1. ¿Qué demostraron los experimentos de Stanley Miller sobre la formación de moléculas orgánicas? 2. ¿Qué observación clave ayudó a Vale y colaboradores a diseñar una estrategia para diseñar el aislamiento de la quinesina? 3. ¿Cómo afectaría el movimiento de los cilios la eliminación de la nexina? 4. ¿Cuál es la función celular de la y-tubulina? 5. Estas estudiando el transporte de vesículas secretoras que contienen insulina a lo largo de los microtúbulos en un cultivo de células pancreáticas. ¿Cómo afectaría el tratamiento con colcemida al transporte de estas vesículas? 6. ¿Por qué los filamentos de actina poseen una marcada polaridad? ¿Por qué es la polaridad de los filamentos de actina importante para la contracción muscular? 7. ¿Qué es el intercambio rotatior (treadmilling) y a qué concentración de monómeros se produce? 8. ¿Cómo afectarían la citocalasina y la faloidina al treadmilling de los filamentos de actina? 9. ¿cómo regulan el ensamblaje y renovación de filamentos de actina la ADF/cofilina, la profilina y el complejo Arp2/3? 10. ¿Qué bandas o zonas de un sarcómero muscular modifican la longitud durante la contracción?¿Por qué la banda A no cambia de longitud? 11. ¿Cómo regula el Ca2+ la contracción de las células del músculo liso? 12. ¿Cómo afectaría la expresión de siARN dirigidos frente a la vimentina al crecimiento de fibroblastos en cultivo? 13. ¿Por qué los filamentos intermedios apolares, aunque se ensamblen a partir de monómeros, poseen extremos diferentes? 14. ¿Qué tipo de macromolécula es capaz de dirigir su propia autorreplicación? 15. Discute las evidencias que apuntan que las mitocondrias y los cloroplastos se originaron a partir de bacterias que fueron internalizadas por el precursor de las células eucariotas. 16. Muchas energías bioquímicas son desfavorables bajo condiciones fisiológicas (energía de gibs > o) ¿Cómo lleva a cabo la célula estas reacciones? 17. ¿Por qué se cree que la fotosíntesis ha favorecido la evolución del metabolismo oxidativo? 18. A continuación hay una vía para la biosíntesis de la molécula D catalizada por las enzimas E1 , E2 , E3 ABCD ENCIMA DE LAS FLEZAS POR ORDEN VA: E1 , E2 ,E3 Estás estudiando la reacción catalizada por E1 en ausencia de las otras enzimas. Encuentras que en la tasa de la reacción desciende a medida que aumentas las concentraciones de D. ¿Qué indica este resultado sobre el mecanismo de regulación de la enzima E1? 19. Dado que el diámetro de una célula bacteriana de S. Aureus es de 1 µm y el diámetro de un macrófago humano es de 50 µm, ¿cuántas células de S. Aureus caben en el interior de un solo macrófago humano? Asume que las células son esféricas. 20. ¿Qué organismo modelo proporciona el sistema más sencillo para el estudio de la replicación del ADN eucariótico? 21. Estás estudiando un gen implicado en el desarrollo embrionario mamario. ¿Qué organismo modelo sería el más apropiado para tus estudios? 22. ¿Qué resolución se puede obtener con un microscopio óptico si la muestra se observa al aire en lugar de a través de aceite? Asume que la longitud de onda de la luz visible es de 0,5 µm. 12. ¿Por qué la glucogenogénesis no es una simple reversión de la glicólisis? 8. Las levaduras pueden crecer bajo condiciones anaeróbicas además de bajo de condiciones aeróbicas. Por cada molécula de glucosa consumida, ¿cuántas moléculas de ATP serán generadas por levaduras crecidas en condiciones anaeróbicas en comparación con las condiciones aeróbicas? 9. ¿Cómo regeneran los organismos anaeróbicos NAD + a partir de NADH que se producen durante la glicólisis? 10. ¿Por qué los lípidos son más eficientes como moléculas de almacenamiento de energía que los carbohidratos? 