilos. Espirilos Poseen pared celular rígida, forma helicoidad y movilidad. Actinomicetos Crecen en forma de filamentos delgados. Son los microorganismos dominantes del suelo, degradan restos orgánicos y son fuente de antibióticos. Micobacterias Microorganismos afines a los actinomicetos, resisten los ácidos. Corinebacterias Microorganismos afines a los actinomicetos. Espiroquetas Forma helicoidal, alargadas, delgadas y con longitudes que van desde unas pocos µm hasta 500 µm. Tienen pared celular menos rígida que la de los espirilos, son móviles. Micoplasmas Inmóviles, diminutas (0.1 µm), sin pared celular. Algunas son de vida libre, otras parasitan en organismos superiores. Rickettsias y Pequeñas (1µm o menos), casi todas parásitos intracelulares clamidias obligatorios que probablemente dependen de la célula huésped para tener buen suministro de coenzimas. Deslizantes Se deslizan sobre el sustrato, muchas son unicelulares, otras forman filamentos (se parecen mucho a las algas verdeazules, no son fotosintéticas). La mayoría son heterótrofas; pocas son quimioautótrofas. Fuente: Kimball, 1982. En biotecnología se trabaja mucho con bacterias, familiarícese entonces con una de las siguientes: Bacillus subtilis, Escherichia coli, Bacillus thurigiensis, Lactobacillus bulgaricus, Corynebacterium diphtheriae, Clostridium acetobutylicum, Clostridium tetani. ______________________________________________________________ ________________________________________________________________ ________________________________________________________________ ________________________________________________________________ ________________________________________________________________ ________________________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ 104 Describa el procedimiento seguido para identificar cuando una bacteria es gram positiva o gram negativa 105 LECCIÓN QUINCE LAS BACTERIAS EUBACTERIAS GRAM POSITIVAS Características distintivas Familia Cocos Inmóviles Forman agrupaciones cúbicas, organizadas irregularmente. Organizados en cadenas, presentan fermentación láctica de los azúcares Bacilos rectos Inmóviles Fermentación láctica o propiónica de los azúcares. Oxidativa, débilmente fermentativa. Móviles, con flagelos perítricos y formas inmóviles relacionadas producen endosporas y pueden ser: Aerobias Anaerobias Fuente: Davis et al., 1989 Género Micrococáceas Sarcina Micrococcus Staphylococcus Streptococáceas Streptococcus Leuconostoc Lactobaciláceas Propionibacteriáceas Lactobacillus Propionobacter corynebacter Baciláceas BACTERIAS GRAM NEGATIVAS Características distintivas Familia Bacillus Clostridium Género Cocos Casi todos permanentemente inmóviles, Aerobios Neisseriáceas Anaerobios Bacilos rectos Móviles, con flagelos perítricos y formas inmóviles relacionadas Anaerobios facultativos Fermentación ácida mixta de azúcares. 106 Neisseria Veillonella Brucella Pasteurella Hemophilus Bordetella Enterobacteriáceas Escherichia Erwinia Shigella Salmonella Proteus Yersenia Bruceláceas Aerobios Fermentación butilenglicólica de los azúcares. Enterobacteriáceas Fijadores libres de nitrógeno. Azobacteriáceas Fijadores simbióticos de nitrógeno. Rhizobiáceas Móviles, con flagelos polares. Aerobios Oxidan compuestos inorgánicos. Nitrobacteriáceas Oxidan compuestos orgánicos Pseudomonáceas Enterobacter Serratia Azotobacter Rhizobium Nitrosomonas Nitrobacter Thiobacillus Pseudomonas Acetobacter Bacilos curvos Espiriláceas Photobacterium Zymomonas Aeromonas Vibrio Desulfovibrio Spirillum Fuente: Davis et al., 1989 Orden Actinomicetales OTROS GRUPOS IMPORTANTES DE BACTERIAS Familia Género Mycobacterium Actinomyces Nocardia Streptomyces Treponema Borrelia Leptospira Spirocheta Spiroquetales 1 Micoplasmatáceas Mycoplasma Rickettsiáceas Rickettsia Coxiella Clamidiáceas1 Chlamydia Bartoneláceas2 Bartonella Son fácilmente filtrables. 2 Parásitos intracelulares, que limitan con los protozoos. Fuente: Davis et al., 1989 107 El enfoque antes descrito ordena las bacterias en términos de rasgos fenotípicos. Sin embargo, el crecimiento de la genética molecular proporciona una base cuantitativa precisa para definir la afinidad biológica, ya que al diferenciarse los organismos en la evolución, a través de la acumulación de mutaciones, sus genes difieren no solamente en sus productos sino también en las secuencias de sus bases. De otro lado, algunos investigadores, con ayuda del computador y para evitar la arbitrariedad de los caracteres, han revivido un intento taxonómico introducido en el siglo XVIII por el biólogo francés Adanson. En este sistema se determina un gran número de caracteres para cada una de las cepas y se establecen los grupos basándose en la proporción de caracteres presentados, sin que ningún carácter tenga más importancia que otro. Algas azul-verdosas: Son fotosintéticas, poseen clorofila a (la misma molécula encontrada en las plantas y en otras algas), utilizan agua como fuente de electrones para reducir el bióxido de carbono a carbohidratos. Luz (CH2O)n + H2O + O2 CO2 + 2H2O Dos eucariotes: protistos y hongos Protistos: Fueron los primeros organismos eucarióticos en evolucionar y en ningún caso presentan el desarrollo de tejidos especializados propios de las plantas y los animales (Kimball, 1982). Reino 1 2 Protista Clasificación Fílum Características 1 Protozoos Sarcodina (rizopos) Movimiento por seudópodos Mastigophora (flagelados) Movimiento por flagelos Ciliophora (ciliados) Movimiento por cilios Sporozoa (esporozoos) Parásitos sin locomoción Algas2 Rhodophyta (algas rojas) Propias de aguas marinas Pyrrophyta (dinoflagelados) Reserva nutritiva: almidón Euglenophyta (euglenofitos) Unicelulares con flagelos Chlorophyta (algas verdes) Con pared rígida de celulosa 3 Chrysophyta (algas doradas) Unicelulares con flagelos Phaeophyta (algas pardas) Propias de aguas marinas 4 Hongos Myxomycetes Producen mucílago (mucilaginosos) Protozoos: La palabra protozoo ya no es un término taxonómico formal sino un nombre común para unas 30.000 especies de organismos pequeños, unicelulares, desprovistos de clorofila, que se clasifican de acuerdo con el modo de locomoción. Algas: Tampoco corresponde a un término taxonómico formal, pero es el nombre común para designar un gran número de organismos simples que contienen clorofila. 108 3 4 A este fílum pertenecen las algas diatomeas, sin embargo gracias a la homogeneidad del grupo hay quienes las ubican en el fílum Bacillariophyta. Hay quienes separan los hongos plasmodiales del mucílaco en un fílum (Myxomycetes) y los hongos celulares del mucílago en otro fílum (Acrasiomycetes). Actualmente hay especies de microalgas cultivadas comercialmente, tales como: Dunaliella, Chlorella y Spirulina. Escoja una y consulte sobre ella. _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ Hongos: Son organismos unicelulares, pluricelulares o dimórficos que carecen de clorofila y poseen en la mayoría de los casos un talo (cuerpo vegetativo) filamentoso, constituído por hilos delgados llamados hifas, las cuales crecen apicalmente y en conjunto integran el micelio. Su reproducción es asexual y/o sexual pero, por lo general producen esporas. Reino Fungi Fílum Phycomycetes Ascomycetes Basidiomycetes Deuteromycetes Clase Ficomicetos Ascomicetos Basidiomicetos Hongos imperfectos Cuyas características son: Clase Ficomicetos Ascomicetos Esporas Esporas asexuales sexuales Endógenos Estructura variable Exógenos Ascosporas, en el interior de sacos o ascas Micelios No tabicados Género o grupo representativo Rhizopus, Mucor, Hongos acuáticos Tabicados Neurospora, Penicillium, Aspergillus, levaduras verdaderas Basidiomicetos Exógenos Basidiosporas, en la superficie de los basidios Tabicados Mohos Deuteromicetos (hongos imperfectos) Exógenos Ausentes Tabicados La mayor parte de los patógenos humanos Endógenos: En sacos Exógenos: Al final o en los lados de las hifas Fuente: Davis et al., 1989 109 Aprenda sobre los hongos comerciales, escoja entre: Lentinus edodes (Shiitake), Cantharellus cibarius (Rebozuelo o rusiñol), Lactarius deliciosus (Rovellón), Clavaria botrytis (Pie de rata), Flamulina velutipes (Hongo de invierno) y Volvariella volvacea (Hongo chino). _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ El complejo constituido por un micelio fungoso y un alga embebida en él se conoce como liquen, entonces, ¿Cuáles son los hongos y cuáles las algas que se encuentran con mayor frecuencia en los líquenes? _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ ESTRUCTURAS MICROBIANAS Bacterias Levaduras Hongos Eucarya Fungi Eucariote Esporulación, seguida de germinación de las esporas, gemación y fragmentación de las hifas Se duplican entre 60 y 90 minutos. Dominio Reino Tipo celular División Eubacteria Monera Procariote Fisión Eucarya Fungi Eucariote Gemación, rara vez por fisión Velocidad de división Se duplican 90 a 120 en 45 minutos 110 Virus Requieren de un huesped para su reproducción Diámetro Formas 1 µm cocos: diplococos, estreptococos, estafilococos, sarcinas bacilos: cocobacilos, bacilos fusiformes, formas filamentosas, vibriones, espirilos Método típico de análisis Coloración de Gram 3 a 5 µm Dentro de algunas condiciones de crecimiento las gemas no se separan de la célula madre, formando cadenas ramificadas de pseudomicelio Azul de lactofenol Fuente: Elaborado a partir de Davis et al., 1989 2 a 10 µm Azul de lactofenol 90 a 300 nm Según los huéspedes se dividen en virus animales, bacterianos y vegetales. Según su mofología general pueden ser Icosaédricos, helicoidales y de estructura más compleja Acetato de uranilo Para tener un punto de referencia, identifique las diferentes formas y partes microbianas, elaborando una representación gráfica y describiendo con palabras sus principales características: diplococos estreptococos estafilococos ____________________ ____________________ ____________________ ____________________ ____________________ ____________________ bacilos cocobacilos ____________________ ____________________ ____________________ ____________________ 111 bacilos fusiformes ____________________ ____________________ formas bacilares filamentosas vibriones espirilos _______________ ________________ __________________ __________________ _______________ _________________ sarcinas pseudomicelio micelio __________________ _________________ ________________ __________________ _________________ _________________ hifa Conidios virón icosaédrico desnudo __________________ _________________ __________________ __________________ ________________ __________________ virón helicoidal desnudo virón icosaédrico encapsulado virón helicoidal encapsulado __________________ __________________ __________________ __________________ ______________ _________________ ULTRAESTRUCTURAS MICROBIANAS Pared celular Contenido citoplásmico Región nuclear Estructuras características 1 Bacterias Rígida, rica en péptidos Mesosomas, ribosomas Sin membrana nuclear En ocasiones cápsulas, flagelos y pili1 Pili: Apéndices filamentosos Fuente: Davis et al., 1989 112 Levaduras Rica en polisacáridos Mitocondrias, retículo endoplasmático Membrana nuclear Hongos Rica en polisacáridos Mitocondrias, retículo endoplasmático Membrana nuclear Virus Ácido nucleico y proteínas Cápsida de proteína Para fundamentar sus conocimientos: Distinga entre bacterias propiamente dichas, micoplasmas, rickettsias y virus. _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ ______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ ¿En qué aspectos son similares los virus ADN y los virus ARN?, ¿En qué aspectos difieren? _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ NUTRICIÓN DE MICROORGANISMOS Teniendo en cuenta los requerimientos nutricionales, es posible dividir las bacterias en dos grupos: Principales tipos de nutrición de las bacterias Tipo Fototróficas 1. Fotolitotróficas (Autotróficas) 2. Fotoorganotróficas (Heterotróficas) Quimiotróficas 1. Quimiolitotróficas (Autotróficas) 2. Quimioorganotróficas (Heterotróficas) Fuente: Merck, 19?? 113 Fuente de energía para el desarrollo Fuente de carbono para el desarrollo Ejemplo del género Luz CO2 Chromatium Luz Compuestos orgánicos Rhodopseudomon as Oxidación de compuestos inorgánicos Oxidación de compuestos orgánicos CO2 Thiobacillus Compuestos orgánicos Escherichia Además, todas las formas de vida, tienen en común determinadas necesidades nutricionales en términos de requerimientos químicos para llevar a cabo su crecimiento y funciones normales. • • • • • • • Todo organismo vivo necesita Carbono. Nitrógeno. Agua. Vitaminas. Azufre Fósforo. Metales como sodio, potasio, calcio, magnesio, manganeso, hierro, zinc, cobre, fósforo y cobalto. El carbono generalmente se suministra como azúcar proveniente de melazas, cereales sacarificados o materiales semejantes; sin embargo, el microorganismo también puede adquirirlo a partir de aminoácidos, ácido láctico, etanol u otras sustancias orgánicas. El nitrógeno se adiciona al medio como amoniaco, sales amónicas (sulfato amónico, fosfato diamónico), derivados proteínicos solubles (pectonas, péctidos y aminoácidos), urea o aminoácidos de cereales hidrolizados. El fósforo como ácido fosfórico, fosfatos (diamónico, ácido de potasio) o superfosfatos. El magnesio como sulfato magnésico heptahidratado (Cate et al., 19??). MANIPULACIÓN INDUSTRIAL Encontrar el microorganismo adecuado para el objetivo deseado y la determinación de los medios de cultivo para la conservación y mayor productividad, son las primeras dificultades con las que se encuentra un profesional en biotecnología (Caicedo, 1997). Propiedades que deben poseer las variedades seleccionadas para uso industrial • Estabilidad bioquímica: características uniformes y constantes • Estabilidad al cultivo: capacidad para reproducirse perfectamente y con buen rendimiento en el medio de propagación • Capacidad para adaptarse al sustrato • Facilidad de desarrollarse rápidamente con elevado rendimiento • Facilidad de recuperación. • Buenas cualidades de conservación: posibilidad de resistir la autolisis (Cate et al., 19??). 114 La fuente de microorganismos es variada y se puede recurrir a colecciones especializadas en centros de referencia mundial, como la ATCC; a colecciones privadas o al medio ambiente que nos rodea. En los dos primeros casos, los medios y condiciones de conservación son suministradas por dichos centros, al igual que la composición de los medios de producción. Sin embargo, la necesidad de nutrientes específicos, difíciles de conseguir a nivel industrial, o la necesidad de mejorar los rendimientos, obligan a diseñar medios de cultivo y optimizarlos. En el último caso, se encuentran mezclas de microorganismos que se deben aislar, conservar, caracterizar y diseñar los medios de cultivo (Caicedo, 1997). Procedimiento para utilizar un microorganismo de colección Selección del microorganismo Ejemplo: Brevibacterium lactofermentum ATCC 13869 Definición de las especificaciones propias del microorganismo Activación de la cepa La cepa elegida se reactiva en matraces de 250 ml con 50 ml de caldo nutritivo Condiciones de incubación: Tiempo = 48 horas Temperatura = 32ºC, con agitación rotatoria. Preinóculo El medio recomendado es: Stock de minerales 100 ml; K2HPO4 (5g/l), MgSO4 (2.5 g/l); K2SO4 (1.0 g/l); MnSO4 (0.05 g/l); FeSO4 (0.05 g/l); FeCl3 (0.05 g/l); Biotina 20 g/l; Glucosa 50 g/l. Condiciones de incubación: Un matraz de 300 ml de capacidad con 50 ml de medio de cultivo se inoculó con el 10% v/v de la cepa activada en el paso anterior, se incubó a 32ºC, durante 24 horas, con agitación. El pH fué de 7.5. En estas condiciones se realizan curvas de crecimiento y se determina la velocidad específica de crecimiento en h-1. 