Crecimiento de la pared celular en bacterias mediante dislocaciones Realizado por: Cosme Gonzalez Ayani Francisco Javier López Encinas Eduardo Jiménez Mori Alejandro Navarro Marín El artículo trata sobre el crecimiento de membranas celulares a partir de dislocaciones. La forma de ciertas bacterias hace que la geometría cilíndrica sea adecuada para tratar el problema. En general: si se quiere aumentar la pared celular de una bacteria se debe crear un defecto topológico en ella. Un tipo especial de estos defectos son las dislocaciones térmicas. Una vez creada la dislocación, ésta se moverá en dirección perpendicular a su vector de Burgers, lo cual en términos simples quiere decir que la dislocación rodeará al cilindro creando una nueva fila de material. Este tipo de movimiento se conoce como “dislocation climb”. (Escalado de las dislocaciones) El problema aquí expuesto se puede tratar por tanto con la teoría de dislocaciones, sin embargo es muy diferente a los problemas tratados en otros campos de la física . Aquí el escalado de las dislocaciones es el proceso principal de crecimiento de la pared celular. Además la geometría cilíndrica tiene como consecuencia ciertas propiedades como la caída exponencial de interacciones entre dislocaciones a lo largo del eje de simetría. Por último, el escalado de las dislocaciones por sí mismo altera la geometría. Se sabe que el ritmo de crecimiento de la superficie cilíndrica es proporcional al número de dislocaciones que se mueven de forma activa y de sus velocidades. Para que una dislocación pueda moverse, el material necesario para la creación de la pared debe estar en el lugar apropiado, es decir, en el núcleo de la dislocación. Por lo tanto, el hecho de que se forme una dislocación no implica que esta sea activa, de tal modo que nos encontramos con dos conjuntos de dislocaciones: activas e inactivas. En adición a esto, para un sistema con un nivel de desorden apropiadamente elegido para los parámetros biofísicos adecuados, las interacciones elásticas son suficientemente fuertes como para parar el movimiento de la dislocación. Es decir, realizando una determinada tensión en una región de la pared celular, las direcciones de las dislocaciones se ven afectas, incluso, pudiendo llegar a detener el movimiento de las mismas. Lo que nos interesa saber es por tanto cual es el número de dislocaciones activas en la pared celular, para así determinar el crecimiento de la misma. Los mecanismos de creación de dislocaciones son, de forma resumida: 1- Creación de pares de dislocaciones, creados principalmente por activación térmica o por ruptura de enlaces de peptidoglicano en la malla. 2- El mecanismo de elongación puede decaer y hacer que una dislocación activa se vuelva inactiva. 3- El proceso contrario también es posible, el material necesario para la creación de material puede encontrarse en el lugar adecuado y hacer que una dislocación se vuelva activa. 4- Finalmente dos dislocaciones activas o una inactiva y otra activa pueden colisionar completando una fila completa. Estos mecanismos nos dan un par de ecuaciones (mostradas abajo) para la cantidad de dislocaciones activas e inactivas que se pueden encontrar en la pared celular las cuales, bajo simplificaciones debido a hechos experimentales, implementado las en la primera ecuación, resultan en el ritmo de crecimiento de nuestra membrana. 𝑑𝑆 = 𝑁𝑎𝑐 𝜈𝑏 𝑑𝑡 𝑑𝑁𝑎𝑐 = Γ𝑆 − 𝛾1 𝑁𝑎𝑐 + 𝛾2 𝑁𝑖𝑛 − 𝛾3 𝜈𝑁𝑎𝑐 (𝑛𝑎𝑐 + 𝑛𝑖𝑛 ) 𝑑𝑡 (2) 𝑑𝑁𝑖𝑛 = Γ𝑆 + 𝛾1 𝑁𝑎𝑐 − 𝛾2 𝑁𝑖𝑛 + 2𝛾4 𝑆 − 𝛾3 𝜈𝑛𝑎𝑐 𝑁𝑖𝑛 𝑑𝑡 (3) Represents de processivity 𝛾2 Activación de una dislocación inactiva 𝛾3 Aniquilación de pares de dislocaciones 𝛾4 Describe la creación de pares de dislocaciones inactivas fuertemente Basándose en las mencionadas consideraciones acerca de los parámetros biofísicos y en el hecho de que experimentalmente se ha mostrado que el número de dislocaciones inactivas es mucho mayor que el de activas (𝑛𝑎𝑐 >> 𝑛𝑖𝑛 ) lo cual simplifica bastante nuestras ecuaciones (2) (3). Teniendo esto en cuenta nos encontramos con dos situaciones para la creación de pared celular: 1- Proceso de dos estapas: en la primera, una enzima corta los enlaces de glicano en la malla para producir un par de dislocaciones inactivas, 2- mientras tanto otras proteínas activan un pequeño conjunto de estas dislocaciones. 3- Inserción directa en la malla: en este proceso los pares de dislocaciones se forman por inserción de materia en la malla. Sobre la cual luego actúa el mecanismo de elongación. Estos dos métodos resultan en diferentes resultados para el número de dislocaciones activas. Experimentos futuros determinarán la densidad de estas dislocaciones y por tanto comprobar cuál de los dos mecanismos es el correcto. (1) 𝛾1 enlazadas Bibliografía: Dislocation-mediate growth of bacterial cell wall – Ariel Amir and R.Nelson. Theory of interacting dislocation in cylinders – Ariel Amir, Jayson Paulose and R. Nelson