23. Estás a punto de comprar un microscopio de investigación para tu laboratorio, y puedes elegir entre dos lentes objetivas diferentes. Una posee un aumento de X100 y una apertura numérica de 1.1. La otra posee un aumento de X60 y una apertura numérica de 1.3. Suponiendo que el precio no es problema, ¿cuál de estos objetivos elegirías? 24. ¿Qué ventaja posee el uso de la proteína verde fluorescente (FP) sobre el empleo de anticuerpos marcados con sondas fluorescentes para el estudio de la localización y movimiento de una proteína en el interior celular? 25. Identifica las diferentes características o propiedades de los orgánulos que permiten la separación por centrifugación de velocidad, en comparación con una centrifugación de equilibrio en un gradiente de sacarosa. 26. Separando la transcripción de la traducció , la envuelta nuclear permite a las eucariotas regular la expresión génica mediante procesos que no se encuentran en los procariotas. ¿Cuáles son estos procesos que son exclusivos de eucariotas? 27. ¿Qué dos papeles juegan las láminas en la estructura y en la función nuclear? 28. Si inyectas dos proteínas, una de 15 kDa y otra de 100kDa, y las dos carecen de señales de transporte nuclear al interior del óvulo de rana . ¿entrará alguna en el núcleo? 29. ¿Qué dirige la direccionalidad del importe nuclear? 30. Describe cómo la actividad de un factor de transcripción regulador de un gen puede ser regulada por el importe nuclear. POR LA RESPUESTA CREO QUE NO ENTRA TAMPOCO. 31. ESTA CREO QUE NO ENTRA. 32. ¿Cómo afectaría una mutación en la señal de exportación nuclear de una proteína que viaja continuamente entre el núcleo y el citoplasma a su distribución subcelular? 33. La replicación del ADN parece tener lugar en 200 localizaciones específicas o fábricas de replicación. ¿Cómo localizarías estos dominios en células de mamífero en cultivo? 34. ¿Cómo te afectaría el ARNi frente a la exportina – t humana de los fibroblastos humanos en cultivo? 35. ¿Cuál es el significado de moteado nuclear? 36. ¿Cuál es la función de los ARNsno? 1. ¿Cuál era la evidencia experimental original que indicaba la vía secretora RE aparato de Golgi vesículas secretoras proteína secretada? 2. Compara y contrasta la translocación contraduccional y postraduccional de las cadenas polipeptídicas en el retículo endoplásmico. 3. Sec61 es un componente crítico del canal proteico localizado en la membrana del RE. En las células mutantes para sec61, ¿cuál es el destino de las proteínas que normalmente se localizan en el aparato de Golgi? 4. ¿Por qué los grupos de carbohidratos de las glicoproteínas están siempre expuestos en la superficie de la célula? 5. ¿cuál sería el efecto de mutar la secuencia KDEL de una proteína residente en el RE como BiP?¿Sería este efecto similar o distinto del que se obtendría al mutar la proteína receptora de KDEL? 6. ¿Cómo se dirige una proteína lisosómica a un lisosoma?¿Qué efecto tendría la adición de una región señalizadora diana para un lisosoma, sobre la localización subcelular de una proteína que normalmente es citosólica? ¿Cómo afectaría a la localización de una proteína que normalmente es secretada? 7. ¿Cuál es el destino predecible de las hidrolasas ácidas lisosómicas en la enfermedad celular-I, en la que las células carecen de la enzima requerida para la formación de residuos de manosa-6-fosfato? 8. ¿Qué procesos resultan en la presencia de glicolípidos y esfingolípidos en la cara externa pero no en la interna de la bicapa de la membrana plasmática? 37. ¿Cómo demostraron Smith y sus colaboradores que la secuencia de aminoácidos 126 -132 del antígeno T era suficiente para la acumulación nuclear de la proteína? 