115 Éstas cepas comerciales pueden tener manipulación genética, por lo tanto es importante consultar las variantes que se encuentran disponibles, describir brevemente qué tipo de manipulación genética pueden presentar y soportar la descripción con tres artículos publicados en revistas. _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ Procedimiento para aislar un microorganismo y condiciones de los medios de conservación y producción Toma de muestras del medio ambiente Se hace en un medio no selectivo Incubación A las condiciones ambientales originales Aislamiento de las cepas de interés Utilizando separación por: Pretratamiento, dilución o medio enriquecido Diseño del medio de cultivo Optimización del medio de cultivo 116 definir las Como la toma de muestras del medio ambiente se hace en un medio no selectivo y es importante conocer los productos disponibles en el mercado, enuncie tres ejemplos de medios de cultivo comerciales e indique los datos solicitados a continuación: Nombre comercial del medio de cultivo Composición Cepas para las cuales el medio es adecuado Características de las colonias Tipos de medio de cultivo De enriquecimiento: El medio de cultivo de enriquecimiento es un medio en el cual determinada especie de microorganismo prospera con mucha facilidad; muchas veces el cultivo de enriquecimiento se usa para seleccionar entre diferentes especies de microorganismos y para el aislamiento de cepas puras. Diferencial: Es un medio de cultivo selectivo; debido a su composición química especial, solo pueden crecer microorganismos de determinada clase. Esto se usa para la identificación de los diferentes grupos por sus características metabólicas diferentes. Medio sintético o definido: Este tipo de medio se usa para la investigación porque permite determinar los requerimientos específicos para crecimiento y formación del producto adicionado o sustrayendo constituyentes del medio de cultivo; con base en estos datos se elabora el medio de producción industrial. Estos medios se caracterizan por tener una composición perfectamente conocida de iones. Un ejemplo de medio definido es el medio Davis para microorganismos fermentativos entéricos. Medio complejo o natural: Estos tipos de medio son utilizados en escalonamiento de fermentaciones para producción industrial. Se usan ingredientes de origen natural, los cuales no están completamente definidos químicamente como extracto de carne, melazas, etc. Medio de fermentación industrial: Los microorganismos son formas de vida, con una gran capacidad de adaptación a diversas condiciones ambientales. Esta adaptación viene acompañada de la reorganización de estructuras macromoleculares, la inducción y/o represión de sistemas enzimáticos y relocalización del material celular. La composición de la célula varía en función de temperatura, pH, fuerza iónica y nutrientes que están en el 117 medio. La limitación de alguno de los nutrientes puede hacer que cambien algunas reacciones metabólicas de la célula. Para realizar el aislamiento de las cepas de interés se utilizan las siguientes técnicas de separación: Pretratamiento: La muestra se somete a calentamiento a diferentes temperaturas y tiempos, o a filtración a través de membranas de diferentes diámetros, dependiendo de los microorganismos a aislar. Dilución: La muestra original se lleva a diferentes grados de concentración, diluyéndola con solución salina (0.9% NaCl), solución tampón (NaCl + fosfato) o medio de fermentación y posteriormente se siembra en un medio de cultivo selectivo. Medio enriquecido: La muestra se siembra en un medio de cultivo enriquecido que permita exclusivamente, el desarrollo del microorganismo deseado. Para diseñar un medio de cultivo es necesario tener en cuenta el metabolismo primario y secundario del microorganismo. Desafortunadamente es muy raro que se puedan tener estudios completos de tales metabolismos. El medio debe responder hasta donde sea posible a los requerimientos del microorganismo, por lo tanto para el diseño del medio de cultivo, un buen punto de partida es la composición de los medios de aislamiento, muchos de los cuales son caracterizados por las casas productoras, además se consideran los siguientes criterios: La composición celular: Se trabaja bajo el criterio de que la composición celular y la composición del medio deben ser similares, sin embargo, diversos estudios han mostrado que no existe relación entre las dos composiciones. La ecuación estequiométrica: Se parte de las fuentes de carbono, nitrógeno, fósforo y otros nutrientes si la ecuación lo exige y llega a la producción de células, producto principal y subproductos. Para ésto se requiere del conocimiento de la fórmula de las células y de los diferentes nutrientes. Los factores estequiométricos experimentales: Permite compensar los consumos de nutrientes dados por reacciones secundarias. Partiendo del medio diseñado, se optimiza el medio de cultivo, el cual debe cumplir con: 1. Los requerimientos nutricionales y energéticos de la célula 2. Las condiciones ambientales de temperatura, presión y concentración de oxígeno 118 3. La función objetivo que se persiga (producción de biomasa o producto), evitando las represiones por exceso de nutrientes o de productos 4. Las limitaciones comerciales de estabilidad, costo y disponibilidad de materias primas, entre otras. 5. Un buen rendimiento, a un menor costo y con menor grado de contaminación debida a los elementos sobrantes (Caicedo, 1997). Técnicas para optimización de medios Univariante: Permite estudiar, por separado, cada elemento que se considere crítico para el proceso, se realiza en un cultivo por lotes y es muy usada para el estudio de fermentaciones. No evalúa el efecto multivariante de los factores. Quimiostato: Se realiza en un cultivo continuo, produciendo perturbaciones escalón o pulso sobre un sistema estable. Se utiliza para optimizar biomasa y productos. Esterilización de los medios de cultivo La mayoría de las fermentaciones industriales ocurren como cultivos puros con cepas cuidadosamente seleccionadas. La presencia de microorganismos extraños al medio, o cualquier parte del equipo, afecta el consumo de nutrientes y disminuye el rendimiento y la productividad del proceso. Además, los productos de estos microorganismos pueden ser nocivos para la cepa seleccionada y limitar su crecimiento. La esterilización destruye, inactiva o remueve toda forma de vida microbiana, y produce en los microorganismos una pérdida irreversible de su capacidad de reproducción en el ambiente considerado. La esterilización puede realizarse, entre otros procedimientos, con calor seco, calor húmedo, filtración con filtros de porcelana no vitrificada (filtro Chamberlad), tierra de diatomáceas (filtro Berkefeld o filtro Mandler), filtros de placas de amianto utilizables una sola vez (filtro Seitz), filtros de ésteres de celulosa (Millipore) y filtros de placas de vidrio sinterizado. Los microorganismos presentes en un medio también pueden removerse mediante centrifugación, agentes químicos, radiación (ultravioleta y rayos X), y medios mecánicos (vibraciones sónicas y ultrasónicas). A nivel industrial el método preferido de esterilización es el calentamiento mediante vapor de agua en el mismo recipiente de fermentación, o en un equipo separado. En este caso el aire presente en el equipo debe ser cuidadosamente purgado, porque la temperatura de la mezcla aire-vapor 119 saturado no solo es menor que la del vapor sino que disminuye con el contenido de aire en la mezcla y, si la esterilización se controla mediante la observación de la presión, la temperatura alcanzada puede ser inferior a la requerida por el proceso. Otro aspecto importante originado por la presencia de aire en la esterilización del equipo con vapor de agua es la diferencia de densidad; así, el aire más denso que el vapor, fluye hacia el fondo del equipo originando gradientes de temperatura. Un segundo método, menos efectivo, utilizado tanto para la esterilización del equipo como para el material de vidrio, es la aplicación de calor seco mediante llama o aire caliente, debido a la coagulación de las proteínas que conforman las células, originando el endurecimiento de la capa externa de las mismas y dificultando la transferencia del calor seco. Se considera que la esterilización por calor sigue una cinética de muerte térmica de primer orden, así: dN = −K d N dt donde: N es el número de microorganismos viables, Kd es la constante de muerte térmica y t es el tiempo. La constante de desactivación térmica se puede expresar de manera análoga a la ley de Arrhenius, la cual es función de la temperatura: ⎛ E ⎞ K d = a × exp⎜ − ⎟ ⎝ RT ⎠ donde: R es la constante universal de los gases 1.987 (cal/gmol.ºK), E es la energía de activación (cal/gmol), a es la constante de Arrhenius (s-1), T es la temperatura (ºK). De las ecuaciones anteriores sale: dN ⎛ E ⎞ = −K d N = − a × exp⎜ − ⎟N dt ⎝ RT ⎠ Integrando: t t No ∇ = ln = K d dt = a exp(− E RT )dt N 0 0 ∫ 120 ∫ Donde ∇ es la relación logarítmica de la población de microorganismos inicial y final. Esta relación es conocida como nabla o reducción fraccional de microorganismos y es un indicador de la severidad del proceso de esterilización. Un ciclo de esterilización por lote típico se caracteriza por presentar tres etapas: de calentamiento, de sostenimiento y de enfriamiento, causadas por perfiles de temperatura que se originan de acuerdo al equipo de calentamiento o enfriamiento utilizado y la reducción fraccional de microorganismos se logra durante estos tres períodos. Así: ∇ = ln No = ∇Calentamiento + ∇Sostenimie nto + ∇enfriamien to N En las etapas de calentamiento y enfriamiento donde la temperatura no es constante, el factor nabla debe ser calculado resolviendo la integral que define el perfil de temperatura el cual varía de acuerdo al equipo utilizado para realizar la transferencia de calor. El tiempo total del ciclo será el resultado de la suma de los obtenidos en las tres etapas (Moreno, 1996). CONSERVACIÓN DE MICROORGANISMOS Para evitar la contaminación microbiana de la cepa es necesario emplear durante el almacenamiento, temperaturas bajas, además de tratamientos que mejoren las cualidades de conservación, tales como el lavado del microorganismo, durante una hora con solución alcohólica (C2-C5), seguido de un proceso de prensado; o bien, el empleo de coloides (pectina, agar, gelatina, goma tragacanto, dextrina) que permitan separar el agua para posteriormente secar a una temperatura tal que no perjudique el microorganismo (Cate et al., 19??). DESARROLLO DEL INÓCULO El desarrollo del inóculo en condiciones óptimas, permite obtener poblaciones genotípicas idénticas, minimizar las pérdidas del microorganismo durante la activación, estabilizar la fisiología con el objeto de mejorar la producción. Algunos aspectos a tener en cuenta para obtener un buen inóculo tienen que ver con las condiciones en las cuáles se trasladan las células del medio de conservación al medio de activación; ello implica condiciones asépticas y un buen método para determinar biomasa; así se logra obtener una curva de 121 crecimiento, la cual indica los cambios fisiológicos a través del tiempo (Montoya, 1989). REACTIVACIÓN DEL INÓCULO Esta parte se realiza generalmente en matraces de 50 ml con un volumen de medio de 5 a 10 ml y agitación de 220 rpm. Se inoculan los matraces con las células obtenidas del medio de conservación, en porcentajes del 5 al 10%. Los tamaños del inóculo varían de acuerdo al volumen de fermentación, por ejemplo: Para un fermentador de 14 litros con 10 litros de volumen de medio (volumen real), el inóculo al 10% será un litro. Para 100 litros de fermentación, el inóculo será de 10 litros. Generalmente se disminuye el porcentaje del inóculo en la medida en que se aumente la escala de fermentación. Así, para un tanque de 100.000 litros, se partirá de 10 litros de laboratorio, escalando a 5.000 litros a nivel piloto, para inocular 100.000 litros a escala industrial. El inóculo se obtiene utilizando como reactor un matraz de 50 a 250 ml con medio de cultivo (hasta 1/3 del volumen total). Se inocula del 5 al 10% (v/v), del cultivo anterior. El medio se ha esterilizado a 121ºC durante 15 a 20 minutos. La determinación de la biomasa es un indicador de las características del inóculo, teniendo el tiempo de duplicación y la velocidad específica de crecimiento se puede pensar en optimizar el sistema, el objetivo es disminuir el tiempo en el cual empiezan a aparecer los productos y aumentar los rendimientos, en la medida en que la biomasa también está en mayor cantidad. El tiempo en el cual se transfiere el inóculo, está en relación con la cantidad de producto obtenido (Montoya, 1989). CRECIMIENTO MICROBIANO Durante un cultivo por lotes el medio nutritivo es inoculado con un cultivo semilla; los microorganismos toman selectivamente los nutrientes disueltos en el medio y los convierten en biomasa y/o productos. Un cultivo típico por lotes incluye diversas fases: 1. Fase lag: Ocurre inmediatamente después de la inoculación y es un período de adaptación de las células a su nuevo ambiente. Durante este período la biomasa se incrementa muy poco, y no existe reproducción celular. La duración de la fase lag puede verse afectada por la baja concentración de algunos nutrientes y/o factores de crecimiento, tales 122 2. 3. 4. 5. 6. como: concentración de Mg+2, concentración de CO2, edad del inóculo, composición del medio de cultivo, tamaño del cultivo y viabilidad del cultivo. Fase de crecimiento exponencial: También conocida como fase de crecimiento logarítmico o de crecimiento balanceado. En esta fase, las células ya adaptadas a su nuevo ambiente, crecen y se reproducen rápidamente. Fase de desaceleración del crecimiento: Sigue a la fase de crecimiento exponencial. El crecimiento se desacelera debido al agotamiento de uno o más nutrientes esenciales o a la acumulación de subproductos tóxicos del crecimiento, resultando en un crecimiento imbalanceado. Fase estacionaria: Inicia al final de la fase de desaceleración cuando la velocidad neta de crecimiento es cero (no hay división celular) o cuando la velocidad de crecimiento es igual a la velocidad de muerte. En esta etapa, las células aún son metabólicamente activas y se estimula la producción de metabolitos secundarios. Fase de muerte o declinación: Sigue la fase estacionaria y es causada por agotamiento de nutrientes o sobreacumulación de productos. Las células muertas suelen lisarse liberando sustancias intracelulares al medio de cultivo. Fase de crecimiento críptico: En fermentaciones limitadas por sustrato, suele presentarse una segunda etapa de crecimiento, debido a la liberación de las sustancias intracelulares de las células muertas, las cuales son aprovechadas por las células vivas como sustrato (Caicedo, 1997). Cantidad de biomasa Fase estacionaria de muerte Fase Fase de desaceleración del crecimiento Fase de crecimiento exponencial Fase lag Tiempo Otro aspecto a considerar es que la actividad metabólica de las células modifica la composición del medio en el cual crecen y uno o varios cambios pueden eventualmente hacer disminuir la velocidad de crecimiento, dependiendo de las modificaciones iniciales y de las propiedades de las cepas, entre estos están: El agotamiento de algún nutriente, la acumulación de compuestos tóxicos como producto del metabolismo y el cambio en el equilibrio iónico, fundamentalmente el pH. 123 Factores que afectan la velocidad de crecimiento 1. Efecto de la concentración de sustrato: Para un medio fresco, con todos los nutrientes excepto uno en exceso, la velocidad de crecimiento es una curva de tipo hiperbólico, con saturación. 2. Temperatura: Cuando se eleva la temperatura hacia el óptimo, la velocidad se dobla aproximadamente por cada 10ºC de incremento de temperatura. Por encima de la temperatura óptima, la velocidad específica de crecimiento (µ) baja y puede ocurrir muerte térmica. Otro aspecto importante aquí, es la temperatura óptima de formación de producto, ya que ésta, puede ser diferente a la temperatura óptima de crecimiento. 3. pH: Afecta la actividad de las enzimas y por tanto la velocidad de crecimiento microbiano. El pH óptimo de crecimiento también puede ser diferente del pH óptimo de formación del producto. Generalmente, el rango de pH que un microorganismo puede soportar es de 1 a 2 unidades de pH, aunque con adaptación gradual puede llegar a soportar variaciones mayores (Caicedo, 1998). Para regularlo se utilizan soluciones de agua amoniacal y sulfato amónico, ácido sulfúrico, amoniaco y carbonato o bicarbonato sódico (Cate et al., 19??). 4. Oxígeno disuelto: Es un sustrato importante en cultivos aeróbicos y puede ser limitante. En este caso, la velocidad específica de crecimiento varía de acuerdo con la cinética de saturación y tiene como punto de referencia la concentración crítica de oxígeno (Ccrít). 5. CO2 disuelto: En concentraciones muy altas puede ser tóxico, en concentraciones muy bajas puede afectar algunas funciones metabólicas. 6. Fuerza iónica: Afecta las funciones metabólicas y la solubilidad de nutrientes como el oxígeno, así como el transporte de iones hacia el exterior de la célula. 7. Potencial redox: Afecta la velocidad y alcance de muchas reacciones de oxido-reducción. 