ESTADÍSTICA APLICADA Primer Curso del Grado en Bioquı́mica (2015-2016) Tema 5: CONTRASTES DE HIPÓTESIS Observación: En este tema se debe intentar resolver todos los ejercicios posibles tanto “a mano” (ayudándose de calculadora) como con con el programa R. 5.1 Una compañı́a farmacéutica afirma que cierto medicamento elimina el dolor de cabeza en un cuarto de hora en el 90 % de los casos. Tomada una muestra de 200 pacientes a los que se les administró el medicamento, se observó la desaparición del dolor en 170 de ellos. Contrastar la hipótesis de la compañı́a. 5.2 Los contaminantes provenientes de aguas residuales y vertidos industriales pueden reducir la concentración de oxı́geno disuelto en el agua y tener efectos adversos en las especies acuáticas. Se obtienen medidas de la concentración (en ppm) de O2 en diversas localizaciones de un rı́o: 4.9 5.1 5.6 4.3 4.7 4.9 4.5 5.1 Supongamos que la concentración de O2 en el agua sigue una distribución normal de media µ y desviación tı́pica σ. a) Calcular un intervalo de confianza al 95 % para µ. b) Calcular un intervalo de confianza al 90 % para σ 2 . c) Algunos cientı́ficos piensan que 5.0 ppm es una concentración de O2 disuelto en la que apenas pueden vivir los peces. En base a la muestra observada, al nivel de significación 0.05, determinar si hay suficiente evidencia de que la concentración media de oxı́geno disuelto es menor que 5.0 ppm. 5.3 El siguiente conjunto de datos procede del National Quality Control Scheme, Queen Elizabeth Hospital, Birmingham1 Son los resultados de la cantidad de sodio (en ppm) presente en 20 muestras procedentes de análisis séricos: 140 138 143 144 141 144 137 139 132 133 157 159 143 141 149 124 118 145 145 139 a) Construye un intervalo de confianza para la cantidad esperada de sodio en una muestra de sangre. b) ¿Hay evidencia de que el nivel medio de sodio en sangre es diferente de 140 ppm? 5.4 En un estudio farmacológico, unos investigadores midieron la concentración quı́mica de dopamina en el cerebro de seis ratas expuestas a tolueno y seis ratas de control. Las concentraciones en la región del estriado del cerebro fueron las siguientes: 1 Fuente de los datos: Andrews, D.F. and Herzberg, A.M. (1985). Data. A Collection of Problems from Many Fields for the Student and Research Worker. Springer. 1 Dopamina Tolueno 3.420 2.314 1.911 2.464 2.781 2.803 (ng/gm) Control 1.820 1.843 1.697 1.803 1.739 1.990 Suponer que la distribución de probabilidad de la concentración de dopamina es normal en cada uno de los dos grupos. a) A nivel α = 0.1, contrastar si las varianzas del grupo de control y el grupo expuesto a tolueno se pueden considerar iguales. b) A nivel α = 0.05, ¿hay suficiente evidencia estadı́stica para afirmar que la concentración media de dopamina es superior en el estriado del grupo expuesto a tolueno que en el grupo de control? 5.5 Bell y Foster (1994), en The Evolutionary Biology of the Threespine Stickleback, estudiaron el efecto de los depredadores sobre la evolución de la longitud de la espina dorsal en los espinosos (Gasterosteus aculeatus; ver figura). Se piensa que las espinas dorsales actúan como un mecanismo antidepredador. Para comprobar si su teorı́a era cierta, los investigadores muestrearon ocho espinosos de cada uno de los siguientes lagos: Benka Lake (sin depredadores), Garden Bay Lake (algunos depredadores) y Big Lake (muchos depredadores). Reproducimos sus observaciones de la longitud (en mm) de la espina: Benka Lake 4.2 4.1 4.2 4.3 4.5 4.4 4.5 4.3 Garden Bay Lake 4.4 4.6 4.5 4.2 4.4 4.2 4.5 4.7 Big Lake 4.9 4.6 4.3 4.9 4.7 4.4 4.5 4.4 Estamos interesados en saber si la longitud media de la espina difiere entre estas tres poblaciones. a) Para analizar los datos con R los investigadores escriben: Datos = read.table("EspinosoLagos.txt",header=TRUE) A = aov(Longitud ~ Lago,data = as.data.frame(Datos)) ¿Cómo tiene que escribirse el fichero de datos EspinosoLagos.txt? 2 b) A continuación los investigadores escriben: summary(A) obteniendo la siguiente tabla de la cual se han borrado algunos resultados Df Lago Residuals --Signif. codes: 0 Sum Sq 0.3033 0.7363 Mean Sq F value Pr(>F) 0.0267 * *** 0.001 ** 0.01 * 0.05 . 