1. ¿Por qué generalmente es necesario el suero en el medio empleado para el cultivo de células animales? Haz una lista y explica brevemente las técnicas de proteómica a gran escala para determinar la localización subcelular de las proteínas. 2. A pesar de que el glucógeno y la celulosa están compuestos por monómeros de glucosa, son químicamente distintos. ¿En qué sentido? 3. ¿Por qué la activación de proteínas Rab requiere la asociación con una membrana? 4. Los lisosomas contienen poderosas enzimas hidrolíticas, que son transportadas desde su sitio de síntesis en el RE vía al aparato de Golgi. ¿Por qué estas enzimas no dañan a los constituyentes de estos orgánulos? 5. ¿Cuál es la fuente de energía para la fusión entre las membranas diana y vesicular? 6. Un paciente llega a su clínica con una acumulación de glucocerebrósidos en sus lisosomas. ¿Cuál es su diagnóstico, y qué terapia sugeriría si el precio no es un factor limitante? 7. Cuáles son las principales funciones de las grasas y los fosfolípidos en las células? 8. ¿Qué dos propiedades de la membrana mitocondrial interna le permiten tener una actividad metabólica especialmente elevada? 9. De acuerdo con reglas wobble estándar, la síntesis proteica citosólica puede tener lugar con un mínimo de 30 ARNt diferentes. ¿Cómo consiguen las mitocondrias humanas traducir ARNm en proteínas con sólo 22 especies de ARNt? 10. ¿Qué papeles juegan las chaperonas moleculares en la internalización de proteínas en la mitocondria? 11. El citocromo b2 es sintetizado en el citosol y posee una segunda secuencia señal hidrofóbica, después de la secuencia mitocondrial de carga positiva habitual. Sugiera una vía que le llevará a su destino final en el espacie intermembrana mitocondrial. 12. ¿Cuáles son los papeles de la coenzima Q y el citocromo c en la cadena de transporte electrónico? 13. La ATP sintetasa consiste en dos complejos multisubunidad, F0 y F1. ¿Dónde se localiza cada uno en la mitocondria y cuál es su función? 14. ¿Cómo se dirigen las proteínas a los peroxisomas? 15. Además de servir como bloques de construcción para los ácidos nucleicos, ¿qué otras funciones importantes poseen los nucleótidos en las células? 16. Si eliminas todas las bases de una molécula de ARNm, ¿podría seguir funcionando como molécula transportadora de información? 17. ¿Cuál era la evidencia experimental que demostró que la información necesaria para el plegamiento de proteínas está contenida en la secuencia de sus aminoácidos? 18. ¿cómo facilita la cadena lateral de la cisteína el plegamiento de algunas proteínas? 19. ¿Cuáles son los papeles biológicos del colesterol? 20. ¿Por qué son las regiones que atraviesan la membrana de las proteínas transmembrana frecuentemente α-hélices? ¿Qué otra estructura proteica es capaz de atravesar membranas? 21. ¿Cómo proporcionó la traducción in vitro de ARNm pruebas de la existencia de una secuencia señal que se dirige a proteínas secretores potenciales al retículo endoplasmático rugoso? 22. ¿Cuál de los siguientes aminoácidos es más probable encontrarse en una α-hélice transmembrana? a) Lisina b) Glutamina c) Ácido aspártico d) Alanina e) Arginina 23. ¿Qué propiedades de las proteínas son las aprovechadas para la separación de proteínas individuales a partir de una mezcla compleja mediante electroforesis en gel bidimensional? 24. ¿Qué característica de la histidina le permite jugar un papel en reacciones enzimáticas que implican el intercambio de iones de hidrógeno? 25. ¿Qué características del agua contribuyen a su función como la molécula más abundante de las células? 26. El bolsillo de unión de la tripsina contiene un residuo de aspartato. ¿Cómo crees que afectaría a la actividad enzimática el cambiar este aminoácido por lisina?