8. Concentración de sustratos: Altas concentraciones de sustrato pueden causar inhibición, así por ejemplo, una concentración de glucosa mayor o igual a 200 g/l inhibe por reducción de la actividad acuosa y una concentración de cloruro de sodio mayor a 40 g/l inhibe por alta presión osmótica (Caicedo, 1998). Puede un microorganismo como el Saccharomyces cerevisiae dejar de crecer si acumula etanol intracelularmente? Es viable que esto suceda? _______________________________________________________ _______________________________________________________________ ________________________________________________________________ ________________________________________________________________ 124 ________________________________________________________________ ________________________________________________________________ ________________________________________________________________ ________________________________________________________________ ________________________________________________________________ ________________________________________________________________ ________________________________________________________________ ________________________________________________________________ ________________________________________________________________ 125 LECCION DIECISEIS MODELOS CINÉTICOS DE CRECIMIENTO CELULAR Y FORMACIÓN DE PRODUCTO Una de las relaciones que más interesa en procesos fermentativos, es la variación de la concentración del biocatalizador (célula) con el tiempo, ya que de ella depende el rendimiento y productividad del proceso. Dentro de los modelos de crecimiento propuestos para células se encuentran: Modelo Segregado Observaciones Las células presentan diferentes tiempos de reproducción, edad, viabilidad y estados metabólicos No segregado Considera que todas las células Es un modelo más simple. se comportan exactamente igual Útil cuando no es muy o que presentan características claro el proceso de medias crecimiento o cuando la población es homogénea Estructurado Considera los detalles de las Intenta describir la forma reacciones que existen dentro de y cinética de interacción las células entre los componentes del medio de cultivo No estructurado Considera la célula como una Interactúa con el caja negra. Las diferentes ambiente y no importa actividades de la biomasa se que pasa en su interior. consideran explicadas o Su uso es válido especificadas por una sola únicamente para variable crecimientos en fase exponencial Estocástico Considera la distribución Útiles para procesos con probabilística de las población celular baja características celulares de (< 104 cel/ml) tales como, interés cinéticas de esterilización Determinístico Considera datos o variables No considera mutaciones determinados Fuente: Elaborado a partir de los datos dados por Caicedo, 1998 126 Características Considera cada célula como una identidad independiente Para ejemplificar lo anterior, enuncie tres modelos cinéticos de crecimiento celular y formación de producto. ____________________________________________________________ ________________________________________________________________ ________________________________________________________________ ________________________________________________________________ ________________________________________________________________ ________________________________________________________ Es posible determinar la biomasa o masa celular (X) durante diferentes tiempos de fermentación utilizando modelos matemáticos; así, por ejemplo: Durante la fase de crecimiento exponencial en un reactor por lotes la velocidad de crecimiento es constante e independiente del cambio de la concentración de los nutrientes esenciales o sustratos para el crecimiento y se puede escribir: dX = µX dt donde X es la masa molecular, dX/dt es la variación de masa celular con respecto al tiempo y µ es la velocidad específica de crecimiento de las células. Integrando desde el fin de la fase lag (X = Xo y t =tlag) hasta cualquier punto en la fase exponencial (X, t): x t ∫ (dX/X) = µ ∫ dt tlag xo se tiene: X = Xo exp (µ(t-tlag)) Durante el crecimiento exponencial, µ es constante y al graficar el ln de la concentración celular vs tiempo, se obtiene una recta con pendiente µ Si dX/dt = µX ⇒ El tiempo de duplicación cuando X2 = 2 X1 es: 127 X2 ∫ dX/X = µ ∆t X1 ln 2X1/X1 = µ ∆t Cuando el crecimiento celular está en fase exponencial, µ es constante, entonces: ln 2/ ∆t = µ Modelo de Monod: La reacción de Monod se cumple a velocidades altas de crecimiento, como es el caso del cultivo continuo o quimiostato, en donde se supone que (µ), velocidad específica de crecimiento, es continua y se halla en la fase exponencial de crecimiento. Para conocer el comportamiento del modelo de Monod, dibuje la gráfica propuesta por él para relacionar el crecimiento del microorganismo con la concentración del sustrato. y escriba la ecuación que describe este comportamiento: donde Ks es ________________________________________________________________ ________________________________________________________________ ________________________________________________________________ ________________________________________________________________ Así la velocidad de crecimiento específica es función de la concentración de sustrato. Para Ks bajo, la velocidad de crecimiento específica durante la fase 128 logarítmica de crecimiento es constante. La transición de latencia a crecimiento logarítmico es bastante rápida o abrupta cuando el sustrato residual (s) es bajo. La alta concentración celular utiliza rápidamente el remanente de sustrato (s) y por esta razón es muy difícil determinar Ks en cultivos por lotes. Es posible emplear la cinética con bajos niveles de sustrato inicial antes de un cambio significativo en la concentración del mismo. Ks se emplea más en cultivo continuo. El modelo de Monod es empírico y fué determinado experimentalmente (Montoya, 1989). LOS MICROORGANISMOS EN LA INDUSTRIA Desde el punto de vista industrial, el sustrato se debe considerar como la materia prima y los microorganismos como el proceso de transformación que da origen a nuevos productos. Por lo tanto, la reacción general del proceso puede escribirse así: Sustrato + microorganismo producto proceso catabólico o anabólico Sólo cuando el microorganismo es capaz de convertir materias primas baratas en productos útiles, es posible con fines industriales, realizar la reacción a gran escala y para ello se necesita definir los siguientes prerrequisitos: Microorganismo a utilizar: Debe ser capaz de producir o transformar grandes cantidades de producto, ser estable frente a las diferentes condiciones de trabajo, ser capaz de desarrollarse rápida y vigorosamente y no ser patógeno. Medio a utilizar: Incluye el sustrato del cual el microorganismo producirá el nuevo producto, debe ser barato y fácilmente obtenible en grandes cantidades. En ocasiones es posible aprovechar desperdicios que contienen material nutritivo, tales como: suero lácteo, líquidos de desecho que resultan del cocinado de la madera y líquidos de desecho con sulfitos. Producto a obtener: El producto obtenido por el metabolismo de los microorganismos queda en una mezcla heterogénea que contiene células microbianas, componentes poco comunes del medio y algunos productos del metabolismo distintos a los que se planea obtener. Cuando se hace a gran escala, exige poner en marcha métodos de recuperación y purificación para lograr un buen producto final (Pelczar et al., 1990). 129 METABOLISMO MICROBIANO El objetivo principal del metabolismo microbiano es crecer y mantenerse. Los microorganismos crecen y se alimentan extrayendo nutrientes, electrones y energía del ambiente. Los nutrientes son el C, N, P, S y oligoelementos que conforman la base de los constituyentes celulares: carbohidratos, aminoácidos, lípidos y ácidos nucleicos. Los electrones son necesarios para reducir los nutrientes a la forma química utilizada por los constituyentes celulares y para generar la energía necesaria que posibilite la síntesis y el mantenimiento de la biomasa (Morris et al., 1998). Ahora bien, en todos los seres vivientes se desarrollan complejos procesos vitales que pueden dividirse en procesos que requieren energía o suministran energía. Los procesos anabólicos de asimilación o de síntesis, requieren energía para poder desarrollarse. En el caso de las plantas, esta energía la suministran directamente las radiaciones solares; en los animales y la gran mayoría de los microorganismos son los procesos catabólicos, de degradación, los que facilitan la energía necesaria. Estos procesos de degradación reciben el nombre de respiración, fermentación y glucólisis, y consisten esencialmente en procesos de oxidación mediante sucesivas dehidrogenaciones de glúcidos y otras sustancias orgánicas (aminoácidos, ácidos grasos, etc.). La respiración de las células requiere la intervención del oxígeno atmosférico, al final del proceso de dehidrogenación, como aceptor final del hidrógeno extraído de los sustratos. Proceso básico Es la transferencia de electrones desde un sustrato donante (SD) hasta un sustrato receptor (SR). El sustrato donante puede oxidarse y emitir electrones; algunos de éstos son transportados por un cosustrato interno reducido (CIR) hasta un sustrato receptor, generando energía en forma de adenosintrifosfato (ATP), un compuesto de almacenamiento de energía, empleado para satisfacer las necesidades de mantenimiento de las células. El resto de los electrones y parte del ATP se emplean para generar biomasa nueva (Morris et al., 1998). 130 SD 2e - CIox 2 CIR SDox Síntesis de biomasa Nutrientes ADP + 2 e e SR - ATP Pi SRred Mantenimiento de biomasa Como la transferencia de electrones entre los sustratos donantes y receptores es esencial para crear y mantener la biomasa, estos materiales se denominan sustratos primarios. Ahora bien, una vez se tenga una biomasa activa, se podrá producir cualquier reacción de biotransformación, siempre que los microorganismos posean las enzimas necesarias para catalizar la reacción. Sustrato secundario: Cuando existen otros materiales que sirven como sustrato primario, un compuesto específico se puede biodegradar como sustrato secundario, es decir, como un sustrato cuya oxidación (o, a veces, reducción) produce un bajo flujo de electrones y energía que se muestra incapaz de mantener la biomasa que lo degrada. 131 Sustratos secundarios Sustrato de baja concentración Sustratos de electrones que pueden aportar flujos de electrones y energía al metabolismo celular. La velocidad que presentan estos flujos es menor que el flujo mínimo necesario t l bi ti Cometabolito clásico Describe un compuesto cuya transformación no puede generar flujos de energía y electrones. Generalmente, se transforma mediante metabolismo incidental, es decir, mediante una enzima que normalmente reacciona con un compuesto diferente, pero relacionado, que cataliza un paso de transformación sencillo para el cometabolito. Moduladores: Compuestos que pueden afectar la cinética de transformación y éstos pueden ser cosustratos, limitantes del sustrato e inductores. 1. Cosustratos: La mayoría son receptores o donantes de electrones, reaccionan directamente con el compuesto degradado (o quizas con un intermediario metabólico) en el punto de reacción de la enzima. La reacción no forma parte del flujo de electrones que necesita la biomasa, sino que reaccionan directamente con el sustrato específico. 2. Limitantes de los sustratos: Disminuyen la velocidad de las reacciones catalizadas por las enzimas mediante su reacción directa con la enzima. Entre ellos están los que originan la limitación competitiva, donde el limitante compite para acceder al centro activo de la enzima; y los que originan la limitación no competitiva, ya que el limitante se une a la enzima en un lugar diferente al centro activo, pero lo hace de tal forma que dificulta la capacidad de reacción hacia el sustrato específico. La 132 autolimitación, es un caso especial de la limitación y se debe a que las altas concentraciones de un sustrato limitan su propia degradación. 3. Inductor: Controla la formación de las enzimas que llevan a cabo las reacciones de transformación (Morris et al., 1998). Para adquirir una mayor compresión sobre la naturaleza y origen de los productos obtenidos en un proceso microbiológico, represente gráficamente dos de los procesos metabólicos solicitados, indicando la estructura química de cada sustancia obtenida, su nombre común, la enzima que actúa en cada paso y la coenzima requerida. Utilice colores para visualizar claramente los cambios presentados en cada paso: 1. Obtención bioquímica de ácido butírico 2. Obtención bioquímica de butanol 3. Obtención bioquímica de acetona 4. Obtención bioquímica de isopropanol 5. Obtención bioquímica de 2,3-butanodiol 6. Obtención bioquímica de ácido cítrico 7. Obtención bioquímica de ácido itacónico Además conteste las siguientes preguntas: 1. ¿Cuál es la relación de moles de oxígeno consumidos a moles de producidos cuando se respira glucosa? CO2 _______________________ _____________________________________________________ _____________________________________________________ _____________________________________________________ _____________________________________________________ _____________________________________________________ _____________________________________________________ 2. ¿Qué le ocurre a la relación anterior cuando se utilizan las grasas como el combustible de la respiración celular? _____________________________________________________ _____________________________________________________ _____________________________________________________ _____________________________________________________ _____________________________________________________ 133 TERMODINÁMICA DEL CRECIMIENTO MICROBIANO Sistema termodinámico: Una reacción química, una célula o un organismo completo. Entorno del sistema: Todo aquello que no sea parte del sistema definido. La primera ley de la termodinámica establece que la energía del universo, esto es, el sistema más su entorno, es constante. Dentro de un sistema dado son posibles cambios netos de energía, así: 3. La energía absorbida en la reacción directa es exactamente igual a la energía liberada en la reacción inversa. 4. El cambio de energía interna del sistema, ∆E, antes y después del proceso se puede expresar como: ∆E = q - w donde q se define como el calor que el sistema absorbe de su entorno y w se define como el trabajo hecho por el sistema sobre su entorno. En términos matemáticos, el trabajo se puede definir como: w = P∆V + w’ donde P es igual a la presión, ∆V es el cambio en el volumen que tiene lugar durante el proceso y w’ representa el trabajo diferente al trabajo de presión-volumen. Para la mayor parte de estas reacciones, w’ = 0. Dada esta restricción, al sustituir la segunda ecuación en la primera y reacomodando se tiene: qp = ∆E + P∆V donde qp es el calor absorbido a una presión constante. Como cualquier combinación de las funciones de estado debe ser también una función de estado, qp es por consiguiente una función de estado, que se denomina el cambio de entalpía (∆H): ∆H = ∆E + P∆V. En los sistemas biológicos, el volumen permanece prácticamente constante. Así, ∆H y ∆E son equivalentes efectivamente. Proceso exotérmico: Proceso en el cual el sistema desprende calor y ese calor pasa al entorno. El ∆H es negativo. Proceso endotérmico: Proceso en el cual el calor es absorbido por el sistema a partir de su entorno. El ∆H es positivo. El criterio para espontaneidad se encuentra en la segunda ley de la termodinámica. Ella establece que en todo proceso espontáneo, la entropía (S) del universo (el sistema más su entorno) se incrementa. En los sistemas metabólicos, las fuerzas de la entropía son contrarrestadas por los procesos celulares creadores de orden. Las vías metabólicas existen en un estado estable que está lejos del estado de equilibrio. Así, por ejemplo: A 134 B C Si se considera que no hay otros reactantes, sólo B en este sistema puede estar en un estado estable. El estado estable ocurrirá si la velocidad de formación de B a partir de A es igual a la velocidad de utilización de B para formar C. Con el tiempo, la concentración de B en un estado estable no cambiará, pero A se puede agotar, y C se puede acumular. Entonces, la concentración de B es mantenida a expensas del cambio continuo en las concentraciones de A y C. Un criterio útil para estimar la espontaneidad de los procesos fue desarrollado por J. Willard Gibbs. La nueva función de estado, denominada el cambio de energía libre de Gibbs (∆G), se define en términos de H y S para los procesos que tienen lugar a presión constante y es una medida de la energía disponible para trabajar dentro de un sistema: ∆G = ∆H - T∆S donde T es la temperatura absoluta y ∆G se expresa en unidades de Kcal/mol. Procesos exergónicos: ∆G < 0. El proceso es espontáneo y se puede llevar a cabo en ausencia de energía proporcionada por el exterior del sistema. Procesos endergónicos: ∆G > 0. El proceso no puede tener lugar espontáneamente, requiere del suministro de suficiente energía externa. Proceso en equilibrio: ∆G = 0. Las concentraciones de los reactantes y de los productos están en equilibrio y las velocidades de las reacciones en ambos sentidos son iguales. El cambio de energía libre de una reacción depende de las condiciones bajo las cuales se efectúa la reacción. Por consiguiente, es útil tener un conjunto de condiciones de reacción de referencia establecidas en forma convencional. Estas condiciones de referencia se conocen como estado estándar (∆Gº’). Para una reacción, el cambio de energía libre se puede calcular como sigue: ∆G reacción = ΣG productos - ΣG reactantes Cuando el sistema se encuentra en equilibrio: ∆Gº’reacción = -2.303 RT log Keq Si se conoce ∆Gº’ para la reacción, la ecuación permite calcular Keq y viceversa. 135 Para una reacción que no está en equilibrio: Se observa una relación diferente de productos a sustratos (Q) y el cambio de energía libre se deriva de: ∆G = ∆Gº’ + 2.303 RT log Q donde Q es la relación de acción de masas. En otras palabras, el cambio de energía libre es una medida de lo lejos que está el sistema que reacciona del equilibrio. En consecuencia, es ∆G y no ∆Gº’, el criterio para evaluar la espontaneidad de una reacción y por consiguiente su dirección dentro de un sistema en particular. Entonces, las reacciones metabólicas se pueden dividir en: 3. Reacciones cerca del equilibrio: Reacciones en las cuales Q tiende a Keq. Las enzimas que catalizan las reacciones cerca del equilibrio son capaces de restablecer con rapidez los niveles de sustratos y productos a estados cercanos al equilibrio debido a la gran actividad enzimática que existe. 