0.1 1 Completa la tabla ANOVA. A nivel α = 0.05, ¿qué concluimos acerca de la influencia de los depredadores sobre la longitud de la espina?. Si cambiamos el nivel a α = 0.01, ¿cambiarı́a la respuesta? 5.6 Se realiza un cruzamiento prueba de un posible dihı́brido (un doble heterocigoto) de Drosophila B/b;F/f con doble homocigoto recesivo b/b;f/f (B = cuerpo negro, b = cuerpo marrón, F = quetas dobles, f = quetas sencillas). Los resultados son los siguientes: Cuerpo Cuerpo Cuerpo Cuerpo negro, quetas dobles negro, quetas sencillas marrón, quetas dobles marrón, quetas sencillas 230 210 240 250 Utilizar un contraste χ2 para determinar si estos resultados se ajustan a los esperados para un cruzamiento prueba de este hipotético dihı́brido. Observación: Este tipo de experimento que cruza un dihı́brido con un doble homocigoto recesivo y luego aplica un test χ2 de bondad de ajuste se utiliza para comprobar si dos genes se segregan independientemente. 5.7 Un veterinario midió la densidad de células nerviosas en lugares especı́ficos del intestino de nueve caballos. Los resultados del lugar I (región media del yeyuno) y del lugar II (región mesentérica del yeyuno) se muestran en la tabla siguiente: Animal 1 2 3 4 5 6 7 8 9 Lugar I 50.6 39.2 35.2 17.0 11.2 14.2 24.2 37.4 35.2 Lugar II 38.0 18.6 23.2 19.0 6.6 16.4 14.4 37.6 24.4 ¿Hay suficiente evidencia muestral de que en toda la población de caballos la densidad de células nerviosas del lugar I es superior a la del lugar II?. 5.8 La tabla siguiente muestra los efectos de un placebo y de la hidroclorotiacida sobre la presión sistólica de 12 pacientes, a la mitad de los cuales se les administró el placebo. A los otros seis se les dio la medicación. 3 Placebo H-cloro 211 181 210 172 210 196 203 191 196 167 190 161 Supongamos que la presión sistólica es una v.a. con distribución normal. a) Dar la estimación de máxima verosimilitud de la presión sanguı́nea sistólica media con ambos tratamientos. b) ¿Puede aceptarse que las varianzas, con placebo y con hidroclorotiacida, son iguales? c) Determinar si hay suficiente evidencia estadı́stica, a nivel α = 0,05, para afirmar que el tratamiento con hidroclorotiacida reduce la presión sanguı́nea sistólica. Hacer el estudio asumiendo igualdad de varianzas. d) Decidir razonadamente si el p-valor del contraste anterior es superior o inferior a 0,05. 5.9 Se usan el método de la glucosa oxidasa y el de la hexoquinasa para analizar el nivel de glucosa en diez muestras de sangre, obteniéndose los siguientes resultados (en mM): Muestra 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 glucosa oxidasa 1.1 2.0 3.2 3.7 5.1 8.6 10.4 15.2 18.7 25.3 hexoquinasa 0.9 2.1 2.9 3.5 4.8 8.7 10.6 14.9 18.7 25.0 Determina si hay diferencias entre el nivel medio de glucosa determinada con uno y otro método. ¿Qué hipótesis se utilizan? ¿Depende la conclusión de que se utilicen los niveles de significación α = 0.01, α = 0.05 y α = 0.1? ¿Qué se puede decir del p-valor del contraste? 5.10 Sir Joseph Lister (1827-1912), profesor de cirugı́a en la Universidad de Glasgow, comprobó que una herida envuelta en vendas tratadas con fenol frecuentemente no se infectaba. Reproducimos los datos de Lister observados en fracturas abiertas y amputaciones: Perı́odo 1864–1866 1867–1870 Fenol No Sı́ Resultados De 34 pacientes operados, 19 se recuperaron y 15 murieron. De 40 pacientes operados, 34 se recuperaron y 6 murieron. ¿Hay suficiente evidencia muestral a favor de la hipótesis de que el tratamiento con fenol disminuye la proporción de muertes por infección? 4