Utilizaci n de herramientas gen micas en vegetales: an lisis de QTL, mapeo asociativo y selecci n gen mica

UNIDAD DE POSGRADO Y EDUCACIÓN PERMANENTE
UNIDAD DE ENSEÑANZA
FORMULARIO DE PROPUESTA DE CURSOS
1. Datos generales del curso
Por favor indique el Programa al que pertenece prioritariamente el curso y los cupos para
estudiantes de diferentes programas:
Programa
Posgrado Académico
Posgrado Profesional
Educación Permanente
Grado (optativos de 5to)
Marque el programa al
que el curso pertenece:
x
Cupos para estudiantes
de cada programa:
30
10
10
0
Cupo Total 50
Modalidad del Curso:
x Presencial
A Distancia
En caso de ser curso de posgrado, indicar tipo de curso:
Curso General (créditos pueden contar como obligatorios) para el programa de
Maestría en Ciencias Agrarias
Curso de la Opción de especialización de la Maestría (indicar opción):
Bioestadistica, Ciencias Vegetales
Obligatorio para el posgrado profesional (indicar programa):__________
Temática opcional
SERVICIO :
Universidad de la República - Facultad de Agronomía
DEPARTAMENTO O UNIDAD :
Producción Vegetal; Biometría,
Estadística y Computación
NOMBRE DEL CURSO : Utilización de herramientas genómicas en vegetales: análisis
de QTL, mapeo asociativo y selección genómica
PALABRAS CLAVES (3):
Mejoramiento genético, Genética, Estadística Genética
2. Equipo docente
Para todos los docentes por favor incluir el título académico (p.ej., Ing. Agr., M.Sc., Ph.D)
delante del nombre. En cargo especificar grado docente y dedicación horaria global (semanal).
Docentes responsables :
Nombre
Ing. Agr. Ph.D. Ariel Castro
Cargo
Gr.5, 40 hs DT
Nombre
Cargo
Gr.4, 40 hs DT
Cargo
Investigador
Principal
Mejoramiento
Genético de Trigo
Ing. Agr. Ph.D. Lucía Gutiérrez
Docentes Participantes de la UDELAR :
Nombre
Especialistas invitados :
Nombre
Ph.D. Martín Quincke
Institución
INIA - Uruguay
Especialización
Docentes Extranjeros :
Nombre
Ph.D. Rex Bernardo
País de origen
Cargo
Estados Unidos
Especialización
University of Minnesota
Professor and
Endowed Chair in
Corn Breeding and
Genetics in the
Department of
Agronomy and Plant
Genetics.
Genomic Selection
Institución o Universidad
Nombre
Ph.D. Susan McCouch
País de origen
Cargo
Estados Unidos
Especialización
Institución o Universidad
Cornell University
Professor of Plant
Breeding and Plant
Genetics
Rice Breeding
3. Programa del curso
DESTINATARIOS :
(Indique a quien va dirigido el curso citando disciplina y especialización)
Estudiantes de la Maestría en Ciencias Agrarias y de PEDECIBA. Estudiantes del
Doctorado en Ciencias Agrarias, post-docs, investigadores y mejoradores.
OBJETIVOS:
(Indique brevemente los objetivos principales del curso)
Desarrollo de los conceptos referidos a la utilización de información genómica
(marcadores moleculares, mapas de ligamiento) en el estudio de las bases genéticas de
variables de interés con especial referencia a su aplicación en el mejoramiento vegetal.
Desarrollo de capacidades en la aplicación de distintas herramientas de análisis de QTL y
mapeo por asociación, y de los conceptos de selección genómica. Desarrollo de
principios, conceptos y prácticas en el uso de marcadores moleculares para el
mejoramiento de caracteres complejos en plantas.
CONTENIDOS :
(Indique brevemente los principales contenidos temáticos del curso)
Teóricos:
1. Introducción general. Herramientas genómicas y mejoramiento genético. Objetivos de
mejoramiento. Conceptos generales de mejoramiento genético.
2. Marcadores genéticos. Marcadores moleculares. Utilidades, limitaciones. Efectos de
escala y utilización práctica.
3. Análisis de ligamiento, construcción de mapas de ligamiento. Relación mapas de
ligamiento- mapas físicos.
4. Asociación marcadores-genes, análisis de regresión simple. Ejemplos clásicos de
utilización de marcadores en selección asistida.
5. Análisis de poblaciones balanceadas. Generaciones avanzadas, generaciones
tempranas y poblaciones doble haploides. Análisis de regresión simple, análisis de
intervalo.
6. Análisis de intervalo compuesto. Alineamiento de mapas.
7. Limitaciones del análisis de QTL clásico. Precisión, resolución, efecto del tamaño de
población. Calidad de datos. Uso de modelos mixtos. Interacción QTL x ambiente.