4. Reacciones metabólicas irreversibles: Reacciones en las cuales Q esta lejos de Keq. En las células las enzimas que catalizan las reacciones metabólicas irreversibles existen en cantidades limitantes, insuficientes para lograr estados cercanos al equilibrio para estas reacciones. Todos los puntos de control de las vías son reacciones metabólicamente irreversibles (Horton et al., 1995). Proyecte sus conocimientos discutiendo la siguiente afirmación: “La producción de calor en sistemas biológicos es usada como parámetro energético característico del crecimiento y puede utilizarse para calcular el crecimiento empleando el balance de entalpía”. _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ 136 _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ PRINCIPALES MICROBIANO CLASES DE PRODUCTOS DEL METABOLISMO Los productos del metabolismo microbiano han venido cobrando importancia porque: 1. Son utilizables por sí mismos 2. Son utilizables como precursores para la síntesis de otras sustancias 3. Muchos pueden competir desde un punto de vista económico con la síntesis química, tal es el caso de los metabolitos con una configuración estereoespecífica. Teniendo en cuenta los productos metabólicos obtenidos y la aplicación de los mismos, las industrias biotecnológicas se pueden agrupar en: 1. Industrias productoras de bebidas alcohólicas: Son las industrias microbiológicas más grandes y antiguas. Entre ellas están las cervecerías y vinaterías, así como las fábricas de otras bebidas alcohólicas. 2. Industrias productoras de alimentos fermentados: También son industrias antiguas, pero en su gran mayoría no muy grandes. Entre éstas se incluyen las empresas elaboradoras de productos fermentados lácteos, cárnicos, de frutas, verduras y panadería. 3. Industrias productoras de sustancias quimico-farmacéuticas: Las productoras de antibióticos y esteroides son las más prominentes en esta categoría. Sin embargo, hay otras sustancias para uso terapéutico que pueden ser producidas por microorganismos. 4. Industrias productoras de suplementos alimenticios: Entre ellas están, la producción masiva de levaduras y algas en medios que contengan sales inorgánicas nitrogenadas y sustratos baratos, son una buena fuente de proteínas y de productos orgánicos útiles como suplementos alimenticios. Además, un proceso interesante, empleado en muchos países, es la producción industrial de aminoácidos de origen microbiano. 5. Industrias productoras de sustancias químicas valiosas comercialmente: Varios preparados con enzimas microbianas tienen aplicaciones industriales, y en consecuencia, son fabricadas a gran escala. En otro tiempo, los procesos microbiológicos para producir acetona y alcohol butílico fueron importantes. 137 6. Industrias productoras de vacunas (antígenos inmunizantes): El cultivo masivo de microorganismos para ser usado en vacunas puede considerarse como una empresa industrial. 7. Industrias orientadas a mantener el medio ambiente: Teniendo en cuenta que los microorganismos juegan un papel importante en el deterioro de materiales como pieles, textiles, hule, metales, lana, suero, aguas residuales, sustancias orgánicas, etc. cada vez más, se desarrollan procedimientos para mantener los diferentes ecosistemas. 8. Industrias para procedimientos analíticos: Se han adoptado técnicas analíticas biotecnológicas para determinar vitaminas, aminoácidos, azúcares y antibióticos, entre otros, las cuales son muy empleadas por los fabricantes. 9. Industrias para la producción de productos energéticos: Con la escasez de gas natural, petróleo y carbón, la economía mundial habrá de reorientarse progresivamente. Hasta ahora, únicamente el metano o “biogas” y el etanol se han mostrado como sustancias prometedoras para ello. Para visualizar la naturaleza de las industrias anteriores, elija una de su interés (asegúrese de no conocerla) y elabore un documento que incluya: proceso industrial, diagrama de flujo, aplicaciones del producto, empresas que trabajan dentro y fuera del país en el campo, así como proyección nacional e internacional. _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ Considerando que los científicos están hablando de elaborar alimentos que sirvan para inmunizar la población frente a determinadas enfermedades y que la producción de vacunas es una industria interesante, documéntese sobre el tema y describa el proceso a seguir, utilizando un diagrama en árbol. Emplee como punto de partida las bases de datos. www.unad.gov.co (biblioteca hemeroteca). 138 _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ Algunos productos industriales (diferentes a los antibióticos) producidos por bacterias son: Producto Butanol-acetona Clostridium acetobutylicum y otros. Usos Solventes, manufactura química 2,3-butanodiol Bacillus polimixa, Ent. aerogenes Solvente, humectante, intermediario químico Dihidroxiacetona Gluconobacter suboxydans Químico fino Ácido 2-cetoglucónico Pseudomonas sp. Intermediario para el ácido D-arabo-ascórbico Ácido 5-cetoglucónico G. suboxydans Intermediaria para el ácido tartárico Ácido láctico Lactobacillus delbrueckii Productos alimenticios, textiles y lavanderías, manufactura química, curtido de pieles Amilasa bacteriana Bacillus subtilis Modificador de almidones, encolado de papel; desencolado de textiles Proteasa bacteriana B. subtilis Laminado de pieles, desencolado de fibras, quita manchas, ablandador de carnes 139 Microorganismo Dextrán Sorbosa Leuconostoc mesenteroides Estabilizador de productos alimenticios, sustituto de plasma sanguíneo G. suboxydans Manufactura de ácido ascórbico Cobalamina Streptomyces olivaceus: Propionibacterium freudenreichii Tratamiento de la anemia perniciosa; suplemento alimenticio Ácido glutámico Brevibacterium sp. Aditivo de alimentos Lisina Micrococcus glutamicus Aditivo de la alimentación animal Estreptoquinasaestreptodornasa Streptococcus hemolyticus Uso médico (disolvente de Fuente: Pelczar et al., 1990 140 coágulos sanguíneos) Algunos productos industriales producidos por levaduras son: Product Microorganism Método de preparación o o Cerveza S. cerevisiae o S. Cebada, malta y almidones carisbergensis juntos mezclados con agua caliente; después de la conversión enzimática del almidón, la cerveza nueva se filtra; luego se hierve con lúpulo y finalmente se fermenta con levadura Ron S. cerevisiae u Se añaden como alimentos otras levaduras melazas que contengan 12 14% de azúcar fermentable; sulfato de amonio y ocasionalmente fosfatos; se destila después de la fermentación Whisky S. cerevisiae La masa de granos cocinados (generalmente escocés se sacarifica con malta levadura tratada con carbón y se especial) fermenta; la tanda destilada y el destilado se añejan en barricas de roble durante 3 años por lo menos; después se mezclan con whisky en grano Bourbon S. cerevisiae La masa de granos compuesta de maíz (al 136 Factores que influyen en la reacción Aerobiosis en los estados primarios, pero pronto se hace anaeróbico, temp. 8 12ºC, pH al principio 5.0 5.4; al final 4.0 - 4.8; la fermentación primaria por lo menos 5-9 días Función de los microorganismos Transforma azúcar en alcohol y dióxido de carbono; produce cambios en las proteínas y otros constituyentes menores que modifican el sabor pH óptimo = 4.0 - 4.7 T inicial = 21ºC elevándola a la T final de 35.5ºC; fermentación por lo menos 3 - 7 días Transforma azúcar en alcohol, el cual se obtiene después por destilación pH óptimo = 4.0 - 5.0 T inicial = 26ºC la fermentación se completa en 72 hs Produce alcohol y sustancias congéneres (ácidos, ésteres, varios alcoholes) que con la malta carbonosa dan el característico sabor del whisky escocés Lo mismo que para el whisky escocés Lo mismo que para el whisky escocés, pero el Vino 137 S. ellipsoideus, varias cepas menos 51%); generalmente se fermenta con centeno cocido y se sacarifica con malta, se destila entre 110 y 130 grados, se madura en barricas de centeno carbonoso Las uvas deben tener concentración de azúcar superior al 22%; al licor se le agrega sulfito par reducir el índice de fermentación; se deja fermentar con cepas especiales de levaduras, o con las levaduras que existen en las uvas en forma natural; a la fermentación primaria sigue un periodo de almacenaje para maduración sabor es el característico del bourbon Aerobiosis en los estadios iniciales, pero principalmente anaerobiosis después T inferior a 29.4ºC, pero varía de acuerdo con las condiciones locales, cepa de levadura y tipo de vino; la fermentación dura 7-11 días Transforma el azúcar en alcohol y también produce cambios en los componentes menores que modifican el sabor y bouquet; la cantidad de alcohol varía según el tipo de vino Los hongos se usan para elaborar antibióticos, algunos productos alimenticios, en la industria química y en la obtención de enzimas. Algunos productos industriales producidos por hongos son: Producto Ácido cítrico Ácido fumárico Ácido glucónico Ácido itacónico Pectinasas 11-γ-hidroxiprogesterona (diferentes Microorganismo Aspergillus niger o A. wentii a los antibióticos) Usos Productos alimenticios, citratos medicinales, en sangre para transfusiones Rhizopus nigricans Manufactura de resinas alquídicas, agentes humectantes A. niger Productos farmacéuticos, textiles, curtido de cueros, fotografía A. terreus Manufactura de resinas alquídicas, agentes humectantes A. wentii o A. aureus Agentes clarificantes en la industria de jugos de frutas R. arrhizus, R. nigricans y otros Ácido giberélico Intermediario para 17-γhidroxicorticoesterona Fusarium moniliforme Guarnición de frutas, producción de semillas R. oryzae Alimentos y productos farmacéuticos Ácido láctico Fuente: Pelczar et al., 1990 Para ampliar su conocimiento sobre el uso de microorganismos a nivel industrial. 2. Busque en una revista especializada, un artículo en inglés, que corresponda a la elaboración de cualquiera de los productos 37 anteriores y en él analice la estructura del texto, determine la finalidad del documento y subraye las partes importantes. 3. Construya una guía de trabajo que permita estudiar el proceso de inmovilización de un microorganismo. 38 LECCION DIECISIETE TECNOLOGÍA DE FERMENTACIÓN En biotecnología, el término fermentación se emplea en un sentido más amplio de lo que se usa en la bioquímica clásica. Así, en general todos los procesos que implican un crecimiento microbiano; ya sean anaeróbicos, o aeróbicos, independientemente del sustrato que sea utilizado como fuente energética, son denominados fermentaciones. La fermentación describe el crecimiento y la formación de productos por microorganismos, no solamente en cuanto a células activas, sino también en cuanto a restos de células, ya que muchos productos de interés comercial se producen después de que el crecimiento ha pasado. El estudio de las fermentaciones no solo está limitado a los aspectos de crecimiento sino que también incluye el pH, temperatura, nutrientes y en general, las condiciones adecuadas para el cultivo microbiano (Montoya, 1989). TIPOS DE FERMENTACIONES Los cultivos microbiológicos pueden clasificarse en: Sistemas abiertos: En un sistema abierto todos los materiales que componen el sistema pueden entrar y salir simultáneamente, lo cual permite que éste entre en contacto con el ambiente. Un proceso de flujo continuo, en el cual se introduce medio fresco a una velocidad uniforme, para obtener biomasa y otros productos, es un ejemplo de sistema abierto; en él, la velocidad de conversión del sustrato, producto y biomasa es constante, debido a que es posible fijar la velocidad de crecimiento entre cero y un valor máximo. Sistemas cerrados: En un proceso cerrado ninguna de las partes esenciales del sistema puede entrar y salir a la vez y por lo tanto, no existe relación con el medio exterior. Un cultivo tradicional o de lote en el cual la cantidad de nutrientes está limitada, es un ejemplo de sistema cerrado; en él, la velocidad de crecimiento de biomasa (tiende a cero) ya sea por falta de nutrientes o por acumulación de algún producto no tolerado por el microorganismo; por esta razón los sistemas se encuentran siempre en estado transitorio. Para mayor comprensión, presente ejemplos de cada uno de los sistemas: _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ 39 _______________________________________________________ _______________________________________________________ Los procesos fermentativos pueden ser: Procesos discontinuos Son los llamados procesos en lote, tienen gran importancia comercial por su amplio uso. Las técnicas de instalación de los cultivos discontinuos van a depender de si el proceso es aeróbico o anaeróbico. 1. Fermentaciones aeróbicas: Pueden llevarse a cabo como cultivos en superficie o como fermentaciones en cultivos sumergidos Cultivos en superficie: Se realizan en recipientes planos de poca profundidad (bandejas), dentro de los cuales se coloca el medio de cultivo, que puede ser líquido o sólido. Finalmente el medio se inocula con esporas del microorganismo correspondiente y se cultiva a temperatura apropiada. Cultivos sumergidos: se realizan sobre sustratos líquidos en recipientes herméticamente cerrados y provistos de un eficiente sistema de agitación y oxigenación. 2. Fermentaciones anaeróbicas: Se realizan en recipientes cerrados, semejantes a los utilizados para la fermentación en sumergido pero en lugar de aire se inyecta gas carbónico, o cualquier gas inerte, para suministrar una atmósfera libre de oxígeno. En los procesos por lotes, si se da el sistema de parámetros variables, no se pueden controlar las reacciones, debido a que la concentración del sustrato es función del tiempo. Procesos continuos Las técnicas de cultivo continuo han sido desarrolladas en las últimas décadas y pueden ser: 1. Cultivo de flujo tapón: El cultivo viaja sin mezclarse a través de un tubo o canal. Este sistema se emplea en el caso de inmovilización de células o enzimas, cuando se trata de columnas empacadas. 2. Quimiostato: Consta de un tanque agitado con una suspensión de biomasa perfectamente mezclada y homogénea, que se alimenta con medio fresco a una tasa constante; el caldo de fermentación es extraído a la misma velocidad de modo que el volumen permanece constante. La importancia fundamental del quimiostato es que se puede fijar la velocidad específica de crecimiento entre cero y un valor máximo (Montoya, 1989). La relación de 40 la velocidad a la cual el medio nuevo se agrega al cultivo (f), con el volumen operativo del cultivo (V), es lo que se denomina índice de dilución (D): D = f/V. El índice de dilución corresponde al número de volúmenes de medio que pasan a través del frasco de cultivo en el término de una hora. Su inversa, 1/D, es la media del tiempo de residencia de un microorganismo en el frasco de cultivo. En el quimiostato los microorganismos se están multiplicando pero también están siendo “lavados” del tanque de cultivo. Por consiguiente el cambio neto en el número de microorganismos en el tiempo está determinado por las tasas relativas de crecimiento y “lavado”: dX/dt = µX - (f/V) (Joklik, 1995). Las ventajas del cultivo continuo se fundamentan principalmente en: 1. La velocidad específica de crecimiento puede establecerse (dentro de los límites de microorganismos) de acuerdo con las necesidades del experimento. Se puede seleccionar un estado de actividad metabólico particular y el control de éste. 2. Se pueden obtener células de un estado definido independiente del tiempo. 3. Con equipo de laboratorio se puede producir, comparativamente gran cantidad de material celular definido. Las variables susceptibles de ser estudiadas en un cultivo continuo son: 1. Variables independientes: Tiempo (t), velocidad de crecimiento (µ), concentración del sustrato (S), sustrato limitante, concentración del producto, cultivo mixto, pH, temperatura (T), aireación-agitación (KLa), inhibidores (I), inductores de enzimas y agentes mutagénicos. 2. Variables dependientes: Tasas metabólicas (Qi), concentración celular (X), composición celular, excreción celular, morfología celular, velocidades de mutación, patrones metabólicos, selección de microorganismos, tiempo de expansión del mutante y virulencia. Para mayor entendimiento, presente ejemplos de cada uno de los procesos: _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ 41 VARIABLES QUE SE DEBEN CONTROLAR EN UNA FERMENTACIÓN Las variables que se deben controlar para lograr un efectivo conocimiento y por consiguiente el control y la manipulación del proceso, en una fermentación de interés económico o científico son: 1. Aquellas que se deben medir continuamente: Temperatura, pH, velocidad de agitación, presión, espuma, oxígeno disuelto, adición de nutrientes. 