UNIVERSIDAD CENTRAL DE VENEZUELA FACULTAD DE AGRONOMIA DEPARTAMENTO DE QUIMICA Y TECNOLOGIA CATEDRA DE BIOQUÍMICA ETAPA I PRACTICA DE LABORATORIO Nº3 DETERMINACIÓN DEL EFECTO DE LA CONCENTRACIÓN DE SUSTRATO SOBRE LA ACTIVIDAD ENZIMATICA. INTRODUCCIÓN Una característica especial de la célula, es la capacidad que tiene para llevar a cabo reacciones químicas rápidamente a temperatura ambiente. Esto se debe a la presencia de un grupo de sustancias proteicas llamadas enzimas, que catalizan esas reacciones de tal forma, que la velocidad de las mismas sea compatible con los procesos bioquímicos esenciales para la vida celular. La naturaleza proteica de las enzimas les confiere especificidad, es decir que cada enzima por lo general cataliza una determinada reacción, de allí que sean necesarias miles de ellas para que se realicen las diferentes reacciones químicas en la célula viva. La actividad de las enzimas es afectada por factores tales como: concentración del sustrato, pH, temperatura, activadores e inhibidores. Cuando se determina el efecto de un factor sobre la actividad enzimática, se deben mantener constante los otros factores. OBJETIVOS 1. Determinar el efecto de la concentración de H2O2 (Sustrato) sobre la actividad de la enzima catalasa. 2. Calcular la velocidad máxima de reacción (Vmax) y la constante de Michaelis- Menten (Km), utilizando la gráfica de Lineaweaver – Burk. FUNDAMENTO La catalasa es una enzima que se encuentra ampliamente distribuida en la naturaleza (sangre, hígado, etc.) cuya función es descomponer el Peróxido de Hidrógeno que se produce en la célula. La reacción de descomposición es la siguiente: 2H2O2 catalasa H2O+ O2 La catalasa es una de las enzimas más efectivas conocidas ya que una molécula de ella puede descomponer 5 millones de moléculas de H2O2 por minuto a 0ºC. La actividad de las preparaciones de catalasa puede determinarse por dos métodos: a) Midiendo el volumen de O2 producido por manometría; es decir, midiendo el incremento de uno de los productos formados. b) Midiendo la concentración H2O2 descompuesto; es decir, midiendo la desaparición del sustrato. En esta práctica se utilizará el método (b). Para determinar la concentración de H2O2 descompuesto por la catalasa, se incubará la enzima con una concentración conocida y en exceso de H2O2 por un determinado tiempo y a temperatura y pH adecuados. Transcurrido el tiempo de incubación, la catalasa se inactiva acidificando el medio con H 2SO4. Luego se titula el H2O2 que no se ha descompuesto por la enzima con una solución standard de KMnO4. Por otra parte, se titula un blanco (control); es decir, un ensayo en el cual no existe actividad enzimática y por lo tanto se determina la concentración de H2O2 agregada. La reacción de permanganometría que ocurre es la siguiente: 2 KMnO4 + 4 H2SO4 + 5 H2O2 2 KHSO4 + 2 MnSO4 + 5 O2 + 8 H2O En esta reacción, el ión permanganato de color violeta es reducido por acción del H2O2 a ión manganoso que es incoloro. De allí que el punto final de la titulación con KMnO4 viene dado por la aparición de un color rosado proveniente de un exceso de KMnO4. MATERIALES Y REACTIVOS. Fiolas de 250 ml H2SO4 2 Mc Pipetas graduadas 5-10 ml KMnO4 0,05 Mc Buretas de 50 ml H2O2 1% Soporte Universal Buffer fosfato pH 7 Pinza para buretas Solución Sanguínea 0,1% PROCEDIMIENTO a) Numere 10 fiolas de 250 ml y prepárelas como sigue: Nº 1 – 2 Añada 2ml de H2O2. Agregue 8 ml de agua destilada. Nº 3 – 4 Añada 4ml de H2O2. Agregue 6 ml de agua destilada. Nº 5 – 6 Añada 6ml de H2O2. Agregue 4 ml de agua destilada. Nº 7 – 8 Añada 8ml de H2O2. Agregue 2 ml de agua destilada. Nº 9 –10 Añada 10ml de H2O2. b) A cada una de las 10 fiolas agregue 5ml de buffer pH 7. Ahora tendrá 10 fiolas que contienen 5 concentraciones diferentes de H2O2. Un grupo de 5 fiolas servirá como control (fiolas impares) y el otro será incubado con la enzima (fiolas pares). c) Añada a las 5 fiolas control 5 ml de H2SO4 2Mc y agite. Adicionalmente mida 5 tubos de ensayo 5ml del mismo ácido (H2SO4 2Mc) y guarde para su uso posterior. d) Añada a las fiolas a incubar (fiolas pares) 10 ml de la enzima. EL TIEMPO DE INCUBACIÓN DEBE SER CONTROLADO RIGUROSAMENTE A PARTIR DE QUE CAE LA PRIMERA GOTA DE LA ENZIMA EN LA FIOLA. e) Cinco (5) minutos después de la adición de la enzima a las fiolas