8. Estudio de poblaciones no balanceadas. Diversidad genómica, desequilibrio de
ligamiento y estudios de asociación. Estructura de poblaciones
9. Revisión del mejoramiento vegetal, revisión de las estrategias en selección por
marcadores, de poblaciones y genética cuantitativa.
10. Genome Wide association análisis 1
11. Genome Wide association análisis 1
12. Selección asistida por marcadores para QTL de efecto mayor, enriquecimiento de la
F2, selección recurrente asistida por marcadores e introducción a la selección genómica.
13. Selección Genómica 1
14. Selección Genómica 2
15. Síntesis final. Integración de marcadores en un programa de mejoramiento aplicado.
Prácticos:
1. Análisis de ligamiento. Ligamientos simples. Mapas de ligamiento.
2. Análisis de asociación marcador/gen. Uso de software estadístico de rutina para el
estudio de este tipo de asociaciones.
3. QTL1. Análisis de intervalo simple y compuesto.
4. QTL2. Modelos avanzados.
5. Asociación 1.
6. Asociación 2.
7. Estrategias de mejoramiento.
Talleres
Discusión de los métodos presentados en los prácticos. Discusión de los ejercicios.
Presentaciones
Se presentarán trabajos nacionales publicados recientemente, por sus autores
Bibliografía
Se dispondrá del material necesario (artículos científicos, software, etc.) en página web.
Se presentará y discutirá software específico para eQTL y en R.
METODOLOGÍA :
CURSOS PRESENCIALES:
Exposiciones
Otras (indicar cual/es)
x
Trabajos Prácticos
x
Actividades Grupales
x
CURSOS A DISTANCIA:
Video-conferencia
Materiales escritos
Internet
En caso de utilizar videoconferencia:
Localidad emisora
Localidades receptoras
SISTEMA DE EVALUACIÓN (en caso de realizarse evaluación de los estudiantes) :
Entrega de Ejercicios Prácticos
Presentación de trabajos científicos en forma de seminario. Los trabajos serán
asignados por el responsable del curso y se discutirán en plenario (presentación
de 15 minutos, 15 de discusión)
BIBLIOGRAFÍA :
Se dispondrá del material necesario (artículos científicos, software, etc.) en página
web. Se presentará y discutirá software específico para eQTL y en R.
CRONOGRAMA DEL CURSO :
Año:
2015
Semestre: Primero
Bimestre (si es de posgrado):1
10, 11 y 12 de Febrero: EEMAC, Paysandú
23, 24, 25, 26 y 27 Febrero: CURE, Maldonado
9, 10, 11, 12 Marzo: FAGRO, Montevideo
Frecuencia (anual, cada dos años, a demanda) :
Cada dos años
EVALUACIÓN : (Indicar si se realiza)
DEL CURSO: (Por los cursantes)
si
(Por los docentes)
(Por el responsable de Educación Permanente)
DE LOS CURSANTES: (Por parte de los docentes)
INTERSERVICIO :
si
Indique con cual / es :
FECHA PROBABLE DE REALIZACION:
HORAS TOTALES :
A partir del 10/02/2014
108
Por favor desglosar las horas totales en:
Teórico, Teórico práctico, seminario, presentación oral y/o defensa de informes o
realización de evaluaciones
Práctica de campo o laboratorio
Trabajo grupal o individual de preparación de informes
Excursiones, lectura domiciliaria de bibliografía obligatoria exigible en algún tipo
de evaluación y cuyos contenidos no hayan sido tratados en clase, pero formen
parte de la estrategia docente del curso
48
30
20
20
Un curso de posgrado puede otorgar hasta 6 créditos (salvo fundadas excepciones). Para la
UDELAR, 1 crédito equivale a 15 horas de trabajo del estudiante (sumando presenciales y no
presenciales).
CRÉDITOS SUGERIDOS :
LOCALIDAD :
SALÓN :
6
EEMAC, Cure y Montevideo
Para los cursos de Educación Permanente:
MATRICULA : SI
Monto matrícula : USD 500
Con el objetivo de mejorar el proceso de propuestas de cursos en forma coordinada agregue si
desea comentarios, sugerencias o críticas al presente formulario. Muchas gracias.
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Formulario completo
Fecha recibido el formulario:__/__/____
Aval del coordinador de opción
Aval del Director del Departamento o Unidad
Aprobado por Comité Académico de Posgrados (fecha:__/__/____)
Aprobado por Comisión de Enseñanza (fecha:__/__/____)
Código del curso en BEDELÍA: ____________
Fecha límite de inscripción:__/__/____
Publicado en página web