2. Aquellas que se deben medir intermitentemente: Biomasa, producto y consumo de sustrato. Temperatura: Afecta de manera importante el crecimiento microbiano, de acuerdo con la especie. Así, por ejemplo, los microorganismos crecen en rangos restringidos de temperatura: psicrófilos 5 - 15ºC; mesófilos 25 - 40ºC y termófilos 45 - 60ºC; presentando éstos últimos, un gran potencial de utilización, si se tiene en cuenta que la alta temperatura permite mejor transferencia de calor, velocidades de reacción mayores y menores posibilidades de contaminación. La dependencia de la velocidad específica de crecimiento, respecto a la temperatura puede expresarse como ecuación tipo: µ = A. e-Ea/RT donde, Ea es la energía de activación y A es una constante. Por lo tanto, cuando se grafica log µ vs l/T debe obtenerse una línea recta cuya pendiente es: Ea/2.3R pH. El pH es la medida de la concentración de iones hidrógeno y tiene un marcado efecto tanto en la velocidad de crecimiento como en el rendimiento. Es óptimo para algunas especies, así: las bacterias se desarrollan mejor a un pH entre 6,0 y 8,0; las levaduras entre 4,0 y 6,0, y los mohos entre 3,7 y 7,0. Velocidad de agitación mecánica: La agitación permite mantener una distribución homogénea en el tanque de fermentación, facilita la transferencia de oxígeno, nutrientes y calor. Además, determina la morfología celular: si la agitación muy intensa puede partir el micelio en caso de mohos, y si es muy lenta limita la actividad en el tanque de fermentación. Espuma: Se puede controlar mediante agentes químicos antiespumantes o equipo mecánico de desespumación, asociado al ajuste de la velocidad de aireación. El agente antiespumante empleado debe ser atóxico para el microorganismo y para el consumidor final, eficaz a baja concentración, estable en las condiciones de uso y de precio reducido. Tampoco debe interferir con la recuperación del producto. Entre los agentes antiespumantes se encuentran 42 Vegifat®, DC Antifoam A®, dodecanol, aceite de ricino sulfonado y partes iguales de hexadecanol o tetradecanol y parafina líquida (Cate et al., 19??). Oxígeno disuelto: La oxigenación de la fuente de carbono y su transformación en células, productos y CO2 establece una demanda de oxígeno inicial que se debe satisfacer a través de la aireación y agitación del cultivo; por lo tanto, es indispensable conocer los rendimientos de oxígeno del cultivo y calcular las resistencias a la transferencia que encuentra el oxígeno antes de llegar a la célula, para asegurarse de que su suministro sea suficiente. El mecanismo de transferencia se puede dividir en varios pasos: 1. La transferencia difusional del oxígeno a través de las películas de gas y líquido que rodean la burbuja de aire 2. El camino que siga en la solución 3. El paso a través de la película de líquido que rodea la célula 4. La reacción bioquímica intracelular Se ha demostrado que la mayor dificultad la presenta la película de líquido que rodea las burbujas, pero esto ocurre en caso de organismos unicelulares. En los agregados celulares (pellets) la difusión en el agregado mismo, constituye el paso limitante en la transferencia de oxígeno. La velocidad de transferencia de oxígeno se puede expresar así: Velocidad de transferencia = Coeficiente de transferencia de masa x área x fuerza directriz de masa Velocidad de transferencia de masa = KLa (Cg* - CL) KL representa el coeficiente de transferencia de masa (cm/h), es la concentración de oxígeno en la fase líquida y un área interfacial a, equivale a la relación entre el coeficiente de difusión de oxígeno en el agua y el espesor de la película a través de la cual se efectúa la transferencia; a representa la superficie específica de transferencia (cm2/cm3); Cg* es la concentración de oxígeno en la interfase gas-líquido y es casi igual a la solubilidad; CL es la concentración de oxígeno en el seno de la solución y es proporcional a la presión parcial del oxígeno en la burbuja, se calcula según la Ley de Henry: CL = He.p Siendo He la constante de Henry (n mol = 2/L atmóstera) y p la presión parcial de oxígeno en la fase gaseosa (atmósfera) La contante de Henry varía con la 43 temperatura, haciendo variar la solubilidad que disminuye cuando la temperatura aumenta a 37ºC. La concentración máxima de oxígeno que se puede obtener con el aire como gas de oxigenación es alrededor de 7 ppm (p en el aire = 0.209 atmósferas) ¿Cuáles son los problemas asociados al uso de erlenmeyers agitados cuando se realizan experimentos de procesos fermentativos en el laboratorio? _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ Para aprender a controlar las variables que industrialmente se utilizan en un proceso fermentativo, describa los métodos ofrecidos por el mercado. _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ Antes de continuar y para comprender los cálculos matemáticos que se describen enseguida, es importante que usted recuerde el funcionamiento de los multiplicadores de Lagrange4: 4 www.itpl.edu.mx /publica/tutoriales/investoper2/tema12 44 BALANCE DE MATERIA EN PROCESOS CON CÉLULAS Representando el sistema como una caja negra donde todas las corrientes entran: O2 M5 M3 Producto Biomasa (X) M2 M4 Fuente Fuente de Nitrógeno Carbono – M1 (P) de (N) Sustrato (S) M7 M6 H2O (W) CO2 y expresando las composiciones normalizadas de biomasa, sustrato y producto por átomo de carbono: CHa1Ob1Nc1 CHa2Ob2Nc2 CHa3Ob3Nc3 Cd4Ha4Ob4Nc4 Biomasa Sustrato Producto Fuente de nitrógeno Se pueden plantear los balances de carbón, hidrógeno, oxígeno y nitrógeno así: Elemento Carbón Hidrógeno Oxígeno Nitrógeno 45 X M1 a1M1 b1M1 c1M1 +S M2 a2M2 b2M2 c2M2 +P M3 a3M3 b3M3 c3M3 Balance +N + O2 + CO2 d4M4 M6 a4M4 b4M4 2M5 2M6 c4M4 +W 2M7 M7 Suma =0 =0 =0 =0 Revisando los grados de libertad: Siete variables - cuatro ecuaciones = tres grados de libertad. Aplicando multiplicadores de Lagrange para cada una de las ecuaciones: λC (M1 + M2 + M3 + d4M4 + M6) = 0 λH (a1M1 + a2M2 + a3M3 + a4M4 + 2M7) = 0 λO (b1M1 + b2M2 + b3M3 + b4M4 + 2M5 + 2M6 + M7) = 0 λN (c1M1 + c2M2 + c3M3 + c4M4) = 0 Desarrollando los multiplicadores de Lagrange: M1 (λC + λHa1 + λOb1 + λNc1) + M2 (λC + λHa2 + λOb2 + λNc2) + M3 (λC + λHa3 + λOb3 + λNc3) + M4 (λCd4 + λHa4 + λOb4 + λNc4) + M5 (2λO) + M6 (λC + 2λO) + M7 (2λH + λO) = 0 Llamando los valores obtenidos entre paréntesis, grados generalizados de reducción γi, y simplificando la ecuación, el balance de materia del sistema se puede presentar así: M1γ1 + M2γ2 + M3γ3+ M4γ4 + M5γ5 + M6γ6 + M7γ7 = 0 Suponiendo: γ4 = γ6 = γ7 = 0 y λH = 1 y resolviendo: 0 0 M1γ1 + M2γ2 + M3γ3 + M4γ4 + M5γ5 + M6γ6 + M7γ7 = 0 γ1 γ2 γ3 γ4 γ5 γ6 γ7 = = = = = = = γx = λC + λHa1 + λOb1 + λNc1 γs = λC + λHa2 + λOb2 + λNc2 γp = λC + λHa3 + λOb3 + λNc3 γn = λCd4 + λHa4 + λOb4 + λNc4 γo = 2λO γco2 = λC + 2λO γw = 2λH + λO Como λH = 1 entonces: γ7 = γw = 2(1) +λO = 0 ∴ λO = -2 46 0 γ6 = γco2 = λC + 2(-2) = 0 ⇒ λC = 4 γ4 = γn = (4)d4 + (1)a4 + (-2)b4 + λNc4 = 0 ∴ λN = (2b4 - a4 - 4d4)/c4 Si la fuente de nitrógeno es amoniaco (NH3), Cd4Ha4Ob4Nc4 queda: C0H3O0N1, al reemplazar los valores de a4 = 3, b4 = 0, c4 =1 y d4 = 0 Por lo tanto λN = (2(0) - (3) - 4(0))/1 = -3 Ahora es necesario calcular los valores de los γi restantes: γ1 = γx = 4 + a1 - 2b1 + [(2b4 - a4 - 4d4)/c4]c1 γ2 = γs = 4 + a2 - 2b2 + [(2b4 - a4 - 4d4)/c4]c2 γ3 = γp = 4 + a3 - 2b3 + [(2b4 - a4 - 4d4)/c4]c3 γ5 = γo = 2(-2) = -4 Como el balance se expresó en función de las masas y de los γi, es posible dividirlo por M1 y quedaría presentado así: γ1 + (M2/M1)γ2 + (M3/M1)γ3+ (M4/M1)γ4 + (M5/M1)γ5 + (M6/M1)γ6 + (M7/M1)γ7 = 0 Las relaciones presentadas se conocen como rendimientos (Y), de este modo: YX/S = M2/M1 YO/X = M5/M1 YP/X = M3/M1 YCO2/X = M6/M1 YN/X = M4/M1 YH20/X = M7/M1 Además, como unas corrientes entran y otras salen, la dirección de éstas se representa por αi, de forma tal que las de entrada equivalen a +1 y las de salida a -1, por lo tanto el balance de materia se debe escribir como sigue: α1γ1 + α2γ2YS/X + α3γ3YP/X + α4γ4YN/X + α5γ5YO/X + α6γ6YCO2/X + α7γ7YH2O/X = 0 47 LECCION DIESIOCHO PARA COMPRENDER MEJOR EL BALANCE DE MATERIA, REALICEMOS JUNTOS EL SIGUIENTE EJERCICIO: Industrialmente se dispone de dos métodos para producir etanol. El primero de ellos utiliza Saccharomyces cerevisiae y presenta un YX/S = 0.4; el segundo utiliza Zymomonas mobilis y su YX/S = 0.06. Determinar para cada caso, el porcentaje de rendimiento respecto al teórico cuando la fuente de carbono y energía es glucosa y la fuente de nitrógeno es amoniaco. La reacción metabólica es: 2 CH3CH2OH + CO2 C6H12O6 Cálculo del YP/S teórico: Para definirlo, es necesario plantear la ecuación normalizada y balancearla: 6 CH2O Sustrato CH2O Sustrato 4 CH3O0.5 + 2 CO2 Producto 4/6 CH3O0.5 + 2/6 CO2 Producto Luego el YP/S|Teórico = 4/6 = 0.6667 Balance para el proceso con Saccharomyces cerevisiae: Recordemos que γ4 = γ6 = γ7 = 0 Además como el proceso es anaeróbico no hay masa de oxígeno ∴M5 = 0 0 0 0 α1γ1M1 + α2γ2M2 + α3γ3M3 + α4γ4M4 + α5γ5M5 + α6γ6M6 + α7γ7M7 = 0 Como se conoce YX/S, se debe dividir todo por la masa del sustrato: α1γ1(M1/M2) + α2γ2(M2/M2) + α3γ3(M3/M2) = 0 reemplazando ahora, por los Y correspondientes, se tiene: α1γ1YX/S + α2γ2 + α3γ3YP/S = 0 48 0 Para definir los valores α, se ubican las corrientes de entrada y las de salida: Corrientes de entrada: Biomasa y sustrato ⇒ α1 = α2 = +1 Corriente de salida: Producto ⇒ α3= -1 Entonces: γ1YX/S + γ2 - γ3YP/S = 0 Por lo tanto: YP/S = (γ1YX/S + γ2)/γ3 Bien, ahora se deben calcular los valores de γ1, γ2 y γ3, razón por la cual es necesario definir la composición de cada una de las corrientes: Corriente Fórmula general Fórmula del compuesto Biomasa CHa1Ob1Nc1 CHa2Ob2Nc2 Sustrato CHa3Ob3Nc3 Producto Fuente de nitrógeno Cd4Ha4Ob4Nc4 1 Fuente: Nagai, 19?? Luego: a4 = 3.0 a1 = 1.75 a2 = 2.0 a3 = 3.0 b4 = 0.0 CH1.75O0.45N0.21 C6H12O6 C2H6O NH3 b1 = 0.45 b2 = 1.0 b3 = 0.5 c4 = 1.0 Fórmula a utilizar en el balance CH1.75O0.45N0.2 CH2ON0 CH3O0.5N0 C0H3O0N c1 = 0.2 c2 = 0.0 c3 = 0.0 d4 = 0.0 Como: γ1 = γx = 4 + a1 - 2b1 + [(2b4 - a4 - 4d4)/c4]c1 ⇒ γ1 = 4 + 1.75 - 2(0.45) + [(2(0) - 3 - 4(0))/1.0]0.2 4.25 γ2 = γs = 4 + a2 - 2b2 + [(2b4 - a4 - 4d4)/c4]c2 γ3 = γp = 4 + a3 - 2b3 + [(2b4 - a4 - 4d4)/c4]c3 ∴ γ2 = γS = 4.0 γ3 = γP = 6.0 Reemplazando en YP/S: YP/S = (γ1YX/S + γ2)/γ3 = (4.25 (0.4) + 4)/6 49 γ1 = γx = ⇒ YP/S = 0.95 Cálculo del porcentaje de rendimiento con respecto al teórico, utilizando levadura para producir etanol: Como: % Rendimiento = (YP/S / YP/S|Teórico) * 100 entonces: % Rendimiento = (0.95/0.6667) * 100 = 142.49 Por lo tanto el % Rendimiento respecto al teórico, para la producción de alcohol con levadura es del 142.49 % Muy bien, continúe usted. Asegúrese de aplicar los conocimientos adquiridos para definir el % de Rendimiento en la producción de alcohol con Zymomonas mobilis, considere la composición normalizada de la bacteria equivalente a CH1.8O0.5N0.2. 50 ¿Cuál de los dos rendimientos es mayor? _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ FERMENTADORES Son recipientes para el cultivo de células microbianas, animales o vegetales que buscan producir algún metabolito o bien la biomasa misma. Su función es proporcionar, en forma homogénea, las condiciones químicas y fisicoquímicas en las que el cultivo presente los máximos rendimientos. Tipos de fermentadores 1. Tanque con agitador: Es el tipo de fermentador más usado en el ámbito industrial. Es un tanque cilíndrico con una relación altura / diámetro generalmente mayor a 2, equipado generalmente con cuatro mamparas y 3 a 5 agitadores de turbina (tipo Rushton), con una relación del diámetro del impulsor a diámetro del tanque de 1/3. Por razones mecánicas, el tamaño de estos fermentadores está limitado a volúmenes de 200 m3. 2. Columna de burbujeo: Este tipo de fermentador es usado en la industria para la producción de ácido cítrico, enzimas, ácido láctico, esteroides, levadura de panificación, entre los más importantes. Consiste en un cilindro cuya relación altura / diámetro es mayor a 3. Se encuentra equipado con un distribuidor de aire. Una de las desventajas de este tipo de reactor es la excesiva generación de espuma. 3. Fermentador de recirculación: Las dos variantes más usadas son el fermentador air lift y el fermentador jet de recirculación. El primero es fundamentalmente una columna de burbujeo a la que se le ha agregado un tubo concéntrico por el que se distribuye el aire. El segundo es similar al fermentador air lift solo que, en adición a la corriente gaseosa, el líquido se bombea para crear una velocidad de recirculación mayor. Se usan en la producción comercial de anticuerpos monoclonales, en la producción de proteína unicelular y en los sistemas de tratamiento de aguas (Galindo, 1995) Para conocer información sobre los proveedores latinoamericanos de fermentadores, revise en Internet la información referente a la New Brunswick Scientific Co (U.S.A.) y a las firmas europeas Chemap, A.G., Bioengineering A.G., Braun y Biolafitte. 51 Características de los fermentadores más usados en varias escalas Nivel de escalado del Características fermentador Investigació Matraces agitados de 200 ml. n Pueden utilizarse deflectores, para incrementar la capacidad de transferencia de oxígeno. Se esterilizan en autoclave. Laboratorio Fermentadores agitados de 0.5 a 5 lts con dispositivos de control de temperatura, pH y rompimiento de espuma. Se esterilizan en autoclave. Banco Fermentadores agitados, similares a los de laboratorio, pero con volúmenes de trabajo entre 5 y 15 lts. Se esterilizan en autoclave. 52 Usos • Selección de cepas. • Desarrollo y optimización de medios de cultivo. • Establecimiento preliminar de condiciones de cultivo (como pH y temperatura) • Estudios cinéticos de crecimiento y de formación de productos. • Estudios de correlaciones de transporte y mezclado. No son adecuados para el desarrollo de cultivos viscosos. • Estudios de correlaciones de transporte y mezclado. No son adecuados para el desarrollo de cultivos viscosos. Planta Piloto Fermentadores flexibles con tamaños que oscilan entre tres niveles: 1. 15 y 100 lts 2. 200 y 600 lts 3. 2500 y 3700 lts Cuentan con sellos mecánicos. Se esterilizan mediante inyección de vapor directo Industriales Son fermentadores cuyo volumen de producción varía entre los 100 y los 20000 m3. Se utilizan “estoperas” para lograr la operación estéril de los sistemas de agitación. Fuente: Galindo, 1995 Es una pequeña fábrica en donde se desarrollan y estudian procesos. Producción industrial. Para visualizar mejor el concepto, incluya en esta sección un plano detallado de un fermentador e indique su aplicabilidad. Conceptos básicos de diseño Para diseñar un características: fermentador es preciso establecer las siguientes 1. Dimensiones geométricas: Dependen de la capacidad de operación, la cual está a su vez definida por el volumen de producción del producto en cuestión. Se opera normalmente al 70% de la capacidad nominal (debido en parte a la generación de espuma), el cálculo del volumen nominal se reduce a establecer las dimensiones de un cilindro con relación altura / diámetro de entre 1.5 y 2.5 2. Número y tipo de impulsores: Generalmente se utilizan las turbinas Rushton, Mig e Intermig. El número de impulsores depende del volumen de trabajo del fermentador y de las características reológicas del caldo de cultivo. 3. Capacidad del motor: Está determinada por el tipo y número de impulsores que se utilicen, la velocidad de agitación, la viscosidad del fluido, las pérdidas por fricción y la eficiencia del motor. 4. Aireado: El aire se introduce por el fondo del tanque de fermentación a través de aireadores de diversos tipos: de placas, tubos, en forma de candela, de regadera, o de falsos fondos5, mediante instrumentos de tipo utilizando una malla de salida ubicada de forma tal que distribuya las burbujas uniformemente por la sección transversal del tanque (Cate et al., 19??). 5 53 fijo o móvil construidos con metal no corrosivo; empleando un tamaño de burbujas entre 0,025 y 25 mm de diámetro, el cual se obtiene por ejemplo, con tubos de aireación cuyos orificios están entre 0,4 y 0,8 mm de diámetro o bien, si se quiere un tamaño de burbuja más fino, con dispositivos porosos que pueden obstruirse y requieren mayores presiones de aire. De otro lado, cuando una determinada cantidad de aire pasa a través del líquido, el área superficial de las burbujas y el tiempo de contacto con el medio aumentan al disminuir su tamaño. Además, la valoración correcta de las necesidades de aire se basa en la información disponible en relación con la altura del caldo (en cada momento) en el fermentador, la concentración del microorganismo en relación con el tiempo, el rendimiento del microorganismo por unidad de materia prima y la relación entre biomasa nueva y biomasa sembrada. Generalmente, las necesidades de aire, se expresan en ft3/galón de caldo (Cate et al.), 1992). 5. Capacidad para mezclar el líquido y el gas: En condiciones normales de operación, los tiempos de circulación promedio en un tanque industrial operando con un fluido viscoso y pseudoplástico son de alrededor de 70 s. 6. Capacidad de transferencia de oxígeno: La transferencia de oxígeno es el parámetro de diseño más importante. En tanques agitados el KLa (coeficiente volumétrico de transferencia de oxígeno) es una función de la potencia aplicada por agitación, de la velocidad superficial del aire introducido y de la viscosidad del fluido. 7. Capacidad de transferencia de calor: Los procesos de fermentación son exotérmicos y requieren control permanente de la temperatura. El área de transferencia disponible de la chaqueta no es suficiente y prácticamente todos los fermentadores con capacidad superior a los 1000 litros necesitan de un serpentín interno. 