pares, añada 5ml de H2SO4 2Mc (Medidos previamente en un tubo de ensayo) y agite. f) Añada 10 ml de la enzima a las fiolas control para completar el volumen g) Titule las 10 fiolas con KMnO4 0,05 Mc hasta color rosado pálido. h) Calcule los miligramos de H2O2 degradados. i) Elabore el gráfico de Lineweaver –Burk. j) Revise el fundamento teórico y determine los valores de Km y Vmax. Calcule el valor de Km en mol/lt. ESTE EXPERIMENTO ESTA RESUMIDO EN EL CUADRO SIGUIENTE: FIOLA Nº H2O2 ml H2O ml BUFFER ml H2SO4 Ml ENZIMA Ml TIEMPO min H2SO4 ml 1 2 8 5 5 10 - - 2 2 8 5 - 10 5 5 3 4 6 5 5 10 - - 4 4 6 5 - 10 5 5 5 6 4 5 5 10 - - 6 6 4 5 - 10 5 5 7 8 2 5 5 10 - - 8 8 2 5 - 10 5 5 9 10 - 5 5 10 - - 10 10 - 5 - 10 5 5 Ejemplos de los cálculos 1) Al concluir la parte experimental usted tendrá 10 valores diferentes de KMnO4 correspondiente a los volúmenes del mismo, empleados para titular 10 fiolas. Ejemplo: FIOLA 1 = 23,7 ml de KMnO4 FIOLA 2 = 8,4 ml KMnO4 2) Como se cumple la relación ´ Mc KMnO4 x V KMnO4 = Mc H2O2 x V H2O2 Sabemos que: Mc KMnO4 x V KMnO4 = mmolc H2O2 Ejemplo: FIOLA 1 23,7 (ml de KMnO4) X 0,05 (mmolc KMnO4/mL) FIOLA 2 8,4 (ml KMnO4) X 0,05 (mmolc KMnO4/mL) FIOLA 1 1,185 mmolc H2O2 FIOLA 2 0,42 mmolc H2O2 De esta manera podemos calcular los Mc de H2O2 existentes en las 10 fiolas. 3) Con los datos siguientes: PM H2O2 = 34 mg/mmolc 1 mmolc H2O2 = 17 mg H2O2 Calcule los mg de H2O2 existentes en las 10 fiolas. Ejemplo: F1 1,185 mmolc H2O2 x 17 mg/ mmolc = 20,145 mg H2O2 F2 0,42 mmolc H2O2 x 17 mg/ mmolc = 7,14 mg H2O2 4) Como la actividad de las preparaciones de catalasa será determinada por medición del H2O2 degradado tenemos que: *mg H2O2 totales – **mg H2O2 remanentes – mg H2O2 degradados *Fiolas controles donde no hubo actividad enzimática ** Fiolas pares donde hubo actividad enzimática Ejemplo: 20,145 mg H2O2 - 7,14 mg H2O2 = 13,01 mg H2O2 degradados Al finalizar este cálculo tendremos 5 valores correspondientes a los mg de H2O2 degradados para cada concentración. 5) En una tabla ” resumen” deberá reflejar los siguientes datos: (S) 1/S V 1/V Correspondiendo a S los mg de H2O2 totales de las 5 fiolas controles. Ejemplo: F1 = 20,145 mg 1/ (S): Inverso de la concentración de sustrato. Entonces, F1 1/ (S) = 1 / 20,145 1/ (S) = 0,049 V: Velocidad de la reacción, es decir, la descomposición del H2O2 en 5 minutos. Ejemplo para las fiolas 1 y 2 13,01 mg de H2O2 / 5 min = 2,602 mg de H2O2 descompuestos por minuto. 1/V: al inverso a la velocidad de reacción Ejemplo para las 1 y 2 1/V = 1/ 2,602 1/V = 0,384 6) Elabore con los datos anteriores el gráfico correspondiente, 1/ (S) en la abscisa y 1/ V en la ordenada. 7) Determine los valores de Km y Vmax 8) Transforme el valor de Km en mol/l , sí el volumen= 30 ml OBSERVACIÓN: Las fiolas con mayor concentración de H2O2 se tornan rosadas al principio de la titulación. Debe titularse despacio, gota a gota y agitando bien. Luego, la reacción es bastante rápida. Esto se debe a que la reacción es auto catalizado. Fecha UNIVERSIDAD CENTRAL DE VENEZUELA FACULTAD DE AGRONOMIA DEPARTAMENTO DE QUIMICA Y TECNOLOGIA CATEDRA DE BIOQUÍMICA Sección PRACTICA DE LABORATORIO Nº2 DETERMINACIÓN DEL EFECTO DE LA CONCENTRACIÓN DE SUSTRATO SOBRE LA ACTIVIDAD ENZIMATICA. NOMBRE CÉDULA 1.- En el cuadro siguiente, presente los resultados de las titulaciones realizadas con KMnO4 y posteriormente calcule la concentración del sustrato (S) y la velocidad de reacción (V) en cada experimento. FIOLA H2O2 ml H2O Ml KMnO4 ml H2O2 meq (S) mg H2O2 1/( S ) V mg/min 1/V 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 3.- a) Elabore con los datos anteriores el gráfico de Lineaweaver – Burk. b) Determine los valores de Km y Vmax c) Transforme el valor de Km en mol/l. Post Laboratorio N°2 a) ¿Por qué es necesario que el volumen total sea igual en todas las fiolas? b) ¿Qué finalidad tiene el buffer utilizado en la práctica? c) ¿Cuándo se estudia el efecto de un factor sobre la actividad enzimática? ¿Qué se debe hacer con los otros factores? d) ¿Qué finalidad tiene el uso del H2O2 en el experimento? e) ¿A qué se debe el color rosado, en el punto final de la titulación? f) Deduzca la relación de la Lineaweaver- Burk partiendo de la ecuación MichaelisMenten. g) Mencione otros métodos utilizados para determinar la actividad enzimática