8. Diseño mecánico: Debe garantizar que el tanque soporte la presión de esterilización, sea estructuralmente estable y conserve la asepsia. Además, la flecha estará firme y alineada, será resistente al torque aplicado y no llegará a su velocidad de resonancia. Con el fin de observar los alcances de la automatización, consulte a través de Internet sobre, El FERMACS: un sistema computarizado para supervisión y control científico de fermentadores, desarrollado por el CIGB. De él, enuncie sus características generales, los requerimientos de hardware, así como, sus diferentes opciones de control y supervisión. _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ 54 _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ BIBLIOGRAFÍA DE APOYO 1. Aiba, S.; Humphrey, A. y Millis, N. Biochemical Engineering. 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TRABAJO DE COMPLEMENTACIÓN Conteste las siguientes preguntas 1. ¿Cuáles son los ceparios más conocidos y dónde están ubicados? 2. ¿Cuáles son los intervalos de temperatura a los cuales se desarrollan los microorganismos psicrofílicos, mosofílicos y termofílicos? 3. ¿En qué consiste o qué se entiende por medio mínimo y medio complejo? 4. ¿Qué significa crecimiento balanceado y en qué etapa de crecimiento es más probable que se presente? 5. ¿Cómo las células, en un cultivo estacionario, reciben oxígeno? 6. ¿Qué factores limitan la altura de un biorreactor? 7. ¿Qué ventajas tienen los reactores air lift sobre los reactores de columna de burbujeo? 8. ¿Cuál es el principio físico del reactor U.A.S.B.? 9. ¿Cómo se consigue la transferencia de oxígeno en un reactor de lloriqueo (trickle bed reactor)? 10.¿Por qué se prefiere incubar en una posición horizontal? Resuelva los siguientes problemas 1. En una esterilización por lotes, los nutrientes se destruyen más rápidamente que los microorganismos. Se propone por consiguiente el siguiente esquema: a.- Esterilizar los nutrientes separadamente en un recipiente donde el volumen es menor Vo = Va/100 del total a fermentar y donde se consigue una velocidad de calentamiento 10 veces mayor, igual de enfriamiento. b.Esterilizar el volumen restante en el fermentador y al final adicionar la solución de nutrientes. 57 En qué porcentaje se incrementaría la concentración real de nutriente al iniciar la fermentación con el nuevo sistema, referido al tradicional por lotes? Tomar como sustancia modelo, por ejemplo, el triptófano, suponiendo que la concentración teórica que se conseguiría al iniciar la fermentación fuera 0.001 g/l. Suponer coeficientes de transferencia para tanque agitado, relación H/D = 1.5, volumen útil 0.75 del volumen total. Temperatura del agua de enfriamiento disponible: 15ºC Cuq y Cheftel, en 1983 reportaron mediante curvas de correlación la degradación térmica del triptófano: En presencia de aire, la degradación del triptófano aumenta con la temperatura y el tiempo, formándose derivados pardos parcialmente insolubles. La reacción cinética puede estequiométricamente como sigue: Triptófano + O2 Derivados oxidados Polímeros pardos insolubles d[derivados oxidados]/dt = k[triptófano]a x [O2]b En presencia de aire o de oxígeno, puede asumirse que la concentración de oxígeno disuelto remanente es constante durante la reacción y la ecuación cinética de primer orden puede escribirse: d[triptófano]/dt = kaparente x [triptófano] y ln [triptófano] = - kaparente x t + ln [triptófanoo] Cuando el tratamiento térmico se realiza en presencia de aire, las líneas de regresión y sus coeficientes de correlación son: a 90ºC a 110ºC a 140ºC ln [trp] = -2.5x10-3 x t + 2.30 ln [trp] = -15x10-3 x t + 2.30 ln [trp] = -78x10-3 x t + 2.28 r = 0.999 r = 0.992 r = 0.995 La energía de activación de la reacción puede ser calculada con la ecuación de arrenius: ln k = (- Ea/RT) + constante De resultados experimentales, a varias temperaturas, se obtuvo la siguiente ecuación: ln K = (-9703 x (1/T)) + 20.9 r = 0.986 58 Por lo tanto la energía de activación de la degradación térmica del triptófano en solución y en presencia de aire es igual a 80570J/mol. 2. Con base en la composición media de la melaza de caña, determine su fórmula condensada y el factor de reducción, considerando C, N, O, P, S, H. 3. Si en una fermentación alcohólica con Saccharomyces cerevisiae, en ausencia de oxígeno, se emplea glucosa como fuente de carbono y se sustituye el amoníaco por urea. ¿Cómo se afectan los factores YP/S, y YX/S? Si se sustituye el amoníaco por nitrato de amonio, ¿qué pasará con estos factores y con la cantidad de CO2 producido?. Haga e indique las consideraciones que crea convenientes. 4. Partiendo de las siguientes condiciones iniciales de biomasa y sustrato limitante, respectivamente: Xo = 4,468 g/l y So = 1.0 g/l. Utilizando la ecuación de Monod expresada como: dX/dt = µX donde µ = (µmáx.S)/(Ks +S) y (X-Xo) = Y(So-S) Y haciendo uso de los datos experimentales dados en la tabla adjunta, calcule los valores de µmáx, Ks y Y. Datos experimentales para el modelo de Monod reportados para un cultivo de Tricoderma viride en glucosa (Young, 1985) Tiempo (h) 0 1 2 3 4 5 59 [celular] (g/l) 0,468 0,522 0,576 0,626 0,672 0,713 [sustrato] (g/l) 1,0000 0,8709 0,7421 0,6177 0,5021 0,3986 Tiempo (h) 10 11 12 13 14 15 [celular] (g/l) 0,829 0,839 0,847 0,853 0,857 0,860 [Sustrato] (g/l) 0,0946 0,0683 0,0490 0,0349 0,0248 0,0176 6 7 8 9 0,747 0,776 0,798 0,816 0,3095 0,2355 0,1761 0,1298 16 17 18 19 Rta: µmáx = 0.5 hr-1; Ks = 3.3 g/l; Y = 0.4 60 0,862 0,864 0,865 0,866 0,0124 0,0088 0,0062 0,0044 ANEXOS ESTUDIO DE CASO: APLICACIONES DE LA BIOTECNOLOGÍA EN LA INDUSTRIA CERVECERA Para comprender la aplicabilidad de la biotecnología en la industria cervecera es importante que usted recuerde el proceso de producción e identifique los puntos críticos de control. Elabore entonces, un documento que le permita alcanzar este objetivo. Para la resolución de este ejercicio deb leer todo la formulación del estudio de caso y resuelva cada uno de los interrogantes y envíe la solución. La información presentada a continuación corresponde a una serie de afirmaciones del proceso, está intercalada con preguntas que permiten consolidar conceptos y promueve la solución de problemas propios de la industria. Facilite la comprensión, ubicando cada afirmación sobre el diagrama de flujo del proceso. Materia prima La malta de cebada fué la materia prima más importante para la producción de extracto y, al mismo tiempo, la única fuente esencial de enzimas. Sin embargo, es una materia prima cara, debido fundamentalmente, al tiempo requerido en el proceso de malteado y a la pérdida de energía ocurrida durante el mismo. ¿Es posible emplear otros granos como fuente de almidón para la producción de extracto? __________ ¿Cuáles? _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ 61 Para obtener un extracto más barato se utilizan granos crudos (o adjuntos), materiales no malteados preparados de granos de cereales, tales como arroz, sémola de maíz o cebada. Alternativa Para obtener un rendimiento inalterado de extracto, deben utilizarse 1,2 kilogramos de cebada por kilogramo de malta sustituido (la cebada tiene un contenido de humedad más alto que la malta). La cebada no necesita cocción, ya que el almidón se licúa más o menos a la misma temperatura que la malta. Puede mezclarse con la malta durante la maceración. ¿Contienen los granos crudos (o adjuntos), una cantidad adecuada de enzimas? __________ ¿Cuáles? _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ ________________________________ ¿Qué son los grits? _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ ________________________________________________ Cuando se utilizan materiales no malteados, se limita la cantidad de grano crudo en el total de la mezcla y es necesario sustituir o suplir las enzimas de la malta. Silos de malta En ocasiones se utiliza malta poco modificada, en la que los β-glucanos no están muy degradados. 62 Molienda La molienda y trituración de la malta facilita la extracción de sus componentes por el agua; permite el trabajo de las enzimas sobre los almidones y proteínas, y finalmente, garantiza un mosto de composición adecuada para la producción de cerveza. Alternativa Al igual que para la malta, para moler la cebada puede utilizarse tanto el método de molienda en húmedo como el de molienda en seco, sólo con pequeños ajustes: Molienda en húmedo: El grano y la gluma se ablandan durante la maceración. La cebada y la malta pueden molerse juntas, pero es mejor moler la cebada por separado con una distancia de rodillos de sólo 0,2 mm en un molino de dos rodillos, mientras que la distancia típica para la malta es de 0,3 - 0,5 mm. Para la cebada es apropiado un molino de malta con un 50% más de potencia de motor. Molienda en seco: Mientras que normalmente se prepara la malta antes de molerla para aumentar su contenido en humedad, esto no es necesario para la cebada, ya que contiene un 10-12% de humedad. Para sustitución baja de la malta por cebada, ésta debe mezclarse con la malta antes de la trituración y deben molerse juntas. Silos de adjuntos Algunos de los cereales que se utilizan como granos crudos contienen grandes cantidades de β-glucanasas y/o pentosanos. Olla de crudos La licuefacción de los granos crudos tradicionalmente se realiza en la caldera de crudos, conjuntamente con un 10 - 20% de malta, como fuente de αamilasas. 63 La temperatura de empaste depende del proceso: al comienzo, puede estar entre 45 - 65ºC, pero después, alcanza los 85 - 100ºC, durante 15 - 30 minutos. Sin embargo, como los gránulos de almidón gelatinizan a una temperatura superior a la que soportan las enzimas de la malta, se obtiene como resultado una mezcla bastante viscosa, cuya licuefacción es incompleta. Solución El empleo de una α-amilasa termoestable garantiza la completa licuefacción de los granos de almidón y, por consiguiente, una menor viscosidad. Facilita además, el proceso de bombeo y la posterior adición a la olla de mezclas. La dosis de estas enzimas depende de su actividad, pero puede estar situada entre 250 - 500 g por tonelada de grano crudo. La concentración del crudo debe estar entre el 20 y el 30%. Olla de mezclas Mientras la masa de triturados hierve en la olla de crudos, la masa de malta se agita en la olla de mezclas. Después de un tiempo determinado, se bombea la masa de crudos sobre la masa de malta y bajo ciertas condiciones de temperatura y tiempo actúan las enzimas de la malta transformando los almidones en azúcares fermentables. Los mostos viscosos contienen polisacáridos como β-glucanos y pentosanos, que causan una salida lenta en la cuba-filtro y en los filtros de producto terminado. Solución El uso de β-glucanasa bacteriana en mostos viscosos reducirá bastante, tanto el tiempo de salida de la cuba-filtro, como el de la filtración final de la cerveza. Las dosificaciones relativamente pequeñas tienen un efecto bastante eficaz sobre el β-glucano. Se considera normal una dosificación entre 0.2 y 0.5 Kg por tonelada de malta. Si se usan cantidades de cebada, como grano crudo, superiores a un 10%, se aumenta la dosis hasta 2.0 Kg por tonelada de malta/cebada. 64 La pérdida de extracto no sólo se debe a glucanos y pentosanos de alto grado molecular, sino que también puede tener su origen en el material restante de la pared celular, el cual impide una degradación y descomposición completa del almidón. Solución Añadir un complejo de enzimas que, además de β-glucanasas, contenga celulasas, hemicelulasas y pectinasas, entre otras, con el fin de disminuir al mínimo la pérdida de extracto, así como la salida y el tiempo de filtración. La dosificación de estas enzimas debe establecerse mediante ensayos en cada caso individual, pero suele ser entre 0.2 y 1.0 Kg por tonelada de malta o malta/cebada. Olla de cocción de mosto El mosto pasa a la olla de cocción para hervirlo por un tiempo aproximado de dos horas, con el objeto de estabilizarlo químicamente, esterilizarlo y agregarle el lúpulo que da a la cerveza su sabor característico. En ocasiones, el mosto contiene almidón y el almidón no convertido, presente en la cerveza acabada, tiene un efecto negativo sobre la calidad, tanto en lo que se refiere al sabor como a la estabilidad. Además, dificulta la filtración de la cerveza. Solución Puede añadirse una pequeña cantidad de α-amilasa termoestable a la caldera del mosto para convertir el almidón en dextrinas. Se adicionan 2 g/hl de una α-amilasa termo-resistente antes de hervir el mosto. 65 En otros casos, la fermentación presenta problemas y aunque es cierto que puede ajustarse variando el tiempo de sacarificación y las temperaturas de fermentación; otra manera de ajuste es mediante la adición de enzimas microbianas en la sala de cocción. Solución Añadir 1 - 2 Kg de α-amilasa fúngica por tonelada de malta. Sedimentación El mosto se recibe en un tanque de sedimentación, donde se separan algunas sustancias insolubles formadas durante la cocción. Enfriador de mosto El mosto se somete a temperaturas de 7 a 9ºC dependiendo de las características que se deseen para el producto final y mediante la acción de la levadura se inicia el proceso de fermentación. Sobre el mosto frío también puede encontrarse almidón. Solución Debe añadirse α-amilasa fúngica cuanto antes, ya sea en la fase de trasiego o en la de Krausening. Cuando el procesado se hace sobre un Unitank, puede agregarse la enzima durante la circulación, junto con los estabilizadores. A una temperatura de 10 - 12 ºC, la dosis recomendada es 0,5 g/hl, mientras que a 4 ºC la dosis es de 1,0 g/hl. Si quedan β-glucanos presentes en la cerveza acabada se puede obtener una filtración lenta y una cerveza turbia. Éste es uno de los momentos para resolver el problema. 66 Solución Este problema puede evitarse utilizando β-glucanasa fúngica (0,5 – 1,0 g por hl de mosto) al mosto enfriado durante el sembrado. Fermentación El tiempo de fermentación es de siete días, sin embargo, cuando el mosto tiene bajo contenido de α-aminoácidos y péptidos, la fermentación se torna demasiado lenta. Solución La adición de una proteinasa bacteriana tiene un efecto positivo, puesto que aumenta la solubilidad de los compuestos nitrogenados. Sin embargo, cada vez menos empresas usan las enzimas durante la fermentación. La razón principal es que hay grandes dificultades para inactivarlas después de su uso. Los β-glucanos presentes en esta sección, también pueden ocasionar una filtración lenta y una cerveza turbia. Solución Este problema puede evitarse utilizando β-glucanasa durante la fermentación. Maduración De los tanques de fermentación, la cerveza pasa por un enfriador y de allí a los tanques de maduración, donde permanece por un período de 2 a 3 semanas a 0ºC para mejorar el sabor del producto y clarificar la cerveza. 67 En ocasiones se descubren residuos de almidón en la cerveza, justamente antes de la filtración. Solución Es necesario transferir la cerveza a otro tanque, añadir una α-amilasa fúngica y prolongar el período de maduración dos días. Se adiciona 1,0 g/hl de enzima en cinco días o 3,0 g/hl en dos días. Aún en esta sección se pueden detectar β-glucanos, polímeros que generarían la filtración lenta y la cerveza turbia. Solución Debe añadirse aquí β-glucanasa fúngica y prolongar la maduración en 2-5 días. Filtración A una temperatura de -1 ºC, la cerveza pasa a través de páneles de celulosa o tierra de diatomaceas, para eliminar pequeñas cantidades de levadura y las partículas que puedan producir turbiedad, obteniéndose así una cerveza clara y brillante. Esta cerveza se recibe en tanques llamados de contrapresión, quedando lista para ser envasada. ¿Qué tipo de enzima utilizaría usted si pese a todas las soluciones propuestas, la cerveza sigue saliendo turbia, debido a la acción del cobre o del hierro presentes en el agua sobre las albúminas? Solución 68 De otro lado, por diversos motivos tecnológicos, se requiere de modelos matemáticos que describan el proceso fermentativo y permitan: 1. Simular qué puede suceder al aplicar unas u otras estrategias. 2. Predecir, a partir de unas condiciones iniciales concretas, la evolución futura de un proceso, lo cual puede ser útil a efectos de optimización, monitorización y control. 3. Hacer posible la creación de “sensores en software”, que permitan medir indirectamente, en tiempo real, las variables importantes, de tal modo que se potencie de monitorización y supervisión de los procesos. Planta de experimentación Para poder realizar estudios experimentales, manteniendo la temperatura de fermentación constante, se requiere del diseño y construcción de una planta de experimentación isoterma, con dimensiones y características energéticas que permitan la realización de varias fermentaciones simultáneas (hasta 24), en idénticas condiciones de temperatura. La planta debe constar de las siguientes partes: 1. Tanque de agua: Sirve de baño maría. 2. Fermentadores sumergidos 3. Sistema de enfriamiento del agua: Bombea agua para que pase a través de un serpentín dentro de un congelador, con un caudal constante (3 l/min). Este circuito no debe pararse y debe estar conectado al tanque de agua. 4. Sistema de calentamiento del agua: Bombea agua con un caudal constante (3 l/min), y hace que pase por el interior de un tubo metálico al que se arrolla una resistencia eléctrica aislada (1000 wat, 220 volt). 5. Sensores: De temperatura, pH 6. Electrónica de adaptación 7. Computadora: Mediante sus salidas digitales, controla la puesta en marcha, o la desactivación, de la bomba de agua caliente y de la resistencia. Mide la temperatura y el pH de las fermentaciones, y la temperatura del agua del tanque. Deberá estar dotada de una placa de toma de datos con un conversor analógico/digital con varios canales de entrada y varias salidas digitales. 69 ¿Qué es un conversor analógico/digital? _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ Durante los experimentos, la computadora se ocupa de mantener la temperatura del baño maría en un valor predeterminado y de visualizar en pantalla, mediante gráficos, los datos que va tomando; también puede detectar, durante los experimentos, discordancias en los valores medidos de temperatura y pH, y avisar al operador. Estudio preliminar Para obtener un conocimiento cualitativo del proceso se pueden efectuar en la planta isoterma cuatro experiencias con seis recipientes cada una. Descripción de la reacción: Obtención de alcohol y anhídrido carbónico, a partir de un mosto azucarado, mediante la acción de una levadura apropiada (distintas variaciones de Saccharomyces, según la empresa fermentadora). 70 Observaciones Durante el tiempo total que dura el proceso, se distinguen en el interior de los fermentadores distintas etapas: Llenado del fermentador con mosto: En esta etapa se controla la concentración de azúcares, la oxigenación inicial y la forma geométrica del fermentador. Inoculación de la levadura: En esta etapa son importantes la cepa de la levadura, su generación y la concentración que se inyecta. A las 10 horas de fermentación: Se aprecian visualmente seis capas. La primera de ellas corresponde al precipitado de la biomasa inicial, las demás presentan distinto color y transparencia. A las 16 horas de fermentación: Se identifican cuatro capas. Entre las 18 y 24 horas de fermentación: La capa del fondo aumenta n poco. Se aprecia una progresión continua de concentración de biomasa, mayor en el fondo y menor en la superficie. Aparecen por primera vez, en la superficie, pequeñas manchas blancas. Aproximadamente a las 40 horas de fermentación: El líquido se homogeniza. El número y extensión de las manchas de la superficie se incrementa. Comienzan a verse burbujas. Hay agitación interna. Entre las 45 y 50 horas de fermentación: La superficie se llena de espuma blanca. En el interior hay gran agitación debida al anhídrido carbónico que se produce. En el fondo del recipiente se incrementa la cantidad de biomasa inactiva. Aproximadamente a las 120 horas de fermentación: La superficie queda limpia de espuma. Cae la biomasa al fondo. Disminuye la actividad interna. A las 150 horas de fermentación: La superficie queda limpia y la biomasa se deposita en el fondo. El líquido queda transparente, con un color rubio acaramelado. Pocas burbujas y pequeñas. Se puede dar por terminado el proceso de fermentación. 71 Analice las anteriores observaciones a la luz del crecimiento microbiano y encuadre las etapas en tres fases fundamentales: fase de latencia, fase de fermentación principal o tumultuosa y fase de fermentación secundaria. _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ ________________________________________________ Conclusiones Durante el tiempo que dura el proceso, se distinguen tres fases fundamentales: fase de latencia, fase de fermentación primaria y fase de fermentación secundaria. A lo largo de la fermentación, hay un proceso de sedimentación de la biomasa, que se ve contrarrestado por la agitación interna. La biomasa activa en suspensión tiene un papel preponderante en la fermentación, para comprobar este punto, se pueden realizar diversas experiencias “ad hoc”, decantando la capa de levadura depositada en el fondo. 72 Planteamiento de las fermentaciones Para la realización de cada experiencia, el sistema se preparará de la siguiente forma: 1. Se esterilizan previamente todos los componentes que puedan estar en contacto con el cultivo durante el proceso. 2. Se llenan los recipientes con 2,5 litros de mosto industrial y se espera el tiempo necesario para que adquiera la temperatura base de cada proceso. La fermentación se realiza con el mosto filtrado, con el fin de calcular las concentraciones de biomasa con el menor error posible. 3. Se inocula, en cada recipiente, la levadura en la concentración que vaya en cada frasco (40 ml). 4. Se introducen los sensores de pH, presión, temperatura y fotocélulas. 5. Se pone en funcionamiento el programa preparado para el control del proceso y toma de datos por ordenador. Esquema de muestreo Para cada una de las fermentaciones se realizan tomas de muestra a lo largo del tiempo, con mayor proximidad en las primeras horas de la fermentación, y partiendo siempre del mosto. Se considera como punto cero el mosto más la levadura. La toma de la muestra se debe efectuar a una altura media dentro del fermentador y corresponde a 25 ml. Una vez obtenida, se filtra a través de un filtro Millipore de 0,25 µm; el líquido filtrado se utiliza para la determinación de azúcares y alcoholes. Métodos analíticos Determinación de la biomasa: La muestra filtrada a través del filtro Millipore de 0,25 µm en condiciones óptimas de estreno, se coloca en una estufa de secado durante 12 horas, a 32ºC. A continuación se pesa en una balanza de precisión de 0,0001 g y se hacen los cálculos necesarios para la determinación de la concentración de biomasa. Describa los cálculos requeridos para determinar la biomasa. _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ 73 Describa la técnica para determinar los azúcares, mediante cromatografía líquida de alta eficiencia. _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ Resultados Concentración de azúcares en el instante cero Glucosa Fructosa 0,76 ± 0,20 g/l Maltosa Sacarosa 1,46 ± 0,31 Total de azúcares Maltotriosa 4,48 ± 0,45 7,11 ± 1,34 g/l 34,94 ± 0,59 48,22 ± 1,67 Concentración de azúcares en la fermentación a 12ºC Tiempo Fructos (Horas) a (VM) 0 6 12 24 30 36 48 60 72 84 96 120 144 VM: Valor 74 Glucosa (VM) Sacaros a (VM) Maltosa (VM) 1,62 7,76 0,74 1,77 6,84 0,00 2,02 5,81 0,00 2,04 3,62 0,00 1,79 2,40 0,00 1,44 1,52 0,00 0,71 0,00 0,00 0,52 0,00 0,00 0,74 0,00 0,00 0,22 0,00 0,00 0,14 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,20 0,00 0,00 medio de cada muestra analizada Maltotrios a (VM) 26,17 26,84 34,23 33,76 39,46 35,92 22,96 12,59 10,76 6,71 4,52 2,01 1,75 por triplicado 3,82 4,69 5,20 4,61 6,66 8,41 5,24 3,87 3,00 1,94 2,20 1,24 1,31 en g/l. Totales (VM) 40,11 40,15 47,75 44,04 49,90 47,59 28,93 20,18 14,58 10,15 7,08 3,25 3,46 Concentración de azúcares en la fermentación a 16ºC Tiempo Fructos (Horas) a (VM) Glucosa (VM) Sacaros a (VM) Maltosa (VM) Maltotrios a (VM) 0 1,12 8,74 1,96 34,63 6,32 6 1,63 7,75 0,77 36,12 7,86 12 1,66 3,31 0,40 39,18 7,67 24 0,55 0,39 0,20 29,28 8,74 30 0,21 0,17 0,27 20,07 6,82 36 0,21 0,00 0,00 10,56 4,30 48 0,00 0,00 0,00 2,15 2,53 60 0,00 0,00 0,00 0,97 1,66 72 0,00 0,00 0,00 0,71 1,27 96 0,00 0,00 0,00 1,29 0,07 144 0,00 0,00 0,00 2,21 0,08 VM: Valor medio de cada muestra analizada por triplicado en g/l. Construya una gráfica que compare el comportamiento azúcares cuando la fermentación ocurre a 12ºC. Totales (VM) 54,53 54,13 52,42 39,03 27,90 15,45 4,51 2,66 1,93 1,35 2,38 de los BIBLIOGRAFÍA RECOMENDADA 6. Andrews, G. F. The Yield Equiations in the Modeling and Control of Bioprocesses. Biotechnology and Bioengineering. Vol. 42. John Wiley and Sons, Inc. 1993. 7. 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México. 1990. 77 ESTUDIO DE CASO: ESTUDIO DEL EFECTO DE LA VELOCIDAD DE AGITACIÓN EN LA PRODUCCIÓN DE POLISACÁRIDOS EXTRACELULARES Complete entonces el siguiente cuadro describiendo la naturaleza del polisacárido obtenido y sus aplicaciones Acetobacter aceti Microorganismo Polisacárido Acetán Características Acetan también es un polisacárido anionico con un estructura celulosica pero con una fracción de pentasacarido el consiste en una cadena lateral de alfa-L-Rha-(1->6) - ¤ - D-Glc-(1->6)-alfa-D-Glc-(1->4) - ¤-DGlcA-(1->2)-alfa-D-hombre-(1->3) se unió a cada otra glucosa en la estructura. Por consiguiente, Acetan tiene una estructura química estrechamente relacionado con el xanthan. Las propiedades de la solución también son similares a aquéllas de xanthan. Alcaligenes faecalis Curdian b-1,3-Glucan, Hidrato el Beta-1,3 -glucan es un azúcar compleja del fibra-tipo (polisacárido) derivada de la pared de la célular de los levadura para panaderia, de la fibra de la avena y de la cebada, y de muchas setas medicinales, tales como maitake . En sus estados naturales, la levadura y las setas contienen una mezcla de beta-1,3-glucan y de beta1,6-glucan. La avena y la cebada contienen una mezcla de beta-1,3-glucan y de beta1,4-glucan. Además de beta-1,3-glucan purificado de estas fuentes, usted puede ver los productos enumerados como beta1,3/1,6-glucan en la caja de productos levadura-derivados y como beta-1,3/1,4glucan cuando está derivado de avena. (si no) las características idénticas similares se han demostrado para los extractos betaglucan-ricos y el beta-beta-glucan purificado derivados de avena, de levadura de los panaderos, y de setas . Las dos aplicaciones primarias del beta- 78 beta-glucan son realzar el sistema inmune y bajar niveles del colesterol de la sangre. Los estudios experimentales numerosos en tubos y animales demostrado el de prueba han beta-beta-glucan para activar las células blancas de la sangre, allí han sido centenares de investigación en el beta-beta-glucan desde los años 60. 6 la investigación indica que beta-1,3-glucan, en detalle, es muy eficaz en las células blancas de la sangre que activan conocidas como macrófagos y neutrophils. Estas células proporcionan una de las primeras líneas de defensa de los sistemas inmunes contra invasores extranjeros. Un macrófago o un neutrofil beta-glucan-activado puede reconocer y matar a las células del tumor, quita la ruina celular resultando de daño oxidative, acelera la recuperación del tejido fino dañado, y activa más lejos otros 7 componentes del sistema inmune. 8 aunque la investigación en tubo de prueba y los estudios animales es prometedora, muchas preguntas permanecen sobre la eficacia del beta-beta-glucan como suplemento oral realzar la función inmune en seres humanos. el Beta-beta-glucan es el factor dominante para el efecto colesterol-que baja del salvado de la avena como con otros componentes de la soluble-fibra, el atascamiento el colesterol (y los ácidos de la bilis) por el beta-beta-glucan y de la eliminación que resulta de estas moléculas en las heces es muy provechosos para reducir el colesterol de la sangre resultados de un número de ensayos doble pared con el beta-beta-glucan de la avena o levaduraderivado indican reducciones típicas, después por lo menos de cuatro semanas 79 de uso, de el aproximadamente 10% para el colesterol total y el 8% para el colesterol de LDL ("malo"), con elevaciones en el colesterol de HDL ("bueno") que se extiende a partir de la cero hasta el 16%. Aureobasidium pullulans Azotobacter indicus Pullulan Alginato -1.4 ' -; -1,6'-Glucan Peso Molecular: 50000-100000 Característico: Hhidrolizado por el pullulanase en más de 94% de maltotriosa. Color : Blanco Aspecto: polvo Se utiliza para personas glicemicas dando muy buen resultado. Los estudios estructurales de S-7, otro polisacárido del exocelular que contiene ácido 2-deoxy-arabino-hexuronico, bDGlcp(1-6)bDGlcp(1-6)+ | -4)bDGlcp(1-4)aLRhap(1-3)bDGlcp(14)bD2darapHexA(1D2daraHexA = 2-deoxy-D-arabinohexuronic acid Erwinia tahitica Heteroglicanos. D- glcp – Dgalp – Lfuc- DglcpA Polisacarido Zanflo En relación 6:4:2:3 contiene 4.5 % de acetilo Polisacarido Zanflo bDGalp(1-4)+ | -3)aDGlcp(1-4)bDGlcpA(1-4)aLFucp(1- Leuconostoc mesenteroides Dextranos 80 Lso dextranos son homopolisacaridos de molécular que tienen con enlaces alfa 1,6 alfa-D glucanos o glucosa de alto peso una cadena principal y ramificaciones alfa Sclerotium Scleroglucan 1,3. El limo extracelular producido por el Leuconostoc Mesenteroides es un ploblema en la industria del azucar, pues este limo recubre los tanques y el equipo, ralentiza la filtración y altera la cristalización del azucar. Estas mismas dextrinas se utilizan en la industria alimentaria, farmaceutica y química como estabilizantes alimentarios, como sustitutos del plasma sanguíneo, como anticoagulantes y absorbentes. D-glucanas. Grupo de gomas producidas por hongos del género Sclerotium y también por especies de los géneros Corticium, Sclerotinia y Stromatinia Polisacárido ramificado formado por uniones Nigerosa -(1 3) con ramificaciones genciobiosa -(1 6) Grados de polimerización entre 500 y 1600 unidades. Y la comercial de 800 Shizophyllum commune Shizophyllan Xanthomonas campestris Xantano Beta (1,3 )D- Glucano tiene propiedades anticancerigenas pertenece a la familia de los Beta glucanos La goma de xantano se produce de manera comercial desde 1967 gracias al crecimiento Xanthomonas campestris sobre glucosa, sacarosa, almidón, azucares de maíz, solubles de destilería, o suero ácido. Este polimero polianionico se compone de D- glucosa, D- manosa y ácido Dglucoronico en una proporción molar 2:2:1 con dos tipos de grupos carboxilo (acetato y piruvato) y un esqueleto de alulosa. La unida que se repite es un pentasacarido constituido por un esqueleto de glucosa Beta 1,4.Las principales ventajas de la goma xantano como polímero alimentario son el elevado rendimiento de producción obtenido, las altas viscosidades obtenidas con producción diluida de xantano, unintenso comportamiento seudo plastico y la gran estabilidad en amplios rangos de pH. 81 Antes de continuar, fundamente sus conocimientos: ¿Es la aireación un parámetro crítico en una fermentación sumergida? _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ ____________________________________________ ¿Qué efectos tiene el aporte de oxígeno sobre los organismos aerobios? _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ ¿Cómo se transporta el oxígeno a través de microorganismos que crecen como pellets o agregados celulares? ________________________________________________________________ ________________________________________________________________ ________________________________________________________________ ________________________________________________________________ ¿Puede llegar a afectar negativamente el objetivo del proceso el uso de sistemas mecánicos que generen agitación en el interior del sistema? ________________________________________________________________ ________________________________________________________________ ________________________________________________________________ ________________________________________________________________ ________________________________________________________________ ¿Cuándo la agitación se produce mediante una turbina de paletas, se puede originar daño debido a los cambios bruscos de presión que se dan delante y detrás de cada una de las paletas y a los grandes esfuerzos tangenciales en las inmediaciones del extremo de las mismas? ________________________________________________________________ ________________________________________________________________ ________________________________________________________________ ________________________________________________________________ ________________________________________________________________ 82 ¿Qué es más sensible a los cambios bruscos de presión, originados en un flujo turbulento, los organismos filamentosos y pelletiformes o una célula individual? _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ ¿Cuáles son los factores que producen stress a un microorganismo? _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ Ahora, proponga un método para determinar la concentración de biomasa y uno para determinar la concentración de polisacárido. Además, escriba y explique la ecuación Ostwald de Waele. ________________________________________________________________ ________________________________________________________________ ________________________________________________________________ ________________________________________________________________ ________________________________________________________________ Concentración (g/l) de biomasa y polisacárido (PS) Tiempo 200 rpm (h) Biomasa PS 0 0.3 1.5 20 0.6 2.2 40 4.0 2.5 60 7.0 3.4 80 7.5 3.8 100 7.5 3.9 120 7.5 3.9 300 rpm Biomasa PS 0.1 1.4 1.0 3.2 2.5 6.5 3.0 9.0 4.0 9.3 4.0 9.3 4.5 9.4 400 rpm Biomasa PS 0.1 1.3 1.0 3.0 3.5 5.8 5.0 7.6 6.0 8.5 5.5 8.5 5.5 8.5 Con los resultados anteriores construya una gráfica que muestre la evolución de la concentración de biomasa y polisacárido, durante el 83 proceso de fermentación, para las diversas velocidades de agitación ensayadas: 200, 300 y 400 rpm. Grafica 1. Evolución de biomasa y polisacárido en el tiempo. Análisis Diferencias morfológicas Para analizar las diferencias morfológicas tenga en cuenta las siguientes preguntas: ¿Al operar el sistema a mayor velocidad de agitación se puede dañar el microorganismo?, ¿Por el tamaño reducido de los pellets, se podría pensar que es posible disminuir las barreras difusionales e incrementar el área interfacial de contacto entre fases, llevando a un incremento en la producción de polisacárido?, ¿el comportamiento mostrado se debe al efecto negativo irreversible que el empleo de un agente mecánico, para lograr velocidades de agitación elevadas, provoca sobre el hongo modificado su capacidad productora. 84 Análisis Variación del esfuerzo cortante y la viscosidad aparente con el gradiente de velocidad para las diferentes velocidades de agitación a las 72 horas de fermentación Gradiente de velocidad (s1 ) 200 400 600 800 1000 200 rpm 0.30 0.18 0.16 0.13 0.12 300 rpm 0.33 0.22 0.18 0.15 0.14 400 rpm 0.44 0.26 0.21 0.19 0.16 Elabore las gráficas correspondientes 85 Esfuerzo (N/m2) Viscosidad aparente (Nm2/s) 200 rpm 35 48 59 65 70 300 rpm 55 67 80 86 95 400 rpm 66 84 92 103 110 Análisis Concluya: Un proceso de fermentación es un proceso complejo donde hay que tener un cuenta muchas variables ya sean físicas como la temperatura, la presión; fisicoquímicas como el pH y fisiológicas del microorganismo, también afectan los aspectos mecánicos y de diseño es por esta razón que al hacer una fermentación debemos estudiar muy a fondo todas estas variables para el producto a fabricar. 86 ESTUDIO DE CASO APLICACIONES DE LA BIOTECNOLOGÍA EN LA INDUSTRIA ENOLÓGICA Para comprender la aplicabilidad de la biotecnología en la industria enológica es importante que usted recuerde el proceso de producción e identifique los puntos críticos de control. Elabore entonces, un resumen que le permita alcanzar este objetivo. Durante la elaboración de vinos, la contaminación por Brettanomyces/Dekkera, es especialmente problemática y causa a nivel mundial pérdidas que Fulgelsang y otros en 1993 estimaron en muchos millones de dólares anuales. Teniendo en cuenta lo anterior, es importante aplicar sistemas rápidos y eficaces de detección, así como conocer el origen de las contaminaciones para evitar en lo posible su acceso al vino. Al igual que en el primer caso, la información presentada a continuación corresponde a una serie de afirmaciones y está intercalada con preguntas que permiten consolidar conceptos y promover la solución del problema. Antes de comenzar, revise la literatura buscando información sobre las levaduras Brettanomyces/Dekkera. _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ ______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ Facilite la comprensión, ubicando cada afirmación sobre el diagrama de flujo del proceso o construyendo un diagrama de flujo que permita visualizar los experimentos presentados. 87 Las levaduras Brettanomyces/Dekkera conforman uno contaminantes más problemáticos en la industria enológica. de los grupos Requerimientos para su desarrollo Se adaptan fácilmente a medios que contienen 15% v/v de etanol, escasa o nula presencia de azúcares y alta presión de CO2. Se han encontrado cepas de Brettanomyces/Dekkera en vinos tan diferentes como Jerez, tintos de crianza en barril o espumosos embotellados. Características organolépticas de los vinos afectados por Brettanomyces/Dekkera Las características organolépticas son muy variables dependiendo del tipo de vino de que se trate. La levadura Brettanomyces/Dekkera confiriere propiedades como olor a ratón, a animal, a especia o a madera húmeda, que obedecen a la presencia de compuestos derivados de su metabolismo como el ácido acético o fenoles volátiles como los derivados del ácido p-cumárico entre otros. La pregunta ahora es, ¿dónde realizar el control? Solución Es importante el análisis de todas las instalaciones de la vendimia, ya que una proliferación sin control en alguna fase inicial del proceso de vinificación podría provocar una propagación extensiva a fases más tardías. 88 Métodos para la detección de Brettanomyces/Dekkera Método convencional: Depende del aislamiento e identificación de las cepas y es tan poco eficiente que existen casos en los que los vinos llegan a manifestar una clara alteración organoléptica sin que las pruebas detecten a tiempo la presencia de este contaminante. El proceso consiste en filtrar por membrana estéril y sembrar en medio selectivo, por ejemplo con cicloheximida. Éste método casi siempre resulta ineficaz debido a que en el ecosistema proliferan numerosas especies microbianas y la mayoría de ellas presentan, en medios de laboratorio, un crecimiento mucho más rápido que la Brettanomyces/Dekkera, lo que enmascara su presencia e impide su detección. Una vez se logra el aislamiento de la cepa, ésta se puede identificar mediante métodos taxonómicos convencionales. Describa en qué consisten: 1. El método de Elisa. _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ 2. El método de cromatografía para realizar perfil de ácidos grasos. ________________________________________________________________ ________________________________________________________________ ________________________________________________________________ _____________________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ 89 3. El método de PCR _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ ______________________________________________________ ____________________________________________________ ______________. Éste es un procedimiento eficaz y presenta sensibilidad de hasta una célula por muestra. A continuación se describe el proceso experimental que permite observar la eficacia del método de detección de Brettanomyces/Dekkera en instalaciones de vendimia mediante PCR Controles para la detección por PCR Cepas de levaduras: Dekkera anómala STCC1008, CBS77 Dekkera bruxellensis STCC1451, CBS74, OSB101 Medio selectivo YPD: Extracto de levadura Glucosa Peptona Agar Etanol Cicloheximida 1% 2 2 2 10 0,005% Muestreo En las uvas 1. Tomar las uvas de las viñas antes de entrar en el lagar1. 2. Introducir las muestras 90 En las instalaciones Tomar las muestras al finalizar la jornada de trabajo en el lagar, de dos formas diferentes: En las moscas Drosophila Coger, de la zona a investigar, las moscas vivas y mantenerlas en frascos estériles a 4 ºC en bolsas estériles. 3. Procesar las muestras el mismo día de su recogida. 1 1. Directamente 10 ml hasta su procesado. de agua de lavado de las distintas instalaciones de tubo estéril. 2. Por contacto con hisopo estéril y resuspensión en 10 ml de agua destilada estéril. Mantener las muestras a 4 ºC hasta procesarlas al día siguiente. Lagar: Sitio donde se pisa o se prensa la uva. Aislamiento de Brettanomyces/Dekkera En uvas En moscas Drosophila Sumergir 15 - 20 granos de uva en 50 ml de agua estéril con SDS1 al 0,005%. Introducir 5 - 10 moscas en un tubo ependorf con 100 µl de agua destilada estéril. Agitarlas. Retirar la muestra de agua con-teniendo las levaduras en suspensión y diluir2 o concentrar3 según la densidad celular. Sembrar 40 µl por extensión en cajas de medio selectivo. Incubar a 30 ºC hasta por 10 días. 1 Como paso previo se realizó un experimento que permitió concluir que el tratamiento con SDS no afecta la viabilidad de Brettanomyces/Dekkera, y por tanto que es factible su aplicación a muestras reales. 2 La dilución se realiza de 10 a 106 veces según densidad, añadiendo agua destilada estéril. 3 La concentración se realiza por filtración de 0,1 ml a 2 ml de la muestra a través de membranas estériles de 0,22 µm de poro. En este caso se depositan las membranas en placas Petri de medio selectivo. Identificación de las colonias aisladas mediante PCR Se buscan colonias que cumplan con las características descritas a continuación, razón por la cual se recomienda hacer preparaciones para la observación al microscopio óptico. 91 Características de la Brettanomyces/Dekkera Pigmentación: Blanca o crema. Morfología: Semiesférica, normalmente elipsoidales, muchas ojivales o de cilíndricas a alargadas. Textura: Brillante y lisa, a veces con relieves. Tamaño: Pequeño, 2 - 6,5 x 4 - 22 mm. Incluya en esta sección, la representación gráfica o una imagen fotográfica de Brettanomyces/Dekkera. Para confirmar que dicha colonia es efectivamente de Brettanomyces/Dekkara, se realiza la identificación por PCR. Procedimiento para identificación por PCR Tomar con punta de pipeta estéril una porción de células (del orden de 105) de la colonia. Resuspenderlas directamente en la mezcla de la primera reacción de PCR, con un volumen final de 50 µl. Realizar el ensayo en un Termo Gene 1.7 (Bio-Rad). Cuando el PCR genera un fragmento de ADN con los cebadores empleados (ensayo positivo), la colonia es inequívocamente perteneciente a una cepa de Brettanomyces/Dekkera. 92 Detección directa de Brettanomyces/Dekkera por PCR En uvas1 En las instalaciones En moscas Drosophila Tomar 3 µl de muestra y Introducir 10 moscas de añadirlos directamente a cada muestra en un tubo ependorf con 100 ml de la mezcla de la primera reacción de PCR (sin Taq YPD. Mantener a tempepolimerasa). Mantener a ratura ambiente durante 1 hora. Resuspender el 100ºC durante 10 min. contenido del ependorf. en el termociclador. Centri-fugar por 10 min. Tomar 3 µl para iniciar la Tomar 3 µl para la primera reacción de PCR, a 6000 rpm. Añadir la prime-ra reacción de PCR Taq poli-merasa e iniciar y 2µl de ésta para la sey una vez concluida, la ampli-ficación por gunda una vez concluida 2 emplear 2 µl de la PCR . la primera reacción. primera reacción para realizar la segunda. 1 Los compuestos de mosto de uva inhiben la reacción de amplificación por PCR, por lo cual las uvas que de la recolección vienen impregnadas de mosto, requieren un procedimiento diferente. 2 Si la densidad de levaduras es baja, la muestra debe concentrarse mediante centrifugación y luego resuspenderse el precipitado en 10 µl de agua destilada estéril. Tomar 2 uvas por muestra. Incubar durante 5 días a 30 ºC en 5 ml de medio líquido YPD enriquecido con gentamicina al 0,025% y oxitetraciclina al 0,050%. Consideraciones Un positivo en la primera reacción indica que la muestra analizada contiene más de 1000 células de esta levadura. Un negativo en la primera que genera positivo en la segunda reacción representa una muestra que contiene entre 1 y 1000 células contaminantes. ¿Es fácil eliminar esta levadura, una vez instalada en la industria vinícola? _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ 93 _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ Busque por lo menos dos métodos para lograrlo y explíquelos. _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ Enuncie otros contaminantes biológicos que afectan la producción de vinos e indique las alteraciones que producen en los mismos. _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ ______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ Al aplicar la técnica descrita sobre muestras de diferentes fases del proceso y materiales de las instalaciones de vendimia, en una fábrica dada; así como sobre muestras de uva intacta provenientes de los viñedos que la alimentan, y sobre Drosophilas propias del área de trabajo, se encontraron los siguientes resultados: Aislamiento e identificación de cepas 1 En uvas No. de controles Resultados de los controles 1. En muestras procedentes de superficies con restos de mosto 2. En muestras procedentes de superficies sin restos de mosto No. de colonias que crecieron en las cajas de medio selectivo 94 En las instalaciones 10 Se cubrieron con bacterias u hongos, ocultando la presencia de la levadura. Crecieron en promedio 80 colonias, las cuales fueron identificadas positivamente por PCR. 610 2000 Resultados de las muestras reales, en muestras procedentes de superficies con restos de mosto No. de cajas que presentaron características macroscópicas y microscópicas parecidas a las cepas de La mayoría de las muestras daban cajas cubiertas de bacterias u hongos 20 56 0 2 1. Suelo de la zona de depósitos de almacenamiento del vino recién fermentado 2. Exterior del depósito de almacenamiento • Los aislamientos en caja de medio selectivo no son eficaces para detectar y controlar la existencia de estas levaduras. • Las dos colonias que dieron positivo, indican la presencia de Brettanomyces/Dekkera Número de pruebas por PCR positivas Origen de las muestras contaminadas Conclusión Ninguno de los aislamientos correspondía a este tipo de levaduras. Brettanomyces/Dekkera en las instalaciones 1 Para realizar los controles: Se añaden células de alguna de las cepas de Brettanomyces o Dekkera a distintas muestras de forma que en las siembras en caja de medio selectivo pudieran crecer de 100 a 200 colonias de estas levaduras. Al observar los resultados, se encontró que las muestras procedentes de superficies con mosto se cubren con bacterias u hongos. Explique este fenómeno _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ 95 Detección por PCR de Brettanomyces/Dekkera en uvas Primera Segunda reacción reacción de PCR de PCR Muestra Control positivo (agua + 105 células) Uva sana viña 1 + 10 células de Brettanomyces/Dekkera Uva sana viña 1 Uva sana viña 2 + 10 células de Brettanomyces/Dekkera Uva sana viña 2 Uva sana viña 3 + 10 células de Brettanomyces/Dekkera Uva sana viña 3 Uva sana viña 4 + 10 células de Brettanomyces/Dekkera Uva sana viña 4 Uva sana viña 4 + 10 células de Brettanomyces/Dekkera Uva sana viña 1 Uva sana viña 4 + 10 células de Brettanomyces/Dekkera Uva sana viña 2 Uva podrida viña 1 + 10 células de Brettanomyces/Dekkera Uva podrida viña 1 Uva podrida viña 2 + 10 células de Brettanomyces/Dekkera Uva podrida viña 2 Control negativo (agua) Fuente: Alguacil et al., 1998 + - + + + + + + + + + + + + + - Elabore el análisis de estos resultados y conteste las siguientes preguntas: 1. ¿Se constata en forma directa Brettanomyces/Dekkera?_____ ¿Por qué? la presencia de _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ 96 2. ¿Qué función cumple el tratamiento de incubación con YPD durante 6 días? _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ _______________________________________________________ Detección por PCR de Brettanomyces/Dekkera en las instalaciones Procedencia de la muestra Tolva de recepción de uva y bomba de pistón Característic A1 B2 C3 a Agua lavado Hisopo estéril Desagüe de la zona de la tolva Hisopo estéril Tubería de conducción de uva Agua lavado Hisopo estéril Zona de prensas horizontales Agua lavado Pocijón de las prensas Agua lavado Tubería de conducción del mosto Agua lavado Depósitos de desfangado Agua lavado Líneas de trasiego Agua lavado Suelo del lagar en la zona de fermentación Hisopo estéril Exterior depósito de reposo Hisopo estéril Suelo de lagar en la zona de depósitos en reposo Hisopo estéril Pared del lagar en la zona de depósitos en reposo Hisopo estéril 7 2 1 7 1 7 6 6 8 1 1 1 1 1 4 1 1 3 1 3 2 3 0 0 0 1 1 0 1 0 0 3 0 2 2 3 6 1 0 0 0 0 TOTAL 50 20 18 1 Número de muestras 2 Número de muestras que dieron positivo en la 2ª reacción de PCR 3 Número de muestras que dieron negativo incluso en los controles positivos Fuente: Alguacil et al., 1998 97 Análisis La presencia de las innumerables bacterias y hongos que proliferan en zonas con restos de mosto imposibilita el aislamiento tradicional de colonias para analizar la presencia de levaduras contaminantes, aunque este procedimiento ha permitido constatar su presencia. Como en 20 de las 50 muestras tomadas se detectó la presencia de Brettanomyces/Dekkera, en 12 no se detectó, y en las 18 restantes se encontraron resultados negativos (incluso en el control positivo), puede afirmarse que hay presencia de inhibidores, los cuales impiden obtener conclusiones para estas últimas. Continúe usted con el análisis. Detección por PCR de Brettanomyces/Dekkera en las moscas Procedencia de la muestra Control positivo (agua + 105 células de Brett/Dekkera) Zona de prensas (orujos) Zona de prensas (orujos) + 10 células de Brett/Dekkera Uva antes de molturar Uva antes de molturar + 10 células de Brett/Dekkera Boca de depósito de almacenamiento A Boca de depósito de almacenamiento A + 10 cls de Brett/ Boca de depósito de almacenamiento B Boca de depósito de almacenamiento B + 10 cls de Brett/ Control negativo (agua) Fuente: Alguacil et al., 1998 98 Primera Segunda reacción reacción de PCR de PCR + - + + + + + + + + - Análisis En la tabla se observa que 3 de las 4 muestras procesadas dan positivo para Brettanomyces /Dekkera, razón por la cual puede pensarse que la mosca Drosophila colabora con la difusión del contaminante. Ésta explicación se consolida aún más, al revisar los resultados anteriores, en los cuales se confirma la presencia de las levaduras tanto en las uvas como en las instalaciones de vendimia. Conclusiones Las levaduras están presentes en numerosas partes de las instalaciones especialmente en la zona de recepción, conducción y prensado de la uva. Aunque no resultaron positivos los análisis en los depósitos de desfangado, estos valores no son significativos ya que la particular composición del mosto inhibe el PCR, y de hecho en 6 de los 8 análisis realizados no se obtuvo positivo en el control al que expresamente se añaden levaduras contaminantes, por lo que no se puede excluir la presencia de Brettanomyces/Dekkera en estos depósitos. BIBLIOGRAFÍA DE APOYO 1. Andalzúa Morales, A. La evaluación sensorial de los alimentos en la teoría y la práctica. Editorial Acribia. Zaragoza. 1994 2. Andrés Toro, B. de; Girón Sierra, J. M.; Fernández Conde, C.; Peinado, J.M. y García Ochoa, F. 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